1H44A

R210l n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFILESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 99
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A02
2O1MA 5AA4A 3JYRA 3G3FA 3MVXA 1B4HA 2Q2AA 4MLQA 1ANFA 5J1DA 4LZ5A 2HZKA 1QKAA 2ZYOA 4ONYA 2I4BA 5F1QA 4KYSA 1JW5A 2NWJA 3C36A 2HFBA 2M8CA 5I58A 2RC8A 1QKBA 1MQJA 3CFLA 3IORA 2XXUA 4JBZA 3IAZA 2F5XA 5CMBA 2I48A 1P1QA 2I4CA 1MY0A 4NEDA 4NMYA 5A5XB 1TFAA 4L17A 2DWHA 2AL5A 2DYXA 1N3XA 1JQFA 5ITPA 3RN8A 2Y7WA 3U72A 4F2QA 2Y7KA 3K0VA 5AE4A 1B0LA 1SI0A 2OWSA 1B3GA 1AOVA 4GD5A 1IEJA 2P1SA 4QSCA 5B7DA 1JVXA 5IAIA 2H98A 3P7IA 1OMPA 5H8HA 3KGCA 4Q0CA 3H06B 3QSLA 3TCFA 5L8DA 1UIUA 2PVUA 3MP8A 3FATA 3FUZA 2Q9TA 3PV0E 5DVJA 3RT8A 3TCHA 3T22A 3KOTA 4PQJA 4FE8A 4Q5TA 3O97A 5FHOA 4ZEFA 1IZ1A 3O6GA 4THIA 3CSGA 1N0TA 3VLWA 1B3HA 4DCXA 3TELA 2ONSA 4G8HA 2R71A 1JEVA 1OQGA 3PMVA 1UTHB 2XX9A 4ZEIA 3RPWA 3KEIA 2P2AA 4RXLA 2H9BA 4YKJA 3DP6A 1IQ7A 3EHUA 3I5OA 2GRVA 3UIFA 1Z7NE 1B05A 3GZGA 2QS1A 5ICTA 3Q25A 4R73A 4NF4A 2UYFA 1N84A 2HAVA 1SW1A 2Y7IA 1LGBC 4ZZAA 3R26A 1GVCA 4LONB 2XXXA 4XKPA 2ZXTA 1I69A 1VFEA 3PGFA 4R9GA 4XKRA 3IX1A 1A40A 3G3GA 5AA4B 2Z23A 5I84A 4XKNA 3CG1A 4GLIA 4LVQA 3VFJA 1B2HA 1BKAA 1B3FA 3IOVA 5FTIA 4F19A 1LBBA 4KCCA 2UVJA 2CMOA 3OD7A 1GV8A 4OTEA 2QSXA 5I58B 4BLAA 2LAOA 2GFEA 4GVOA 3CG3A 2V84A 3HN0A 1YAEA 2QL3A 3IR1A 2O7IA 3W9VA 3LC8A 1UQWA 1R9QA 1ZIUA 4R2FA 3OO6A 5F7VA 3TTLA 1R6ZA 4OEVA 4F18A 3T9UA 4FORA 3TTMA 2PT1A 4BDRA 2W7YA 5I57A 2RF1A 4C1UA 4DXUA 3KN3A 2FA7A 3V83A 4RPNA 2DOJA 4HW8A 3HV1A 3O9PA 3MP1A 3DLNA 4F29A 4FJPA 3FZVA 1SI1A 1UTBA 1AIVA 5BWJA 2HEUA 3O2AA 4ELQA 3KN8A 1USYE 1YCJA 1LB8A 3LUYA 3V8XB 1SQYA 2H99A 5H8HB 4BDLA 4Z7EA 3PUZE 3QYTA 1LSTA 2WKYA 4F1YA 2QMXA 3SEYA 1LAXA 3A09A 1EU8A 1QUJA 1LAHE 1OLCA 1B9JA 4H8JA 3LSXA 1MXXA 3UN6A 4BDQA 3EN3A 3FIRA 3I3VA 1F9BA 1US5A 4ZECA 1Y4CA 4H5FA 4LZ7A 