1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
3OSQA 1B40A 1P99A 3MQ9A 3K02A 4GL0A 1HSEA 4NWDA 3I6VA 3SEYA 1AMFA 4POWA 2HAUA 1EZPA 2F8DA 1B5JA 3N5LA 2FA7A 2ZYMA 5I57A 3SEUA 3HCQA 1MQDA 1UIUA 5CMCA 2PX1A 1II5A 1MPCA 2REJA 2VD2A 1FTOA 2GHBA 5KDTA 1LB9A 2VD3A 4BDNA 1MPBA 1B9JA 4NE4A 3OENA 1MY3A 5H8HB 4XKRA 1IITA 2G29A 3H6UA 2UYFA 2O1LA 5TP9B 4QFKA 2XXXA 2NOOA 1O7TA 1XHYA 3O6IA 1D9VA 4JXIA 3C9HA 3B6QA 4RXLA 5AA2D 5CMKA 3MVZA 2Y7WA 1R1NA 4WKMA 1QVSA 1O64A 5BUUA 3MVYA 2VP1A 3GBAA 1RYOA 5AA1A 3KOTA 1A40A 1B7UA 3QIMA 5HPQA 3QUFA 3T93B 2YJPA 3QSLA 3PUWE 4EQ7A 2OBGA 4U4SA 4EF1A 2QS4A 3TYHA 2A5TA 5H8SA 1SI1A 2HQ0A 4M1VA 3KN3A 4PFYA 1YCJA 5JK4A 2VGQA 2R9JA 2Z22A 3R26A 3MWBA 4KPTA 1A99A 1VSOA 3KJ7A 1SYHA 1L5TA 4KYEA 2I6EA 1MDP1 1ZLQA 4ONYA 3VLWA 4IO6A 2F7CA 5FHNA 2XXQA 2H4IA 2B65A 3ILUB 3UORA 2DWIA 2QJEA 1NNFA 4KQPA 1N7WA 1N84A 3CFXA 5J1DA 4L17A 2PYYA 4QF9A 1SBPA 4LQ2A 2DYXA 5JTYA 2RCBA 5I2NA 4Q0CA 4Z0IA 4XKNA 2QS1A 1MQGA 3H7MA 2DSFA 3EHTA 1LCFA 4ZZAA 2O51A 3IR1A 1PBQA 5TU0A 3PD8A 4UA8A 2F6GA 2AL5A 4FE8A 3KOSA 3TTNA 5A5XA 1MY4A 4BDOA 2DXRA 3IOTA 1B4HA 3KEIA 2OK2A 5ICTA 4PETA 1GGGA 2O7UA 4U22A 4ELQA 3V83A 2UYEA 3MJNA 3CFLA 4GVOA 4QFOA 3W9WA 3MBPA 1NFTA 3VVEA 1MY2A 3H03A 1RKMA 1MXXA 3G3KA 5B70A 2FYIA 3HPIA 1I6QA 4I62A 4X9TA 1VE4A 1B3HA 3S9LC 2QS2A 3GXAA 2Q8JA 5DVFA 5K2YA 4ZZEA 3S2VA 3TMGA 2DVCA 4TQUQ 2I3WA 4AQ4A 2AIXA 4EQ9A 1MH3A 3MP6A 1MRPA 3QYTA 2YLNA 2ZYOA 5AE4A 1MY1A 3K1PA 4R6YA 3Q28A 2V3UA 1OLCA 4C1TA 4H8IA 1H45A 1QULA 4NEDA 1FW0A 5H8HA 3KSJA 4ISUA 4HS7A 4KCDA 4OERA 3M3KA 3IK6B 5TP9A 2E1SA 2F78A 4OEUA 5TPAB 3TUSA 3ILTB 4ZEIA 5IAIA 2F97A 4G2ZA 3O9PA 5I2KB 4F29A 2F7AA 2HCAA 3B7DA 4OFJA 4F3GA 4OTEA 3LBSA 3VV5A 4POXA 4H67A 3MZ9A 1N76A 4FIMA 2PBWA 4FATA 1FTLA 4MLQA 1EZOA 3MP8A 3KBRA 2YPNA 2IEEA 2W7YA 3C35A 3ODBA 3UA8A 3TTRA 4H6DA 1AL3A 4YU0A 5EHSA 4FECA 3RQTA 1USYH 3MW0A 4U4XA 4IB2A 3MAMA 1GR2A 3K6XA 2HZLA 2D3IA 4PFUA 3KJTA 1US5A 3W9VA 1DPPA 3W15C 3A09A 1POTA 1Z7ME 3ZSFA 4OFOA 2NUVA 1BP5A 3VVDA 3M3FA 4LATA 2DE2A 4THIA 1D9YA 3ZS6A 4F39A 