1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
3CFLA 3PUXE 4P0GA 1UTBB 2I4BA 4G4PA 1Q1KA 4WEPA 2E0SA 4QSEA 2HXWA 4Z0IA 2PVUA 1AIVA 4F1UA 1A40A 1R1NA 2DS9A 5CMMA 4G68A 4IB2A 1BLFA 1LAHE 2DE3A 4BDNA 4TLMB 3U92A 3KBRA 3TODA 3PD8A 2PX1A 3IB2A 4RK9A 4PFTA 4GRKA 1LAFE 3DP4A 1PBQA 4PP0A 1M5FA 2H9BA 1TXFA 1D9VA 1SW5A 3O29A 3C34A 3G3GA 3C33A 4O3AA 5FTHA 1VFEA 1ZIUA 3ILUB 1N3XA 3EHSA 4EQBA 2F7BA 2D21A 4HCYA 4H1XA 3FVGA 3E4RA 2NWJA 5DTBA 3T96B 1GVCA 4DCYA 1SQYA 4LA9A 2GRVA 2DWIA 2UXAA 1ZMGA 4OESA 4R9GA 2O51A 3G3HA 5KZTA 3A3UA 1S7YA 1H43A 2ONRA 1A55A 2O1LA 4IO4A 4GL0A 3G3IA 3DP8A 3TTMA 5HM4B 3N6TA 3K0VA 3G3FA 3SESA 3Q29A 3L6HA 5CM6A 1IUDA 5CI5A 2DYXA 3KGCA 5CMBA 1FTMA 3UA8A 3W15C 4AB6A 5JEIA 1LBCA 5JTYA 1US4A 5I2KB 1AOVA 3MVYA 4PETA 3LSLA 3O6IA 2DE4A 1N3WA 1CB6A 5DEXB 3IL1B 2GHAA 2OLBA 3CR9A 3OO8A 1Y4CA 4X1DA 3IB1A 4F18A 3FXUA 4R73A 2DWAA 4NMYA 4HTGA 3D4CA 3B6WA 3C9HA 3PMVA 4C1UA 4OERA 4EXLA 4THIA 1PC3A 4GXAA 1ZTYA 5H8NA 4DCXA 3PPNA 3FUZA 1FTJA 1B32A 4PFUA 2I49A 4G8MA 4M1VA 1MQIA 4UACA 1DOTA 1FTLA 1N04A 3IO6A 4KYEA 5L9MA 4NE4A 4YKPA 4U22A 3PD9A 4C0RA 3JV9A 4JDFA 2NOOA 1FW0A 5EHSA 3M3KA 5KCJA 2AIXA 4LVQA 4H65A 3DM0A 1Y3QA 3OD7A 4C1TA 1MY0A 3FATA 4F31B 1OQGA 1LAXA 1OLCA 4OEUA 3USDA 2R71A 2DXRA 2UYFA 5L9OA 4NF5A 3H6WA 4KR5A 3K6VA 1ZU0A 2G29A 3MPLA 4R2FA 2F35A 3TTKA 3OENA 1SI0A 3VDFA 1B6HA 1B7HA 1N84A 3H4ZA 3TEPA 2XXYA 2OJTA 3OEMA 2F97A 3O97A 3IOTA 1B58A 1P1OA 3ZKLA 4MLQA 4NF8A 4ESXA 3HSTA 3SKPA 2HQ0A 3VXBA 3SEWA 1LCTA 1JQFA 4G77A 5JTYB 3OXNA 1MRPA 5AA2A 1P1NA 4ISUA 4JSOA 4N07A 3FV1A 1L5TA 3KOSA 4GWOA 3HCQA 1UTHA 3T9HB 2XD2A 1B52A 2XX9A 5H8SA 1MY2A 4I1DA 4ZECA 4OFJA 3FJ7A 3F11A 1FQEA 3TUSA 5IKBA 4P0IA 3TZAA 4IO2A 1JW1A 4RPOA 2ZYMA 4MH5A 3RPWA 2PYYA 4HW8A 3OO9A 3DELB 5H8NB 3PMXA 1A8FA 4H67A 2UVJA 1YTVA 1LCFA 3H6TA 5TU0A 1DSNA 2UVGA 3VV5A 3IO4A 3RT6B 2GH9A 