2Y84A 4U4XA 5H8SA 1POY1 2XXHA 1HSJA 4U21A 4EUOA 4OQOA 2X7QA 3T9HB 2F6PA 4X1BA 1NNKA 1QUKA 1ZJLA 4JSDA 4NF4B 3OMBA 3S2VA 1B5IA 4ZEBA 2XXYA 4G68A 3VVDA 2NOOA 3IB0A 3H03A 4FATA 1SW5A 1XC1A 2ANJA 3EHSA 4H0WA 3C34A 1PBPA 4X9TA 3RGYA 3KOSA 1FW0A 1Y3PA 3EQ1A 4QRZA 4UACA 1URGA 5CC2A 3N94A 4NF5A 1IXIA 1XVXA 2YPNA 3TZAA 3FJ7A 4U1OA 5KDTA 1PDAA 3RNNA 2I49A 4RY1A 1MQDA 4N07A 2Q2CA 3G3IA 3OSRA 4IO5A 4QSDA 1H44A 1O7TA 1YTVA 2XXQA 5I2KA 4Q8RA 2I58A 4OFLA 4ZDMA 3VVFA 3WAEA 4GL0A 2DE3A 1Q1KA 4ZS9A 3MC2A 5I57B 1QUIA 1H76A 4R74A 2QPQA 2VHAA 2DWAA 1FQFA 4AB6A 1A55A 4OXVA 1L5TA 2F35A 3TPAA 4TLLB 1URDA 3E13X 1VSOA 2Z8EA 1UTBB 4DIGA 4DE8A 3TYHA 4YB6A 4XXUA 4IY6A 1TWYA 1D4NA 3OELA 4LZ8A 1RYOA 2F34A 3JZJA 4GFRA 2ZNTA 5JTYA 1KWHA 4YMAA 1BP5A 4KPTA 2F78A 3D4GA 3PMXA 3R6UA 1PBQA 4OMBA 1S9TA 1MM7A 2DWJA 3HHGA 2VOZA 4ZZEA 2HZLA 3K4UA 1NNTA 3FVNA 3MJNA 4HTGA 3PPQA 3W15C 3OOAA 4NF8A 3S4UA 1QJMA 3PD9A 3IJOB 2RCAA 5TU0A 4POXA 3ECRA 4M4GA 1N7XA 4C0RA 1IIWA 3OEMA 4JDFA 4H65A 1MH3A 2DQVA 3RY3A 5FHNA 1NH7A 3G3HA 4OHNA 1JW4A 5DVIA 4QFLA 4G68B 3VXBA 3SEWA 5JK4A 4GF8A 3L6GA 1B7UA 2G29A 2F7BA 3VV5A 4KFQA 4YKPA 3TEPA 2XD3A 5ITOA 3ZS6A 4H1XA 3TFLA 1IITA 5EHMA 4ZEKA 1MG1A 1A99A 3BFUA 2NVUB 4IO2A 2P0SA 3T93B 1D3KA 2PBWA 4NF5B 2ZNSA 4YB7A 1A8EA 2ESNA 5KDTB 4ESXA 4I9DA 1MXZA 4MBPA 2X26A 1GR2A 4P0IA 3N26A 3TQWA 3K6XA 5HM4B 1QULA 4MF3A 1B5JA 3T66A 1N7WA 5I2KB 2ZMBA 1PC3A 3K2DA 3S9MC 1MDP1 2V3QA 3DELB 5EYFA 2UVGA 1B58A 3TTKA 2XXWA 1XS5A 3MPLA 3SETA 1IXHA 1IUDA 2QMWA 3E9XA 2F7CA 4NWDA 3CIJA 1DTZA 2O51A 4I1DA 1FQEA 3G7WA 3RUMA 3B6QA 1N3WA 3RT6B 3TUSA 4LA9A 2AYSA 4NWCA 4HS7A 2DVCA 5L9MA 1OVTA 5JTYB 4EQBA 2O7UA 3LSLA 4JWXA 4OESA 3IL1B 2O69A 4IGRA 1M5DA 3TODA 1VR5A 3O6IA 3PU5A 2B65A 5EHSA 2QS2A 1LCTA 3PPPA 4FAJA 2NUVA 4JSOA 3HSTA 1SDXA 1VFDA 4IO7A 3CVGA 4GOTA 4RA1A 1FQCA 2I0CA 3LSWA 3MZ9A 4OZ9A 1MH4A 2Q89A 4PFUA 2B3BA 4NF8B 3VLUA 