1F9BA

Melanin protein interaction: x-ray structure of the complex of mare lactoferrin with melanin monomers
Total Genus 210
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
210
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKSVRWCTISPAEAAKCAKFQRNMKKVRGPSVSCIRKTSSFECIQAIAANKADAVTLDGGLVYEAGLHPYKLRPVAAEVYQTRGKPQTRYYAVAVVKKGSGFQLNQLQGVKSCHTGLGRSAGWNIPIGTLRPYLNWTGPPEPLQKAVANFFSASCVPCADGKQYPNLCRLCAGTEADKCACSSQEPYFGYSGAFKCLENGAGDVAFVKDSTVFENLPDEAERDKYELLCPDNTRKPVDAFKECHLARVPSHAVVARSVDGREDLIWKLLHRAQEEFGRNKSSAFQLFKSTPEEQDLLFKDSALGFVRIPSQIDSGLYLGANYLTATQNLRETAAEVAARRERVVWCAVGPEEERKCKQWSDVSNRKVACASASTTEECIALVLKGEADALNLDGGFIYVAGKCGLVPVLAENQKSQNSNAPDCVHRPPEGYLAVAVVRKSDADLTWNSLSGKKSCHTGVGRTAAWNIPMGLLFNQTGSCKFDKFFSQSCAPGADPQSSLCALCVGNNENENKCMPNSEERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLQNTDGKNSEPWAKDLKQEDFELLCLDGTRKPVAEAESCHLARAPNHAVVSQSDRAQHLKKVLFLQQDQFGGNGPDCPGKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAELQGKTTYEQYLGSEYVTSITNLRRCSSSPLLEACAFLRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Lactoferrin-melanin interaction and its possible implications in melanin polymerization: crystal structure of the complex formed between mare lactoferrin and melanin monomers at 2.7-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
total genus 210
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA03
2Y7IA 2AYSA 1O7TA 1IQ7A 2DOJA 2REGA 2V3TA 4H5GA 4OHNA 2Q8JA 2WKYA 4ND9A 5BUUA 1HSLA 2DS9A 3E4RA 3EQ1A 4YICA 4MBPA 3CIJA 3TCHA 2GRVA 2VP1A 1NKXA 1RKMA 2GFEA 1B3GA 2PT1A 3LBSA 4AB5A 3LSXA 4R6KA 1B3FA 1M5BA 5ICTA 3MC2A 4LP2B 4YMAA 3JYRA 2PT2A 1B3HA 4PFTA 2O69A 3TCFA 1ZIUA 2ALUA 3U1OA 1B6HA 3LR1A 4RA1A 3OO7A 2O6AA 3Q26A 4XKPA 3TTMA 3SETA 1PB8A 4ZEKA 2NOOA 