1N7WA

Crystal structure of human serum transferrin, n-lobe l66w mutant
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGWVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin. A Structural Study
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serotransferrin
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA01
1GGGA 1P1NA 1LBCA 1N3XA 2Z8EA 3O2AA 4F1UA 1MY0A 3T93B 1Y20A 1LAHE 4O3AA 3MC2A 2XXVA 2VD2A 4I1DA 1QVSA 4R9FA 1B58A 3G3HA 3DP4A 3PGFA 3OO7A 2D5WA 1SW5A 5H8QB 1MDP1 2ONRA 1B5IA 3OO9A 1JQFA 2I49A 3PD9A 4FATA 3EF7A 4BDLA 4C0RA 2OWSA 1TT1A 1EZPA 1MXVA 5AA2D 5J1DA 1XT8A 1FQFA 3MJNA 3B7DA 4LZ5A 1AIVA 3K6XA 3S2VA 3F11A 1R9LA 4OWDA 3TKDA 2F7BA 1GVCA 1P1UA 2PT2A 4YICA 4NMYA 1MH3A 2OZZA 2YLNA 4WEDA 3R26A 4U2RA 3HO7A 2HEUA 1B7HA 3RT6B 4XKPA 4KYSA 4FORA 1II5A 1N3WA 1XHYA 1FTLA 3G3FA 5H8NB 2G29A 5TU0A 3E3KA 4IO7A 2V3QA 4R6KA 3GLBA 4JWYA 5B70A 3EQ1A 4ZECA 2XX7A 4NWDA 1NH7A 3MVWA 1JVXA 3PD8A 2HFBA 3GZGA 2X7QA 3O66A 1POY1 4RYAA 4OESA 1WVJA 2F36A 4PE5B 4EUOA 4EF1A 4P0GA 2ALUA 3O29A 1N7WA 2O68A 3VVEA 5TP9A 4MLVA 1USYE 1B1HA 4TQUQ 1MQHA 5A5XA 3AXFA 1H3DA 2FA7A 1Q1KA 2ANJA 3OO8A 2E1SA 3EN3A 4F2OA 3LR1A 4F31B 4DDDA 3Q27A 4AQ4A 2XXYA 3RLFE 2F34A 2VD3A 1H76A 3W9VA 2XXIA 2ZNUA 1P1OA 4BDOA 2DWAA 4GVOA 1UQWA 1XVYA 2R6GE 2FNCA 4GIZA 5IKBA 1LFGA 2X26A 2OCUA 2RINA 5FHNA 4R2BA 3IB0A 1D9VA 2H99A 1Y4CA 5I84A 1IZ1A 5ICQA 1VFDA 2Q2AA 3E9XA 3C9HA 3O28A 1M5BA 2PVUA 4MH5A 4DXBA 2FYIA 3UK4A 5I56A 1MXXA 4RK9A 2CZLA 1VSOA 2UVJA 5TPAA 4GWOA 4KYEA 4Z0IA 2Q2CA 3U94A 5H8SA 1OQGA 3VVFA 1B40A 1N76A 2Q88A 2QS1A 4R9GA 4IO2A 2IA4A 2H4IA 3HHGA 3MW0A 1P1WA 2O6AA 1PB9A 1ZLQA 5I2NB 2QJEA 4QSCA 1JEUA 4O3CA 1IUDA 2I6EA 3CSBA 4I62A 3MZBA 1B7ZA 2I0BA 5H8QA 5DVJA 3L6GA 1LFIA 3VV5A 2QS4A 4OMBA 1I6AA 1I6BA 3DLNA 4U1OA 4X9TA 4ELOA 2R9JA 3FZVA 4F1VA 4EDPA 3CRBA 3RT8A 4POWA 1DMBA 1LGBC 4OFJA 1D9YA 2Y7RA 2V84A 2B3BA 5L8DA 3P7IA 3KJTA 3TPAA 3ILTB 