1IQ7A

Ovotransferrin, c-terminal lobe, apo form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
343
structure length
341
Chain Sequence
RIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESCSKDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Anion-mediated Fe3+ release mechanism in ovotransferrin C-lobe: a structurally identified SO4(2-) binding site and its implications for the kinetic pathway.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Ovotransferrin
total genus 102
structure length 341
sequence length 343
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A02
1XVYA 5TPAA 3M8UA 1ZTYA 4TLMB 3OEKA 1QUIA 3MZ9A 2ZNTA 4I9DA 4NF5B 2O6AA 3K01A 2XX9A 4PFTA 3S9MC 2LAOA 3ODBA 4NWCA 1B3LA 4LUBA 4OQOA 4U4SA 3R6UA 5HBCA 1M5DA 4ECFA 3V89B 4I8CA 2XXRA 3TQLA 5CMCA 4I1DA 2Y7IA 2RKMA 4KYEA 3OD7A 3FD3A 3BFUA 4M1VA 5I58B 3MVWA 3K6WA 5DVFA 3H6WA 4DXCA 2BJJX 1UIUA 2GHAA 3SEUA 4EQ9A 5A5XB 1QUKA 3N94A 2ZNSA 5H8QB 2QMXA 3DLNA 2ZYKA 3FVGA 3FJ7A 3OMBA 4OESA 4YB6A 4QRZA 3IX1A 4FIMA 1SW2A 4H6DA 5IKBA 4F2QA 3V83A 4Q30B 1A8FA 3O97A 4O3CA 5AA2B 1P1WA 1VSOA 5L9SA 2F97A 4R6KA 2ESNA 1TFAA 1O7TA 2XXVA 3T9VA 4JB7A 4N07A 4WKMA 2O1MA 2F7AA 5H8NA 4NF8A 2F7BA 1LSTA 4F3SA 1NNPA 1IXIA 3KFMA 2O69A 4RNSA 2DP8A 2OWTA 2F5XA 4OFOA 3KN8A 3W9VA 4HS7A 1B32A 3W9WA 3UORA 4F22A 4G68C 2ZMBA 3HCQA 4MLQA 4X1DA 3O9PA 1MDP1 4I62A 2V3TA 4G77A 1P99A 5TP9B 1B3EA 2I4CA 4LZ8A 2QL3A 3FV1A 2ALUA 2OWSA 4YZZA 4RA1A 2Y7PA 3I6VA 3Q28A 3U93A 4ELRA 3FUZA 4M4GA 4FATA 5F7VA 4AB5A 4OFLA 3P7IA 3PUVE 4ZEKA 3W15C 1ANFA 1O63A 5J1DA 4YKJA 2NUVA 1DTZA 2H98A 4R74A 4C1UA 1OQGA 5ELVA 1HSLA 1P1NA 1GV8A 2DOJA 1BLFA 5AA4B 1WDNA 4L17A 2D21A 1NKXA 4NF4B 1ZIUA 1Y3NA 3DP8A 4NWDA 2XX8A 2H5YA 2AL4A 4LP2B 2QS4A 4NMYA 3Q29A 3IB2A 4PP0A 3KBRA 3TCFA 3MPKA 2E1SA 4KYSA 3K6UA 2OLBA 1B58A 2I4BA 3PUXE 5B70A 1II5A 1FQBA 2Y7WA 4LATA 2NWJA 2I3VA 5I57B 4EXKA 1LAHE 3C36A 1MPCA 4MLVA 2Q8JA 3RQTA 2ONKE 2CZLA 2PT1A 4Q5TA 3KEIA 3TTLA 