3WAEA 2VD2A 2QS2A 3IOVA 4PFWA 4X1DA 3SESA 4FAJA 4I8CA 3RTWB 3PGFA 4MFIA 3V8XB 3SEYA 3S9NC 5ELVA 2G29A 1LLSA 3IL1B 2Y7PA 4EXKA 4JWXA 3EPEA 1Y20A 3MZ9A 1EZPA 1FTJA 3TELA 2X26A 3IOWA 1LAFE 4NF8A 1M5DA 1D3KA 4PFYA 4LA9A 4G8MA 1P1QA 4IB2A 1M5CA 3P7IA 2A5SA 3W9VA 3PD9A 3O97A 4Z7EA 1AMFA 2Y7WA 1ZJLA 1RYXA 4I9DA 4F1YA 2I3VA 3K02A 1FTOA 2DVCA 4TQUQ 1ZLQA 3KZGA 3RT6B 2D5WA 3KFMA 4OYVA 1NL5A 1TFAA 1JW5A 2Q88A 3FIRA 1Y4CA 1XHYA 2XXUA 3H6UA 1MQIA 3G3FA 5I57B 3UK4A 3GXAA 5CMKA 1MQHA 1MXZA 3IOUA 4KR5A 4YKKA 3N6TA 4HS7A 2XX7A 2I0CA 1PDAA 1B51A 2QPQA 1WODA 2RC9A 3UORA 4JXIA 3H6WA 2PVUA 2F78A 1JQFA 4LUBA 3MVXA 1SYHA 4G68B 4G4PA 2OCUA 3OO9A 3HPIA 4P0IA 3BBRA 4JBZA 4IGRA 1OVBA 4GRKA 4ZE8A 1FW0A 1B7HA 3RT8A 3K01A 1AL3A 3FZVA 3K4UA 1NFTA 1N0TA 1US4A 4Z0IA 3UIFA 4IO2A 3R26A 3C9HA 2RC7A 3FJ7A 1GTKA 1LFIA 1BIYA 2PYYA 4H6DA 4DE8A 4KCDA 1IITA 1D4NA 4R9FA 1MY0A 5I2KB 3Q29A 3MVZA 2F7AA 4GXAA 4H8JA 4JB7A 4Q0CA 3IOTA 4JDFA 1MDQA 1TFDA 1SQYA 3TQWA 2BJJX 5DTBA 4F2OA 4H5FA 4OEUA 3LSFB 2QS3A 3PU5A 3DM0A 2DWJA 3BKIB 4DXUA 2F6PA 4F2QA 2QMXA 1N84A 2ABHA 3O66A 1UTHB 1B1HA 1B4HA 1POY1 4IY6A 1I6AA 5AA4B 3H7MA 2F6GA 1B52A 3TYHA 3VE1B 3FASA 2ANJA 5JEIA 3C34A 4F3GA 4RK9A 3OOAA 1VFEA 5CMCA 4KD5A 3FVNA 1OQGA 3G7WA 2Q9TA 2XX8A 3JZJA 5DVJA 2Y7RA 4P11A 5TPAA 4U21A 4ECFA 1PBPA 4EQ9A 1URDA 4DXBA 2Z8EA 1FQDA 3KN8A 2YLNA 4ONYA 1WDNA 3M3LA 4QSDA 4YB6A 4JSDA 1ZTYA 3FVKA 3SEUA 1HSJA 3MPKA 2D21A 4GF8A 1B58A 5DYHA 4F3BA 4L17A 4C1UA 2XXPA 1SI0A 4GWOA 2GHAA 3PUYE 1PC3A 3M3KA 1BTJA 4U2RA 1J1NA 1A8EA 1EH3A 1SVXB 3A3UA 3IB1A 5KDTA 4RNSA 4X9TA 2DYXA 3MBPA 4RK2A 3RNNA 4Q5TA 3QSLA 2B65A 3C31A 4THIA 2V3UA 1IXCA 3G3HA 2Z8FA 1B0HA 5AA2D 2YJPA 5K2XA 5TP9B 3IORA 3KSJA 1PBQA 5M2VA 3KOTA 1SYIA 1N04A 4O3BA 2R9JA 2DE3A 4QFOA 3QAXA 4FIMA 1YAEA 