1FQFA

Crystal structures of mutant (k296a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFADSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 95
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA02
2O6AA 2B65A 1SQYA 1UTHB 1VR5A 2REJA 1ZBMA 4G68C 4TOZA 3TPAA 2ABHA 1URSA 3U93A 3USDA 1L5TA 5HPQA 4PQJA 1B51A 2Y7IA 1N04A 3JYRA 3U8QA 3HV1A 4Z7EA 2O7IA 4OQOA 1JQFA 3M3KA 5DVJA 4LP2B 4HS7A 1RYXA 3OSRA 3MVYA 1QUKA 3QUFA 4TLMB 5FHNA 2XX7A 5FTHA 4IGTA 5ICTA 1MRPA 1B5HA 3O9PA 3G3KA 4H8JA 4YKIA 4MBPA 4YKJA 2V3TA 3UORA 2Y84A 3LUYA 1I6BA 4EQ9A 3SERA 2QMXA 1XS5A 4DXCA 1B3FA 4ECFA 4EF1A 5F7VA 1PC3A 4QRZA 1GV8A 3A3UA 3G3HA 4M4GA 1QJMA 3L6HA 4ZEDA 3K1NA 4H5GA 3EHUA 3T66A 3A3CA 3K1PA 4PP0A 1N84A 3GBBA 4NF5A 3E9XA 1JEVA 1MQIA 1I69A 1A54A 2F5XA 4OVJA 5IKBA 4F2QA 5I2KA 2HXWA 3H3GA 1B5IA 1LB8A 3D4CA 2PMSA 3VFJA 2OBGA 5H8QA 4GOTA 3O66A 4E0WA 2UVHA 2RCAA 1OLCA 1A7LA 4THIA 2Z8EA 3PU5A 2XHDA 4X1BA 5ITPA 3S9EA 1R6ZA 3CFXA 4F19A 3PUWE 1D3KA 3SEYA 1RYOA 4TQUQ 4DCYA 4G68B 1ZTYA 1FTLA 3VVEA 2Y7WA 3PGFA 4OYVA 1MXYA 2QSXA 4OMBA 4LVQA 4RXLA 3KSXA 3OEKA 3KBRA 1H45A 2DSFA 2VHAA 3IL1B 3PMWA 3UK4A 2R6GE 4OFJA 3FJ7A 2ZYKA 3IJXB 4YB5A 5B7DA 2O68A 2THIA 2GRVA 4G8MA 3B6WA 4IY5A 3KN3A 2AIXA 5AA2D 3N94A 4OTEA 4IB2A 1USYH 4TLLB 4QSDA 4ELPA 3RTFB 4KHZE 4ZECA 1URDA 1B7UA 3IX1A 5EHSA 3N6TA 4GIZA 2NWJA 1I6AA 2I0BA 4IGRA 5I59B 3UA8A 3CSGA 3LSFB 2V84A 1IUDA 2ZXTA 3IOVA 1P1WA 3MWBA 3O2AA 4DXUA 4GXAA 4R75A 3IB0A 4MFIA 1YCJA 4M1VA 2XXTA 3H6UA 5L9MA 4LQ5A 4OEVA 3MPLA 1ATGA 3KOSA 1H43A 2VP1A 3EHTA 1GVCA 1PB8A 1ELJA 2ZNUA 2F7BA 4R2BA 2RC8A 2UYFA 2HCAA 4JBZA 4NWCA 3S2VA 4XXUA 2DYXA 5K2YA 4GL0A 3TTNA 4JWYA 3TQLA 1VSOA 4QFPA 2O84X 4F31B 2YPNA 3IO4A 3C9HA 1Q35A 4KYSA 3KJTA 3FVKA 4NF5B 1S7YA 4Z0IA 5BWJA 4Q8RA 5KDTA 2I0CA 4MF3A 3GXAA 3O28A 1JW5A 1MY0A 4WEDA 5AA4A 1R9QA 4OHNA 1BLFA 3CVGA 1YAEA 1EZPA 4Q0CA 2ESNA 2ZNTA 3PV0E 5DYHA 1LAXA 5LOMA 5JEIA 2DWHA 4F1UA 3IB2A 1EU8A 3K1MA 1AMFA 1NH7A 4GFRA 1FQDA 2E1SA 2XX8A 4YZZA 3VE1B 1LBCA 2R9JA 3RLFE 4EDPA 1GR2A 1MXZA 3U92A 4LZ8A 3K02A 4JSDA 2Q88A 4G2ZA 4LQ2A 5CMMA 1R1NA 2DWIA 