1IITA

Glur0 ligand binding core complex with l-serine
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
226
structure length
221
Chain Sequence
GSAMALKVGVVGNPPFVFYGAFTGISLDVWRAVAESQKWNSEYVRQNSISAGITAVAEGELDILIGPISVTPERAAIEGITFTQPYFSSGIGLLIPGTATPLFRSVGDLKNKEVAVVRDTTAVDWANFYQADVRETNNLTAAITLLQKKQVEAVMFDRPALIYYTRQNPNLNLEVTEIRVSLEPYGFVLKENSPLQKTINVEMLNLLYSRVIAEFTERWLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for ligand binding to GluR0 ion channels: crystal structures of the glutamate and serine complexes and a closed apo state.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Synechocystis sp. pcc 6803 substr. kazusa
molecule keywords Slr1257 protein
total genus 69
structure length 221
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iitA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iitA02
1A99A 3MP8A 1IXIA 3KG2A 3W9WA 2R6GE 1ANFA 3TEPA 1VFEA 1EU8A 4F22A 2Q8JA 3LSFB 1DMBA 1IZ1A 3TELA 1MXVA 3HPIA 4GXAA 5H8QA 2V3QA 4U4XA 2XXHA 5H8HA 4K3FA 3CG1A 2LAOA 3T96B 5H8QB 2PT1A 3K4UA 2O68A 4UACA 1B3FA 2I49A 5CMCA 4YKKA 3T66A 3U94A 4OFJA 3VXCA 1PB7A 3Q28A 3RN8A 4N07A 4NE4A 3FGSA 3TUSA 4WEDA 5ITPA 1BTJA 5EHSA 3C34A 5BUUA 4I8CA 2HFBA 4R73A 4HW8A 3HHGA 3QAXA 1JNFA 1URDA 4XKPA 3FVGA 3QIMA 1YCJA 5FHOA 5BWJA 1I69A 3WAFA 1OIBA 4ZEBA 3TTRA 4ZE9A 5CBSA 1MXUA 1SW2A 1TWYA 4EQ9A 3OO8A 4PQJA 2RCAA 3V5AA 4JSDA 4RY1A 5DVIA 4OZ9A 4BLAA 1I6QA 2XD3A 1NH8A 3TTLA 1R9QA 3VVEA 3OMBA 4GL0A 3R7XA 4F39A 4OEUA 2F97A 1N7XA 4EDPA 2I4BA 1OQGA 1B52A 1TFDA 1DOTA 2O69A 4OXVA 5ICQA 2AIXA 4TQUQ 3JYRA 4GWOA 1T0KA 3EHSA 1N0TA 2Z8EA 4ZE8A 2Z8DA 3RPWA 4KCCA 4O3AA 4IGTA 4R6YA 3F11A 3U93A 3MQ9A 4FAJA 2FNCA 2H98A 4IO5A 3IR1A 1PDAA 1WVJA 4RJZA 1B3EA 2P1SA 3SEYA 3MC2A 1DPEA 3H3GA 2QS1A 4LP2B 1IUDA 4QFPA 3LSLA 4YAHX 4JDFA 3H6VA 