1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
1I6AA 3CI8A 2ZYKA 4XXUA 2QSXA 5F7VA 4YU0A 3VLWA 1R6ZA 3IOUA 3D4GA 2A5TA 5B70A 5ISUA 2H5YA 4R72A 1VFDA 3UGWA 4EUOA 1FQEA 4GFRA 3KOTA 5JEIA 1A7LA 2RKMA 3IR1A 4OEUA 2G29A 4G8MA 4ZZEA 1N76A 2HFBA 3O6GA 3LC8A 4BDRA 3V83A 4G68A 3T9XB 2Z8EA 3B6TA 1A40A 2XXPA 3PU5A 3KBRA 1AMFA 5DTBA 1O64A 2V3QA 4ZE9A 4DDDA 4FECA 1US5A 4BDQA 2F6GA 1SI0A 4NE4A 1MM7A 1LSTA 4IY5A 4HCWA 4KCDA 2YJPA 1B5JA 3IL1B 4IB2A 4QFOA 4YZZA 3C9HA 4OYVA 5I2NB 4GVOA 3QYTA 2NOOA 4YKPA 1B0HA 4GLIA 2R9JA 4G8NA 3TQWA 3DP6A 2H25A 3PD8A 4Q5TA 2ZMBA 4DXCA 3PGFA 2XXHA 1B3HA 1P1OA 1OVTA 2GRVA 2Y84A 3ZS6A 4I1DA 3CSGA 5L9SA 4AB5A 3N5LA 3RTFB 2O6AA 4R9FA 2UVHA 3K00A 3CG3A 5CMBA 2PT2A 4FORA 4OEVA 3PUWE 4RJZA 3TUSA 4EXLA 1ZKBA 3O2AA 2GHBA 4Q30B 2UYFA 3C33A 3RPWA 1B7ZA 3TTNA 3SESA 4NEDA 1N3WA 3SKPA 1MS7A 3KJ7A 3FGSA 2XXIA 3IK6B 4F1VA 2Z22A 5I58B 4EF2A 2DVZA 2OLBA 4JSDA 4ZS9A 3TTLA 1USYE 1ZJLA 3Q25A 1XC1A 4H0WA 1JETA 3G3KA 2Y7IA 4JDFA 2NWJA 1PBPA 2Z23A 1PB8A 1LCFA 5DEXB 2Q88A 4H5GA 4RK9A 5CI5A 1FCKA 4WEPA 3S4UA 1LCTA 1D9VA 2XXYA 2THIA 3TCGA 3S9MC 5H8NB 5H8HA 3HV1A 3RQTA 3RT8A 2VOZA 2RCBA 3KN7A 4HTGA 2O1MA 3TODA 1B51A 3IOVA 3BBRA 4XKRA 3K6UA 3VLUA 1IXCA 1JVYA 5EYFA 2X7PA 1DSNA 4ESXA 3DM0A 3KSXA 1P1UA 4G68C 3FXUA 2KLFA 2I0CA 3VXCA 5HM4B 3IORA 1LAHE 4KYSA 3OOAA 1Y1ZA 4I9DA 1P99A 3G3GA 3RN8A 3K2DA 4N13A 4OTEA 4G77A 1Q1KA 4H65A 3IB1A 3IJXB 1JEUA 4JB7A 5I84A 2ONKE 2RCAA 1DTGA 5TPAA 2AL4A 1XS5A 3Q27A 3LSFB 4NF8A 2W7YA 4PFYA 2Y7WA 3QUFA 1Z7NE 1R9QA 1GVCA 1MXXA 4WXJA 1MY0A 3R7XA 4O3AA 4IY6A 5BWJA 5DYHA 4OENA 2HAVA 2DS9A 2DWJA 1M5FA 3N6UA 5L8DA 4QFKA 5CMKA 2X7QA 2VD3A 4ELPA 2ONSA 3TYHA 3FD3A 4IO6A 3WAEA 4POXA 5TU0A 3SEYA 4YMBA 2R71A 1QUJA 4EXKA 3KN3A 3CIJA 3QXMA 2DQVA 4U4SA 1NMUA 2E0SA 3FVGA 2XXVA 2V84A 5H8HB 1XT8A 4NMYA 4GXAA 2QS4A 3B6QA 3H6UA 4FATA 2PYYA 3HSTA 3QUJA 3T9VA 3Q29A 1B05A 4IO3A 3EHSA 2DWAA 3SEWA 5HPQA 3CFLA 1MXUA 4FIMA 3TTKA 4FE8A 3FJMA 5IAIA 2Y7KA 2F97A 1D9YA 4NTLA 1AIVA 4P0GA 3C32A 2D21A 4BDLA 1MXZA 2CZLA 3MP1A 1OQHA 2UYEA 3U1OA 