1LFHA

Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 219
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA03
3M3KA 4IO7A 1P1QA 5BWJA 4GLIA 3IJXB 5F7VA 5AA3A 4F1VA 4F3BA 1DPPA 3PUWE 5TP9B 3TTNA 4PP0A 1MQDA 3G3JA 1B4ZA 3VVFA 3IO6A 2NXOA 2NWJA 3S9LC 1ZBMA 1UTHA 4IO4A 1MY2A 3IK6B 4YKKA 3TUSA 1EZOA 3EN3A 5FTIA 2O69A 4TOZA 5H8FB 3IB0A 4NF8B 4Z0IA 1FQDA 3CFXA 2ZNTA 3VDFA 1B4HA 2XXVA 5ICQA 3LSWA 4BDLA 4C1TA 5ICTA 1O63A 2RC8A 4F19A 4OVJA 5FHNA 1QKBA 3OO7A 1M5EA 2QS3A 2F6PA 4QFLA 3A3CA 3WAFA 4OENA 3LC8A 1H45A 3W9VA 4EQ9A 1IZ1A 4R73A 3A3UA 2I3WA 1ANFA 1F9BA 3KOSA 4XTCQ 2HXWA 1P1UA 5CBSA 4HTGA 4AB5A 3U8QA 2V3TA 2XHDA 3MPKA 1YCJA 2HFBA 3C31A 3O97A 1JW1A 3N6TA 3ZSFA 2I48A 4YKPA 1Z7NE 2DQVA 4XKQA 4QHQA 2REGA 2VHAA 1HSEA 5AE4A 2D21A 4KCDA 1H76A 2F7BA 3UP9A 1LBBA 1LAGE 2Y7KA 4NF6A 4F2QA 4NF5B 1MPCA 2O6AA 3G3KA 4DXCA 4YICA 1D4NA 3SDFA 1T0KA 4PFUA 3PUVE 3K6UA 3PV0E 1I6BA 4AQ4A 4NF4B 4EF1A 3VLWA 4GVOA 1SI1A 1SW2A 2A5SA 3KN8A 2XXHA 3S2VA 3P7IA 3H4ZA 3G3FA 5H8NA 4DE8A 2Y84A 4KFQA 3JYRA 5TPAA 3K00A 4QFKA 1N3XA 1USYE 3HN0A 1Q35A 2Z8DA 3CI8A 2UVIA 1SDXA 3PPQA 5AA1A 1OQHA 2G29A 3T9HB 1NNPA 4FEBA 4U4SA 3JZJA 5M2VA 3FXRA 3ZKLA 4NF6B 4QSCA 3H6UA 3TAJA 4HS7A 4DXUA 3MVYA 2Y7RA 4G68A 1OVTA 3FD3A 4JDFA 2PVUA 4PFTA 3TQLA 2E0SA 5ELVA 3SEUA 5AA4A 2RCBA 2PT2A 4IGTA 3FJGA 3O28A 1MDP1 3M8UA 5IAIA 3DLNA 3FUZA 4KR5A 1JVYA 3V8XB 3SERA 4POWA 5K2XA 3MPLA 1POY1 3IR1A 1RYXA 3KN3A 3SEVA 1B40A 4NEDA 5TPAB 3HO7A 4U2RA 4WEDA 4ZEIA 4IO3A 1LB8A 2DWIA 3KG2A 2H99A 2PT1A 1VE4A 4EDPA 4E0XA 3UA8A 1WVJA 2X7PA 2ZXTA 2AL5A 2E1SA 1MXUA 5I58A 4TQUQ 2NUVA 1Y4TA 3R7XA 3T66A 3H6WA 2B65A 2GFEA 3FJMA 5I59A 4G68B 1LCFA 2HZLA 1B3EA 1LFIA 5CM6A 4GL0A 1IUDA 3RQTA 3PMVA 4QFNA 3HCQA 2NVUB 1B3GA 1RKMA 3QUJA 4RPNA 5I2KB 2GHBA 2OCUA 3ILTB 1M5BA 1MG1A 1B0LA 2XXIA 4KYEA 5H8SA 1LSTA 1NH8A 5CI5A 4RJZA 1H44A 1MS7A 2ALUA 3H3GA 