1EZPA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin using peptide orientations from dipolar couplings
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezpA01
3VLUA 1PB8A 3GBBA 2F7AA 1Q35A 4R2BA 3O6IA 3LUYA 4R2FA 5I2KA 3EHUA 3ZSFA 4NMYA 3Q26A 1MY4A 2UXAA 1NL5A 1FTKA 3S4UA 5ISUA 2XD2A 1NNTA 2F8DA 3ILTB 4PQJA 2B65A 4F29A 2A5TB 3Q27A 2F36A 4FECA 5FTHA 3S9LC 2VOZA 4KYSA 1Y1MA 2XXUA 1IXGA 1HSJA 1J1NA 3KSJA 4ESWA 4DZ1A 3H3GA 1SI1A 1N3WA 1OLAA 3G7WA 2Y84A 1MXZA 1B4HA 2XXHA 3A3CA 3D4GA 2B3FA 1ZTYA 4DXCA 1YTVA 2F5XA 4OTEA 1B9JA 3KN7A 2RCBA 4ZE9A 1ZMGA 2YJPA 1JVYA 3FV1A 5I2KB 5CRYA 4I1DA 2DP8A 4GOTA 2QSXA 4ELRA 4QF9A 2V3TA 2CMOA 2GRVA 2O68A 1LLSA 3O9PA 3U72A 1R9QA 1N7XA 3K2DA 3ZKKA 1USYH 3W15C 2DXRA 4JDFA 3V8XB 4ELQA 4RPNA 3VDFA 1XOCA 4OFOA 1MM6A 3DLNA 1I6AA 3IB0A 4TOZA 1XS5A 4R73A 1Y1ZA 1AH5A 3H06B 3T9XB 4F3PA 1EU8A 2ZYNA 4HW8A 1ZKBA 2A5SA 3TMGA 4ZE8A 1D9YA 1GVCA 4LQ5A 4OYVA 3KOTA 4PFWA 4NF8A 3CFZA 4R9GA 4PFTA 4ZEBA 3A09A 3ODBA 1M5DA 3QYTA 3IL1B 3QAXA 1PBPA 3CG1A 4NWCA 2ANJA 4OENA 1POTA 2F6PA 3RQTA 4OVJA 3IOWA 3H03A 2DQVA 1NNFA 1DOTA 5ITPA 1B3EA 3MW0A 2XXQA 4FJPA 5DVJA 3N6UA 2O7UA 5CMBA 4ISUA 3SEXA 4PFUA 4YICA 2XX7A 1VFEA 1QVSA 2NUVA 3SEWA 4N6PA 3VE1B 2H98A 5JEIA 1B0HA 1CB6A 2VP1A 1B5IA 5AA4A 1A55A 4JWXA 2ZXTA 1OLCA 1A40A 1LCFA 1B5JA 3BKIB 2X7QA 4F3SA 3U1OA 4YU0A 3T93B 3THIA 1MDP1 1UTBB 3FIRA 1PC3A 4U4SA 5I57A 2QS4A 2HXWA 4EUOA 1VSOA 4U2RA 2REJA 1A99A 4LZ8A 1L5TA 5I84A 4ZZAA 3MAMA 3AXFA 3TTMA 2WKYA 1GV8A 1A7LA 4ZEFA 3TEPA 2THIA 3SDFA 4I8CA 3ONMA 2ZYOA 3BBRA 3BFUA 1SBPA 2DVZA 3M3FA 3RT8A 4YMAA 4F3GA 5B7DA 2ZNTA 3O2AA 2DWIA 2QJEA 1EZ9A 5FHNA 3MUQA 3C35A 1JNFA 2PVUA 2XXXA 2NOOA 2OWTA 5I57B 3HN0A 4G8MA 4ZZEA 4L17A 1MY0A 2W7YA 5LOMA 3C33A 3PPOA 3RT6B 3KOSA 3GBAA 4KHZE 1S7YA 1YAEA 1B3GA 1EH3A 4KCCA 1B1HA 4U23A 2XXPA 5DEXB 4P11A 5CMCA 1ATGA 3IJOB 4MF3A 1TT1A 1JVXA 1US4A 2R6GE 