1MPDA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg), complexed with maltose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpdA01
3I5OA 1LAFE 4ZEFA 4X1DA 1B5JA 4ESWA 3O28A 3ODBA 3IJOB 4JSDA 3O29A 3TCGA 1PC3A 5FTIA 3U1OA 2XXUA 3C33A 3LBSA 4ELOA 1RYOA 5FHOA 3PPNA 3U8QA 3CR9A 1XVXA 2P1SA 4H8IA 1FTLA 3M3KA 2DQVA 4DXUA 1LB8A 4G2ZA 3MZ1A 3KN8A 4H1XA 3EQ1A 4LATA 2VP1A 3KOTA 3PPQA 1H43A 4PFYA 1MXVA 1B05A 3OSQA 1LFGA 1TFDA 1POY1 1OLAA 3CSBA 3VE1B 2X7QA 2QS4A 3HN0A 3RGYA 1M5BA 2DWHA 4GFRA 1MY2A 2O51A 3RT6B 4LZ8A 1MY1A 3RY3A 3N94A 3IB2A 4Z0IA 3PMWA 1AH5A 2A5TA 5K2YA 4EF2A 1PBPA 4HCWA 3RLFE 3MP6A 5ELVA 1Y3PA 3VXBA 3C9HA 3VV5A 4PP0A 2DVZA 4FORA 3V89B 5I56B 3VVFA 3Q29A 3RNNA 2HXWA 1O7TA 5AA2B 1URDA 1UTBB 2ZYOA 5H8QB 1B7HA 4ZECA 1MXYA 5L9OA 2DWIA 1A55A 3EHSA 2I6EA 1M5DA 2F34A 5I2NA 3ECRA 4P0IA 1B4ZA 4F2OA 1SVXB 4GL8A 3FASA 1Y3QA 4DLDA 1O64A 1YPNA 4GRKA 3JZJA 4BDLA 2ABHA 4BDRA 3OO6A 1N3WA 3SEUA 1SDXA 3PUYE 3PMVA 3TPAA 1MG1A 3IK6B 2YLNA 1MY4A 4ZEBA 2OWTA 3KJTA 4R2BA 2F6GA 4O3AA 2UXAA 4WXJA 2V3QA 2XX8A 3K0VA 5TP9A 5KDTA 5TU0A 3IORA 2O84X 2F36A 3SEVA 3IOUA 4H67A 1S7YA 2XXRA 1MDQA 3T9XB 3QYTA 3RUMA 3PD8A 3B6WA 2ONSA 1PEBA 2O1LA 3OD7A 2XXYA 5L9SA 1WDNA 3SETA 1CB6A 3T93B 2DXRA 4M1VA 3H4ZA 3A09A 5ITOA 1SW4A 1ZMGA 2QJEA 4F18A 3UGWA 2I0CA 4PFUA 2DOJA 1HSLA 4I1DA 2V84A 4ZEIA 4HS7A 4F1YA 2Y84A 1Z7NE 4IY6A 1IXCA 2REGA 4N13A 3H6TA 2A5TB 4F3PA 4OEVA 3G3GA 4GIZA 5FHNA 3MZ9A 4I8CA 3A3UA 1ZJLA 5L8DA 3IL1B 3QUFA 1IITA 3G3FA 2V3TA 3S9MC 4TQUQ 4ZE8A 1B40A 3E13X 3ONMA 3T9VA 1LBCA 2D5WA 2XXHA 3FZVA 3TMGA 1VFDA 4HTGA 3A3CA 2XX7A 1L5TA 3FGSA 4H0WA 2P2AA 2ZNSA 2XXXA 4TLMB 3C4MA 5I2NB 4PFTA 1IEJA 3K6VA 2Z8FA 3PUVE 1ANFA 1MH3A 3FV1A 5CMBA 1ZIUA 2R71A 1OMPA 1Y9UA 3C31A 4R9FA 1ATGA 3UA8A 4RPOA 2AL4A 4ONYA 4G68A 1DPPA 4GQOA 4H65A 2ANJA 5LOMA 4OFLA 4NF8A 1VSOA 2H25A 3QIMA 4RJZA 5TP9B 5KDTB 3QUJA 1SD3A 1MXZA 2X26A 2F6PA 5ITPA 2OWSA 2G29A 4ZZEA 4QFOA 3ZKLA 4IGTA 1LCFA 3FD3A 3S9EA 1KWHA 3VVDA 2Z22A 3TEPA 1PB8A 3EN3A 5DEXA 4POXA 3CG3A 3FATA 2GRVA 2I48A 3H6VA 1EZPA 2Y7RA 1DTZA 2RC7A 2YPNA 