1BP5A 1FTMA 1VFDA 3G3HA 4OZ9A 3B7DA 3RY3A 1AIVA 1ZLQA 3TAJA 1M5EA 3GBAA 2O7UA 4NF6A 1YPNA 3FXQA 2H9BA 5DT6A 3KJTA 2OJTA 3C34A 4JBZA 2X26A 3PD8A 4G8NA 5L9MA 3O28A 1RYOA 1Y4TA 4AB6A 1FQCA 3CFZA 2Z22A 3HSTA 1B7UA 4ZZEA 3JZJA 3GXAA 3UGWA 1VE4A 2G93A 4EF2A 5I59A 1HSEA 1B51A 3MP1A 2P1SA 3UA8A 3IOVA 3IORA 4G68B 3A3UA 1Y4CA 3U8QA 3KG2A 4KYDA 4EF1A 4ZE9A 1CB6A 3KZGA 3B6TA 4F19A 4TQUQ 3VVEA 3E13X 4OETA 4RK9A 3KN7A 3UK4A 4JSOA 4N13A 5DVJA 2I0BA 3MWBA 2UVJA 3QYTA 3PGFA 4EQBA 3FGSA 1I6BA 2I3WA 1B05A 4QSCA 1B0HA 2OBGA 3PMWA 3FXRA 4JWYA 3FV2A 1SW5A 4BLAA 4HCWA 2QJEA 5H8FA 3R7XA 1UIVA 4RPOA 5HPQA 2I0CA 1AL3A 2QRYA 2R71A 3PPPA 3OSQA 5DTBA 1IUDA 3I5OA 4PFUA 3VLVA 1PBPA 1IITA 3FIRA 3VVFA 5I84A 4ZEBA 1URDA 3K1PA 3DM0A 2XXYA 1WVJA 1OVBA 1YAEA 5H8HA 1T0KA 3DP6A 4FE8A 1PDAA 3DELB 3PUZE 4IO2A 1EH3A 1MXXA 4DZ1A 2ZXTA 3MQ9A 2I49A 2WKYA 1H43A 3TCGA 4LZ5A 3MPLA 1KWHA 3A09A 4MFIA 3CI8A 1FQAA 2XXTA 3QIMA 5CBRA 3DP4A 4OFJA 4K3FA 2RF1A 1P1UA 5FTIA 4QFOA 1MS7A 4KFQA 4OWDA 1B1XA 4RJZA 4NTLA 2B65A 1QVSA 4DIGA 1Y1MA 1US4A 3UN6A 4PFYA 5CMBA 2G29A 1MY4A 4XKQA 1XVXA 3OO7A 2Z8DA 4DLDA 2I6EA 1GR2A 4FJPA 1UTHA 1XHYA 5LOMA 2A5TB 3KN3A 1IIWA 1FQDA 1B4HA 1AH5A 1B0LA 3T66A 4FECA 1UTBA 2OCUA 3IAZA 5BUUA 2AYSA 2O1LA 3OO6A 4ONYA 2ABHA 3V8XB 3FATA 2XX7A 3MZBA 4XXUA 1HSJA 3PPNA 4QFNA 1GGGA 1MQJA 1URGA 3USDA 1A40A 3S9EA 1JQFA 2DWHA 5I2NA 3RN8A 4PETA 2XXHA 4KHZE 3HPIA 2RC7A 4XTCQ 5FHNA 5KDTB 2NVUB 4WXJA 4DXBA 3IJXB 3TTKA 4IO7A 3GLBA 3U94A 1FTKA 3IO4A 1LAXA 1SDXA 2H99A 2AL5A 1MPBA 3MBPA 3PUYE 2H4IA 4KQPA 4Z7EA 3CSGA 5CM6A 1GTKA 2IEEA 3PU5A 5DEXA 3ILTB 3UP9A 1LB9A 2GFEA 3SESA 3VDFA 1N7WA 4LA9A 3CG3A 4QFKA 2CMOA 1YCJA 2XD3A 1NMUA 3CFXA 3VFJA 2RCBA 2OZZA 3N5LA 1N3WA 4F31B 2UYFA 4TLLB 1MRPA 2Z8FA 4QF9A 3G3GA 4ESWA 2QS3A 4OTEA 1MH4A 3IO6A 5TPAB 3KOSA 1Q1KA 5I56A 1SW4A 1B6HA 3PMVA 1A55A 3VV5A 1L5TA 4KCDA 3K02A 1IXGA 3T22A 5KCJA 3E9XA 2Q2CA 1Y9UA 4DDDA 4ZECA 3EF7A 1MG1A 3JV9A 3E4RA 2VGQA 4ELPA 5JTYA 4KR5A 3Q26A 2UXAA 