1P1NA 4LUBA 4FJPA 1UTHA 4R74A 2F35A 4OXVA 4JXIA 4TLMB 2ALUA 3KZGA 1XVYA 1JQFA 5FHMA 1B3EA 1B6HA 3IOWA 3VVEA 2DSFA 4KR5A 1B1XA 1QKAA 1MG1A 3SERA 2P1SA 1IQ7A 3RUMA 3TTRA 4G4PA 5H8SA 2V3TA 2RC7A 4H6DA 2OWTA 3W9WA 2O51A 3PPOA 1H44A 1CE2A 3HHGA 2HZLA 3PUVE 1MH4A 3U92A 3U94A 1II5A 3MVWA 3G3JA 3EQ1A 3E9XA 3K1PA 1LAGE 2WKYA 3PUYE 1FTJA 1SW1A 2G93A 1B0LA 2QRYA 1GTKA 3MJNA 2XX9A 1IIWA 4MFIA 3OSQA 1I69A 1LB8A 5IKBA 2DWIA 3ZKKA 2RC9A 5DVIA 2OZZA 4QFLA 4WKMA 4GWOA 3EN3A 3T96B 2Q2CA 1A55A 1M5BA 1SVXB 2I58A 4R73A 2F36A 4OVJA 3O97A 3G3FA 3SETA 1QUKA 4O3CA 1QW0A 3LBSA 5I56A 3EPEA 4DE8A 2O68A 4EQ7A 5I57B 4DIGA 4F3SA 5A5XA 5H8QB 1LLSA 3H6TA 4FEDA 1UIVA 4MBPA 1OIBA 1N3XA 3QAXA 4HS7A 2AYSA 4R2BA 2QPQA 2YLNA 3LSWA 1GGGA 1WVJA 1MQIA 3U72A 3TFLA 4L17A 1A99A 2HQ0A 1N0TA 3A09A 4PFUA 4X1BA 4JWYA 3KFMA 4KYEA 4DXUA 3F11A 4IO5A 1EU8A 5I59A 5AA2B 2Q9TA 2VP1A 4F18A 1Y4CA 1NNKA 5JTYA 4LP2B 3PPRA 4ZE8A 3U8QA 3B7DA 4OQOA 2DWHA 1DPEA 3SEVA 3C4MA 1LAFE 1HSJA 3MBPA 3HHFA 2QS3A 3VFJA 2QS2A 2I48A 1ZTYA 3GBBA 3IB2A 2BJJX 4NF5B 4ZZAA 3HO7A 4XTCQ 2XD2A 2UVIA 3EF7A 1Y1MA 3USDA 5ICTA 4IO2A 4R6KA 2QL3A 1ANFA 3W15C 1B3LA 4KQPA 3ONMA 4P11A 3TCFA 1UQWA 3CRBA 4P0IA 4MLVA 1Z7ME 2ZYNA 2HAUA 4YMAA 1B46A 4F19A 4RPOA 3V8XB 2A5TB 5AA4A 3FXQA 2QMWA 1O63A 3MZ1A 4OWDA 1VFEA 4DZ1A 2FA7A 4MF3A 2QJEA 3DP8A 1SDXA 2RINA 3DP4A 2AIXA 4X48A 4ZEIA 3OSRA 1SW5A 3MP6A 3VXBA 2XHDA 3RY3A 3H6VA 5I59B 4F22A 2ABHA 3T9HB 1FQBA 2DE2A 4F2OA 2Q2AA 1LBBA 3ZSFA 4OFOA 3UP9A 3MVYA 1TFAA 5JTYB 4G68B 1LGBC 3I5OA 4XKNA 2FNCA 4EDPA 2Q89A 2REJA 3M3KA 1N84A 1B52A 2XXRA 1MY1A 5L9MA 3VVFA 2H9BA 3PMWA 3CFXA 1DOTA 1S50A 4N07A 4ZEDA 2B65A 3K6WA 3FXRA 4X1DA 4DCXA 3CG1A 1QKBA 1Y3PA 2XXXA 1SW2A 3K6VA 2NVUB 4R6HA 4OERA 5AA1A 3FIRA 5KCJA 2VD2A 4F29A 2O7IA 4QSEA 1NFTA 1D4NA 2ZNUA 2R6GE 1MDP1 3R26A 3UN6A 2A5SA 2H99A 3O6IA 2XX8A 5DVFA 3E4RA 3MZ9A 3GZGA 2Y7PA 2V93A 2DXYA 3VVDA 1URGA 3MAMA 2UVJA 4G8HA 1XVXA 4JSOA 3MVXA 4ISUA 3TTMA 3T66A 4TQUQ 1B3GA 4HW8A 3KJTA 1SQYA 5TP9A 3TQLA 3E13X 1CB6A 1H43A 1QJMA 3KOSA 4BLAA 2XXUA 4ZECA 3CFZA 