1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
1F9BA 3N6UA 1B9JA 3U8QA 4X1DA 1ATGA 5H8SA 1MQGA 2R9JA 4X48A 3EHSA 2VHAA 1Q35A 1P1NA 2FNCA 2FYIA 1IIWA 2ZYOA 1FQCA 3FD3A 2B3BA 1B0HA 4NWDA 4KHZE 1JVXA 3ODBA 4YKPA 2F78A 4NE4A 3K6WA 4JSDA 3T9UA 1BIYA 4F19A 5ITPA 4JWXA 1DSNA 3MWBA 4G77A 4KYEA 4XKNA 4I62A 3O2AA 4NWCA 1MXWA 3LC8A 2GHBA 1MPBA 2FA7A 4ESWA 3UK4A 4F31B 5JK4A 4QF9A 3K1NA 3S9EA 4JB7A 3VE1B 2RCBA 1NNKA 5F1QA 5K2YA 1GVCA 2ONRA 3O29A 3TCGA 1TFAA 4EF1A 3VLUA 3U92A 1ZTYA 4EF2A 1LCFA 4GRKA 5I2NB 4DIGA 4BLAA 3H6VA 4POXA 4U21A 3JZJA 1B4ZA 4GD5A 1B3LA 1QKAA 3FVNA 4HCWA 1NH8A 2DS9A 4F3GA 3IB2A 2NOOA 1MH3A 3RT8A 1JW1A 5KZTA 4FECA 3QUJA 5I2KA 4FEDA 3U94A 3WAFA 3HPIA 3SEUA 2DYXA 2OBGA 1B52A 2A5TB 2F5XA 3RPWA 1IXCA 4OFOA 4JXIA 1GTKA 1ZJLA 2R6GE 3OD7A 5I84A 1B58A 3PPRA 3UP9A 1N76A 1L5TA 4OQOA 1VFDA 1JEUA 5I58A 5EHSA 1USYE 4G8MA 3C34A 3G3FA 3TKDA 3K02A 4NF4B 2ZNSA 4I1DA 2ZYNA 3C36A 4OERA 4LQ2A 1JQFA 3CSBA 3LSLA 3L6GA 5F7VA 5TP9B 4U23A 2REJA 4DDDA 3FXRA 1B4HA 2Q88A 1B5JA 2QS3A 4LZ5A 1P1UA 3UORA 1LAXA 3PV0E 1MM6A 4MLQA 2XXXA 4KR5A 4OENA 1UTHB 1M5CA 4R74A 3MW0A 4KI0E 2QL3A 3D4GA 5CMBA 2RC8A 3FV1A 3RQTA 4LA9A 3G3IA 2QPQA 5DVFA 5ITOA 4GL8A 1D9YA 4NEDA 5DEXB 1NH7A 2W7YA 2QMWA 5CM6A 1B3EA 1NNPA 2D21A 4LUBA 3TCHA 3PMVA 1ELJA 4R72A 4JWYA 2F6GA 2Z8DA 4PETA 5H8HA 3K6XA 4IO5A 1Y9UA 4KPTA 4L17A 2XXQA 2QSXA 3ZSFA 3TTRA 3K01A 3KFMA 3W9WA 5M2VA 4RPOA 4DXBA 4KQPA 1QW0A 1AH5A 1MM7A 1FTKA 4XKPA 3T9HB 1MY4A 3GBAA 4THIA 4PP0A 3IL1B 2V3QA 1LB8A 4OESA 3FIRA 3LUYA 5I56B 3C31A 2HEUA 2NUVA 3H03A 2I4BA 3G3HA 2V3TA 4ESXA 4E0XA 4ZEDA 5TU0A 4Q5TA 2O7UA 4YB5A 3DLNA 3IAZA 2I48A 5TPAB 3MBPA 3VLWA 2F36A 4JBZA 4OZ9A 3ECRA 4IO2A 3RNNA 1N84A 3HHFA 4GIZA 3C35A 1DTZA 3T9XB 1MS7A 4RYAA 3S9NC 4F39A 3K2DA 4R73A 3FVGA 4EUOA 1RKMA 4ND9A 3VXBA 1P1OA 3TTNA 4P11A 4F1YA 4F2OA 3OENA 4LVQA 3GBBA 1UIUA 