1FW0A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with kainate at 2.0 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fw0A01
1B3FA 1EZ9A 3MQ9A 4JXIA 1IIWA 4OENA 3KN7A 1B0HA 2I58A 3N5LA 3FJMA 1NNFA 1SQYA 4PQJA 3Q26A 5J1DA 1CE2A 3VFJA 4JWXA 1P1UA 2AL5A 3MVXA 5HM4B 3K4UA 1DPPA 2DE3A 4R2BA 3Q29A 1MH4A 4U1OA 3UIFA 4ZZEA 4GD5A 2VHAA 1FTKA 2D3IA 2P2AA 2ONRA 2YJPA 4ZE9A 3DELB 3V5AA 4MLQA 4I8CA 2R6GE 5AE4A 2I0BA 4HCWA 3TKDA 3WAFA 2XXHA 3S9NC 3K01A 3HO7A 4KI0E 4XKPA 1NFTA 2PYYA 4NF6B 4OEVA 2XXVA 2RCAA 1FW0A 3S9LC 4NF5A 1HSEA 3IOVA 3SEVA 2UYEA 3FXQA 4DXCA 2FYIA 1B52A 2UYFA 4R72A 4THIA 2RINA 1USYE 3CR9A 5H8NA 2HXWA 3ZS6A 1ANFA 2ZYMA 2OJTA 1N04A 3R7XA 3VXCA 4JSDA 4KQPA 2PMSA 4FIMA 3V83A 5B70A 2F34A 3OO7A 4JSOA 3B6TA 3FASA 4JDFA 4ELRA 1UTBA 5CMCA 3LSLA 3PU5A 2Q2AA 5FHOA 4NEDA 4F1VA 4ECFA 4OWDA 4IO3A 5H8HB 3VXBA 4G8MA 3VV5A 1Y20A 2XX8A 3PMVA 3O97A 2GH9A 1HSJA 3VLWA 1MQGA 2DWAA 4I62A 3MZBA 4OFOA 5I57A 3H3GA 4GXSB 3R6UA 3MUQA 2DWJA 2GHBA 2YPNA 3LSFB 4FJPA 4GL8A 2FNCA 5H8QB 5AA2B 4Q0CA 1II5A 2QS4A 4ZEDA 1FCKA 5DYHA 1LB8A 1IUDA 1ZLQA 3N26A 1MDQA 3C9HA 4NWCA 3K6XA 4K3FA 5L8DA 4QRZA 5DTBA 2R71A 2QMXA 2WKYA 3PUYE 5L9MA 1Z7NE 3LR1A 4R73A 2DS9A 1B7UA 2XXPA 3PPPA 1XS5A 3H7MA 2RC7A 1YCJA 3TTKA 3ODBA 3C34A 1IXGA 4EDPA 2CMOA 4U22A 4MH5A 2ZYKA 4PFTA 2F36A 3SEXA 2F97A 3K0VA 1PDAA 3CIJA 2RC9A 5I58B 2DXYA 1IEJA 1MG1A 4DE8A 2QRYA 1R6ZA 5I59A 4EF2A 4Q8RA 3D4GA 2F6PA 4FEDA 3I3VA 1MH3A 2F7BA 4GF8A 2I4BA 3S4UA 2ZNSA 1ZBMA 4IO4A 1MXVA 1LGBC 5IKBA 1AIVA 4P11A 4I1DA 4F1UA 2Z22A 3CFLA 4ZECA 3KSJA 3PV0E 2I49A 3IAZA 1H76A 4RPOA 3HHGA 1GR2A 2O69A 2F8DA 3K00A 4OFLA 4YB7A 1NKXA 1VE4A 1MY3A 1QVSA 1S9TA 1LLSA 1MM6A 2I6EA 3G7WA 5CM6A 2RC8A 1US5A 4YAHX 4EF1A 3EQ1A 4H6DA 3O29A 1SI0A 3U72A 4NMYA 4RK2A 1Y1ZA 4KYSA 4F2OA 3QUJA 2HEUA 3KN8A 5CMKA 3UA8A 4QFOA 1UIVA 1N84A 3CFXA 4Q5TA 3THIA 2UVJA 3SDFA 3MP6A 2XXRA 2VD2A 5B7DA 3E9XA 2I4CA 3K2DA 1BTJA 4L17A 3BFTA 1M5BA 1M5DA 1O64A 4U4SA 3T93B 4O3CA 4WXJA 4TQUQ 3FV1A 3N6UA 4R6HA 2BJJX 1YAEA 1ELJA 1AH5A 4HW8A 3TUSA 4KCDA 1B4HA 5DVIA 1LAXA 4LZ5A 1OVBA 