1MS7A

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-des-me-ampa at 1.97 a resolution, crystallization in the presence of zinc acetate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluR2 ligand-binding core complexes: importance of the isoxazolol moiety and 5-substituent for the binding mode of AMPA-type agonists
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor subunit 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ms7A01
1FCKA 3SEXA 4ELRA 4NWCA 5TU0A 2B3BA 1MPDA 4DCXA 4OWDA 3LC8A 4PFYA 4N6PA 4U4XA 3G3HA 2Q88A 2RF1A 3A09A 1HSEA 2HEUA 2UVHA 4QFKA 4TLLB 3UA8A 1VFEA 3TELA 2IA4A 3K0VA 5FTHA 1FW0A 3RTWB 4P0GA 1TWYA 4ZECA 3T96B 1FQDA 5L9MA 3U93A 4NF5B 1ZU0A 2XXWA 3PPQA 3M3KA 1JEUA 3FJGA 3WAEA 1Y1ZA 2GFEA 4ZE9A 2F6GA 4GL8A 2GRVA 1UIVA 4G68B 4DXCA 3R26A 1MQJA 1VFDA 1SI0A 3FV2A 2ZYNA 1FQFA 3FVNA 5DTBA 4F39A 5JTYB 3H6WA 4H8IA 2ONKE 1T0KA 4EQBA 2PBWA 2H5YA 2QS2A 1OMPA 3LBSA 1FQBA 2NUVA 4YAHX 3CSBA 3PD8A 3V83A 5DYHA 4GIZA 5A5XB 4NEDA 5CI5A 5EHMA 1DTGA 2Q8JA 5IAIA 1PC3A 2V25A 2P1SA 3C4MA 5I2NB 2ONRA 2I4BA 3C9HA 5CMCA 3H7MA 5I58B 3CIJA 3SEYA 3OSQA 4X48A 5AA2A 3O9PA 3O29A 3O66A 4XKQA 4ISUA 2ALUA 5K2XA 3OELA 4IO6A 4Z7EA 2D3IA 4KCDA 1B3LA 1A8FA 1D9YA 3FVGA 2F6PA 4R6KA 2DOJA 1RYOA 2THIA 4DLDA 5CMBA 4PETA 3GBAA 3JV9A 1EU8A 3UN6A 3HN0A 4YB7A 2H98A 2O7UA 3OXNA 5DEXA 2Q2CA 3OSRA 1MXVA 3GXAA 3RY3A 3QXMA 1B7ZA 4XIGQ 2ZYOA 3CG1A 2WKYA 3QYTA 1TFDA 2XXRA 4PP0A 1MQIA 3UORA 2RCBA 3IB2A 1B58A 4JWXA 1WVJA 2DXRA 3K6XA 1A40A 3FXUA 3UP9A 4IGTA 2HQ0A 4OQOA 3GZGA 2B3FA 4ESWA 4FORA 2Z22A 3MP8A 2VD3A 3T66A 4KD5A 4AB5A 2ANJA 4X1DA 2QJEA 1EZOA 3RGYA 2LAOA 5F1QA 5AA1A 3MVZA 4RYAA 3SEUA 4G4PA 4NF4B 4F18A 1UTHA 4OHNA 1OIBA 4IO4A 2Q89A 3TCGA 