4ZZAA 1GR2A 3R6UA 2XXUA 2Q9TA 4YAHX 3DP6A 4GRKA 3DP4A 3QIMA 1JW4A 4AB6A 4OWDA 1JQFA 4F1UA 2RC9A 1DMBA 4ESWA 4LVQA 4U1OA 5I59B 4R9GA 3IL1B 3HV1A 1WDNA 1LAXA 4RXLA 1UTBA 3BFUA 3GBAA 4GIZA 3O9PA 1FTKA 3L6GA 4ZE9A 3T9UA 3D4CA 4OYVA 1PBPA 4GFRA 4ZEKA 4EF2A 5DTBA 3EQ1A 3RT8A 1ELJA 4PETA 3UIFA 4YMAA 3VXBA 4PFWA 2I6EA 2Q89A 3C33A 2P2AA 1A40A 2I3VA 3ECRA 4F3SA 1S9TA 3UORA 3SKPA 3K01A 2DWAA 3C9HA 1S50A 2XD3A 1JW5A 3IJOB 4GF8A 1A8FA 3KFMA 3LR1A 1ZKBA 3MZ1A 3IB2A 5KCJA 2DVZA 4G4PA 2ZYOA 1FTLA 3AXFA 4R9FA 4XKPA 4ZS9A 1R9QA 4RYAA 2HQ0A 3RT6B 3VFJA 1FQBA 3KSJA 4POXA 3Q26A 1SYHA 4MH5A 1XHYA 4LATA 2VD2A 2Q88A 1UTBB 2IEEA 2BJJX 5AA2D 4Q8RA 4YB6A 5I2NA 2RINA 4DCYA 3KN7A 2XX7A 1PBQA 3O6IA 3M3FA 4ECFA 2I4BA 4H67A 4ZEBA 2HAUA 5JEIA 2DE4A 1URDA 2AL4A 1SI0A 1SVXB 3T96B 4I8CA 3O29A 1B32A 1B3LA 2ANJA 4TLMB 1FTMA 1B5HA 1GTKA 4Q30B 3TTLA 1PB9A 2DXYA 4QSDA 5I57A 4JB7A 4F29A 3RN8A 4KHZE 3QK6A 5A5XA 4IY6A 2H9BA 3T9XB 1P99A 4YB7A 1N84A 1XC1A 1LB9A 3S9EA 4ZE8A 3U72A 1IEJA 5H8HA 1A99A 5I2NB 5BUUA 1D9YA 2X7QA 1A55A 4RA1A 2V93A 4YB5A 1P1OA 1SW5A 3PGFA 1GV8A 5IKBA 2V25A 2F6GA 4GXSB 4HCYA 1DPEA 1O7TA 3EHSA 2ZYKA 1US5A 4EXKA 4R6HA 1XVXA 1B51A 2P0SA 1TXFA 3THIA 3TELA 1IITA 3V5AA 4M1VA 5I57B 5FTHA 4X9TA 1EH3A 2WKYA 1LGBC 3KJ7A 1Y1MA 2V3QA 3G7WA 4UA8A 4ELOA 1HSJA 2H25A 3N6UA 4GD5A 4MFIA 2D3IA 4OXVA 1MQHA 2DYXA 3C35A 1PC3A 4U4XA 3TPAA 3K1MA 4JWXA 3HPIA 2Q8JA 1UIUA 1A8EA 1QKAA 5AA2A 2Q2AA 3EHUA 1LBCA 4OTEA 3F11A 1MQJA 4F18A 1NKXA 1UTHB 3O2AA 2B3FA 2RKMA 2F5XA 3PMXA 2ONSA 2UXAA 4Q5TA 3CSGA 1ZU0A 4LONB 1IXHA 2DE2A 2HEUA 2XXPA 3OO8A 2V84A 2F78A 2V3UA 1M5DA 3Q25A 1MQGA 2ONKE 3U93A 2OJTA 1NNFA 4GXAA 1MY3A 3GXAA 2VGQA 1BKAA 4EUOA 3B6TA 5LOMA 1POTA 4KYSA 1TFDA 4N07A 2UVGA 1NNTA 2GHAA 3JV9A 3PD8A 1VSOA 4EQ7A 1R9LA 1AOVA 2HAVA 2DWJA 2PBWA 3H03A 3IOVA 3FXUA 1LFHA 1N04A 1B52A 1DTZA 1NMUA 3BFTA 1MPBA 2XXTA 3PU5A 2DXRA 