3V8XB 1WVJA 1GV8A 1MY4A 3TTLA 2DVCA 3MAMA 3HPIA 2LAOA 1P1WA 1MXYA 5I2NA 3G3IA 2XXWA 4LA9A 3PD9A 3FVGA 1FQAA 3DLNA 4F29A 1NNPA 5H8QA 1TT1A 4EUOA 2RKMA 2F35A 1B46A 2QJEA 1LCTA 5HBCA 1JEVA 4YKKA 4HS7A 1B1HA 2PT1A 3DP4A 4NWDA 2DVZA 4MLVA 3IL1B 4FATA 2ANJA 1CB6A 3JV9A 2HQ0A 4ZEIA 4WEDA 3K02A 1KWHA 2VGQA 3OENA 4YICA 4XKNA 3RGYA 2H5YA 3GXAA 4EQ7A 3UGWA 3IJXB 3ECRA 4XIGQ 4OESA 1P1OA 1JW5A 2H9BA 1S50A 2D5WA 2VOZA 1AMFA 3E4RA 1N3WA 3PMWA 3C4MA 3U8QA 1OLCA 4H8IA 2G29A 1D3KA 1QW0A 4WKMA 3QYTA 2ONSA 4F2QA 3SETA 2O68A 4KYEA 3PUVE 5KCJB 4H0WA 4OERA 2DE2A 3OELA 1PB8A 1DPEA 3EHUA 4GVOA 1MQJA 2ZYNA 4OYVA 1B9JA 2Y7IA 4IO2A 1B3EA 2ZXTA 3ILUB 3U94A 4FEBA 1A8FA 3KJ7A 2GRVA 1P99A 2P1SA 1LFIA 5ICTA 3CI8A 3GZGA 1SDXA 3OO6A 3TDJA 3QAXA 1VFDA 5AA4B 4UA8A 4G8HA 4RPNA 3B6QA 2DWIA 2GHAA 2RF1A 1Y9UA 5I56A 4ESWA 3T96B 4F3SA 4LQ2A 1N7XA 2NOOA 1D4NA 3L6GA 4GRKA 4QFPA 3T9UA 1A8EA 2XXTA 5JK4A 3OD7A 3FXRA 2DSFA 3TQWA 1SI1A 2IA4A 3Q27A 4E0XA 3TTRA 2Q89A 3KGCA 2A5TA 3TYHA 4H1XA 1Y3QA 2PX1A 3CRBA 4UACA 3TODA 1OLAA 3MZ1A 3O2AA 5CI5A 2Z8EA 3K1PA 2NVUB 1R9QA 4LZ8A 4GOTA 3MWBA 3LSWA 3TPAA 1MY0A 1MM7A 1BIYA 1I6QA 4PFUA 3CVGA 3RTWB 3FD3A 4DXUA 4QFLA 1Y3PA 1H3DA 1LB9A 1M5EA 4BDQA 2Y7RA 1D9VA 1SW4A 1NNTA 4POWA 3E3KA 3T22A 3KG2A 4R2FA 1N76A 3OEMA 1LSTA 2PVUA 3SKPA 1YTVA 2Q8JA 4X48A 4YB6A 4YMAA 4MFIA 4QFNA 3IJOB 4XKQA 2GFEA 5KDTA 1B51A 3IO4A 5ITPA 1JVYA 3O66A 1OIBA 3UK4A 4KFQA 3PPQA 4JWOA 1DTGA 2VD3A 5AA1A 1MY2A 1EZOA 4U21A 3PMXA 2E1SA 1MS7A 2DYXA 2THIA 3D4CA 4TLMB 3KN3A 5CBRA 3PPRA 4YU0A 1XHYA 3DP8A 3TTNA 5ELVA 2I3VA 2HZKA 1M5FA 3KJTA 4G77A 1NH7A 1B3GA 1RKMA 1I6AA 3O6GA 2XXYA 1LBBA 4H65A 3RLFE 1F9BA 1WDNA 2DE4A 1MQHA 2HCAA 3SEYA 1O7TA 3TCHA 1XC1A 3CG1A 2E0SA 1MQDA 2HZLA 4RYAA 3QSLA 2V3TA 1ZJLA 1QKBA 1ATGA 1GTKA 1IXHA 3RNNA 1QUJA 2ALUA 4G68A 4JBZA 1ZU0A 1UTHA 1SYHA 1POY1 2OWSA 2XXIA 1FQFA 3LSXA 4R75A 1NNKA 3ZKKA 1B5IA 1Z7ME 4RXLA 5L9OA 2F7AA 4IO7A 4P0GA 1Y3NA 4NTLA 5TP9B 3A3UA 4LVQA 5AA4A 4H5GA 4AB6A 4C1TA 1EU8A 3SESA 1IXIA 2PBWA 4RNSA 3EHSA 3JYRA 3MBPA 3EPEA 3O6IA 4OQOA 2Q88A 4H5FA 1P1QA 4HCYA 