2XX7A 3SETA 5HBCA 5K2XA 1IIWA 2VOZA 2XXHA 1SD3A 2RINA 4DLDA 3KEIA 3FV2A 4NWCA 2H25A 1USYE 1UTBA 4ZZAA 5KCJB 3C35A 3TTNA 3KOTA 3KN8A 3QSLA 2DVZA 3FD3A 4Q0CA 3PPPA 3DLNA 3FGSA 4DIGA 3KJTA 1NMUA 4FIMA 4YU0A 1QULA 3RGYA 2THIA 4NF4B 4BDMA 3W9WA 3TQLA 4JXIA 5I56A 3E9XA 2KLFA 5AE4A 1ANFA 1NH8A 4NF5B 4GFRA 2V3QA 1FTOA 4Q8RA 1EZOA 2XD3A 4OENA 1B1HA 2DQVA 4LATA 1IXIA 4QHQA 3CG3A 1XC1A 3RTWB 1LFGA 4BLAA 1FCKA 1B3LA 5ITOA 1M5DA 4BDOA 3G3JA 1VFDA 3VVEA 1A99A 3TTLA 5DVJA 3KJ7A 2OCUA 4N6PA 4NF8B 2X26A 3E3KA 3QK6A 1MS7A 4OMBA 3CG1A 3RY3A 1B51A 4MFIA 5AA2B 3E13X 2DXYA 1MQHA 4I62A 4KYDA 4KPTA 1B0LA 1B3HA 1UTHB 4TOZA 2AYSA 4F39A 2RKMA 1NKXA 4FEDA 2I3VA 2Y7RA 1NNKA 3OOAA 1Y3NA 3OSRA 1TT1A 2ABHA 4U1ZA 4U21A 2I48A 1Y3PA 4AB5A 3D4GA 1JW4A 5I2NB 5DEXA 1Y9UA 1GTKA 3H7MA 1O7TA 1BP5A 3CSBA 5I84A 4FATA 1Y4TA 2GFEA 3O9PA 4OYVA 3B6QA 1O63A 3HN0A 2XXIA 1P1QA 1R9QA 3TAJA 1EH3A 3H6UA 2Z8FA 4POWA 2AL4A 3ONMA 1VSOA 1Q35A 3PUVE 1B0HA 2XXRA 4ZEIA 1B05A 2XXTA 2O69A 1N7XA 4I8CA 2HZKA 4JWYA 4G68C 1FQBA 4H6DA 1QUJA 4AQ4A 2XXUA 1MPDA 3SEXA 5I56B 5FHMA 3K2DA 3TDJA 5K2YA 5EYFA 3PGFA 4KQPA 3C36A 4EXKA 3CIJA 4IO7A 1JW5A 3OO7A 1POY1 3V83A 3OEKA 1F9BA 3MZ9A 5BUUA 2ZYOA 3PPQA 4QSCA 2HFBA 3EHTA 3V89B 2YJPA 2ALUA 4IGRA 3JZJA 3GBBA 3TCGA 2FNCA 2ANJA 3QYTA 4H0WA 1N7WA 1SW1A 1S9TA 3MZBA 1POTA 3CRBA 4OTEA 3PV0E 1DPEA 3M3LA 3IJOB 3PU5A 5IAIA 3L6GA 3VE1B 4E0WA 2V25A 1N76A 3RNNA 1DPPA 4IO5A 2W7YA 1RYOA 2B65A 2ESNA 4JWOA 4ZE9A 2Z8EA 2Y7IA 1XOCA 3U93A 4ZEFA 3KSJA 2Q8JA 3ZSFA 1DMBA 2BJJX 1A7LA 3K00A 4BDLA 5J1DA 5TPAA 4FECA 3CI8A 4KCDA 1Z7ME 1JNFA 2VGQA 4QFKA 5ICQA 1PBPA 1PDAA 1URGA 3LUYA 2DSFA 2QSXA 3N26A 4K3FA 3N94A 3FJMA 3PMWA 4EF1A 4ZEDA 1GR2A 3LC8A 1BTJA 2QRYA 1QKAA 1FQDA 1DTZA 4YB5A 3MUQA 1YPNA 5FHOA 1RYXA 4X1BA 1SI1A 1WODA 5B7DA 3FJGA 1P1WA 1I6QA 4GOTA 4XKPA 4OEVA 4RYAA 1QUIA 4N13A 3OELA 5FHNA 1D9YA 4XKRA 