1FQFA

Crystal structures of mutant (k296a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFADSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA02
3HO7A 4AB5A 5H8NA 3GZGA 4IGTA 3MQ9A 1IXHA 3A09A 1VR5A 3K4UA 2AIXA 3M8UA 1SBPA 3MP1A 4QSEA 2HQ0A 3O2AA 4G68C 4AB6A 3R26A 3Q27A 3UN6A 4BLAA 1B32A 1MXXA 3M3KA 2UVHA 4ECFA 2ONSA 2RC9A 5HM4B 5F7VA 4KR5A 3T96B 1MY2A 4H8JA 1AMFA 2QS1A 1SYHA 1EH3A 2DOJA 4R2BA 1IUDA 3IO4A 3FIRA 3RQTA 3CFXA 3PPNA 4QFKA 1UIVA 2Q8JA 2AL4A 4IO4A 1LBCA 1R1NA 3S9MC 4U4XA 1S9TA 2XXQA 4GF8A 4G8MA 3MJNA 2I58A 4H1XA 3PPQA 2H4IA 1FTKA 3MW0A 5AA2A 1US4A 5BUUA 3OO6A 3KFMA 4I1DA 4XXUA 2XXTA 3TODA 4R73A 3MC2A 1ZBMA 4FATA 2DWIA 1P1WA 1I69A 2RF1A 4ZDMA 5JK4A 5ISUA 4QRZA 3SEXA 3LSFB 5AA4A 3CVGA 5DYHA 3TTMA 1JW1A 2UYEA 4LATA 3KJTA 3KG2A 3FASA 4DDDA 3G3IA 3QXMA 1WODA 1B3FA 3BFUA 1DPEA 1O64A 5KCJA 3V83A 1UQWA 1Z7ME 5DTBA 4GLIA 4C1TA 3HHFA 1TXFA 1FQBA 4HCYA 5H8HB 1URGA 1MXUA 2ZNTA 5HPQA 4F31B 3KOTA 1AIVA 4H5FA 4FEDA 1WVJA 2F8DA 3K6UA 2XXUA 4JWOA 3RT6B 4I8CA 3UGWA 2ABHA 4NF5B 5F1QA 5I58B 4EXLA 1L5TA 3FD3A 3HCQA 3OO8A 4GOTA 4IB2A 4G2ZA 2DE4A 3RLFE 4EQ7A 1OMPA 4MLQA 2HXWA 4ELPA 4WKMA 2NXOA 1BIYA 3VVFA 1VFEA 3PUVE 4DIGA 3E3KA 3FVKA 4JWYA 3LSLA 2ONRA 1UTHB 4UA8A 4BDQA 3H6WA 4KFQA 4RXLA 2QMWA 5TPAA 3C32A 3TPAA 1FTLA 2PT2A 2H9BA 2I48A 5EHMA 2DXYA 2REGA 1D4NA 3LBSA 4FIMA 4EF1A 4OFOA 1A99A 1B4ZA 1EZOA 3S9NC 1SW2A 4X9TA 2FA7A 4NF8B 3LC8A 3PUZE 1PB8A 5CC2A 3D4CA 5CI5A 3PUXE 4BDNA 4NF4B 1DSNA 3HSTA 3M3FA 3BBRA 1B40A 5L9OA 3G3GA 3N6UA 4MBPA 4DLDA 1FQAA 3KOSA 3R7XA 3IK6B 3K6XA 4RA1A 1Q1KA 3SERA 4PFWA 3IR1A 3RT8A 3KN8A 3KSJA 3KSXA 5JEIA 2V3UA 3USDA 1AOVA 1MXZA 1USYH 2X7QA 5IKBA 4ZE9A 1NMUA 4YKKA 3SKPA 2VHAA 4JXIA 3FGSA 3UA8A 1YAEA 4E0WA 3TCGA 1A7LA 4EUOA 5H8FB 3MP6A 4EQBA 4G68A 4BDLA 4LONB 5CMCA 1SI0A 1EZPA 5CRYA 3FUZA 2WKYA 1UTBA 4WEDA 1EU8A 3KZGA 1M5EA 4XIGQ 3TCHA 1B3LA 5DVIA 