2H99A 1US5A 1D4NA 4BDLA 3IJOB 1JVYA 1MY3A 3Q26A 4GFRA 2ZMBA 2HCAA 1O63A 4YMAA 2Q89A 3Q27A 1PC3A 2X7QA 4ECFA 3CRBA 3OEKA 3O28A 1MQDA 1QUJA 3M3KA 4O3AA 1MY1A 3O6HA 4ZEFA 4QSCA 4U4SA 1WDNA 3VVFA 2GRVA 2RC9A 4Q0CA 4NTLA 3FV2A 4U22A 2RF1A 5FHOA 4EQ9A 3RUMA 5KCJB 1HSJA 3MC2A 2ZNUA 2HAUA 3KGCA 1RYOA 4U4XA 3PPPA 2DP8A 4HS7A 1EZ9A 4AB6A 3A3CA 3KOTA 3U1OA 1VE4A 2XXYA 2D5WA 1B3FA 1N3XA 5A5XB 1IXHA 1SW4A 3KJ7A 4H8IA 3T96B 1SI1A 4TQUQ 2Q9TA 4G2ZA 4YKIA 4NMYA 3H4ZA 1DPEA 3SDFA 1MH4A 3OO6A 5I2NA 1MXVA 1A8EA 2DXYA 4R6YA 4LQ5A 3C33A 4QRZA 1D3KA 4IGRA 3N6TA 3MPKA 5ISUA 4EQ7A 1PB9A 4QFOA 2Y84A 1NFTA 2PT2A 4G4PA 1B3HA 1BP5A 3PD9A 1P1QA 3QXMA 2NWJA 1H76A 1H43A 5DYHA 3KBRA 2O6AA 3KSXA 4F3PA 1Q1KA 4YKKA 2Z8FA 3EN3A 3TTMA 3KN3A 4ZECA 3HSTA 4ELRA 3TODA 1GGGA 3DM0A 4LZ7A 2O69A 2ZYMA 4G68C 1QUIA 4IO4A 2VGQA 3GLBA 3QK6A 1YPNA 4NF4A 1LCTA 1FQAA 4OVJA 2UVHA 5CMKA 3VV5A 1UIVA 4ZE8A 1NNTA 3OO9A 2RC7A 4IY5A 4P0GA 1YCJA 2UVIA 2GFEA 4IY6A 4G8NA 2DQVA 3H6WA 4KYSA 3SESA 2XXHA 3G3JA 1B7UA 1NKXA 3KSJA 3PMWA 1B6HA 1UTHA 3IOWA 1MG1A 4ZEIA 4G8HA 3S9MC 4IO6A 1LFHA 1YAEA 4JWOA 2H5YA 4RA1A 3DP6A 4MFIA 1A8FA 3QAXA 5DEXA 4WEDA 1JETA 4ZEKA 5DVJA 4MBPA 2GHAA 1XS5A 2I58A 1BLFA 3IO4A 4G68B 1IZ1A 4OYVA 3TFLA 2Y7IA 2O68A 2OK2A 2I3WA 3R26A 2H4IA 5EHMA 2ONKE 3IB1A 4C1TA 1XC1A 4O3CA 3FVKA 4F22A 1AOVA 1LB9A 3A09A 5L9MA 1NMUA 5BWJA 3FJ7A 2D3IA 1I69A 4X9TA 3KN8A 4QFLA 1M5BA 1URDA 2X7PA 3IOVA 4R6HA 5CBSA 5I56A 3MP8A 2ABHA 5I59A 2VD3A 1AL3A 3MAMA 3TTLA 3CSGA 2DOJA 1B40A 5TPAA 2I3VA 4OETA 5B7DA 1A54A 2Z8EA 1LAHE 3IOUA 5K2XA 4H5GA 5AE4A 1JW5A 5HPQA 4KCCA 1B7HA 3TMGA 1BTJA 1SYIA 4YZZA 3O66A 1O64A 4QHQA 4IO7A 4N07A 4DCXA 1POTA 3R6UA 3FASA 4H67A 3MPLA 4R75A 4LP2B 3R7XA 3V89B 4FAJA 2ZNTA 1UTBB 2QS1A 4Z7EA 1H44A 3MP1A 1TWYA 4OWDA 1B3GA 4M1VA 3RGYA 1LBBA 5L9OA 4TLMB 1N7XA 4RNSA 4LATA 2DE2A 4NF8B 3RN8A 3V8XB 3RT6B 3JYRA 