3RTFB 1MXWA 1QW0A 3AXFA 2XXPA 2ZYNA 3KFMA 4GQOA 1B1XA 4F19A 3FXQA 3IK6B 3K4UA 3VLWA 4KYSA 2YPNA 3K6XA 1LLSA 5L9SA 4YB7A 1FTKA 4I9DA 2Q2AA 4NF4A 1JVXA 5I59A 1SVXB 1PEBA 1S50A 3UGWA 4EQ9A 5CRYA 1GV8A 2ZXTA 4LP2B 2RC7A 2QS4A 3KN7A 1Y1MA 1HSJA 1B46A 4EQ7A 5I58A 4O3CA 1VR5A 3BBRA 4G8HA 1XS5A 3LR1A 1Z7NE 1GGGA 2Y7PA 2X7QA 3MQ9A 5H8QA 4RPNA 3V5AA 1QUKA 2ZYKA 4PE5B 3B7DA 1ELJA 1M5CA 2D3IA 5ELVA 1TWYA 1A8EA 1JVYA 3PUZE 3IX1A 4LUBA 3SEVA 3THIA 2DP8A 4G8NA 4NF6B 4QF9A 4KFQA 2Q89A 1B2HA 4JBZA 2RF1A 4DE8A 3CSGA 4U4SA 1FQFA 4YKJA 4EUOA 2D5WA 5TPAB 4NWDA 3MP1A 4OXVA 3U8QA 3KG2A 5F7VA 2DOJA 1LB8A 2HAUA 3W9VA 3R6UA 4DXCA 2B3BA 4X48A 1QKBA 2F7CA 3TQWA 3HHGA 2IA4A 4R6HA 4LZ7A 5FTIA 4FORA 4ESWA 3UORA 2ZNUA 3VFJA 2UYEA 3UIFA 2AL5A 5I2NA 4YZZA 3V8XB 2H4IA 4QRZA 1Y20A 1B5HA 1XVXA 2QS3A 2RC8A 4JB7A 3O28A 3IOWA 3SERA 4DXBA 3GXAA 2WKYA 1H76A 3FVKA 3B6TA 4YMAA 4F3PA 4XTCQ 3K1MA 1B5IA 3U1OA 2YLNA 1IZ1A 1MXYA 1LFHA 4IO6A 1MDP1 3RN8A 4YKIA 3RT8A 4R6KA 2OWTA 1OIBA 1PB9A 1MXXA 5I59B 3K1PA 3IB0A 3U72A 1BKAA 1HSLA 4OWDA 1YAEA 4JWXA 1XT8A 3IORA 4PFWA 1SW2A 3FVOA 1ZBMA 3MWBA 3M3FA 1ZKBA 1NL5A 4GF8A 2PBWA 5I58B 4MBPA 2O6AA 2RC9A 5H8QB 1MXUA 3MPKA 4Z7EA 1EU8A 1P99A 4RK2A 2DE2A 4MLVA 2CZLA 4F2QA 2HEUA 1URDA 4KI0E 4GL8A 3K01A 5AA1A 4PQJA 1WVJA 2XXWA 3MC2A 2F6PA 2QPQA 5DYHA 2O1MA 3MBPA 3H6VA 4F3SA 1OVTA 5AA2D 4RA1A 3EF7A 2I3WA 4BDQA 3BFTA 3C31A 4H8JA 2P1SA 1Y1ZA 4ZE8A 2QL3A 3PUWE 2OBGA 4F2OA 1OQHA 2FYIA 3Q28A 1MQGA 1MH3A 2Q9TA 2X7PA 3Q26A 3UK4A 3S9EA 2I58A 3OSQA 1UIVA 4U4XA 2NUVA 3MVXA 1B5JA 3ZS6A 3O6GA 3EHUA 2P0SA 1OMPA 4F29A 4XKQA 2HZLA 4H8IA 3TELA 3GLBA 1LBBA 2QMXA 5ISUA 3R26A 5H8HA 4PFYA 1LFIA 1MM7A 2REGA 4YMBA 3K1NA 3O2AA 3K6WA 4DXUA 5KDTB 2O7UA 4H5FA 3RLFE 1MY1A 2F78A 5TP9A 1NH7A 1JETA 5DVFA 1KWHA 3TCHA 2PMSA 2ZMBA 3I3VA 5I57A 3T93B 3WAFA 3S2VA 2OWSA 4ELPA 3H06B 4TQUQ 1M5EA 3ODBA 