5TU0A 1IQ7A 3GBBA 1B5IA 4PQJA 3IOUA 2XX7A 3OO7A 1P1OA 1YCJA 2DYXA 3G3JA 4L17A 1QUKA 3FXRA 1O63A 2O1MA 5L8DA 4WXJA 4LQ5A 4OESA 4YB6A 2O7IA 1N76A 2RKMA 4I62A 5FTIA 5AA1A 3V5AA 2Z22A 1H44A 1TFDA 1IXIA 4RJZA 2ZYMA 2RCBA 1A40A 4PETA 1PB9A 4YKJA 1GR2A 3K01A 4F2QA 2V3QA 4XKQA 2GHBA 5I56B 2XHDA 4M4GA 4F3SA 1TWYA 2Y84A 4QFLA 1N84A 5BWJA 2V93A 3R6UA 3IJXB 3CFZA 4GVOA 4GL0A 1MY0A 4ZEBA 4LVQA 1R9QA 2XXYA 3OENA 1MQIA 4ESXA 5H8QA 3K1NA 4NE4A 3FVOA 1US5A 3G3KA 3BKIB 1XS5A 4YICA 3B6TA 4C1UA 3TELA 4QF9A 1ZLQA 1OLCA 4O3BA 1QUJA 1Y1ZA 1MS7A 2NWJA 2XXRA 5A5XB 4JBZA 3FJGA 2NUVA 3CI8A 3N5LA 1URSA 1B58A 3O28A 3OMBA 2OWTA 3VVDA 3O9PA 4BDOA 4ESWA 3E4RA 4OVJA 3W15C 4F1YA 4OMBA 2GFEA 1B5HA 3FV1A 4TLMB 3B7DA 3CG1A 1A54A 2AL5A 4JSOA 2QPQA 3KBRA 4YKPA 2O6AA 3QYTA 2UVGA 2XD2A 1LAXA 5AA2B 4IO3A 5I59A 3HN0A 2RC7A 1LCTA 3WAEA 1I6BA 1BKAA 2DQVA 4FEBA 3VV5A 5ICQA 4XKNA 3D4GA 5H8SA 3H6UA 3OO9A 2I4CA 1MXYA 3FJMA 4U23A 3K6WA 1MM7A 2HZLA 4R74A 2H98A 3MVYA 1B0HA 3S9LC 1II5A 2OBGA 1LCFA 4EF2A 5AA4B 1DTGA 3S2VA 2B65A 1LAHE 5KDTA 1GGGA 2UVJA 1B1HA 5FHMA 3SETA 5DEXA 2THIA 3U92A 3LR1A 2I49A 3O66A 2OZZA 1Z7NE 3IL1B 1RKMA 4N07A 4OFLA 4LZ7A 1N0TA 1FW0A 4JSDA 2I6EA 2Q2CA 4RY1A 3C4MA 3EHUA 1QVSA 3O6GA 5I2NA 2P1SA 3EN3A 4YB5A 2Y7RA 2XXXA 3H3GA 1B7ZA 4ISUA 2UVIA 4U21A 3K1MA 1IXGA 4ZS9A 4DXBA 1J1NA 2I0CA 1JEUA 4HCWA 3C34A 2I3VA 3C31A 2O68A 2Z23A 2UXAA 1NL5A 1HSEA 3H06B 4GXSB 2I0BA 4OXVA 2YLNA 1ATGA 1FQFA 2DVZA 3EHTA 5TPAB 3ZS6A 1PB7A 4ELOA 1JW4A 2H5YA 3L6GA 2DXRA 4KD5A 1B3EA 3O97A 3ZSFA 3AXFA 3PD9A 3VE1B 4OQOA 4POXA 3IOVA 3MWBA 1TT1A 4IY6A 1LAGE 2P2AA 1ZKBA 4H5GA 3H03A 3G3FA 3U8QA 1QKBA 3IB2A 1QUIA 4ELQA 5AA2D 1BTJA 3DP8A 4LZ8A 4LQ2A 3H4ZA 3U93A 2HAUA 1MQDA 2GHAA 1EZ9A 4GQOA 4Q8RA 4FAJA 4H8IA 2YJPA 2Z8DA 3PU5A 1UIUA 1PEBA 1LLSA 3DP6A 2Z8FA 3MUQA 4X48A 1MG1A 2O84X 2A5TB 1SI1A 4ZEIA 2O51A 2DWHA 4FJPA 2NOOA 3E9XA 2OLBA 2O69A 