1HSLA

Refined 1.89 angstroms structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport(slash)chemosensory receptors
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
AIPQKIRIGTDPTYAPFESKNAQGELVGFDIDLAKELCKRINTQCTFVENPLDALIPSLKAKKIDAIMSSLSITEKRQQEIAFTDKLYAADSRLVVAKNSDIQPTVASLKGKRVGVLQGTTQETFGNEHWAPKGIEIVSYQGQDNIYSDLTAGRIDAAFQDEVAASEGFLKQPVGKDYKFGGPAVKDEKLFGVGTGMGLRKEDNELREALNKAFAEMRADGTYEKLAKKYFDFDVYGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Refined 1.89-A structure of the histidine-binding protein complexed with histidine and its relationship with many other active transport/chemosensory proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords HISTIDINE-BINDING PROTEIN
total genus 68
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hslA02
1GR2A 5DEXB 3G3FA 4PQJA 4RYAA 4QHQA 4EUOA 3OMBA 2ONKE 4FATA 3S9EA 1VFEA 1EH3A 3QUFA 3L6GA 3JV9A 2A5TA 3B6QA 4H8IA 4JXIA 2XXIA 3MP1A 5DVJA 4RPNA 2O6AA 3EHUA 3TYHA 3G3KA 4IO3A 3T9UA 3W9WA 4ZEBA 4QFNA 4OFOA 3BFUA 3MQ9A 5J1DA 2DOJA 5CBSA 4NF5A 2BJJX 3D4CA 4GQOA 3FVNA 4H8JA 4Q0CA 5M2VA 4ZEKA 1IQ7A 3TZAA 4DXUA 1N0TA 3PU5A 2I3VA 3O6HA 1AL3A 2NXOA 4I8CA 4LZ7A 2DXYA 3HSTA 3SEXA 1Z7NE 1MQDA 2H25A 2W7YA 4F2QA 3IL1B 4DXCA 5CC2A 3VLUA 3DP4A 1SD3A 4ZZEA 3SEWA 5AA2B 1MY3A 3CSBA 4YB5A 4IO6A 3TELA 3K6XA 1FCKA 2ANJA 2OWSA 4IB2A 4NTLA 4OWDA 4ZDMA 1OVTA 4RXLA 2FA7A 4G2ZA 1OLCA 4H6DA 2THIA 1T0KA 4JB7A 1B1HA 4WKMA 4DZ1A 1FTMA 3N6UA 5H8NB 3TAJA 3E3KA 3KOSA 1MQJA 5BUUA 3OELA 1PB8A 3FGSA 2D21A 3FVOA 5I2KB 1N04A 4ZE8A 5H8FA 4KQPA 3TPAA 1IIWA 1FTJA 5H8QA 3MP6A 1GVCA 2PX1A 2XXHA 3RLFE 3IK6B 4FECA 3PUXE 3T93B 1HSEA 1SW1A 1QKAA 3WAEA 3IAZA 4WEDA 1MXWA 2ALUA 4F3GA 4Q8RA 3EN3A 3RUMA 1B7HA 4P11A 1GGGA 3FASA 1QJMA 4X1DA 4GFRA 3PUWE 3TQWA 4PFYA 2B65A 3H4ZA 