1JNFA

Rabbit serum transferrin at 2.6 a resolution.
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
EKTVRWCAVNDHEASKCANFRDSMKKVLPEDGPRIICVKKASYLDCIKAIAAHEADAVTLDAGLVHEAGLTPNNLKPVVAEFYGSKENPKTFYYAVALVKKGSNFQLNELQGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLLCDLPEPRKPLEKAVASFFSGSCVPCADGADFPQLCQLCPGCGCSSVQPYFGYSGAFKCLKDGLGDVAFVKQETIFENLPSKDERDQYELLCLDNTRKPVDEYEQCHLARVPSHAVVARSVDGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSGDFQLFSSPHGKNLLFKDSAYGFFKVPPRMDANLYLGYEYVTAVRNLREGICPDPLQDECKAVKWCALGHHERLKCDEWSVTSGGLIECESAETPEDCIAKIMNGEADAMSLDGGYVYIAGQCGLVPVLAENYESTDCKKAPEEGYLSVAVVKKSNPDINWNNLEGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNRINHCRFDEFFRQGCAPGSQKNSSLCELCVGPSVCAPNNREGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKSQTVLQNTGGRNSEPWAKDLKEEDFELLCLDGTRKPVSEAHNCHLAKAPNHAVVSRKDKAACVKQKLLDLQVEFGNTVADCSSKFCMFHSKTKDLLFRDDTKCLVDLRGKNTYEKYLGADYIKAVSNLRKCSTSRLLEACTFHKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal and molecular structures of diferric porcine and rabbit serum transferrins at resolutions of 2.15 and 2.60 A, respectively.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords serotransferrin
total genus 219
structure length 674
sequence length 674
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA03
4YMBA 4NE4A 3G3FA 3QK6A 2ZXTA 4FJPA 3FJ7A 5ITPA 4NF4A 5DEXA 2B3BA 3H06B 3S2VA 4HCYA 3TTKA 2F7CA 2H98A 1QW0A 1SW5A 2VGQA 2E0SA 2XXHA 4F3BA 4F22A 1D4NA 1H44A 1MY3A 1Q35A 2H5YA 3TKDA 1ZKBA 3IL1B 2XXPA 1UTBB 3VVDA 5F7VA 3FZVA 2YJPA 4LQ2A 1IXHA 3UGWA 2Q8JA 3PU5A 5I2KA 2HZLA 1B7ZA 4R2FA 1N0TA 4QFNA 4JB7A 3CVGA 3PPOA 3IX1A 2XXUA 2XX9A 1S9TA 1J1NA 3RPWA 3H6VA 1TXFA 4F19A 2H4IA 4G68B 3S9EA 1ELJA 4PFUA 4PQJA 3VLVA 