3VLWA 4AB6A 4JXIA 1UTBB 2P1SA 2PT2A 5H8NA 1MXUA 3K6WA 4ZEKA 3C31A 1HSJA 4GWOA 4KPTA 1VFEA 3DP6A 1AIVA 3Q28A 4JWOA 1P99A 2Z8DA 5DVFA 1T0KA 2ZNSA 5BUUA 1LCFA 1BP5A 4KQPA 3B6QA 4WKMA 2DXYA 1MPDA 2UVJA 3VLVA 1UIVA 2Q2CA 3RPWA 1PB9A 3JV9A 3QIMA 3LSLA 1MG1A 4HTGA 5ISUA 1MY2A 2QS2A 2DP8A 3VVDA 2HEUA 3I6VA 1XHYA 1A8EA 1SYHA 4PFTA 3OO9A 1FQAA 5IAIA 4PE5B 4OFOA 2H5YA 3SEWA 3G3FA 3SESA 1LFIA 3TQWA 1OVTA 3OOAA 3KJ7A 2LAOA 4IO2A 4ZEFA 4WXJA 3OELA 2FNCA 5CMCA 4EQBA 3PUZE 4YICA 3S9NC 3LSXA 1LAGE 4H65A 1J1NA 4RPOA 2I4BA 1AH5A 1DTGA 4WEPA 3TZAA 1FQEA 2DE3A 2DVCA 3TELA 4ZEBA 4ELQA 4I8CA 4F22A 3FV1A 3THIA 1BTJA 3U72A 3ILTB 2GHBA 3OENA 5ELVA 5H8HB 4EQ7A 2NOOA 3SKPA 3GZGA 3MP6A 4KI0E 4MH5A 4U1ZA 1Y3PA 2XXYA 1TXFA 2ONRA 1DSNA 1DOTA 3F11A 2PYYA 1FTKA 1QUIA 2F7AA 3V5AA 4GD5A 4JB7A 3I3VA 4I62A 3QYTA 1URGA 3Q27A 2ZYMA 1MDQA 4EUOA 1B4ZA 1JEUA 4G4PA 1DPEA 2OJTA 5I59A 1VE4A 2UVGA 3UGWA 1LB9A 1D4NA 2OCUA 3PUXE 4LATA 2OK2A 1B1XA 3R6UA 3N5LA 3TFLA 1N3WA 3U94A 1I6QA 3PUYE 4F1YA 3G3IA 4LONB 3CG1A 3UP9A 5H8NB 3PMVA 5J1DA 3DLNA 4H0WA 3A09A 1FW0A 3DM0A 2RC9A 5TP9A 3W9WA 5A5XB 4PFYA 4EXKA 3C32A 1B3EA 1YTVA 3PPOA 1FTMA 1POTA 2HZKA 4QFOA 5L8DA 3ZKKA 4ZS9A 4YU0A 3SEUA 4F39A 1ZMGA 3T96B 2WKYA 3FXQA 2W7YA 1Q1KA 2F8DA 4F3SA 3RT6B 3H06B 4ELRA 3OEMA 2F6GA 2DVZA 2F34A 1ZKBA 2GH9A 2VGQA 1IXHA 4F3GA 3KN8A 2PT1A 5CBSA 3BFUA 5EYFA 1ZIUA 3QUJA 2O69A 2Z22A 5CC2A 4GLIA 1NNPA 3MZBA 1LSTA 3LC8A 2Q2AA 3KOTA 2Z23A 2V3UA 3IB1A 4F29A 3QK6A 4NWDA 1MS7A 4U4SA 2Y7KA 4IO7A 2I3WA 4GXSB 3CSBA 4U2RA 3DP4A 4KD5A 5I57B 1IXIA 1AL3A 1IZ1A 1UTBA 3TKDA 2DWAA 2DS9A 4C0RA 3CFZA 5K2XA 2Y7PA 3S9MC 3IOWA 3CFLA 1B32A 2X7PA 1KWHA 1EZOA 4H6DA 2A5TB 2IEEA 3V83A 3KFMA 3HO7A 4U21A 1NNFA 3PPNA 2KLFA 4N07A 1F9BA 1POY1 1QULA 3FZVA 2DWJA 1JW4A 4O3AA 1S9TA 3MPKA 3H4ZA 3CG3A 2V93A 1Y1MA 3M3FA 3MJNA 1Y20A 2DE2A 5TU0A 2ALUA 2CZLA 4DLDA 1EH3A 3K2DA 1NH8A 2NUVA 2ZYOA 4I9DA 5CMKA 3OO7A 2ZMBA 1D9YA 1EZ9A 1II5A 5DTBA 4ZDMA 3ODBA 3V8XB 3FVGA 1B1HA 3K6XA 4LUBA 5I58A 2OLBA 2PX1A 4OEUA 5TP9B 1FQCA 1NMUA 1O63A 4F18A 3H6WA 4ZEIA 3T9UA 1SW2A 1XOCA 1D9VA 1LBBA 3H03A 2O7UA 