5DVIA 4NF4A 3ZKKA 2AIXA 2V3TA 4DXCA 2OWTA 1B2HA 1S9TA 3H6WA 1ZMGA 1MH4A 2V25A 3QUJA 2I4CA 1IQ7A 4OHNA 1MXUA 1TFDA 3H6UA 4EXLA 2UYEA 1BP5A 4OXVA 2PYYA 1MRPA 1ZU0A 3FJMA 3SEWA 3G3IA 4GOTA 1H44A 3CR9A 4XIGQ 1MS7A 2VOZA 1B3LA 1RYOA 3V83A 4JWXA 2RC9A 4ELRA 3L6HA 4YKKA 1MPCA 3I5OA 1OVTA 1M5CA 1S50A 3PU5A 1IXGA 1JEVA 2P1SA 1USYH 3MP1A 1Y3QA 3R6UA 3C35A 4R73A 1DPEA 3KEIA 3VLWA 3MVZA 4X48A 1BTJA 4PQJA 2LAOA 1SYIA 4U22A 3G3JA 4BDRA 3S9EA 3OO6A 2F35A 1LB9A 1QUKA 4YMBA 5KCJB 4H5FA 2H25A 3DELB 1RKMA 5JK4A 3VFJA 1VE4A 3OENA 1A40A 4C1TA 3FXUA 3VE1B 1I6QA 1AOVA 1SDXA 1DPPA 2UVIA 4GF8A 4LONB 3PPQA 3FV1A 3FVOA 2HXWA 5ELVA 2Q9TA 4G2ZA 4LA9A 5HM4B 3LSWA 4G8HA 5JTYB 3UP9A 1A8EA 4IO4A 1B3GA 4MFIA 4EQ9A 3KN3A 1LLSA 3MVXA 2Q89A 4GLIA 1FTMA 3KBRA 1GTKA 2KLFA 1MQIA 3DP8A 2ZYOA 1NNTA 4NF6B 2UVHA 4GXAA 4FE8A 2THIA 5CBSA 4EXKA 3HV1A 4PP0A 1O7TA 3KSJA 5AE4A 4GL8A 3IB1A 3EHSA 4QRZA 1QULA 1PB8A 2DSFA 1A54A 4ISUA 1B5JA 4OEUA 5H8FB 1B52A 2QS2A 3H6TA 1WDNA 4R6YA 3KJ7A 1HSLA 2HZKA 4Q0CA 1MM7A 4R6HA 2PT1A 3T9XB 4YZZA 4RPOA 3S9NC 4F3GA 4HS7A 4QSDA 2R71A 4IO5A 3CIJA 4ZEBA 3FIRA 4FIMA 2HQ0A 2RCAA 2GHAA 1NNFA 4ZEKA 3PMXA 4JDFA 3T66A 3SDFA 5ICTA 3MZ1A 4JSDA 1MG1A 2XD3A 3KOTA 4P0IA 1Y4TA 2QPQA 2E0SA 1NL5A 3OELA 2GRVA 1LBBA 3Q29A 2A5SA 2QS3A 3JV9A 3SEUA 5CM6A 1US5A 4QHQA 3FD3A 5BUUA 1QUJA 4X1DA 4R75A 1A99A 4F29A 2I48A 4DIGA 4U23A 1FQCA 1UTHA 1L5TA 5I58A 2Y7PA 1MDQA 1B3EA 4HTGA 4G68C 3IX1A 2O69A 1B0HA 1UTBB 1JW5A 1URGA 1Y1ZA 3RQTA 1Q35A 2V93A 4XKRA 3MP8A 3W9WA 2GH9A 2ONKE 1LCTA 3KGCA 3B6QA 3VXBA 5KZTA 5K2XA 5HPQA 2XX8A 4GFRA 1QJMA 2PX1A 3QYTA 2F6GA 4MBPA 2GHBA 3OD7A 4NF5B 1BKAA 1B4ZA 4RJZA 1R9QA 3TUSA 1N7XA 5AA3A 3IO6A 1DOTA 2I3VA 4FEBA 5JTYA 4F22A 2P0SA 1LAXA 4RK2A 4KD5A 3S9MC 1YPNA 2DP8A 1HSJA 1IIWA 1B4HA 3Q28A 4ESXA 1IXHA 4IY6A 1MXWA 2HAVA 3MPLA 1URDA 2F5XA 1T0KA 4KCDA 4YKJA 5AA4A 3C34A 3TFLA 4N07A 3N94A 3O6HA 4FJPA 3RTFB 5H8HB 3RGYA 1AL3A 