1HSEA

H253m n terminal lobe of human lactoferrin
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSMAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutagenesis of the histidine ligand in human lactoferrin: iron binding properties and crystal structure of the histidine-253-->methionine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 93
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA02
1IZ1A 4NMYA 1MM6A 4ZEDA 3TCFA 3V5AA 5DTBA 4EQ9A 3JZJA 1MY0A 1BKAA 1IXIA 2F5XA 3ODBA 2H99A 2Q88A 1QUIA 3R6UA 5KDTA 3ZS6A 3H6TA 3CVGA 4RYAA 4ELOA 3OO6A 3TTMA 2I58A 3T9UA 1JVXA 4KYEA 2P1SA 2FYIA 1NKXA 2ALUA 1P1NA 4DZ1A 5TPAA 4WEDA 1IXGA 3V8XB 5CRYA 3VVEA 2OWSA 5I2NA 2DOJA 4KCCA 4HW8A 2DWAA 4X9TA 4QFPA 4ZEKA 4R2FA 3N6UA 2V3UA 1B0HA 2HZKA 4YKPA 4OEVA 3E13X 4GXAA 1LAXA 2XX8A 1UTHA 4NF6A 3EQ1A 2P0SA 2D3IA 3SEWA 2XXPA 2DSFA 4YB7A 3GZGA 1LSTA 3FASA 1I6AA 5CMBA 5AA2D 4DCYA 2ESNA 4JBZA 1M5CA 3MQ9A 2XXIA 3MPKA 5H8HB 1VFEA 2RCBA 3PMXA 4O3BA 5DVIA 4Z0IA 1FTJA 4OENA 3DM0A 5DEXB 2VHAA 4GRKA 1IXCA 4H0WA 3M8UA 4KR5A 1B3FA 4F1YA 4F2OA 3N6TA 1OLAA 4YZZA 4EXKA 3FJGA 3OXNA 3DP6A 3B7DA 4ZEFA 3PPRA 3S4UA 3T9HB 4G8HA 4EQBA 3KOTA 4DDDA 4EF2A 3ILTB 4BDLA 1MQJA 1BIYA 4OVJA 3ONMA 4EUOA 4U23A 5K2YA 1WDNA 2ZXTA 3RY3A 2RC7A 3O6IA 1LB8A 5ICQA 5HBCA 3VLVA 3HCQA 4YB6A 3PMWA 4MF3A 5HPQA 2XXTA 1NMUA 3FXUA 2AIXA 2XXRA 1MH4A 2P2AA 4X1BA 3MZ1A 4RNSA 5ITOA 3TPAA 1FCKA 1Y9UA 3MVWA 4IY5A 5CBRA 2UVJA 4IO2A 2F7CA 2XXWA 4JXIA 1EZPA 1LFIA 2Q9TA 1B6HA 2Z8EA 3RQTA 1A55A 1OQGA 2O7UA 4TLLB 3VFJA 3CFZA 3G3JA 2PX1A 3UN6A 4JWYA 3L6GA 4DLDA 4R75A 3U1OA 1FQDA 1RYXA 1DPPA 4HTGA 1B5HA 3QXMA 1OIBA 2R71A 4C1TA 1B51A 1ANFA 4IB2A 2F7AA 1B5IA 3OMBA 4QSCA 1UQWA 3FJ7A 3VDFA 