3SEXA 3TTKA 5L9SA 3UA8A 4EDPA 3CFXA 1VFEA 2HFBA 2V3UA 2ESNA 3TEPA 3CG3A 3PUVE 2F7CA 1D9VA 2XX9A 3MVXA 3PUWE 2AL5A 2B3FA 1B05A 3L6HA 2F8DA 5KCJA 4FEBA 3CFZA 2PVUA 3S2VA 2DVCA 2O7IA 1SW1A 3LSWA 5H8QB 5CC2A 5AA2A 2A5SA 2XD3A 4R9GA 5H8FB 3PPNA 4F1VA 2X26A 4AB5A 3Q28A 2Z22A 5A5XA 1OMPA 3ILTB 3HN0A 3H3GA 4GF8A 4H6DA 5KDTB 2F97A 4X1BA 1Y3PA 3H6UA 3HHGA 2AYSA 5IAIA 2THIA 2RCAA 1VR5A 3G3KA 2HZLA 1Z7NE 2QMXA 2I0CA 4NF5A 4EQBA 4UA8A 5ICTA 3ILUB 1OQGA 2B65A 4N13A 3VXCA 2XXWA 3DELB 4POWA 2BJJX 4GVOA 3WAEA 1B5IA 2Y7PA 2UVJA 4MH5A 3BFUA 1TFDA 3E4RA 1B2HA 1R6ZA 2DWJA 2F7BA 2HZKA 3G3GA 3OSQA 4K3FA 4BDRA 5ICQA 1JNFA 2M8CA 5DVIA 1FQFA 3SKPA 1MXZA 1LLSA 3TYHA 5HM4B 2UYEA 1MXYA 1ZKBA 3TQWA 1UQWA 4HW8A 4RJZA 1QVSA 3MJNA 1H3DA 4OFJA 3ZS6A 1HSEA 1FQDA 3F11A 4YAHX 4GXAA 2DWHA 4BDNA 4DXCA 1FCKA 1SD3A 2CZLA 1Y1MA 5JTYB 3OEMA 1H45A 2YLNA 4OTEA 2QRYA 2OZZA 1LAFE 2I4CA 3E9XA 2RKMA 4OXVA 2AIXA 2O1LA 3FJGA 1JEVA 4FE8A 2OCUA 4R6KA 2OLBA 3H6TA 2DWAA 2XHDA 4HCYA 2XXTA 1B51A 1LBCA 3JV9A 4H8JA 3SEVA 1SI0A 1IEJA 3TUSA 1MXUA 3PUYE 3VDFA 2F6PA 1EU8A 4DE8A 1EH3A 4G68A 3IX1A 4C1UA 2DE4A 3KZGA 5B70A 3PD8A 4GL0A 3THIA 1KWHA 3HO7A 1N3WA 4IO3A 4DLDA 1LGBC 2YJPA 3IORA 2GH9A 2VP1A 3IB0A 4U2RA 3OELA 1XVYA 3EQ1A 4GWOA 2XD2A 1N0TA 5FHNA 4ZDMA 1CB6A 4F18A 3V5AA 4YKJA 4ZE9A 3HCQA 1LFGA 3PUXE 3MUQA 4XIGQ 1TT1A 4GOTA 3N5LA 2YPNA 1FQEA 1PEBA 2ZXTA 3IR1A 3W15C 5IKBA 1OVBA 2VD2A 3MVYA 3KJTA 3B7DA 1IITA 1A7LA 3K6VA 3N26A 4JDFA 1LSTA 3KEIA 2DVZA 2A5TA 2XXUA 4NF6B 3K0VA 5CMMA 4ZZAA 3MZBA 4OEUA 1MDQA 1QJMA 1ZIUA 3T9VA 5ELVA 3A3UA 3OO8A 3CFLA 5L8DA 2HQ0A 3CI8A 3PUZE 2UXAA 2Q2AA 3RTFB 3GXAA 4OHNA 3LSFB 2HXWA 1XOCA 1SDXA 3GZGA 2E0SA 1XVXA 5TP9A 2G93A 4ZS9A 3I5OA 4NF8A 1Y3NA 4OFLA 3V83A 2Q2CA 3I3VA 1ZLQA 1Y4CA 1I6QA 4IB2A 3B6WA 3TPAA 4KD5A 4Z0IA 3BFTA 3SETA 5AA4B 2LAOA 1WODA 4MF3A 2E1SA 1WVJA 3K00A 2XXVA 2P2AA 1POY1 