5I57B 4GD5A 3BKIB 3CG3A 3DP6A 1PBQA 3TCFA 4H5GA 4Q30B 3EHTA 2Q8JA 3UORA 2UVGA 4KCCA 4XKQA 4EQ7A 3M3FA 3O6IA 5I2KA 4OTEA 4ELPA 3V5AA 1UIUA 1VR5A 4RA1A 2QL3A 3ZS6A 2PMSA 3H4ZA 1SYHA 3LSXA 2ZNTA 1B0LA 2DS9A 1N04A 4F39A 1NMUA 1LB8A 1MY3A 3TTRA 1OLCA 3IR1A 3PUWE 4GRKA 3FV2A 4PFYA 3QUFA 1KWHA 4F3BA 5IAIA 5F7VA 3GBAA 3LC8A 4H6DA 3K6WA 5L9SA 4H0WA 3FVGA 3ECRA 1TXFA 2Y84A 1IEJA 1ATGA 2VGQA 4G68B 2DE3A 5EHMA 3W15C 2QMXA 2XXUA 3K4UA 4Z7EA 3H03A 1NH8A 5BWJA 3HPIA 3VVDA 3TELA 3CI8A 2DXYA 1JW4A 4R2FA 3K1NA 2DYXA 3TQLA 1URSA 2Z8DA 1NKXA 4M4GA 3OEKA 1QKAA 3IOTA 3SETA 4OFOA 2AL4A 3T9HB 4ZDMA 4IO6A 2XD2A 5CMCA 4JWOA 1XVXA 5EYFA 4F19A 4EQBA 2AYSA 2HCAA 3U92A 1UTBA 1OIBA 1B1XA 3U8QA 1DSNA 1MQJA 1HSEA 2YJPA 4EF2A 5CBRA 3QSLA 1POTA 4H67A 2XXTA 2A5TB 2CMOA 4Q8RA 3QXMA 5FHOA 4QFOA 1ZKBA 4OFLA 2HZLA 5H8NA 2ZMBA 3JYRA 5CC2A 3KZGA 2O7UA 1NFTA 4HW8A 2F6PA 4KR5A 3K01A 3KN7A 1LFHA 2BJJX 1LSTA 1SD3A 5AA2B 4YKPA 3SERA 1I69A 5ITPA 3V89B 1QUIA 1VFEA 1FTKA 1GV8A 2ZYNA 1H45A 4GL0A 4C1UA 1MY2A 4IB2A 1LCFA 3JZJA 3K2DA 4BLAA 3KFMA 3TODA 1MPDA 2DVCA 2H5YA 3IJOB 3T9UA 3KG2A 2REJA 2WKYA 4ZZAA 3FVNA 2HAUA 3LUYA 3TTMA 3E13X 1IXCA 3QAXA 2Z8FA 3RNNA 2VP1A 4UACA 1MM6A 3FVKA 3FUZA 2DWJA 5K2YA 4I9DA 2NOOA 3PPPA 2XXRA 1ZTYA 3EPEA 3KSXA 4FAJA 1B5HA 1IXIA 2RKMA 3ZSFA 3K0VA 4GQOA 3CG1A 5FHMA 3TYHA 1R1NA 1Z7NE 3QIMA 2I4BA 2D3IA 2Y7KA 4XKNA 1Y9UA 1PC3A 3SESA 1SBPA 1DTGA 3SKPA 1EU8A 4KFQA 1SW4A 2XXWA 1B46A 3A3CA 2QRYA 3MAMA 4G68A 3CVGA 4MLQA 1P1QA 3Q26A 1Y3NA 3USDA 3KOSA 4QFPA 1US4A 2Z22A 3CFZA 5I2NA 3MVYA 2D21A 3Q25A 1M5DA 4MF3A 4IGRA 3HCQA 4KI0E 3HN0A 3E4RA 5CMKA 4RXLA 3TTNA 4QF9A 3UN6A 5A5XB 1B3HA 3PPRA 3K6VA 4NF8B 5LOMA 3FXQA 3R7XA 3TEPA 4UA8A 4OEVA 4I8CA 3IB2A 4TLMB 4NEDA 3WAEA 4ELQA 4KQPA 3H7MA 1RYXA 4F2QA 1FCKA 4OVJA 2OLBA 3IL1B 4L17A 3UIFA 5EHSA 4ZEFA 4DE8A 3PUVE 2F7CA 2I0CA 1CB6A 3MZ9A 2RF1A 3C36A 3K00A 2VHAA 2G93A 3K6UA 2DOJA 2P2AA 1SI0A 4H1XA 3ILUB 