3ONMA 1EZ9A 4OFLA 1I69A 1M5FA 4F1YA 3CSBA 4U23A 1B9JA 3TCGA 2ZMBA 1OIBA 3CFLA 1CB6A 1USYH 5DVIA 3C36A 2O7UA 3FVNA 2G93A 2FYIA 4R75A 2XXXA 3DM0A 5EHSA 4R2FA 3KSXA 2CMOA 1OLCA 4G8NA 1YPNA 3OSRA 1ZMGA 1H3DA 2Z22A 1AH5A 4QF9A 4LP2B 1ZIUA 2Y7PA 4Z7EA 1XS5A 2F8DA 2H4IA 3D4GA 3O6HA 4LZ5A 3T22A 2I0CA 1B7UA 5H8NB 4DZ1A 1Y3PA 1B46A 4U21A 1YTVA 2DE3A 2XD2A 3IX1A 3VE1B 4ELPA 3SEWA 3FGSA 4E0WA 3UGWA 2P1SA 2LAOA 2OK2A 1TT1A 4GWOA 5ITOA 3K1NA 1O64A 4LZ7A 2QL3A 1BP5A 4ESXA 4P0IA 1LLSA 2D5WA 3SEXA 4M4GA 5HM4B 1M5CA 4G2ZA 3OEKA 3CG1A 3EHTA 1MY4A 2H5YA 2Q2CA 3OEMA 2IA4A 5AA4B 1B7HA 2R9JA 3RUMA 2QS1A 5JTYA 1PDAA 4KPTA 3IAZA 4XKRA 4LQ2A 3MJNA 3N94A 2O84X 5KDTA 2ZNUA 4WEPA 3PPRA 4JBZA 4G8HA 4YKJA 5HPQA 1UIVA 3B6QA 1AL3A 4KCCA 2F7AA 2PX1A 3FVKA 3ODBA 5I58B 5H8QA 4U22A 4JXIA 1GGGA 3MVZA 5J1DA 5L9MA 3OELA 1J1NA 1MXYA 4KYDA 1Y3NA 1KWHA 4R6YA 3ZKKA 2GH9A 1IXGA 1Y1ZA 3K4UA 1NH7A 4MLQA 4BDNA 2HCAA 4RPOA 1FQEA 4FECA 1B5JA 3OO9A 3VLVA 3N26A 3K0VA 4ZECA 5CMBA 4DLDA 1N3WA 4PE5B 4JWYA 3U1OA 1MM6A 4YZZA 5KDTB 5I56A 4DIGA 3O6GA 1BTJA 5DT6A 5L8DA 1S7YA 3HSTA 3MUQA 4THIA 2DP8A 4NE4A 4LUBA 1B3HA 3C4MA 3TFLA 2GRVA 2F34A 3FATA 3OSQA 1A54A 4R6KA 3MVWA 5H8QB 4K3FA 4F2OA 2QPQA 4JWOA 4OERA 3MZBA 1SW1A 4LA9A 3H06B 3M3LA 3VVEA 2Z8FA 3U92A 3MP6A 3H6TA 1FTJA 4DXBA 4R74A 4FEDA 2XXWA 1QUIA 3TMGA 4HCWA 5HBCA 2ZYMA 2YLNA 4ZDMA 4C1UA 1Y3QA 3K6WA 3K6VA 5B7DA 2HZKA 4BDRA 1MRPA 1JEVA 4H5GA 2OBGA 2AYSA 2OWSA 5TP9A 1IQ7A 4G68C 1IIWA 3S9MC 3IOUA 3B7DA 3S9NC 4QRZA 2X26A 1IXIA 1MXZA 1RYOA 5KCJB 2I58A 3E9XA 3T9VA 1DSNA 3MBPA 3O66A 2RF1A 1QVSA 4GQOA 3PUZE 1MH4A 3IB1A 3LSLA 2OWTA 3C34A 5CMCA 3TODA 1B7ZA 4H8JA 4KQPA 3TTMA 3PD9A 1H43A 3FVOA 3HHFA 4H6DA 3QXMA 4MLVA 3RNNA 4YU0A 4JSDA 3I3VA 1B2HA 2XXQA 3G3GA 4RK9A 1R1NA 1FCKA 2PYYA 3EF7A 1P1NA 4OEVA 2Y7IA 2QRYA 4ELQA 3ILUB 4FATA 2QJEA 3A09A 4L17A 4NWDA 3S4UA 4U1ZA 4DDDA 2A5TA 2QSXA 