1FQEA

Crystal structures of mutant (k206a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVAHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqeA02
5B70A 3KN8A 1NMUA 4O3BA 3Q28A 1DOTA 2VP1A 5CMKA 3HHFA 2X26A 3GBAA 4ONYA 3HCQA 4RPOA 2A5SA 1POTA 2ZYMA 4NE4A 3T9UA 2RCAA 1MH3A 5JTYB 3MZBA 1XC1A 1PB9A 3H6WA 1NNTA 4R9GA 3KJTA 4HS7A 1SW5A 3TAJA 4NF8A 3R6UA 3MVZA 4TQUQ 4XKPA 3VVEA 3KN3A 3PPQA 4PFWA 3OO8A 2DP8A 3C9HA 3HSTA 1RYOA 5FTIA 2D5WA 5I84A 3G7WA 4G2ZA 3ZS6A 3GLBA 1NNPA 1A55A 1VFEA 3G3HA 3IB2A 3FV2A 2ONRA 1USYE 1BLFA 4PFTA 4BDMA 4FORA 3M3KA 4FJPA 1GVCA 5FTHA 1GR2A 1LCFA 1PDAA 3SEYA 4TLMB 3H6VA 4IY6A 2PT1A 5I58B 2QS3A 3VV5A 3MJNA 4GRKA 3MP8A 1QKAA 1SYIA 4NF5B 4ZEDA 4KR5A 1LSTA 3N6UA 5TP9A 1HSLA 1IXGA 1DPEA 1N76A 3U92A 1P99A 2O84X 1I6AA 2XXWA 2Q89A 1OVTA 1N7WA 3RLFE 5AA3A 2Y7KA 1B7HA 4ESXA 3FXRA 3K01A 4ZZEA 3OEKA 1FQFA 4EXLA 5A5XA 1B4ZA 3W15C 2YLNA 4XKNA 3FVKA 1Z7NE 4RNSA 1D9VA 1ZKBA 1GGGA 3GXAA 4GOTA 4THIA 1XVYA 4OEVA 3L6HA 4ZECA 5CM6A 3RTWB 2Z8DA 4U1ZA 4OZ9A 3FASA 4OWDA 2NOOA 3RT8A 3U72A 4GXAA 3KOTA 1LBBA 1B3HA 4I1DA 5I59B 1OQGA 2AIXA 2Z8EA 2F7CA 3H4ZA 1VSOA 1JVXA 5DTBA 3UP9A 4IO4A 4GVOA 3CFXA 3S9EA 3F11A 1B3FA 1PEBA 3S9MC 3VXCA 4JXIA 1GTKA 1IZ1A 2GHAA 1J1NA 3MWBA 1NL5A 4IO3A 3SEVA 4F3PA 1MY4A 1B3LA 4DE8A 4ZDMA 3V89B 3FVNA 4WEPA 2QMWA 1QW0A 2DS9A 4DIGA 4G68B 4Q5TA 4H67A 4FAJA 5HM4B 1LBCA 4YAHX 2QSXA 3K6VA 2CZLA 3DLNA 4KQPA 5ELVA 2I4CA 3M8UA 3KSXA 4N6PA 5L9SA 1SBPA 4ELPA 3OMBA 3T9XB 4WXJA 4OTEA 4LATA 3RN8A 1JETA 3P7IA 2DXYA 5L8DA 2VD3A 5CBSA 2OWTA 4RY1A 4RJZA 3Q27A 3FD3A 4KD5A 3U1OA 4U23A 4I8CA 3TTNA 2DWJA 2O68A 4R2BA 2KLFA 3BKIB 4FEDA 2HAVA 1D4NA 3A3CA 5I58A 1MY1A 3ONMA 4X1DA 5ICTA 4NF5A 3TODA 5CI5A 2DWHA 2REGA 2WKYA 2Y84A 3WAFA 3Q26A 4YB6A 4OEUA 1IQ7A 1ZBMA 4YB7A 2AL4A 1MXZA 1QUJA 2E1SA 3FZVA 1MQIA 2QL3A 5ITPA 1H76A 3T93B 4WEDA 3V5AA 4IO5A 3OOAA 2HXWA 3I5OA 5H8FA 5CMCA 3THIA 4MLVA 4H5GA 1LGBC 2GFEA 4YKJA 1O7TA 2I48A 3TEPA 1AH5A 1FW0A 4GQOA 3IORA 4PFUA 3UA8A 5H8QA 4C1TA 4Q0CA 4ESWA 3FGSA 3LSFB 2H25A 3O9PA 4NF4A 2ZXTA 5KCJA 1EU8A 3RNNA 1A40A 3EN3A 