2DE2A 1PBPA 4LQ2A 3S9LC 2PYYA 2R9JA 3G3IA 1FQCA 4P0GA 4QF9A 3T66A 3T9XB 4MLQA 1URSA 1B0LA 2DS9A 4RY1A 3CR9A 1B0HA 5EHMA 3OEMA 3S2VA 3PD8A 1A7LA 2UYFA 5EYFA 2RC7A 3IOUA 4NE4A 5KDTA 3PMXA 5AE4A 4DDDA 2O7UA 2XD2A 1MQIA 3TMGA 3N6TA 2GFEA 3CFZA 2LAOA 2IEEA 5L9SA 3FV2A 2Y7RA 5IAIA 3QAXA 2Q89A 4R6YA 2P1SA 4N07A 4XIGQ 1M5FA 2ZYMA 2Q8JA 4YMBA 4MH5A 5TPAB 1FTLA 1B58A 4R72A 3K01A 4M1VA 2X7QA 3UK4A 4JSDA 3IJXB 1LFIA 1URDA 1XC1A 4GOTA 4YKPA 1MXUA 2ZYNA 3KEIA 5I59B 2WKYA 4KR5A 1MPDA 2ABHA 3PV0E 3GXAA 3KFMA 4ESWA 4OMBA 1IXCA 4NF6B 1WODA 4FAJA 2XX9A 2XXXA 3FZVA 4U1OA 5FTIA 3TODA 3K2DA 1B05A 1P1UA 3QSLA 5TU0A 3PGFA 3SEYA 3K0VA 1YPNA 2O84X 4WEPA 1FQBA 1N3WA 3JZJA 3PPPA 4U2RA 5K2XA 2O69A 3SDFA 2GHAA 4G8HA 1P1QA 3N94A 1WVJA 3QUJA 3U72A 3UORA 3QXMA 4OXVA 1Y3NA 3T22A 3Q25A 2HZLA 2I58A 4OERA 2ZNUA 4JWOA 4XKPA 3FXRA 4BDOA 2DVCA 4O3CA 3L6HA 3LSLA 4O3AA 3H6WA 3K6UA 5JTYA 1LBCA 5CMKA 4MF3A 3VV5A 4LZ5A 1SW4A 5A5XB 3ZS6A 1JVYA 1PBQA 1R9QA 3W9VA 1MDQA 4DLDA 3IOWA 4OETA 4Q5TA 3SEVA 3GBAA 5DYHA 1TFAA 2FYIA 5L9MA 2QS4A 5H8QB 1IXHA 3LSWA 1BP5A 2Z22A 4R6KA 4X48A 2XX7A 2Z8EA 2CZLA 5BWJA 1PB9A 1YAEA 1B5JA 4TQUQ 4POXA 5JEIA 4G68A 4OYVA 4XXUA 1XVYA 1AOVA 3VVEA 3E9XA 4YZZA 4GF8A 4ELPA 4IGTA 1UTHB 2F35A 4AQ4A 4LVQA 4R75A 4C1UA 3I6VA 1US4A 5CM6A 2PVUA 5AA4B 4N13A 3KBRA 3HV1A 4U4XA 3R6UA 4LUBA 4HCWA 1IITA 3AXFA 2OK2A 4OVJA 3C36A 4DE8A 4HW8A 4JBZA 2RC9A 1H43A 1Q1KA 3DELB 2PT2A 3QIMA 2QJEA 1SI1A 5DVFA 3VFJA 5F7VA 3IB1A 3MPLA 1MY4A 3A3UA 1FQAA 4IY6A 4F3PA 2ONRA 1M5DA 1XVXA 4YKIA 4ND9A 5DT6A 1IUDA 3MVXA 2RCBA 1N84A 3KGCA 1DSNA 2F34A 1UIVA 2O1LA 5EHSA 2QS2A 4QFOA 3KN3A 3FD3A 1EZPA 3G3GA 4YB6A 4GLIA 1L5TA 3IO4A 2QMWA 3HHFA 4GRKA 1B4ZA 3IORA 3S9NC 2HAVA 3VVDA 4IO4A 4RNSA 1BIYA 1IZ1A 4H67A 1N76A 2VD2A 4EQ7A 2F7BA 3EPEA 2OLBA 4F1VA 4FEBA 