2DS9A 3FXUA 4U22A 3KSXA 1VFEA 4U21A 2REGA 3K1MA 3TTMA 4KD5A 3G3KA 4LZ7A 3RT6B 4YMAA 1MM6A 1DMBA 4G8MA 3E3KA 3EHSA 1J1NA 3K6VA 3MW0A 1B46A 3TQWA 1QKAA 4U4XA 3N6UA 5CC2A 1USYE 2PX1A 3IL1B 4MH5A 4R9GA 3O29A 3H06B 3MVYA 3C35A 4RXLA 5CI5A 1NNFA 4DCYA 2ONRA 5FTHA 1Y3QA 2Z23A 1B9JA 1OIBA 3T9XB 1FTOA 1SI0A 3FJGA 3GBBA 3ZS6A 2XXUA 2Q9TA 4F39A 4MF3A 3TTRA 4PE5B 4LQ2A 4GLIA 3UIFA 1B5HA 2M8CA 4GXSB 2XHDA 4BDNA 3WAFA 4ISUA 2HCAA 1MM7A 3G7WA 1NFTA 1POTA 4P11A 3BBRA 4OXVA 4YB7A 1WODA 1S7YA 2HFBA 4BDLA 3N6TA 1MDQA 3IOUA 3FVNA 4F29A 1LAGE 4ND9A 4NF8B 1S50A 2DE2A 1B3HA 4G68A 1I6QA 3L6GA 2XXPA 1RKMA 2QS2A 3D4GA 5H8SA 1BIYA 4Q8RA 1URSA 4GL8A 2XXXA 5CMMA 4ELQA 2RINA 3TPAA 3O6IA 3KJ7A 1LBBA 3U1OA 1H76A 2RCAA 3RT8A 4OHNA 1B2HA 1ZU0A 1PC3A 1EZPA 3MVZA 1I69A 4LONB 1EZOA 2F8DA 3IR1A 1ZBMA 4H5FA 4RPNA 4IO6A 4F1VA 1NH8A 3T9UA 4RYAA 3GZGA 3OENA 1XT8A 2Y7RA 4H65A 2D3IA 2B3FA 1S9TA 1TXFA 1Y1ZA 3VXBA 3HO7A 1DTGA 2RC9A 3M3LA 3OSRA 3CIJA 2E0SA 3IJOB 4GIZA 2KLFA 1A54A 2R6GE 3WAEA 5I2KB 5L9OA 3H3GA 3O66A 4G8HA 3OOAA 1JW5A 2VD2A 2W7YA 2V93A 3OXNA 4FEBA 3QUFA 5F1QA 1N76A 1OVTA 1B1HA 4YAHX 4FORA 1MY0A 1XC1A 4H5GA 5EHMA 1VR5A 4IB2A 2YPNA 2HZLA 1M5FA 3CFLA 5DYHA 1JEVA 3ZSFA 4ZZAA 2DE3A 4H1XA 5AE4A 3CG1A 1LBCA 1PB9A 3H6UA 4IO4A 1FQEA 4XKNA 4HW8A 4KCCA 4EUOA 1LB8A 5BWJA 3ZKLA 2RC8A 4C0RA 1SD3A 2X7PA 4NF6B 3SEVA 1H44A 1CE2A 4KPTA 3M3KA 1Y3PA 1DOTA 4U1OA 2HAVA 4EQ7A 1IXHA 5HM4B 4GXAA 5I59B 3C4MA 5L8DA 3CR9A 2PT2A 1MQIA 1MPDA 4NF5A 2F78A 3RGYA 3JYRA 5CBSA 1B52A 1NH7A 4E0XA 3CRBA 3LUYA 3R26A 1QKBA 1NL5A 5CRYA 3S4UA 4FAJA 1BTJA 4YKPA 3HN0A 4IY6A 4IY5A 1B7ZA 3RNNA 4JWOA 3Q27A 1EZ9A 3K6XA 1TWYA 3OEMA 4KI0E 5I58A 5H8FB 3IOTA 3OELA 2Y7KA 3O6GA 5FHMA 4FEDA 4BDRA 4G4PA 5A5XA 3PV0E 4TOZA 1B3GA 5H8QA 3FVKA 2Q88A 1OMPA 3K4UA 1R6ZA 3MC2A 4XIGQ 1Y20A 4OVJA 4YU0A 3SEXA 1B5JA 1SYIA 4G2ZA 4N6PA 3HHGA 3ILUB 1OLCA 2AIXA 1LLSA 5AA2A 2P0SA 1A8EA 3TCHA 3LSLA 1DSNA 2VD3A 3T9HB 1MXZA 3PUWE 3IOWA 5ICQA 1LCTA 3SKPA 3TDJA 