1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
1II5A 1MS7A 4F1VA 2QJEA 3TCGA 3QXMA 5JTYB 1UTHB 4FORA 1P1UA 1JVYA 1UQWA 4LA9A 1LFHA 2F7AA 3MZBA 4RYAA 3RQTA 1OMPA 2V93A 3PUVE 2R6GE 4C1TA 5DT6A 2ONRA 5A5XB 5ICTA 4NF8B 3HPIA 4U2RA 4JWYA 1QUIA 1IUDA 3PD8A 3OO6A 1MM7A 1BKAA 4XXUA 1JW5A 2XHDA 2DS9A 1B58A 3S9LC 4N13A 1MQDA 4XKRA 1JNFA 5TP9A 3SDFA 1MXVA 1URGA 4BDNA 3LSLA 3K01A 1BTJA 5K2XA 2GHBA 4DCYA 3M3LA 4Q0CA 5H8FB 3K0VA 2QS3A 4DXUA 2GHAA 1SVXB 4F3SA 5KDTB 3DP4A 1AIVA 3TKDA 2P2AA 4ESXA 5CMCA 2RCBA 2F7BA 2PYYA 3VXCA 2NVUB 5I56A 4H0WA 4XKQA 4N07A 3PGFA 4FECA 1AL3A 4ZEKA 3PPNA 2XXWA 5JEIA 3H06B 2FYIA 3OOAA 4YZZA 1IXIA 4NF5B 3TMGA 1O64A 2KLFA 4EQBA 3ILUB 1Q35A 3HV1A 1B0LA 5J1DA 1DMBA 3FV2A 3MVXA 4KPTA 4IO3A 1LCFA 4QFLA 1XHYA 2Z23A 1BLFA 2GH9A 5CBRA 1WODA 1KWHA 4U23A 4F3BA 3FVNA 5K2YA 2OBGA 2F34A 2DOJA 3G3IA 2I3VA 4HS7A 4ELOA 4RK2A 1OVTA 5AA2A 2VOZA 4X1DA 1T0KA 1HSEA 2V25A 3FVKA 3K6VA 4O3CA 3B6WA 2DWHA 3KBRA 5L9MA 4JB7A 3UN6A 3R6UA 1VE4A 4R2FA 4E0XA 4XKPA 1QULA 2DQVA 1JEVA 4I9DA 2DWJA 3FJMA 3TTLA 4H8JA 1WDNA 2UVIA 3MUQA 3QIMA 4OFJA 2IEEA 3LSFB 4N6PA 3VLWA 4BDLA 1B32A 3E9XA 4QFOA 3QAXA 3K6WA 4QFKA 1MQGA 2PT1A 1Y3PA 1FTLA 2QS1A 4G8MA 3CI8A 2QL3A 1NL5A 2M8CA 1R1NA 4C0RA 5EHSA 2DWAA 5IKBA 3O28A 4G8HA 2R9JA 2Z8EA 4HW8A 2UVGA 5CMKA 3HHFA 3O97A 3H6VA 4AQ4A 2VD2A 3OEKA 1NNKA 2I48A 3K4UA 4GQOA 2XXTA 1B52A 5CI5A 4OQOA 3MVZA 1IITA 4FEDA 2UXAA 3EHTA 1QW0A 1UTBB 1VSOA 1MRPA 1NH7A 3SEYA 4KCDA 3CRBA 2ONSA 1LGBC 2ZNSA 3A3UA 4C1UA 4ELQA 3KGCA 1NNTA 3IL1B 4R73A 1GTKA 5CMBA 3CIJA 2XXHA 3EF7A 2H98A 3TQLA 1MH4A 1M5FA 5B70A 3JV9A 3N6TA 3SKPA 4EUOA 1M5CA 4HCWA 1Y3NA 4NMYA 2X7PA 4EDPA 1XT8A 1D9VA 2UVJA 2AL4A 2Q2AA 3ZS6A 2V84A 1JVXA 3WAFA 3N6UA 4ZZAA 2ESNA 3RPWA 2P0SA 5ITPA 4OYVA 2F5XA 4ZECA 5AA3A 3AXFA 3CVGA 4X1BA 2UYEA 3O66A 2XD2A 4I62A 2HAVA 3T9VA 3PD9A 4NF6B 4O3BA 4F22A 