1IEJA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, holo form, at 1.65 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAITLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain closure mechanism in transferrins: new viewpoints about the hinge structure and motion as deduced from high resolution crystal structures of ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 112
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iejA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iejA02
1LGBC 2OJTA 3B6TA 1FQAA 1MPCA 3I6VA 3P7IA 3H4ZA 1JNFA 3AXFA 4KCDA 4RXLA 2D3IA 5AE4A 2ANJA 1N3WA 2Q9TA 1LSTA 3GZGA 2F6GA 1N84A 4C1UA 3W15C 3FIRA 1MDQA 1EZOA 2G93A 2XXHA 4BDOA 2I58A 2Y7PA 4F1UA 1P1NA 1QJMA 2R71A 4HCYA 5HBCA 2F7CA 3TTLA 4YKPA 3I5OA 1LAFE 4F18A 4MLVA 3A09A 3O2AA 4P11A 4G8NA 4KI0E 4G8MA 3H03A 1B4ZA 1UTHA 2O84X 3KJ7A 3O28A 1Z7NE 2RC9A 4F2QA 2X7PA 4ZS9A 3CI8A 1OQHA 2GFEA 4OZ9A 3LSXA 4DXUA 3OEKA 3RTWB 5I2KB 3W9VA 4OFLA 1XT8A 3T9XB 3Q28A 1LAGE 1SDXA 3QXMA 1CE2A 4DIGA 2UYFA 3MP1A 1M5CA 2B3FA 3IX1A 3EHTA 4R6HA 4IO7A 2NWJA 1RYXA 3G3IA 3RLFE 3PUZE 5M2VA 5BUUA 2DYXA 3EN3A 3CFLA 3KOTA 1Y1MA 1US5A 1MM6A 2I4CA 3HHGA 3QIMA 3FV2A 2QMXA 3U92A 1R9LA 4YB7A 5KCJB 4ZDMA 1BP5A 4FAJA 3U1OA 4DE8A 4U22A 1P1OA 4XTCQ 3IO4A 1SI0A 1P1QA 2QS1A 4RPOA 3TCFA 3FV1A 4MBPA 1LCFA 3VVEA 3TODA 2KLFA 3SDFA 1URGA 4GL0A 2Y84A 3C9HA 3C34A 3K4UA 1ZTYA 4R9FA 3OELA 2F7AA 3IOTA 1Y3PA 3KN7A 1N76A 1N0TA 1LB8A 2O51A 4NF8A 2I6EA 3MZ9A 5L9OA 2GH9A 3H6VA 4Z0IA 4N13A 4PFTA 2O69A 5KZTA 3DP4A 3GXAA 5H8HA 2XD3A 4Q30B 3D4CA 5A5XA 2CMOA 2V84A 2F78A 1OQGA 4KYDA 2H99A 2ONSA 3ONMA 3FATA 2ZMBA 1NH8A 3TKDA 3KSJA 4NWDA 5DVIA 4GXAA 4G68B 3E4RA 4DZ1A 4IGTA 4ND9A 2NUVA 4ONYA 1Y1ZA 2QS2A 