1FTJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with glutamate at 1.9 resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA01
3LSLA 4ESXA 4IO4A 2XXPA 3GLBA 3Q28A 1UIUA 1N04A 5FTHA 1VFDA 2Y7RA 2PVUA 3GBAA 3TUSA 1LAXA 4OXVA 2O1MA 3ONMA 3MPKA 5I58B 4JSOA 4ESWA 2UVIA 3QAXA 1B7UA 1SYHA 5I56A 1FTOA 4NTLA 2HAUA 3C35A 3LBSA 5A5XB 2H99A 1FQDA 3TTMA 1QULA 3TELA 3Q25A 1FCKA 3E3KA 3CVGA 2M8CA 2VGQA 2NUVA 4H6DA 1NKXA 4X1BA 3S9MC 3O28A 1R9QA 4PETA 1SI1A 2UVGA 4U4XA 1B1XA 1R1NA 3FVNA 1ZMGA 4LQ5A 4GRKA 1BIYA 1ZBMA 1XT8A 3CG3A 4F39A 2OWTA 4YB7A 1Y4CA 4HW8A 4KCDA 3B6QA 1IEJA 1Z7ME 2HZLA 1Y1MA 3KOTA 3PMWA 1LCFA 1XOCA 4XKPA 4PE5B 3U1OA 1Y4TA 3HN0A 3CG1A 1SI0A 1UIVA 5I59B 4NF4A 4FIMA 1LGBC 5L9SA 3T96B 1TFAA 4H5FA 4O3BA 2A5TB 4KHZE 3PD8A 2XX9A 3C9HA 4YMBA 4R2FA 4IO7A 1PBPA 2Q8JA 4X1DA 1IXHA 1AOVA 2GHAA 2H25A 1NH8A 4G2ZA 1ANFA 3ILUB 5I2KA 3Q26A 5CM6A 4MBPA 2IA4A 2DWIA 4PFWA 4EDPA 1FTMA 3PPQA 2ANJA 1T0KA 2UVHA 3H6WA 3IJOB 1B6HA 3MVYA 1BLFA 1PEBA 5TPAA 2Z23A 3ZKKA 4QFNA 1A55A 1HSLA 1B40A 4QFLA 3ZKLA 3UGWA 1P1QA 4ISUA 1LBCA 3RN8A 4DXUA 3A3CA 1Y3NA 3CFLA 4PQJA 2WKYA 1QUJA 2XXUA 3VFJA 4OYVA 2DVCA 3T22A 4PFYA 4EXKA 3TTNA 1US5A 3MZ9A 3T9VA 4R73A 3O29A 3CI8A 2PT1A 4GXAA 1RYOA 4R75A 3OELA 3BFUA 1O64A 1M5CA 3EN3A 1RYXA 5CC2A 4LVQA 1JEUA 3VVEA 1POTA 1NH7A 2P1SA 3QK6A 3MBPA 2NOOA 4POXA 4C1TA 3SDFA 4H8IA 3TODA 3K6UA 3SEYA 5IKBA 1NNKA 3KN3A 1MM6A 3EF7A 5TU0A 3B6TA 4MF3A 3V8XB 5DVIA 4DLDA 3GBBA 3MVXA 3M3KA 2F7AA 1AL3A 5DEXA 3MWBA 3Q29A 4QFPA 1JQFA 3T9HB 5KCJB 2I0CA 4X48A 1GVCA 1P1WA 3RQTA 2V3TA 4F1UA 4JWYA 3GZGA 1B3GA 3K6VA 3K01A 5AE4A 4OERA 4F1VA 5LOMA 3I5OA 3RPWA 4RK2A 4LA9A 3PMXA 1SW5A 4GLIA 3N26A 3OEKA 1A8EA 1ZLQA 4ZEBA 3C36A 4FAJA 4ZE8A 1FW0A 2ZNUA 3Q27A 1MXYA 2XXXA 3PD9A 3IB0A 4C0RA 4G77A 4TOZA 3IB2A 3PPRA 2XX8A 5I56B 4QFKA 2FYIA 3DLNA 3KFMA 3K6WA 2OBGA 1Z7NE 1D3KA 4HCWA 4F29A 1LCTA 3N6TA 2UYEA 1I69A 4FORA 4GD5A 4BDQA 3UN6A 4POWA 1TT1A 4PP0A 3G3IA 5KZTA 5H8FA 1AMFA 1ZIUA 2DP8A 3G3GA 2XXIA 1VE4A 3IB1A 3LUYA 4RNSA 2OZZA 3OOAA 1FQFA 4GWOA 1H45A 1MM7A 3LC8A 2V3UA 2PYYA 