5H8HA 2XXXA 5CMCA 3U72A 1SBPA 4DXBA 3MP1A 4KD5A 3KZGA 1WODA 4JDFA 4G4PA 5DEXA 3JYRA 5EHSA 3SESA 3Q27A 4GD5A 4H8IA 1XVYA 1PEBA 3RT6B 3IOVA 2VP1A 4IGRA 2A5TB 2THIA 1P1WA 3SERA 2XHDA 5JTYB 1MDQA 3Q28A 2Z8DA 2ABHA 1JW5A 2IA4A 1GVCA 4MBPA 3OO9A 4LQ5A 1URSA 2RKMA 1T0KA 4XIGQ 2HAVA 3MVYA 1ATGA 3PV0E 3IB0A 3EPEA 1FW0A 4I62A 4F1VA 1B3HA 1SI0A 3H6WA 1N0TA 4RA1A 3TMGA 4GVOA 1URGA 4PFTA 3VE1B 4XKNA 2AL5A 3H3GA 3TTRA 1ZLQA 4R9GA 3HPIA 2D21A 1DTGA 3RN8A 4F22A 4UA8A 3TTNA 4ECFA 4OERA 1MPCA 1B5JA 2W7YA 4MFIA 3PUWE 5TU0A 1L5TA 4GWOA 3MWBA 4WKMA 3RUMA 4U1ZA 3QUFA 2ZYMA 4R6YA 3EHTA 4C0RA 5F1QA 4XKRA 1IITA 2O7IA 3M3KA 4YB5A 2ZYNA 4ZE8A 1B1HA 1PDAA 4PFYA 1UIUA 4H5FA 4N07A 4H67A 2G93A 4F29A 3KSXA 4OHNA 4P0IA 1N7XA 1SI1A 5I56A 1M5EA 5M2VA 4ISUA 1MRPA 4K3FA 4G8NA 2X7PA 5H8FB 3GBAA 3TTLA 5I57A 3UIFA 3UP9A 4KQPA 2Z22A 4P11A 1XVXA 4ESWA 5JTYA 1SVXB 2Q2AA 4FAJA 2H98A 3H6UA 1GV8A 5L8DA 4I9DA 1MQGA 4GL0A 1R9QA 1B1XA 2E0SA 1LB9A 3KEIA 1LBCA 2CMOA 4ND9A 3A09A 4MH5A 4H6DA 1EZ9A 5K2XA 3LBSA 4OYVA 4ZS9A 4G68A 3CI8A 1XOCA 2DVCA 1ZIUA 2UVHA 1ZU0A 3A3UA 3T9XB 4LVQA 3MJNA 3DP4A 4F19A 5DVFA 3H03A 2CZLA 3G3HA 3G3GA 4F3SA 3VV5A 2IEEA 1MH3A 2XX7A 1P1UA 3C32A 1DTZA 4F2QA 4XKPA 2B65A 1LCFA 4OZ9A 1MY1A 1USYH 3IJOB 3OSQA 5CC2A 2GHAA 4DIGA 1POY1 1VR5A 4ELPA 3PUZE 1YCJA 2RINA 5F7VA 3DELB 5B70A 4F39A 2HZLA 3QSLA 2RC9A 3FUZA 2F6GA 2XD2A 1D4NA 2R6GE 4BLAA 3U8QA 4OFLA 3IOTA 3KSJA 3HHGA 1NNFA 3IORA 3QIMA 1M5BA 3M3LA 5FTIA 1NL5A 4ELRA 1HSLA 3IO4A 1MPBA 1QJMA 1H44A 1VSOA 5H8FA 1N7WA 3BBRA 3TTKA 3K2DA 1MQIA 1NNKA 4QFLA 5CMKA 4OMBA 1A8EA 2I4CA 1O64A 4TQUQ 1M5FA 1JNFA 1N3WA 2V25A 3ILUB 3HO7A 3T22A 4FJPA 1XHYA 3OO8A 1SYIA 2I6EA 1LFGA 3TKDA 1I6BA 2XXHA 1QKAA 3B6QA 2VD3A 1MQHA 