1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
4RPNA 2ALUA 1RYOA 1B3LA 2I49A 2IEEA 3CI8A 3A3CA 4GQOA 2XXHA 5ELVA 4AB6A 3RNNA 1B0LA 3MW0A 4R2FA 3SETA 3ZKKA 3OO8A 3O28A 1I6BA 4BDMA 3N6UA 5EHMA 4FJPA 4LP2B 5LOMA 1GV8A 3T96B 4PP0A 2F5XA 4G68C 4YZZA 4DCXA 3FVGA 3E3KA 1Y3NA 1FTJA 3C35A 1B6HA 1B7HA 1P1UA 1SW4A 4RPOA 1WVJA 3QUFA 3T9XB 1ZIUA 2O6AA 5CM6A 4RNSA 5I2NA 1B7ZA 5KDTA 1R6ZA 1SQYA 5I57A 2HAVA 1NNFA 3BBRA 3KN7A 5F1QA 4IO5A 1B0HA 4G8HA 3FASA 3EHTA 3GXAA 4OETA 3KG2A 3KBRA 1FQDA 4I1DA 2I3VA 1N84A 1R9LA 3VLVA 3O2AA 1LFHA 4KHZE 1MRPA 1EH3A 4F2QA 1LAHE 4G68A 5H8HA 1MM6A 2DXRA 3IX1A 3PPOA 4JWOA 3RT6B 1M5BA 3FATA 3KJ7A 4GL8A 4KYSA 1MXYA 2OCUA 5CMBA 4M4GA 2CZLA 3R6UA 1B05A 2Y7IA 3GBAA 3PUVE 4QSDA 2VD3A 1MPDA 2DS9A 4G77A 2V3QA 4P11A 4WXJA 2VGQA 4NWCA 2XX8A 3C33A 4LQ5A 2XHDA 1XVYA 4OERA 5K2YA 3FJMA 3S9LC 2D5WA 3U94A 4C1TA 2RC7A 1SW2A 2HZKA 3K6VA 1FTOA 5I59B 1Y1MA 4H67A 2RKMA 3C31A 3OSQA 5CC2A 4R9FA 3U1OA 3VVFA 3TTMA 5I2KB 1LLSA 1SYHA 1UTHB 1MQDA 5F7VA 3USDA 3IO6A 2ONKE 4KFQA 3KOTA 2F7BA 1ANFA 4QSEA 1MXUA 2YPNA 2XXUA 1II5A 4IGRA 3MP8A 4K3FA 2Q88A 3K1NA 1VFEA 3SKPA 2XXPA 5L9MA 1P1WA 4OQOA 3P7IA 3K01A 2HFBA 4U4SA 4DZ1A 3FV2A 1NL5A 5CMKA 3KFMA 3T66A 1QULA 4N07A 2V93A 4YU0A 4ELPA 2AIXA 1QKAA 3DP8A 4NF5B 2Z23A 1JQFA 1CE2A 1LAFE 1UTBA 4H0WA 1MQIA 2Z8EA 3I5OA 3RTFB 3CFZA 4QFPA 4WKMA 2OK2A 3KOSA 1CB6A 4TOZA 1NNPA 2ZMBA 2WKYA 4TQUQ 4N13A 3MZ9A 1O64A 4R2BA 3IK6B 3CFLA 1SBPA 1I69A 3FVKA 1FQBA 4YMAA 2XXRA 3RY3A 1JEVA 1Y20A 2H99A 4X1BA 2DE3A 3GLBA 4FATA 1MH3A 4FORA 1GR2A 1NNTA 3C9HA 4OFJA 2UXAA 4IO2A 5ITOA 1N0TA 2Y7KA 2OWTA 4XTCQ 3GZGA 2NVUB 4DXBA 1NNKA 5K2XA 1M5FA 4ZEBA 1FQAA 1B9JA 2RINA 1LCFA 1XVXA 1PEBA 3RT8A 4G4PA 3CG1A 1A99A 2HCAA 1O63A 3CR9A 3F11A 4GWOA 3VXCA 5J1DA 2QS1A 4E0XA 4ZDMA 4QFKA 4ZZAA 3TTRA 2P0SA 1ZLQA 5ISUA 3TCHA 5AA4A 2Q8JA 3T22A 1H43A 3EQ1A 3K4UA 