3CSGA 5HM4B 2H25A 2UVHA 2I3VA 3PGFA 4LUBA 1MH4A 4KD5A 1FQEA 3K01A 1M5EA 4KI0E 3A3CA 1P1UA 4WEPA 1F9BA 4R6KA 3RT6B 3LUYA 3R6UA 1FQCA 2RCAA 1S50A 2D5WA 2PMSA 4U21A 3TELA 4G8MA 2PT1A 1PB9A 1WDNA 5AA3A 3IB1A 4M4GA 4LA9A 4MH5A 3H6WA 2ANJA 3RY3A 3UP9A 1N3WA 4GQOA 1SW5A 5H8QB 1B7ZA 1JW5A 4LZ5A 4U23A 1GV8A 1MS7A 3G3FA 3CG1A 3FD3A 1MM7A 1JEVA 4KYDA 1OQGA 1B3GA 3M8UA 4P0GA 3S9EA 2H5YA 3QK6A 1H43A 1NH7A 1Y1ZA 2ONRA 3KGCA 3FV1A 2QL3A 2O7IA 1AIVA 3U92A 2AYSA 4ZEDA 4E0WA 2B3BA 5IKBA 4RK9A 1IQ7A 3T66A 2XHDA 3T9XB 4YKJA 3U8QA 2Y7IA 1B0LA 4G8NA 5I56B 4JWYA 3VE1B 2Q2CA 3B6WA 1ZU0A 3K6UA 4R2BA 3HV1A 3S9MC 3RLFE 3T96B 4DCYA 1HSLA 1Y1MA 1Z7NE 5ELVA 3O66A 1B6HA 3OO7A 1B58A 4OESA 2DXYA 3O6HA 1T0KA 3IOUA 5CBSA 3IJOB 3UK4A 1Y3PA 2NXOA 2Z23A 4QHQA 3OOAA 2I48A 1IEJA 1B51A 3PPNA 1NNKA 3PPRA 5TPAA 1OVBA 3TTLA 3EQ1A 4NF8B 2Y7RA 5I2KA 4YB6A 4Z7EA 4Q30B 1B7HA 3G7WA 5AA2B 3QUJA 2RC7A 1LGBC 4RPNA 4ESXA 3TEPA 3KSXA 5H8FB 2V3QA 4ELOA 3TZAA 4P0IA 5CC2A 3OO9A 2XXRA 3LSFB 2F35A 3RT8A 1H76A 1MDQA 2QMXA 4XTCQ 3TTKA 4O3BA 1FQAA 3H4ZA 4ZEKA 2H99A 2ZNUA 2QSXA 1MXZA 2XX8A 1NH8A 4ZDMA 1AOVA 3E4RA 4ZECA 3EHSA 4EDPA 3FASA 4MFIA 2OWTA 3OEKA 5H8NB 1B32A 3S9NC 4EQBA 3IO6A 3RNNA 2X26A 2XXPA 2AL4A 2I4CA 3T22A 3T9VA 3SERA 3Q27A 2HZKA 5DVJA 1IXHA 1MY0A 1OIBA 1QKAA 2XXWA 2VHAA 1TWYA 3KN8A 4RA1A 1I6AA 4XXUA 3I5OA 3DLNA 1QUKA 5DYHA 5M2VA 2V25A 4AB6A 1QUIA 3TODA 4HW8A 4G68C 1H44A 1Y9UA 3KFMA 4GWOA 2ZMBA 4JB7A 5DT6A 1POY1 3OEMA 2CZLA 2ZNTA 3CSBA 4G68B 1TT1A 4IO3A 3L6GA 1JW4A 4LVQA 3FXUA 3VXCA 2QS3A 4ECFA 4LQ5A 3HHFA 2A5SA 2KLFA 1ZTYA 4ELPA 3K0VA 1XVYA 3MZ1A 1LAGE 5H8QA 4RK2A 1A8FA 4JBZA 1SW1A 1Y3QA 3PUXE 4GIZA 1B2HA 3P7IA 1LBCA 1OLAA 3UN6A 1LCTA 3JV9A 4KYSA 5EHMA 3FXQA 1B4ZA 4XIGQ 2O1MA 1IXIA 4JWOA 1B5IA 5I56A 2DVZA 4PFTA 5HBCA 1TXFA 2IA4A 4DDDA 4DCXA 2OZZA 1P1WA 1NMUA 3K1MA 1MM6A 1FTJA 2DQVA 2RC8A 1PB7A 1SYIA 1AH5A 3M3LA 5I59B 1ZKBA 2E0SA 3CG3A 2DS9A 1LB8A 1IIWA 4X1BA 3H6TA 4R73A 3EPEA 1JNFA 3VLVA 3PV0E 4HCWA 1DTZA 5CM6A 5CMMA 4NF5B 4Q5TA 5K2XA 2F7BA 4NF8A 1I69A 1PBPA 3GLBA 1XC1A 4NF4A 