1FCKA

Structure of diceric human lactoferrin
Total Genus 230
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
230
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
RRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metal substitution in transferrins: specific binding of cerium(IV) revealed by the crystal structure of cerium-substituted human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 230
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA02
1B4ZA 5H8NB 4MFIA 1EZ9A 3B6WA 1MY2A 1QUKA 5IAIA 1B52A 1MM6A 3UA8A 3CSGA 3IORA 4DZ1A 5ISUA 3SEYA 3QK6A 5I2NB 4NF6B 3SEXA 4TLLB 3RUMA 1NNKA 1OMPA 4YMAA 3FIRA 1JEUA 1Y20A 5TPAA 2F6GA 3RT6B 1A8EA 1DPPA 3E13X 1Q1KA 1LFHA 3PGFA 3QYTA 5AA2B 4OTEA 3G3FA 4QFKA 1Y3QA 5I56A 3WAEA 1JW1A 3U93A 4MH5A 1EH3A 1ZJLA 2NXOA 1IXIA 2Z23A 1TFDA 3S9LC 4ESWA 2REJA 1FW0A 2F97A 1MPBA 1B5IA 5JK4A 3PUYE 1B1HA 1MXYA 5L9SA 3E9XA 5TP9B 4G68C 4U4XA 1OQHA 1OVBA 2XXRA 4RPNA 4U1OA 1H44A 3EHSA 1Y4TA 1VSOA 1CE2A 3K1PA 4G8HA 1B5HA 1MH3A 1I6QA 3MP6A 4JB7A 3VV5A 5KCJB 5I58A 3K02A 4Z0IA 4F31B 3H03A 5CMCA 5A5XB 2YJPA 2Z8DA 4G68B 2XXTA 3IR1A 3PUVE 3T9HB 4DXUA 5ITOA 2VD2A 5HPQA 2ONKE 2ZNSA 2A5TA 4KR5A 4P11A 1B6HA 4QSEA 1DOTA 1US4A 4H67A 5I59A 4EF1A 3MZ1A 2NVUB 1IIWA 1LGBC 1B58A 4PE5B 4YAHX 4NEDA 4ZEIA 1PBPA 3CFXA 5CMMA 4BDQA 2RC7A 3EHUA 2BJJX 2Y7WA 3D4CA 3HSTA 3KJTA 1M5BA 3RNNA 4G4PA 3SETA 2XXIA 3WAFA 3OSQA 2XX7A 2I58A 1ELJA 2X26A 5TU0A 2H25A 1JETA 1B0HA 1OLCA 4JSOA 2Q8JA 3C31A 4ONYA 2YLNA 3G7WA 1M5FA 1LCTA 4BDOA 4YICA 4R73A 5I57A 3IOUA 3EF7A 4R2FA 4MF3A 2VGQA 1QKBA 4LUBA 2AL5A 3OENA 4WEDA 2E1SA 3HO7A 2OK2A 1I69A 2OLBA 3GXAA 3B6TA 1MQIA 5I2KA 2XXQA 2F78A 4K3FA 2QMXA 1QKAA 4LP2B 3QUFA 1EU8A 5DVIA 3OD7A 1EZPA 