3CVGA 4JXIA 1MY4A 1YTVA 2UYFA 1PDAA 5LOMA 4DXUA 3OD7A 3TPAA 1USYH 4MFIA 3ILTB 3IK6B 2Y7IA 4IO5A 1D4NA 5H8NA 4HS7A 2YLNA 1DMBA 3BFTA 1QUJA 1MXWA 2CMOA 3KN8A 4X9TA 1B5HA 1H45A 1KWHA 1I69A 3Q25A 4R74A 3IB0A 1NNFA 1SW5A 1TXFA 3IO4A 4YKKA 4ECFA 3H03A 2CZLA 3EF7A 4MLQA 4ESXA 1FQEA 3U72A 3PMWA 3KBRA 3K1NA 5TP9B 4ZEKA 2PX1A 4WKMA 1FQAA 4QF9A 3T22A 4R73A 4LQ2A 4G77A 2HAUA 3S9EA 2IEEA 1IXGA 3T93B 5L9SA 4U2RA 4DDDA 4GVOA 4BDQA 4JWYA 1QUKA 3TUSA 1GGGA 2HZLA 1OLAA 2PT1A 2G29A 1XT8A 1LBBA 1Y4TA 1HSJA 4F19A 3MZBA 3G3FA 2F7AA 1II5A 4RA1A 1LAFE 2XX8A 1DSNA 3TKDA 3TZAA 4QSEA 1SDXA 4HCWA 1ELJA 3MP1A 2P0SA 4BLAA 1XVYA 3KZGA 1MH4A 1EZPA 1BLFA 3KEIA 4PE5B 3BFUA 3DP6A 3IO6A 1SYHA 3VVFA 4OTEA 2KLFA 4H1XA 1SVXB 1NFTA 3RN8A 1JNFA 5H8FA 3HO7A 1H3DA 4YMBA 3PUYE 2V93A 1IXCA 3E3KA 2Z8EA 1SQYA 4Q8RA 5KCJA 4HTGA 1DPEA 2XHDA 1O63A 3A3UA 3PGFA 4Z0IA 1AL3A 4JSDA 2PYYA 3IJOB 3VLUA 2F7BA 1MRPA 3FUZA 3PMXA 5KDTA 3OENA 3PV0E 4KYDA 1LAGE 5B70A 5I59A 3E4RA 3VVEA 4JSOA 4I8CA 1RYXA 1ZKBA 1S50A 3T9HB 1O64A 2QMWA 2AIXA 4GF8A 1LFHA 3RQTA 4KR5A 4R9GA 1B3FA 2OWTA 1S7YA 1TFAA 2QMXA 1QVSA 3FXRA 3HCQA 1B52A 4RK9A 4IGRA 5I2KB 4IO2A 1JQFA 1PB7A 4NE4A 2VD2A 4JWOA 2DE3A 3K4UA 4UACA 1Y3NA 4OEUA 1F9BA 1A7LA 3C35A 1JEVA 4PFWA 4WEPA 3RPWA 3E13X 3LUYA 4U23A 2DE4A 4FECA 1MS7A 4F3GA 3KFMA 3Q27A 4NF6A 3R7XA 1ZJLA 4IY5A 4NF8A 3VVDA 3TQWA 5M2VA 2BJJX 4I9DA 4HCYA 1NL5A 2Y7WA 1A55A 4FJPA 4G8HA 2F36A 4RK2A 5CBRA 1B9JA 3D4CA 3AXFA 3S9NC 2I4CA 4UA8A 4YZZA 4YU0A 2HXWA 4R9FA 5AA4A 4FATA 1NNTA 4HW8A 4H65A 1B5IA 5CM6A 2RCAA 3H3GA 4EF1A 2PMSA 3SKPA 2DWHA 2H99A 1LSTA 3USDA 1ZBMA 2XXTA 3U94A 2PT2A 2O1MA 1I6AA 1POY1 4ZEIA 2H4IA 3CFXA 3OEKA 1LCTA 4F3SA 4R2BA 4H5FA 1NKXA 3CI8A 3BBRA 5AA3A 2DXYA 