2Q2CA 3FJ7A 5J1DA 3ILTB 2AYSA 1B4ZA 1KWHA 2Y7KA 5DVFA 4I9DA 1D9YA 4F3BA 2F6GA 2F78A 4NF4B 3TCHA 5F1QA 4G8MA 1WVJA 4F3GA 1L5TA 3QUFA 2O68A 4IO5A 3C31A 1AIVA 3C4MA 2CMOA 1LAHE 3VLUA 1N7XA 3LSFB 3LR1A 3U93A 4IGRA 4U4SA 4OZ9A 2Z8EA 4EF2A 4H5GA 1M5DA 5H8QA 3TAJA 5I2KB 4P11A 2RCAA 1FQCA 5AA4A 3C34A 3O9PA 4K3FA 4DXBA 2DSFA 3IOVA 1B3HA 4WEDA 3OEMA 4KFQA 1OQHA 3PGFA 5JEIA 3FVGA 4U23A 2VP1A 4FJPA 1RKMA 3TQLA 3W9WA 4G68C 4U21A 4G8HA 2XXTA 5TPAB 2DQVA 1B0HA 1QKBA 1H44A 1BTJA 1SQYA 1SBPA 5I2NA 4OMBA 4LQ2A 3CFXA 4ZEFA 2V84A 3FZVA 1IIWA 2RC8A 1B2HA 3KGCA 1OIBA 1SD3A 3EQ1A 4IY6A 4RPNA 3KSXA 4R6YA 1FTLA 2ALUA 5ICTA 2Q88A 3R7XA 5EHSA 3M8UA 1MDP1 2ZYKA 2Y7IA 2OLBA 1EH3A 3DP8A 4F3PA 2F7BA 2RINA 1A40A 2OK2A 2O51A 3UP9A 3SESA 1Y9UA 1B1HA 4H1XA 5JK4A 4F18A 2DOJA 1Y20A 4ZZEA 3H6UA 3WAEA 4OQOA 4YKKA 4FEDA 4YZZA 3BFTA 4OHNA 1H3DA 4NEDA 4LUBA 4E0WA 5DEXB 3HHFA 4AB5A 1UTHA 2QL3A 2REGA 5TP9A 2DVZA 4RK9A 3PUXE 1TFDA 4RY1A 4I1DA 3TDJA 4DXCA 4F2QA 4RPOA 1N7WA 1FQEA 1MDQA 4XIGQ 1NNTA 2Q89A 1URGA 3N5LA 1QUKA 3TZAA 3KZGA 1GR2A 2HCAA 3KEIA 4RA1A 2HXWA 2B3BA 3GXAA 2G29A 1HSJA 1NNPA 2BJJX 4MLVA 2OJTA 3OO8A 4ZECA 5B7DA 3O2AA 4Z7EA 2F5XA 4PFUA 3O6GA 3FV2A 2CZLA 3VVDA 2YPNA 5B70A 3FIRA 3PPNA 3DM0A 2XX7A 3TPAA 3FD3A 4LZ5A 3FASA 3PPPA 1B58A 2GHBA 2QS1A 2XXQA 4Z0IA 4JSDA 3USDA 4OEVA 3U94A 1LFHA 5H8FB 3MPLA 4R6HA 2I6EA 1N76A 1YAEA 2V25A 4H0WA 2FA7A 4FATA 1B3EA 1MY3A 4EQ7A 3VE1B 3OO9A 3BKIB 4DZ1A 1EZOA 4N13A 4MLQA 4FE8A 3DP6A 1URDA 3IL1B 3FVOA 4RJZA 2Y7WA 2ABHA 1XC1A 4NF8B 3K4UA 4F22A 2DYXA 2F7CA 3I3VA 4P0IA 3H6VA 1I6QA 1HSEA 3M3FA 1MPCA 4NF5A 1LFIA 2F36A 2OWSA 2H98A 2KLFA 2G93A 2O84X 4OWDA 1QJMA 4TLMB 2PT2A 3S9NC 5H8QB 3H7MA 3IOUA 1IITA 1ZKBA 3SEVA 5AA4B 3MP8A 3TYHA 3RNNA 1XHYA 3KG2A 3DP4A 1DMBA 1QW0A 2AIXA 1MXVA 3OENA 2Z8FA 1M5EA 2Q2AA 3G7WA 4BDMA 2F6PA 4YAHX 3MAMA 3UK4A 3WAFA 3QYTA 4H8JA 3E13X 1IXCA 3MQ9A 1EZPA 4OTEA 4G68A 3RGYA 4BLAA 2I3VA 3T9XB 4QSEA 2PX1A 3OO6A 5I2NB 3JYRA 4UACA 4KYEA 2ZYOA 1XS5A 1WDNA 4M1VA 3C33A 1A8FA 5H8HA 2F34A 2PMSA 1EU8A 2AL5A 3T66A 4LZ7A 4EQ9A 5CMBA 2UYFA 2ZYNA 4Q30B 