4RPNA 2ZNUA 2Q89A 2Y7RA 3K6UA 2UXAA 2XD3A 1OLCA 4YKJA 2O1MA 5FHNA 2ANJA 5BWJA 1B52A 2RF1A 2NVUB 3L6HA 4ESXA 3T66A 4KYSA 2Q8JA 3MVXA 5LOMA 2DYXA 4G77A 1A8FA 3C9HA 4R6HA 2YJPA 3FJMA 1IXHA 4RXLA 2ZNSA 4QFNA 2E1SA 1P99A 1D3KA 3D4CA 1TWYA 2ZMBA 1Q1KA 3C34A 2F34A 1S7YA 3O2AA 1R6ZA 5L9MA 4GF8A 4E0WA 4QSDA 1AH5A 4OETA 3C31A 5DT6A 3UORA 4R74A 1HSJA 2UVGA 2M8CA 1TT1A 5CM6A 3FIRA 3FGSA 1PB8A 1I69A 4IY6A 1GGGA 3OEMA 3TQLA 5FHOA 3Q29A 4EQ7A 4RK9A 3IR1A 4IO5A 2F97A 4X1DA 3K6XA 3ZKLA 4BDRA 2QS1A 3K00A 1B58A 4LZ8A 2PT2A 3SETA 4R6KA 3LC8A 5L9SA 1F9BA 2X7QA 5I58B 4H5GA 3B6TA 4LZ7A 2QSXA 5I2KB 3G3IA 1FTMA 4PFWA 1GTKA 1B46A 3CR9A 3MC2A 3QUJA 3ZSFA 4JSDA 3TYHA 2YLNA 1NNTA 1R1NA 3FVGA 2D5WA 4O3AA 1QKBA 2DXYA 3K01A 4RJZA 1Y1ZA 4C1UA 4JWOA 3CFLA 1MM7A 3USDA 4QHQA 1ZMGA 2F7BA 5H8NB 3CSBA 5CBSA 1Y4CA 1FTOA 2ONKE 2GH9A 1DPEA 1KWHA 1R9LA 4U22A 1UIVA 2DQVA 2PMSA 3EF7A 4OESA 3FATA 2H4IA 3K1PA 3MBPA 1US5A 3SEXA 4YMAA 3ZKKA 5H8QB 4E0XA 1MXWA 1QULA 4EF1A 3K6WA 4HCYA 3FZVA 2V93A 3MVZA 1B05A 1N84A 3I5OA 1B32A 1B2HA 4IO6A 2NOOA 1UTBB 2OZZA 1D9VA 3K1MA 3R26A 2I3WA 4M1VA 1MXVA 4OFJA 1MQDA 4PQJA 2DWIA 1RYOA 3EN3A 5B7DA 1FQBA 1H76A 1LAHE 3S9EA 1A40A 2F35A 3HHFA 5I58A 2OJTA 3LR1A 4R73A 2OCUA 5I2KA 3PPOA 4F3BA 3MPLA 3OELA 1B7ZA 3OSRA 2FNCA 3O97A 2HAUA 1S9TA 3IB2A 2QS3A 1SQYA 2O69A 3VVFA 3O6GA 3C36A 3MW0A 1B0LA 3MP6A 4F3PA 1JEUA 3THIA 3RNNA 4LONB 3RTFB 3SEUA 4ZZEA 2UYFA 4ZECA 4DCXA 3TQWA 1YAEA 4PE5B 3T96B 3DP8A 1ZJLA 4BDQA 2R9JA 3OOAA 4BDNA 1H43A 5H8QA 4KFQA 3LSFB 2PVUA 2QMWA 2BJJX 3SEVA 5DVJA 2AYSA 1PB7A 2O1LA 3V89B 4U2RA 4LQ2A 2LAOA 1N3XA 1MDP1 4YMBA 1IEJA 4R72A 1A7LA 1US4A 1UTBA 2NXOA 3IB1A 4GLIA 4QF9A 2XXYA 2X26A 1FTLA 1GR2A 3BFUA 1SW5A 3WAEA 4H65A 