3UIFA 1OLCA 4OYVA 4G8MA 4U1ZA 1WDNA 2UVJA 3TEPA 2DWAA 5L8DA 4ZEBA 3I3VA 3OOAA 2I49A 2R9JA 3KJTA 1RKMA 1OQGA 4LUBA 1UIUA 2H9BA 1FQCA 1MDQA 3VXCA 4YMAA 4R2FA 4KFQA 1M5DA 4EDPA 1UTBA 4K3FA 3TTMA 4R72A 4OZ9A 4F29A 2ONSA 3VV5A 1LBCA 2XXIA 3PUXE 3IB1A 3MWBA 4C1TA 4OEVA 4F2OA 4QSCA 1ZMGA 3MW0A 1R9LA 5ICTA 4ELOA 1YPNA 3RT6B 4FEBA 3O28A 4OMBA 3K02A 3G3IA 2A5TA 1M5BA 2Q2AA 4NWDA 5CRYA 3SETA 5DVIA 1MXUA 2F5XA 3O6GA 3THIA 2H25A 2DS9A 2ZNSA 1P1QA 1B5JA 2V3QA 1LLSA 2XD3A 4AQ4A 3FVKA 1B2HA 4KHZE 3K6WA 5FHOA 2RINA 1AIVA 1DOTA 3FXQA 1SW4A 2ZYMA 1MG1A 2GHAA 1OVBA 3R6UA 1MXYA 3N26A 1JW1A 1LFIA 1MDP1 3DELB 1ZLQA 3M8UA 4LZ8A 1H76A 1SBPA 1IXHA 3IOVA 5H8FB 2O6AA 1A8EA 5I57B 4IO7A 3MVXA 3B6WA 2YJPA 2F7CA 1POTA 4YKIA 3ZKLA 3OEMA 3JYRA 3QAXA 4ZEFA 3S9MC 2X7PA 5CMKA 2G93A 3M3LA 5I84A 5I56A 3CSGA 3MQ9A 3T9VA 3EQ1A 3RUMA 1DTZA 1EH3A 5KZTA 3IAZA 2NXOA 2W7YA 3FIRA 5CC2A 5I59B 3FJ7A 3C36A 2AL4A 1OQHA 3TDJA 3EHTA 3FATA 3O2AA 1M5CA 1SW1A 1LGBC 1B7HA 5CBSA 5HPQA 3MVWA 3OO9A 4IB2A 3U8QA 3ZKKA 1N3WA 3MP6A 3IOTA 2E1SA 4FE8A 4RY1A 1QJMA 3S9LC 2O51A 1SI1A 3IL1B 2DWJA 1MQDA 4BDOA 4G68A 3P7IA 4G8NA 1MM6A 4QFPA 3K01A 3FJMA 1IITA 2OK2A 3U1OA 3IJXB 3W9WA 4ZZAA 1QUIA 1A54A 2F78A 3MPKA 5DVJA 1CB6A 2I48A 4MH5A 5IKBA 1VSOA 1B0HA 4LONB 3LR1A 1R6ZA 3MBPA 4GWOA 2O84X 4OFLA 1PB9A 5JK4A 3G3KA 3SEWA 1XVXA 4NF6B 1MPCA 4POXA 4LA9A 4M4GA 3SESA 4NF8B 1Q1KA 3EHUA 4QFLA 4GL0A 2YPNA 3N6UA 3O97A 2REGA 3JZJA 2Z8FA 4ZDMA 2XXUA 3HSTA 1NNPA 1LCFA 4NTLA 3IOUA 4LZ5A 1HSLA 3A3CA 2PVUA 3L6HA 1BIYA 2QL3A 3VLVA 2P2AA 3SDFA 4BDMA 1FTLA 2ESNA 3DP4A 1YCJA 4THIA 3RNNA 4POWA 1ANFA 1EZ9A 2ZYKA 2F97A 2FNCA 5AA2D 2DP8A 3G3GA 1Z7ME 3HHFA 1B40A 3LSLA 1FTKA 4EUOA 2Q9TA 1JETA 2X26A 1UQWA 4IY6A 2UVGA 2M8CA 