4DCXA 3T9HB 4KCCA 5I57A 3HSTA 1D9VA 3DP8A 3TCGA 2ZXTA 1OVTA 1HSEA 4KPTA 1ANFA 2QMWA 3CVGA 4QRZA 5KDTA 4ZEFA 4JXIA 1XHYA 1SW5A 4FE8A 3OO9A 3PMVA 3DLNA 2XXUA 4BLAA 1FTKA 3ODBA 4QSDA 2F6PA 4H65A 1QW0A 1MXZA 2DS9A 1ZKBA 3MZ1A 1B9JA 4WXJA 3CSBA 5I2NA 2XXXA 4EXLA 3VLVA 5EYFA 3N26A 3JZJA 3RT6B 1A40A 5I58B 5K2XA 1NH7A 1FTLA 3MVWA 2Y7KA 3K2DA 2ZYKA 4OVJA 3KEIA 4YMBA 1JW4A 1YTVA 2Q8JA 1MRPA 4ESWA 1B3FA 1R9QA 4G4PA 2R6GE 3TTMA 1CB6A 4ZZEA 4GF8A 4Z7EA 3CG1A 2HAUA 4WEPA 4O3CA 4U1ZA 1PB8A 5ITOA 2XXWA 2RC8A 1MY4A 1FTOA 4H0WA 3KJTA 3UIFA 3M8UA 3HN0A 5H8FB 2F35A 4AQ4A 3TELA 3FXRA 3GLBA 3TEPA 3A3UA 4ZEBA 4BDRA 4NF6B 4WEDA 5DT6A 5L8DA 3O9PA 1XC1A 4TLLB 2H98A 1IITA 3LC8A 1NL5A 4Q5TA 4ISUA 3VDFA 4JBZA 1FQFA 5I59A 5JTYA 1TXFA 2P0SA 1ZIUA 1EZPA 4IO6A 1MXWA 4LZ7A 4NF4A 3ZKKA 1WODA 3H3GA 1MPBA 3G3KA 1ZU0A 2QS3A 5I56B 4IO5A 1FTJA 4EQBA 1D3KA 1MXYA 4DDDA 3C31A 4TQUQ 1FQCA 1SBPA 4RY1A 2E0SA 3PPRA 4XKPA 4GVOA 4XKQA 3H7MA 1IEJA 3TPAA 3EPEA 2UXAA 2ZYNA 4KD5A 3R6UA 2Z8FA 2P2AA 3UGWA 3VVFA 5DEXA 1DTZA 1YCJA 1DMBA 3S9LC 2PX1A 5H8QA 4DCYA 3I3VA 4FIMA 4WKMA 4QFLA 2HFBA 5CM6A 4IO4A 2YPNA 3HCQA 2HZKA 2PVUA 5DYHA 2O7IA 3IK6B 5CMBA 4OQOA 1R6ZA 3TYHA 2RF1A 3N6TA 3RN8A 1VFEA 1N7WA 5B7DA 1TFAA 3IB2A 3USDA 5FHMA 2DWAA 4F39A 1IUDA 2I3WA 2LAOA 4R9GA 3G3HA 1AL3A 4H8IA 1B7ZA 1VE4A 4ECFA 2D21A 3UN6A 3U72A 2QSXA 4R72A 1IQ7A 3VLUA 2DWHA 4ESXA 2Z23A 3IR1A 1B1XA 4I62A 3SESA 1AH5A 5F7VA 3O29A 4AB5A 1NNFA 2DE2A 2V93A 4ZE8A 4YU0A 4ZZAA 2IA4A 2OK2A 4PP0A 4ZEDA 1USYE 1B0HA 4F3GA 4LATA 1FQBA 3RTFB 4NF5A 3RY3A 1GGGA 4L17A 1L5TA 1O7TA 3CSGA 3LSLA 4OERA 2A5TA 3K00A 4FORA 1FQEA 3IJOB 5ICTA 4F19A 5B70A 4IB2A 1B51A 1GTKA 2RINA 4GIZA 1UQWA 4YB5A 1EH3A 2VHAA 1MH3A 1AMFA 1J1NA 2PT1A 1QULA 3FJ7A 1LBBA 