4IO6A 3U1OA 4AB5A 5KZTA 4P0GA 1GTKA 2PX1A 3PPNA 4QFNA 1MPDA 4PP0A 5AA3A 3SESA 4G68C 5LOMA 3FVOA 4F1UA 2IEEA 2QRYA 1IXGA 4C1TA 5AA2D 4IB2A 5L9OA 2ZYMA 1XVYA 5CM6A 1BLFA 1LLSA 4H5GA 5KCJA 3Q28A 3U92A 1N76A 1OLAA 3C31A 3H6WA 4YU0A 1JW1A 2I3VA 4F2OA 3KZGA 3TTRA 1LCFA 2H4IA 1MY1A 3IOWA 1XT8A 1B52A 5M2VA 1JETA 5TPAA 1EH3A 3AXFA 2D3IA 4BDOA 2HAUA 3ZKLA 3SKPA 3TQLA 2GH9A 1MXUA 3B6TA 2A5TA 2OBGA 3O28A 4F1VA 4EF1A 2GHBA 3FGSA 1TFDA 2DE2A 4QFOA 4KYDA 3E3KA 3MQ9A 3G3JA 3QUJA 3FVKA 1ZBMA 3TCGA 3GBAA 2BJJX 3CI8A 2FNCA 5BUUA 4FEBA 1PB9A 1Y3NA 1ZU0A 4LQ2A 4XIGQ 2DP8A 3MW0A 2Z8DA 3G3KA 3S9EA 1WVJA 1A8FA 1US4A 2PMSA 1B51A 3M3KA 1Y20A 1QVSA 3TDJA 4QFPA 1MY4A 1I6QA 2V3UA 1I6BA 2F8DA 3ODBA 4GRKA 5DYHA 3CRBA 4EXLA 3K1MA 5I56A 3FV2A 2QS3A 2RCBA 1PB8A 1NKXA 4OFOA 3TAJA 2H5YA 2AL4A 4GL8A 3PUWE 3GLBA 4H6DA 5HPQA 4QFKA 3N5LA 3GBBA 2UVHA 4YKIA 4DXCA 3KN7A 4OFJA 3FXQA 2I6EA 2RINA 4X1DA 1PB7A 2REJA 3RTFB 1ZKBA 1YPNA 2XXPA 1A7LA 2DXRA 2R9JA 1MPCA 3S9LC 4KYEA 1M5EA 1B3LA 4FECA 4U23A 5DVFA 3MBPA 2E1SA 2F97A 4NE4A 3VE1B 2G93A 3HHFA 1ATGA 3GXAA 4RPOA 1VE4A 2ABHA 3K6WA 1LFIA 4DDDA 3MPKA 3N6TA 4MLVA 1B40A 4U2RA 3HO7A 5KCJB 4DXBA 1H45A 5DTBA 3IJXB 2F36A 2DSFA 3M3FA 3FD3A 5ISUA 2OCUA 2Z8FA 4ELRA 1NNFA 1Y3QA 1ZLQA 4U4SA 4EF2A 1TT1A 4RNSA 4R2BA 4LUBA 4G2ZA 3ILUB 3LSFB 1R1NA 2R6GE 3PUVE 5TPAB 1MQHA 4IGTA 1GGGA 3CR9A 4I8CA 4NTLA 2A5TB 3CFXA 3H4ZA 1D9YA 1ZTYA 3ILTB 4ZE9A 2QS4A 1FTMA 4BDMA 4PETA 1EZOA 1MXVA 4ND9A 1NFTA 2I3WA 4YMBA 3W9WA 4P11A 3PUXE 2YJPA 4O3AA 2A5SA 3DP4A 4MFIA 1BTJA 3H6TA 3QXMA 1MQIA 4HCYA 4AQ4A 4RK2A 2ZNUA 1XOCA 4WKMA 3SEVA 4POWA 4R75A 1MXWA 4JWOA 3RTWB 4F3GA 5H8NA 4EQ9A 3TTNA 5K2YA 3IO4A 1FTKA 3JV9A 2RC9A 2UXAA 4YICA 4U22A 3M8UA 1ZMGA 4EXKA 1H3DA 2O1LA 5CMCA 2HXWA 1P1NA 5I56B 3VXCA 1T0KA 2RKMA 4R72A 3K6UA 2DWIA 1WODA 3OO7A 3UA8A 5B70A 3SEXA 2D5WA 2ALUA 3PPRA 4F39A 3Q29A 3SDFA 4BDNA 4Z0IA 1NL5A 