4XKQA 4FEBA 3TTMA 4RPNA 4NF4B 3T9VA 1US5A 2D21A 1SW4A 3EN3A 3EPEA 3S4UA 1R9LA 3JZJA 1IXCA 4DDDA 1FQFA 2O1LA 5I2NB 3FASA 3HHGA 4F2OA 3FXUA 4U4XA 1GGGA 5KCJB 3H6TA 4XKPA 4O3BA 4IO4A 1SVXB 1P1QA 3TTRA 3VDFA 3FV2A 5H8HA 3N26A 1FQBA 3W9VA 4YKKA 1B3GA 3V89B 3O97A 2PVUA 3PD8A 3BBRA 5H8FA 4IY6A 3U1OA 3PMXA 3CR9A 4C1UA 4F1VA 4MLQA 3MQ9A 2HAUA 2F36A 1M5CA 4JSOA 4OZ9A 3G3JA 5AA2B 4XTCQ 2HQ0A 5JTYB 4NF8A 3RQTA 2RCBA 4JDFA 4ND9A 1Z7ME 3K6UA 1CB6A 5TPAB 3UN6A 2XXUA 5FHOA 3PPRA 4NE4A 2F97A 4O3CA 3R7XA 3Q25A 2NVUB 2QJEA 4BDMA 4YB7A 3TAJA 2Y7RA 4OWDA 4ZE8A 4RK2A 5A5XA 3G3GA 3FVNA 3M3LA 1MPCA 1M5BA 5M2VA 5FTIA 4IO5A 1SI0A 1SW1A 5CI5A 5DT6A 1MDP1 2ONKE 1B3HA 1N3XA 2X26A 4RY1A 2NXOA 3OD7A 4FJPA 4L17A 1P1OA 3RN8A 1N7WA 1MXWA 1M5FA 1BKAA 4XKNA 2RC7A 4DE8A 1SW5A 3K0VA 3HCQA 1IEJA 3KSJA 1H76A 3ZSFA 3T22A 3FGSA 3RGYA 3T93B 2H25A 1MXXA 3SEXA 1HSEA 4YMAA 5H8SA 4NF6B 5DEXB 3TODA 5I58B 5I56B 1MH4A 2DXRA 4OETA 1B9JA 3C36A 4RNSA 2AL5A 4G8HA 3S9LC 3IJOB 4YMBA 4NTLA 4E0XA 2H98A 3FXRA 1PBPA 2H99A 2GHAA 3O6HA 3VV5A 4BDOA 1PB7A 1NNKA 5I57A 2Q89A 3KN7A 2I58A 3MP1A 2AL4A 3LSWA 4LA9A 4U23A 4FE8A 1MQGA 2YJPA 3P7IA 1XVYA 1OQGA 1MXVA 1TFAA 2REGA 3MAMA 1SBPA 3H6VA 2RINA 3SEVA 4R73A 1B52A 3I5OA 2A5TA 3FATA 1B7HA 1PBQA 4N13A 2F78A 5H8FB 3ZS6A 3AXFA 1WVJA 1OVBA 2Z8FA 1LLSA 2QS3A 2XXIA 1B2HA 3VLUA 1GTKA 4DXBA 3IR1A 2VOZA 1NNTA 3ONMA 1Y4TA 4NEDA 2V3QA 3EF7A 4QFLA 1B05A 4H67A 2O1MA 1N76A 3OSQA 1QW0A 4R74A 4NF8B 3L6GA 2DE4A 3N6UA 2OWSA 4BDQA 2I6EA 2PBWA 2HAVA 3UIFA 4XKRA 1WDNA 1NL5A 2DQVA 4RYAA 3Q29A 1PEBA 1SYIA 4KYDA 3TTKA 3CI8A 5CRYA 2XXHA 1ZU0A 4P0IA 5DVIA 5B70A 1A8FA 5AA3A 4BDNA 2XX9A 2H4IA 1JNFA 3RUMA 4NF4A 1B4HA 3VVFA 3E3KA 4G77A 1B3LA 3C33A 2XXWA 2A5SA 5CMBA 1LFGA 5HBCA 4FIMA 1P1NA 1YPNA 2F6PA 5I2NA 2QPQA 4QHQA 1BIYA 3TUSA 4POXA 3ZKLA 1MY3A 3EHSA 4PFWA 5CBRA 1DMBA 5KCJA 3EQ1A 3MZ9A 4OERA 3FJGA 2I3VA 3SDFA 3C4MA 2XXQA 3W15C 3T9HB 1JW1A 1SDXA 5HM4B 3PPPA 4BDLA 4RA1A 1XT8A 3B6TA 5AE4A 2XD3A 3WAFA 4JWXA 5ICQA 1ZLQA 5AA2A 4UACA 4OXVA 1LCTA 3WAEA 4POWA 4F3BA 5JTYA 5FHMA 3TCHA 4LZ7A 3B7DA 4C1TA 3MVZA 2ONSA 2D3IA 