4GVOA 1H45A 5JK4A 1LGBC 4OQOA 4P11A 5CBRA 1HSEA 4HS7A 3Q27A 4KCCA 1AH5A 4IY6A 5B70A 3Q25A 4IO3A 1B40A 3EN3A 1IXCA 4H5GA 4XIGQ 4FE8A 3LSFB 1D3KA 2V84A 2DWHA 1MY3A 2NXOA 5ITPA 1B3GA 3HV1A 3VLVA 1PB7A 3LSXA 2Y7WA 3KZGA 4RXLA 4YKKA 3A09A 3MJNA 1NNPA 4R75A 5HPQA 2XX8A 2HCAA 1PB8A 3UN6A 1A54A 4HCWA 3CVGA 3DP6A 4ZEKA 4IGTA 4ELOA 1ZLQA 3IAZA 5A5XA 3S9NC 3S9MC 2UVHA 3S4UA 1B4ZA 5CMCA 2Q88A 4JSDA 4QFOA 2R9JA 3T9VA 2ONKE 4Q30B 3TKDA 1DTGA 4LQ2A 3MVWA 4NF6A 3FIRA 2Z23A 3MP6A 2HAVA 1I6BA 2VP1A 4GIZA 4IY5A 3FXRA 4R9FA 2F8DA 1EZ9A 2QS1A 1N0TA 4WEDA 3VVFA 2H99A 2PT2A 4R72A 1B7ZA 2CMOA 1TFAA 3UP9A 3CFXA 3ILTB 3MVZA 4L17A 1TFDA 1XHYA 2O84X 2XXQA 3VLUA 5H8HB 1LB9A 3QUJA 1R9LA 2O7IA 3RUMA 4XXUA 1H3DA 5F1QA 4QFNA 2F6GA 1P1UA 2V3UA 5TP9B 3IJXB 3SDFA 4EF2A 5BWJA 4U23A 5I57B 2VD3A 2I4CA 2RCBA 2UVIA 3O6HA 4ND9A 2FA7A 1UIUA 3T66A 1SYIA 1SDXA 3HO7A 5AA4A 3IR1A 3PPOA 2IEEA 2XHDA 3T9UA 3P7IA 5CMKA 4F3GA 1FQCA 3PUYE 1OLAA 1MM6A 2ONSA 4G68B 5LOMA 3T9XB 3WAEA 4ECFA 4KD5A 3KSXA 1MXZA 1US5A 2REJA 2Q2CA 3MW0A 2M8CA 4ZS9A 1D4NA 1ZJLA 2VHAA 3VVDA 1T0KA 4ZDMA 4TLLB 4EDPA 4O3BA 4WKMA 3BFUA 3MAMA 3H3GA 3KN3A 3OO6A 2H5YA 1I69A 3TFLA 2F36A 5A5XB 1QVSA 1IXGA 1AL3A 1QJMA 3H03A 2H98A 2I0CA 1MY4A 1IEJA 4FEBA 3N5LA 4OFOA 3GBAA 4DZ1A 2A5TA 3EQ1A 3HHFA 4WXJA 1NNTA 5M2VA 2F5XA 1SW4A 4BDRA 2QJEA 5CC2A 3EPEA 5AA3A 4POXA 2OK2A 4R6YA 2VD2A 5ICTA 3PPRA 4ZEBA 2Z8DA 2QMWA 2QS2A 4LZ5A 1IQ7A 1NFTA 1B3FA 4U2RA 3LBSA 3TPAA 4F1YA 1B3EA 1URSA 3IOVA 1MDQA 5H8FA 3S9LC 2B3FA 4F3BA 4RY1A 4RNSA 5DT6A 2Y7KA 4M4GA 4GLIA 4QSDA 3FASA 4YAHX 3TTRA 3TYHA 3JYRA 3QAXA 4MF3A 1WDNA 1IITA 4LQ5A 3OMBA 2GHBA 1MH4A 4NTLA 2Y84A 5AA4B 3LSWA 1XVYA 1CE2A 1J1NA 5KDTA 1II5A 4E0XA 1UQWA 2A5SA 4LONB 2P2AA 2ZNSA 2Z22A 4OHNA 4ONYA 2E1SA 3ECRA 3M8UA 5EHMA 4ELQA 1SYHA 3QIMA 1MQJA 1IXHA 2DWJA 3SEYA 1R6ZA 2OZZA 3HPIA 1RKMA 3GZGA 4UA8A 1EZPA 1JEUA 