5H8HA 4XKNA 1GV8A 4OFOA 3KJ7A 2RC7A 1URGA 2XXPA 3EHSA 3QK6A 3H6UA 4QSDA 1B1HA 1VE4A 4QRZA 3MVYA 1B3GA 3VE1B 3MZ1A 1MQHA 3O6HA 3Q28A 3ILUB 3B7DA 3TAJA 2GHBA 3KGCA 2OWSA 5TPAA 5AA2B 1AMFA 2DYXA 1JVYA 1US5A 1B7UA 1LAXA 1R1NA 2QRYA 3K6UA 1O7TA 1N76A 1MM7A 1VR5A 3GLBA 3TCHA 3DP8A 4MLVA 2F35A 1GTKA 1XOCA 4FIMA 1I6QA 2XXVA 3HHGA 3RLFE 1FTOA 4NF4A 1OVTA 2V84A 4Q0CA 4RPNA 4ZZEA 1LAHE 3IR1A 2A5TB 4RPOA 1BP5A 3IOWA 1Y9UA 3N94A 1B46A 4GQOA 1LB9A 2FYIA 3TCFA 5DEXB 4H5GA 1ZIUA 2RC8A 1DPPA 5BUUA 3ZSFA 4EQ7A 4F3BA 4N13A 2F8DA 4G2ZA 3KOSA 2XX9A 3F11A 3W9VA 4ONYA 3UGWA 5FHMA 1PEBA 4EQ9A 4DXBA 1MY3A 1IUDA 3N5LA 1N0TA 3CFZA 2RC9A 4X1BA 3TTKA 4DE8A 4BDRA 4H6DA 4IO3A 3PUWE 4F22A 2DVCA 1N7WA 1D3KA 1H43A 2VOZA 4F2QA 2HZKA 4PFUA 1SD3A 2UXAA 1A99A 2ZXTA 5TP9A 3PPRA 2UYEA 4RJZA 5I56B 1UTHB 4JBZA 1N3XA 3MUQA 3C34A 4O3AA 4DCYA 1TT1A 1MPBA 3V8XB 1FTMA 5B7DA 5HM4B 1FTJA 2UVIA 1MH3A 3OO6A 2X7QA 1N7XA 4JB7A 5H8NB 2D5WA 1QW0A 4TLMB 1P1WA 4BDNA 2O7IA 4C1UA 2VGQA 2XXYA 3H6VA 2QS1A 3RT8A 4JDFA 1NNKA 3H4ZA 3TODA 2Z8DA 2VP1A 3QSLA 4ZE8A 1MY1A 4KYEA 4QFNA 2OLBA 1IZ1A 3QIMA 3CG3A 4H8JA 3SERA 3OMBA 2REJA 1NH7A 2V3UA 1LFGA 3VFJA 4GOTA 5L9OA 4ZEDA 5ELVA 4E0WA 1M5EA 2XD2A 4OVJA 4F1UA 3ODBA 4U22A 5ICQA 2I58A 4YB5A 1XS5A 4RXLA 1ATGA 1GR2A 1P1NA 2NWJA 2XX7A 2QSXA 3U92A 1D9VA 5K2YA 1URDA 1QKBA 3W15C 3I6VA 1Y3QA 3TTNA 3IX1A 3PU5A 2QS3A 5FTIA 1IQ7A 3L6GA 5AE4A 4GXAA 1Z7NE 3SEVA 1I6BA 1AOVA 1MY0A 1B4HA 4XXUA 1B1XA 1MXZA 3C33A 3K1MA 3FVOA 2I3WA 4F1VA 1Y1MA 1Y4CA 5J1DA 1US4A 1NMUA 2ZMBA 1B6HA 5H8HB 2O1LA 4KQPA 3QUJA 5H8QA 4EF2A 5I2KA 2Z23A 1USYE 1JW5A 2DE2A 2XXQA 3TQLA 4NMYA 4F1YA 1PBQA 1S9TA 4H0WA 3TTRA 4BDLA 3T9XB 4U4SA 1PB8A 4I1DA 1B3HA 4F31B 5KCJB 1J1NA 5TPAB 4Q5TA 4OERA 