1JW5A 1Q1KA 2PMSA 3IOTA 3KEIA 2Y7WA 1POTA 1LFIA 4F2OA 4RYAA 4C1UA 3M3KA 4R73A 4F22A 2DE2A 3IORA 4YKKA 1F9BA 1PBPA 4OFOA 2HQ0A 4GXAA 4U22A 1OQHA 3L6HA 1AIVA 2Q9TA 3MP6A 4JSOA 3T93B 4P0GA 2Z8FA 2QSXA 3LR1A 3H6WA 3PUZE 5I2NB 4BDNA 5I57B 3G3FA 1OMPA 5I2KA 3HCQA 3RGYA 3SERA 4LUBA 1XOCA 1Y4TA 3QK6A 1B5HA 1ELJA 4ZEDA 3HN0A 2F6GA 1OVBA 4F19A 3SESA 4YAHX 4H8JA 5L9SA 4MBPA 2DOJA 4QFLA 4X9TA 4HS7A 4F1UA 4H8IA 2YJPA 1MPCA 1I6AA 4JWXA 4ELOA 5H8HB 1A8EA 3ILUB 4KPTA 2D21A 2O1MA 4ZE9A 4AQ4A 3LSFB 3OEMA 5EHSA 3VDFA 1EZPA 1P1NA 4NF4A 4DE8A 1MY1A 4NF5A 2UYFA 4X48A 3MBPA 2F7CA 1D4NA 4EDPA 1B2HA 4IY6A 3M8UA 3CFXA 2UVIA 1LB9A 4EXKA 4LZ8A 3MP1A 1GVCA 3T9VA 1B40A 1B7UA 5B70A 1MH4A 5EYFA 1YTVA 4G2ZA 3UK4A 3VE1B 3PUWE 1Y3PA 2QMXA 3HPIA 1P1QA 2M8CA 1JW1A 3DM0A 1JVYA 4OXVA 4IO6A 3MZ1A 3S9NC 2DXYA 3RUMA 3OO7A 3KGCA 2H25A 3A3UA 3PUXE 3Q29A 3MUQA 2W7YA 4H5FA 4F3BA 2ABHA 3TTNA 2ESNA 3DLNA 3UA8A 3K1PA 3H4ZA 4BDQA 3VVEA 3MPKA 1IXHA 1B4ZA 3O9PA 2P2AA 1URDA 1QVSA 2O84X 2UYEA 4KI0E 4PETA 3FVOA 4FEBA 1MM7A 2O69A 4OYVA 2Q2AA 4LATA 3OD7A 4GXSB 2QRYA 5L9OA 1L5TA 3KN8A 1UTBB 2Y7RA 4UA8A 3SEWA 2ONRA 1IITA 4R74A 5DT6A 3KSXA 3K2DA 3KN3A 3PPQA 3LSXA 3QSLA 2ZYOA 2DSFA 3IOVA 1EZOA 3MVYA 1LGBC 4JXIA 1SD3A 3PD9A 4DXUA 1N76A 4Q30B 4LQ2A 3GBBA 1HSJA 2KLFA 2F8DA 1DPPA 1LAGE 3EN3A 2DWJA 3D4GA 4JDFA 3B7DA 1AH5A 5FHOA 3TEPA 1TFDA 2H4IA 4IO4A 1S9TA 3TDJA 1IXIA 1DPEA 4YB7A 4AB5A 3FIRA 3TCFA 2THIA 3G3KA 5HBCA 2Y7PA 4F3GA 4FE8A 2DVZA 3RTWB 1HSLA 4H65A 3C36A 2XXWA 3S4UA 4DCYA 2GFEA 2ZNSA 4ZEFA 1SVXB 2REGA 4OZ9A 1QKBA 3E13X 2VP1A 5H8SA 3PGFA 3SEUA 4LZ7A 4IO7A 4X1DA 5AA4B 4PE5B 1QUIA 3PPRA 1ATGA 2DVCA 3O6GA 3B6QA 4PFYA 3K6UA 4MLVA 3S2VA 1Y1ZA 3IB0A 3PV0E 1Z7NE 2DWIA 3RN8A 3IOUA 3TPAA 4WEPA 3VFJA 4EF2A 4P0IA 1MY2A 3K02A 1N7WA 3H3GA 4DXCA 3FJ7A 2B3BA 4GLIA 2AL5A 2FYIA 2OBGA 2O1LA 4ZECA 1AOVA 1YPNA 1NH8A 3H06B 2I48A 