1I69A

Crystal structure of the reduced form of oxyr
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
212
structure length
206
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHSLRDQAMGFCFDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
total genus 45
structure length 206
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A02
3VFJA 4KI0E 4H6DA 4NF5B 4F1YA 1MY0A 3K02A 1UTBA 4GD5A 2RKMA 2QPQA 3KN8A 5AA2B 1ZBMA 4ELPA 4JB7A 2QS3A 3LSXA 4N6PA 4YZZA 2UYEA 3GBBA 1TWYA 4DCYA 4LQ5A 4WEDA 2R9JA 4X48A 3VVFA 4X9TA 3H6VA 1FQAA 5DEXA 4YAHX 1PBPA 2ONRA 2RC7A 3ZKLA 3PPNA 3CFLA 1M5DA 3K6VA 3A3UA 3G7WA 1UTBB 4IY6A 3OEMA 5M2VA 3T96B 3KGCA 2DWIA 1BKAA 4F31B 2V3UA 3H3GA 2RCAA 4MF3A 3C31A 3FATA 4H8IA 5J1DA 1IXCA 3G3KA 4OZ9A 1P1OA 3SESA 1LAGE 3FJ7A 4FEDA 1DPEA 5DEXB 3S9LC 4G4PA 4DE8A 4XXUA 1AOVA 3FVGA 4UACA 4F2QA 3O66A 4ELQA 2REJA 1ELJA 3RPWA 5EHMA 3SEYA 3JV9A 2NXOA 2UXAA 2QS1A 1MQJA 2Z8EA 1NKXA 4X1BA 5DT6A 1N3WA 1Y3QA 3OENA 2O68A 1B5IA 1URGA 4KYEA 1N04A 2V3QA 1NL5A 4OEUA 5DVFA 3OO9A 2THIA 1IQ7A 3OO6A 2I4CA 1N76A 5JK4A 3O2AA 3SEVA 3U94A 1B4ZA 1ZJLA 2OCUA 3FXQA 4EF1A 1H44A 3PUYE 3W9WA 4HTGA 4GQOA 5IKBA 3I3VA 1A7LA 2B3BA 4GWOA 3LUYA 4XKQA 1GVCA 3VLUA 1N7XA 3LSFB 3FVOA 4JWXA 1R1NA 3JYRA 2Z23A 3PPQA 5A5XA 1O7TA 2O7IA 3MP1A 3VLVA 1UQWA 3PUVE 4NF6A 2B65A 4O3BA 5CBRA 5KZTA 1B46A 4GLIA 1GGGA 2Y7KA 1SYIA 4PETA 3SDFA 3TAJA 2AIXA 3T9XB 4DCXA 5I59A 2AYSA 2NWJA 3AXFA 2HZKA 5I57B 3L6GA 4R2BA 3SETA 4DXCA 1Z7NE 3TMGA 4NF4A 1LB8A 2Z22A 2H9BA 3K00A 3RT8A 5A5XB 5FHNA 1LAXA 5CRYA 3VVDA 3PUXE 3U1OA 4NF6B 3FXUA 4PE5B 1B7ZA 4PFUA 4EUOA 1RYOA 3KFMA 2QS4A 4U23A 4GL0A 1ZU0A 5I59B 3MW0A 1POTA 4YB5A 1Y3PA 4U4SA 3M3KA 2A5TB 2DS9A 3KEIA 