1USYH 2YLNA 4I9DA 3TAJA 3TCHA 2XXIA 3G7WA 1RYOA 4F3BA 1SVXB 2HZLA 2VD2A 4GOTA 2FNCA 2OZZA 3UP9A 1P1UA 1ATGA 3TTRA 1H44A 2Y7RA 4GWOA 3PV0E 3GBBA 4OFOA 1B4HA 3RQTA 2H5YA 3KN3A 4ELOA 3N6UA 3MUQA 4LA9A 3LBSA 4FATA 1IXIA 3FVOA 2HXWA 1SYHA 5AA4A 3SEVA 3SKPA 1BKAA 1WDNA 3TTNA 3SEXA 3K6UA 4ELRA 3LSFB 4OYVA 1B52A 3MWBA 2AIXA 1AOVA 1JVXA 4NTLA 1IIWA 1POTA 4THIA 3TQLA 3EHSA 5JK4A 1PBPA 5AA3A 3O6IA 2E1SA 4LZ5A 1Y20A 3K01A 4R6YA 1VFDA 4FJPA 2P1SA 5L9SA 4GD5A 1MQJA 4F3PA 1M5BA 4OHNA 4Q0CA 1URSA 3OO6A 4OENA 4F22A 3Q25A 3T96B 1ZJLA 3MW0A 2Y7IA 3V8XB 3MBPA 2ZNUA 3C32A 3ILTB 3PPQA 1A55A 4QFPA 1B3HA 1I6BA 4F29A 4OMBA 4KYEA 1NKXA 2I4BA 3M3KA 1LFIA 1IZ1A 3PMWA 1N3XA 2V3TA 3IJXB 4OEVA 3PPNA 3FGSA 1S50A 3Q29A 3RT8A 1DSNA 2XXYA 3PUXE 4RJZA 3T9UA 5I2KA 3BFUA 5CI5A 1QUKA 5I84A 1LB9A 5CMMA 3V89B 1LLSA 2OWTA 1MXUA 3H6WA 4U1OA 5H8NB 3MAMA 3V83A 3TTKA 1EZ9A 1PBQA 1FTMA 2DWIA 5ITPA 1R1NA 3IORA 3SETA 4XXUA 2CZLA 4IO2A 1NMUA 4H8JA 1B0LA 3S9MC 4U23A 1WVJA 4OXVA 3FXQA 4R2BA 1JEVA 4XKRA 3DM0A 4BDMA 1D4NA 1B5JA 4RPNA 4K3FA 1GV8A 1B1HA 5KCJA 1B3GA 2AL5A 5FTIA 2M8CA 4YB6A 4I1DA 2Y7WA 1ZBMA 2A5SA 4EXKA 2OBGA 5ISUA 1NNTA 1DPEA 2DVCA 1IXCA 2B3BA 1FQDA 1LFGA 3TQWA 5FHNA 3ZS6A 4ZEIA 4POXA 3MZBA 3KZGA 3WAEA 4R74A 5DTBA 1QUJA 4QFOA 4ELPA 4EQ9A 2ALUA 4O3BA 2HEUA 1UTBB 1YPNA 2DSFA 1P99A 3M3FA 1ZMGA 1OLAA 3PUWE 3RUMA 3MC2A 2V3UA 4ZECA 5TU0A 5FHOA 3C33A 3VXBA 3MP6A 3K6VA 3EF7A 3JYRA 3FASA 4M4GA 2VGQA 4JB7A 1B3EA 5TP9B 5TPAB 2Q2AA 3FVNA 1LCTA 4ELQA 3BBRA 2H4IA 2HQ0A 2ABHA 4X48A 4PFYA 5J1DA 4JSDA 3S2VA 3FVGA 4FEBA 1VR5A 3EQ1A 4G68A 4EF1A 4GL8A 1B6HA 3K1NA 4HS7A 1PC3A 3PD9A 2AYSA 4NWCA 3KFMA 2XHDA 4LQ2A 4OWDA 4HCWA 4RNSA 3LSWA 1M5EA 2H25A 4FEDA 4IO3A 5AA1A 2I3VA 2ZYMA 3TUSA 4YKJA 1B05A 