4KQPA 1N04A 2F97A 2PBWA 3PMVA 3EPEA 4DXUA 3PGFA 1M5FA 5I2KA 4MLVA 3GBAA 1F9BA 4G68B 3PUYE 4RYAA 4R75A 3H6VA 4POWA 4GIZA 4EQ9A 1ZJLA 3E13X 1SD3A 4U1ZA 4KCCA 1MXWA 1UTBB 3P7IA 1HSJA 3IB0A 1N7XA 3IOTA 1MY3A 1Y3PA 1FQEA 3KN7A 2LAOA 2F7BA 2D3IA 1URDA 1VE4A 3RNNA 2Q88A 1MQHA 4ND9A 1CB6A 2I3WA 2PYYA 4TLLB 1N7WA 2ONKE 4YMAA 3TTKA 1A8FA 4QFNA 3T9VA 4M1VA 1JW5A 1KWHA 2ZXTA 3U72A 3DM0A 3TCFA 4FE8A 4ELRA 3FXUA 1B7HA 1MM6A 3QIMA 3CRBA 3Q29A 4BDMA 3K02A 3N94A 1GV8A 4PFUA 3QSLA 2X7PA 3PMXA 2XXHA 3DELB 1XOCA 1ZTYA 4IO6A 3JYRA 3Q28A 4OENA 3CR9A 5H8HA 1OQHA 3HPIA 3T9UA 2OJTA 1B46A 3OEKA 2XX9A 1R6ZA 3TQLA 2DS9A 4DE8A 1Q35A 3QUJA 3SESA 3I6VA 2HCAA 4ZEFA 4P11A 5H8QB 2DE2A 2FNCA 2I4BA 1B52A 4IY5A 1A8EA 3TFLA 4R6YA 5FTHA 5CMKA 3MAMA 2Q89A 1UTHA 3RPWA 1VSOA 2DWAA 2IEEA 1ZMGA 2Y7PA 3EQ1A 1NKXA 1SW5A 1M5BA 3RTWB 1QKAA 1P1NA 4IO7A 1PC3A 2YPNA 5KZTA 3IORA 2R6GE 4F3GA 2DP8A 4F2OA 3TKDA 5IAIA 3BFTA 3QUFA 2H25A 2X26A 1GTKA 2QS3A 4N13A 3LSXA 4E0XA 4JDFA 3IAZA 1MY1A 1SYIA 2QRYA 3PMWA 3VXBA 4F3BA 2F35A 1B9JA 4P0GA 3TAJA 5H8NB 4OETA 4XKPA 2D21A 2Y7WA 3LUYA 4DCYA 4QFPA 4YAHX 3V89B 3Q25A 5ITPA 1AL3A 5CBRA 3K6VA 3KGCA 1SQYA 4NF6A 3FATA 2F6PA 2XD3A 1ZU0A 4GRKA 2VP1A 4ZECA 1TFAA 3VLUA 4QSDA 5DVJA 2RC8A 4OWDA 1MH3A 3OELA 3HHGA 2KLFA 2ANJA 3I3VA 4R6KA 1JQFA 4G4PA 1OVBA 3T66A 1NH7A 3SEVA 2RINA 1ANFA 3OD7A 3DLNA 3H7MA 3OOAA 4C0RA 1HSLA 4FORA 4WEPA 2GH9A 4HS7A 4KI0E 1D3KA 2DVCA 5I2NB 1BLFA 3CFLA 3VLWA 3N26A 3Q26A 1Y20A 3OXNA 3F11A 2A5SA 4NWCA 4Z0IA 1N3XA 2Q9TA 2Z8EA 2PVUA 3ZKLA 1NFTA 2PX1A 1SW1A 2FYIA 3S9EA 1IXCA 1XC1A 2OCUA 3TDJA 1MDQA 1SVXB 1MPCA 2XXWA 2ZNSA 1POTA 3G3HA 3WAFA 4EDPA 1LB9A 3THIA 1LFHA 1PDAA 4KYDA 3W9VA 4R9FA 4F29A 4ZZAA 1VFDA 2PT1A 1FTOA 1MPBA 1PBQA 1Y1MA 5CM6A 3KJ7A 1XVXA 1H76A 1FTJA 1WDNA 2ALUA 4OZ9A 3A3CA 4R2FA 2QL3A 3IO6A 1OVTA 4H6DA 2ZMBA 2V84A 3PPPA 5AE4A 1LGBC 4GL8A 3SDFA 5KCJB 5B70A 5ICTA 