1Z7NE 2ANJA 1B6HA 5I2KA 3O2AA 3CR9A 1H44A 3H6UA 5CRYA 2A5TB 4YB6A 3GXAA 1P99A 3FJGA 5FHMA 4RJZA 3KN3A 1MQHA 2V3UA 5AA2D 2Y7KA 1N7WA 3O9PA 3QUFA 1B5HA 3MWBA 3IR1A 4G68B 4IGRA 3FATA 3TEPA 1MQJA 4ECFA 2THIA 1LB9A 4I8CA 3M3FA 1RKMA 2O69A 3E3KA 3K6XA 3T9XB 3JYRA 1B9JA 4LONB 2UVHA 3FASA 4KYEA 4LZ5A 3MQ9A 2DXRA 4U22A 5H8HB 1EZ9A 2D3IA 3CFZA 3FXRA 4GXAA 4RPOA 3OXNA 4FATA 2AL5A 4FE8A 1ZBMA 3OSRA 4RXLA 2PBWA 1Y3QA 3C32A 3CSGA 5FHOA 4GRKA 2REJA 4IB2A 4X48A 5H8NB 3SEVA 3PMWA 2G93A 3IOTA 4R75A 5L9SA 4PFYA 4FJPA 1H3DA 3BFTA 3SESA 1TFAA 1B3GA 5F7VA 2Q2CA 2H9BA 4ZEBA 4U21A 5CMMA 1O7TA 1ZMGA 4H67A 1B7ZA 1JEUA 1BP5A 1HSLA 1Y1MA 3WAEA 3FD3A 4R74A 4IY6A 1A55A 3PV0E 4AB6A 4DLDA 3RLFE 1N3WA 3ONMA 4BDRA 4LZ7A 4ZZEA 1A7LA 4Z7EA 4PE5B 2QMXA 1GV8A 4H8IA 4F1UA 4QRZA 4OETA 5I59A 1US4A 3HCQA 1SI0A 3JZJA 5FTHA 3MVWA 3K00A 1EZPA 3SETA 1ANFA 5I58A 4R72A 2E1SA 2V3TA 4R6YA 1TWYA 4TLLB 1FTKA 5CM6A 3IOUA 4IY5A 3TAJA 1ZJLA 1OIBA 4LQ2A 1A8EA 4JXIA 3C9HA 2QS2A 4NF4A 3RNNA 3FIRA 5L8DA 3IJXB 2DE4A 4LZ8A 2O1LA 3DP6A 1B05A 2NOOA 2OLBA 2F78A 5FTIA 3W9VA 5EYFA 4BLAA 3IOWA 4EF2A 3H03A 4YKPA 3R26A 5JTYA 3MVYA 3D4GA 1UTHA 2R71A 4UACA 3EPEA 2O1MA 2X26A 1FTMA 1POTA 3PMVA 3VFJA 1LB8A 3IB0A 3USDA 3CSBA 1RYXA 4Q5TA 2FA7A 2ZNTA 1IXHA 2ZNUA 5A5XA 4RPNA 1B5JA 4NF8A 1POY1 2RINA 3FGSA 3E13X 3KSXA 5AA4B 5LOMA 2D5WA 2ABHA 4RK9A 5DVFA 2G29A 1B4HA 1LSTA 3T9UA 5AA1A 3IAZA 3P7IA 1YTVA 3MC2A 1LAXA 3H6WA 2OCUA 2B3BA 1J1NA 2F8DA 3LBSA 3VXBA 4NEDA 3TTMA 4KFQA 4RNSA 4MLQA 1VFDA 4KHZE 2I0BA 4U4XA 2WKYA 5HM4B 4YKIA 1IIWA 3FUZA 3W9WA 3KN8A 4ZDMA 3PPQA 2RC7A 5H8FA 4OMBA 4OEUA 5KDTA 3TZAA 1CB6A 4IO7A 3EN3A 1XC1A 3LR1A 3OO7A 4JBZA 4GL8A 2ZYOA 2BJJX 2ONKE 3HSTA 3TTRA 1P1QA 1MM6A 3IO6A 1EZOA 5ICQA 2Q89A 1HSJA 1NFTA 3G3JA 4YMAA 4NF5A 3PUYE 4OWDA 4G68C 3GLBA 4F31B 3FJ7A 3RGYA 1CE2A 4GOTA 1D4NA 1MPDA 1SW1A 1UIUA 3KOTA 4IO4A 1UIVA 