5H8QA 5I2NB 1JNFA 4GRKA 2DWIA 1N84A 2V3UA 1BLFA 4GL8A 3PD8A 2DXRA 1RYOA 2AIXA 3MBPA 3QUFA 2UYEA 5DVJA 4DCYA 4JDFA 1MDQA 3TCGA 3O28A 5HM4B 3WAFA 3VLUA 4OFLA 3TQLA 1B5IA 5AA4B 4OHNA 4MLQA 1XS5A 4JWXA 4RJZA 5TPAA 4KCCA 4YZZA 4RYAA 4IO6A 3RTFB 1CE2A 4FEBA 4ZEDA 2HAVA 4H65A 1MY4A 1DOTA 3LSFB 3VDFA 3Q25A 3TTMA 4DIGA 4RK9A 3G3HA 1MH3A 3ILUB 3T9VA 2NOOA 2NUVA 5CBRA 4O3AA 3RUMA 1XVYA 4N6PA 2THIA 4ESWA 2ZYKA 4R72A 1SQYA 3R7XA 4R9GA 5AA3A 4TLLB 2PBWA 1P1NA 1LCTA 2I4CA 5L9OA 3IK6B 2F36A 4POXA 3JZJA 3OD7A 3PGFA 2G93A 2GRVA 4AB5A 1YPNA 1OLAA 4NF4B 4RNSA 4XIGQ 4R74A 4KCDA 2R9JA 1B5JA 2DSFA 3OO8A 2G29A 3SETA 1LBBA 3OO7A 5B70A 1SW2A 5CBSA 4Q5TA 1A7LA 1XC1A 2UVIA 3E13X 5KCJA 5CMBA 1D9YA 1PEBA 3ILTB 4AQ4A 3RLFE 2AL4A 2GHBA 2O69A 5ICTA 3TDJA 5FTHA 3M3LA 3S9NC 4XKNA 2VD3A 5FTIA 4ZEIA 3A09A 2QMXA 1OIBA 3M3KA 4PFTA 3K1PA 1A54A 1B0HA 3VXCA 1SYHA 3Q26A 3G7WA 4Q30B 5AE4A 1R6ZA 4PE5B 1A55A 1QJMA 3PMVA 4JWYA 4ZEBA 1ANFA 4IO3A 3ONMA 4IO4A 3O2AA 2OK2A 4G8MA 5H8QB 4M1VA 1FTLA 2VD2A 4H67A 5H8SA 2QRYA 4P0GA 2O1MA 4NWCA 3FV1A 3KJ7A 1PB8A 2DWAA 5IAIA 1SYIA 4EQBA 5CC2A 4FATA 3KOTA 4LONB 3QYTA 1MXWA 1JW4A 1TFDA 2Z8DA 1B46A 3PUXE 1OQHA 2YLNA 1SBPA 2WKYA 3ZSFA 3KSXA 3MPLA 1HSLA 1B58A 4X1BA 4P0IA 3MQ9A 4HW8A 4GVOA 2ZYMA 1USYH 1Z7ME 4QHQA 2DQVA 2ANJA 1B40A 3T96B 1JQFA 1IXIA 2F7AA 3OENA 4R2BA 2V93A 1NH8A 3W9WA 1M5BA 1DPPA 2REJA 3PV0E 4LP2B 4F3SA 4I9DA 4BDOA 2XXIA 4OZ9A 4OENA 3FD3A 2XX8A 1Y1ZA 3C36A 4IO7A 3MPKA 5K2YA 3FVNA 4BDNA 3MP8A 4U23A 4GOTA 1BIYA 3OO9A 4PETA 3G3GA 4X9TA 1A8EA 1RYXA 1POTA 3TAJA 1YTVA 3SESA 1AH5A 3JYRA 4U2RA 1IZ1A 2XXQA 2HCAA 3MZ1A 1N7WA 1IUDA 3TTRA 1BP5A 1A99A 2XD2A 3PUWE 2XHDA 1UQWA 1QVSA 1SDXA 1Y4CA 2Q9TA 5L9MA 3O6GA 1O7TA 2I3VA 3QXMA 1A8FA 4BDMA 2DWJA 4GD5A 3TPAA 1MQJA 3LSLA 