1LFIA

Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metal substitution in transferrins: the crystal structure of human copper-lactoferrin at 2.1-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 203
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfiA03
2XXTA 1MQJA 3PPRA 3VLWA 2DS9A 3LUYA 5DYHA 1AIVA 1MXVA 3TYHA 2DXYA 3LSLA 4ISUA 1P1OA 4KHZE 3C35A 2F6PA 1JW4A 4OEUA 4IO7A 2F78A 4JXIA 4E0WA 2HAUA 3G3JA 4QF9A 4TQUQ 1Y4CA 3N94A 3EN3A 1B5IA 5H8HB 4BDNA 1Q35A 3ZKLA 4NE4A 1EZOA 1B0HA 3TDJA 3W15C 3UORA 1ANFA 4MLVA 4ZEFA 4BDLA 3IJOB 4M4GA 2PT1A 1MRPA 3G3FA 1IITA 1QJMA 1MQDA 5LOMA 4YICA 1B51A 2O1LA 2X7QA 3LC8A 1OVBA 4DZ1A 1QULA 3QIMA 1RYOA 1XVYA 2ZYKA 5DVFA 3AXFA 2QMWA 1N0TA 3HHFA 4DCXA 4U2RA 1B1XA 4GOTA 5CBRA 4MBPA 3H6WA 4G4PA 4FE8A 2V3UA 4OXVA 3CFZA 5BWJA 3CSGA 3BFTA 1ZTYA 2F97A 4ELQA 3V8XB 3RTFB 3MPLA 2F7BA 4YU0A 4G8HA 4XKPA 3CVGA 3ZSFA 4P0IA 4LZ7A 3I3VA 3Q29A 4QFNA 3LBSA 4IO3A 1OQGA 4NWDA 3T9VA 4RYAA 1M5EA 3EQ1A 3PPQA 1NL5A 1FQBA 1BTJA 4PFWA 3FXUA 4K3FA 1GV8A 3PD9A 1PB7A 1NNPA 4GXAA 2O51A 1JW5A 5HM4B 1HSEA 1D9VA 3I5OA 1YTVA 2DVZA 5CMCA 4KYSA 2AL4A 1B3HA 2XD3A 2E0SA 4KR5A 3FATA 3FVNA 1LBCA 4FECA 1MXWA 4YKJA 2HCAA 2ZXTA 3I6VA 4EUOA 4IO6A 2G29A 4DLDA 4F29A 3BFUA 3VVEA 3TFLA 1QKAA 3CR9A 3VLVA 4GXSB 2GRVA 2X7PA 2ZNSA 3LSXA 1MS7A 4JWYA 2OJTA 2VOZA 2XXXA 1O7TA 2E1SA 3K6UA 3LSWA 2CMOA 1LB9A 1NNFA 2RC7A 1IQ7A 2F6GA 1ZKBA 4I9DA 2XXIA 1OLAA 3G3IA 2QMXA 3U72A 1I6AA 4YZZA 1FQDA 1B3FA 4GWOA 5K2XA 1XS5A 4DDDA 1JW1A 2V3TA 1P1QA 1OQHA 2HFBA 1B7UA 2XXUA 2UVGA 5EYFA 3O6HA 3R7XA 1D4NA 3MQ9A 3OO7A 1Y4TA 3UA8A 2YJPA 4F2QA 3OO6A 1PC3A 3KSXA 5TP9A 4F3GA 5H8NB 1MQGA 3UK4A 4H1XA 4IO2A 4OHNA 4OMBA 5CI5A 3OO9A 3FVOA 4NF4A 3H03A 1YPNA 2Y7KA 1MXUA 3G3HA 1XVXA 4NF8B 3KN8A 4ZE9A 5AA4B 3JV9A 3H6UA 1B1HA 2I3VA 1QKBA 2QJEA 1Y1ZA 3CG3A 2VGQA 4DXBA 4AQ4A 2XHDA 2ZNTA 3B7DA 5KDTB 3T22A 1UTBB 4F3SA 3G3KA 2Q2AA 3BBRA 1LAGE 