1UTBB 1GR2A 3D4CA 3MP1A 3KOTA 2PVUA 5JK4A 2DWAA 3CI8A 3VDFA 1JW5A 3CR9A 4R9FA 4H65A 3PD8A 3THIA 2UYEA 2Y7KA 1AOVA 4JSOA 3CFXA 3JV9A 4YB6A 4KFQA 1MS7A 2F7AA 4YB7A 2XXTA 4RK9A 3OO9A 4ZEFA 1B3HA 1LB9A 3O29A 3LSXA 4U2RA 4TLMB 1ZTYA 2WKYA 1POTA 1LFGA 1B46A 3AXFA 1JVYA 5IAIA 3EPEA 4ZEKA 4H1XA 4PFTA 1FQDA 1R6ZA 3UP9A 2XHDA 3KFMA 3N5LA 2O84X 3PPRA 3MP6A 4IY6A 3KN3A 4POXA 3RGYA 3I6VA 3TDJA 3PPPA 5DT6A 4YICA 3MPKA 3OENA 3MVWA 2I6EA 4NF6A 1BLFA 3ILUB 3K0VA 1MDP1 2DE4A 2XD2A 4DLDA 4OESA 1S50A 4ZECA 4EUOA 1H44A 5AA2A 1MQJA 4ND9A 5M2VA 4LA9A 3FVNA 1SBPA 3K01A 4R74A 2OZZA 1LFHA 3QYTA 1Y3PA 5AA2B 3HO7A 2XXPA 3OSQA 1L5TA 1YTVA 4HS7A 1N04A 2X26A 3SEVA 1A7LA 4LQ2A 4RPNA 1FCKA 1NNPA 4F3PA 5I2NA 3GXAA 4F19A 5FTIA 4ESWA 4QFNA 1SI1A 4F18A 4NF8A 4H5GA 3EF7A 3RTFB 3IJXB 3CIJA 3ODBA 2CZLA 3O28A 3FXUA 5H8SA 4U21A 1XT8A 1AL3A 1NH7A 2O6AA 4KYSA 1PB9A 4KYDA 1US5A 2DVZA 5H8FA 3Q25A 3D4GA 2ALUA 3ZS6A 1N7WA 4IY5A 4O3BA 3IORA 2HQ0A 3S2VA 3T22A 1B5IA 1FTKA 2PT2A 2HCAA 3KN7A 3VLUA 2H99A 1JVXA 4E0WA 4QFKA 1GTKA 5CI5A 5I57A 1II5A 4F2OA 2PBWA 3BKIB 3N26A 4DXUA 3G3GA 1MPCA 1S7YA 3W9VA 1FQFA 4OEVA 3IB0A 3PPNA 5IKBA 1XOCA 2DP8A 4QF9A 4F1VA 4JWYA 3G3IA 2DE3A 2PMSA 4M1VA 4H67A 5FTHA 4DXCA 1Q1KA 3LR1A 3GZGA 4ISUA 1ELJA 4BDQA 3TCGA 4WXJA 2DWJA 3E4RA 2PYYA 4LZ7A 1UTHB 4OFLA 1VSOA 5CM6A 5I59B 1N84A 5AA3A 2YPNA 3C33A 5CC2A 1LBCA 4F31B 3FASA 5TU0A 2NWJA 1JEUA 1ZU0A 3I3VA 1MDQA 4OHNA 4NF4A 2ONKE 4H5FA 3K6XA 4FECA 1A8FA 4NF4B 1SI0A 4JXIA 2I3VA 3TAJA 3Q27A 1FTOA 4FJPA 1URSA 3KSJA 1B05A 1JW4A 3OEKA 2O51A 4LATA 4OENA 3RTWB 3CRBA 4OYVA 5H8NB 1Y4CA 1RKMA 1MQGA 3OXNA 3B6TA 1ZIUA 1UQWA 2P2AA 2UYFA 3FZVA 4YKIA 5EYFA 4G2ZA 2O7IA 3S9EA 1F9BA 2Y7WA 1FQCA 3M3LA 3MZ1A 4U1OA 3S9MC 1B51A 1LCTA 1JW1A 1Z7NE 3CFLA 1B32A 2V3UA 2XXYA 4YB5A 1ATGA 3W15C 1P1OA 2Z23A 