4ZDMA 4ND9A 3USDA 3LSWA 1EZPA 1A8FA 4U1OA 4NF8A 1PB7A 4RXLA 3PPOA 1ZLQA 3BBRA 3S4UA 4HS7A 3QUFA 4KQPA 4LZ7A 4R6HA 4OETA 2DWAA 1JVXA 2PYYA 3R7XA 4PP0A 2REGA 2VHAA 1GV8A 5IAIA 1B58A 4OENA 3UA8A 1ATGA 4AB5A 1NNKA 1SQYA 5H8FA 1MY4A 2UVGA 2YLNA 2R71A 4NF8B 4MLVA 4YU0A 1GR2A 5CI5A 3FJMA 4F3SA 1VSOA 2VOZA 3TZAA 3PGFA 3N6TA 4F1VA 4QSEA 1D4NA 1II5A 2F36A 4RYAA 1JW4A 3IX1A 2GHAA 4H0WA 2F8DA 4ZECA 3RTFB 2ZYOA 1B3FA 5H8FB 3KSJA 3ECRA 3B6TA 4F39A 4G68A 2YJPA 3PUWE 1OQHA 4OVJA 1YTVA 2HFBA 3H4ZA 3K1MA 4N13A 3ZSFA 4F19A 1NMUA 1JW1A 2R6GE 3V8XB 1MM6A 5TP9A 3T66A 1IUDA 3EQ1A 4ISUA 1IXGA 3KG2A 3F11A 4ZEIA 4DDDA 3VVEA 4IY5A 2RF1A 1MXYA 2QRYA 3QXMA 4NWDA 3M8UA 2OWTA 2QS2A 2P1SA 4GOTA 5EHSA 2I58A 4G68B 1FTMA 4ELRA 4RPOA 1PEBA 1FTJA 1ANFA 1UIUA 4THIA 3RNNA 4IGTA 4EQBA 2DSFA 2OBGA 4AB6A 1WDNA 1B7HA 4RPNA 3MP6A 1VFEA 1B3EA 3SKPA 3KOSA 1JEVA 2I6EA 4JBZA 3MZ1A 3MZBA 3UN6A 3TTRA 2I49A 2QL3A 4BDMA 3CG3A 4EXLA 2I4BA 3CFXA 1AMFA 3B7DA 3DLNA 5H8QA 3I6VA 4OFLA 4U21A 1N3XA 4I1DA 4YMAA 2CZLA 3GLBA 4POWA 5HM4B 1YCJA 4YB6A 3R26A 3O29A 2HAUA 1A8EA 2XX9A 3KOTA 3KZGA 3BFUA 3TDJA 4MLQA 4TOZA 4IO2A 3OOAA 2PBWA 2UVJA 3Q26A 4NTLA 1I69A 1H76A 3QIMA 3IO6A 3PUZE 3T9UA 3SERA 3QYTA 4BDLA 2H25A 5K2YA 4KFQA 2DVCA 5H8QB 4RA1A 5CMBA 3C35A 4OERA 4H5GA 3U8QA 2AL5A 4U2RA 3T93B 1XHYA 2DOJA 1Y1ZA 1DSNA 1FQFA 1ZMGA 5JEIA 4EQ9A 2Y7WA 3IJOB 3RY3A 5TPAA 3OSQA 3EHUA 3H6TA 3VDFA 1SI0A 2H5YA 1IZ1A 1TT1A 4E0WA 3ZS6A 2GRVA 3MPLA 3MC2A 3C9HA 3M3FA 4KPTA 5I2NA 3EHSA 3DP8A 3HV1A 1B1HA 3OMBA 5I2KA 3PMVA 1SW5A 4EDPA 3WAFA 4BDOA 3V83A 3HSTA 1P1QA 5LOMA 5L9SA 4YB7A 1T0KA 2Y7IA 2QMXA 2VP1A 4U1ZA 3HHFA 1QULA 4OQOA 5ITPA 3U72A 1A99A 1B51A 2E0SA 1Y4CA 2PT1A 2DXRA 2KLFA 3IORA 