1LCTA 3N5LA 1PB9A 4F3SA 3THIA 3QYTA 4Q0CA 3TFLA 1MXZA 1ZBMA 1P1OA 2XXQA 1RKMA 1N04A 1MQJA 5DEXA 2G93A 1DMBA 3MPLA 1Z7ME 4KQPA 2XD3A 2NXOA 4HTGA 2R6GE 2F7AA 3HO7A 3V5AA 3K1MA 4NF4B 3CVGA 2V84A 5H8NB 1XC1A 1M5EA 3MQ9A 4OFLA 5HM4B 5KCJA 1JW4A 2VD2A 1XHYA 1Q35A 3OO6A 3MVZA 3O6IA 1A40A 5DYHA 1VR5A 4RK2A 1EU8A 3QAXA 3O97A 4OEVA 4GF8A 1FCKA 3CIJA 4YICA 1VE4A 3HHFA 2XXTA 4WEDA 3K6XA 2RC8A 1AL3A 2B65A 3PMVA 4QFNA 1HSEA 3BFTA 3G7WA 5HPQA 4U1OA 3PPPA 1QUKA 4MFIA 2DE4A 1R1NA 5BWJA 3MAMA 4XKNA 5DVIA 4ND9A 3FZVA 1FTKA 2ONSA 3FVNA 1UIVA 1N7XA 3K00A 2REJA 3V8XB 2RF1A 3TTLA 4OMBA 3JYRA 1XS5A 1B52A 2HEUA 4R9GA 2FNCA 5TP9A 2I4CA 3OO9A 4R75A 3EHSA 1ZMGA 3PD8A 1ZTYA 4DIGA 1QJMA 2I0CA 1URSA 4ESWA 1SW5A 3Q25A 3TAJA 1US4A 5CBRA 3UGWA 4ZEKA 3IR1A 3TCGA 5H8QA 4NTLA 1IXGA 1MY4A 4EUOA 5B7DA 4BDLA 4ZE8A 5FTIA 5AA2B 3Q26A 2UVJA 4OESA 3LUYA 2PVUA 3S9EA 3FUZA 1H45A 1NH7A 3ONMA 2QMWA 3FXRA 1B4HA 4FEDA 2F97A 4U2RA 5FTHA 1SDXA 2LAOA 2A5TB 1JEUA 3EF7A 2RC9A 4BLAA 1LAXA 3CG3A 1AMFA 3H6UA 3TQLA 2DP8A 2A5SA 3TUSA 4YB6A 3OELA 1B3EA 1BP5A 1PB8A 5H8FB 3M3FA 2CMOA 2P1SA 3G3HA 2I6EA 3IL1B 1B5IA 2FA7A 3FGSA 4ZEIA 1YCJA 3E9XA 2QS4A 5CI5A 1S50A 1M5DA 3HSTA 3KSJA 3H7MA 1D9VA 1DSNA 3W15C 2O68A 4KYDA 3R7XA 4Q5TA 2QPQA 3V83A 1TT1A 3G3IA 5TU0A 5ICQA 4HCYA 3SEVA 1IUDA 4QSCA 1MY3A 3TYHA 2XXXA 1DTGA 3CSBA 4H5GA 2ZYNA 2XD2A 3MJNA 3C4MA 4XXUA 1YAEA 2ZNUA 1ZKBA 5JEIA 1NMUA 1FQEA 4M1VA 3RQTA 1B3GA 1OVTA 5AE4A 1FQCA 4GD5A 1GGGA 4IY5A 4OHNA 3SDFA 4LONB 2F34A 3VLWA 5M2VA 4NF8A 2AL4A 5H8NA 1MXXA 1NKXA 5I56B 3LSLA 2VHAA 2I58A 3N6TA 1QW0A 3IO4A 1UIUA 5ITPA 3N26A 4F18A 1LSTA 4DDDA 4RJZA 4ESXA 2Z8DA 4H6DA 4YMBA 3MZBA 2VOZA 4G8MA 3LSWA 2OJTA 2PT2A 4QHQA 1MXWA 1LBBA 3TELA 1USYE 3K6WA 2O7IA 3MWBA 1B32A 5DVFA 4EXLA 4F1VA 1FW0A 1B5JA 3ZKLA 2PX1A 5TPAA 1ZU0A 3WAFA 2E0SA 3W9WA 3A09A 2D3IA 5AA1A 4HW8A 4R6HA 3T9HB 1A7LA 