1FQEA

Crystal structures of mutant (k206a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVAHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 100
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqeA02
3C4MA 3IOWA 1A8EA 2Q88A 1M5EA 1URGA 4OEUA 2ABHA 2H4IA 1SW1A 3QK6A 1QULA 3BBRA 3MVYA 5TU0A 1I6BA 2ZMBA 3IOTA 2DP8A 1OLAA 1QVSA 2I4CA 2B3BA 2F5XA 2I3VA 2QL3A 5CMKA 3IJOB 1ATGA 5DEXB 3EHTA 2Y7IA 5CC2A 2DXRA 3N26A 5TPAB 1FQAA 2PMSA 5L9SA 2HAUA 2NOOA 5F1QA 4GIZA 5HBCA 1POTA 3FJGA 1NH8A 1N04A 1TFAA 3I3VA 3ILTB 1R1NA 1LCFA 4F31B 5AA1A 5H8QA 4NF8B 4QF9A 4Q30B 2YJPA 3U72A 4BDMA 3TZAA 3KZGA 1KWHA 1O64A 2Y7RA 4DIGA 2AYSA 4QFLA 4EF1A 4YKJA 1JEVA 1B0HA 4X9TA 4RNSA 5J1DA 3L6GA 3O9PA 2QS2A 4OXVA 4R2BA 1OVTA 2D21A 2QPQA 1USYE 4HCWA 1UTBB 1Y20A 1P1NA 4NF4A 3Q27A 4IO6A 4U23A 3FV2A 4AB6A 1B4ZA 2HAVA 1US5A 1MXUA 1PDAA 4OENA 4OFOA 2GRVA 1MQDA 2OJTA 4Q0CA 3CR9A 5DVFA 2RC9A 2I48A 1A99A 2V84A 1MQHA 3H6UA 1DPPA 3MZ9A 4LA9A 3CFLA 5I58B 3QUFA 2OZZA 1MY4A 3FVGA 2PVUA 5JTYA 5DVIA 1MQIA 2XX7A 1LLSA 3RNNA 4OWDA 1AH5A 3KJ7A 5FHOA 4R2FA 2A5TA 4UACA 4LVQA 3Q25A 1GR2A 2DQVA 1AOVA 1H44A 4F1YA 3N6UA 4RJZA 3MZBA 1A8FA 2YLNA 4N6PA 3LSXA 2Z8FA 4ELRA 2GHAA 4O3BA 1LSTA 3L6HA 4XKRA 1MY1A 5ISUA 1MS7A 2DYXA 3W9WA 1MRPA 1MH3A 4OYVA 3MP6A 5AA2D 3QUJA 5FTHA 1MY0A 4NF6B 2NXOA 3V8XB 4R72A 3O66A 4ZZEA 1LFGA 1UIVA 2OLBA 4XKPA 4G77A 1TXFA 5KDTB 3M3LA 1PC3A 4U1ZA 4HS7A 4XKQA 2OWTA 1D3KA 5FTIA 3U92A 1B3LA 4F1VA 1DTGA 1IXIA 1VR5A 3IJXB 5HM4B 1PBQA 3M8UA 3TTNA 4H67A 1BTJA 4U21A 3VVEA 3ZKLA 1PB9A 1B7UA 1MXZA 2H9BA 1IEJA 2X7PA 4ESWA 2F7BA 4JWYA 3SESA 4P0GA 4RY1A 1OLCA 3C33A 5I2KB 4KCDA 3MC2A 2QS3A 2O51A 3TTRA 2D5WA 3VXBA 3IB1A 1A55A 4ZEIA 3EPEA 2FYIA 4ZEDA 1SQYA 4YMAA 4F3GA 2F78A 3KSXA 4MF3A 1N76A 1PEBA 2H5YA 2ZNUA 3C34A 3MZ1A 3RPWA 3EQ1A 3PUXE 3H6TA 4R73A 1QUJA 1R9LA 4YU0A 4PFWA 5I2NB 2R9JA 4I1DA 1LAFE 1SI0A 2DWAA 3PPPA 1DTZA 4GFRA 4MLVA 2ONSA 3SEVA 1IXGA 3N5LA 4QRZA 4IO3A 1BLFA 1TFDA 4DE8A 2PX1A 2Q89A 3MUQA 3U8QA 4C0RA 5CM6A 4KR5A 4DZ1A 3C36A 1PB7A 4EDPA 3FVKA 1N84A 5CMMA 1P1QA 3W15C 4E0WA 3PGFA 3Q26A 5B70A 3PUVE 