2DE4A 3TCFA 2P0SA 1XT8A 4IY5A 5KCJB 3E13X 4DXBA 1FQDA 3DM0A 2F6PA 5AA2A 3RN8A 3SESA 4JSDA 5I84A 3Q26A 3CIJA 3A3UA 3VDFA 5H8FA 1Q35A 4F3SA 5FTIA 1OQHA 3BFUA 3SEXA 4IGRA 3FJGA 4DIGA 3DP4A 1WODA 3Q29A 1VFEA 4QFNA 4G8HA 4WXJA 2UVIA 1B05A 4LZ8A 4ZE9A 4MBPA 3MVXA 2O84X 4FEBA 1CE2A 1NL5A 3TDJA 1URSA 5F7VA 2Q89A 3G3GA 1FQBA 2QMWA 2Q9TA 1SW2A 3PUZE 3QXMA 3C31A 1QUJA 3BBRA 4IGTA 4QFPA 5ITOA 3FJ7A 1LBBA 3SKPA 5AA4B 2ESNA 5EYFA 4R72A 1Y4CA 3H3GA 3PPQA 1A8EA 4AB5A 3T9UA 3PUYE 5H8NA 2I58A 3S4UA 4DLDA 2RF1A 2RKMA 4YKKA 4YB7A 1EH3A 4OHNA 3IOVA 3VFJA 5L9SA 1DPEA 3CVGA 3IX1A 4K3FA 3N6TA 4ZE8A 1FCKA 4WEDA 3U93A 3N6UA 4KR5A 4BDRA 5ISUA 4F1UA 2QRYA 3MC2A 3K00A 1N3XA 4PFWA 1MXUA 3CI8A 3B6TA 4NWCA 4ESWA 1J1NA 1EU8A 4GL8A 2H9BA 1ZIUA 2DWHA 1ATGA 4PE5B 2GH9A 4G68A 2ZYNA 3TQLA 3SETA 3IB0A 2ALUA 1B1XA 4I8CA 2THIA 3IAZA 2DP8A 3IB2A 5L9MA 2DE3A 5L8DA 1O63A 1PB8A 1BLFA 3JYRA 4F3BA 1B3LA 1BTJA 4YKPA 1B5HA 4NTLA 5F1QA 2OJTA 2PVUA 4HCYA 1R9QA 4TLMB 4GXAA 3O2AA 4GXSB 1US4A 4EXKA 4YAHX 1Y4TA 5FTHA 2ZYKA 3HSTA 2FNCA 2NWJA 1GTKA 4MF3A 1TFAA 2GFEA 3O28A 4DZ1A 4DE8A 3K1NA 3UIFA 2H98A 2Q88A 3EN3A 1D3KA 2XXIA 4ELRA 2G93A 4OMBA 4R6HA 1VR5A 3G3HA 2UVGA 1SVXB 4GLIA 3ONMA 2NVUB 4U1OA 1I6BA 3OXNA 3IO4A 1NNPA 2ONSA 5I59A 3C33A 1XS5A 4UACA 1DMBA 1M5BA 2PT2A 1DTGA 3JZJA 3D4GA 4NF5A 3FGSA 2UXAA 5LOMA 4JWXA 1MPDA 4OYVA 2DWAA 3THIA 4QSDA 3H6VA 4LP2B 1SDXA 1P1QA 5KCJA 3VXBA 1MQJA 5ICQA 1LLSA 5JEIA 4NF4B 3RUMA 3IJXB 4U1ZA 3FJMA 3OSRA 1XVXA 3K6WA 5CMBA 4KCCA 4N6PA 4IO4A 1JVXA 2Z8FA 1ELJA 4QSEA 5DVIA 1UTBB 1JEUA 3CR9A 4JSOA 4YMAA 3C4MA 4BDMA 4OQOA 3U1OA 5FHMA 1JQFA 3Q25A 1LAHE 4BLAA 4NF6B 4FORA 1Y3NA 4IY6A 5AA4A 3R7XA 4RPOA 3RGYA 1ZJLA 3K6VA 5CI5A 4JDFA 3EHUA 3O97A 3PMWA 3RPWA 1MQHA 4R2FA 1P1OA 1B0HA 4F19A 2HAVA 3KZGA 1R9LA 4XKPA 1UQWA 3G3JA 2XXUA 3L6HA 1N0TA 3PPOA 3MPLA 4U2RA 4RYAA 1FTKA 3FVOA 2XXHA 5CBRA 3U72A 1B1HA 1XOCA 4QSCA 3DP8A 2HFBA 4H5FA 3HN0A 4G4PA 3N94A 5I58B 1P1NA 4X48A 3SEVA 2Z8DA 3OO6A 3C34A 3DP6A 1H3DA 4X1DA 4F1VA 2QPQA 1SQYA 2F34A 3TCGA 1B3FA 3OMBA 1B52A 1RYXA 3H06B 