4GRKA 4U2RA 1NNFA 2UXAA 1FTMA 4KCCA 2O84X 5CC2A 2F6PA 4GF8A 1FQFA 3MW0A 3P7IA 1MXWA 1MY3A 4AB6A 2IEEA 2V25A 3ILTB 1T0KA 1GV8A 3VV5A 2B3FA 4QRZA 1Y20A 1RKMA 1LB9A 3FVKA 2D3IA 4IGTA 1M5CA 5KCJB 3K1NA 1IUDA 2F7AA 3RNNA 2CMOA 4NWDA 4RYAA 1HSLA 4LATA 3TDJA 2XD3A 2B3BA 1TT1A 1MPBA 1NNPA 1R9LA 4ZEFA 3EHUA 1VE4A 1B32A 3EHTA 3GXAA 3M3FA 1B9JA 3SEXA 4H67A 1F9BA 2ANJA 5TPAB 2VHAA 1IXHA 4WEDA 1URDA 4E0XA 4NF8B 4E0WA 5K2XA 4BDNA 5KDTA 2Y7RA 1OLCA 3DLNA 4LVQA 3FJ7A 3UK4A 1OMPA 1ZU0A 3B6WA 1EZ9A 1FTLA 3BFUA 2DXRA 3IO6A 3H4ZA 3LSLA 1BKAA 4IGRA 4KPTA 1JW4A 5L9OA 3MPKA 3U93A 5AA3A 1URSA 3TEPA 2FYIA 5JK4A 1EZPA 3OD7A 3PV0E 1MDQA 4F1UA 4R75A 3JZJA 4LQ5A 4AQ4A 2F7BA 3H6WA 4QF9A 2GFEA 3QSLA 1LFIA 1YTVA 4Z7EA 2M8CA 2F7CA 3TELA 1POY1 5FTIA 1WDNA 1QVSA 4GXSB 1IEJA 3O66A 2DVCA 1GR2A 1B7UA 3K1MA 5AA2D 3FV2A 3M3LA 5BUUA 3OO7A 4QFNA 1ZMGA 3RT6B 1VR5A 5I2NA 3OO6A 3L6GA 1SBPA 3H06B 1MY4A 4GL0A 4KD5A 4H8IA 4YKJA 4OZ9A 3FUZA 3QIMA 1Y9UA 4OESA 1BP5A 1UTHB 1IXIA 1IXGA 2ESNA 1MQHA 1YPNA 1H45A 1AOVA 2F5XA 2V3UA 4OFLA 5CBSA 4K3FA 2OCUA 4I62A 3K02A 3I3VA 3SDFA 1EZOA 2OBGA 1JNFA 1MY2A 5KDTB 1FTOA 3A3CA 1ZIUA 4FEBA 4MLQA 2O7UA 4F2QA 3CR9A 4YB7A 2XXWA 3D4CA 2XXTA 4UACA 4KFQA 1OQGA 1B7HA 1FW0A 2DP8A 1O7TA 1AH5A 3ILUB 4C0RA 2F78A 5DVJA 3IO4A 4ND9A 1M5EA 1Y4TA 3TMGA 1OVBA 4YKKA 1JEVA 2PMSA 4TLLB 3N26A 5AE4A 1LAXA 2PBWA 4OFJA 4ZEKA 1BTJA 4GQOA 2HEUA 4H1XA 3THIA 3Q26A 1MPDA 3KEIA 5CRYA 4ZDMA 5I58A 3MP8A 5M2VA 3MQ9A 3C34A 4N6PA 1ELJA 3IAZA 1QUIA 3MVZA 1XOCA 1RYXA 5DEXA 1B1HA 2IA4A 1JVXA 4NF6A 1B40A 4F3GA 1B2HA 5H8NA 3I6VA 4QSCA 3OMBA 1FQDA 5ITPA 4OHNA 5FHOA 2F34A 4THIA 4H8JA 3IOTA 4KYDA 4GL8A 5I56B 1A8FA 2ZXTA 2OWSA 3LR1A 1B5HA 3WAFA 1SYIA 1LBCA 5A5XB 3O9PA 1ZLQA 4KI0E 4RY1A 1EH3A 1N7WA 4YB6A 3L6HA 3LUYA 1L5TA 5KZTA 4FAJA 1I6QA 4QHQA 4PFTA 3OENA 1US4A 5HBCA 4PETA 1VSOA 2UVGA 1MQJA 1USYH 2DOJA 4LZ8A 3C35A 5EHSA 4QFPA 3M8UA 3VE1B 1NH8A 4OETA 4ZEBA 3TZAA 1AL3A 2I4BA 3K4UA 4LZ7A 4X9TA 1IITA 4XIGQ 3C31A 4GD5A 2NXOA 3S9LC 5H8FA 5K2YA 2P0SA 1B58A 3OO9A 1Q35A 1J1NA 1A54A 3OXNA 4O3BA 