5I2NB 4R72A 1Z7ME 1US5A 5I2KB 4OHNA 1FTLA 2OJTA 1ZTYA 1RYXA 2NVUB 2O84X 2FYIA 3B6WA 5TU0A 1JW5A 3C33A 1L5TA 3PMWA 2DYXA 2Q9TA 3S9MC 1B5HA 4IO3A 5F7VA 4KCCA 1PBQA 4X1DA 2O1LA 4KR5A 3TODA 1XVXA 3TELA 5FHMA 3IL1B 4L17A 4C1TA 4ONYA 1QUJA 3MPKA 2D5WA 2Z8DA 1NNTA 4ESWA 4Z7EA 2V84A 1B2HA 3RLFE 3RTWB 1PB9A 2P0SA 4KHZE 3RUMA 3K2DA 1VFDA 2ZNTA 3TQLA 3TEPA 1NH8A 4PFYA 1DMBA 1B3LA 1LAFE 3RQTA 3TTKA 4JSDA 1LSTA 3ILUB 4XKRA 3CR9A 1FQEA 1MPBA 1FCKA 3JZJA 4KYDA 4DZ1A 4R9FA 4ZE9A 4BDRA 1QKBA 3FUZA 2DP8A 5HPQA 2XXXA 4ZEDA 1SI1A 3V5AA 3MVWA 1I6AA 3PD9A 4BLAA 5AA1A 1LB9A 5F1QA 2XD3A 2PMSA 1MPDA 2FNCA 4IO6A 3O28A 3RT6B 3E3KA 4TLMB 4G8NA 1R9LA 3Q29A 1JEUA 1N7WA 3GBAA 1FTOA 4F3BA 4YKJA 1LBCA 1N0TA 1B32A 1QJMA 3TPAA 3VE1B 5H8SA 2Y7PA 3FVNA 5FTHA 1IXHA 1F9BA 2Y84A 4ZEKA 1TFDA 2G93A 2I3VA 5H8NA 3UK4A 1M5EA 3SEWA 4H65A 4XKPA 1IXIA 1EZ9A 4NF4B 1MXVA 3VXCA 4Q30B 1BLFA 3Q28A 4F2OA 1R6ZA 3THIA 1Y9UA 1MRPA 2O51A 2F6GA 1MDP1 1MXXA 1P1UA 1AIVA 4ELOA 3VXBA 5FHOA 2F6PA 5CC2A 3N94A 3K6UA 2I48A 3IAZA 3H6UA 4OXVA 4RK2A 1LLSA 3CG1A 3IOTA 1RKMA 3IOWA 2O69A 4G8HA 3K1PA 4H8JA 2Q2AA 4F29A 2DE4A 1MDQA 2UVHA 3IB0A 5DTBA 3C36A 4PFTA 4DIGA 3O9PA 1B7UA 3R6UA 4LVQA 4QFOA 5ICQA 3QUJA 3EF7A 3SEUA 4KYSA 1Y1MA 2GFEA 1US4A 3G3JA 2RC9A 4JDFA 1VE4A 3CI8A 1ZKBA 2UYFA 1LBBA 4PFWA 1BTJA 4WEPA 3CSBA 1B5JA 4YICA 1MQDA 3MUQA 3IO4A 2V3TA 4TQUQ 5BUUA 2XD2A 2W7YA 1P99A 3KN3A 1EH3A 1B3GA 1BIYA 3A3CA 4E0XA 3UORA 4F18A 3ZKKA 3M3LA 1URSA 4POXA 4ZS9A 3EN3A 2HQ0A 1SYHA 4R6YA 3ODBA 2ZYNA 2VD3A 1OLAA 3I5OA 5KDTA 3T22A 1USYE 1R9QA 1D9VA 5B7DA 2DVZA 3TYHA 1UIVA 1MM7A 1SDXA 1QUIA 4FE8A 3TTLA 4N07A 1KWHA 3E13X 4LZ8A 2HXWA 1B4HA 5TP9B 5K2XA 2ZNUA 3D4CA 4XTCQ 1XS5A 1HSEA 3UIFA 3EPEA 