2D21A 2QJEA 2O6AA 4WEDA 4KQPA 4R6HA 4H8IA 4OERA 3A3CA 4YKKA 4YAHX 3K1NA 2E0SA 2RC7A 1S50A 4FIMA 3EHTA 3B7DA 3OEKA 5I2NA 3BKIB 5H8QB 2HQ0A 1JVYA 4R6KA 5AA2A 2PYYA 1DOTA 4JWYA 3MVYA 1O63A 4O3CA 2Y7PA 4KHZE 4F3SA 4RJZA 4TQUQ 4U1ZA 4KI0E 4IO4A 4YZZA 4NF6A 1II5A 2I0BA 5I59A 1B3EA 2VP1A 1EZPA 1MDQA 1PEBA 3UP9A 4MH5A 4PFWA 2UVIA 3I6VA 3UGWA 4ISUA 1MXYA 3FJMA 3CFZA 1WDNA 1DSNA 2O68A 2V93A 1NNPA 3FJGA 4GQOA 3T9VA 4KD5A 2ZYKA 2V3TA 5TP9A 2XX8A 4EDPA 2OWTA 3VDFA 1TXFA 3OSQA 3MZ1A 5CBRA 2XXVA 3Q27A 4O3BA 1SW4A 4OYVA 1ELJA 1HSLA 1FQDA 1B1XA 1B6HA 1B46A 4DZ1A 5L9SA 4ECFA 1Q35A 2Z22A 3U8QA 3OO8A 1Y9UA 3E4RA 5ELVA 5DEXA 3QK6A 1SD3A 3KSJA 3B6WA 5H8NB 1AH5A 1MQGA 3HPIA 4F22A 4F31B 1Y1ZA 1IXCA 1FTJA 1FCKA 2ONKE 4R6YA 4OWDA 2V25A 1CB6A 3N6UA 3U93A 1FTLA 2XXTA 4LQ5A 4TLMB 3LR1A 3T96B 3IOUA 1OIBA 1Y1MA 1MY3A 1M5FA 3H6VA 4LP2B 3C4MA 3C32A 5H8FA 2CZLA 2OK2A 1XHYA 3C35A 2VGQA 3FXUA 2VD3A 3USDA 1M5CA 3TMGA 4F3BA 5DT6A 5CMKA 4G8NA 5CI5A 1MY2A 2OJTA 3KJTA 4KR5A 3H3GA 3K00A 5I2NB 5CMMA 3QIMA 1NMUA 5AA2B 1DMBA 4OENA 1LFHA 5ICQA 3HCQA 3SEUA 4PFTA 5K2XA 1B1HA 4GWOA 1UIVA 1DTGA 4ELPA 3MVZA 3ZKKA 1P1WA 2HCAA 4NF6B 4DLDA 1EZ9A 1MS7A 5I59B 1R9LA 4OEUA 1B32A 2Q8JA 1LB9A 1QW0A 3FXRA 5IKBA 2Q88A 3F11A 1DPPA 2F7AA 3FASA 1SVXB 1SW2A 3IOTA 2ZYNA 3BBRA 3L6HA 4H67A 1RYXA 3KFMA 4HCWA 1P99A 1MPBA 3U94A 4M1VA 3IO6A 5TP9B 3UK4A 3H6UA 4ZE8A 1RKMA 3ONMA 3FVGA 1MRPA 4TOZA 4F3PA 1MM6A 1P1UA 3OXNA 4IY5A 3CSBA 1B0HA 1NH8A 1FTOA 3K01A 4YB5A 3R7XA 3PD8A 5CRYA 2REGA 4X48A 3VLVA 3KG2A 2UYEA 1OVBA 5DEXB 3MWBA 3V89B 3BFTA 4N13A 1CE2A 4EQ7A 1LAFE 3C33A 2FYIA 3K02A 3A3UA 3PUYE 1URSA 4QF9A 2NXOA 1LBCA 3Q26A 1USYH 3H7MA 1AMFA 5FHMA 2ONRA 3MP6A 4WEPA 4G8MA 3IK6B 3M3LA 1OQHA 4Q30B 3S9NC 4K3FA 3K6VA 4OETA 1POTA 5H8QA 5CBSA 3KJ7A 1H43A 3EF7A 4PFYA 3WAFA 2KLFA 3KBRA 4OVJA 3THIA 2XD2A 1FQBA 2XXIA 3O66A 1O64A 4G4PA 2PT2A 4G77A 1A54A 1FQAA 5H8FB 