4RXLA 4TOZA 1NNTA 1PB9A 2I3VA 1R1NA 5I2KA 3PUXE 4PE5B 1NL5A 1QULA 1S7YA 2I6EA 1P1QA 3MZBA 2NUVA 2PT1A 3CVGA 4LA9A 1MXVA 4JWOA 4BDMA 2QMXA 1XHYA 4M1VA 4F39A 1M5DA 2ZYOA 1KWHA 3E3KA 3GBAA 3G3IA 4ELRA 4Z0IA 4NF6B 1BIYA 5DT6A 1UTBA 1ATGA 3IJOB 1N04A 4EF1A 3FASA 3TCHA 3A3UA 3PUZE 3TAJA 1FQAA 3FV1A 2AL5A 1YCJA 2ZNTA 2OJTA 2REGA 2VGQA 3BFTA 2O1LA 2D5WA 1POTA 3BKIB 3TKDA 3KGCA 1HSEA 3ODBA 2H4IA 3H3GA 1MXYA 4Q8RA 1NH7A 1LFGA 5AA4B 3FATA 1SYHA 3OO8A 3TPAA 2RC8A 4U22A 1RYOA 4ECFA 3UIFA 4IO7A 1PDAA 1B4HA 4LONB 3V5AA 2YPNA 1LFHA 4ELQA 2ONRA 1SI1A 3CSBA 2O69A 1TFDA 5F1QA 3JYRA 4NF4A 3MC2A 1FTKA 2OK2A 5CM6A 1JW5A 1TXFA 4F1YA 5H8FB 3O28A 4F3BA 4DCYA 2H98A 5FTHA 5LOMA 4RA1A 4G2ZA 4POWA 3SEUA 1YAEA 3HN0A 5I2KB 3OEKA 2QS1A 3MUQA 1B4ZA 3G7WA 2I4CA 3PPQA 4R9GA 3ECRA 1DPPA 4OMBA 2HZKA 3OELA 3Q28A 3RLFE 1PBQA 1WODA 3HPIA 2XX7A 3KG2A 5CMMA 2P2AA 4Q0CA 4U1ZA 1UTBB 4YICA 3S2VA 4GOTA 1PC3A 4C1TA 4PP0A 2I0BA 3VDFA 1H3DA 4LZ5A 4I8CA 1TWYA 3QK6A 2ZNSA 4XKPA 4NWCA 3IB0A 3H7MA 1D3KA 4M4GA 3T9UA 3PPPA 4EQBA 4IO4A 5ITOA 1MM6A 1NKXA 3LSXA 3K01A 1MPCA 1MQGA 5CMCA 4F3PA 5ELVA 3T22A 3S9EA 1I6BA 4F31B 5I57A 2RF1A 4ONYA 4YKIA 2HXWA 5H8QA 3W9VA 4XKQA 2I3WA 4RK2A 2DE3A 1ZBMA 5EHMA 4MH5A 1B5IA 3V89B 4ESWA 3O6HA 3OEMA 4U1OA 4RNSA 1P1WA 3UA8A 2F8DA 5TP9B 3S9NC 4KHZE 2GH9A 1FQCA 4PQJA 2HCAA 4EQ9A 3UORA 3MPLA 3PPNA 4PFWA 3MWBA 4R2FA 4JBZA 1N7XA 4NF4B 4QSDA 1SD3A 2X26A 5AA2A 2XXQA 1UIUA 4R6YA 2ZYMA 3KN8A 3AXFA 4GIZA 5J1DA 5FHNA 3FVNA 4ELOA 4H5FA 1IZ1A 3JV9A 4DLDA 3FVOA 1MH3A 3H03A 3DELB 3K0VA 1JW1A 3FZVA 5B7DA 1DMBA 4DXBA 2E1SA 3RGYA 1PEBA 4HCYA 3R6UA 3PD9A 1MQDA 4U4XA 3IX1A 2DYXA 4U23A 1SW4A 3C36A 1DTZA 4BDOA 2LAOA 3PMVA 1MRPA 4NF5A 2PX1A 3N94A 1S9TA 2GHAA 2I49A 4U21A 4UA8A 3T93B 3HCQA 1OLAA 4YB5A 1H76A 2Q8JA 4C1UA 3N6TA 3O29A 4RPNA 5CBRA 2DE4A 1A8EA 3G3HA 5ICQA 3FJGA 3RTWB 1PB7A 4YAHX 2PVUA 1Y3NA 2Z8DA 3GLBA 3PMXA 1B3FA 3VLVA 1Y3QA 3K6XA 3KSJA 3ZKLA 4LQ2A 2Z8FA 4JWXA 1BLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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