5I56B 4JBZA 1SI1A 3TMGA 1LAFE 1N84A 3U72A 1J1NA 1NNKA 1S7YA 1B51A 4GXSB 4AB6A 1ZIUA 2XX9A 1MXYA 3MWBA 4ZEDA 1GR2A 4RNSA 3SEVA 4WKMA 2F7AA 1WODA 2O51A 2ZXTA 2Y7WA 1M5FA 4RPNA 3D4CA 3MPKA 2ABHA 3MBPA 1LAGE 2UYFA 1YCJA 5KCJA 2B3FA 3KN8A 1SVXB 3T9VA 2RCBA 1FQBA 3ZKLA 4POXA 1MY4A 4G4PA 1MQDA 4BDQA 2ONSA 3C31A 1M5EA 3QK6A 1SW2A 4NF4B 1A7LA 2PBWA 3TTKA 4YKIA 3H6VA 3K02A 3K1MA 4TOZA 4TLLB 1B6HA 1BLFA 1UIVA 2XHDA 3PUZE 5DYHA 4YMAA 5HBCA 5L9MA 1FTOA 5FTIA 3IORA 1FQAA 3ODBA 4LATA 4NF6A 4PETA 4U1ZA 3IAZA 5M2VA 4YB7A 5FTHA 3MP6A 4PFTA 4BDNA 4QFLA 4YU0A 1TFAA 3C4MA 4U4SA 4H65A 3MQ9A 5DEXB 2REGA 3PPNA 4NF8A 4FECA 5ISUA 4O3BA 1OLAA 5H8FA 1A55A 2NWJA 3EHUA 1EZOA 4XTCQ 1QKBA 3PMWA 1TWYA 3FJ7A 2W7YA 1F9BA 3OSQA 2XXXA 3H3GA 2ZYKA 2DWHA 2M8CA 4LZ8A 3LBSA 4LQ5A 3K1PA 3IJXB 5CMMA 2QMWA 2RC8A 3C32A 4ONYA 5I59B 4ZEIA 4DXUA 2XXQA 2ZYMA 1FQDA 3VXCA 1OQHA 5F1QA 4AB5A 5KDTB 3S4UA 1AMFA 2O84X 4ZE9A 1JNFA 3BBRA 4NE4A 4PFWA 1EH3A 3FJGA 1MPBA 4H8IA 3TAJA 3A3UA 5ITOA 3UA8A 1JETA 2F97A 5JEIA 4DCYA 1QW0A 1XC1A 4K3FA 1NNPA 1JVYA 3D4GA 3N26A 1FW0A 1FTJA 3H06B 3M8UA 3IO4A 3MUQA 3U1OA 4G8NA 3PV0E 4LQ2A 2OJTA 4M1VA 2DE2A 3HHFA 2X7PA 4YAHX 5DTBA 4OZ9A 1MXZA 2F78A 2ZNSA 5B7DA 1A8FA 3THIA 2B65A 1P99A 3I6VA 4QSEA 3VLVA 2DQVA 4R72A 4R74A 4FEDA 2YPNA 3N6UA 1XS5A 4LZ7A 1D4NA 4NWCA 1B3FA 2F8DA 3IOWA 5AA1A 2Z23A 4G77A 3N6TA 3WAFA 3M3KA 1AH5A 4NF5A 3IOVA 1YAEA 4PFUA 3N5LA 3PUXE 2OK2A 4E0WA 2ESNA 3I3VA 1SQYA 4LVQA 4JB7A 1DTZA 1OVBA 4LP2B 5CRYA 4OETA 4KPTA 1Y3PA 3U93A 4IO3A 4KHZE 4WEPA 4XXUA 3ONMA 3T96B 4OYVA 3A09A 3GXAA 4N6PA 4F18A 3C33A 3SEYA 1B05A 4F3PA 3CFXA 3S9LC 4F3SA 3M3LA 2O1LA 2V3UA 2I3WA 3LSFB 3TCHA 3CFLA 3RY3A 5H8HA 3TQWA 5I57A 2AL5A 2OBGA 3B6TA 5DEXA 3OXNA 4JXIA 4H8JA 4OQOA 1ANFA 1UTHB 2H98A 3TZAA 4ND9A 2DE4A 5I58B 5CI5A 3HSTA 4U21A 1MY1A 4ECFA 3FASA 4E0XA 4DCXA 1ZJLA 1D3KA 4DZ1A 3OSRA 4KYDA 4OENA 3RTWB 1PEBA 3VDFA 1FQEA 1IITA 4RY1A 2NUVA 1O64A 