2F34A 4GXSB 4DDDA 3O66A 3MP8A 4X9TA 1B7UA 1NNFA 3FVNA 3IOUA 3ZKKA 1O64A 4R2BA 1LSTA 1OVBA 1MPBA 4Q5TA 2F7AA 1B9JA 3QXMA 2PT1A 4OZ9A 2NVUB 2LAOA 2XXVA 3I6VA 3RQTA 2XXXA 3K6UA 4RJZA 1BIYA 1JEVA 2A5TB 3C4MA 4QFLA 1LAGE 2G93A 1FQAA 3BKIB 5DVIA 4F22A 4ZZEA 4OETA 3A3CA 3FZVA 3R7XA 4F1VA 3MZ1A 3U94A 2O68A 4ELRA 5CBSA 1MPCA 3CFZA 1VE4A 5H8FB 1MXVA 2V93A 3G7WA 4LZ8A 3C32A 1USYH 4XKNA 2V3TA 3G3KA 3VXCA 3N6UA 1B4HA 4QFPA 4YB6A 2DVCA 3SEUA 4U1OA 1M5BA 1MG1A 4FJPA 4G2ZA 3I5OA 4KHZE 3K02A 4R74A 3QUFA 4GD5A 3TMGA 1I6AA 2R6GE 5I2KA 4OFLA 2I6EA 2I0BA 4NEDA 5L8DA 2ZNTA 4OVJA 3T22A 1YCJA 1ATGA 1SBPA 3TCFA 4YICA 1AMFA 1MQDA 4FAJA 1H44A 2RCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CFLA 3PUXE 4P0GA 1UTBB 2I4BA 5I7IA 4G4PA 1Q1KA 4WEPA 2E0SA 4QSEA 2HXWA 4Z0IA 3IFCA 2PVUA 1AIVA 4F1UA 3HFUA 1A40A 5ET8A 1R1NA 2DS9A 5CMMA 4G68A 4IB2A 1BLFA 1LAHE 2DE3A 4BDNA 2OX3A 4TLMB 1G0IA 4PGNA 4N91A 3U92A 3KBRA 3TODA 3PD8A 1FJ9A 2PX1A 2QVRA 3IB2A 4RK9A 4PFTA 4GRKA 1LAFE 3DP4A 1PBQA 4PP0A 1M5FA 5ET6A 2H9BA 1DK4A 1TXFA 1D9VA 1SW5A 3O29A 3C34A 3G3GA 3C33A 4O3AA 5FTHA 1VFEA 1ZIUA 3ILUB 4PBQA 1N3XA 4AS4A 3EHSA 4EQBA 2F7BA 2D21A 4HCYA 4H1XA 3FVGA 3E4RA 2NWJA 1FBEA 5DTBA 1FBPA 3T96B 1GVCA 4DCYA 1SQYA 4LA9A 2GRVA 2DWIA 2CEYA 1NV3A 2UXAA 1ZMGA 4OESA 4R9GA 2O51A 3G3HA 5KZTA 3A3UA 1S7YA 1KA1A 2HXRA 1H43A 2ONRA 1A55A 2O1LA 4PFRA 4IO4A 4GL0A 3G3IA 3DP8A 3TTMA 4H46A 5HM4B 3N6TA 3K0VA 3G3FA 3SESA 3Q29A 3L6HA 5CM6A 1IUDA 5CI5A 2DYXA 3KGCA 5CMBA 1FTMA 3UA8A 3W15C 4AB6A 5JEIA 1BK4A 3RPLA 4GWYA 2FHYA 1LBCA 5JTYA 1US4A 5I2KB 2VPNA 1AOVA 3MVYA 4PETA 3LSLA 3O6IA 2DE4A 1N3WA 1CB6A 5DEXB 3IL1B 2GHAA 2OLBA 3CR9A 3OO8A 1Y4CA 4P9KA 4X1DA 3IB1A 4F18A 3FXUA 4R73A 2DWAA 4XFEA 4NMYA 4HTGA 3D4CA 3B6WA 3C9HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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