3DP4A 4OVJA 4Q30B 1LAGE 4EQ9A 3PV0E 4MLQA 4DXCA 2H5YA 3FXRA 1M5CA 3PPRA 3O97A 1N0TA 2QMXA 3JV9A 5DT6A 2E1SA 3OEKA 4NWDA 3W15C 1Y1ZA 4IO3A 3TCHA 4XXUA 2FYIA 1B0HA 3B6TA 5CMMA 1IZ1A 4U23A 5AA1A 1B32A 4LVQA 5FTHA 4JSOA 1JETA 1A8EA 1SQYA 1WVJA 3TKDA 4YKKA 2F7AA 1LFHA 2PT1A 3EHTA 4R6YA 5I2KA 3KFMA 1URSA 3IB0A 4IO7A 3BBRA 5DYHA 1P1OA 1GR2A 1XT8A 5KZTA 5A5XA 3DM0A 5CM6A 3IOWA 4GL0A 1FCKA 3V83A 2F35A 4HW8A 4YB6A 4OEUA 4YKJA 4M4GA 4YKPA 4NWCA 3K4UA 4C1TA 2OJTA 4ELRA 3IX1A 4ELQA 5AA3A 1B1XA 3PUZE 4UACA 1FQFA 1UQWA 3RPWA 4LQ5A 4G68B 2RC8A 1JEUA 2W7YA 4DIGA 2RF1A 5I57A 1Y1MA 4KCCA 1MH4A 3GLBA 1FTKA 4NF8B 2KLFA 1SI0A 4GXSB 3G3IA 1D9VA 3K6WA 1Q1KA 1MQJA 3PMXA 2NWJA 3Q27A 4RA1A 1SI1A 2F5XA 4LP2B 3OENA 5CBSA 4L17A 4R73A 4YMBA 3W9VA 4KHZE 1Y3NA 3U94A 4LZ7A 3VXCA 2DWAA 3HO7A 4HCYA 3SEWA 1PDAA 3O6HA 3MWBA 1MXUA 4I62A 2BJJX 4FECA 4PE5B 3THIA 3F11A 4P11A 3OO9A 3VLVA 3SEYA 1D4NA 3T9UA 3DP6A 3LSWA 4YZZA 4QRZA 3TFLA 3TTLA 1EU8A 1QKAA 4KQPA 2AYSA 3OSRA 5ICTA 3K1NA 3FVGA 4AB5A 3CFLA 1IXGA 4O3CA 3S2VA 3LSFB 1IXHA 4DE8A 3GXAA 4F22A 2XHDA 4IY5A 4U21A 3TTNA 5CRYA 3SDFA 1XHYA 3QK6A 5I2KB 1Y4TA 1D9YA 3G3HA 3CVGA 4ZDMA 1NFTA 3ILUB 3ZKKA 4I9DA 4GWOA 4OESA 5EYFA 3M3LA 2I3WA 4U2RA 1M5FA 1DSNA 1NH8A 1MPBA 3H7MA 3O66A 4GF8A 3M3FA 4C1UA 3E3KA 2O1MA 4XKNA 4X1BA 2FNCA 4G8HA 2VD2A 3PPPA 2RCAA 2LAOA 4RK2A 1OQGA 3KZGA 2I3VA 2O69A 3GBBA 5JK4A 2ZYMA 2H98A 2UVJA 5I57B 4KPTA 1UIUA 2RC9A 2D3IA 1LCTA 2XXWA 3FJMA 4TLLB 5H8FA 3K2DA 1IIWA 1B3FA 1LAXA 3UK4A 3SEXA 1SBPA 4JXIA 3VDFA 4JWYA 4FEBA 1AMFA 1NH7A 3SERA 3C35A 1QUIA 1FW0A 3KG2A 2P0SA 1FQEA 3IAZA 2O7UA 3T96B 4IO4A 1MXWA 2Q89A 1LB9A 1QULA 4U1OA 1O63A 3CIJA 4RK9A 4R6HA 1POTA 3DELB 3QSLA 1BIYA 2DXYA 4GD5A 5CMCA 3S9NC 3KGCA 2HEUA 2G93A 3OXNA 2QS3A 5IKBA 4ZS9A 1B5IA 3L6HA 5I84A 2F8DA 2DE4A 1I6AA 1XVYA 4OMBA 1LSTA 4NE4A 3C36A 2XXIA 4GVOA 3KSJA 4FJPA 2B65A 2UVIA 4FEDA 4KFQA 3P7IA 1H45A 4BDMA 4NF4A 3IB1A 1SYHA 2Y7KA 1IQ7A 1N04A 5BWJA 1URGA 4OHNA 3RTWB 4RNSA 3CSGA 3KOSA 1NNFA 4ZEKA 1IUDA 1SW2A 1USYH 2ZNTA 3MW0A 1JNFA 2QSXA 1IXIA 3MUQA 2GHAA 3MVXA 2I0BA 3K00A 