3KG2A 4FEDA 1H76A 3FJMA 2I0BA 5KCJB 5J1DA 1B51A 2DE4A 1PB7A 4DXUA 1LFGA 3K1MA 1ZJLA 3CSGA 5L8DA 5BUUA 1Y20A 1B7UA 1D3KA 3E9XA 1EH3A 1Y9UA 5F1QA 3IO6A 2QS3A 5DVIA 3U93A 4R6YA 3GLBA 2E1SA 3AXFA 2RINA 5H8HB 3IB0A 1L5TA 4R73A 1PDAA 3C31A 3IR1A 4NWDA 4YB5A 4DXBA 3FVGA 3IO4A 4F2OA 4EQ7A 1XHYA 3FATA 4QFKA 2IA4A 3H6UA 3V89B 2LAOA 2O1LA 3CFXA 2VP1A 2A5SA 4OXVA 3BBRA 3H7MA 3SDFA 4QF9A 4DZ1A 1R9QA 5AA2D 5I57A 1BTJA 3DP8A 1JVYA 1M5EA 1NNFA 4ZZEA 4IO2A 1JEUA 1HSJA 4LATA 3OEKA 2F8DA 2ESNA 1UTHA 3H4ZA 3KN8A 3RGYA 4ELPA 4TOZA 4O3CA 3FUZA 2QPQA 1B1XA 3K6UA 3UORA 3PD9A 3EHUA 3S9MC 5A5XB 2ALUA 4N13A 2HQ0A 3C32A 1I6QA 4DDDA 1EZOA 4ESXA 1D9VA 3QUJA 1FTOA 1SI0A 3THIA 4DXCA 2RCBA 3FXUA 2XXXA 1O63A 4G2ZA 4NF8A 4I1DA 2A5TB 3MZBA 1B2HA 2OWTA 1IIWA 2QJEA 2DXYA 1MXZA 3N6UA 4FE8A 4Q0CA 3I5OA 3PUVE 4F3GA 1LGBC 3TZAA 1QKBA 2M8CA 1MXVA 3HHGA 4EXKA 1IQ7A 4F3PA 2NWJA 4QFPA 2GFEA 5CI5A 1P1UA 5K2XA 4OFOA 4GXSB 3GBBA 2P2AA 3QIMA 4JSDA 3SEXA 1ZBMA 3VE1B 3HPIA 1QUJA 3PUYE 5H8FA 3B6QA 3FXRA 4KYDA 3DELB 2X26A 3IB1A 3HCQA 3TQWA 3RN8A 1B3FA 4PFWA 4H8JA 4OQOA 4QSEA 2DYXA 3EN3A 1M5DA 4R6HA 3DM0A 3FVOA 4OFJA 1YAEA 2OWSA 3PMXA 5CRYA 1MM7A 4QFOA 1KWHA 1USYE 2DE2A 2QS1A 1IITA 1FTKA 4FECA 5M2VA 4ZECA 1JW1A 2V84A 3MAMA 3K6WA 2O84X 1DSNA 3V5AA 5I56A 2RC7A 2YPNA 1FCKA 3HO7A 5H8NA 3V83A 2RC8A 1DMBA 1UIUA 4U1ZA 1SD3A 3L6GA 4NF6B 1JEVA 1N76A 1YCJA 3T22A 5TP9A 3RNNA 1MQHA 4BLAA 1I69A 1CB6A 4RXLA 3T66A 2PT2A 4QFLA 4DCXA 3A3CA 3CG1A 3PPPA 3IAZA 1B3LA 1NH7A 2DOJA 4NF5B 5JEIA 4I8CA 4MH5A 1US5A 3FV2A 2DE3A 3VVEA 3ODBA 3CSBA 2HZKA 3N5LA 3RT6B 2PX1A 5DEXB 1IXGA 4GIZA 4OWDA 3ZKLA 2Y84A 3P7IA 5KZTA 3FJGA 4F29A 3FASA 3RY3A 2FYIA 1URDA 2H25A 4H5GA 4LVQA 4F31B 4PP0A 3OOAA 3TYHA 1H43A 2D3IA 1MDP1 4C1TA 4OEUA 3IOVA 2F34A 1PBPA 