4F39A 2H5YA 4POWA 3V89B 3PD8A 1LB8A 2ESNA 4GXAA 4GQOA 1LSTA 1VFDA 5CC2A 4I62A 2O1MA 3OO8A 3O6GA 4NF6A 3MZ9A 2QS2A 2XXWA 5F7VA 4XKRA 4GFRA 4R72A 3FXRA 3MBPA 2ALUA 2PMSA 3RTFB 3G3KA 4GWOA 3OSQA 2HAVA 5IAIA 2XXRA 1OVBA 3IAZA 2VD3A 4PFYA 3QK6A 3T9UA 1IXCA 2ONSA 3IORA 1LFHA 3TFLA 1QKAA 3I3VA 1SW2A 1MY2A 1SYHA 1HSEA 4EXKA 1ELJA 1LFGA 1B7ZA 1IEJA 1UIVA 3IOVA 3M3KA 4OFJA 1MY3A 1SW5A 2XX9A 1JEUA 1AOVA 3G3GA 3FJGA 1JW5A 1RKMA 4PE5B 4BDNA 4XXUA 4F1UA 5H8QA 2RF1A 2KLFA 3IK6B 3S9MC 2I58A 3V5AA 3PD9A 4ZDMA 1R6ZA 4TLLB 3B6QA 3IB1A 3TUSA 3H6VA 4NF6B 4H8JA 3T22A 3LSXA 5DVIA 3LSLA 3O97A 2DE2A 3N94A 3FGSA 3IOUA 4YKJA 4QHQA 3TELA 2UYFA 2PT2A 2DWJA 2XX8A 3LR1A 5FHMA 2Z8EA 1RYXA 3U94A 1SD3A 3WAEA 3CRBA 2XD3A 1LGBC 3IO4A 4GF8A 2RC7A 3DP6A 4YKPA 1QW0A 4F19A 4U21A 1PB7A 5AE4A 1DMBA 4Q5TA 2D5WA 1N04A 3UORA 3E3KA 5H8QB 4H65A 3UA8A 4ECFA 3ZKLA 1AIVA 4LZ7A 4U1OA 4BDLA 3EN3A 4OXVA 1MQHA 1MPDA 3T66A 1JQFA 1B52A 3HV1A 2I3WA 3LSWA 1LAHE 4U22A 4GD5A 3KGCA 3W9WA 2HEUA 2Q2CA 4OERA 2M8CA 2QMXA 1YCJA 4F22A 5A5XA 4G68B 1UQWA 5CM6A 3CR9A 3FVOA 4IO3A 1GGGA 2V3QA 3G3JA 4N07A 3PMVA 2V25A 3K6WA 1P1UA 3SESA 5DT6A 3TDJA 1FW0A 4FORA 2X7PA 4NWDA 3OELA 4MBPA 4F1VA 4G2ZA 3G3HA 3ZS6A 1MQDA 4XKQA 3FATA 3QIMA 1Y3PA 2O7IA 1P1QA 2HCAA 3K02A 4YKKA 1HSLA 5I2NA 1FTLA 3VLVA 4OMBA 1N84A 2OWSA 3VV5A 4QSDA 5EHMA 4HCWA 3FJMA 3HHGA 3CFLA 1FTJA 2Q2AA 2AIXA 1N3XA 3VLWA 5I59A 1XVYA 4IY6A 3B6TA 1FQCA 4WEDA 5TP9A 4EXLA 1VR5A 4LQ2A 1USYE 1B3HA 3TODA 3FVNA 4PETA 3VXBA 4FEDA 5HBCA 1MXXA 5H8NA 2HQ0A 4XTCQ 1SVXB 1UIUA 3O28A 4OZ9A 4AB6A 2OJTA 4MLVA 3KBRA 1AMFA 5AA2A 4MFIA 3RLFE 3B6WA 3KJ7A 1Y4TA 5F1QA 1LAGE 3TQLA 2F97A 3K01A 1Q1KA 3K6XA 3MVXA 4H5FA 2ONKE 3JZJA 3UP9A 2UVIA 2F34A 3HPIA 1B7HA 2Y7RA 3K1PA 1D4NA 1JW1A 2OCUA 2H4IA 4OESA 4G68C 2AL4A 1B32A 3W9VA 2D21A 4DXBA 3VFJA 1R9LA 3IJXB 5TP9B 4X1BA 1OVTA 3MPLA 3K6VA 4Q8RA 4G77A 1XC1A 5H8NB 4H0WA 