2O6AA 3IB0A 1ZKBA 4GIZA 1Q1KA 1B3HA 2YLNA 3SEWA 2HFBA 2F6GA 1MPBA 1B32A 3M8UA 2Y7WA 3T9XB 3M3LA 2A5SA 4OXVA 1LFGA 5I2KB 2PT2A 2ZNTA 5ISUA 3SEUA 3FGSA 3C31A 1VSOA 3DP6A 1VFEA 4F22A 1URGA 3HHFA 2V25A 1DTZA 3H06B 1FTJA 3HCQA 4YZZA 4NF6A 3RPWA 1ZTYA 3IOWA 2OLBA 1IXCA 1PB9A 1MQIA 1JETA 3OEKA 4RY1A 2M8CA 4RK9A 3N94A 1HSLA 1UQWA 1SW5A 3A3CA 4N6PA 4PFWA 1B0LA 1FQBA 1PC3A 3EF7A 3H6UA 2HAUA 3GLBA 4GLIA 4ESXA 1OQGA 1M5CA 3RUMA 2OCUA 1GGGA 2HAVA 1D9YA 4IGRA 1BP5A 3C33A 3K6UA 1B5HA 3IB2A 5H8HA 5KZTA 4KYDA 3RN8A 2I48A 2IEEA 5TPAB 4U2RA 2W7YA 3K1MA 1MPCA 4G2ZA 5DEXB 2REJA 4DXBA 2QSXA 5AA2A 1MXWA 3N6TA 3TFLA 2AL4A 3OOAA 3KBRA 4X1DA 2ZNUA 3H6VA 3S9EA 1N7WA 4M1VA 4R74A 2O1LA 2NXOA 2O84X 1SBPA 3OSRA 5LOMA 3FATA 3IR1A 3VLVA 4Z0IA 1MPDA 1ZMGA 4F19A 1S7YA 4BDNA 1NH8A 5FHMA 3H6WA 4LP2B 3PD8A 2XXUA 4ZZAA 2XXQA 2UXAA 3FIRA 3UORA 3OMBA 5I58A 3MVWA 4U1ZA 3IOUA 1UTBB 4O3BA 3FVOA 1Y1MA 2OZZA 4ND9A 1J1NA 4GQOA 4E0WA 2ESNA 2Y84A 1QULA 2G93A 4YMBA 5TP9A 3ZSFA 4FORA 3FVKA 2P0SA 4PFYA 5ICQA 3G3KA 4X1BA 3G3JA 4F3BA 3PPOA 5ITOA 3O9PA 5HPQA 2CZLA 1YPNA 2XD3A 1R1NA 4F1YA 2ONKE 4YKPA 3L6HA 3GBBA 4DIGA 3GBAA 3I6VA 1SW2A 2O1MA 1B7HA 1H43A 3IK6B 4G8NA 3MP8A 4OVJA 1MXXA 5CMMA 1DSNA 1OVTA 3RQTA 3FJGA 5I2KA 4DDDA 3MP1A 2H25A 5EHMA 2V3UA 3TELA 1B4ZA 2R9JA 5DVJA 2ABHA 2V93A 5L9SA 3S9MC 1XVXA 1LFHA 1H45A 4TOZA 3TCFA 5AA2D 2FA7A 4MBPA 3PUZE 4MF3A 3CSBA 5I59B 3I5OA 3QIMA 2F7CA 4X9TA 1BLFA 4NF4B 4P0IA 4R9GA 4ONYA 1PB7A 2KLFA 4F3GA 1N3XA 1FQEA 1SVXB 3W9WA 4BDLA 1IZ1A 5JTYB 3UP9A 3RTFB 1PEBA 2Q9TA 3VLUA 4M4GA 4OFJA 5EHSA 1PBQA 2Z8FA 5FTHA 3HSTA 3KZGA 5K2XA 5I84A 1OMPA 4KHZE 1I6BA 3CG3A 1MRPA 5CBSA 3TEPA 3MPLA 4DCYA 1O63A 1UIUA 5TPAA 3C32A 3PGFA 4KR5A 3B6WA 1MXZA 4IB2A 4ELQA 4G4PA 3AXFA 2UVGA 2Q2CA 1IITA 3Q25A 5JEIA 5DEXA 1URSA 1R9LA 3MVZA 3RT8A 4DZ1A 2XX9A 4YKIA 1N0TA 4PP0A 1LCFA 1MXUA 4FAJA 3O6HA 3R26A 3T66A 4IY6A 4QSEA 4BDOA 1LBCA 3H4ZA 3BKIB 4PETA 5FHNA 1USYH 4LQ5A 4C0RA 3P7IA 3MVYA 3U93A 3CFZA 3HV1A 1SD3A 3OSQA 2X7QA 4F3PA 4GWOA 2NWJA 5H8FB 4IY5A 4ZEKA 3SERA 3RT6B 5DVFA 2H98A 4FECA 4Q30B 4GXAA 1EH3A 