3O29A 3ONMA 3Q25A 2DWHA 1FTKA 4R2BA 1OMPA 3S4UA 4EQ7A 1GGGA 1NH7A 4NF5B 5AE4A 2UVGA 3U72A 4NEDA 4U22A 4BDLA 3BFTA 4LQ2A 2ZNSA 2FA7A 3RN8A 3IAZA 3C35A 1MQJA 2XXHA 2XXRA 1B9JA 3JV9A 3TEPA 2FYIA 4LZ7A 3QUFA 1SBPA 3S2VA 4GLIA 4PE5B 2QMWA 1DPPA 3PPQA 2UVJA 3FV1A 1LFGA 2V25A 3HO7A 5DVIA 5CI5A 4BDNA 4R75A 3OXNA 1B5HA 4R9GA 3TCGA 2E1SA 1S9TA 4OMBA 5I2NA 2ZYNA 4ESXA 1XC1A 4YKJA 1LCTA 5AA3A 4GD5A 4U1OA 5H8NA 5H8FA 4KI0E 4KYDA 2ONRA 2B3BA 1IXIA 2I4BA 1B5IA 4MLVA 2NXOA 4KQPA 3PMVA 1LBCA 1PB9A 3IJOB 2V3QA 2XX9A 1POTA 4OTEA 2PX1A 4N13A 3F11A 4XKQA 4JSOA 4KYSA 2F7CA 1USYE 4AB6A 3OENA 3E9XA 3OMBA 3VLVA 4KYEA 1H45A 1B46A 3TTLA 2NUVA 1Z7ME 2QJEA 2HAVA 5ICQA 4H67A 3W9WA 5CBSA 3UA8A 3KN3A 3OO6A 3A3CA 3PV0E 4E0WA 3C32A 3PUVE 3T66A 5I59B 2Z8DA 1H44A 3K00A 3SEXA 5L9SA 3OSRA 1LCFA 2A5TB 4FEDA 5CBRA 1BP5A 3L6HA 1B40A 1Y3PA 3KGCA 3ZKLA 1B1XA 4U4SA 4PETA 1AOVA 3MP6A 1WVJA 2O1LA 4BLAA 3TUSA 3QUJA 4ZEBA 2QS1A 1MXVA 4MLQA 4TLLB 5EHSA 4QFPA 5CM6A 1LGBC 2DE2A 4QFLA 1OIBA 4ZS9A 1H76A 3LSWA 4Q8RA 3ILUB 3TPAA 1NNKA 1QKAA 4R6HA 1QUKA 4AQ4A 2O84X 4YB7A 3H6TA 5TU0A 3OEMA 2B3FA 1UTBA 3E13X 5H8HB 5I57A 4QRZA 5KCJA 4QHQA 4ZEFA 3O9PA 4F39A 3CVGA 1XOCA 1XT8A 4G77A 1TT1A 3G3IA 2P1SA 2I58A 4F29A 1MPDA 4YKIA 3QK6A 4ESWA 4IO7A 4HCYA 4ISUA 3TTKA 1JEVA 4FATA 4IGTA 1B3EA 4ZE9A 2F7BA 4M4GA 2Q89A 2QS4A 1A54A 2UYFA 1YPNA 2O7IA 2W7YA 1MY1A 4EXLA 3PMWA 3DP4A 1B0LA 1MY2A 4HTGA 3O6HA 3A09A 3RLFE 1A8FA 4EF1A 3PPPA 4I1DA 5DVFA 4NF8B 4BDOA 1MDP1 1GVCA 4QSEA 2DWAA 3SDFA 4GXSB 2H25A 2Z23A 4GIZA 3G3GA 1Y9UA 1IXHA 5H8QB 2DSFA 3MP8A 1FTMA 3DELB 1FQEA 1ZBMA 1SD3A 2Z22A 2HZKA 4UACA 4KFQA 3VDFA 1HSEA 3TKDA 2NWJA 4Q30B 1M5EA 3KN7A 1YTVA 5ISUA 2ZNUA 3SKPA 1UTHA 5F7VA 4MF3A 3U94A 4NF6A 2H98A 1H43A 1XVYA 4N6PA 1YCJA 2XXIA 3G3KA 4K3FA 5AA4A 