3V8XB 2XXPA 3CSGA 3DM0A 1ELJA 2Y7IA 3OEMA 4ZS9A 1R6ZA 3PUYE 3TDJA 2NXOA 3OOAA 2RC7A 1N0TA 3UGWA 1Z7ME 5I59A 2GFEA 3G3KA 4U4XA 2H9BA 2O7IA 5KDTA 4ZZEA 1PB7A 4IGTA 1ZBMA 2DVZA 4QFNA 1Y1MA 3O9PA 4X1BA 3G7WA 5DT6A 4F1YA 1B9JA 1BIYA 4WXJA 3LSLA 4HCYA 1JW1A 5TP9B 4BDMA 4YB5A 3FXRA 4HCWA 3PMVA 1B7UA 4THIA 3TCGA 3T22A 5AA4B 2IEEA 1OMPA 3BFTA 3BFUA 1PDAA 1B32A 3FGSA 2UXAA 3PPOA 1PBPA 3O6GA 2QSXA 1EZ9A 3SEXA 3GBBA 3RUMA 5CMBA 3G3GA 3OMBA 2DWIA 4P11A 1XOCA 2O1MA 4Q5TA 5I2KB 1YTVA 3IK6B 2A5TA 3RPWA 3IOUA 4DLDA 2DXRA 4N13A 4LUBA 3VLUA 1H43A 1O63A 4IY5A 1CE2A 4OERA 2NVUB 2I58A 4QFKA 3TTLA 2XXHA 3B6WA 1MQGA 3RN8A 4NTLA 5DVFA 1SW1A 5L9OA 4JSOA 5TPAB 4YB6A 4ESWA 5AA2A 3O97A 4G8MA 3FATA 4ZE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GGGA 2GQ1A 1P1NA 2XWOA 1G0HA 1NV4A 1LBCA 1N3XA 1NUYA 2Z8EA 3RYDA 3O2AA 4F1UA 4O94A 1MY0A 3T93B 1Y20A 1LAHE 4O3AA 5IZ3A 3MC2A 2XXVA 2VD2A 4I1DA 1QVSA 4R9FA 1B58A 3G3HA 3DP4A 3PGFA 3OO7A 4PFIA 4LN5A 2D5WA 5I3SA 5IM2A 1SW5A 5H8QB 1MDP1 2ONRA 1B5IA 3OO9A 1JQFA 2I49A 3PD9A 3A29A 1IMAA 5ET6A 1AWBA 4FATA 4GBWA 2OX3A 3EF7A 4BDLA 4C0RA 2OWSA 1TT1A 1EZPA 1MXVA 5AA2D 5J1DA 1XT8A 1FQFA 3MJNA 3B7DA 1IMEA 4LZ5A 1AIVA 3K6XA 3S2VA 3F11A 1R9LA 4MCOA 4OWDA 3TKDA 2F7BA 1GVCA 1K9YA 1P1UA 2PT2A 4YICA 4NMYA 1MH3A 2OZZA 2YLNA 4WEDA 3R26A 4U2RA 3HO7A 2HEUA 1B7HA 3RT6B 4N8GA 4XKPA 4KYSA 4FORA 1FTAA 1II5A 2B4MA 1N3WA 1XHYA 1FTLA 3G3FA 5H8NB 2G29A 5TU0A 3E3KA 1FBFA 4IO7A 2V3QA 4R6KA 3GLBA 4JWYA 5B70A 3EQ1A 4ZECA 2XX7A 4NWDA 1NUZA 1NH7A 3MVWA 1JVXA 3PD8A 2HFBA 3GZGA 2X7QA 3O66A 1POY1 4RYAA 4OESA 1WVJA 2F36A 4PE5B 4EUOA 4EF1A 4P0GA 2ALUA 3O29A 5DW8A 1N7WA 2O68A 3VVEA 2VT5A 5TP9A 4MIJA 4XF5A 4MLVA 4PGPA 1USYE 1B1HA 4TQUQ 1MQHA 2FVZA 5A5XA 3AXFA 1H3DA 1FSAA 2ZZVA 1IMCA 2FA7A 1Q1KA 2ANJA 3OO8A 4NHBA 2E1SA 3EN3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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