4NMYA 2RINA 5DYHA 2ONRA 4RPOA 1CE2A 2XXRA 2ONSA 3VFJA 2E0SA 1FQAA 4G68C 3V83A 3PV0E 3O6IA 4DXBA 2UVHA 3FVOA 5DTBA 5H8HB 3K6WA 3FUZA 4ECFA 2H5YA 3IO4A 1IQ7A 3B6QA 1N3WA 1LB8A 4G8HA 2XXIA 3QK6A 2A5TA 2F34A 3V8XB 2Z22A 3ILTB 3LC8A 4LZ8A 4UA8A 3HN0A 2OWSA 2Q89A 3H6UA 3H6TA 3IOWA 1RYOA 3KGCA 2H9BA 3UA8A 4MLVA 5TP9A 1DSNA 3UORA 3MVZA 2R9JA 1TT1A 4G8MA 5TP9B 3DP6A 1P1WA 3RNNA 3TZAA 1IXGA 1UIVA 1MM6A 2DXYA 3USDA 2ABHA 1MY1A 5KDTA 3N6UA 2ZNSA 3K6VA 4JWXA 4XIGQ 3WAEA 3O66A 3HCQA 1O64A 5K2YA 2QL3A 2V25A 1ZJLA 3OOAA 1NKXA 3FJMA 4IO3A 4FEDA 4GIZA 1B7UA 4Q5TA 5FHMA 1POY1 2QS2A 2V3TA 4U22A 1P1NA 2F5XA 2I58A 2ESNA 5JTYA 1RYXA 1N3XA 3IB2A 2XXQA 4I1DA 2I0BA 1BKAA 3O6GA 5DEXA 3QXMA 3MVYA 5JTYB 1D9YA 3IB1A 2F8DA 3GBBA 1MQHA 1URGA 3KJ7A 3EN3A 4GQOA 1AH5A 3PUWE 4ELRA 2H25A 2GHAA 4XKQA 4KPTA 4THIA 3H7MA 4GOTA 2UVJA 2XXXA 3C31A 4FORA 2DE2A 1JQFA 2QS4A 2QJEA 4NTLA 2RC7A 4BDNA 4I9DA 3K2DA 4GL8A 4RYAA 1B2HA 4IGRA 2XX7A 1KWHA 3MAMA 3PUXE 1A40A 3KOSA 4NF5A 3C35A 3KBRA 3K1PA 1NFTA 1MY3A 3M8UA 1AIVA 2F36A 1B0LA 4U23A 1Q35A 3IOUA 1WODA 1M5DA 1PBQA 4XXUA 2NOOA 3RT6B 2UXAA 4C0RA 1FQEA 5AA4A 3O9PA 5TPAA 3U8QA 2B3BA 1MRPA 4ELOA 5L8DA 3DLNA 2F6PA 4KI0E 4KD5A 3EHUA 3PU5A 3S9LC 1FTLA 4OFOA 1WDNA 1A55A 2NUVA 2OWTA 4MFIA 3FIRA 2Q88A 1SYIA 4HCWA 4FEBA 5ITOA 4G4PA 4X1BA 1LAFE 1TFAA 5A5XA 5AA1A 3VVDA 4QFLA 3MW0A 1MH4A 1VR5A 2ANJA 1I6BA 3SETA 2DWHA 3VLVA 2IEEA 4NF6B 2UVIA 4YZZA 1PEBA 2DS9A 3I5OA 2ZNTA 4MF3A 4LUBA 1SDXA 3FV1A 4OVJA 3GBAA 4KYEA 1B1HA 1PBPA 2QMXA 3DM0A 2VHAA 5EHMA 2OK2A 3OEMA 3KJTA 3TTMA 4DDDA 1VE4A 1AMFA 3O2AA 3KZGA 4LZ5A 3M3KA 4RK2A 1LAXA 2V93A 4HTGA 4YMAA 3ZSFA 1LGBC 5I2NB 3FJGA 4F1UA 1B40A 3KN8A 4ELQA 3T9VA 5I58A 2I4CA 5AA2D 2B3FA 5DVFA 4IO4A 3TQLA 4NF8B 3MVXA 3S4UA 4XKNA 3ZKKA 3P7IA 1M5CA 2R71A 3G3JA 4DCXA 4NWCA 4ZEDA 2ZMBA 