3C35A 3TCFA 4FECA 4KCDA 3E4RA 4LZ5A 4H8IA 1N7XA 2Q9TA 4MLVA 2H9BA 3HSTA 1RKMA 3K6VA 4I1DA 5TPAA 3KEIA 4G8NA 2ZYNA 1Y9UA 1B0HA 1XC1A 1N0TA 4K3FA 2P2AA 3VXCA 3SETA 3OO8A 1USYE 2M8CA 2RKMA 3TTLA 4AQ4A 4IO3A 3FVOA 1JETA 3MVWA 2UYEA 1PDAA 1A55A 4Q5TA 1IQ7A 4H5FA 2CMOA 2RF1A 4RK9A 1MQHA 3G7WA 2OZZA 4HCYA 3HHFA 3D4GA 3IOUA 2Q8JA 3O6IA 2YLNA 2XXXA 3QAXA 1HSLA 1US4A 2P0SA 3MZ1A 2E0SA 3TDJA 2VD3A 2D5WA 2R71A 4Q30B 4HCWA 3FIRA 4R72A 4NF6A 1Y4CA 5DEXA 3TYHA 5I56A 4DCXA 4FATA 2GFEA 4X1DA 3LR1A 2F35A 1QKAA 5EHMA 3ECRA 1FTJA 4OENA 1NFTA 1MY1A 2ANJA 4QFNA 4R2FA 4EXLA 4IO6A 3GBAA 1O64A 4X48A 5L9OA 1FTOA 2I48A 3HPIA 4ESXA 3TMGA 4U22A 4DIGA 1IIWA 3FD3A 1A99A 1VFDA 3H7MA 4YB6A 4PETA 2B3FA 1IXGA 3RTWB 3RY3A 1B5JA 1UQWA 2OWTA 3IO6A 3MUQA 3K00A 4QFKA 3DP8A 1TWYA 3MP8A 4R9GA 1OLAA 3MC2A 3MVXA 3K01A 5I2KB 1OIBA 3DELB 4PFUA 3IOTA 5F1QA 3IAZA 5H8QB 4HW8A 4R6YA 1XVXA 4ZZEA 1Y3NA 4FAJA 2B3BA 3KG2A 1OQHA 3KZGA 1IITA 1Y1ZA 1UTHA 1MPBA 3OMBA 2IA4A 2QS1A 2X7QA 1A40A 4R6HA 5ITOA 3TEPA 1CE2A 3TCGA 3FJMA 3R26A 4ELOA 3T9XB 3PD9A 3CRBA 4ISUA 4QF9A 1OMPA 2I4CA 4KR5A 4YKPA 1JVYA 2BJJX 1H44A 4QSCA 3GLBA 3KGCA 3C34A 5CM6A 3QXMA 2FYIA 3E13X 1FCKA 1SI1A 2QMWA 3PPQA 1B40A 1DTZA 3Q26A 4AB5A 3QSLA 4XIGQ 4GVOA 1QUJA 4X9TA 5AA1A 2F7CA 1MQJA 2XD2A 2UVIA 1M5EA 1ZJLA 1Z7NE 2HFBA 3OO6A 1LFHA 1LAFE 1B58A 3M8UA 4ESWA 3LBSA 5JK4A 4GRKA 4P0GA 4N6PA 1TFDA 2O51A 4KFQA 3MBPA 2QS4A 1S50A 4KCCA 4ZE9A 4U1OA 4EF2A 1MY4A 1ANFA 1QVSA 3RT8A 4ZZAA 3O29A 5L9SA 4H1XA 4OFLA 3K4UA 1M5DA 1UIUA 4GQOA 3IORA 3OXNA 4F3PA 3PUVE 1QKBA 2VD2A 4GF8A 3BFTA 2I49A 1P1UA 4GL8A 4ONYA 3ILUB 4KYEA 2QL3A 4FORA 4R9FA 1H3DA 1B7ZA 1LGBC 4FEDA 4RJZA 2G29A 1O7TA 3IK6B 4G68A 1MH3A 4YAHX 3BKIB 1LAHE 4OESA 2XXPA 5KZTA 1Y3QA 1TT1A 2DOJA 1B46A 3HN0A 1AOVA 2UXAA 1MM6A 4BLAA 2V25A 1DPPA 1MM7A 1SD3A 2AYSA 4P11A 1B6HA 4UA8A 3CIJA 4R6KA 5KDTB 1JVXA 3O6GA 2G93A 2XXRA 5AA4B 3VXBA 1NKXA 4DZ1A 3FUZA 5I84A 3MW0A 4BDRA 1WODA 4QSEA 2QRYA 4NMYA 2XXVA 1MQDA 1B0LA 3RNNA 2FA7A 2HZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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