1MY0A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 nm brw)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A01
4JSOA 4YB7A 3TEPA 4H8IA 3LSFB 1Y3NA 1QVSA 1TT1A 2HXWA 2P1SA 1JETA 4ELRA 4R2FA 4R6YA 3D4CA 4XTCQ 1USYH 4DXCA 1MQJA 5AA2B 4GXSB 1YPNA 3USDA 2Z8EA 2I49A 1BKAA 3JV9A 1LCFA 3EN3A 4ELOA 3KG2A 4RK2A 2X7QA 1XC1A 2E1SA 3ZS6A 2ZYMA 3A3CA 2OCUA 3O6HA 4YZZA 3V89B 2XXQA 3THIA 3VLUA 5FHNA 5I57A 1MPBA 3CVGA 1Y1ZA 3SEVA 1M5BA 4ND9A 4R75A 4ZEDA 2DE3A 2YJPA 2DE2A 3VE1B 3K6XA 3IOVA 1MG1A 4R74A 1ZU0A 4I8CA 4U23A 1MXUA 2AIXA 3FJMA 1IUDA 2F78A 4JBZA 1D9VA 1B52A 2I3WA 1MM6A 4OYVA 1IIWA 1I6QA 3CSGA 1XVYA 4AB5A 5IAIA 2Y84A 2PBWA 1SI1A 3I3VA 1B58A 3TYHA 1EU8A 2Y7PA 1OLCA 2O7IA 1DTZA 4OESA 1B7ZA 5DEXA 1SBPA 4OVJA 3PMVA 4DXUA 2FYIA 3KSXA 3UA8A 3HCQA 4FECA 3L6HA 1NNFA 3K4UA 3SEWA 1M5CA 3TTMA 2H25A 3GXAA 4XKQA 4UACA 1GR2A 3B6WA 1MM7A 3IX1A 2ESNA 3RGYA 3OEMA 4YU0A 1UTBB 2OBGA 1TXFA 4I1DA 4EQ7A 2IEEA 4PFUA 5BWJA 1A55A 4RA1A 2F36A 4QF9A 1Q1KA 4H65A 4BDLA 3FD3A 4LZ5A 5KCJA 2DOJA 3V5AA 4ZECA 2RC7A 4KYSA 2QMXA 5AA4A 1SYIA 2A5TB 5I56A 2G93A 3ZSFA 1MXYA 3PUWE 4F29A 5H8SA 4GLIA 2QS2A 1DPEA 1UTHA 5CC2A 4U21A 2F6GA 2XHDA 3PD8A 4PFTA 2DXYA 3IAZA 4K3FA 3FV1A 4KR5A 5H8NA 1N3WA 1NMUA 4XIGQ 4LONB 1US5A 3OO6A 3CR9A 3E9XA 4MLVA 1OQGA 3PD9A 1ANFA 2NWJA 5AE4A 2HFBA 4X48A 3Q28A 3MP8A 5A5XB 1N3XA 1Z7ME 3W9VA 3RQTA 4X9TA 2ZYNA 1IXCA 4X1DA 5L9OA 5KDTA 1YAEA 3K1PA 3R6UA 4N07A 3F11A 3Q29A 3K1MA 1LB8A 4MBPA 1JVXA 2ANJA 4KPTA 2V84A 1MPDA 3K0VA 2OK2A 4DE8A 2PT2A 3W15C 2XXIA 1PC3A 1RYOA 4NF4A 4H5FA 2I4BA 2VP1A 1FQDA 5H8HB 4DCXA 3IK6B 1DOTA 3QIMA 1BP5A 4NMYA 1UIVA 1N7WA 5CRYA 3KN3A 3VLWA 3N6UA 2H4IA 2UVIA 3QSLA 3O6IA 1D9YA 1FQCA 3N6TA 3CG3A 4YB6A 1LB9A 2QS3A 3S4UA 1Y20A 1MH4A 1MY4A 3U8QA 3QAXA 1SW4A 3PV0E 4DIGA 1H3DA 3MBPA 1PB7A 4NE4A 2V3TA 3KEIA 5TU0A 3EHUA 4I62A 1CB6A 3TMGA 1PBPA 2ZYKA 4Z7EA 1NH7A 4E0WA 3L6GA 4PE5B 2XX9A 2ABHA 3MVZA 1QUIA 4FEDA 4BLAA 3QK6A 4L17A 5HM4B 1HSLA 2F7BA 5ITOA 2REJA 4G2ZA 3QUJA 3KZGA 4F31B 4QFKA 4FEBA 1AMFA 4OTEA 4F39A 4WEDA 4IO6A 1B9JA 4Z0IA 3FASA 1MY0A 