1LCTA 3VDFA 2Q88A 2XXYA 3UP9A 3K6XA 2QRYA 1KWHA 3O6IA 1SYIA 4OFJA 2P1SA 3T9XB 1URDA 3N6TA 3MAMA 4C0RA 5DT6A 4WKMA 1SDXA 3QUJA 5AA3A 4GL8A 1Y3PA 3K01A 3MP8A 2REGA 4KQPA 4NTLA 4KCDA 3RTWB 2NOOA 2F7AA 4KCCA 3OENA 4POXA 5A5XB 4IGRA 1N3XA 2VP1A 4I1DA 3PPOA 4LVQA 1UTHA 3F11A 1SVXB 1UTHB 3PMXA 2H5YA 4RXLA 3HO7A 4R9FA 4O3AA 4H8IA 4MF3A 2V3QA 1N7XA 2DQVA 1JEUA 5BUUA 1NH8A 3K1MA 4YMAA 1UQWA 1I6QA 2OK2A 1B4HA 4KD5A 2RKMA 1LB8A 4QFOA 4OZ9A 3RQTA 5I59B 1US4A 5KCJA 1LSTA 1O64A 3V5AA 4M1VA 2QS4A 4YAHX 3WAEA 1UIVA 1B7HA 1ZMGA 3IB0A 3Q28A 1R9LA 3PUYE 1A8EA 3OXNA 4HCYA 2D21A 3KJTA 4ZEIA 1B3EA 2XXHA 1MPDA 1R1NA 4R2FA 1FTJA 3UGWA 3VFJA 3H6TA 3C33A 3IOTA 3IO4A 3USDA 5F7VA 3KBRA 2A5TA 5DEXB 3S2VA 3CRBA 4KI0E 5AA1A 1S50A 4TLMB 1P1NA 4YKIA 4KFQA 2DWIA 3PD8A 3D4CA 3V89B 1MY1A 1B40A 2GH9A 1P99A 2D3IA 3PUXE 1MG1A 1TXFA 5IKBA 1MH4A 3SEXA 4OTEA 4F2OA 3FUZA 2I58A 1ZJLA 3IOWA 4R74A 4PETA 2DVCA 2O1MA 3IK6B 4H5GA 2QSXA 3N26A 1HSLA 4BDMA 4PFTA 1US5A 2DWAA 1DMBA 1A7LA 2IEEA 3MUQA 1LAXA 3QK6A 4NF6A 4O3BA 4EDPA 4NF6B 2VD3A 3HHGA 3O2AA 4OFOA 4YB6A 2YPNA 4C1TA 4PP0A 5KZTA 1B32A 3TAJA 1RKMA 1D9YA 3IJXB 4XKQA 5EHSA 2F34A 3TKDA 1H44A 5H8SA 4P11A 4E0XA 1BLFA 2B65A 3E9XA 4Z7EA 4UACA 5CMKA 1BP5A 2V25A 4ELPA 1IZ1A 1NNTA 3TQLA 2REJA 1OVTA 1YCJA 5H8HA 3IO6A 4KPTA 2F36A 2O84X 3JZJA 3EF7A 1B5HA 2RINA 1XOCA 1ATGA 4FEBA 2XD2A 3T66A 2XXWA 2PYYA 3PGFA 3EHUA 3KG2A 1SW2A 2WKYA 3KJ7A 4MFIA 4MLQA 4R72A 1N84A 4HTGA 1SW4A 2ZYNA 3E4RA 3TODA 1JETA 3S9MC 2O69A 3S9LC 1DSNA 1PBPA 3S9EA 2DP8A 2XXQA 2VD2A 2UXAA 4YKKA 4HS7A 2V93A 1MY3A 1MY2A 2OWTA 5I57B 2HEUA 2OBGA 1EZPA 1F9BA 3JYRA 3C4MA 2P2AA 3FXRA 5AA2B 3FJMA 3MBPA 2OCUA 4R6HA 1CB6A 4G68C 4R73A 2DWJA 3CFLA 1I6BA 5FHOA 3TCFA 4LA9A 3QSLA 4GD5A 1FTKA 5I56B 2I0CA 3L6HA 1XC1A 4WXJA 4GFRA 2QL3A 2RCBA 4JSOA 2AIXA 3CI8A 2THIA 2ALUA 2F8DA 2Z23A 3IAZA 1Y9UA 4LZ5A 3TQWA 2XX9A 3SEYA 1ELJA 4Q0CA 3OMBA 4LZ8A 2DOJA 