1QUJA 4KI0E 4OEUA 3GZGA 4ZZEA 4Q0CA 1XT8A 5A5XB 4F31B 3KBRA 1L5TA 1N7XA 2ZNSA 1II5A 3G3HA 4PQJA 1MXVA 2FNCA 5H8HB 3MP8A 4QFOA 2ONRA 1OLAA 1PB7A 1MY0A 3MW0A 1JNFA 1Q1KA 3SETA 4NF5A 3Q27A 1IXCA 3PUXE 2OLBA 3RLFE 3PUYE 4OZ9A 1VFEA 4NF4A 2O7IA 1Y20A 4H1XA 2XX9A 1A7LA 5KZTA 1Y4CA 3FVGA 3PMWA 4O3CA 4O3AA 1NFTA 4WXJA 3CG3A 2A5TB 3RPWA 5ITPA 3K02A 2F36A 1JVXA 1N76A 3QSLA 3K1PA 3OMBA 1D3KA 3FXQA 4RY1A 4NMYA 1PEBA 1Z7ME 3PPNA 4C0RA 3IOTA 3E4RA 4F22A 1NNKA 5EHMA 2I0BA 1VFDA 1LAFE 3TTKA 4DCXA 2DS9A 4IGRA 1TWYA 4NTLA 5CRYA 4XXUA 1N0TA 5AA2B 1MDQA 3W15C 1OQGA 1SBPA 2O51A 4FAJA 1B58A 1MY1A 1FW0A 3RY3A 4XIGQ 1AMFA 1FQFA 1UQWA 3OOAA 2Z8EA 4F3GA 4FE8A 1SQYA 4EXLA 3FV2A 1MXWA 4XKNA 1XOCA 1MH3A 2KLFA 5CMMA 1I6QA 5FHOA 1CE2A 1BLFA 3B6WA 4OQOA 1QULA 3FV1A 5DEXA 4X1DA 1ZJLA 3MZ9A 4TLLB 2O1LA 1LAHE 1QUKA 2AIXA 2F97A 3KGCA 4G8MA 4H65A 3W9WA 3FJ7A 4BLAA 1Y9UA 5EYFA 1B6HA 5I84A 4IO6A 3K2DA 3MAMA 3QAXA 1B3FA 3E13X 2DOJA 3Q28A 3OXNA 3KOTA 4RNSA 2XXRA 1N7WA 3EPEA 2I49A 2F35A 4O3BA 4HW8A 3KJTA 4RK2A 5FHMA 3USDA 3FASA 5I2KA 3KEIA 3KZGA 1QW0A 3TCFA 1DOTA 1AIVA 1BIYA 1NL5A 4F39A 1FQCA 5B70A 3G3IA 5DEXB 1MPDA 3VLUA 3TDJA 1SW4A 2QMWA 1HSLA 3GLBA 1EZPA 2DSFA 2O1MA 3HHGA 4OMBA 5CBRA 4H0WA 1OMPA 3FIRA 3GBBA 3CFZA 2M8CA 3OD7A 2Y7WA 4ND9A 1US4A 2I4CA 4OFOA 1YAEA 4KD5A 2THIA 4R2BA 1MXXA 2REJA 2VP1A 2RCAA 1R6ZA 1MM7A 3PPOA 3C32A 3ZS6A 3OENA 2VD3A 4GL8A 4FIMA 4NWCA 3TZAA 4BDOA 3LSFB 3R26A 1B0HA 1JEUA 3T93B 2QS4A 3I5OA 4MBPA 1P1WA 2R6GE 5TU0A 3H6VA 4FJPA 4OFJA 2O68A 4P11A 2QMXA 4OETA 3LUYA 2DVCA 2QS2A 2Z23A 1QJMA 4F3PA 3TYHA 3TCHA 5L9OA 3QYTA 3SESA 4N6PA 2FA7A 3K6XA 2UVJA 3H7MA 4YMBA 3LBSA 2DWHA 4MF3A 1OVBA 3VV5A 3MQ9A 4P0GA 4OHNA 5JK4A 4JSOA 1SD3A 4WKMA 3I6VA 2ESNA 5JTYB 3MC2A 5F1QA 3WAEA 5CC2A 4H8IA 3V83A 2UVHA 4EQBA 3V89B 3RTWB 2CZLA 3PPPA 1VR5A 4ONYA 4ELRA 4N13A 2XX8A 3CIJA 4PFYA 1FTOA 2W7YA 4LZ8A 5L9SA 