3C35A 4NWDA 4R9GA 2F5XA 4H5GA 5I2KB 4HW8A 1Y4CA 3LSXA 4NF5A 1LLSA 4IO4A 4EDPA 2DSFA 3H6UA 4R9FA 2RC9A 5FHOA 2I4CA 3KJTA 4Q0CA 3K01A 5B7DA 3PUVE 4QRZA 3ILUB 4NF8B 4I9DA 2X7PA 1B3HA 2ONKE 3DP4A 3FXUA 2Z8FA 4BDNA 2DWAA 1II5A 3FXRA 2DXRA 4NTLA 3MPLA 1PDAA 4OXVA 3AXFA 4LQ5A 4R2BA 1WODA 1MXXA 3O28A 3MW0A 3CFLA 1PBQA 3B7DA 2HAVA 1ELJA 1N84A 1HSJA 4ESXA 1D4NA 1EH3A 1M5FA 2NOOA 1HSEA 3EHTA 3ODBA 4YKIA 3G3HA 1SW1A 4XXUA 5H8FB 1LAXA 2B65A 3OSQA 1FQAA 5H8QA 2H5YA 4DXBA 2Z8DA 1BTJA 2Q8JA 3FVNA 3M3LA 1OLAA 4RXLA 5EHSA 1SVXB 3UORA 3P7IA 4YMBA 1IZ1A 3IJOB 2ALUA 2F6PA 3T9XB 5AA3A 2I0CA 2HEUA 5IKBA 3QYTA 4NF6B 1URSA 5JTYA 4G68A 4NF4B 5TP9A 1AIVA 1NNPA 1B40A 4EXKA 3FIRA 3E13X 1T0KA 3BBRA 1EZPA 1Z7NE 1QKAA 4ONYA 4QHQA 1SI0A 1FQBA 2UVHA 5ISUA 3K00A 2I0BA 3CG1A 1GVCA 5FTHA 1B3EA 1QJMA 1QULA 4MH5A 4MLQA 4LATA 4IO3A 4KHZE 5EHMA 1MY3A 3K02A 1WVJA 4OETA 2VOZA 1R1NA 5I2NB 2A5SA 4HCWA 3PUYE 3E4RA 1SDXA 1B5IA 2RCAA 1KWHA 4Q30B 3H06B 5I58A 3BKIB 3EF7A 2O69A 1B7HA 1BIYA 1F9BA 1LFGA 1R9QA 1YTVA 3VXCA 2R71A 3UP9A 1LSTA 1PEBA 3Q26A 1POTA 2F7AA 1LCTA 4Q5TA 3C32A 5I59A 1ATGA 4RK9A 3EHSA 5DT6A 2Y7KA 1EZOA 4O3CA 3A3UA 1MY1A 3IOUA 1ZLQA 2ZMBA 5LOMA 2F35A 1OVBA 3OOAA 2DVCA 3GBBA 3U94A 3TAJA 5TPAB 1B05A 4G4PA 3SETA 4GRKA 1MXWA 3N94A 3KSJA 3TPAA 1H43A 2YPNA 1P1NA 3VV5A 2XXRA 2UYFA 4EF2A 5CBRA 2HAUA 4GWOA 3C33A 4EQBA 4KFQA 4MFIA 3K6VA 3TTKA 5HBCA 3UK4A 3H03A 4OFOA 2QS1A 4XKRA 1NH8A 3MZ9A 2VGQA 3T66A 4LZ8A 4O3AA 4TQUQ 2QL3A 3HSTA 4H0WA 2V25A 1JW4A 1MH3A 1M5DA 3TELA 1IXGA 4EXLA 2PVUA 4YKPA 2V3UA 2D21A 3UGWA 1B6HA 1SW5A 2GHAA 1A7LA 1ZIUA 4XKNA 1O7TA 1B0LA 4P0GA 3PUZE 4PFWA 4H8JA 2E0SA 2Q2CA 3ONMA 3MP1A 4FIMA 2RC8A 2ZYOA 3K6WA 5ICTA 3UIFA 3VXBA 4F2OA 4YKKA 5J1DA 4OFLA 1ZMGA 3BFUA 3GZGA 1IXIA 3MPKA 4YAHX 1B3LA 4OEVA 1UIUA 4BDQA 4GF8A 3S9LC 5CMCA 4ESWA 3FZVA 2HZLA 1DTGA 3H4ZA 3KGCA 1NNKA 3TCFA 4QSDA 4LQ2A 3OEKA 3MAMA 1MRPA 4GL0A 4EF1A 4IY6A 5L9MA 2ONRA 2Y7RA 2ZNTA 1B2HA 1B46A 3EPEA 4NWCA 2DE4A 4P0IA 3JZJA 3FVGA 3W9WA 3C4MA 1SYHA 3CIJA 4O3BA 1FTJA 2GH9A 3PMWA 1US4A 4RJZA 5EYFA 4ISUA 1MDP1 2REGA 