4MFIA 1FQDA 1JQFA 1M5FA 4GFRA 1D9YA 2F5XA 2NUVA 3KN7A 4R74A 5KDTB 3U92A 2F7BA 1CB6A 2HEUA 5DVIA 1MQHA 3C32A 4KCDA 1LFGA 5DVJA 1LFHA 1Y4TA 4TLLB 3TCHA 1VR5A 2Y7RA 4OFOA 4G2ZA 1EZOA 2V93A 4OWDA 1TFAA 4R6KA 2DE3A 3DP6A 1P1WA 1S9TA 2H4IA 1FTKA 4K3FA 1LAHE 2ALUA 3EHTA 3O6IA 3MZ9A 1JVYA 3MAMA 4OYVA 1O64A 1M5BA 3S9EA 4FEBA 5ICTA 3G3FA 5L8DA 2IEEA 4QF9A 3VLWA 4P0IA 2XXUA 4QFNA 1MY2A 3BKIB 3OXNA 4C1UA 2F7CA 1NFTA 2ONKE 4MH5A 3PPPA 3RGYA 1H45A 4Q0CA 4M1VA 2DXYA 2XHDA 4QHQA 2I0CA 4F1UA 1B52A 4QSDA 4JWOA 2RCBA 3N5LA 1IEJA 2VD2A 3FIRA 5I56A 1SW1A 3Q27A 3P7IA 5AA2D 1AH5A 4OMBA 1MXZA 1MH3A 4JXIA 4QFPA 1MXUA 4WKMA 5JTYA 1MXWA 3TFLA 2FA7A 3O6HA 3D4GA 4U4XA 3N6UA 3W9VA 4I9DA 4LUBA 1OVTA 5H8HA 2F97A 2CMOA 2XXTA 2XX8A 5I56B 1A40A 2RC8A 1GTKA 3CFZA 3H6WA 5KCJA 5TPAB 4NE4A 1I6QA 1Q35A 3FD3A 4RNSA 3TCFA 5JTYB 3WAEA 4O3CA 2E1SA 1JETA 5AE4A 1LCTA 4YMBA 4M4GA 3OO7A 1ZIUA 1MQIA 3MWBA 2ZXTA 4EF2A 5H8HB 4OESA 3UGWA 1URDA 1H43A 3K6XA 4HW8A 4ZEFA 3LR1A 3HCQA 5KCJB 1P1NA 1MH4A 4UA8A 3OSRA 4H67A 4HCWA 2Z8FA 4Q8RA 2DWJA 2I3WA 3T9HB 4R2FA 4LA9A 4R75A 3Q25A 3FXRA 2YPNA 5CMMA 1M5CA 4FECA 2ABHA 1B1XA 1WODA 3VV5A 1S7YA 4DXUA 2HCAA 3TTMA 1NNPA 2HZLA 2H99A 5CMKA 1A54A 4G77A 3QSLA 2VGQA 3H03A 4EQ7A 1B0LA 1J1NA 1MY3A 1B3HA 4RJZA 2B3FA 3B6QA 4ZEBA 4JSOA 3PU5A 1Q1KA 3ONMA 1XVYA 2XXYA 4ZZAA 3OD7A 3OEKA 2HAVA 2O6AA 4RY1A 3QAXA 1BP5A 2ONSA 3DP4A 3DM0A 4NMYA 4H1XA 3S9NC 3PMXA 4HCYA 4YKKA 5I57A 3FV2A 3PV0E 4OEVA 2PVUA 4P0GA 2F78A 3MVXA 4XIGQ 3IB1A 4IO7A 4GRKA 4XKNA 5HBCA 1DTZA 4OFJA 4RK9A 1H3DA 3HPIA 3T9VA 3CIJA 3GZGA 2XXQA 3A09A 1MQGA 3K4UA 1MG1A 3H7MA 5I58A 3TKDA 3MVYA 3UP9A 1O63A 2LAOA 4GIZA 3FVKA 3TTNA 1QUKA 1CE2A 1HSLA 2QSXA 2A5TA 4AQ4A 2OZZA 