1DPPA 4G77A 3VE1B 4IO7A 4G68C 3C35A 1USYH 4YKJA 4IO2A 3CIJA 1KWHA 5AA3A 1O7TA 3K02A 1NNFA 3KZGA 2XHDA 4DXBA 2HFBA 3TTNA 1UTBA 1SI0A 4OENA 3C9HA 3MP8A 3IR1A 1UQWA 3G3HA 3T9VA 1Y3QA 2UVJA 3GBBA 3MPKA 1Z7ME 3K1PA 3EF7A 3IOTA 1EZ9A 3K1NA 2F6PA 2I4CA 2XXVA 4M4GA 3A09A 1A8EA 3S9MC 1B2HA 4NMYA 3OO9A 1NL5A 1Y3PA 4NF4B 3R26A 3O66A 2DWAA 3PUVE 2I49A 4PFTA 5FTHA 1MDP1 2OZZA 1SDXA 4QSEA 5CRYA 4PFWA 4BDNA 1D9YA 1SW5A 1B3GA 4YICA 1M5EA 3OO6A 1NH8A 3D4GA 3TKDA 1JEVA 3GZGA 1A99A 3U8QA 3RGYA 3FJ7A 1MY2A 4RK2A 3H6VA 2Z23A 4OZ9A 5AA2D 4G68B 3PMVA 4GXSB 5FHOA 1LFGA 4I1DA 3FIRA 4H1XA 1SQYA 4EQ9A 1SYHA 2H99A 2Y7PA 1H3DA 1ZIUA 1OMPA 5ISUA 4U4SA 1H44A 2R6GE 5HPQA 3W15C 2O7IA 3SKPA 5FHNA 3TEPA 1TT1A 1N3XA 5IKBA 1VE4A 4GL0A 1MPCA 1LSTA 4NEDA 5K2YA 1AH5A 2D5WA 4N6PA 2XXTA 1J1NA 1B46A 1NNPA 1VFDA 1YTVA 1RYOA 1XHYA 3CI8A 1JEUA 1FW0A 3CVGA 2F7CA 1LGBC 4K3FA 4L17A 3VLWA 2REJA 1R1NA 4OFLA 3OOAA 1US5A 4NWCA 1ZTYA 5B70A 5ICQA 1B3LA 1DOTA 1MXZA 3GLBA 4EXKA 3KSXA 3N5LA 1JVXA 5I58B 1Y4TA 3C34A 2QS1A 4ISUA 4YU0A 3UP9A 4F19A 1NNTA 5I57B 3MJNA 3HCQA 1NFTA 2DWJA 2E0SA 1BKAA 3MC2A 3PUYE 4OEVA 4R6HA 4RK9A 1MRPA 2HQ0A 4AB5A 5KCJA 2A5TB 4F1YA 5I2NA 3G3JA 1DTGA 1D3KA 3V89B 1PC3A 3RN8A 4NF8A 2I6EA 4LONB 3C31A 3HPIA 2DE4A 2IA4A 1IEJA 4FEDA 2V3TA 2UVHA 1DMBA 4EQBA 2XD3A 2AIXA 5DEXA 3C4MA 3B6WA 4THIA 3U94A 2UXAA 4O3BA 3OEKA 4NF5B 2Z8FA 1QUKA 4R9GA 1LAGE 3ILUB 3THIA 1P1WA 3ZKKA 4ZZAA 1Q35A 1MS7A 4LA9A 4RPOA 3E4RA 4HCYA 1I69A 3ECRA 5FHMA 2QRYA 3LC8A 3TDJA 1MXYA 4ZECA 4Z7EA 1QW0A 4H5GA 2DSFA 1MQHA 3V5AA 1MXXA 3PPRA 1B5IA 3DLNA 4IO5A 2NVUB 2VD3A 1OQHA 4ZEIA 5I56A 4WXJA 4G4PA 2O1MA 3OSRA 1B5HA 2Z8DA 4JDFA 1A54A 4ELQA 1URGA 2RC8A 1P1NA 3U1OA 1HSJA 3TCHA 2E1SA 3EHTA 3SEUA 4KI0E 1MM6A 1R9LA 4EF1A 1LCTA 1QULA 1LCFA 2RKMA 1FQDA 1EU8A 3K4UA 1WDNA 