3U93A 3K1MA 1ANFA 5I57B 1B9JA 2PBWA 4X48A 1VFDA 3LSFB 3ONMA 3LSLA 5DEXA 4YKPA 3VLWA 1VSOA 4NE4A 4KPTA 1S7YA 3V89B 4PP0A 1EZ9A 5TPAA 2YPNA 1MPDA 3K1PA 3OEKA 1HSEA 2VHAA 1TT1A 2NUVA 5LOMA 1H76A 1QKBA 1M5DA 1LAGE 3C35A 4EXKA 3PU5A 4OHNA 1B5HA 4QSEA 4QSDA 3GXAA 1IUDA 2AL4A 1O7TA 1SYHA 1B3HA 3GBAA 1N3WA 1B4HA 4G68A 2HZKA 4BDLA 2P2AA 2RC8A 1QW0A 2XXYA 4IO4A 3O2AA 4H6DA 2O1LA 4DCXA 2XXTA 3CSBA 3SEXA 2ZYOA 2AIXA 1XOCA 3FGSA 2HQ0A 3ODBA 4LZ8A 4X1DA 1D9VA 5CMBA 3H03A 3K0VA 4G4PA 5L9OA 2DVCA 1B1XA 2RCAA 2V93A 3ILUB 3TTKA 1B6HA 1QJMA 3MQ9A 3O97A 2XXQA 3V5AA 1QUIA 4IB2A 3IX1A 2VOZA 2DXYA 2XHDA 3T9XB 2O7UA 5H8FB 1B7HA 1URSA 3JV9A 2QS1A 4MLQA 2D3IA 4YB6A 3S9EA 2XXUA 1B32A 5ELVA 4PFTA 1LGBC 2Q2CA 5I58A 4JBZA 1Y4CA 3H6WA 3T66A 3R6UA 3OMBA 3N6TA 4ND9A 3IOVA 2F35A 4NTLA 4XIGQ 1B5IA 3VVDA 5FHMA 4GQOA 1LBCA 1FQCA 3IO6A 4IO2A 2UVHA 3SDFA 3HHFA 3O6HA 4F3BA 3K00A 1JQFA 3OSRA 4O3AA 1D4NA 1B05A 3Q29A 4C1TA 2Q9TA 1IIWA 2I6EA 2QJEA 1PB8A 4H65A 2OK2A 4ZE9A 5CBRA 3N94A 1M5CA 4OERA 3WAEA 4MBPA 2O1MA 1EH3A 1JETA 2O7IA 1POY1 3VLVA 1SI1A 3H3GA 4RXLA 3VE1B 2Z22A 5I59B 4GXAA 3KN7A 2I58A 2F7CA 1RYOA 3UA8A 2XD2A 4WKMA 2UYEA 1B1HA 3HV1A 3PV0E 2PT1A 3S2VA 4KCCA 3LSWA 1Z7ME 4QFNA 2UVJA 2DWJA 5KCJB 4QFOA 4OEVA 3G3GA 4KI0E 4H8IA 2R6GE 3TKDA 3CG1A 2B65A 4EUOA 5FHNA 1VE4A 2G29A 1MXWA 3OO9A 3Q28A 3W9VA 2E1SA 4K3FA 3HO7A 2XXWA 2F34A 1MQGA 2I0BA 4QHQA 3JZJA 4LQ5A 4NF5B 2V25A 3SEUA 3K6XA 4OETA 4RK9A 4ESXA 3T93B 4GOTA 3K02A 2V3UA 4U4XA 4U22A 3D4GA 3S9MC 1FQFA 3MVZA 4LUBA 4OTEA 2Z23A 4GRKA 4LQ2A 2XX9A 4P0IA 1N3XA 2M8CA 3KGCA 3IB2A 2IA4A 1II5A 3HN0A 1CE2A 1AMFA 5AA4B 4QFPA 1DMBA 1S9TA 3WAFA 4M4GA 4RPNA 5F7VA 4Q5TA 3BFTA 4FATA 3KOSA 4WEDA 3UN6A 1FQBA 3KFMA 5I2NA 1YPNA 1FCKA 2VD2A 3FXQA 4FIMA 1IZ1A 1YCJA 1FTMA 1A54A 3AXFA 2NWJA 2QSXA 2UVGA 4DCYA 1H43A 1IXHA 4MH5A 4MFIA 4WEPA 3IO4A 3MP1A 3RQTA 4EF2A 4JWXA 3CRBA 1MXXA 1DOTA 4Z7EA 4NMYA 2ZYKA 4YB7A 3I5OA 1MM7A 2Z8DA 1NNTA 1SD3A 3P7IA 5ITOA 2RF1A 5I57A 4YICA 3OEMA 2F36A 1MXVA 4JWOA 1IQ7A 4YKIA 1URDA 3OENA 1H45A 3PPOA 4PQJA 3K4UA 3GLBA 5H8HB 3HCQA 3PMWA 1FQDA 2Y7KA 4DXUA 4H0WA 