4TOZA 4OFOA 4G2ZA 2P2AA 3IJXB 1JVYA 1MM6A 3MJNA 1SDXA 1US5A 2GH9A 3C4MA 1QUJA 5FHMA 3TTRA 3MUQA 3HHGA 3K2DA 3SEWA 3RGYA 3MZBA 4NWCA 2NVUB 2QRYA 2R71A 5EHMA 1R1NA 2OBGA 3L6GA 4XTCQ 4UA8A 1FQBA 1QVSA 4JWOA 3KBRA 2O1MA 1P1WA 4IO6A 3O6GA 2CZLA 4KHZE 4LQ5A 1Y3QA 2P0SA 4X1BA 2ZYKA 1DPEA 5JTYB 4LATA 3OEKA 4LVQA 4F18A 5K2YA 2E0SA 3BFUA 4OFJA 5IAIA 3UN6A 2DP8A 3H03A 5A5XB 2D3IA 2ZYMA 5L9MA 3ZSFA 1RYOA 5H8SA 1OVTA 4ELQA 2DVZA 5CC2A 3USDA 1IZ1A 3VXCA 2O68A 5HM4B 1SW2A 5FTIA 1GV8A 4ZDMA 2M8CA 3DP8A 3MWBA 1Q35A 2XXVA 5L9OA 2RINA 1P1OA 5TP9A 5B7DA 5I58A 1O63A 3FVOA 4X48A 2RCBA 3O28A 5ITPA 5AA2B 3FXUA 3Q27A 1L5TA 3W15C 2IEEA 4ELPA 2ONKE 3FXQA 3I3VA 3ILTB 4N07A 4FECA 3HV1A 1XVXA 3V83A 3CSBA 4F3PA 4NF5A 1ELJA 2O7UA 4OETA 3KJTA 3AXFA 5TPAB 4WKMA 1MM7A 3VVDA 1DOTA 1JW4A 3N94A 5HBCA 1R9QA 3CSGA 3K6XA 4NWDA 3D4CA 3GLBA 3CR9A 3EHSA 1VR5A 1UIVA 2UYEA 2H9BA 1NMUA 2Q2CA 1N7XA 2REJA 3VVEA 2FNCA 4H1XA 2XHDA 5KDTB 3SERA 1MQDA 4KCCA 4NF4B 1OLAA 3FUZA 1GR2A 4IO4A 4OFLA 2XXQA 1DSNA 1OQHA 4M1VA 3H06B 3K6VA 4ZEDA 1EZ9A 3FJMA 3T22A 3N6UA 1B5JA 1NNPA 3EF7A 3MAMA 2V84A 4FE8A 3M8UA 2RC8A 1MH3A 4FJPA 4F31B 5KZTA 2OZZA 3UGWA 1OLCA 1FQFA 1P99A 3LC8A 3UP9A 4EDPA 2PBWA 5F1QA 1CB6A 3KSXA 4QF9A 4YMBA 1ATGA 4O3CA 1B32A 1R9LA 4G8HA 4IY5A 3U93A 3MZ1A 3N5LA 1Q1KA 3PPOA 2H99A 4JWYA 1XS5A 1IXGA 5I56B 3N26A 4LZ8A 4U4XA 4GL0A 4C1TA 4ELOA 2VOZA 5I84A 1FQCA 5DT6A 4U1ZA 3K1PA 2ZMBA 4DCXA 2HEUA 4OESA 1JEUA 3PPRA 4P0GA 4XKRA 2OWTA 3ECRA 4OENA 5H8NB 5H8FB 3VFJA 2VGQA 4XIGQ 5L8DA 3QXMA 3RPWA 2VHAA 1QKBA 3TMGA 3V89B 3CFXA 4RPNA 1ZMGA 2V93A 4OWDA 2Y7KA 2UVIA 3QIMA 4OQOA 2XXYA 4F22A 2XXWA 5DEXB 5BWJA 3MQ9A 5H8HA 1N76A 3IO6A 3H6VA 3DP6A 4OVJA 3HSTA 3T9VA 1R6ZA 2AL5A 1MY4A 4BDQA 3TAJA 1MPCA 1MS7A 1SW4A 4EQBA 4ZECA 2UVHA 2LAOA 1LSTA 