5M2VA 3TUSA 5TPAB 4F19A 1FW0A 1D3KA 3HN0A 4NWCA 1VFEA 4BDMA 3DLNA 2P1SA 2PT2A 2DVCA 4FIMA 1I69A 3KFMA 4ISUA 1LBCA 3KEIA 3Q29A 4K3FA 2D21A 1NMUA 4QFPA 1EU8A 4LVQA 5B7DA 4MBPA 2OJTA 4O3AA 3PUXE 2HAUA 1MXYA 4WEDA 1N7XA 2ZYMA 5KCJB 1PEBA 1NKXA 3TFLA 3PU5A 4KI0E 2XD3A 1IXGA 1SQYA 1FTJA 3E4RA 5DEXB 4DXCA 1I6BA 1SW4A 3Q28A 4ND9A 2ZMBA 3MW0A 2RCAA 1MPBA 5DVJA 3BKIB 4LP2B 4TQUQ 3Q27A 1B40A 3VVFA 2QRYA 5ITOA 4OFOA 3VVEA 1B3EA 4G77A 1US5A 3VDFA 2XXPA 3TODA 3LC8A 1Y20A 2I3WA 3U1OA 4QSCA 2QPQA 3IOVA 4BDOA 3K6UA 1MY2A 5IAIA 1IXCA 3LSXA 3ODBA 1QVSA 3RTFB 4F1YA 3G3GA 1NNFA 4IO2A 1MPCA 4X9TA 1P1OA 3V5AA 1ELJA 4OERA 1UTBA 5HBCA 3SEWA 3LSWA 4OESA 3TCFA 2QSXA 4OTEA 2IA4A 3TPAA 3FZVA 4IGTA 1ZU0A 4ZE8A 1EH3A 3MBPA 3A3CA 4OVJA 4PFTA 3OMBA 3OO9A 4EF1A 3FVOA 4H5GA 3OO8A 2AYSA 2B65A 2HEUA 3H3GA 2VHAA 1IEJA 1MY3A 1R6ZA 4FEBA 1OLAA 2RF1A 2XXUA 4ZEDA 3O6HA 2NUVA 3K1NA 4TOZA 4OXVA 3H7MA 3KG2A 3DP8A 4U4SA 2W7YA 1R9LA 2DYXA 2I4CA 1SW5A 3VV5A 2F7CA 5ISUA 1SW2A 2ZXTA 5TU0A 3G3HA 3U93A 5BWJA 4NF6A 4TLMB 4OENA 1M5DA 2Z8FA 2CMOA 2XXQA 3RN8A 3G3KA 3S9EA 4YB7A 1XVXA 4M1VA 5JK4A 4G4PA 2O6AA 4OZ9A 5ELVA 3IK6B 2A5TA 1Y1ZA 3PMXA 1MH3A 1N76A 2RKMA 1AMFA 3UP9A 5H8SA 3RY3A 4G68A 5I2NB 3BFUA 1I6AA 2E0SA 1PC3A 4F2OA 1N84A 1JQFA 2HZLA 1DOTA 3KSJA 5KZTA 3V89B 3ZKLA 3N26A 1OQHA 3V83A 3VLVA 5H8HA 1MY0A 2V3QA 3CG1A 4KCCA 5L9OA 3EHUA 1LAHE 1MXWA 3KJ7A 1OLCA 4ZS9A 4Q8RA 1R9QA 1B3LA 1SD3A 4WKMA 4PFWA 4GXSB 1B3HA 3TELA 4ESWA 2UYFA 4THIA 5FHNA 2O68A 1FTOA 1B4ZA 3FXUA 3TDJA 1MXUA 3W15C 2AIXA 4POWA 1ZIUA 2REGA 5H8NA 5CC2A 2XX9A 3OENA 3MPKA 4MH5A 4GWOA 4QFNA 5H8QB 2OWSA 2XXYA 2PVUA 1LBBA 4PFUA 1YAEA 3QK6A 4RY1A 4GLIA 1MXZA 4DE8A 1B1HA 4EQ7A 3M8UA 3GZGA 1XS5A 1QUKA 1MY4A 1YPNA 4M4GA 1RYOA 3T22A 3CFXA 4XTCQ 3DELB 1SYIA 4H65A 3CG3A 1LFIA 1YCJA 3C33A 1GGGA 4ELRA 4H1XA 2F6PA 1Q1KA 3T93B 2CZLA 2XXVA 1B51A 3R7XA 