3K6WA 3QXMA 3UN6A 1FQCA 3KOSA 1JEUA 5I2NB 1H44A 4EXKA 2AIXA 3KFMA 2V3QA 3FZVA 3MW0A 4YKJA 4F18A 3ONMA 1US4A 3OXNA 4GL0A 3TZAA 5KCJA 4TLLB 4JWYA 4ELPA 3KSXA 1LAHE 3G3HA 1TFDA 3TQLA 3V89B 1TFAA 5IAIA 3IB1A 1MY1A 4DLDA 4AQ4A 2Y7KA 3ZKLA 1JNFA 3W15C 1A7LA 4XXUA 3Q28A 2REGA 4POXA 3VVEA 4YB5A 1B40A 5A5XB 2RCBA 3KEIA 3T9VA 3TAJA 5CRYA 3OO8A 4KD5A 1A99A 4FE8A 3MPKA 1B7ZA 2ZMBA 2DQVA 1B3LA 4NF4A 3USDA 2B3BA 1DOTA 1TXFA 4NE4A 2Y7PA 3EHTA 4OMBA 4U4XA 1SYIA 5JTYA 2ZYOA 3FJ7A 3W9VA 1B6HA 1WODA 4KPTA 3U1OA 2V84A 3PPNA 3QUFA 4GFRA 2B3FA 2I0CA 1Y4TA 2X26A 3MZ9A 4R6YA 5BUUA 3F11A 4QFKA 1VR5A 5FTIA 4BDRA 4ISUA 2F78A 3BFUA 4KCCA 1B05A 1JW4A 3FXUA 4EQ9A 4Z7EA 2O7UA 2XX7A 1T0KA 3K6VA 4R6KA 1QKAA 2DWHA 3TCGA 4NF8B 1URDA 5F7VA 4LATA 4BDMA 2D21A 3LBSA 4N13A 3T9HB 3H6TA 4LUBA 4PE5B 4ELOA 4QF9A 2O51A 3LUYA 1LAFE 1NL5A 3VVFA 2XD2A 1PBPA 3VE1B 5DT6A 3WAEA 5BWJA 5EYFA 1FTMA 5I56B 4C1UA 3VDFA 1QUKA 3G3FA 2I3WA 5F1QA 4IO6A 2O7IA 2DP8A 5K2YA 4OEUA 3CSGA 1POTA 1RYXA 4ZEBA 3FUZA 1ZIUA 3QK6A 2X7PA 3FV2A 4I9DA 3ILTB 4AB5A 3IORA 1B2HA 4N07A 2B65A 5H8FA 2DXRA 1SW1A 3BBRA 4XKRA 3MC2A 5H8SA 2A5TB 1FTOA 3PUWE 1MDP1 3EN3A 4U23A 4IO5A 1JVXA 4OZ9A 1AOVA 1LAGE 2OWTA 3TMGA 3IOTA 4ZEFA 1NMUA 2VP1A 1P1NA 4IGTA 5CC2A 4XTCQ 2XHDA 1XOCA 4NF5B 1I69A 5TU0A 2OBGA 2QL3A 4JB7A 3B7DA 2XXXA 3G3GA 4O3AA 4DCXA 5H8NB 2NUVA 4F39A 2QS3A 1A55A 4EQBA 5CMBA 1DMBA 2DOJA 3HN0A 1OQHA 4QSDA 4OHNA 2QS2A 3MJNA 3A09A 3IO6A 3TTMA 1AL3A 1EZPA 3DM0A 4G68C 5AA3A 4WEPA 3M3FA 4LZ7A 5KDTB 2OK2A 4F31B 3H03A 1Y4CA 1RYOA 3FVNA 2F5XA 5A5XA 4HTGA 3C35A 1JW1A 5I57B 4ZE8A 4H8JA 1A54A 4RJZA 2UVIA 3OO9A 3S2VA 1A40A 3M3KA 2AYSA 2UVHA 2Z23A 1TWYA 3PUXE 2Z8DA 3IX1A 1FTLA 4OTEA 2QS1A 3U92A 3RY3A 5M2VA 1GVCA 1FQDA 3LC8A 3VVDA 1B58A 4RA1A 1B1XA 3C36A 4QSCA 1JQFA 4BLAA 1IQ7A 3JZJA 4EXLA 1L5TA 4ZS9A 3KOTA 2QMWA 1BKAA 2H99A 4H67A 1Q35A 3K1NA 4R9FA 1XT8A 2H4IA 1XVYA 3O28A 4QHQA 4G68B 3E13X 4LONB 2QPQA 4ZDMA 1UTHB 1QUIA 1QJMA 4OETA 4NF8A 1B5JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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