3VFJA 4F1VA 4U23A 3MZBA 2FYIA 1HSJA 3UP9A 1XOCA 5CI5A 1UTHA 4ZEBA 1P1OA 2HQ0A 4DLDA 4IY6A 1MY3A 1BKAA 1N3XA 1NNPA 3S4UA 3I3VA 3Q26A 3PPRA 4QHQA 1LCFA 2FA7A 4U22A 5CRYA 1SDXA 3E3KA 1A55A 3MVXA 1FQDA 2UYFA 5DEXB 1TT1A 1SBPA 4KD5A 3FV2A 3FUZA 4PFWA 4NF4A 2UVIA 3T9VA 5DVJA 3K00A 2VP1A 2CZLA 4R6YA 3U92A 3VVEA 5JTYB 1PB9A 1SW5A 3U94A 4RK9A 5H8QA 4FIMA 3KBRA 4JWYA 1P1QA 3N26A 5ICQA 3SEWA 2XX8A 1AIVA 4LZ7A 2I6EA 3AXFA 1POTA 3VLUA 4IO4A 2RC9A 3KG2A 3U8QA 3M3LA 3TKDA 4ZS9A 5ICTA 5H8FA 3I6VA 1XT8A 1GVCA 2H99A 2Q2AA 3TTRA 3C34A 1LBBA 3C36A 1FQFA 3ILTB 2ZMBA 1A8FA 5CM6A 4I8CA 3MZ9A 4AB6A 1MQJA 3TCFA 1OVTA 4ELQA 3VVDA 2YPNA 4PFUA 3T96B 1DTZA 3OXNA 3KSXA 3K1NA 3TODA 4BDRA 4OFJA 4DCXA 2XXVA 3R26A 3ZSFA 5I56B 4QSCA 3FVNA 2O6AA 2HCAA 2IEEA 3B7DA 3G3IA 1R1NA 3M8UA 3RQTA 2ZYOA 4EQBA 2UVJA 3TUSA 1PC3A 1Y3PA 3ODBA 1N76A 5M2VA 2NOOA 4H8IA 2OJTA 2HZLA 3TTMA 4R74A 5AA3A 3TAJA 1SQYA 1O7TA 1MXWA 3UIFA 3R6UA 4ECFA 3T22A 4IGRA 2I0BA 3VLWA 3VVFA 3KOSA 5CC2A 4R2BA 1OQGA 3G3KA 3BFTA 3MC2A 3T93B 1LBCA 4F22A 3TYHA 4O3BA 4IY5A 4JSDA 3KSJA 1UTBA 2F6PA 3C33A 3U1OA 1NKXA 2Q2CA 2ZXTA 4M1VA 3QXMA 1II5A 1M5DA 4H1XA 2P1SA 1MY1A 3O29A 2B3FA 3TELA 4POXA 2GRVA 3VDFA 4XKQA 4OEVA 4ZEDA 3MVWA 1ZLQA 2O84X 2OZZA 3LUYA 3DLNA 2A5TB 3FVKA 4LQ5A 3MJNA 1IXGA 4IO6A 5AE4A 3TTNA 3TMGA 4ELRA 3MWBA 4WEPA 3QIMA 2RCAA 5LOMA 3K6VA 3TQWA 1A54A 2DS9A 4XTCQ 1ZKBA 2P0SA 2IA4A 4GIZA 4FATA 3IB0A 3OELA 3H7MA 1UQWA 4G77A 4U4SA 1D4NA 3IOTA 4UA8A 2O1MA 4F1YA 4JXIA 3DELB 1O64A 2O51A 1S9TA 5JEIA 4KHZE 1MG1A 1QULA 1FTMA 4RJZA 1N04A 4EXKA 3KN7A 4FAJA 2DWIA 2RKMA 1B51A 2QSXA 2DE3A 2DE4A 1LSTA 4R6KA 3BBRA 3PD8A 4DXCA 3KZGA 4LONB 3N5LA 3PUZE 4YKJA 5EHSA 1Y4CA 1H76A 1GTKA 2DWAA 4QSDA 4O3CA 4FE8A 1B7UA 