2B3BA 3K02A 2I0BA 2VGQA 3TELA 3E9XA 1LAGE 1O7TA 3C33A 1FQCA 3PGFA 2GFEA 3ECRA 4LUBA 3A3CA 1B4HA 1MPDA 2Y84A 4NWCA 2A5TA 1HSEA 4YAHX 3D4GA 4F1UA 3FVKA 3T9VA 3I6VA 3HV1A 4OXVA 4RK2A 2I4BA 2B3FA 3S9NC 2F78A 3I3VA 4GOTA 1TXFA 1JW1A 3PD9A 1N04A 3IK6B 3G3KA 2O84X 1QVSA 5EHMA 3N26A 3KG2A 1JVYA 5JEIA 1DOTA 3O6HA 3IAZA 4R9FA 1B3EA 1BLFA 2DVZA 1A99A 3SEYA 2I49A 4GXSB 2HQ0A 5A5XB 3CRBA 1CE2A 3F11A 4XXUA 5TPAB 5HM4B 2ZYOA 1Z7ME 1TFDA 4EDPA 3MUQA 4KPTA 1FTKA 1LCTA 3PUYE 3BFTA 1I6QA 1A54A 2Q2CA 4M4GA 3GLBA 2F36A 5ELVA 4YKKA 4AB6A 3RTWB 1JW4A 5FHMA 1N76A 1MG1A 2G29A 4OEUA 4X48A 5KCJB 4OWDA 2HXWA 5I59B 4IO7A 5L9OA 4FEDA 1II5A 3U94A 3VLUA 3TFLA 4RPOA 5I84A 3TODA 1NH8A 2OLBA 2PT1A 4U4XA 4OTEA 1MY2A 4ZE9A 1OQHA 2O68A 3KGCA 1AIVA 1JETA 4NF8B 4PETA 1Y1MA 4QSEA 1H3DA 3KN8A 4Q0CA 4EXLA 3HSTA 1LLSA 4N6PA 2ZNTA 2NWJA 4NF5B 4ELQA 4QRZA 3TCGA 2ONSA 1SW4A 4PFUA 4I8CA 4FORA 4OFOA 4LATA 3C4MA 3QYTA 3MZ9A 3O29A 2O6AA 3TCHA 3B6WA 2A5SA 4DXCA 4IGTA 3W15C 5IAIA 4L17A 1ZTYA 4LP2B 2OK2A 3E4RA 4G8MA 3MP8A 2XX9A 1M5DA 1VE4A 5CMMA 3O9PA 3KOSA 5ITPA 1SD3A 2PYYA 3RLFE 3CSGA 1B7HA 4TLMB 4MLQA 3IOUA 5A5XA 3Q25A 3LSWA 4WEPA 4YU0A 1DMBA 4U4SA 2I3VA 4BDOA 3S2VA 5AA3A 1XT8A 3PUXE 4NF4B 1CB6A 2FA7A 3LSLA 2WKYA 4Q5TA 2DWHA 3PPQA 4BDMA 3G3FA 5JK4A 1MY4A 4P0GA 4XKQA 1Q35A 4POXA 3FXRA 1H45A 4U21A 3WAFA 2H5YA 1SYHA 3IL1B 2GRVA 2PBWA 4G68C 5KCJA 5I59A 5DYHA 2REJA 4NTLA 5J1DA 3FD3A 1B3LA 3TAJA 2HCAA 2QS4A 2QPQA 4NF8A 4PP0A 4G2ZA 1IUDA 4UACA 4Q30B 3IO6A 3KJ7A 4GL8A 1SW2A 4F31B 1Y3PA 2ZYKA 1ZBMA 3CG3A 2RC8A 4NF5A 2DWJA 4KCDA 4FIMA 5AE4A 5BUUA 4JWXA 1ZKBA 1FQEA 1LBBA 1URDA 3OO7A 4NE4A 3DLNA 2UVIA 2O51A 3LUYA 4LA9A 1PBQA 3VLWA 4N13A 2VD2A 2H9BA 3TDJA 5ICTA 1QUJA 5FTHA 4YICA 