3S9NC 4R72A 4R2FA 2OK2A 2O7IA 2THIA 3TTNA 3QUJA 1BKAA 4IGTA 5AA2D 2ZYMA 4U2RA 4OENA 4BDQA 1MY3A 4F2OA 4ZEFA 3ONMA 5K2XA 3RUMA 1QJMA 1SBPA 5TP9A 2A5SA 3RPWA 4GVOA 3THIA 3HV1A 3OO8A 4IGRA 4Z0IA 1SW1A 4UACA 1D4NA 2ANJA 1JVYA 4R75A 4XKRA 4F3PA 4X1BA 1N84A 5ITPA 2QMWA 2DXYA 1TFDA 3C31A 1MXVA 4YMBA 1F9BA 4E0WA 3H7MA 2PBWA 1UTHB 4UA8A 2FYIA 1POY1 3MAMA 2VOZA 3SEYA 3A3CA 4GD5A 2ZYOA 4F3GA 5IAIA 1UTBB 1B3FA 4JDFA 1PB7A 4GFRA 3M3FA 2PMSA 4OEUA 5FHOA 1QULA 2O84X 4YKIA 4WEDA 5AA4A 3LSWA 3EHTA 2DXRA 2PYYA 4NF4A 4H8JA 1MQHA 1ATGA 5I2NB 1R9LA 3MUQA 3MVXA 2YLNA 3PMXA 1B7HA 4O3AA 1AOVA 2F6GA 3H6VA 2HQ0A 4R6HA 1A7LA 2V3UA 1N0TA 3C9HA 2DWJA 2P2AA 5KZTA 4BDOA 1MY1A 3SERA 2UVIA 2YJPA 1D9YA 1FQFA 2V25A 4GOTA 5EYFA 1Q35A 5I57A 2DWIA 1JW1A 5DEXB 1PEBA 4H0WA 1H45A 3VE1B 3LC8A 5AA1A 3PPQA 1DPPA 2DE4A 1M5CA 4F1UA 4JSDA 3K1NA 1N3XA 4ZE8A 1ELJA 5ITOA 4NE4A 1FTJA 4P0IA 4XKPA 3KGCA 2R9JA 3KOTA 1P1QA 2PVUA 3MJNA 1QW0A 3RTWB 3S9LC 4P0GA 2IA4A 3PPOA 4JWXA 5ICTA 3SETA 3N26A 2DVZA 3D4CA 3LSFB 1UQWA 3U72A 3Q25A 1N04A 1B5IA 3H4ZA 5M2VA 4H67A 3TODA 4IO3A 3K0VA 3O2AA 5I56B 5H8NB 2I58A 1LFGA 2XXWA 2GH9A 3LBSA 4JXIA 1IXCA 3IB0A 4DE8A 1OQHA 4QFLA 1RYXA 3BKIB 3QAXA 5I2KA 5KCJB 1IZ1A 4RY1A 5DVIA 3F11A 1NNKA 5JTYB 2DWAA 1SQYA 2F7CA 4R2BA 4O3BA 1MH3A 3K2DA 3H03A 1IEJA 4ESXA 4R6YA 4QHQA 4GWOA 1USYH 1AMFA 2UYEA 2NOOA 2H25A 4DXUA 3TUSA 5CMKA 4PQJA 5EHSA 4IO5A 3QXMA 2GHBA 2O51A 2Q2AA 4THIA 3OO9A 3C33A 1PBQA 3VVDA 2ONSA 2Y84A 1QUJA 2I48A 4MBPA 3TFLA 2VHAA 5AA3A 3O6HA 5JEIA 2HZKA 2O68A 3H6TA 2HAUA 1LGBC 3CSBA 2Z8EA 3TYHA 1DPEA 1SI1A 2UVGA 3K00A 2ZYNA 4OYVA 3VLWA 2XXQA 4ELOA 4U1ZA 3VLUA 3V5AA 1JEUA 4ZEIA 1LCFA 3HHFA 3PD9A 4POWA 4LVQA 2VP1A 1I6AA 2HEUA 1MQDA 2HXWA 4ZDMA 2F34A 1MY2A 2Q89A 1MXUA 2UVHA 3IK6B 1US5A 2V3QA 4YB5A 2QPQA 3PPRA 4F1YA 3C32A 3FVOA 1Z7ME 1EU8A 3RLFE 3SDFA 4F3BA 4OEVA 3MP8A 4HCYA 5JK4A 1ZJLA 1MXWA 2DQVA 3QK6A 1GVCA 2F35A 1LFIA 3L6HA 4YKKA 3FASA 1B4ZA 3EQ1A 4H8IA 4F18A 2ZNUA 1MQGA 2X7QA 2F36A 