4U1ZA 3T9HB 1OQGA 4KYDA 4DXBA 1SI1A 4RA1A 3QSLA 5BUUA 4R2BA 1XOCA 2OK2A 1DPPA 1I6QA 3MZ9A 2XX7A 1Y4CA 4P0IA 3N94A 3RTWB 1TFDA 1DTZA 3PPOA 3HHGA 4F18A 5TP9B 1M5BA 1IQ7A 4YB5A 3S4UA 1H76A 3S9NC 2HFBA 4IO5A 1D9YA 2O7UA 3MP8A 3K2DA 3O6IA 2NXOA 4PQJA 2PMSA 4E0WA 3EHSA 5AE4A 2QMWA 3N5LA 1OVBA 3KOSA 5I56B 5F1QA 3F11A 3Q26A 1VR5A 4R9FA 3BBRA 4JDFA 4R6HA 3UIFA 1QKBA 2XXIA 2H4IA 2H99A 4DIGA 1SYHA 3V8XB 4WXJA 1B5IA 4KR5A 3SEXA 2I6EA 1PB7A 2O51A 4JSDA 1GVCA 1A40A 3D4CA 3GBBA 3IORA 3O29A 5AA4A 2F35A 3S2VA 1B46A 1S7YA 3FVGA 2QS4A 3KN7A 4QHQA 3TYHA 3ILTB 4JWXA 4U1OA 1AOVA 4P11A 2VGQA 1URSA 1MG1A 1FQAA 1N3XA 4NE4A 4DCXA 4H6DA 4I1DA 1FQFA 3OELA 3Q25A 5AA2B 1PDAA 4HCYA 4ZEFA 2H5YA 2O7IA 4GF8A 1MXXA 3THIA 2Y84A 4G8NA 3H4ZA 3K1MA 4R9GA 1PB9A 3VVDA 4EQ9A 3SEUA 3C35A 4P0GA 1QUJA 1FQDA 3A09A 5DYHA 1S9TA 3VE1B 4H5FA 4QSEA 2RC8A 4YAHX 1M5EA 3PUWE 3MPLA 4QF9A 1L5TA 3H6TA 1B7UA 2XXRA 2DSFA 4R6KA 2VP1A 1B3FA 1ZTYA 2DWIA 2YPNA 1LLSA 4UA8A 3MZ1A 5I84A 5TPAA 5DVIA 1F9BA 4F3PA 2XXXA 3S9MC 1FQBA 3O6GA 4PETA 2O84X 4PP0A 4AB5A 1Y4TA 2VD3A 5EHMA 4BDQA 2PX1A 2LAOA 3RUMA 5I57B 4OEVA 1FQEA 3MAMA 4Q30B 3FXQA 3IB2A 4KD5A 2I4BA 1P1WA 4DDDA 4MFIA 4ZE9A 3ECRA 1B2HA 3U94A 3EQ1A 5KCJA 2RC9A 3L6HA 1N0TA 1DPEA 2YJPA 5DEXA 1H45A 4GFRA 1TXFA 4MF3A 1ZLQA 5I57A 3C36A 4F3GA 3RT8A 2GFEA 2Y7RA 2Q8JA 3TCHA 2F97A 1P1NA 1Z7ME 3TQWA 1LAGE 4OHNA 3OSQA 3FV1A 1S50A 1N04A 4LATA 3K1PA 2Y7IA 3KJTA 1LCTA 1FQCA 3LUYA 1ZKBA 1GR2A 1URDA 3B6QA 1B7HA 2F36A 3K02A 1Y9UA 3U92A 1PBQA 4LUBA 3KZGA 2GRVA 3PPPA 1H43A 1WVJA 4GIZA 2YLNA 4DZ1A 1B0HA 4Z0IA 2DE3A 4NWDA 5I2KB 2ZYNA 3I3VA 3RT6B 1NH8A 3TTKA 5CBSA 1B1XA 1LFGA 5HPQA 4GD5A 4KQPA 3G7WA 4POXA 2H25A 4F29A 4GVOA 1JW4A 1MQIA 3B6TA 4YU0A 1TT1A 2X7QA 1DSNA 3UA8A 3C34A 1BIYA 2Q88A 4F39A 2HCAA 3G3FA 4NTLA 3SERA 3MJNA 1NNPA 1QJMA 2ZYKA 2Q9TA 2HZKA 4JSOA 1PB8A 1O63A 4G2ZA 4XIGQ 4HTGA 