5CBSA 1N04A 1B4ZA 2O7IA 3SETA 4HCWA 4FEDA 4OESA 4RY1A 1R6ZA 3R26A 2Z22A 4IGTA 4QHQA 4XKNA 4QFLA 1B3GA 2F35A 1SI0A 1IXGA 3IL1B 4EF1A 3U93A 2QPQA 3PMVA 1B46A 3PV0E 2I49A 2PX1A 2NWJA 3A3CA 4Q30B 2ONRA 1QW0A 4ZS9A 1FW0A 4DXCA 3KOSA 1I69A 1NFTA 3MC2A 1IXIA 3C9HA 4G8NA 4F39A 4ZDMA 3VV5A 3A09A 2DE2A 1MDP1 3RUMA 4RA1A 3MP1A 1Y20A 2Q89A 4IY5A 4EQBA 5L9SA 3M3FA 1H3DA 4ZZAA 1B52A 1GR2A 1XHYA 3C31A 1IEJA 3R6UA 4BLAA 5ELVA 4ESWA 2B3BA 2KLFA 1NMUA 5H8NA 2ONKE 3IOUA 1QUIA 4X1BA 1T0KA 2QS1A 1ZLQA 2XXVA 1JVYA 4NF8A 5AA4A 2D5WA 5ICTA 3EHTA 2O68A 2RF1A 2O7UA 4DXUA 2RC9A 5JTYA 1BIYA 3K1PA 5JTYB 5AE4A 1YAEA 2ZNUA 5KDTA 1UTBA 2AYSA 4X1DA 2HQ0A 3SEUA 1XT8A 3ONMA 1JNFA 1H45A 4N13A 4FAJA 3MVZA 3IB1A 3OOAA 1SW1A 5EHMA 3S9NC 4R9GA 1VFEA 2FNCA 3Q25A 3CFXA 1LBBA 1Z7NE 2R9JA 4G2ZA 3MPKA 3RNNA 4F3PA 4MH5A 5DTBA 2R6GE 2Y7IA 3B6WA 1TFDA 4PFYA 1MXZA 2I6EA 5I84A 5A5XA 3O29A 4FORA 1POY1 4P0GA 2PMSA 2UVHA 4BDOA 5B70A 3MJNA 1EZ9A 2F5XA 4X48A 3RPWA 3H3GA 4GF8A 4F1UA 4ZEKA 1GVCA 1NNKA 3MZBA 2ESNA 3UIFA 4F22A 4PE5B 1DTZA 1HSJA 4H8JA 1NKXA 3OSQA 4RNSA 4KYDA 5CM6A 2Y84A 1B05A 4XKRA 4EXKA 3M3KA 5I59A 4FIMA 1VSOA 4OERA 1USYH 4F31B 2Y7PA 1N7WA 5CRYA 2I4CA 4G68B 3QUFA 3PUZE 3MZ1A 4TLLB 4GVOA 4RK2A 4N6PA 1DOTA 3B6TA 1A54A 4N07A 3A3UA 1JEVA 3EPEA 2DWHA 1N3WA 2QS2A 2I3WA 4LONB 3OELA 1BKAA 4GRKA 3MVYA 5CC2A 4QFPA 2Y7RA 3DM0A 3O9PA 3TELA 2PVUA 5H8FA 4U22A 3QYTA 4JDFA 5DEXA 5H8FB 1EH3A 4GL0A 5I58B 4LP2B 1JVXA 3RY3A 3RN8A 3VLUA 4QFKA 1L5TA 3RT8A 5TPAA 3IB2A 2FYIA 3G7WA 3KOTA 4YB7A 5TPAB 3MP6A 4F18A 3C36A 2R71A 3T9UA 3T93B 1LAFE 1URGA 1B58A 1B3LA 5DVIA 1ZBMA 4DIGA 2ZYOA 2I0BA 2DE3A 3TTMA 1SW5A 1TT1A 3HN0A 3PUVE 4ZEBA 2Q9TA 2ZMBA 4R2BA 3SKPA 5CMBA 1LFHA 1LAHE 3DP8A 3VXBA 3RGYA 3TTKA 3H7MA 1N76A 5I2NB 5FHMA 1M5FA 2B3FA 1MDQA 2ONSA 2F7CA 3KEIA 3OO8A 4F1VA 1MXXA 3THIA 4X9TA 4FJPA 3C34A 1OIBA 3O28A 5I2KB 1B5JA 1S7YA 1FTOA 2DXRA 2GFEA 3TTLA 3VVFA 4LQ5A 