5AA1A 4PFTA 3T93B 5H8QA 1ZBMA 1XHYA 5I57B 4H0WA 4YB6A 2QJEA 5H8FA 4ONYA 3UGWA 3G7WA 2PT1A 2H9BA 1SW2A 4ZZEA 3EHUA 3M3FA 3N94A 3QSLA 4C0RA 3IOTA 5KDTA 1SW5A 2H25A 4H65A 3VVEA 2P0SA 5FHMA 1R9QA 2I49A 5DTBA 2V25A 3PGFA 4I8CA 2OWTA 3VLVA 3UN6A 1B0LA 4AQ4A 3FXUA 1ZU0A 3MZ1A 1NL5A 1PDAA 4XKRA 2Z23A 1M5FA 5AA2D 4RXLA 1PBQA 1I6BA 2V93A 3HV1A 3K6UA 2UVGA 4PFUA 3MP6A 2NVUB 2VOZA 4FIMA 4QFKA 1R1NA 1DTGA 4R2FA 3QYTA 1B32A 4BDQA 1LFIA 4F1UA 3C4MA 1OLAA 3RY3A 4QSDA 3OO7A 3PMXA 4KYDA 3LBSA 1SYHA 4Q30B 4QFPA 5FTHA 3FZVA 1NNFA 2XX7A 1SQYA 4HTGA 4DXUA 4WXJA 3RTWB 4FJPA 1PB8A 4TLLB 3CIJA 1S50A 5CI5A 5JTYA 3Q29A 4OMBA 1S9TA 4U1OA 2DWIA 1ANFA 4KCDA 1PBPA 1Y3QA 3OMBA 2OWSA 1O7TA 1FW0A 2Y7RA 3VFJA 1LAGE 2DE3A 3MVZA 3KG2A 3M8UA 3MZ9A 1A40A 4RY1A 2I0BA 5H8NB 3IK6B 1DMBA 2WKYA 1MPCA 3OXNA 3OOAA 1B1HA 3U93A 5J1DA 3PU5A 4GLIA 2F34A 3T66A 1P1WA 3K1MA 1B5HA 3EPEA 4H5FA 2XXPA 4RPNA 4YB7A 3B6TA 3MVWA 1FTMA 2KLFA 4PFYA 1IXIA 1Z7ME 4ISUA 2XXIA 4PE5B 2O51A 3K4UA 2RINA 3C32A 4WEPA 3PPQA 1URGA 4EXLA 1T0KA 1I6AA 1YTVA 3CVGA 1FQBA 1PB7A 4FATA 3ONMA 5FTIA 5AA3A 4KFQA 4YMBA 2DSFA 3FATA 3T22A 4MLVA 1M5EA 3H7MA 3OSRA 3VVDA 1DPPA 4FORA 2Q8JA 2UYFA 1TXFA 1USYH 3O97A 3DP4A 3UIFA 1SBPA 4XXUA 5JEIA 1QULA 2DXRA 3TDJA 2NXOA 3O6IA 1HSLA 3IJXB 3U72A 4NF6A 4LONB 3BBRA 1B46A 1OLCA 2I6EA 2IA4A 3E13X 3MQ9A 4QSEA 4WKMA 5I59B 4OEVA 4BDOA 4IGTA 2G29A 2F35A 5EYFA 4F3BA 2PX1A 1OVTA 3FGSA 1QKBA 3BKIB 2XXRA 1DOTA 1MRPA 3ZKKA 5I2KB 3FUZA 2ZYKA 4JSOA 4E0WA 3SEYA 3Q25A 3C9HA 2PYYA 4RK9A 1MQIA 3SERA 2AL4A 1CE2A 5I58B 2HAVA 5AA4A 1US4A 4U1ZA 5CMCA 1MY0A 1B7ZA 3EHTA 5DT6A 2XX8A 3FVOA 2V84A 3W9VA 4F3SA 2ALUA 3TELA 4F2QA 3LR1A 1AMFA 5I57A 4F29A 2Y7KA 4XKQA 4ELOA 1MQHA 2O1MA 4P0IA 3EF7A 3FJMA 3USDA 5BUUA 1URSA 2PMSA 3QIMA 3LSXA 1S7YA 2F7AA 3TAJA 1IXGA 3D4CA 1EZPA 1M5DA 1OIBA 4LZ8A 3RLFE 3TCFA 1RYXA 1MPDA 4R2BA 5AA2B 