1B4ZA 4KCCA 4XKPA 2XXHA 2AL5A 4P11A 2RKMA 4L17A 1B0LA 3EPEA 4RNSA 5KDTB 3B6QA 3H06B 3HV1A 3PD9A 1AH5A 3VDFA 1IXIA 3MZ9A 2AYSA 4R6HA 3FGSA 4ZS9A 3QUFA 3V5AA 3ZS6A 3HPIA 4NF5A 2DWIA 4OESA 5CMMA 2I0BA 2XXXA 3MC2A 3KG2A 2D21A 4XTCQ 3K1PA 1B32A 3ONMA 4EXKA 5JTYA 3ECRA 1N04A 4FAJA 3M3FA 3C31A 4TOZA 3FZVA 5JEIA 5ITOA 1B05A 4ELPA 3KN3A 2DSFA 4MBPA 4DIGA 1MY2A 1Y3PA 5ITPA 1ZTYA 4LVQA 4OXVA 5A5XA 3PPNA 2I6EA 4PFTA 4LZ7A 3D4GA 5I2NA 4ELQA 1CE2A 2R71A 5HBCA 4M1VA 3CR9A 3Q29A 4GFRA 3PUZE 1R9QA 5I58A 2QS4A 2DQVA 2I0CA 1P1UA 2OBGA 3WAFA 4KI0E 4KYSA 4R75A 3G7WA 4DZ1A 5AA4B 2I3VA 5DT6A 2Y7RA 2QPQA 4G68C 2ABHA 3CRBA 3DLNA 2ZNUA 1XHYA 3VLWA 2OCUA 5ISUA 1Y20A 4F3PA 1QULA 3GBBA 3MJNA 1BTJA 2O68A 4LP2B 4LATA 4LQ5A 5EHSA 2Y7PA 4H67A 4QHQA 1URSA 1YAEA 3G3JA 4WEDA 3I5OA 1N84A 3EN3A 3OO8A 4FEDA 5FHNA 3BKIB 2Y7KA 3FD3A 4MF3A 3O6IA 4I62A 3Q26A 1B51A 2E0SA 3H6TA 1P1OA 4U1OA 4AB6A 2O69A 2HCAA 3PMVA 4PQJA 1GVCA 2HFBA 1PBPA 3LSFB 3K2DA 1IEJA 5F7VA 4O3CA 1UTBB 4YKPA 3PUVE 2Y84A 3KOTA 4N07A 5I57A 4GD5A 3PPOA 3S4UA 3E9XA 3N6TA 1LB8A 4TQUQ 4OETA 3KSJA 1JVXA 4U21A 1P99A 3C32A 2F34A 4GLIA 5EYFA 2HAVA 3IORA 4OFJA 4EXLA 3TMGA 3OO7A 4E0XA 1IIWA 4QFOA 2NOOA 4O3BA 3V89B 4ND9A 4OENA 1M5FA 4XKRA 3TTLA 5H8SA 1QKAA 1WODA 3MPLA 3PPPA 2GH9A 5BWJA 2V3TA 2R6GE 2A5SA 3CFLA 1NH8A 3S2VA 3UK4A 3TYHA 3DM0A 4WXJA 3K6VA 1MQGA 1SYIA 4C0RA 2ZNTA 3T9UA 3B6TA 4R6YA 2FA7A 1MXXA 4YKJA 1BKAA 3FASA 4YICA 3RTFB 3LSWA 1JW4A 4KPTA 4YB6A 1Q35A 2OJTA 3TFLA 2B65A 3LSXA 5DVFA 5H8QB 3K00A 3FV1A 1SW2A 4GXSB 2DVZA 1XC1A 3KN7A 3VXBA 3KSXA 4Q30B 2OZZA 1B3EA 4P0IA 1H44A 3MAMA 4GRKA 2VHAA 2NVUB 1L5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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