4BDQA 1JETA 2D21A 2Y7KA 2M8CA 4RJZA 4KHZE 3SEWA 3K4UA 1EZ9A 4GD5A 3FXRA 3RTFB 5FHOA 3PPPA 1ZBMA 1UTHB 4TLLB 3E3KA 4PQJA 3BKIB 4OENA 1TFDA 3TTMA 2O6AA 2ONKE 1ZMGA 1A7LA 4EXLA 1DOTA 4LZ7A 1PC3A 1FTMA 2XXYA 1CB6A 4ZEBA 4R75A 5L9OA 3USDA 3MVWA 5DEXB 1S9TA 3HO7A 4IO5A 2LAOA 1LFGA 2V3TA 1D4NA 3PMXA 1YTVA 2GRVA 3EF7A 3QAXA 2X7QA 4F31B 1JW1A 1MXYA 2V93A 4QRZA 4YKIA 1IZ1A 4FEDA 4OFLA 3CFZA 1B3EA 5BWJA 1MXVA 1N04A 4I9DA 2P1SA 4IO2A 3ZKLA 3DELB 4G77A 3VVFA 1LSTA 3IL1B 2F36A 4MLVA 2Q2AA 2ZNSA 4GFRA 4IO7A 3K2DA 2REGA 2DOJA 3V5AA 1MXWA 3N26A 2OWSA 2B3FA 3TFLA 4HTGA 1R6ZA 4N13A 4F18A 1M5CA 1BKAA 4C0RA 3TPAA 4EF2A 1YAEA 3MP1A 3TAJA 1QJMA 1FQFA 3FUZA 2I4BA 1S7YA 1UIVA 3O6GA 2RC9A 1N7XA 3V8XB 1MQIA 4OVJA 3GBBA 3FIRA 2O69A 5CRYA 1SI0A 2XXVA 4GF8A 2GHAA 5I57B 4ZEFA 3OO8A 2P2AA 2I0CA 4F22A 4GRKA 4R74A 4H65A 3OELA 1UTBA 4NMYA 2R71A 3ECRA 1JVYA 2VOZA 1URDA 2ABHA 3MUQA 3VLUA 5KDTB 1NKXA 3ZKKA 2ZXTA 1ANFA 4RNSA 4LONB 1OVTA 3KN7A 4NF6A 2HEUA 2XX7A 2Y84A 4EUOA 3D4CA 4C1UA 3V89B 3WAFA 1QKBA 4QFLA 2Y7PA 3IOWA 1KWHA 3C36A 4I1DA 4F1YA 5B7DA 4PP0A 2UVJA 1URGA 3FVNA 1Q1KA 1LAXA 4BDLA 1GVCA 4RY1A 2I0BA 4F2QA 3E9XA 3WAEA 4H5GA 4TOZA 3PD9A 3MPKA 1HSJA 4DXCA 2RINA 4E0XA 5I58A 2XD2A 1SD3A 3KG2A 4O3CA 1IUDA 1QW0A 2A5TB 1A55A 4OWDA 4H0WA 2XXTA 2CMOA 1VFDA 4Q8RA 3LSWA 3G3IA 2X7PA 3O29A 3MZBA 4GOTA 1PEBA 3FV2A 4YICA 2OCUA 1PDAA 4N07A 4F3PA 1B46A 3TKDA 4YMBA 1LFHA 4H1XA 4H8JA 1UTHA 2BJJX 3HHGA 3GZGA 3CRBA 3LSXA 1MG1A 1DSNA 3AXFA 4FAJA 3BFTA 1Y20A 1M5DA 3FVKA 4XKQA 1LAFE 3TCHA 1OMPA 1WVJA 2F5XA 4OEVA 1LFIA 2I49A 5ITPA 4R9FA 4OXVA 4OZ9A 3FZVA 4F2OA 3RTWB 2XX9A 4ZS9A 1YPNA 2HXWA 3F11A 3UGWA 4OETA 3U94A 2O68A 1IXCA 3IORA 5DEXA 5JTYB 3PUVE 1A54A 5I2NB 2R6GE 4P11A 3LR1A 1NNTA 4DXUA 3LSLA 1BIYA 4O3AA 5KZTA 3FVGA 1SW4A 3C32A 4ND9A 3LC8A 3T9HB 5A5XB 2DWJA 3PMVA 2Z8EA 4YZZA 1USYE 3TQWA 2XD3A 2OLBA 3SDFA 3PU5A 3OD7A 4R9GA 1IXGA 3I3VA 2V84A 4FJPA 4YB5A 2WKYA 1M5FA 3FATA 4KFQA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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