3C35A 4LZ7A 1URGA 3RT8A 2DVCA 5JTYA 1MH4A 4M4GA 5FHMA 1VR5A 2UYFA 1FQDA 3VFJA 2FA7A 4DE8A 4NF8B 3S4UA 5I84A 1JVXA 4OEVA 3C34A 2F78A 2RC9A 1LLSA 4UACA 1ZMGA 4OERA 3OMBA 4R9FA 3OSQA 4H1XA 4IO5A 4G4PA 1MXYA 4XKQA 5I2KB 3K00A 1BKAA 4KD5A 5ICQA 2QS2A 4H5FA 5DVFA 3U72A 4XKPA 2ONSA 3T9HB 3FGSA 3HHFA 2ZYOA 2F6PA 5AA2A 3Q29A 1SVXB 2RKMA 4ELRA 2UXAA 3K4UA 3TEPA 3N26A 3CI8A 1SW4A 3IOUA 2R71A 2XXRA 1Q1KA 3C4MA 4YB7A 5I58A 3E4RA 3TMGA 2Y7WA 1OVTA 4DLDA 3LBSA 4LZ5A 4WKMA 5HPQA 3TODA 4OVJA 1B52A 5TPAB 4G77A 3EPEA 4MF3A 3E3KA 1T0KA 4ONYA 3Q27A 1B6HA 5I56B 4XTCQ 4YICA 4KQPA 2O68A 1VFEA 2V3QA 2HEUA 3KSJA 5H8NB 3DP6A 1MQGA 3UP9A 3B6TA 2CZLA 1ZLQA 4IGTA 4JWOA 3IB2A 3T9XB 3EQ1A 3N6TA 2Y7KA 3MW0A 4G8HA 1WVJA 3M3FA 1B3HA 1P1WA 2OCUA 3FVKA 2I58A 2RCAA 3I3VA 4OYVA 4MFIA 1NL5A 2F6GA 4KFQA 3B7DA 1NNTA 4LZ8A 2F35A 1NMUA 2I4BA 5TU0A 2XD3A 3K01A 2ZYNA 4YKKA 2OBGA 1B9JA 5L9SA 3SKPA 2Y7IA 2Z8FA 1S50A 3A3UA 1VFDA 1F9BA 4YKPA 3KEIA 3LC8A 3GZGA 1FTMA 4THIA 4KI0E 4JSOA 2NVUB 3VXBA 5FHOA 1RKMA 3VV5A 4WEDA 4G68C 4QSDA 2W7YA 2ZNTA 1LCFA 1LSTA 1MQIA 1MXXA 3N94A 5DT6A 4NEDA 4JBZA 1AL3A 1XT8A 2ZMBA 5CMCA 5AA2B 5IKBA 3UA8A 4KYEA 1NNKA 4E0WA 1AMFA 2QL3A 2VOZA 3KZGA 1MY1A 1WODA 2D21A 1IEJA 4U1OA 3KN3A 2Q2CA 2VHAA 2D5WA 3KFMA 2I0CA 3BFUA 3L6HA 4F1UA 4F39A 1N3XA 3O29A 4FAJA 5AA1A 3G3JA 4BDRA 4FORA 3ZS6A 5JK4A 1GTKA 3U94A 3RTWB 2Z23A 1POY1 4U4XA 3ECRA 1TFAA 4HCWA 2X7QA 5ELVA 1II5A 3O97A 2ZNSA 1P99A 4RA1A 2ZNUA 3LUYA 3GBAA 1Y3QA 3C33A 3MUQA 3PUZE 4C0RA 1GV8A 5DTBA 4ZEKA 1EZ9A 1MY0A 4C1UA 2XXVA 5BWJA 4HTGA 3H3GA 3T9UA 1GVCA 4ZS9A 3DP4A 1N7XA 1LB9A 5I59A 4IY5A 4IB2A 4F18A 4K3FA 3USDA 2I6EA 4EDPA 3PPNA 1OQGA 1JETA 4IGRA 2R6GE 4OTEA 2UVJA 1NNPA 1M5FA 4E0XA 1FQBA 1EU8A 4GLIA 4Z0IA 2PVUA 1MPCA 1MPDA 1B3EA 4GFRA 