3QSLA 1H3DA 1ZMGA 1I6AA 1LB8A 3CSBA 3T9XB 5FTIA 1LAFE 5FTHA 3LSWA 3IL1B 4FORA 3O9PA 3H3GA 4WKMA 1MQGA 4DIGA 2UVGA 3S9MC 2B3BA 3RT8A 3IJOB 3TDJA 3OO7A 2KLFA 4RY1A 3VE1B 2PMSA 4DDDA 1M5CA 2QMWA 2V3UA 1RKMA 4GL8A 1FQBA 1Q35A 3HN0A 2E0SA 2GFEA 3K2DA 1A7LA 4YZZA 3K6UA 3KOTA 1MQDA 1ZBMA 1JVYA 1P1WA 4OYVA 4C1UA 1N84A 4P0IA 1QUIA 4TLMB 4IO3A 2I4CA 1PB8A 3LSLA 2PX1A 4M4GA 3I5OA 3H6UA 3N6UA 1GR2A 3W9WA 1XHYA 1Y1ZA 1B46A 5K2YA 1Z7NE 1HSEA 4X1DA 1R9LA 3UGWA 1S7YA 2DVCA 4C1TA 3FASA 2HZKA 2REGA 4PETA 2Y84A 1MM7A 5BUUA 4KYDA 4QRZA 4OXVA 3CVGA 1IITA 4NWDA 3SERA 3KEIA 4F2OA 2ZYNA 2B65A 3O66A 1WODA 4GLIA 5H8FB 4HS7A 1NFTA 4X1BA 5DT6A 5KZTA 5CBSA 1NNTA 3CRBA 4PFTA 4XXUA 4ELPA 2RCBA 1MQHA 1B3GA 1MY0A 1SW4A 4NTLA 1D3KA 1PB7A 3HCQA 1B4HA 2H5YA 2XXPA 3PD9A 1OIBA 2XXUA 2ESNA 5I2NA 2ONRA 1H45A 4L17A 4NF6A 1PEBA 1L5TA 5K2XA 1SD3A 1MH4A 4F3SA 1S50A 4YKIA 1XC1A 3N94A 4F3PA 3JYRA 5H8HB 2Q9TA 4KPTA 2I0CA 3M3KA 1A99A 3PPQA 2ANJA 4YB5A 5AA2A 2I49A 4AQ4A 1N3WA 1TFAA 4ZEFA 2R71A 2RC8A 5DTBA 5AA1A 4YB6A 4XKPA 4HTGA 4YMBA 1MXUA 2F7BA 3SEUA 4KCDA 2DQVA 4Q0CA 4NF5B 1MXXA 3VXBA 3K1MA 1QW0A 1ANFA 5TP9A 1VE4A 1B32A 1OLAA 2RF1A 5CMKA 1FTOA 3K6XA 4ZZAA 1JW4A 4EDPA 1A40A 3SDFA 4X48A 2LAOA 2O1LA 1UTBB 5AA4B 3MQ9A 1Y3NA 1LFIA 3K6WA 4LZ8A 1SYIA 3JV9A 2QL3A 4ND9A 4GFRA 1NH8A 4G8NA 1MXVA 4FJPA 3HHFA 3S9EA 3CR9A 3FD3A 3G3HA 4NF8B 2X7QA 3CG1A 5BWJA 1SYHA 3D4GA 2I3WA 5ITPA 5KCJA 4RPOA 2HAUA 4ZEKA 2F35A 1DSNA 2NUVA 1SI0A 4IO5A 3IOWA 1DPEA 2DE2A 4G68A 3Q28A 2DXYA 1USYE 1XVXA 2I4BA 2PT2A 4U2RA 3A09A 2A5SA 4NMYA 4OFLA 3JZJA 4ZZEA 4IO2A 1JW5A 1LAXA 1N0TA 4RYAA 2THIA 3LR1A 1O63A 1JEVA 3MP1A 4YB7A 2XHDA 3OMBA 4R72A 4ISUA 2Y7KA 3MAMA 2DP8A 3KN3A 3O6GA 2PVUA 3KGCA 1AMFA 4GXSB 5TPAB 2H4IA 