4MLVA 3P7IA 4ONYA 4FECA 1LAFE 2Y7KA 1USYE 2DXRA 3BKIB 4THIA 3GXAA 1MY3A 1NFTA 2KLFA 3IJXB 1MXZA 3VXCA 4DE8A 5TP9B 4HCWA 4DXUA 4Z7EA 1MXUA 1BTJA 4NF4A 3CFXA 3GBBA 2Y7IA 4HS7A 3OD7A 1ELJA 4KYDA 3V83A 2YPNA 4R2BA 3IOWA 1IQ7A 1B3GA 3O28A 1LGBC 1OVBA 2VOZA 4IO3A 4NEDA 5KZTA 3N94A 3KBRA 2OWTA 3K0VA 3VVDA 1S50A 2DE4A 1J1NA 1MXYA 3KJTA 3MAMA 1XS5A 1FQFA 2V84A 1PC3A 5CI5A 4AB5A 2DE3A 2DS9A 3K1NA 3CG1A 3K4UA 1IIWA 1OVTA 2XXUA 5AA4B 1B40A 2V3QA 4ZZAA 3KN7A 2AL4A 3PUVE 3KN3A 2XXQA 4GIZA 2F6PA 3H7MA 2Z8FA 3PD8A 1QUKA 5EYFA 2QS2A 2GHBA 5I56B 2REGA 1B4ZA 1BP5A 4AQ4A 1JEVA 1Z7NE 1Y3QA 4IO4A 2QRYA 1MS7A 5AA1A 3PU5A 5I57B 1Y20A 4KI0E 3KFMA 5TP9A 3EHSA 5ISUA 3U92A 4LZ5A 5H8NA 2Y7WA 2Z23A 3OENA 2HEUA 3R7XA 3MZBA 4FATA 3SKPA 2DP8A 1LFHA 3H6VA 4G68B 2RCAA 3FXQA 3S9LC 5H8SA 1PBPA 3FV2A 3EHUA 4ZDMA 3LSXA 1Y4TA 3U93A 4I1DA 4KHZE 1XC1A 1POTA 1B9JA 4Q8RA 3H06B 4QFKA 3UK4A 1QW0A 1SW1A 3RPWA 4O3CA 2ONRA 2DE2A 1YTVA 3CIJA 4H1XA 3Q26A 3TEPA 5AA2B 4WXJA 1OMPA 1D9YA 3FVOA 3K6VA 3PMVA 5AA4A 3TZAA 1JQFA 4QFOA 1AMFA 2HFBA 1Y3NA 2F8DA 4NWDA 3W9VA 3AXFA 3S9MC 4YKIA 1EU8A 3OEKA 3SDFA 2XXVA 3VXBA 1EH3A 3IX1A 4FE8A 2QJEA 4JB7A 4TOZA 3TUSA 5KDTB 4GQOA 3RT8A 2UYEA 4F18A 4H8JA 4ZEBA 1P1OA 4GFRA 3FV1A 3UGWA 1PB9A 3FVNA 1YPNA 1DSNA 3O66A 3PPPA 2V3TA 1SDXA 3JV9A 3T93B 1NH7A 1WVJA 4F3GA 2NUVA 3QK6A 3N5LA 3W9WA 1AL3A 3E3KA 4RY1A 3UA8A 4ZEIA 4POWA 3G7WA 1O63A 5I2NB 1B7UA 2QMXA 1VFDA 4U1OA 5IKBA 3QAXA 4FEBA 3H4ZA 1UTHB 4NF6B 3HN0A 1MXXA 3C35A 3PPNA 2QL3A 1NNPA 1P1QA 4XTCQ 3M3FA 4OQOA 1EZOA 4JSOA 2OBGA 2H25A 3RGYA 1AOVA 5AA2A 1TFAA 1RKMA 1FQAA 2I48A 2I0CA 2Y7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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