3EPEA 3MUQA 1N04A 3PPOA 3OO9A 5HBCA 5A5XA 1JNFA 3FV1A 4JB7A 2DVZA 2YLNA 4DCYA 4ELOA 3ZSFA 2VD2A 3MVWA 2XX7A 2XHDA 1HSEA 1J1NA 3C9HA 1B5HA 1Y4TA 1D9VA 4IO3A 3MAMA 2DE4A 2OZZA 1BIYA 3PMWA 1AL3A 4E0XA 1P1OA 4PE5B 3V5AA 3LBSA 2F6GA 4QHQA 2Y7RA 4I62A 4ESWA 4WXJA 2X7PA 5AA1A 2H25A 4GXAA 3QAXA 1SBPA 2THIA 3VVEA 2XXRA 3QUFA 1B7HA 5JEIA 4R9FA 4UA8A 3D4CA 4LATA 1LAGE 3RQTA 4XKQA 3DM0A 4E0WA 3IB1A 3MZBA 4GXSB 3DP8A 1LFGA 4FEDA 4GIZA 4RK9A 3K1PA 3TKDA 1UTHA 2B3FA 3KSXA 2IA4A 2O84X 1B4ZA 3UORA 1DPEA 2OLBA 3SERA 3O6HA 1M5BA 4RYAA 2AIXA 4QSEA 4XTCQ 2DS9A 1B7ZA 4N6PA 4KCDA 3RLFE 1SYHA 3OENA 1Z7ME 1I6AA 3IB2A 4ZEDA 5FTHA 4JXIA 3T9XB 2DXYA 1S7YA 1JEUA 2GHAA 1SYIA 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O1MA 5AA4A 3JYRA 3G3FA 3MVXA 1B4HA 4H45A 2Q2AA 4MLQA 1ANFA 3HFUA 5J1DA 4LZ5A 2HZKA 5IGAA 1QKAA 2ZYOA 4ONYA 2I4BA 2HHMA 1DK4A 5F1QA 4KYSA 4G61A 1JW5A 2NWJA 3C36A 2HFBA 2M8CA 1EYJA 5I58A 4NN3A 2RC8A 1QKBA 1MQJA 5T3JA 3CFLA 3IORA 1FBEA 2XXUA 4JBZA 2Y5KA 3IAZA 4PE3A 2F5XA 5CMBA 2I48A 1P1QA 2I4CA 1MY0A 4PFRA 2VT5A 4NEDA 4NMYA 5A5XB 1IMAA 1IMCA 1TFAA 4L17A 2DWHA 2AL5A 2DYXA 1N3XA 1JQFA 3KC0A 5ITPA 3RN8A 2Y7WA 3U72A 4F2QA 4GWYA 2Y7KA 4MHFA 3K0VA 3QMFA 5AE4A 1B0LA 1SI0A 2OWSA 1B3GA 1AOVA 4GD5A 1IEJA 2P1SA 4QSCA 5B7DA 1JVXA 5EYHA 5IAIA 1LBYA 2H98A 3P7IA 1OMPA 4GX6A 5H8HA 3KGCA 4Q0CA 3H06B 3QSLA 3TCFA 5L8DA 1UIUA 2PVUA 3MP8A 3FATA 3FUZA 2Q9TA 3PV0E 5DVJA 3RT8A 3TCHA 3T22A 3KOTA 4OVRA 4PQJA 4FE8A 3A29A 2WEFA 4Q5TA 3CHGA 3O97A 5FHOA 4ZEFA 1IZ1A 3O6GA 4THIA 3CSGA 1NV7A 1N0TA 3VLWA 4P3LA 1B3HA 4DCXA 3TELA 2ONSA 4G8HA 2R71A 1JEVA 1OQGA 3PMVA 1FPJA 1UTHB 1FTAA 2ZZVA 2XX9A 4ZEIA 3RPWA 3KEIA 4PTKA 2P2AA 4RXLA 2H9BA 4YKJA 2BJIA 3DP6A 1IQ7A 3EHUA 3I5OA 1NV3A 2GRVA 3UIFA 1Z7NE 1B05A 3GZGA 2QS1A 4N81A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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