3FIRA 3FZVA 5EHMA 3PPRA 3IB0A 3PPNA 4N13A 4GLIA 2DOJA 1LAXA 3OOAA 4JSOA 2O68A 3LUYA 1DSNA 1YTVA 4TLMB 4FEBA 1OMPA 3OO8A 3UGWA 5A5XA 3C9HA 4LZ7A 3FXUA 5CI5A 2HEUA 1ZU0A 2XXHA 1ZKBA 4G8MA 1D9YA 4KQPA 3MW0A 4R75A 5EHSA 3QXMA 1AIVA 1MY2A 3D4CA 3DM0A 2ZXTA 1Y3QA 3VLUA 4JSDA 4P11A 5ICQA 1EZPA 4H1XA 1VFEA 2I49A 2REJA 5I56B 3EHUA 4OZ9A 1SW4A 3T96B 1R9QA 2IEEA 3TCFA 5IAIA 1SVXB 5ITPA 1UTHB 3EN3A 5CRYA 2RCBA 5B7DA 4GVOA 2V3TA 2THIA 3DELB 3HSTA 4JDFA 4E0XA 4XXUA 5AA2B 4ONYA 3UP9A 4U1OA 1A7LA 1AL3A 4POWA 2QS4A 4GL0A 5TP9B 4O3CA 4R74A 2I4BA 3E13X 3T22A 1SW2A 4F3SA 1OQGA 4JB7A 2QMWA 1CB6A 1IXCA 3B6WA 2Q2AA 4G8NA 3DP6A 3RGYA 5JEIA 3RTWB 4THIA 3KN8A 3FJMA 4DXBA 4BDQA 1R6ZA 1B40A 3SETA 2VD3A 3IAZA 1JVXA 4FORA 2BJJX 1Q1KA 3VXCA 1MDQA 3PD9A 3IORA 3QSLA 4RA1A 3TMGA 2Z8EA 3ZSFA 4KYSA 1B3FA 1B58A 4ECFA 3K6UA 1GGGA 1Y3NA 4BLAA 3CFZA 1H3DA 3RT6B 4WXJA 1XT8A 4G8HA 4LP2B 1Y9UA 4ZEBA 3HPIA 4YMBA 5I84A 2ANJA 4DDDA 1B0LA 3G3HA 2ZYNA 2W7YA 4YZZA 2X7QA 4I62A 3FUZA 4M1VA 3S4UA 4GL8A 3TTMA 5AA3A 3PUWE 1TWYA 5I59A 2FA7A 2OBGA 4NF8A 4OESA 2DVZA 4PFUA 2UYFA 3FXRA 1B5JA 4OFLA 3TYHA 4RPOA 4OVJA 2ZNTA 1ELJA 3TTLA 3TELA 1ZMGA 1J1NA 3GZGA 3G3FA 3RLFE 2F8DA 4LONB 5KCJA 4IY5A 3OO7A 4F3PA 3MBPA 1M5BA 1UTBA 2ONKE 4TLLB 3TFLA 3EF7A 2Q8JA 2HFBA 4FE8A 3CIJA 3S9NC 1UIUA 1FTLA 1Q35A 2CZLA 3SEWA 1I6QA 4NF5A 4G68C 1GV8A 3TCHA 2F6PA 1GVCA 4NWDA 3SEYA 2RINA 1LAHE 2I3WA 5AE4A 4F2OA 3K01A 3HHGA 4KHZE 1RYXA 2XXIA 4RK2A 1SYIA 3OXNA 4ELOA 1BP5A 2DS9A 2PT2A 4OFJA 3I6VA 4KFQA 5CBSA 4EXLA 4I9DA 3PPQA 4ZEKA 1JVYA 3H6VA 2GFEA 3QAXA 1MDP1 3VDFA 2HXWA 1LFIA 3FVOA 2RKMA 2AL5A 4AQ4A 5HPQA 5IKBA 5DYHA 2WKYA 2ESNA 5CMCA 1WDNA 3IR1A 4U4SA 2QMXA 3IK6B 1WODA 4ELPA 3MPKA 4NF6A 4TOZA 3TPAA 2ONRA 1LB8A 3K6WA 3MAMA 3MVWA 1Y4TA 4FECA 3GBBA 5KDTA 4U2RA 4ZEFA 4FJPA 5H8NB 3K2DA 3TUSA 1B3GA 4G68B 3A09A 5H8HA 1M5FA 3B6TA 1A40A 2H98A 4NWCA 3IOUA 3MVXA 2OWSA 4LATA 2H99A 1L5TA 3U94A 1SDXA 1P1WA 3T9UA 4XKNA 1NNPA 1Z7NE 5BWJA 4EQ7A 1MH4A 4HTGA 2DE2A 2VGQA 3OD7A 4ZE8A 1JNFA 5L8DA 5K2XA 1XHYA 2XXRA 4JXIA 5DTBA 2ZYMA 5K2YA 4GD5A 3G3JA 5I2KA 1P1OA 3FJ7A 