2Y7PA 3OEMA 3VLUA 1A99A 3PPRA 3QUJA 4YMBA 4GL0A 3U72A 1JETA 4MLVA 3DM0A 3UGWA 4EXKA 4YKKA 2A5SA 3UK4A 3PUZE 2OWTA 3L6GA 3GBAA 1MDP1 4YKJA 3C31A 1IZ1A 2I0CA 1QKAA 2XX8A 2I49A 1USYE 3B7DA 3I6VA 3QYTA 2NWJA 2HQ0A 3C4MA 2I58A 3M3KA 4WEPA 3U8QA 5DTBA 1SBPA 3IJOB 1LAFE 4FAJA 1DTGA 1ATGA 2DVZA 1XVYA 2Z8DA 4EXLA 4F2QA 5I2NA 2FNCA 4LQ5A 4QSDA 1FCKA 3T96B 2Z22A 3IO4A 4ELPA 1USYH 3MP1A 3ZKKA 1PBPA 1MDQA 4KYSA 5I59B 3I5OA 3HO7A 4IO6A 1MY1A 1A8FA 5I58B 2B3FA 4XKNA 4JWOA 3IB1A 4L17A 4ZEIA 2F6GA 3MP6A 3IX1A 4ONYA 3UORA 2HXWA 3OD7A 3ZSFA 2OZZA 3CFLA 2DP8A 4YICA 4NF4B 5H8QA 2Y7WA 1A54A 3T66A 1JW1A 1AH5A 3TTNA 2ALUA 1SDXA 2DXYA 2DE2A 4OFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DI3D 1II5A 1FTAA 1MS7A 4F1VA 5EQ8A 2QJEA 3TCGA 3QXMA 4N4UA 5JTYB 1UTHB 4FORA 1P1UA 1JVYA 1UQWA 1G0HA 4LA9A 1LFHA 2F7AA 3MZBA 1Q9DA 4RYAA 2HXRA 3RQTA 4UABA 1OMPA 2V93A 3PUVE 3B8BA 4OVRA 2R6GE 4C1TA 5DT6A 2ONRA 5A5XB 4PC9A 5ICTA 4NF8B 3HPIA 4NHBA 4U2RA 4JWYA 4NX1A 1QUIA 1IUDA 3PD8A 1FBEA 2QFLA 3OO6A 1MM7A 1BKAA 4XXUA 1JW5A 2XHDA 3IFCA 2DS9A 1B58A 5EYGA 3S9LC 4N13A 1MQDA 4OANA 4XKRA 1JNFA 5TP9A 3SDFA 3KBZA 1MXVA 1URGA 4BDNA 3LSLA 3K01A 1NV2A 1BTJA 5K2XA 2GHBA 4DCYA 3M3LA 4Q0CA 4P1LA 5H8FB 3K0VA 2QS3A 4DXUA 4GWSA 2GHAA 1SVXB 4F3SA 5KDTB 3DP4A 4XF5A 1AIVA 3TKDA 2P2AA 4ESXA 5CMCA 2RCBA 2F7BA 2PYYA 3VXCA 2NVUB 5I56A 4H0WA 4XKQA 4N07A 3PGFA 4FECA 1AL3A 4ZEKA 4FBPA 3RYDA 3PPNA 3NOHA 2XXWA 5JEIA 3H06B 2FYIA 2VT5A 3OOAA 4YZZA 1IXIA 4NF5B 3TMGA 4GWZA 1O64A 2KLFA 4EQBA 3ILUB 1Q35A 3HV1A 1B0LA 2XWVA 5J1DA 1DMBA 2ZZWA 3FV2A 4NN3A 3MVXA 1KZ8A 4KPTA 4IO3A 1LCFA 4QFLA 1XHYA 2Z23A 1BLFA 2GH9A 5CBRA 4IR8A 1WODA 1KWHA 2CZKA 2BJIA 4U23A 4F3BA 3FVNA 5K2YA 2OBGA 2F34A 2DOJA 3G3IA 2I3VA 4HS7A 1SPIA 1FJ6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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