1ELJA 4HS7A 5KZTA 1SW2A 5H8FB 4UACA 4Q30B 3O6IA 4YMAA 3F11A 1MY1A 1UIUA 3FVGA 1I6AA 4R74A 4U23A 2GHBA 1RYXA 4TOZA 1MY0A 3LSXA 3VLVA 3RPWA 3KJTA 1ZJLA 5H8NA 2DXRA 1POTA 1A8FA 2DQVA 4FJPA 5I2KA 3ONMA 2NUVA 4KYDA 3TFLA 3I5OA 1QUIA 3HN0A 1S7YA 4DCYA 1JW5A 3DM0A 1B40A 4H5FA 5H8HA 4DIGA 4KPTA 1GTKA 1IXGA 2Y7WA 3T9HB 2F5XA 5I57A 2I3WA 2V93A 1LLSA 3IOVA 2PMSA 3MW0A 3K6VA 4EXLA 3CG1A 3G7WA 4GIZA 2R71A 2GRVA 5KDTB 2Q88A 2B3BA 4OESA 3H06B 3ODBA 4R2FA 1TWYA 2I4BA 3TQLA 3USDA 2DWHA 1NNKA 2V3QA 5HBCA 5ELVA 3TTRA 4POWA 5CMCA 3PPOA 1SVXB 1PDAA 3VVFA 4XKNA 1S50A 3IB2A 2V84A 2B3FA 3CG3A 5I2NB 4KHZE 1S9TA 2ONSA 2XXUA 1LB8A 4GXAA 3M3KA 2CMOA 5TP9A 3FJMA 3Q26A 2UVIA 1P99A 1ZKBA 4MFIA 2FNCA 1XS5A 1TFDA 3TTMA 3K1MA 1MH3A 3FXQA 2F78A 2QMXA 5ITOA 2QSXA 1GV8A 1Y1ZA 1D4NA 1CE2A 1CB6A 2D3IA 2H4IA 3T96B 4R2BA 3Q27A 4F3SA 2ESNA 3TTLA 2HZKA 3RQTA 3H6TA 4BDLA 2Q2AA 2G29A 5TPAA 1JW4A 3DP8A 4RA1A 3O97A 4OFJA 3SERA 3CSGA 1JQFA 2ZMBA 1D9VA 4JSOA 2XX8A 4KCDA 2DWIA 1ANFA 1B1XA 1USYE 3KJ7A 2XXYA 1DTZA 4OHNA 4LATA 5I59A 2X7PA 4H65A 3KOTA 3M3LA 5I56B 2QL3A 4F22A 4NF6A 3TTKA 3MVWA 2F36A 4BLAA 1M5CA 4GWOA 1M5BA 3KN7A 2DVZA 3LSFB 4Z0IA 3RNNA 2H5YA 5JTYB 2ZYOA 2X26A 4P0IA 1SYIA 4PETA 3O6GA 4QSCA 1FQFA 2OJTA 1II5A 4LQ5A 3EHSA 3B6TA 4MBPA 2ZNSA 1MM7A 1JETA 4EDPA 1ZU0A 4FE8A 4QFPA 1LFHA 1JNFA 1F9BA 2P2AA 4JWYA 4F18A 2ZYKA 4E0XA 2KLFA 3BFTA 1HSLA 3OD7A 3MWBA 3P7IA 2I0BA 1PEBA 2RCAA 2AYSA 2O68A 2QS3A 1B7ZA 3OENA 2UYEA 3R7XA 2I0CA 3Q28A 4C0RA 5A5XA 5DVIA 4MLVA 4BDQA 2Y7KA 4F39A 4GVOA 1FQEA 3Q29A 2HXWA 3MAMA 2HEUA 2XXQA 4ONYA 3CFXA 3LR1A 1Y20A 4FIMA 4ZEDA 3FVKA 4UA8A 3FUZA 4YB7A 3MZBA 1LAFE 5H8HB 4XKRA 2YPNA 1XOCA 4F29A 3I3VA 3K00A 3UA8A 3IJOB 3BKIB 1OVBA 2F97A 2DE3A 4IGRA 3H6UA 2V3UA 1I6BA 1MH4A 3PD9A 1VR5A 4TLMB 3VDFA 5L8DA 2AL4A 