1MPDA 4EQ7A 1POY1 1LBCA 4OESA 2UVIA 1N7XA 3BFTA 4YKIA 2F8DA 2XXTA 2Z8DA 4KQPA 1LFHA 3N5LA 2DXRA 3M3LA 2ZNTA 1JEUA 1YAEA 4R75A 1GR2A 1HSLA 2DE3A 1UIUA 5EHSA 3WAFA 3OMBA 4RK2A 2XX8A 4U4XA 3U94A 4P0IA 2BJJX 3TDJA 5I58A 3HHFA 3IB1A 3FD3A 5DVFA 1SD3A 3CFZA 1UTBA 5CC2A 1KWHA 4E0WA 3PD8A 4QSEA 3G3FA 1JW1A 3MVZA 1GVCA 4R73A 1Y3NA 1I6QA 4UA8A 4X1DA 3K1MA 5TP9A 3OOAA 3RGYA 4LP2B 3G3GA 1H76A 3OSRA 3SEYA 3KN8A 3OSQA 1JW5A 4EUOA 1MS7A 2PT2A 4RK9A 3C4MA 1UTHB 4POWA 2VD3A 5H8FA 1N04A 4EDPA 4LZ8A 4BDNA 1ZLQA 2O68A 3KOSA 3IOWA 5K2YA 4NF6A 5CBRA 3N94A 4QFNA 5HPQA 3FVKA 1Z7ME 3H6UA 4HTGA 1TFDA 4F31B 4HW8A 1A99A 1DOTA 1Q35A 1QKAA 3PMXA 2UVJA 3UORA 2DQVA 2DWJA 4G8HA 2IEEA 4PFUA 4E0XA 3SEWA 3QSLA 1PB7A 3SERA 5I56A 3W9WA 3T9VA 1OLCA 3L6GA 2V3QA 5ICQA 1LAXA 1MM7A 1US4A 4DLDA 2Q88A 2HAVA 1B40A 2F7BA 4JWOA 3F11A 4JDFA 2F34A 2Q2CA 2RCBA 1Q1KA 1PB9A 2X26A 3C36A 3K6WA 3OXNA 3S4UA 3E9XA 3MPLA 4PETA 3DP6A 5BWJA 4OEUA 3CIJA 4AB6A 1NFTA 3H06B 3THIA 1SI1A 2I0BA 1PEBA 3MVXA 1QKBA 3B7DA 1M5FA 4XIGQ 1JQFA 4KFQA 4JSOA 3S9NC 4PE5B 5AA2D 2THIA 3FJGA 1SQYA 3IL1B 4OFJA 3MP8A 1IXHA 3FXUA 4QFKA 4KHZE 1M5DA 4MLQA 5L9MA 5CBSA 3T22A 5CRYA 3O97A 3B6WA 1RKMA 4NF8B 1MY3A 4IGRA 1MY2A 5IKBA 3IO6A 3CR9A 1MXXA 1EU8A 3V5AA 5H8HB 5AA2B 3QAXA 2D5WA 5A5XB 3ZKLA 1DPPA 5HM4B 1MDP1 1B46A 4YAHX 2I49A 3U8QA 3CFXA 3PU5A 3BKIB 4RA1A 2REJA 4G68C 4GLIA 1SW2A 2RC7A 4GQOA 3IOVA 3TZAA 2VP1A 2O6AA 4GXSB 1MQGA 5I57B 3PUYE 5IAIA 2QPQA 4ZE9A 4NMYA 5KDTB 4M1VA 2R9JA 1QVSA 4F1VA 4XKNA 4C1TA 2NOOA 4C0RA 2AL4A 2V25A 1S9TA 4JWXA 4UACA 3QUFA 2XXRA 4PQJA 2DVZA 2DE4A 4OETA 3RNNA 3DELB 2XXVA 4H67A 5I2NB 5DVJA 4O3AA 4U21A 1MQIA 5EHMA 2UYEA 3E3KA 3TFLA 5H8SA 4QHQA 2OCUA 1BIYA 1TT1A 3R7XA 1OMPA 2DXYA 1I69A 4NE4A 