1B4ZA 3IAZA 5CRYA 5J1DA 3FD3A 2IA4A 4ZEIA 3E9XA 3OO7A 4EF2A 3HV1A 2ZYOA 1DTZA 3UGWA 4IO2A 3TQWA 4ONYA 4R6HA 5H8FB 3RY3A 4JBZA 3PUVE 4I62A 4RNSA 4KR5A 1OLAA 5ICTA 4GLIA 3C9HA 1B9JA 2D5WA 1B58A 1USYH 2THIA 1MPDA 3H06B 2NXOA 2D21A 3MUQA 3QSLA 1LLSA 4OTEA 3KEIA 2AL4A 1YPNA 3G3HA 5I57B 2XX9A 5I2KA 1M5BA 1NNTA 4H8IA 4G8NA 3A09A 1H43A 1QULA 2DSFA 4NEDA 1B7ZA 5I2KB 1MG1A 3T93B 4Z7EA 3O97A 5B7DA 4IO6A 2GRVA 2HAVA 3H6WA 2W7YA 3G3FA 4YKJA 3S9NC 3PGFA 5KCJA 4QFOA 1TXFA 3MZ9A 1MH3A 4U1ZA 4MBPA 1IXHA 5HM4B 4OWDA 1A8EA 2M8CA 4P11A 5L9OA 5KCJB 2V84A 1Y3NA 4AQ4A 1LAHE 3RLFE 3IL1B 3CFZA 3R6UA 3C4MA 1SQYA 2YJPA 1FW0A 4R9GA 2E1SA 2VD3A 4GF8A 5HBCA 4MH5A 4ZS9A 3CSBA 1SD3A 3IK6B 4X1DA 3VLWA 4GVOA 4DE8A 3Q29A 3MBPA 1NMUA 2I0CA 3V89B 3L6HA 2QS3A 4POWA 2F35A 3JZJA 3ONMA 4QSDA 4LONB 1MPBA 1SVXB 3G3KA 2QMWA 4EF1A 4NWDA 4G68A 2REGA 2OLBA 1LBBA 4KQPA 3TYHA 1QW0A 2VD2A 1LSTA 1MY0A 4FE8A 4XKRA 4EXLA 2DYXA 3TMGA 1MXXA 2OCUA 3GLBA 3VV5A 3PD9A 1FTMA 2Z8FA 3KSXA 4XTCQ 2HEUA 1QUJA 3OO6A 3UN6A 5ISUA 1BP5A 5AE4A 1BIYA 3BBRA 1MY4A 2ZYMA 1EZOA 5K2XA 3MPLA 4YKPA 4MLQA 1A54A 4PFUA 1O63A 4R72A 3BFTA 1GGGA 3OELA 3TTNA 2A5TB 3TCFA 1B0HA 2FA7A 2OJTA 1MXYA 5ELVA 4BDLA 3TCHA 3PUYE 3M3FA 2X7PA 5KZTA 1B3GA 1Y3QA 2VP1A 4HCYA 1MM7A 3PMWA 2HXWA 4YMBA 3SEXA 4RA1A 2REJA 2F7CA 4C1TA 3LSWA 3HHFA 3SERA 2UVGA 5L9MA 5KDTB 5L9SA 1QVSA 2XXVA 1B3LA 2RC8A 1H76A 4PFYA 2GH9A 4R6KA 4PE5B 3T9XB 1B4HA 1IEJA 3C36A 1MXWA 4IO7A 1Y4TA 2AL5A 3EHTA 3TODA 1B5JA 3EQ1A 4R2FA 3U1OA 1ZKBA 1LFIA 3DP4A 2HZKA 4QHQA 4F3BA 4BDMA 1PC3A 4TOZA 2FYIA 2RC9A 5DEXB 1SYHA 4EQBA 3FXQA 4GRKA 1IIWA 3MZBA 2XXWA 2DWIA 4FATA 3IO6A 1P1UA 2BJJX 2HAUA 4R2BA 2P0SA 3FXRA 3HSTA 5F7VA 2KLFA 3VXBA 2DQVA 1B7HA 4L17A 1Y1MA 3IOVA 2AYSA 3SEUA 4AB5A 5CMKA 4E0XA 3U92A 2F78A 3VE1B 4EQ7A 1QUIA 3LUYA 1D4NA 