1FQAA 2HFBA 2F7CA 1TFAA 3MP6A 4R75A 2I3VA 3R7XA 4Q0CA 5CBSA 2GHBA 3OD7A 5KZTA 5M2VA 4ZEIA 1Y4CA 4DE8A 3MQ9A 3P7IA 1BLFA 1H3DA 1LBBA 2RCAA 4C0RA 3Q28A 3MWBA 4NF8B 1M5BA 3MVWA 2DOJA 2FYIA 5L9MA 2I49A 3PUVE 2I48A 4YZZA 3FXUA 3F11A 2DYXA 4KYEA 4P0IA 2UVGA 1MPCA 4DLDA 4LA9A 5CMMA 2Z8DA 3O66A 4RNSA 5I56A 1DTGA 1P1NA 3C9HA 4OHNA 4FATA 1MS7A 5B70A 3QUFA 4DCYA 3TKDA 4PP0A 3OEMA 4KR5A 1DPPA 2OLBA 4GLIA 2I4CA 5KDTA 3KSXA 4ESXA 3U92A 2PX1A 2DWHA 1OQGA 3DP8A 1SDXA 4BDMA 2GH9A 1BP5A 1PEBA 3TCFA 4H8IA 5H8HA 3CG3A 1MQGA 2G29A 4JWYA 3FASA 4GL0A 1POY1 4GRKA 5AA4B 3C34A 4IGRA 1SW1A 1XHYA 2XXIA 1Y20A 3GXAA 4YB6A 1P1OA 1FCKA 1LFIA 4C1UA 3OO7A 5CBRA 1LB9A 4AQ4A 4IO7A 1WVJA 5I56B 3K1MA 3TTRA 3LC8A 3TAJA 2HZKA 4HCYA 2GHAA 2UVHA 4G4PA 5EYFA 2O84X 1WODA 2QPQA 3RN8A 4LUBA 4I9DA 4JSDA 2ZNUA 2IA4A 3FD3A 3PPQA 5ITOA 4O3CA 1IZ1A 4Q30B 4BDOA 1A54A 2UYEA 2QS1A 1B7UA 4FAJA 3O29A 3R6UA 2DS9A 5H8HB 1LAFE 4YB5A 3DELB 3VVDA 3FVKA 4UACA 1B3LA 2DXYA 1DSNA 2Z22A 3PPPA 2Q89A 4KI0E 4G8NA 4FEBA 3QUJA 1H44A 3TQWA 3U93A 4RPOA 4YAHX 3SKPA 5J1DA 1MXYA 3PUXE 1MXUA 3K00A 1MM7A 3I5OA 4LVQA 4IGTA 1NFTA 1II5A 2XHDA 1B51A 2LAOA 3EHSA 1I6QA 2PYYA 3RTWB 4ZS9A 1SYIA 1QUKA 2XXVA 1GR2A 2FA7A 1D3KA 4QFNA 4WKMA 2DE3A 2ZNSA 4F31B 4P0GA 4KPTA 4KQPA 3TCHA 1O63A 3ECRA 2VD2A 4DDDA 3EHTA 4XKPA 1ANFA 2X26A 5JTYA 1BTJA 4DIGA 1B4ZA 4G8HA 3K6UA 4LZ5A 5HM4B 3S2VA 4RK9A 4XIGQ 1M5CA 1MH3A 3EQ1A 1IQ7A 1SQYA 1B3FA 2VHAA 4EF1A 4NTLA 4RY1A 3C36A 4U1ZA 1TFDA 1N76A 4H6DA 1CE2A 1B58A 3OMBA 2F78A 4QFKA 3OOAA 1FQBA 3ILUB 2RC8A 4IO5A 4RJZA 2OZZA 3TTNA 2XXYA 5JTYB 1RYOA 1LCTA 3FJ7A 1WDNA 2DSFA 3TCGA 4OEVA 4ND9A 5TPAA 2NVUB 3EF7A 3O6HA 3M8UA 4ZEKA 2D3IA 4EQBA 5AA2D 2NWJA 4BLAA 2OBGA 3I6VA 4JWOA 2A5TA 3M3LA 5H8SA 2CZLA 3QSLA 1KWHA 3TYHA 4RXLA 3SEVA 2REGA 3FZVA 2I0CA 3E4RA 1MXWA 1AL3A 1MY1A 3K4UA 5FTIA 2OK2A 1NMUA 4JSOA 1H76A 4R9FA 4F3BA 3HCQA 4ELOA 1SI0A 1PBQA 