3U92A 2F6PA 4NEDA 1SYHA 1O64A 3BFTA 1ZKBA 5ISUA 1PB8A 3ECRA 4RK2A 3TMGA 1FTLA 1JNFA 4X48A 4GL0A 3TELA 3RTFB 3CVGA 4C1TA 1ZMGA 4R73A 3G3IA 1R1NA 2A5TA 1XS5A 3T93B 2QS1A 1D3KA 1LAFE 1IQ7A 4EXLA 3IB1A 3LR1A 2FA7A 3MZ1A 4U23A 2QSXA 3B6QA 4HTGA 1FW0A 3ZKKA 4GQOA 4DCXA 1LFHA 4Q0CA 4GF8A 3G3FA 2REJA 4QSEA 3TKDA 3EPEA 5TU0A 3T96B 3MP6A 1TT1A 1MXYA 4GRKA 4YICA 2FNCA 4QFPA 1XOCA 4BDMA 1D9VA 4EDPA 3FZVA 3SEWA 1OLAA 2DVCA 5KDTA 4QSDA 1YTVA 3I3VA 1FCKA 2GRVA 3KSJA 3EN3A 5K2YA 4ZEDA 3G3JA 1Z7NE 4AQ4A 3VXCA 3LSXA 3AXFA 3B6WA 3TZAA 2XD2A 1JVXA 2V84A 4R9FA 1B40A 2NXOA 3EHUA 1H3DA 3QSLA 1P1OA 2B3BA 4POXA 2DSFA 1NNTA 2DYXA 4LQ5A 1JETA 4X9TA 4ZS9A 1JW4A 4OERA 1M5BA 4WEPA 1R9QA 1A99A 4OMBA 1SVXB 2D5WA 1N7XA 3S2VA 5H8HB 3TEPA 3FJMA 2XXIA 4PFWA 5B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XVYA 5TPAA 3M8UA 5IZZA 1NV5A 1ZTYA 4TLMB 3OEKA 1NV3A 4MMPA 1QUIA 3MZ9A 2ZNTA 4I9DA 4NF5B 2O6AA 4PAIA 3K01A 2XX9A 4PFTA 3S9MC 1NI9A 2LAOA 3ODBA 2VPOA 4NWCA 1B3LA 2CZIA 4LUBA 4OQOA 4JVIA 4U4SA 1YZ0A 3R6UA 5HBCA 1M5DA 4ECFA 3V89B 4I8CA 2XXRA 4MHFA 3TQLA 5J16A 5CMCA 4I1DA 2Y7IA 2RKMA 4KYEA 1FJ9A 3OD7A 3FD3A 3BFUA 4M1VA 5I58B 3MVWA 3K6WA 5DVFA 3H6WA 4DXCA 2BJJX 1UIUA 1FPBA 4PAKA 2GHAA 3SEUA 4EQ9A 5A5XB 2PFYA 1QUKA 3N94A 2ZNSA 5H8QB 2QMXA 3DLNA 2ZYKA 3FVGA 3FJ7A 3OMBA 4OESA 4YB6A 2CZKA 4QRZA 3IX1A 4FIMA 2QVUA 1SW2A 4GWUA 4H6DA 1INPA 5IKBA 4F2QA 3V83A 1NV7A 4Q30B 1A8FA 4P47A 3O97A 4O3CA 5AA2B 1P1WA 1VSOA 5L9SA 2F97A 4R6KA 2ESNA 2BJIA 4H45A 1TFAA 1O7TA 2XXVA 3T9VA 4JB7A 4N07A 4WKMA 4P3LA 2O1MA 2F7AA 5H8NA 4P1EA 4NF8A 2F7BA 1LSTA 4PAFA 4F3SA 1NNPA 1IXIA 4RNSA 2O69A 3KFMA 2DP8A 2P3NA 2OWTA 2F5XA 1K9ZA 4OFOA 3KN8A 3W9VA 3KC1A 4HS7A 1B32A 2Q8MA 3W9WA 5EQ7A 1FPEA 3UORA 4F22A 3LUZA 4G68C 2ZMBA 2OX3A 3HCQA 4PGPA 4MLQA 3MYUA 4X1DA 3O9PA 1MDP1 4I62A 2V3TA 4G77A 1P99A 5TP9B 1B3EA 2I4CA 5F24A 2VPNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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