4OEVA 1KWHA 1N7WA 1EZOA 4WEPA 2H5YA 4YKPA 3PUXE 4LONB 1MY3A 4H65A 3CI8A 3K6UA 1SW5A 3VV5A 1I6BA 4BDMA 3OO8A 3O6IA 4R74A 3IB2A 2RCAA 1VSOA 1B2HA 1TWYA 1Y1ZA 4QFNA 1QJMA 3RTFB 2I49A 3PMXA 3FGSA 3GZGA 4RPOA 2IA4A 3U92A 4WXJA 1VE4A 1B7UA 4H0WA 3WAFA 4EF2A 3IK6B 2HQ0A 3K6WA 4DIGA 4G68A 1II5A 2AL4A 5H8QA 2ZXTA 4DDDA 1Y4TA 4NMYA 3B6TA 2XXTA 1Y3NA 3TFLA 1F9BA 1LB9A 4G68C 4XKNA 1D9VA 1NH8A 2KLFA 1JVXA 5CMBA 2HAUA 4LZ5A 3Q28A 1UTBB 3LSLA 2RF1A 2OK2A 2ZYOA 1A99A 3PUWE 5KCJB 2YPNA 2HZLA 1D9YA 3MVYA 1A7LA 3U8QA 3S9LC 3T9UA 2PMSA 3C36A 1MXUA 5I2KA 1LAXA 3FXRA 4F1VA 3H4ZA 1LB8A 3CRBA 3EN3A 4QSCA 4OXVA 4I62A 4ELRA 1CE2A 2CMOA 2OJTA 2X7QA 4PQJA 1B05A 2Q2AA 1LFHA 1LAHE 4FORA 3TZAA 4HW8A 4RXLA 2F36A 3CFLA 5B70A 5FHNA 5FHOA 2ESNA 3H3GA 2ONSA 2I0BA 3MP1A 4O3AA 3GBAA 1N3XA 3I5OA 4YZZA 1A55A 3DLNA 2VD3A 3S9MC 3CG3A 1N3WA 5JTYA 3V5AA 4HCWA 4POWA 1BLFA 3OSQA 3RQTA 5A5XA 1FCKA 1EU8A 3LUYA 3IB0A 4RYAA 3RUMA 3K1NA 4OZ9A 5CMMA 3OD7A 1FQAA 1I69A 3IX1A 2F34A 3EHTA 4ZZEA 1IEJA 2O51A 2DE4A 1QW0A 2F35A 3MPLA 1DMBA 4WEDA 5IKBA 3OELA 3M3FA 4R73A 3B7DA 1M5FA 3C33A 1NNTA 4NF6B 1MXXA 3T9HB 5J1DA 1QULA 4GQOA 1A40A 4YB5A 3T93B 1LAGE 4H8IA 4R6YA 3MW0A 1MXWA 1H3DA 3T9XB 1JW1A 1URGA 4U23A 3IR1A 5AA2A 4BDRA 4F19A 3ZKKA 4QFKA 1B7ZA 3KOSA 1QUIA 1P1NA 4GL8A 3HHFA 1B4ZA 4DCYA 3VXBA 2DQVA 1UIUA 1MXYA 3THIA 4C0RA 3IO4A 4NTLA 1SI1A 3S9EA 1UQWA 3PPNA 2R6GE 5JK4A 4NE4A 3R7XA 3CFZA 3KG2A 2F97A 4IO5A 1MRPA 2I6EA 3GBBA 1BKAA 1MH4A 4GOTA 4ZEIA 4GFRA 3G3JA 3CG1A 1T0KA 2F8DA 3O2AA 3TTNA 2HXWA 3VVFA 1FTLA 3I6VA 3VLWA 1SW1A 4NF4A 4R72A 4YU0A 4F3SA 4POXA 4ZZAA 3PUZE 4OERA 3B6WA 3PD8A 2THIA 1S50A 3SEVA 1URSA 4YAHX 1IIWA 1S7YA 3FVGA 1PEBA 2DWIA 1B3LA 1Z7NE 5I58B 1LBBA 3FATA 1DTGA 3TODA 1AIVA 2I3WA 5AA1A 3QYTA 2HCAA 4RY1A 4G8NA 