3PU5A 5HM4B 1B0LA 2DXRA 2AIXA 4F18A 1B40A 3MPKA 1MRPA 3TCGA 2PT1A 4RNSA 1FTKA 4X9TA 2FNCA 4RK2A 4JWOA 4KQPA 5L9MA 2F36A 5KDTA 1ZIUA 4F1UA 4EF2A 3IAZA 5DYHA 1UIUA 3MPLA 3FXQA 2PYYA 2HXWA 4F19A 4IO7A 3RN8A 3RTFB 3V89B 4PP0A 3EHTA 2UYEA 2F7AA 2OCUA 3O97A 4EUOA 4LVQA 4H5GA 1EZOA 3DP6A 2Y7RA 1CB6A 3CI8A 2I3VA 3PV0E 4AB5A 1GV8A 3OOAA 3FZVA 2DYXA 3MBPA 1MY4A 4F3BA 3PPPA 2XD3A 3ZS6A 1HSLA 2W7YA 4GOTA 1N7WA 4TQUQ 4BLAA 1D9VA 1LB9A 3CIJA 4KYSA 1SI1A 1R6ZA 3DP4A 1LAHE 3TCHA 2D21A 4RXLA 1WDNA 2HEUA 5I58B 4JWXA 5FHMA 3PUXE 2DWHA 1B05A 1FQEA 5B7DA 4GF8A 5ELVA 3FATA 4QFNA 4E0WA 1VFEA 3OEMA 3Q25A 4GRKA 1YTVA 3C32A 4MLVA 5I59B 1IQ7A 1IEJA 3CFLA 2ONSA 3V5AA 3FVGA 4YKPA 3O28A 4KI0E 2PBWA 5JTYA 4YU0A 1T0KA 1FTLA 3N6TA 2QJEA 3PPOA 4DCYA 3SEVA 5B70A 4PFYA 3UORA 1JVXA 4JBZA 4F39A 3OSRA 1ZU0A 1FQCA 1RYOA 3V8XB 3IO6A 2F8DA 4I62A 3LBSA 4OENA 3RGYA 5F1QA 2Z22A 3W15C 4FEBA 3FVOA 3Q27A 4OQOA 3USDA 3RPWA 1IXHA 3E4RA 2Q88A 3G3GA 2DOJA 3P7IA 1LLSA 2RINA 4H6DA 4R9GA 2QS3A 1YAEA 2XX9A 1D9YA 3B6QA 2F7CA 5I57B 1UIVA 2R6GE 3BFUA 3TQLA 2M8CA 4ZE8A 3UN6A 4U21A 4BDNA 1SW1A 3LC8A 2V25A 3EPEA 1POY1 2O7IA 3SKPA 5I2KB 4G2ZA 5F7VA 4OHNA 3A3UA 3C4MA 3TZAA 1H43A 2DVZA 4QFOA 1BIYA 4O3AA 1R9QA 1UTHB 1QUJA 1BTJA 4GD5A 1IUDA 4DE8A 4JDFA 2G29A 1M5EA 1PDAA 4GXAA 3OO9A 2QRYA 1XS5A 1AH5A 3W9VA 2H98A 4NF4B 3MW0A 4OWDA 4N07A 3S2VA 3FJ7A 2D3IA 4EQ9A 5H8SA 1VR5A 2AYSA 1NMUA 4MBPA 1MS7A 5H8QB 2DSFA 1NL5A 4N13A 4LQ2A 1BLFA 2ABHA 3RY3A 4FEDA 3ECRA 4NE4A 2ZNUA 2O68A 2O69A 3HHGA 1SVXB 3IB1A 1URDA 4LA9A 5H8NA 4OESA 4IB2A 4KFQA 3RLFE 4Q30B 2GHAA 3ONMA 5EYFA 4R75A 2Y7PA 4G8MA 5FHNA 3FJMA 3ZKKA 4ELOA 2AL4A 3CFZA 4H5FA 3MVYA 1P99A 1ATGA 5L9OA 4I1DA 1YCJA 3ZKLA 3O2AA 4OETA 1JQFA 2QPQA 5KDTB 2VHAA 