2VGQA 3K1NA 3PMXA 1J1NA 3E3KA 2DOJA 1EZPA 2XXUA 3PUZE 1Y9UA 4NF5B 4Q30B 2Q9TA 2Q2CA 1YAEA 4QSCA 2Y7IA 2VOZA 1QKBA 1I6AA 2RKMA 4U4SA 3SKPA 1UTBA 2QSXA 1HSJA 2QPQA 3E13X 3UK4A 4H8JA 1GV8A 3IJOB 3RT8A 2G29A 1EZ9A 4KHZE 1Y20A 3H4ZA 1ZMGA 1PB8A 1S9TA 1MQDA 5AA4B 1JEVA 4M4GA 1NNFA 1HSEA 3L6GA 5TPAB 4H6DA 2HZLA 1B5HA 3QUJA 1P99A 3R26A 4X48A 3SESA 1OMPA 3O6HA 1MQIA 1D3KA 4P0GA 3TFLA 3LBSA 4BDRA 3ECRA 2ZYNA 1QJMA 3QUFA 4ELPA 3MWBA 5A5XB 2G93A 4ESXA 3FJ7A 1P1QA 3FV2A 1IITA 4GFRA 1FQBA 1R9LA 4DIGA 4ZZAA 3FATA 4RXLA 4F3GA 4H0WA 1B1XA 4OQOA 3OSRA 3OD7A 3TTKA 2Q2AA 4LVQA 2DXRA 5DVJA 3A3CA 3MJNA 4WKMA 2X7QA 3PMVA 4ZZEA 4YU0A 4F29A 3K00A 1QUKA 2Y7RA 2ZXTA 1XC1A 1OVTA 4PP0A 2F6GA 5FHNA 3Q26A 4F1YA 3K6UA 1XVYA 3CVGA 5I58B 1M5FA 5F1QA 2I48A 4Z0IA 2O1LA 3ZKLA 1R1NA 5JEIA 1O7TA 3SDFA 3BFUA 3N94A 4Q0CA 4R75A 1OQHA 3T9HB 4OETA 4F3SA 2O7UA 4JWOA 4ZDMA 4DZ1A 1XS5A 3TPAA 1LAGE 2PX1A 2RF1A 3C32A 1USYE 3B7DA 4OERA 4N13A 1SW4A 4N6PA 4IB2A 1QKAA 4PFWA 2NVUB 3RUMA 1HSLA 2XX8A 4C1UA 5B70A 4X9TA 1LCFA 2YLNA 2A5SA 1CB6A 1OVBA 4O3CA 4LQ5A 1N76A 1XHYA 4WEPA 5I56A 1SW5A 1D9VA 1H3DA 5LOMA 1B6HA 5I56B 1VFDA 5CBRA 2Y84A 4AB6A 1Y1ZA 3IOTA 2I3WA 1ZLQA 4FIMA 3N6TA 4F2QA 2ZYKA 4DCYA 2RCBA 5I84A 1IXCA 3A3UA 3PPOA 1NL5A 1GVCA 1UTHA 4TLLB 3UIFA 5I59A 1ZBMA 1MXZA 3H03A 1JETA 2F7BA 3CG3A 3TKDA 1M5EA 2ZNUA 4KCDA 1H45A 2Y7PA 1Z7ME 4G77A 4OMBA 4JB7A 2D3IA 4GD5A 2CMOA 3RQTA 2QRYA 4QSEA 3IX1A 2DVCA 3K02A 5HPQA 5H8NA 3B6WA 2GHBA 3FVKA 5CMMA 2GFEA 2B65A 1US4A 1SW1A 2H4IA 4P0IA 1DPPA 2O1MA 4GXSB 3VVFA 4PETA 4EXKA 3PPQA 3T9UA 3CSGA 1UIUA 1NNKA 3SEWA 2OBGA 1XVXA 3K1MA 1FTJA 3G7WA 3U72A 3DELB 1DTGA 1EH3A 1OLCA 4Q8RA 4QRZA 5CMBA 4G68B 4BDOA 3DP8A 1MY2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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