4DXCA 3RY3A 2XXXA 4XXUA 2OWSA 1P1UA 2G93A 2RKMA 1O64A 4DZ1A 4F1UA 4TLMB 2QSXA 5EYFA 4FEBA 1DTZA 5LOMA 1IUDA 3MVWA 3KJ7A 2H4IA 5HPQA 1Y1MA 5CRYA 2DXYA 3EHUA 1MQGA 2XD3A 4EUOA 3VLUA 2Y84A 4PP0A 2GHBA 5I56A 1MPBA 2F5XA 1VFDA 3K0VA 3T96B 3HN0A 1JNFA 5FTHA 3B6QA 1AH5A 2OLBA 3K1MA 3E3KA 2XD2A 1ZKBA 1PB7A 2HFBA 4PFUA 3TDJA 5I59A 1USYH 1MG1A 4IO3A 1JETA 3FV2A 4E0XA 4GVOA 2I48A 2DXRA 3FJGA 2A5TA 3D4GA 3ODBA 4KPTA 1ANFA 3HCQA 1NNFA 4RJZA 5ITOA 1TXFA 2QL3A 3KEIA 4MH5A 4DLDA 4R2FA 3R6UA 5DEXA 3FD3A 1I6QA 2AIXA 2UXAA 3TQLA 2ZNTA 3ZS6A 2I4CA 5I2NB 1ZU0A 2X7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7IA 2AYSA 1O7TA 1IQ7A 2DOJA 2REGA 2V3TA 4H5GA 4OHNA 2Q8JA 2WKYA 4ND9A 5BUUA 4OVRA 2PFYA 1HSLA 2DS9A 3E4RA 3EQ1A 4YICA 4MBPA 3CIJA 3TCHA 1NV4A 2GRVA 5EQ7A 2VP1A 1NKXA 1RKMA 2GFEA 1B3GA 2PT1A 3LBSA 3LSXA 4AB5A 4R6KA 1B3FA 1M5BA 5ICTA 2B4MA 3MC2A 4LP2B 4I3EA 4YMAA 3JYRA 2PT2A 2V4CA 4DI3D 1B3HA 4PFTA 1LBVA 2O69A 3TCFA 1ZIUA 1NV3A 2GQ1A 2ALUA 3U1OA 1B6HA 3LR1A 4RA1A 3OO7A 3RPLB 4MNPA 2O6AA 3Q26A 4MEVA 4XKPA 3TTMA 4GWYA 3SETA 1PB8A 4ZEKA 2NOOA 3WAEA 2VD2A 2QS2A 4LN5A 3IOVA 4PFWA 4X1DA 3SESA 4FAJA 1K9ZA 4I8CA 3RTWB 3PGFA 4MFIA 3V8XB 3SEYA 3S9NC 5ELVA 2G29A 1LLSA 5IZZA 3IL1B 2Y7PA 5DW8A 4EXKA 4JWXA 3EPEA 1Y20A 3MZ9A 1EZPA 1FTJA 4NN3A 3TELA 2X26A 3IOWA 1LAFE 4NF8A 1M5DA 1D3KA 4PFYA 4LA9A 4G8MA 1P1QA 4IB2A 1M5CA 3P7IA 2A5SA 4PFIA 3W9VA 3PD9A 5F24A 3O97A 4Z7EA 1AMFA 2HPGA 2Y7WA 2QVVA 1ZJLA 4PAKA 1RYXA 4I9DA 4F1YA 2I3VA 3K02A 1FTOA 2DVCA 4TQUQ 1ZLQA 3KZGA 3RT6B 2D5WA 3KFMA 4OYVA 1NL5A 1TFAA 1JW5A 2Q88A 3FIRA 1Y4CA 1XHYA 2XXUA 3H6UA 1MQIA 3G3FA 5I57B 3UK4A 3GXAA 5CMKA 1MQHA 4GWWA 1MXZA 3IOUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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