3HHFA 1B4ZA 2X26A 4R73A 2Q9TA 1N04A 1MQGA 2ONSA 4ZEIA 3SDFA 3DP8A 2F7CA 2Z23A 2QJEA 3TDJA 3RLFE 3KJ7A 5CMKA 4HCYA 4LA9A 5I57B 2DVZA 4QFPA 3LC8A 3PPNA 1VR5A 3TCGA 4JWYA 3I6VA 2IA4A 3MVYA 3K1NA 5AA2A 1OVTA 3C9HA 1A40A 1Q35A 4IGRA 4LZ7A 4FJPA 3C36A 3PPRA 2XXUA 3FATA 2ZNUA 4H6DA 2XXHA 5CBSA 4DCYA 3OMBA 1NFTA 1VSOA 1JVYA 3IB0A 2XXPA 2I6EA 2O7UA 1XT8A 2M8CA 5DVIA 2Q2AA 3B6QA 2V3QA 3LBSA 4N13A 3FV2A 3T9HB 3QXMA 1P99A 4KYDA 3M3KA 1NL5A 4C0RA 3S9MC 2O84X 1JW5A 4EQ9A 3G3IA 3B6TA 5DEXB 3LR1A 3PPOA 1AL3A 2QS4A 1JQFA 3PUXE 3TQWA 4ELQA 2BJJX 4IGTA 1QUJA 1IQ7A 1QW0A 3G3GA 1B1XA 3I5OA 4U22A 1IITA 2G29A 3O2AA 2LAOA 4FE8A 3G3JA 1N0TA 3EQ1A 3VVEA 1B5JA 4M1VA 2THIA 5KCJB 1I69A 1LBBA 4KCDA 1B3GA 4GQOA 3KBRA 4IO5A 2CZLA 1FQEA 5AA4B 5I56B 5AA1A 1YCJA 3MZBA 3HPIA 1MQIA 2V93A 4X1BA 3PPPA 1MDQA 1ZJLA 4GIZA 3MVWA 2XXXA 4JWXA 1UTHB 3MP6A 4RPOA 4NEDA 2I3VA 5H8NB 1LAHE 4ZS9A 2XXTA 2KLFA 3IL1B 3OO7A 4JDFA 2HZKA 1FTOA 3IR1A 4KD5A 4UA8A 5FHMA 3Q25A 1A8EA 1RYXA 1JEUA 2DWHA 3RTFB 1URDA 4JXIA 2AYSA 4LVQA 3CSBA 4ZEKA 2H98A 1POY1 3U1OA 4GXAA 5DVFA 2XD3A 3KN7A 4THIA 3ECRA 2A5TA 2VD3A 4PETA 5KDTB 4U4XA 4OWDA 4F1VA 5JK4A 4F3SA 2NUVA 4RYAA 1IEJA 3CFXA 4GFRA 3WAEA 1B4HA 2WKYA 3DP6A 4DDDA 1Y1MA 4PP0A 1P1WA 4FORA 4DLDA 2RINA 1FQFA 3LUYA 3O9PA 4MF3A 2RCBA 5A5XA 2ZNSA 3T96B 3U93A 4OHNA 2QMWA 4POWA 5HPQA 2O68A 1J1NA 3MQ9A 1B5HA 4WEPA 3TUSA 4XKPA 1FCKA 4KCCA 4HS7A 4FAJA 2D3IA 3FUZA 3TCHA 3JYRA 2QPQA 4QSCA 1R9LA 4ZEBA 2XXWA 3VVFA 3KOSA 1B7UA 4OERA 3TQLA 3KFMA 5DVJA 3SEYA 4WXJA 3RNNA 3ILTB 4HTGA 1VE4A 4RY1A 1ZBMA 1B0HA 3O6GA 1P1QA 5H8HA 3CI8A 3MUQA 3TKDA 3T9UA 2O6AA 3T22A 1MS7A 4KQPA 4U1OA 3IB2A 2UVGA 1LFHA 1WDNA 1XS5A 1B3FA 2O51A 1SW2A 1S7YA 5F1QA 3IORA 4C1UA 3RT6B 5ICQA 1BLFA 4G8MA 3O29A 4ZZEA 4YKJA 4F18A 4NF5B 5AA2D 1GGGA 1AH5A 4GD5A 4M4GA 2P0SA 3IOTA 3FJGA 4PQJA 1B1HA 1URGA 4G68C 5L9SA 3VFJA 2AL4A 4YMAA 2PT1A 2OZZA 2PYYA 1P1OA 2DYXA 1I6AA 3FGSA 3SEXA 1MXZA 4KYEA 1N76A 2GHBA 5B70A 1LFIA 2O1LA 2OWSA 1SD3A 1Y3PA 1DPPA 4TOZA 1ZKBA 4ZE8A 1IXHA 2O1MA 1RKMA 4YICA 3MC2A 1JEVA 3QUFA 2R9JA 5I2KA 3Q27A 