4QF9A 3LSXA 1N7XA 1A8FA 5HBCA 3G3JA 1GGGA 3FVNA 3V5AA 4DDDA 3SKPA 3MP8A 4X48A 2QS1A 4OERA 1B3LA 4BDQA 4E0XA 2V25A 4G8NA 1JW4A 1P1QA 5JTYA 2X7PA 2DSFA 2VOZA 5DVJA 1ZU0A 3G3KA 1FQCA 2V93A 1HSJA 2DWJA 3ZSFA 5H8FB 1A54A 1B3GA 4DZ1A 1XOCA 3BFUA 2ZNUA 1EH3A 4U4XA 4KCDA 4OYVA 2Q9TA 2F97A 3LUYA 2AIXA 2D21A 5AE4A 1LLSA 3CI8A 3FJ7A 4PFWA 3U72A 1WODA 5I58A 5TPAA 3FVOA 4KD5A 4EQ7A 4MFIA 4XKRA 3HSTA 3B6QA 3Q28A 1DPEA 1N3XA 4OWDA 2VD3A 2ZYKA 3KEIA 3TZAA 4IO5A 5IAIA 1TWYA 3N26A 2CMOA 5CC2A 1AIVA 1P1WA 4KYSA 2IEEA 4QHQA 3ILTB 4NF4B 1N76A 1US5A 4ND9A 1GTKA 4Z7EA 4IB2A 1MY3A 3MPKA 1B5HA 3TCFA 3K02A 1GV8A 3MQ9A 4H5FA 2UYFA 3H03A 2O7IA 4XIGQ 3GZGA 1JW5A 4FATA 1H3DA 4MBPA 4DCYA 1EZOA 3MP1A 2FA7A 3TQLA 3H6WA 3KSXA 4FAJA 3MBPA 4AB6A 3WAEA 4JBZA 4RYAA 2ALUA 2HQ0A 2HAUA 4G77A 4XKQA 5EHSA 3MJNA 3R6UA 3OO8A 3PUXE 1LAHE 3MVYA 2ONKE 2XXVA 3C34A 1VE4A 1B46A 4EF1A 4JWXA 4OENA 2GFEA 3FJGA 1EZ9A 3FUZA 2QRYA 3Q25A 4GOTA 4ZE9A 3V8XB 4OETA 1CE2A 3QAXA 1UTHA 4WEPA 1MQDA 2F78A 1MQIA 4GLIA 5CBRA 1ZLQA 1Z7ME 4H6DA 1XC1A 2XXTA 3MAMA 5HM4B 2Z23A 1S50A 4OZ9A 3T66A 3SESA 3KN7A 3AXFA 1NNKA 3OOAA 4BDNA 4JDFA 1MM7A 1JW1A 5KCJA 2XXQA 5I58B 5TPAB 2QL3A 1NKXA 1BP5A 4KYDA 5AA2A 2CZLA 1BLFA 2OBGA 1UTBA 3GBAA 2I49A 2OZZA 2NVUB 4YMAA 1LFIA 1QVSA 1R6ZA 1TFAA 3S4UA 5DEXB 1AL3A 1OVBA 1RYXA 2GH9A 1OLCA 2THIA 3TODA 3T9HB 2ZXTA 4G4PA 2H99A 3HHGA 4NEDA 3FVKA 3OEMA 3TQWA 5DVIA 1JVXA 3RT8A 4XKPA 3IOTA 3RTFB 3TTKA 3USDA 4N07A 2NOOA 2HFBA 3CFZA 5FHMA 3S9LC 4F31B 3I6VA 3KBRA 3IR1A 2H9BA 4OFJA 2NUVA 1QW0A 4FIMA 4FE8A 5H8HA 4ELPA 2OCUA 1ELJA 4LQ2A 2B3FA 2NXOA 4EUOA 1QKBA 3OMBA 3QXMA 4R72A 3PD9A 1YCJA 3R26A 1M5EA 1ZTYA 2A5SA 4OFOA 4QSDA 4GXAA 4E0WA 5I59A 1LBBA 1OQHA 1FTJA 4C0RA 3FXUA 4QFLA 1NNPA 5A5XB 1PB7A 4LONB 1UTHB 2H4IA 1JEVA 3LR1A 4TOZA 1BTJA 4Q5TA 2B3BA 3N6UA 1YTVA 4IO2A 2PT2A 4QFKA 2OLBA 4MH5A 1MQGA 3JYRA 4IGRA 3W9WA 1TT1A 3D4GA 2QS2A 5KCJB 4NMYA 4F1VA 1Y4CA 3H6UA 1FTMA 3PPOA 1F9BA 1MPCA 1MPDA 2XD3A 4NF6A 4YICA 3WAFA 1QJMA 2UYEA 2VHAA 4F2QA 3U93A 1B4HA 3IOVA 1DOTA 4RXLA 5DVFA 1TXFA 1B1HA 2Y7PA 3O9PA 2AL5A 