4KYEA 4P0IA 1B7UA 5CMMA 2F7AA 4R72A 3TYHA 1IITA 4GD5A 1NNKA 1FTMA 5A5XA 1USYE 4YB7A 1LSTA 4G8HA 3VVEA 2B3FA 3DP4A 4G77A 3RN8A 3K1PA 4LP2B 5EYFA 4ZE8A 1BP5A 4KPTA 5I2KB 2QS4A 1B1XA 4O3CA 1CE2A 5TP9A 4I9DA 5CMBA 3TEPA 1IEJA 2CMOA 4IGRA 2Q2AA 1B6HA 5JTYA 3VLVA 3C33A 2F36A 1DMBA 4F3PA 2ESNA 1NNTA 2UYFA 2ZYNA 5I57A 5AA3A 3PV0E 1OIBA 1LBBA 4HW8A 1IIWA 4U4SA 3IX1A 3MVWA 3PUWE 2QS2A 4F18A 4QSCA 5DT6A 4OTEA 2QSXA 5CBSA 1S50A 3RY3A 4F1UA 3FZVA 4H65A 4Q5TA 2F6GA 1QULA 1SDXA 1I6AA 1R9LA 3ECRA 1B05A 4PE5B 2XXIA 1D9VA 3KN3A 2F78A 3T9HB 2VGQA 2CZLA 3MZ1A 3CSBA 1P1UA 1JNFA 4N6PA 4NTLA 3B6QA 1IZ1A 3C9HA 2HEUA 4MFIA 2F7CA 1YPNA 1ELJA 3JZJA 5LOMA 3U1OA 3T93B 3PPOA 1LAFE 3RTFB 3B6WA 5EHSA 2REJA 5L9SA 2W7YA 4RPOA 1XHYA 3SEYA 4KYSA 1Y3NA 4YMBA 3FJ7A 1S7YA 2R9JA 3OSQA 1A55A 1ZIUA 3K00A 3MPKA 1B0LA 1MY4A 4GFRA 2HAVA 4U2RA 1MXVA 1XT8A 3CG3A 4U22A 3T22A 2ZYOA 3VDFA 3U94A 5K2YA 1MRPA 3TTLA 1P1QA 4THIA 5I84A 3TZAA 1D9YA 3C36A 2O1LA 5HBCA 1XVYA 1AH5A 4HTGA 3RUMA 2GRVA 4H0WA 3FV2A 3OEMA 4JB7A 3LSWA 2RCAA 1YTVA 1LFIA 4TOZA 3UIFA 3UORA 3ILUB 3N6TA 4NEDA 2R71A 5J1DA 2B3BA 4MH5A 1JVYA 1I6QA 3ONMA 2H99A 2QJEA 2F5XA 4OEVA 4OERA 3MPLA 1B51A 5L9MA 4NMYA 4YZZA 3MBPA 4RK2A 1MH4A 3V8XB 3UK4A 1JETA 3H6TA 4UACA 2A5TA 3W9WA 2DE3A 2ZYKA 3SEWA 2F34A 4LZ5A 2XXVA 4NF5A 1SW4A 5I58A 1FCKA 4EXKA 3TMGA 4RPNA 1B3HA 4R6HA 4BDRA 2DSFA 2Y7KA 4NF6B 4AQ4A 3GXAA 4O3AA 4PFYA 3TTRA 1M5CA 3QK6A 3EHSA 3A3UA 3MVXA 3MZ9A 3PD8A 1B2HA 4RK9A 1B5JA 3ZKKA 3TQWA 1RYOA 2ZNUA 4YU0A 4LA9A 4MF3A 3OSRA 2D5WA 2HFBA 4DZ1A 5FHNA 3GLBA 4IO5A 5M2VA 4F39A 5FHOA 1LFGA 3RGYA 3JV9A 4ZEKA 2OK2A 5ITOA 1P99A 4DCXA 3TTNA 4Q30B 4OYVA 2Y7IA 4NF8A 1OLAA 4Z7EA 1FQDA 1DOTA 1NH8A 3HV1A 3ILTB 1N3WA 2HZKA 3MP8A 4NF4A 2VOZA 4ZZEA 5ELVA 4K3FA 1NNPA 4OFJA 4U1OA 2E1SA 3K2DA 4XTCQ 4XKRA 2BJJX 5I59B 1MQJA 4Q0CA 3FXQA 1Y4CA 1H3DA 1H45A 4QHQA 5B7DA 1B4HA 2O7UA 5K2XA 4R9GA 