3WAFA 3FD3A 4LUBA 3VE1B 3U94A 1FQAA 1PBQA 1P1WA 3B6QA 3K2DA 1A8FA 2W7YA 4HW8A 2QS3A 3MW0A 4EQ9A 1WODA 4OVJA 5HPQA 2V84A 3V83A 5IAIA 4NWCA 5ISUA 3TEPA 4H5FA 4F3BA 4YKPA 2IA4A 3QXMA 3RT6B 3MVWA 5J1DA 3FZVA 1SYHA 3EHSA 2DSFA 4OWDA 4UA8A 1SQYA 4R75A 2H9BA 3DP4A 5H8QA 5K2YA 3OD7A 5H8QB 3KN7A 1QUJA 5I57A 5HBCA 1MM7A 2H99A 3TMGA 3CIJA 1WDNA 3DELB 3RLFE 2Q8JA 1LFIA 4YB5A 1VR5A 5AA2A 4JSDA 1MXYA 5L9MA 1MPCA 3FGSA 3KGCA 4XIGQ 3L6GA 1A99A 1FQFA 1R9QA 3O6GA 3QAXA 3H4ZA 3T9HB 2LAOA 3FVGA 4ZECA 3FV1A 4DCYA 3K4UA 3D4GA 3MWBA 1GTKA 2RC8A 5I56A 2YLNA 4RJZA 4JWOA 3K6WA 1MH3A 5L9OA 1CE2A 3FJ7A 3IOVA 3T96B 2PT2A 5ICQA 3ECRA 3HV1A 1M5BA 4LATA 1H76A 2H4IA 3SESA 2XX7A 4U1ZA 3SEWA 3TTRA 4RPNA 2BJJX 3VVDA 3E3KA 1B6HA 1PDAA 5FHNA 2RCAA 3PPNA 3O97A 3LSFB 1MQIA 4QSEA 4QSCA 1VFDA 2I48A 4F1YA 4OFLA 1LLSA 3Q27A 4NMYA 1LGBC 2PBWA 3HSTA 1AMFA 2HZKA 3ODBA 3SEVA 2VHAA 3P7IA 1AL3A 1TFAA 3BKIB 3OEKA 4EF2A 4RK9A 2H98A 1MPBA 1IXHA 3UN6A 3G3GA 2DE4A 1RYXA 4XXUA 3FJGA 1B0LA 4JWXA 3S4UA 2H25A 1D3KA 1Y3NA 4H67A 4O3CA 1DPEA 4Z0IA 2Z8DA 1USYE 3HPIA 4IB2A 4G8MA 1DPPA 3TTNA 3GLBA 3CG1A 4ZZEA 3IORA 2Z8EA 4I62A 1FTMA 4OYVA 3W9VA 2UVJA 3U8QA 1IXCA 3KSJA 1LCFA 2M8CA 2ANJA 4QSDA 3U1OA 1FQCA 4XTCQ 4PFUA 3TPAA 3K6VA 4U4SA 3W9WA 2AL5A 1SBPA 1IUDA 1FQEA 4ZEDA 3PMWA 5TP9B 4BDRA 4EQ7A 1Q1KA 5AA2D 3GZGA 4FATA 4NF4B 4ZE8A 2Y7WA 4H65A 3E13X 3OSRA 3GXAA 3IX1A 2GHBA 3CSBA 3TCHA 2OZZA 1M5CA 5TU0A 4GLIA 4OQOA 3MZ9A 3GBAA 1WVJA 2OLBA 4Q8RA 2HXWA 1GGGA 1SI1A 1URSA 3SDFA 3DP6A 1Y3QA 2XXRA 2A5SA 3MVXA 5JK4A 4H0WA 4RPOA 3FVKA 2XX8A 4L17A 5B7DA 2X26A 1H43A 3FIRA 3HCQA 3N5LA 2G93A 3PPPA 4Q5TA 2ABHA 4THIA 2NXOA 5F1QA 2HZLA 1SD3A 2NUVA 3LR1A 2O6AA 3ZS6A 1O63A 2UYEA 4G77A 4GQOA 4F19A 1S9TA 1FTLA 3GBBA 5JEIA 4GIZA 3KZGA 2NVUB 3O66A 1B2HA 3DLNA 2HAVA 4LQ2A 4G68A 3FXQA 4IY6A 4OETA 1EU8A 2Q2CA 4NEDA 4JB7A 4WEPA 1MM6A 2GHAA 3TZAA 4QRZA 4AB5A 4IO5A 1POTA 4U21A 3H6VA 4ESXA 