4NWCA 4QFOA 3KGCA 4R75A 3PUWE 4N13A 1MXWA 5H8HA 4C1UA 4YZZA 3N6TA 3FJGA 2I0CA 3IB0A 2RC9A 4QF9A 3OXNA 2QPQA 5DYHA 3L6GA 4M1VA 1B0LA 2O1LA 4JB7A 2LAOA 4F3GA 1D3KA 3TCHA 3G3JA 3O29A 4LUBA 3S2VA 2H4IA 3H6TA 2UVJA 3QUJA 4FEBA 1OIBA 5H8SA 5HBCA 3K00A 3MPLA 3N26A 4LQ2A 2OLBA 4L17A 3ZKKA 3TMGA 4MLQA 1LAGE 4R6YA 3CIJA 4QFLA 3HO7A 3G3IA 3W9WA 4EQBA 1KWHA 2ONSA 1CE2A 3BBRA 3TTKA 3FJMA 1L5TA 5K2XA 3W9VA 5AA4B 5A5XB 1R6ZA 4GIZA 1B1XA 1FTOA 2ZMBA 2ABHA 2DWAA 3CRBA 2XXUA 4JWXA 2GH9A 3MZ1A 2XXRA 3FIRA 2V3TA 4IGTA 2P0SA 2DOJA 2X7QA 1EZPA 3HV1A 1IITA 1MDP1 2H98A 4FATA 1Y3NA 4KI0E 2QMXA 2I4BA 3PD8A 4IGRA 1MQHA 4O3CA 1OLAA 2D3IA 2PYYA 2XX8A 3OO9A 2V93A 1QUIA 3VLUA 1MY2A 2PBWA 2IEEA 1N3XA 3O97A 4BDNA 5TPAA 5DEXB 2VD2A 2BJJX 4LZ8A 2Q8JA 4F22A 2XXPA 3UK4A 3RPWA 3IOWA 1MRPA 4WKMA 2B65A 3LSWA 3KEIA 4FIMA 1B40A 4I62A 3O2AA 3H7MA 1MM6A 4H5FA 2OCUA 1QJMA 2I49A 1TWYA 3HPIA 2HZKA 3OSQA 1SYHA 3EQ1A 5AE4A 1JEUA 4ELOA 1EZ9A 1JW5A 3IJOB 3MVWA 3O6GA 1NFTA 2PVUA 1ZU0A 4R74A 4ND9A 3LC8A 4GL8A 4E0WA 1F9BA 3N94A 1B3EA 3PMWA 3QUFA 3G3FA 4KCCA 4NF6B 1JNFA 1IXIA 4F1YA 1SI0A 1B2HA 3M3LA 4O3AA 4JWOA 2ZYKA 3TTMA 1TT1A 1HSJA 4U22A 3RY3A 4ELRA 2A5TB 2RCBA 2F7BA 3B6TA 3PPRA 1I69A 3PUZE 4FE8A 4I9DA 3CFZA 1O63A 3TCFA 3VLWA 1BP5A 3PMXA 4Q8RA 3T9HB 1Q1KA 4ELQA 3D4GA 3B6QA 4RPNA 2XXTA 2XX9A 2XHDA 5I56B 3H3GA 1SI1A 5AA4A 2ANJA 3IOUA 5H8FB 2UVHA 3CR9A 4KFQA 3OD7A 1N04A 3FV1A 2HQ0A 3O66A 3DP6A 5ICQA 3E13X 4GL0A 2O6AA 4QFPA 5FHMA 3H06B 2RC8A 1I6BA 4K3FA 5H8QB 4YB5A 4H8JA 2XXHA 2UYFA 4Z0IA 4NF4B 2DYXA 2B3BA 5KCJB 4NEDA 4F2QA 3ECRA 4YKPA 2ZYOA 4NMYA 5DEXA 5JK4A 1EH3A 4RYAA 3OELA 5H8HB 3IK6B 1A7LA 2QJEA 4KPTA 3ILUB 4G8NA 3SEUA 1QVSA 4R6KA 3QYTA 4EQ7A 3FXUA 2HEUA 2ZNSA 1B52A 1S9TA 4RK9A 2G93A 4BDLA 4XXUA 1LFIA 1D9YA 4ZEFA 2DE3A 2PX1A 1N84A 2XXQA 3PUVE 3S9NC 4QRZA 1Y1ZA 2W7YA 3AXFA 2NUVA 4LA9A 1ZMGA 3RQTA 1OQHA 2XX7A 1UIVA 2ZNTA 1MPCA 3I3VA 4NF6A 1M5FA 1P1NA 4H65A 2IA4A 2AYSA 3A09A 4ZE9A 3Q25A 1USYH 2O51A 2XXVA 4GXSB 1LAFE 3BFTA 4KCDA 1MQJA 1NKXA 2A5TA 2HCAA 4PETA 1T0KA 2PT2A 2F7AA 2XD2A 3T9VA 3FXQA 3S9LC 1UQWA 1P1OA 