3DELB 1FTLA 5DEXB 4OWDA 3PPNA 4LA9A 4NF6A 5FHMA 4I62A 4TLMB 3QIMA 2BJJX 2GHAA 3FXQA 3L6GA 2G29A 1N3XA 2DWHA 4PQJA 5AA2A 2XXVA 3S9MC 1NFTA 5KCJB 1IZ1A 1OLCA 2I3WA 4GIZA 4R6YA 4IO3A 3CSGA 1MDQA 4Q8RA 4PFWA 3AXFA 2Q2CA 3U92A 4RY1A 2A5TA 4KYEA 5CMCA 3DP6A 2X7PA 2XX7A 3O66A 2XX9A 4U4XA 5FHNA 1MY0A 4RXLA 5H8FA 4QFOA 2ZNTA 2NOOA 1USYH 1XT8A 3IAZA 5TP9B 1SW1A 4KCCA 1MG1A 2XXIA 4GVOA 3TODA 1IIWA 4NE4A 3EHUA 4F29A 3D4CA 3R26A 1A8FA 5H8QB 4R6KA 2RCBA 3ZSFA 4POWA 2QS3A 1UQWA 3OMBA 1O7TA 4GOTA 2Y84A 5I58A 3FXUA 3MVWA 5DVJA 1FQFA 2ZYMA 1M5CA 1P99A 4ELRA 3IB1A 1SI0A 5I56A 2RCAA 1H76A 4GL0A 3H6TA 5I84A 4LVQA 4XKQA 4XKPA 5A5XA 3B6WA 1KWHA 1VFDA 1B3FA 1QUJA 2QS2A 4C0RA 4U23A 4L17A 3HHGA 3DP4A 1TFAA 4F3PA 1LBCA 1Y4CA 5L8DA 3I6VA 4N6PA 4KD5A 3FJGA 5BUUA 3BKIB 1D9YA 2DWAA 2GH9A 4H1XA 1IEJA 4ZS9A 4XIGQ 2OWSA 5JK4A 3JV9A 1JVXA 1POY1 2I4BA 4YKPA 4E0WA 4PFUA 1D3KA 1EZ9A 3TTKA 4EQ7A 2B3FA 3M3LA 1RYXA 3H03A 4UACA 1A54A 3VV5A 3IB2A 1TWYA 1H44A 3G3JA 1BIYA 4LZ5A 1S7YA 4ELQA 3UIFA 5JTYA 3FV1A 4R72A 2R71A 4NF8B 5CBSA 3IJXB 2I0BA 3V89B 4DLDA 5CRYA 1Y9UA 2Q89A 4U21A 3IOWA 3JZJA 1PBQA 4F1YA 1VSOA 4Z0IA 2NWJA 3LC8A 3PMWA 3PMXA 3SEYA 4F39A 5KZTA 1MS7A 4I8CA 1MPBA 3TKDA 3I3VA 1PC3A 2X7QA 4XKRA 3HV1A 3Q28A 4O3CA 2AYSA 1JNFA 2F35A 4JB7A 2ANJA 1FTMA 3TZAA 2GRVA 3KJTA 5TPAB 1MQHA 3UP9A 2PBWA 3CRBA 2F78A 5DTBA 4GFRA 2HXWA 3EPEA 2DYXA 2O7UA 1B3HA 3ILTB 1BLFA 4FAJA 1IXCA 3IJOB 1B46A 2R9JA 4NF6B 2ZXTA 3K0VA 2F36A 4NWDA 4ONYA 4PFTA 1J1NA 2PT1A 3Q27A 4G8NA 5IAIA 4OTEA 2GHBA 3UORA 2X26A 3OEKA 1H3DA 3OOAA 4TLLB 2YLNA 4QF9A 3QUJA 4OENA 3U72A 1LB8A 3FD3A 4KCDA 3VLUA 4EQ9A 4ECFA 4THIA 2H9BA 2V25A 2HAUA 2NUVA 4Z7EA 2E1SA 3PUYE 4O3AA 1IQ7A 5I59A 3U93A 1LFGA 4FECA 1Y3QA 2Z22A 5KDTB 4POXA 4BDRA 3MVXA 4MF3A 3KZGA 1WODA 2V3TA 3E4RA 3ZS6A 1R9QA 4QRZA 1UTHA 2DQVA 4JWYA 2PYYA 4I9DA 3QXMA 4EQBA 1B1HA 1MQGA 3SEXA 