4EXLA 4IO4A 1JQFA 1NH7A 1Y1MA 2OWSA 5KCJB 3C32A 3OEMA 1VE4A 3Q26A 1MY4A 4TOZA 1DTGA 4JBZA 3PUWE 5ITPA 1J1NA 5M2VA 1OMPA 1ZU0A 3FASA 4NF5A 4H6DA 5L8DA 2CZLA 4NF5B 3KN3A 3ILUB 4ONYA 5I58A 5FTIA 3K02A 1QUKA 4KYEA 1QVSA 3TCGA 3H06B 2UYFA 4ELOA 1MQHA 2ZYMA 1A55A 4U23A 3U92A 1B9JA 3TUSA 3ILTB 4AB6A 2A5TB 3M8UA 1AH5A 1ZIUA 2I4BA 1II5A 4ND9A 2Z8FA 2XXPA 4YMBA 4U1OA 3K00A 1IIWA 3M3LA 4ECFA 1PB8A 4U4XA 1TWYA 3IR1A 1P1UA 4BDQA 3VXCA 1B7ZA 1FCKA 4R6KA 1UIUA 4OENA 1PB9A 4PQJA 1M5DA 1AOVA 3K1NA 3ZKKA 5I2NA 5ITOA 1MY0A 3N6UA 4WEDA 4C1UA 1A40A 4OEVA 1LFGA 4I8CA 1Z7ME 3K0VA 5DVJA 4DE8A 4ELRA 1PEBA 5FTHA 5I2KA 4POWA 3SERA 2DYXA 2P0SA 3KFMA 1OLCA 3PU5A 5CMMA 3FV2A 2FA7A 2UVIA 4R6YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXTA 1MQJA 3PPRA 3VLWA 4JVCA 2DS9A 3LUYA 5DYHA 1AIVA 1FPIA 1MXVA 4G61A 3TYHA 1LBXA 2DXYA 3LSLA 4ISUA 2FVZA 1P1OA 4KHZE 3C35A 2F6PA 4QXDA 1JW4A 4OEUA 4IO7A 2F78A 4JXIA 4E0WA 2HAUA 3G3JA 4QF9A 4TQUQ 1Y4CA 3N94A 3EN3A 1NV4A 1B5IA 5H8HB 4BDNA 1Q35A 3ZKLA 4PBQA 4NE4A 1EZOA 1B0HA 3TDJA 3W15C 3UORA 3SZPA 4N81A 1ANFA 4MLVA 4ZEFA 1FBPA 2WX9A 3FXBA 3CHGA 4BDLA 3IJOB 4M4GA 2PT1A 1MRPA 3G3FA 1IMAA 1IITA 1QJMA 5ET8A 1MQDA 5IZ1A 5LOMA 4YICA 1B51A 2O1LA 2X7QA 3LC8A 1OVBA 4DZ1A 5LDZA 1QULA 3QIMA 1RYOA 1XVYA 2ZYKA 4P1LA 5DVFA 3AXFA 2QMWA 1N0TA 3HHFA 4DCXA 4U2RA 1B1XA 4GOTA 5CBRA 4MBPA 3H6WA 4G4PA 1BK4A 4FE8A 2V3UA 4OXVA 3CFZA 2WYKA 5BWJA 3CSGA 3BFTA 1ZTYA 2F97A 4ELQA 3V8XB 3RTFB 3MPLA 5EQ8A 2F7BA 4YU0A 4G8HA 4XKPA 4AS4A 3CVGA 3ZSFA 4P0IA 4LZ7A 3I3VA 3Q29A 4QFNA 3LBSA 4IO3A 1OQGA 4NWDA 3T9VA 4RYAA 1M5EA 3EQ1A 3PPQA 1EYJA 1NL5A 1FQBA 1BTJA 4PFWA 1FTAA 3FXUA 4K3FA 1GV8A 3PD9A 1PB7A 1NNPA 4GXAA 2O51A 1JW5A 1DK4A 2XA5A 5HM4B 1HSEA 1D9VA 3I5OA 1YTVA 2DVZA 5CMCA 4KYSA 2AL4A 1B3HA 4P47A 5IZZA 2XD3A 2E0SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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