3PUYE 3TZAA 1O7TA 4EQ7A 3K0VA 4F2QA 2YPNA 3HO7A 2F7BA 4ZECA 3EPEA 1GTKA 3K1NA 3TPAA 4H5GA 1R1NA 1URGA 1MG1A 5BUUA 3MPKA 4R6HA 1OMPA 4QFLA 3UIFA 4NEDA 5TPAB 4R6YA 1URSA 3H6UA 1A8FA 4ONYA 3WAFA 2R71A 3FXQA 3KN8A 1TXFA 4OETA 1Y3QA 3VVFA 1T0KA 5ICQA 4GIZA 2ZYKA 4C1TA 3U8QA 2QMWA 4FE8A 1P99A 2QRYA 5KCJA 5FHOA 3JV9A 3T9HB 5A5XB 2Y7KA 4X48A 1MRPA 3OENA 1M5EA 4GXSB 3H7MA 4Z0IA 3GZGA 3CI8A 1OIBA 4X9TA 1BIYA 1Y3NA 4FIMA 5DVFA 2Z8FA 4JXIA 4AB5A 3JYRA 3C4MA 1MQIA 5JK4A 2B3BA 1B05A 5ELVA 4DXUA 4NF5A 3L6HA 2H9BA 3UGWA 4WEPA 3MJNA 5I2NB 4H1XA 3OO9A 3MP1A 4MH5A 4KYDA 2V3UA 4MLQA 3PUWE 1QUJA 2FNCA 3VXCA 5KCJB 2P2AA 1ZLQA 3B7DA 3VVEA 3KZGA 1I69A 1O64A 3SERA 5I59B 3T9VA 4EDPA 2Q9TA 3A3UA 2QS3A 2P1SA 3RNNA 4KD5A 4ZEDA 5TU0A 2DE4A 2DVCA 1YPNA 4QRZA 1FQFA 3S9NC 3OXNA 1IIWA 3KG2A 1MQJA 4XKNA 5IKBA 2BJJX 1N0TA 4U4XA 2E0SA 3CIJA 1IXHA 2O1LA 4NF5B 1Z7ME 5AA2B 3E9XA 2Y7WA 5HPQA 1UTBA 3IOTA 2ABHA 3TTLA 3PU5A 1LBCA 1FTMA 1QUIA 3PUZE 3PMXA 2I4BA 4IO4A 5L8DA 3OSRA 3TTKA 3UK4A 5EHSA 1I6BA 2P0SA 1S50A 2O6AA 3R26A 2R9JA 3MC2A 4EF2A 3RGYA 4N13A 4RK2A 4E0WA 1US5A 2DWAA 1IITA 3IB2A 1P1WA 1ZU0A 3CSBA 2VGQA 1SW4A 3KJTA 3MZBA 1TWYA 3L6GA 3D4CA 1ZIUA 3PMWA 4KFQA 2IEEA 3CSGA 3H6WA 1MXVA 4EQ9A 2V84A 2I6EA 4IO2A 1Y9UA 1QULA 3G3IA 3RY3A 1QJMA 5ICTA 4OEUA 5H8FA 4LONB 4QFOA 2QL3A 3IX1A 3GLBA 1NH7A 3T96B 3KFMA 5AA1A 3MVZA 3PGFA 4HTGA 1M5FA 2O51A 1B1XA 1B40A 1EZOA 4RA1A 2XXTA 5DEXA 3PPNA 3OO6A 3SEYA 3OEKA 1MDQA 2H25A 2Y7PA 3V83A 1IXIA 3N5LA 1Z7NE 4LP2B 4IB2A 3H4ZA 4KCDA 5L9OA 4DCXA 1NKXA 1EZPA 3DP4A 4OWDA 2I0BA 4M4GA 2PT1A 4JB7A 3KEIA 3CFXA 1URDA 5KDTB 4GVOA 3MZ1A 3PPRA 4O3AA 5DTBA 4JBZA 5H8FB 4YKIA 1LAXA 1DPEA 1IUDA 3SEUA 2RINA 2HZLA 4IY5A 1MPBA 1JEVA 3C31A 2Q88A 2GFEA 3KN3A 1F9BA 1FQEA 4TLMB 4NE4A 1A8EA 1NNPA 4R6KA 4POXA 2Y7IA 3BFTA 2O69A 4RYAA 2F35A 1ZBMA 2AL5A 4OQOA 2RC9A 3HHFA 2ONRA 4H67A 5K2XA 3IO6A 4OFLA 3QXMA 