4R9FA 4TOZA 4ELQA 4GQOA 4DCYA 1MDP1 3KN7A 3FXQA 4Q8RA 2IEEA 4PFWA 1SVXB 4GXSB 3PPOA 4H1XA 5H8HB 3M3LA 5CBRA 1QUKA 4M4GA 5HBCA 3S9LC 3B6QA 3I6VA 1MQJA 1Y1ZA 1FTJA 1VSOA 4XTCQ 2R71A 4QFNA 4DZ1A 1Y20A 5LOMA 1J1NA 1OQHA 2CMOA 4PQJA 1MXXA 4RK2A 2PBWA 4NF5B 1FTLA 1FTOA 5CRYA 3E3KA 3TZAA 3QUFA 1BKAA 4N6PA 4ZEBA 1N04A 3CR9A 1ZMGA 3IO6A 3DP8A 4I9DA 3P7IA 1A55A 2ANJA 1A99A 1JW4A 1GV8A 2QS4A 1UTBA 4YICA 2P1SA 4BDMA 3KOSA 3SEWA 1Y4TA 4ELPA 3S4UA 1AIVA 3TQLA 2O84X 4UACA 3ZKLA 4YU0A 1IQ7A 1MY2A 4EXKA 3K1PA 1XT8A 3AXFA 3CG1A 3O9PA 2Y7WA 4O3BA 1N7WA 3O6GA 5H8NA 1R9LA 2OJTA 2ONSA 2QS2A 1P99A 3H06B 1B1XA 2H98A 2REGA 1EZOA 1GR2A 1IUDA 1II5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MEVA 1F9BA 3B50A 3N6UA 1B9JA 3U8QA 4X1DA 1ATGA 1AWBA 5H8SA 2L5VA 3IFCA 1MQGA 2R9JA 4X48A 3EHSA 2VHAA 1Q35A 1P1NA 2FNCA 2FYIA 1IIWA 2ZYOA 1FQCA 5IZ1A 3IFAA 3FD3A 2B3BA 1B0HA 4NWDA 4KHZE 1JVXA 3ODBA 4YKPA 2F78A 4NE4A 3K6WA 3KBZA 4JSDA 3T9UA 1BIYA 4F19A 5ITPA 4JWXA 1DSNA 3MWBA 4G77A 4KYEA 1Q9DA 4XKNA 4I62A 3O2AA 5ET7A 4NWCA 1MXWA 3LC8A 2XWVA 2GHBA 1MPBA 2FA7A 3LV0A 4ESWA 3UK4A 4F31B 5JK4A 4QF9A 5EYGA 4N91A 3K1NA 3S9EA 4JB7A 3VE1B 2RCBA 2ZZWA 1NNKA 2Q74A 5F1QA 5K2YA 1GVCA 2ONRA 3O29A 3TCGA 1TFAA 4EF1A 3VLUA 3U92A 1ZTYA 4EF2A 1LCFA 4GRKA 5I2NB 4DIGA 4BLAA 1FBPA 3H6VA 4PGNA 4POXA 4U21A 4NN3A 3JZJA 1NI9A 1B4ZA 4GD5A 4P47A 1B3LA 1QKAA 3FVNA 4HCWA 1NH8A 2DS9A 4F3GA 4OVTA 3IB2A 5EQ7A 3MSTA 2NOOA 1MH3A 3RT8A 1JW1A 5KZTA 4FECA 3QUJA 5I2KA 4FEDA 3U94A 3WAFA 3HPIA 3SEUA 4MNCA 2DYXA 2OBGA 1B52A 2FIXA 2A5TB 2F5XA 4HE1A 4JVDA 3RPWA 1IXCA 4OFOA 4JXIA 1GTKA 1ZJLA 2R6GE 3OD7A 5I84A 1B58A 3PPRA 3UP9A 1N76A 1L5TA 4OQOA 1VFDA 1EYIA 1JEUA 5I58A 1FPBA 3CHGA 5EHSA 1USYE 4G8MA 3C34A 3G3FA 3TKDA 3K02A 4NF4B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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