2RINA 1YAEA 3O6IA 1R9LA 3LSLA 4QSEA 2ONRA 3CFXA 3VLUA 2XX9A 4F3GA 4U22A 2RKMA 3OELA 5AA4A 4H8JA 4U1ZA 2O6AA 2HCAA 3K6XA 3K01A 4YU0A 1I6QA 2I58A 1ZBMA 2UVHA 5H8SA 3KN3A 4UA8A 4KI0E 3K1MA 4EXLA 2DE3A 1VFEA 5F1QA 1B2HA 2Y7IA 1B7UA 2DE2A 2F7CA 2Y7WA 5B70A 3CG1A 1OIBA 4KR5A 5ISUA 4R9GA 1MQHA 4X9TA 4BDOA 5H8HB 1US4A 3VLWA 4OTEA 1FTOA 4DCXA 3IO6A 3L6GA 2HZLA 1OVTA 2ZYNA 4YB5A 3MVWA 3IJXB 1DTGA 4NF5A 3D4CA 5ICQA 4F39A 5I59B 1DMBA 3HPIA 1N7WA 4RY1A 1B58A 2VGQA 2V3UA 2YJPA 4EXKA 2WKYA 1II5A 3IO4A 4R75A 3RQTA 1USYE 4Q8RA 5BUUA 2XXPA 1QUKA 3PU5A 1J1NA 3N5LA 1A40A 2PVUA 3UP9A 1I6BA 1B0LA 3UIFA 4LA9A 3B7DA 3HCQA 1JVYA 4G8MA 4QSCA 2XD2A 2RCBA 1RKMA 3TTRA 4AQ4A 5F7VA 3LC8A 4YAHX 1P1UA 3MVZA 5L9MA 4THIA 2E0SA 5JEIA 4NF6B 2DYXA 4K3FA 2DVCA 3T22A 3MPLA 3KJ7A 3I3VA 4EQBA 4PETA 3OO7A 1BKAA 1H44A 4U4SA 3FIRA 4YKIA 2ZMBA 2DP8A 4RPNA 3UN6A 3PGFA 3O2AA 5CI5A 4LZ5A 1A7LA 1SYIA 3VFJA 1R9QA 3U92A 3BFTA 2F7BA 1Y20A 4ZEDA 5AA2D 2DS9A 1NNTA 1MY0A 3ZS6A 3PUWE 1S9TA 5AA4B 3EPEA 2GHBA 1A99A 5H8NA 1B51A 5J1DA 3H06B 4OQOA 4F29A 2I4BA 1MRPA 1PBQA 3MC2A 4F19A 2HZKA 2I4CA 1B3HA 2QPQA 3Q26A 1MXXA 3M8UA 2PBWA 3BKIB 1GVCA 4QFNA 1SW5A 1LGBC 3HV1A 2PX1A 4OXVA 2QMWA 1D3KA 3TDJA 4NF5B 4YB7A 1HSEA 2IA4A 3K6UA 1NL5A 2PMSA 1Q35A 1QUJA 3MZBA 3TAJA 1MM6A 3TELA 4POWA 3CRBA 3TUSA 4BLAA 4F3BA 3DP8A 4JWOA 2Q2CA 4NTLA 5EHMA 3TYHA 1FQBA 1B52A 4ECFA 1SW1A 1P99A 4PQJA 2Z8EA 2UVGA 1I69A 1VR5A 1XS5A 1B3EA 1MDP1 3C32A 5JTYB 3R7XA 4R6KA 4JB7A 1H76A 1N84A 1T0KA 4EDPA 3G7WA 4WKMA 1P1NA 5DTBA 3HHFA 2Z8DA 4ZZAA 2REJA 2PYYA 5K2XA 2OK2A 2ESNA 1UIVA 4H5GA 3RN8A 2Q88A 3E4RA 3K1PA 4XTCQ 4KYEA 2HAVA 4LUBA 1R1NA 4ESXA 4R74A 1B9JA 4N6PA 3DLNA 3N6TA 4DXBA 2O68A 4R2FA 3VVEA 3EHUA 4Q0CA 1B6HA 5I56A 1JQFA 2M8CA 1FQDA 3O6GA 4IO6A 5H8NB 3UORA 1AOVA 2Q2AA 1MS7A 2R6GE 5H8QA 4F1UA 1NMUA 1PB9A 4P0GA 4WEDA 3TTMA 4ISUA 3FXQA 5M2VA 4F3SA 5B7DA 1ZKBA 4QFPA 2R9JA 3H3GA 4G68C 3FV2A 5CMKA 1FQAA 4MF3A 2Q8JA 4MLVA 3EF7A 1B7ZA 4O3BA 3E9XA 5HPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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