4F3SA 3K1NA 4QSCA 4R9FA 2Y84A 3E4RA 3TQWA 3K1PA 5EHMA 2I48A 4QFOA 2H4IA 3SETA 3IX1A 1TWYA 3MVWA 4Q8RA 5DVJA 4QRZA 3L6GA 1UTHB 3O97A 5TP9B 4O3AA 1H76A 2PBWA 1JVXA 2ZMBA 3TCGA 1UTBA 1MRPA 4OETA 3OO7A 1PB9A 3QUJA 3MUQA 4F31B 1IXGA 3K1MA 4TQUQ 1OLCA 3OMBA 2H9BA 1SVXB 3OXNA 3UORA 3IORA 1F9BA 3O6IA 3F11A 4WKMA 3MC2A 3H6TA 1I6AA 5K2YA 3ZS6A 1DTZA 3QIMA 1CE2A 4NMYA 3FXUA 3K0VA 1B46A 2ZNTA 4EUOA 2I58A 4LONB 3QSLA 5FHNA 4AB6A 2B3FA 3C32A 1VSOA 1S7YA 1H43A 4TLLB 3RTFB 4OFJA 2XXVA 2RKMA 1B51A 1Q35A 1JW4A 3FXQA 4I62A 1II5A 1NL5A 4F2OA 4QSDA 3V89B 3FXRA 4HCYA 5H8NA 1ZJLA 1URSA 2DXYA 4NF8A 4ELPA 3AXFA 3PPOA 4DCXA 1SDXA 1Y1ZA 1B5HA 4P0GA 5DYHA 3QXMA 3PMVA 2R71A 2UXAA 4YKJA 4IY5A 3T93B 2O69A 1B9JA 3VDFA 3SEWA 1MQHA 1XVXA 3OD7A 1OQGA 4NE4A 1MPBA 4ELQA 3N94A 3ODBA 2I3WA 3TFLA 2DXRA 4JXIA 4XTCQ 4R74A 2NVUB 1LAFE 4LP2B 4NF5B 5AA2D 4NWCA 4F19A 1MPDA 2DS9A 3HSTA 1MQGA 2I0BA 3K6XA 4BDNA 4XXUA 2XXHA 1SW1A 4GFRA 4L17A 5I57A 4OFLA 3TTLA 4U2RA 4KD5A 1B5JA 1D9VA 2F8DA 3PUZE 1M5FA 2DWAA 2HQ0A 1MY4A 1B32A 1R9LA 2QMWA 2X7PA 5FTIA 1MXUA 2VOZA 3SEUA 4ZEKA 1B05A 4AQ4A 5HM4B 4KI0E 4C1UA 1DTGA 1A54A 5L9OA 2Y7PA 1P99A 1LAGE 4YMAA 3PUYE 2XXWA 4ND9A 2HZKA 3H06B 3HV1A 2QRYA 4G68B 3FGSA 3A3UA 2FNCA 1MY0A 3LSXA 4EQBA 2OCUA 4WEPA 2X26A 1YCJA 2D5WA 2VHAA 2QJEA 5M2VA 3G3HA 4ECFA 5H8HB 1R6ZA 4QF9A 5FHOA 1I6BA 3IAZA 3TEPA 4FECA 1MY1A 3O66A 1B4HA 2ZYMA 4YICA 1SYIA 1MXXA 3LSWA 4KR5A 2O1LA 1DOTA 4GQOA 3FJMA 1VR5A 4H65A 1B52A 3M3LA 3FJGA 3FUZA 5KDTA 4HS7A 1A7LA 1LFGA 3K00A 1N84A 3FATA 5CBSA 3PUVE 1ELJA 1GTKA 3U72A 2Q9TA 2NXOA 3PUWE 1B7HA 1DPPA 1O63A 1B3LA 3KSJA 1MY2A 1SW2A 3I6VA 1OVTA 4JWOA 3HPIA 2ONRA 5DT6A 2DWHA 1B5IA 3U92A 1IQ7A 2XHDA 3SERA 1UTBB 3T9UA 1MQJA 4IO6A 3L6HA 2DE4A 1LB8A 3G3FA 3VLWA 2QSXA 4ZE9A 1MQIA 3E9XA 2ONSA 4R6KA 4H67A 4N6PA 3ECRA 2O7IA 1JETA 4BDRA 2QS3A 3VLVA 1VFEA 4OEUA 2REJA 2VD2A 3RY3A 3MW0A 4G8NA 1YPNA 3IO4A 5AA2A 1UQWA 2DE2A 3RUMA 1JNFA 4R72A 1PB7A 3THIA 1USYH 5H8NB 1JW5A 3TMGA 4O3CA 4GXSB 1B0LA 4HTGA 4ONYA 4DCYA 2O6AA 5JTYA 3SKPA 2LAOA 3UIFA 4GVOA 2XXYA 4QHQA 4JB7A 1Y3QA 3KN8A 