1LCFA 2XXIA 1SD3A 4ZE8A 2Q2CA 4QFKA 3KBRA 3C34A 2P2AA 1AL3A 5DYHA 2PX1A 3RN8A 4ZZEA 4Z0IA 1YAEA 3N26A 1I6BA 4QSCA 1B05A 2X7PA 2DE2A 1USYH 4OTEA 4FORA 1SW4A 5AA4A 1OMPA 5I58B 4R73A 1A55A 1HSJA 3HHGA 2RINA 2OWSA 2Q89A 2F35A 3TQWA 3L6HA 4IO5A 4R9GA 3G3IA 2H98A 1QVSA 3MP8A 4I8CA 1POY1 5H8NB 1S50A 4C0RA 2OK2A 3C4MA 4JWYA 5CMCA 5BWJA 4O3AA 4YKIA 2A5SA 3LSLA 3S2VA 3FASA 5B70A 5AA4B 3G3GA 4G68C 1DTGA 3G3HA 2XXRA 1MS7A 3KSXA 3O97A 2ZNSA 4F22A 5ITOA 1PB8A 2ZMBA 1Y20A 2O1MA 4LONB 1WVJA 5ELVA 1IIWA 4Q5TA 2IA4A 5CBSA 3CSGA 1QW0A 4ECFA 5EYFA 3KJTA 2ESNA 3U93A 3K1NA 3IB2A 1TXFA 3K01A 2QMWA 3IK6B 4LP2B 1YPNA 1OQGA 2X26A 4IGRA 1MY1A 2O7UA 1NNFA 2V25A 3QK6A 4YKPA 2D3IA 1SVXB 2BJJX 3MJNA 4P11A 1EU8A 2ZYMA 2NOOA 4FIMA 3ILTB 4GXAA 1FW0A 3KJ7A 3PPRA 2OLBA 2ZYKA 1SW2A 3MBPA 4DLDA 1FQBA 3DELB 3FV1A 4BDQA 4NWCA 1LGBC 3MQ9A 3BFTA 2GHBA 4LQ2A 4MBPA 3IOUA 5CM6A 1MPCA 1B40A 5I84A 3TUSA 1N84A 4IB2A 3HN0A 2WKYA 3OELA 1LFIA 5L9MA 4F3GA 3MVZA 1OIBA 2ANJA 1OLCA 3CVGA 1QKAA 1IITA 4GXSB 3SEXA 4QRZA 5ISUA 4PQJA 3H06B 3FGSA 1B6HA 4GVOA 2AL4A 3V89B 4GF8A 3TCGA 2XXHA 1PC3A 4H5FA 4GL8A 4FAJA 4LATA 3O6GA 2Q88A 5L9OA 1XOCA 4QFLA 1PDAA 2DWHA 2I0BA 1Y3NA 4FATA 2XXVA 1OVBA 4ESXA 3LC8A 1UTHA 4LZ5A 3PD8A 3E4RA 3K6WA 1NH7A 2XX7A 4WXJA 5AA3A 3HO7A 2D21A 2GH9A 2PT2A 3OO8A 1DOTA 3IOVA 2Q8JA 1B9JA 3IJXB 4FJPA 4NEDA 3E9XA 3FJGA 2UVIA 1B0HA 4NF5A 4I62A 5FTIA 1XT8A 2QJEA 5AA2A 3W15C 1D3KA 2XXWA 3LBSA 3K0VA 4EXKA 1FQCA 2XXPA 1UTHB 4F3PA 1SBPA 2DQVA 2X7QA 3FZVA 3IR1A 1XC1A 2G29A 4DXBA 3CRBA 2F7AA 4KD5A 4BDNA 2F34A 4IO4A 1JNFA 3GXAA 4G8MA 4U22A 2M8CA 1DPPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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