1EU8A 1ATGA 3TTRA 1URGA 3N5LA 2OZZA 1LCTA 1I6AA 4ISUA 3IOWA 3UN6A 4IY5A 3E3KA 1ZLQA 3TQWA 2R71A 4X48A 4IB2A 3VVDA 3BBRA 1WODA 2F7CA 2YJPA 4ZEDA 4OESA 4X1BA 4R72A 4H5FA 1ZTYA 3MWBA 2ZYNA 3IORA 2ABHA 2YPNA 3RTFB 4QSEA 3DELB 5DVFA 2VOZA 2B3BA 1B1XA 2UYEA 3QUFA 1GVCA 1B5IA 4G77A 3L6HA 4BDQA 4BDMA 3VXCA 5I56B 3TEPA 1B1HA 2NOOA 3FZVA 4FORA 4IO2A 3BKIB 4LQ5A 4I9DA 2RC7A 1B05A 4IO5A 3IO4A 3CVGA 3OO6A 2H98A 4YKIA 3MP1A 1JETA 4UACA 5DYHA 1D9VA 1TFAA 3Q29A 4I1DA 5H8FA 4NF8A 4I62A 5K2YA 5CMKA 4ZEFA 3RGYA 1URSA 3SEYA 1LFGA 1SYIA 3U94A 3DP8A 1PB8A 1DTGA 3CRBA 3LSXA 4GOTA 3TKDA 5ISUA 2PMSA 1XVYA 4QFPA 3MVXA 1MQIA 3UK4A 5DVJA 1FQAA 2XXYA 3CR9A 2UYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3KA 4IO7A 1P1QA 5BWJA 4GLIA 3IJXB 5F7VA 5AA3A 4F1VA 4F3BA 1DPPA 3PUWE 5TP9B 3TTNA 4PP0A 1MQDA 3G3JA 1FPJA 1B4ZA 3VVFA 3IO6A 2NXOA 2NWJA 3S9LC 4PF6A 1ZBMA 1UTHA 4IO4A 1MY2A 3IK6B 4YKKA 3TUSA 1EZOA 3EN3A 5FTIA 2O69A 4TOZA 5H8FB 3IB0A 4NF8B 4Z0IA 1FQDA 3CFXA 2ZNTA 3VDFA 1B4HA 2XXVA 5ICQA 3LSWA 4BDLA 4C1TA 5ICTA 1O63A 4DI4B 2RC8A 4F19A 4OVJA 5FHNA 1QKBA 3OO7A 4PBHA 3ROJA 1M5EA 2QS3A 2F6PA 4QFLA 4PCDA 3A3CA 3WAFA 4MNCA 4OENA 3LC8A 4I3YA 1H45A 2PCRA 3W9VA 4EQ9A 1IZ1A 4R73A 5F24A 3A3UA 2I3WA 1ANFA 1F9BA 3KOSA 4XTCQ 2HXWA 1P1UA 5CBSA 4HTGA 5I5PA 4AB5A 3U8QA 2V3TA 2XHDA 2ZZWA 4JVIA 4P56A 3KC0A 4N91A 5I3SA 3MPKA 1YCJA 4P9KA 2HFBA 3C31A 3O97A 1JW1A 1IMEA 3N6TA 3ZSFA 2I48A 4YKPA 1Z7NE 2DQVA 4HE2A 2Q74A 1LBWA 4XKQA 4QHQA 2REGA 5IZZA 2VHAA 1HSEA 5AE4A 2D21A 4KCDA 1H76A 2F7BA 3UP9A 1LBBA 1LAGE 2Y7KA 1G0IA 4NF6A 4F2QA 2HXRA 4NF5B 1MPCA 2O6AA 3G3KA 4DXCA 4YICA 1D4NA 3SDFA 1T0KA 4PFUA 3PUVE 3K6UA 3PV0E 1I6BA 4AQ4A 4NF4B 4EF1A 2JJKA 3VLWA 4GVOA 1SI1A 1SW2A 2A5SA 3KN8A 2XXHA 3S2VA 3P7IA 3H4ZA 3G3FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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