3K6WA 3EHSA 1FQEA 5DT6A 4AQ4A 3K0VA 4IO7A 2ZYNA 1Y9UA 5I56A 1A54A 2F8DA 1N7XA 1UTHA 2OJTA 4POXA 5TPAB 3IOTA 1YCJA 2Y7WA 2Y7RA 5CMMA 3VLVA 3EHUA 5IKBA 1ANFA 3CSBA 1SVXB 3MVYA 1ELJA 3S4UA 4QSDA 4H6DA 3MZ9A 3E9XA 1XVXA 5EHSA 1DTGA 2DWIA 2Q2AA 4JWYA 5CC2A 1SW4A 2RINA 1B5JA 4OYVA 4GWOA 4DXBA 4HW8A 1B4HA 1MXVA 3T96B 1QKBA 3K6UA 1MXYA 4IB2A 1FQBA 3IO6A 1P1QA 2H9BA 5DVJA 3IX1A 4OXVA 2O1MA 4XKQA 5H8NB 1JQFA 3UGWA 4ZZAA 1M5DA 2V3UA 4POWA 3C32A 1DTZA 1MS7A 1US5A 3OSRA 2UYEA 4KYEA 3PUXE 3CI8A 3M3FA 3LUYA 4F18A 4EXKA 1JW1A 3VXBA 1LAXA 1Y1MA 1B51A 2DE4A 3IOVA 2I58A 3TDJA 1B6HA 3BFUA 1A8FA 1BKAA 3KZGA 4H0WA 3TZAA 1NH8A 3Q29A 4QSCA 4GFRA 4H1XA 3U94A 1FQCA 4GD5A 4BDQA 1NNFA 3UORA 1PC3A 3KFMA 1MG1A 1URDA 3B7DA 4PQJA 1UTBB 4YMAA 1YAEA 1NH7A 3CSGA 5BWJA 2UVIA 1SW2A 3TKDA 1AL3A 3VVFA 2P2AA 4YICA 3QAXA 2B3FA 1PBPA 2Z23A 5AA2A 1LAHE 4LZ5A 4JDFA 4G8MA 4N07A 2HZLA 1FTLA 3MAMA 1RKMA 3K02A 1URSA 1SDXA 4EF2A 3EF7A 5HPQA 1H44A 1XOCA 1MQDA 1DMBA 4MH5A 1H3DA 3MW0A 1Z7ME 4NWDA 1S7YA 2YPNA 1AMFA 2M8CA 3U93A 2OZZA 4U1OA 2UXAA 4OESA 3FUZA 1Y20A 3D4CA 4R72A 4EUOA 1OVBA 3RUMA 4Q30B 1A8EA 3EPEA 5CBRA 3IR1A 5I2NA 2ONKE 4ZEKA 1H43A 4QFNA 4KYDA 1II5A 3PUYE 4OETA 1MM7A 3PGFA 3O6IA 4MF3A 3E3KA 1Y4TA 3QSLA 3VFJA 2DE2A 3CVGA 4F1VA 3KOSA 3SEWA 4R2FA 1DSNA 5AA1A 1POY1 1OLCA 1B32A 3GBBA 3TQWA 1PBQA 4PP0A 4P11A 1IXCA 1EZOA 2F36A 1LB9A 5F7VA 4BLAA 1ZLQA 5H8NA 3K2DA 4JSOA 1AIVA 1B0HA 3SERA 3ODBA 1M5EA 2DSFA 2F78A 5B7DA 2O7UA 4OMBA 5DVIA 5TU0A 5ISUA 4OERA 2XXYA 3TQLA 2Q9TA 3QK6A 2I3WA 4JBZA 4R6HA 2F6PA 5KZTA 4EDPA 4R9FA 4TOZA 3K6XA 2UVGA 3MPKA 4KYSA 1ZJLA 1FQDA 5KDTB 1URGA 4U2RA 3RGYA 3PPOA 5F1QA 1ATGA 3MP1A 5CRYA 4OVJA 2HFBA 3C36A 3MVXA 1B7ZA 1R9LA 1UTBA 4HCWA 2GRVA 1ZTYA 2AL5A 1PB8A 4AB5A 3K4UA 3OENA 1A99A 2RF1A 2G29A 1XHYA 1UTHB 3JV9A 1Y3PA 3KBRA 4YKIA 2P1SA 4DLDA 1B3GA 2F35A 1P1WA 1SQYA 2Z22A 4G68C 1H45A 3C31A 2F6GA 5FHOA 2XXXA 3IO4A 1MH4A 1BIYA 4DXCA 1GV8A 3MP6A 1FTMA 4OFOA 3OO7A 1P1UA 1TFDA 2XXIA 4M4GA 4FECA 4UA8A 3KJ7A 1JEVA 1B1HA 1HSEA 4Z7EA 4ECFA 2DXRA 2I6EA 4LONB 4F31B 1Q35A 4C0RA 4OFJA 1XT8A 