3QSLA 1N04A 3W9VA 2B3FA 4H0WA 3CFZA 3O6IA 1FQEA 1US4A 3LR1A 3SEUA 1FQCA 3MJNA 1MXUA 3KOSA 4XXUA 3FIRA 3T93B 2HAUA 4O3BA 2DWHA 4HS7A 2XX7A 3MVWA 3IJXB 2F7BA 1AOVA 1SI1A 4R6KA 3PPQA 4JXIA 3CG3A 2DVZA 3K0VA 4LQ5A 3F11A 3W15C 3OEMA 4BDLA 1MS7A 3H6TA 4QSCA 3G3KA 4ISUA 2OZZA 1R1NA 2IEEA 2ONRA 2H99A 3MWBA 5CMKA 3EHTA 4MBPA 1B4ZA 3S9LC 3HSTA 4ELOA 1JW5A 2P0SA 5KDTA 4KYSA 2XXWA 4ZEFA 4EF2A 2Z8EA 2H9BA 3LSWA 1LB8A 1PB9A 3TFLA 4GL0A 4OETA 4X48A 1B1HA 1ZTYA 4TLMB 2O7IA 4EXLA 2XXTA 4XKRA 5EHMA 1LAXA 2FNCA 1PC3A 1I6BA 5I57B 1S7YA 2F97A 4P11A 1Y3PA 3KN7A 1P1QA 3TELA 4YAHX 3CIJA 2RF1A 4RY1A 3TTLA 4Q8RA 4OESA 4YKJA 3SEVA 3B6WA 1UTHB 2Q2AA 3EF7A 3O9PA 1TWYA 3Q28A 1M5CA 2Y7PA 2I3WA 4I62A 4U22A 4EUOA 3D4CA 1DTGA 3UK4A 4N07A 2QSXA 3IOWA 3MP1A 5ISUA 4OMBA 4MLVA 3M8UA 4ELQA 3IORA 3OO6A 3SEWA 5I59B 4KPTA 2XXYA 4QRZA 2O51A 1TT1A 5B7DA 3OSRA 1VE4A 3MP6A 1B7HA 1XOCA 3BFTA 5DYHA 1MPBA 2Q89A 1SW1A 1AIVA 4POWA 4Z7EA 1Y1MA 1Y4TA 2Z22A 1B3GA 3BKIB 2GH9A 4IY6A 4U4SA 3H03A 1QUIA 3C9HA 5H8HA 3EHSA 3H6WA 3U92A 4PFYA 4U21A 4GWOA 3MVZA 1PBQA 5H8FB 2PMSA 3K6VA 3TUSA 1DPEA 3O6HA 3U8QA 1Y3NA 3VVFA 3R26A 1QUKA 1FQFA 3IOTA 3D4GA 2Q88A 4RK2A 1UIVA 5EHSA 3K1NA 4EQ9A 5HBCA 3K2DA 1NFTA 2I49A 1LAGE 2F5XA 4NTLA 4UA8A 3ZKKA 2PT1A 1URSA 4R75A 2HXWA 1I6AA 1B4HA 3MVXA 2DS9A 3IJOB 4G8NA 5KDTB 4YU0A 3VLWA 1MQDA 4YKIA 3KJTA 1N3WA 2QS4A 4H6DA 1GR2A 2X7PA 5A5XA 1B05A 5TP9B 4H8IA 3OXNA 4EF1A 1LFIA 1EZPA 1MM6A 3DLNA 3U1OA 3TCFA 1UTBA 4ZE9A 4LA9A 2REGA 3UIFA 2ONKE 5EYFA 3R6UA 1FQAA 4F1VA 4RPOA 3MZ9A 2A5TA 2ABHA 1GGGA 2AYSA 1HSEA 4F1YA 3CRBA 5LOMA 2DP8A 2KLFA 3G3IA 1LAHE 1O64A 2PYYA 1FW0A 3SEYA 1OMPA 1B32A 4RPNA 4ECFA 4ZE8A 4KHZE 2HFBA 4WEPA 1QULA 2QMWA 3UN6A 2O7UA 3TCHA 1H3DA 3CR9A 4ZDMA 3V8XB 4G68A 5JTYB 2GHAA 2P1SA 5I2NA 