1FTKA 3R7XA 4PE5B 5KZTA 1UQWA 3KN3A 4R6KA 1Y1MA 3T9HB 4ZS9A 1EU8A 2DE4A 4KYDA 2QRYA 2V3QA 1LB9A 5I56A 1DPEA 1NFTA 1HSJA 3VVFA 2UVIA 4H8JA 4F18A 3TAJA 3SERA 1S50A 4HCYA 4H5FA 4GF8A 1UTHA 4BDNA 3M3KA 1FQEA 3B7DA 5AA2A 2Y7PA 2XD3A 1JW1A 3B6QA 2E0SA 1MPBA 4R9GA 1B7ZA 4HW8A 5TP9A 3PUZE 2UXAA 5BUUA 4TQUQ 2R71A 2VP1A 5L9MA 3CG3A 4NEDA 4YAHX 4FEDA 3RN8A 3G3IA 1NL5A 3MJNA 2GH9A 4IY6A 2REGA 3CSGA 1IITA 1O63A 4KYEA 3TCGA 4ZECA 3G3KA 3O6IA 3O28A 4F39A 1T0KA 2O69A 4L17A 4IGTA 1LFHA 1MG1A 3TDJA 2F97A 3TQWA 1JW4A 1XVYA 4ELQA 4IO7A 2XXVA 4BDOA 3U1OA 5DT6A 3DLNA 5H8QB 3RT8A 4GWOA 1XC1A 3EHSA 3CI8A 1ZLQA 4N07A 4R6YA 3V83A 1MQJA 3KG2A 4DLDA 3TQLA 3K6VA 4RYAA 3BFUA 3UORA 5M2VA 3O29A 3KBRA 2Y84A 1GTKA 1ZBMA 4UA8A 2FNCA 3TEPA 1NNFA 2DWHA 1P99A 1JEUA 1N7XA 4NF4B 4F1UA 1B2HA 3CVGA 4QSCA 4F2QA 4LZ5A 4YKKA 3FV1A 3E3KA 4GXSB 1N0TA 3LC8A 3LR1A 3H7MA 3C31A 4AB5A 1F9BA 1OIBA 3FVNA 3TODA 2F7AA 1FTJA 3CFXA 3ZKKA 2B3FA 3DP4A 2Y7WA 1FW0A 1MXYA 3LBSA 4PETA 2A5SA 1LCTA 5H8FA 2OCUA 3FASA 4QFKA 2NVUB 3QYTA 4C1UA 1EZOA 1Y1ZA 5JTYB 3M3FA 2X26A 1ZIUA 1US4A 3THIA 1B52A 2DE3A 2ALUA 3IL1B 3S9LC 2A5TB 3RY3A 1XVXA 5JK4A 3MPLA 4OQOA 3PUYE 3R26A 3KSJA 4KD5A 4Q8RA 2XXPA 4X1BA 1P1UA 3PMXA 4POXA 1NNKA 3MWBA 4ZZAA 3RUMA 2HZLA 1XS5A 3H06B 3ZS6A 2DWIA 2LAOA 1FTOA 1Y3PA 3BKIB 2RC7A 1YAEA 3VV5A 4ISUA 1MM6A 3E9XA 1LBBA 3USDA 1SW5A 1QKAA 2G93A 4ZDMA 1N7WA 1JW5A 4IO5A 4IGRA 3MP8A 1NKXA 4OMBA 3DP8A 1USYH 1B46A 2CMOA 5DVJA 4PFYA 3F11A 4Z0IA 3JYRA 3OO6A 4EQ9A 3K1NA 1ZTYA 5H8SA 3KOTA 2DSFA 1BIYA 4BDRA 4YB5A 2XX8A 1WVJA 1OVBA 5H8NA 5A5XB 1I6AA 4DXCA 3QIMA 3FD3A 1NMUA 2I0CA 2GHBA 3T9VA 1OQHA 2O84X 1PBPA 3KEIA 5EYFA 3O6GA 1SBPA 4F19A 2H25A 2PYYA 4I8CA 3FATA 3UIFA 3SKPA 3OSQA 3RTFB 3A3CA 3KJTA 3UK4A 3VFJA 2P1SA 2ZNSA 4F22A 4H5GA 4XTCQ 2P0SA 3PMVA 3ECRA 2XXXA 1RKMA 1B3EA 1MPCA 3E4RA 2KLFA 3G7WA 4EQBA 1I69A 1QUKA 3PD8A 2HCAA 3C32A 3H4ZA 5ICTA 1BKAA 3A3UA 4R6HA 3OELA 1B51A 4G2ZA 2O6AA 1ZJLA 2F6GA 1MY3A 4R9FA 1HSLA 1NH7A 5AA4A 4F29A 4FAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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