3CIJA 1OQGA 4G8NA 2E0SA 3SEUA 2G93A 2AYSA 3TUSA 2PMSA 1B3GA 3M3LA 1Y9UA 4DXCA 3K0VA 3IB1A 5H8FA 5KDTB 3PPRA 4PP0A 4X1DA 3O29A 1JVXA 5DEXB 1JEVA 1MPDA 4OHNA 4TQUQ 5DVFA 3G7WA 2VD3A 2M8CA 3VFJA 1QW0A 4GWOA 1DTZA 4F19A 2OWSA 3FVGA 1GVCA 3S4UA 2V3TA 2XX8A 2IA4A 4ZEDA 3EF7A 3I5OA 3CSGA 1M5DA 1Y4TA 3IOWA 4RNSA 4JWXA 4KCDA 4NWDA 1H43A 1PBPA 4YKIA 2P0SA 3KEIA 1T0KA 4X1BA 4OEUA 1NNFA 4KHZE 4ONYA 4IO2A 1O7TA 2G29A 1POY1 3ODBA 4H67A 4GXAA 1MQGA 4QFOA 1FQCA 3L6HA 3IJOB 4PFTA 4F1VA 2VD2A 3C35A 3MVZA 5TP9B 3FVNA 2XXPA 1LB8A 1RYXA 4LUBA 2V25A 5JTYB 3MZBA 1MDP1 5I57B 3O6HA 3UP9A 1QJMA 4FECA 4F22A 5I56A 3O6IA 1DPPA 3VXCA 3T9XB 2DWJA 1Y3QA 3QAXA 2NVUB 2QMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HO7A 4AB5A 5H8NA 3GZGA 1IMDA 4IGTA 3MQ9A 1IXHA 3A09A 4MAGA 4O7MA 1VR5A 3FBPA 2P3NA 3K4UA 2AIXA 5EQ7A 3M8UA 3RPLA 1SBPA 3MP1A 4QSEA 2HQ0A 3O2AA 4G68C 4AB6A 3R26A 3Q27A 3UN6A 1K9YA 4BLAA 1B32A 1MXXA 4QXDA 3M3KA 2UVHA 1FJ6A 4ECFA 2ONSA 2RC9A 5HM4B 5F7VA 4KR5A 3T96B 1MY2A 4H8JA 1NV3A 1AMFA 2QS1A 1SYHA 1EH3A 2DOJA 4R2BA 1IUDA 3IO4A 3FIRA 3RQTA 3CFXA 3PPNA 4QFKA 2VPOA 1UIVA 2Q8JA 2AL4A 4IO4A 1LBCA 1R1NA 4GX6A 3S9MC 4U4XA 1S9TA 2XXQA 4GF8A 4G8MA 3MJNA 2I58A 4H1XA 3PPQA 2H4IA 1FTKA 3MW0A 5AA2A 1US4A 5BUUA 4GWSA 3OO6A 2Q8MA 3KFMA 3QMFA 4I1DA 4XXUA 2XXTA 3TODA 2CEXA 4R73A 3MC2A 1RDYA 2Q74A 1ZBMA 4FATA 2DWIA 2CEYA 1P1WA 1I69A 2RF1A 4ZDMA 5JK4A 5ISUA 5I5PA 4P1LA 4QRZA 1NV7A 3SEXA 3LSFB 5AA4A 3CVGA 3MSTA 5DYHA 2XA5A 1NV2A 3TTMA 1JW1A 2UYEA 4LATA 3KJTA 3KG2A 3FASA 4DDDA 3G3IA 3QXMA 1NUXA 1WODA 1B3FA 3BFUA 1DPEA 1O64A 5KCJA 3V83A 1UQWA 1Z7ME 5DTBA 4GLIA 4C1TA 3HHFA 1TXFA 1FQBA 4HCYA 5H8HB 1URGA 1MXUA 2ZNTA 2WYKA 5HPQA 4P9KA 3FXBA 4F31B 3KOTA 1AIVA 4H5FA 1NV1A 4FEDA 1WVJA 2F8DA 2GQ1A 3K6UA 4GWYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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