1ZIUA 2I48A 1ZU0A 2CMOA 2Y7RA 1B0LA 2AL5A 1OVBA 1NKXA 3OELA 2OLBA 1MY2A 3KBRA 3RQTA 3MVYA 1LBCA 1Z7NE 1B5HA 1IXCA 4AB6A 4FIMA 4LUBA 1A40A 4GXAA 1H45A 1WDNA 1R9LA 3I6VA 3CFLA 3HV1A 1OLCA 1LFHA 5AA4A 1DTZA 1VSOA 1P1OA 3K02A 3LSXA 3SERA 2OJTA 4L17A 4GF8A 2O6AA 5CMMA 1XVXA 2V25A 4NMYA 3WAEA 1QKAA 1MG1A 4WXJA 3O66A 5ITOA 1LAFE 1ATGA 1MRPA 3MC2A 2BJJX 3FXQA 3JV9A 5I58B 3TTNA 3HN0A 2B65A 5CM6A 4NF6A 4BDQA 3PPRA 4GQOA 3GXAA 4YB6A 4X1DA 3PMWA 5FHNA 4ND9A 2UVHA 2V3TA 3QAXA 4KR5A 1FTJA 3KGCA 4ZZAA 3K6XA 2UVGA 4TQUQ 4NF5A 2NXOA 4F2QA 4YMAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YMBA 2CZKA 4NE4A 3G3FA 3QK6A 4MAGA 2ZXTA 4FJPA 3FJ7A 5ITPA 4NF4A 5DEXA 2B3BA 3H06B 3S2VA 4HCYA 2OWZA 3TTKA 2F7CA 2H98A 5EQAA 1QW0A 1SW5A 2VGQA 2E0SA 2XXHA 4F3BA 4JVIA 4F22A 1D4NA 1H44A 1MY3A 4MEVA 1Q35A 4MJOA 2H5YA 3TKDA 4PDHA 1ZKBA 3IL1B 2XXPA 1UTBB 3VVDA 5F7VA 4QBAA 3FZVA 2YJPA 1DK4A 5IZ1A 4LQ2A 3T0JA 1IXHA 1CNQA 3UGWA 1FPEA 2Q8JA 3PU5A 5I2KA 2HZLA 1B7ZA 4R2FA 1N0TA 4QFNA 4JB7A 3CVGA 3PPOA 3IX1A 2XXUA 2XX9A 1S9TA 1IMBA 3BIHA 4PF6A 1J1NA 4I3EA 3RPWA 3H6VA 1TXFA 4F19A 3U65A 2H4IA 4G68B 3S9EA 1ELJA 4PFUA 4PQJA 3VLVA 5H8QA 5I2NB 1JNFA 4GRKA 2DWIA 1N84A 2V3UA 1BLFA 4GL8A 3PD8A 2DXRA 1RYOA 2AIXA 3MBPA 3QUFA 2UYEA 5DVJA 4DCYA 2XWVA 1NI9A 4JDFA 4OVQA 1MDQA 1G0HA 4MIJA 3TCGA 2VT5A 3O28A 5HM4B 3WAFA 3VLUA 4OFLA 3TQLA 1B5IA 5AA4B 4OHNA 4MLQA 1XS5A 4JWXA 4RJZA 5TPAA 4KCCA 4HE0A 4RYAA 4YZZA 4IO6A 3RTFB 4FEBA 1K9YA 4ZEDA 2HAVA 4P8BA 4H65A 2Q74A 1MY4A 1DOTA 1FBEA 3LSFB 3VDFA 4LN5A 3Q25A 3TTMA 4DIGA 4RK9A 3G3HA 1MH3A 3ILUB 3T9VA 4N4UA 2NOOA 2NUVA 5CBRA 4O3AA 3RUMA 1XVYA 3RPLA 4OVTA 3B8BA 4N6PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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