2V3TA 3GLBA 2Z8FA 4ESXA 1BP5A 1LFGA 2VD3A 2F5XA 3G3JA 4OERA 1NNFA 3O6HA 1WVJA 2P2AA 4OMBA 1DMBA 1MPDA 2X7PA 2R9JA 2ZYKA 1B3LA 4LATA 1Y1MA 4PQJA 4P0GA 3IK6B 3Q29A 3LSFB 3OEKA 3H6WA 4KYEA 1B3FA 1AOVA 4EXLA 4H8JA 5IKBA 1JNFA 4OEUA 4ZECA 1N7XA 3H06B 4R6HA 3H6TA 1URSA 1B7HA 3IB2A 4F3GA 3L6GA 3A3CA 4THIA 4OVJA 2UXAA 1RYXA 2Z8EA 3GBAA 1QJMA 3QAXA 4UACA 3MUQA 3IX1A 1MXZA 5HBCA 5CMBA 3DM0A 4H65A 4OZ9A 3FXRA 1USYH 5L8DA 3GBBA 1IXCA 4NWCA 4EQ7A 3EQ1A 3HV1A 5A5XA 3TPAA 2Q89A 5EHMA 3KFMA 3U72A 3K4UA 1NH7A 4N6PA 4BDMA 1XVYA 1Y9UA 3K0VA 1F9BA 2DWJA 1IZ1A 2I48A 3C35A 3T66A 4C0RA 4IGTA 4Q8RA 3LSXA 1FTJA 2D5WA 3MVZA 4FECA 3BKIB 2WKYA 5CBRA 3FXUA 5AA2D 3T9UA 4E0XA 3SESA 1AL3A 4H0WA 3OO6A 4GVOA 4QFLA 3VXCA 3PMVA 4YKKA 4Q5TA 3RTWB 2ALUA 3EN3A 1P1NA 1FCKA 1URGA 2OBGA 2F34A 3FV1A 3OO8A 1TXFA 4XKNA 2CMOA 4TOZA 2ZYMA 1FQAA 4QF9A 1TWYA 1YPNA 2V93A 1KWHA 4ZDMA 4POWA 2G93A 4U1ZA 3PUWE 3UK4A 4ZE9A 3L6HA 1US5A 1SW2A 5DVFA 4QFPA 4HW8A 1MPCA 3VLVA 2Y7IA 1LAGE 1GGGA 3C9HA 3QUJA 1ZTYA 2UVHA 2XXYA 4GQOA 1VFDA 4KCCA 1PBQA 1I6BA 5H8HA 2GH9A 3PPNA 3HPIA 4GL0A 2OWSA 2QS2A 2NWJA 2H9BA 2V84A 3THIA 4GWOA 3H4ZA 2XD2A 3TFLA 2O7UA 3TTKA 4LZ5A 5FHOA 3TTLA 3TEPA 4F29A 4XKRA 4BDLA 1B2HA 3FGSA 3PMXA 4I9DA 4DXBA 2QS4A 4NF5A 3CG3A 1Z7ME 4RA1A 3IOVA 3GZGA 1B7ZA 4OFOA 4F2QA 1B1XA 2QS1A 2VOZA 3K01A 1B9JA 1DTGA 2ZNTA 1B3HA 3PMWA 5AA4A 2HAVA 2V3QA 2HFBA 3ILUB 1P1UA 3FJGA 1MDQA 5DEXA 2XXXA 3H6VA 3KJ7A 3O6IA 3MP8A 3DP8A 4NF8A 1QVSA 5I84A 2GHBA 4HCWA 4Z7EA 4WXJA 2XXHA 2XXWA 3S9NC 2OWTA 3V83A 1J1NA 1B5JA 4R9FA 4MLQA 3F11A 4XIGQ 3IO4A 3KN8A 3M3FA 1MDP1 1B3EA 3IJXB 4HCYA 3R7XA 5J1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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