4GFRA 4YZZA 2REGA 4MH5A 2DOJA 1II5A 3MPKA 2GRVA 4H5GA 2UVHA 1B5HA 5AA2A 4QSCA 3QYTA 1Y4CA 2ONKE 3UK4A 4I8CA 1B58A 2GHAA 4DXBA 1ELJA 3HPIA 1TWYA 4PFWA 1FCKA 2RKMA 4GRKA 3SEUA 1H45A 5CMCA 3Q27A 2RCAA 4G2ZA 2OWSA 1Y3QA 3RPWA 1A54A 3PPPA 3VXCA 3ILUB 4QF9A 2QS4A 1MQDA 3Q26A 1QUIA 1OIBA 2G29A 4TLMB 1IXGA 1JETA 3JV9A 3ZSFA 2XX7A 4R6KA 4TOZA 5CMKA 5I59B 1Y4TA 5JTYB 2PYYA 4YKKA 3VE1B 4MFIA 1B7HA 1BLFA 4NF4B 2FA7A 1O64A 4IY5A 1BTJA 1FW0A 4R2FA 4RYAA 3VVDA 4JWYA 2O7UA 3A3CA 2QRYA 4H6DA 1MQHA 1P1WA 3U93A 1XOCA 1MY1A 1A7LA 5ELVA 2OLBA 4LQ5A 1D9YA 1A8FA 3PUVE 3OENA 4NEDA 4X1BA 1B7UA 2F97A 2B65A 5H8NA 2Q89A 2QJEA 5DEXB 4BDLA 3PPOA 2I48A 4F2OA 5H8QB 1SW4A 4N07A 1F9BA 3OEMA 3OO8A 4LVQA 4G77A 1Y9UA 2X7QA 1H3DA 1MG1A 3MQ9A 3O66A 2ESNA 5LOMA 3GBAA 4X9TA 1SYIA 1O63A 2ZYOA 1MH4A 3ECRA 1H43A 4OTEA 3CRBA 1B3LA 3T93B 1SW1A 2O1MA 4FECA 2VOZA 2DP8A 1OVBA 3LR1A 1I6AA 2WKYA 3CG3A 2ZNSA 1B5IA 3PGFA 3O6HA 3VLWA 2ONRA 3MJNA 4LUBA 1MXVA 2XD2A 1T0KA 1PDAA 2UVGA 1B32A 2QL3A 1A8EA 3KSXA 3HO7A 3KBRA 3K02A 4F1YA 1VSOA 1HSJA 2Z8EA 3IOUA 1S7YA 4P0GA 3IAZA 3UA8A 2YJPA 5JEIA 3K0VA 1XVXA 2XXQA 4KR5A 2I0CA 3D4GA 4H1XA 4KYSA 5F1QA 4MF3A 1AIVA 1UIVA 3B6QA 3MVYA 3KGCA 3OO7A 3FZVA 4U2RA 3FJMA 3OD7A 1DTGA 4NF5B 4BDQA 2F36A 4DXCA 1XVYA 4LONB 2A5TB 5TPAA 3QUJA 4N6PA 2HCAA 4F3SA 4YICA 1B2HA 3HV1A 1URDA 2PBWA 2GHBA 3G3JA 2FYIA 3KG2A 1NNKA 3H6TA 1LAHE 3R26A 2NVUB 3TMGA 4H5FA 1XS5A 4U4SA 3EHUA 3S9EA 3QK6A 5FTHA 2W7YA 4YMAA 3K1PA 2O1LA 3C35A 2F5XA 1MY0A 2PMSA 3T66A 2XXPA 3VFJA 4EF2A 2NXOA 3E13X 3O6GA 4IY6A 3VV5A 4ZEKA 2XX9A 3L6HA 4Q8RA 1JVYA 3LUYA 2H9BA 3FUZA 1NNPA 2Z22A 3IB0A 3K6XA 5AA4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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