1BKAA 1UTHA 2Q8JA 2V93A 3HSTA 3C32A 2NXOA 1H43A 4LATA 1D9VA 2E1SA 5CI5A 1VE4A 5L9SA 1B5HA 4WXJA 1ZJLA 2Z23A 4R74A 5K2YA 1OQHA 4BDQA 2HAUA 2AYSA 4QSEA 4BDRA 3LBSA 2ZMBA 4QFPA 3LSFB 4F18A 5I58A 1B46A 4UA8A 3MP8A 5BWJA 1S9TA 1H45A 2G93A 3S9EA 4IO6A 4Z7EA 1NH8A 4X1DA 3FUZA 1UTHB 3UN6A 4NF4A 3N26A 1B0LA 4O3BA 3SETA 4YB7A 3N6TA 3FVGA 3CVGA 4M1VA 3G3FA 1QKBA 4GL8A 1B6HA 4HS7A 1XVXA 3USDA 4THIA 1XT8A 4F1YA 1NNKA 3DM0A 2ZYMA 2RKMA 2PBWA 3E13X 1JETA 4G68A 2UVJA 4YMBA 1N7WA 5I58B 4ELPA 1PB9A 3IR1A 3Q25A 4K3FA 4F2OA 4E0XA 1FTOA 1PDAA 2F6GA 2H99A 3PV0E 3MVYA 3RPWA 1DTZA 5DYHA 1FQDA 3Q29A 4NF4B 2YLNA 5CMKA 3H6TA 1JW4A 1MH4A 4QSCA 1B2HA 3RUMA 4TQUQ 5AA3A 3FV2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VLUA 1PB8A 3RPLA 3GBBA 4MCOA 2F7AA 1Q35A 4R2BA 3O6IA 4GX6A 2FIXA 1NV3A 3LUYA 1NUYA 4R2FA 5I2KA 3EHUA 3ZSFA 3MYUA 4NMYA 3Q26A 1MY4A 2UXAA 1NL5A 1FTKA 3S4UA 5ISUA 2XD2A 2HHMA 1NNTA 5J16A 2F8DA 4FBPA 3ILTB 4PQJA 4GWZA 2B65A 4F29A 2A5TB 3Q27A 2F36A 4FECA 4N6KA 5FTHA 1DK4A 3S9LC 2VOZA 4KYSA 1Y1MA 2XXUA 1LBZA 1IXGA 3ISPA 1HSJA 1J1NA 3KSJA 4ESWA 4DZ1A 4I3YA 3H3GA 1SI1A 1N3WA 1OLAA 3G7WA 2Y84A 1MXZA 1FRPA 1B4HA 2XXHA 3A3CA 4MNIA 3D4GA 2B3FA 1ZTYA 1K9YA 4DXCA 1YTVA 2F5XA 4OTEA 1B9JA 3KN7A 2RCBA 4ZE9A 1ZMGA 4AS4A 2YJPA 1JVYA 3FV1A 5I2KB 5CRYA 1IMDA 1CNQA 4I1DA 2DP8A 4GOTA 2QSXA 4ELRA 4QF9A 2V3TA 2CMOA 2GRVA 1FPJA 2O68A 1LLSA 3O9PA 5A5LA 3U72A 1R9QA 1N7XA 2PFZA 3K2DA 3ZKKA 1USYH 3W15C 2XWIA 2DXRA 4JDFA 3V8XB 4ELQA 4RPNA 3VDFA 1XOCA 5ET7A 4OFOA 1MM6A 3DLNA 3IFCA 1I6AA 3IB0A 4TOZA 1XS5A 4R73A 1Y1ZA 1AH5A 3H06B 3T9XB 4F3PA 1EU8A 2ZYNA 4HW8A 1ZKBA 2A5SA 1KA1A 3TMGA 1FBHA 1LBYA 4ZE8A 1D9YA 1IMAA 4LQ5A 1GVCA 4OYVA 3KOTA 4PFWA 4NF8A 3CFZA 4R9GA 4PFTA 2OWZA 4ZEBA 3A09A 3ODBA 4OVRA 1M5DA 3QYTA 3IL1B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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