4HTGA 2YJPA 3TPAA 4BDRA 4NTLA 1MY0A 3SESA 3B6WA 2Y7PA 3E4RA 1FTJA 4X9TA 5EHMA 4F2OA 5EYFA 3C4MA 3R26A 3SEXA 3MC2A 3PMVA 1IUDA 1UIUA 1WVJA 3MQ9A 2ALUA 4LVQA 2OBGA 1WDNA 3VE1B 1TFAA 1O64A 1PB7A 1SW1A 2VOZA 1B58A 4MFIA 4AB6A 3C33A 5J1DA 4KHZE 5JTYA 1JW4A 1LB8A 1QUKA 3MUQA 1CB6A 4F3BA 4G77A 3N5LA 3K1NA 1BTJA 2DVZA 5JEIA 2FA7A 3T66A 2QS2A 3PPPA 2I0BA 1RYXA 3V8XB 1DPPA 3TTLA 4XTCQ 3C34A 1IXHA 2DQVA 3IL1B 1XS5A 3A3UA 1B5IA 4F3SA 3SDFA 4ZE8A 4ZEIA 5AA2B 1ZIUA 1LFGA 1MQGA 3K1MA 4P0IA 3TELA 4YKKA 1TXFA 3H03A 2Y7IA 3O6HA 5BUUA 1B7UA 4TLLB 4U4SA 2PMSA 2H99A 5KDTA 1AOVA 1VE4A 3FJ7A 5FHNA 1B5HA 4QSEA 3LR1A 3V83A 2I3VA 2OWSA 4E0XA 3PD9A 3T22A 5M2VA 5I2KB 1NNKA 3PPNA 5DVFA 2VHAA 1MPBA 2RC7A 4JSDA 2NVUB 2QS4A 3WAEA 2O7IA 1FCKA 5I2NB 3ZSFA 3QXMA 4DCYA 2DVCA 3GZGA 1FQAA 4MBPA 2NXOA 4OFLA 2NWJA 3UN6A 3LSXA 4IO6A 4P0GA 5LOMA 5K2YA 3TUSA 5I57B 5IAIA 2FNCA 2F5XA 1SD3A 4GF8A 4U21A 1QULA 4OHNA 4DDDA 3C35A 4PFYA 2ZNUA 2XD3A 1B9JA 2HAUA 4R73A 3G3GA 4ZS9A 4OQOA 4RA1A 4YU0A 4LQ5A 3O28A 3EHTA 4RXLA 4ISUA 4DXUA 4RK2A 2F34A 3I6VA 3ZKLA 3SKPA 1B46A 4X48A 5ITOA 3CFLA 5I59A 3PV0E 4F1UA 4YMBA 1LFHA 3FATA 3OO6A 3DM0A 3ILTB 4EQ9A 3H6UA 3MBPA 3DELB 3U8QA 3KG2A 1M5CA 2GHBA 3QIMA 4H8IA 2D21A 2V84A 3USDA 2R6GE 4NF8B 3TCGA 1R1NA 3R7XA 2F97A 3HHGA 2V25A 3OEMA 1IIWA 1FTKA 3CG3A 4DCXA 3LBSA 1N0TA 5L9MA 3HN0A 1MXUA 2R71A 5CMBA 1YPNA 3UIFA 1Y3QA 4U4XA 4PE5B 3SETA 4GLIA 2O69A 3JZJA 3VVDA 3TFLA 4G8HA 1LLSA 4G68A 3TYHA 4LZ7A 2H5YA 3RT6B 1M5BA 4OENA 4XKRA 1MXXA 2VGQA 1MPDA 3IAZA 3JYRA 3LSLA 4HCYA 1N3WA 4F19A 5TP9B 3IJXB 3FVGA 3KSJA 5AA2D 3IB1A 3DP8A 1JVYA 1Y4CA 2REJA 1US4A 3CG1A 5L9OA 2RKMA 4QHQA 1IEJA 2Z8FA 1YTVA 4G4PA 2OK2A 1B05A 2V3QA 4BDOA 3G3KA 2CMOA 4IY5A 2QRYA 1LCTA 5I2KA 4XIGQ 4LP2B 4X1BA 1MDQA 2Q2CA 2R9JA 3PU5A 1MY3A 2ESNA 4QFKA 1VR5A 4ZEBA 2Q88A 3KN7A 3K1PA 4F39A 1VFDA 1WODA 1S50A 3FVOA 4IO2A 3DP4A 1OMPA 4UACA 3TTRA 2QS1A 2X7PA 4EF1A 2THIA 1R9QA 2E0SA 4F29A 2FYIA 3VDFA 1I6QA 3RTFB 4DZ1A 5I57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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