1DMBA 3RUMA 2AL5A 5M2VA 4ZE9A 1LGBC 1I6BA 1R6ZA 3SKPA 4LUBA 1O64A 4G8HA 3IOWA 4JB7A 3V8XB 3BFTA 2I48A 1Y3QA 3OENA 4NF8A 4U2RA 1P1UA 1A99A 5CMMA 2VHAA 2VD2A 3PGFA 4OMBA 4GL8A 1S50A 1H45A 1A54A 3MWBA 4YB5A 1S9TA 2ZXTA 1FW0A 4F3PA 3ZKLA 3MVXA 3HHGA 5L8DA 2UXAA 4U4SA 5H8QB 1N7XA 3S2VA 1DSNA 1M5EA 4LP2B 1Y4TA 4F3BA 2I58A 1QKBA 4N6PA 4QFOA 2PX1A 3RPWA 3CFZA 3S9EA 5JTYB 1XOCA 4G68B 2OJTA 5TP9B 1OIBA 1MPCA 4F2QA 3FVOA 1VFEA 3HN0A 2RF1A 4JWOA 3H6VA 4AQ4A 3G3KA 3OXNA 4AB6A 1XHYA 5H8FA 3R26A 2DQVA 3PMXA 1A8FA 4DZ1A 3LSWA 3N5LA 2XX7A 3K6UA 3VVDA 1PB8A 3A09A 4QSEA 1OQHA 2Z22A 4G8NA 2H99A 3LSLA 3H3GA 3DM0A 3OO8A 3OELA 5BUUA 1AOVA 1D3KA 2RKMA 4TLLB 5F7VA 3KN8A 1B51A 2D5WA 2DWIA 3RT8A 5ELVA 2R6GE 4NF6A 3GLBA 3FJ7A 1JW1A 4WKMA 2FA7A 5ITPA 2NVUB 2F97A 2UVJA 4OENA 3C31A 5I58B 3H6WA 2Y7IA 4P11A 3T93B 1OMPA 5FTIA 2DWJA 4ECFA 3O97A 1FTKA 3HV1A 3VLVA 5DTBA 4F19A 4JSDA 1GV8A 5I59B 1JNFA 4IY5A 3SERA 3U92A 4E0XA 4ZEFA 5I2NA 3S9NC 4RNSA 2W7YA 3V83A 4FATA 3RY3A 2OWTA 4F3GA 3IO4A 5DYHA 3T9VA 3PU5A 3DLNA 2OLBA 1LAGE 3IB1A 2QRYA 5K2XA 1FTLA 3OO9A 2F8DA 3TODA 1MQHA 2GFEA 2Y7WA 5CM6A 2QSXA 4EUOA 3CRBA 2XX8A 1TFAA 1PB9A 1MXVA 3M8UA 5I84A 4POXA 4KI0E 2Q88A 2CMOA 4G77A 2B3FA 1L5TA 2B3BA 4TLMB 4RPNA 4Q8RA 1TFDA 1GTKA 3SESA 2DP8A 4GVOA 5TPAA 4U1ZA 3RTWB 3TTLA 3OSRA 1FTMA 5JEIA 1LBCA 1EZ9A 3UN6A 2XXYA 4OFJA 4R6KA 2UYEA 4R72A 3G3FA 1O63A 3N26A 1UQWA 4F22A 3K2DA 4OQOA 3G7WA 3IJXB 4QFLA 3E3KA 1UTBA 3O66A 2HQ0A 4OZ9A 4IO7A 3FVKA 3R7XA 4ELPA 3RN8A 4R6HA 4QFNA 1CE2A 3FXQA 4F1UA 3IO6A 1SQYA 2YLNA 3D4GA 4IO2A 2H9BA 1VFDA 5KZTA 3H7MA 2Q89A 3MZ1A 1QUKA 4BDRA 1H76A 4BDOA 4BDMA 2DS9A 3HO7A 2P2AA 1H44A 3ZKKA 3KOTA 3H6TA 1XVXA 5CI5A 2HCAA 1USYE 1LAFE 2FNCA 4GOTA 4PFYA 1NNTA 3TTRA 1B32A 4F1YA 2NXOA 5CMBA 1TWYA 3DELB 3WAFA 4OEUA 3TZAA 3C34A 3PPQA 1MQDA 3M3FA 3SEUA 2XD2A 3U72A 3TFLA 1Y9UA 2PMSA 4C1TA 1NKXA 4ZZAA 3VDFA 4H1XA 2GRVA 3TTNA 1MY2A 5K2YA 1ZTYA 3OD7A 4H67A 4ZDMA 3GBAA 4IB2A 3MJNA 2XXVA 2F34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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