3WAFA 3JYRA 2NOOA 1RKMA 1R6ZA 1UTHA 1BTJA 5ICTA 1VSOA 4KYSA 1EZOA 3MZ1A 4ZE9A 4QFLA 5AA4A 2H98A 3C33A 5ITPA 2AL5A 4XTCQ 1A40A 3OSQA 3ILTB 3LUYA 1MPBA 4FORA 2HAUA 3U93A 4ZEFA 4X9TA 3SETA 2REGA 3MZ9A 3PPQA 3PUZE 2V25A 5TP9B 4JWXA 4RJZA 4BDRA 3HO7A 1B7UA 2VP1A 4H0WA 2O51A 3OXNA 3VXCA 4EF2A 4HTGA 4KD5A 3MBPA 1SBPA 3C32A 3U92A 2HCAA 3FXUA 2VOZA 1DPEA 3ZKLA 3FATA 3PPNA 3RT6B 3UIFA 1LB9A 4ESXA 3O28A 1B9JA 2DP8A 2Q9TA 3RTFB 5CMMA 3RTWB 1AIVA 5JK4A 3CRBA 1POY1 4F2OA 3OO8A 1NKXA 4KCCA 3TCGA 1QKBA 1ZBMA 2NWJA 4OQOA 3OO7A 1UTBB 3IX1A 1MQGA 1NMUA 2F6GA 4QRZA 1MG1A 1BLFA 5L9OA 1LBBA 2OWTA 4LZ8A 3H3GA 2Q2CA 2QPQA 1FTKA 2XXPA 3MVZA 4I9DA 4QSDA 3RT8A 4YAHX 3M8UA 3VXBA 4F3BA 3RY3A 1ATGA 4IY5A 2M8CA 4PP0A 4U22A 3SESA 5AA1A 3LBSA 3A3CA 1Y1MA 3V8XB 3M3FA 4X1BA 1ZLQA 1Y4CA 1B3HA 4XKQA 2YLNA 2OCUA 2Y7IA 4ELOA 4F1UA 4G8NA 1OLAA 2Y84A 3B7DA 1B3FA 4PFUA 1B51A 3QK6A 5I84A 1B32A 1Y9UA 1B3EA 4YKKA 4KFQA 4PE5B 1LAHE 2I48A 1FTOA 1B4HA 1OIBA 3KG2A 2XXRA 3QYTA 3E13X 2DYXA 4LP2B 3PMWA 3KN8A 3DP6A 1MXVA 3IO6A 2RF1A 3HHGA 3S4UA 4NF4A 4GD5A 5AA2A 4U21A 2RINA 4C1TA 4E0WA 4G8MA 1N7XA 1QUJA 4NWDA 1NH7A 2VGQA 4R73A 1OQGA 3UGWA 1O63A 2A5SA 4TLLB 3H03A 2H9BA 5HM4B 2XXWA 4OEUA 5DTBA 2ZNTA 2YJPA 1YCJA 5CI5A 3N26A 4OTEA 5B7DA 3KSJA 3O2AA 2PT1A 3FV1A 1N7WA 5H8SA 3MVYA 1O64A 5CMBA 2ZXTA 5CBRA 3CFLA 3O29A 4BDMA 1H76A 1B6HA 4ELRA 3TCFA 1XT8A 1AMFA 4U1ZA 4AB6A 1LAXA 5LOMA 4F31B 3UN6A 1A55A 1P1OA 3O9PA 1PB7A 4ZS9A 3MUQA 1TXFA 1ZMGA 2F8DA 2PBWA 1H45A 4DCXA 2F7AA 3FJGA 1QVSA 3BBRA 4ECFA 3V83A 3ZSFA 4KYEA 5KCJB 2GH9A 3EQ1A 2VHAA 4QFKA 1B52A 4NF8B 2P0SA 3H7MA 3K6WA 5F1QA 2UVGA 5I58A 1IXIA 4R9FA 4GL8A 1I6QA 3IB0A 2G93A 3TUSA 1JW1A 4I62A 2OBGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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