5I58B 4MLQA 1TXFA 4O3BA 2HZLA 4IGTA 1OQGA 4GRKA 4YB5A 3ODBA 1SI1A 1I6QA 2QL3A 3H6VA 3OSRA 2V3UA 3ECRA 3LBSA 4RK9A 1MXVA 4JBZA 1T0KA 3O6HA 4MH5A 3T9UA 4G68B 4EF1A 4FIMA 2ZYKA 4HCWA 4BDOA 4YKIA 3TQWA 3VVDA 1B1XA 4RA1A 1GTKA 3U8QA 1WDNA 3O29A 1MDP1 1URGA 5A5XB 5ICTA 5IKBA 3VXBA 2OLBA 2H98A 4NMYA 5AA3A 4F31B 5AA2D 3PU5A 1B51A 1BKAA 2OZZA 3UN6A 5CMMA 2O51A 4YKJA 4KR5A 3RPWA 3N94A 1SYIA 1DTZA 1US5A 1A55A 4NEDA 4ISUA 2IA4A 3MC2A 4U1ZA 1ZJLA 2F6PA 3W9VA 2QJEA 1OLAA 4JSDA 3TMGA 2XXYA 1PDAA 1BTJA 4ZZEA 1JETA 1N3WA 1OIBA 3B6TA 1B58A 3OXNA 3WAEA 4OVJA 3RLFE 3OENA 4OEUA 3C32A 5JTYB 1PB7A 2H5YA 2UVGA 2UVHA 3C34A 1DOTA 4IB2A 3BFUA 3G3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RPNA 2ALUA 1RYOA 1B3LA 2I49A 2IEEA 3CI8A 3A3CA 4GQOA 2XXHA 5EQ9A 4NAPA 5ELVA 4JVDA 4AB6A 3RNNA 1B0LA 1XI6A 3MW0A 4R2FA 4GX3A 3SETA 3ZKKA 3OO8A 3O28A 4MCOA 1I6BA 1IMDA 4BDMA 4MMPA 3N6UA 5EHMA 4FJPA 4LP2B 5LOMA 2ZZWA 1GV8A 3T96B 4PP0A 2Q74A 2F5XA 2CEYA 4G68C 3T0JA 4YZZA 4DCXA 3FVGA 5FBPA 4OVTA 3E3KA 1Y3NA 1FPFA 1FTJA 2BJIA 3C35A 3A29A 1B6HA 1B7HA 1P1UA 1SW4A 4RPOA 1WVJA 5EYHA 3QUFA 3T9XB 4I3EA 1ZIUA 2O6AA 3SZPA 5CM6A 4RNSA 5I2NA 1B7ZA 5KDTA 1R6ZA 1SQYA 5I57A 2HAVA 3B8BA 1NNFA 3BBRA 3KN7A 5F1QA 4IO5A 1B0HA 4G8HA 3FASA 4PFIA 3EHTA 4MIJA 3GXAA 4OETA 3KG2A 3KBRA 1FQDA 4I1DA 2I3VA 3E78A 1N84A 1IMEA 1R9LA 3VLVA 3O2AA 5ET7A 1LFHA 4PDHA 4KHZE 1MRPA 1EH3A 4F2QA 1LAHE 2MKZA 4G68A 5H8HA 1MM6A 2DXRA 3IX1A 3PPOA 1FPIA 4JWOA 3RT6B 1M5BA 3FATA 3KJ7A 4GL8A 4KYSA 1KZ8A 1MXYA 2OCUA 5CMBA 4M4GA 2CZLA 3R6UA 1B05A 2Y7IA 3GBAA 3PUVE 4QSDA 2VD3A 1EYIA 1MPDA 2DS9A 4G77A 2V3QA 4P11A 4WXJA 5J16A 2VGQA 4NWCA 2XX8A 4P1LA 3C33A 4LQ5A 2XHDA 5I3SA 4P8BA 2HXRA 1XVYA 4OERA 5K2YA 4QBAA 3FJMA 3S9LC 2D5WA 3U94A 1FSAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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