4NF6A 2IEEA 1N3XA 4GL0A 1PC3A 2GH9A 2ESNA 3O6HA 4YKPA 5AA3A 3MP6A 4ELOA 4ELRA 3MZBA 2ZNSA 3G3JA 4PFTA 1IZ1A 3SEXA 3KJTA 3IR1A 2GRVA 3EHTA 3H3GA 2VD3A 2HEUA 1POY1 3RLFE 4NWDA 1PB8A 1QVSA 3KBRA 3CR9A 5CMMA 3P7IA 1NNFA 4I8CA 2X7QA 4OVJA 4N07A 2DWJA 3MJNA 3D4CA 1Y3PA 2Z22A 1M5BA 4EXLA 5CMCA 5I57B 5K2XA 5BUUA 5FHMA 4LATA 1JEVA 4E0XA 3CSGA 3JV9A 3K02A 3VXBA 1US4A 2YJPA 1J1NA 3RT6B 4ZEDA 3R26A 3V5AA 4U1ZA 2RF1A 3HCQA 4OFOA 1P1NA 1DPEA 1QKAA 2W7YA 2RC9A 2V3QA 3VV5A 1P1OA 3G3KA 4GL8A 5CMKA 2NWJA 1MH3A 1BP5A 1LSTA 2HAVA 3TCFA 3EPEA 2V93A 3MP1A 3H4ZA 1GV8A 3ZSFA 1USYE 1JW1A 2O7UA 4M4GA 3VVFA 1MXWA 1S9TA 1A99A 1EZ9A 5ISUA 1MG1A 3KOSA 4BDOA 5I58A 5F7VA 5BWJA 5ITOA 1OMPA 5CI5A 3OSRA 1PBQA 2RC7A 4R2BA 5A5XA 3B6WA 1YTVA 2HFBA 4THIA 2XD2A 4BDLA 1FTKA 3CFZA 1N0TA 5I84A 2QMXA 3TTRA 4YB5A 3W15C 4U22A 3FV1A 2R6GE 3IJXB 3EHUA 3UA8A 5KDTB 4FEBA 3CRBA 1IXIA 2ZXTA 5L8DA 2D21A 2R9JA 5H8SA 2E1SA 1MH4A 4RYAA 1TXFA 1ZTYA 3IK6B 3PU5A 4JBZA 4DIGA 4XKRA 5HBCA 3K2DA 1MXZA 4OENA 3EHSA 5ELVA 5I59A 4WXJA 3KJ7A 1OVBA 3TKDA 2E0SA 4OESA 4EF1A 3MVZA 1WODA 2A5TA 1QUIA 3R6UA 2I4CA 1FQBA 4LZ8A 2ONKE 3U8QA 3PV0E 1B7ZA 1NMUA 2H5YA 4ZZAA 1MQDA 1S50A 4R9GA 4GIZA 3IOTA 1B3FA 2D3IA 2XXRA 4DDDA 1LBBA 5L9MA 1CB6A 3CIJA 3H03A 4IGTA 1FQAA 1LLSA 5ICQA 4YU0A 2AL4A 5AA1A 5AA2B 4JDFA 1BKAA 1LB9A 1Q1KA 4Q0CA 4KYSA 4XKQA 1O7TA 1SW4A 1MS7A 4KYDA 2Z8DA 3VXCA 2I4BA 4KPTA 3RT8A 1DSNA 4RXLA 3D4GA 4KCCA 4JWXA 5JTYB 4ZS9A 3CSBA 4YB6A 2F35A 3JZJA 3MZ1A 4NF6B 4G4PA 3TTKA 4IO3A 4YKIA 3DELB 3W9VA 2RCBA 5EYFA 3A09A 4Q5TA 4IO2A 3S9EA 1ZU0A 1FTJA 3S4UA 1P1UA 1PDAA 2XD3A 2UVJA 2I49A 4XKNA 1NFTA 4GF8A 1IUDA 4IB2A 4MH5A 2QS4A 3FVKA 2P2AA 5ITPA 1JVYA 2QPQA 3B7DA 4GOTA 1D4NA 1N3WA 3IOWA 3N6UA 4UA8A 4X9TA 3RTWB 3BBRA 2YLNA 4MFIA 1OLAA 3HHGA 1AH5A 2THIA 4KQPA 2A5SA 2GFEA 5CBRA 2P0SA 4ZDMA 4F1YA 3S2VA 1ATGA 5HPQA 3KN7A 5DTBA 2F97A 3HO7A 5KCJA 5IAIA 2DE3A 3IO6A 3S9LC 1GGGA 4ZEIA 2QS2A 2B65A 5CRYA 3V83A 1XVYA 3OSQA 4U1OA 4DE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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