1N7WA

Crystal structure of human serum transferrin, n-lobe l66w mutant
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGWVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin. A Structural Study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA01
2F6GA 4F22A 3E4RA 2O6AA 1UIUA 3T9UA 1XHYA 4E0XA 4EQ7A 2F35A 4BDMA 1SW4A 3IOVA 4EF1A 5I58A 1N7WA 4WXJA 4OXVA 5KZTA 4BLAA 3VE1B 5KCJB 4OHNA 1S9TA 3ZKKA 1Y1MA 3HCQA 2GH9A 1AIVA 4HCWA 1FTMA 3MC2A 1D9VA 2OWTA 3IB1A 1IQ7A 2DSFA 1S50A 5I2KB 1GV8A 1B1HA 1PB9A 3OENA 3BFUA 2Y7PA 3TFLA 3K1NA 1JEUA 2E0SA 3IJOB 2G29A 4EDPA 5AA2D 2R9JA 3OELA 2OWSA 5H8HA 2UVIA 2Z8FA 2QPQA 4ZZEA 3H06B 1B05A 3FJGA 1Z7ME 2M8CA 3O29A 4LZ5A 1SDXA 1US5A 3MWBA 4MFIA 3K6UA 1S7YA 1P1WA 1B32A 3H4ZA 2RCBA 5L9SA 3HHGA 4H0WA 3MVYA 4NF8B 2XHDA 3O97A 4F18A 4WEPA 3K4UA 2ZNSA 3PV0E 2V3QA 5EHMA 1B40A 2NWJA 4O3CA 2UVHA 3R26A 2ZMBA 2GHAA 4YICA 3A09A 3VVDA 2PMSA 4GIZA 3FXRA 5A5XB 1P1UA 2XX9A 4HS7A 4C1UA 1PBPA 3UK4A 4H8IA 3QUFA 2AL5A 2B3BA 3PU5A 4IO3A 4TQUQ 3KJ7A 4ESWA 2AYSA 3FV1A 3N26A 5H8SA 1NH8A 3C36A 3SEWA 1P1QA 3MW0A 3R6UA 5I57B 4JB7A 2I0CA 2BJJX 1JQFA 2Z8DA 3OMBA 1BKAA 5CC2A 3T96B 3UIFA 4NWDA 1MQJA 2QMXA 3RTFB 2O1LA 3A3UA 4U21A 3MZ1A 3IO6A 4KPTA 4RK2A 4OVJA 1MXZA 3K02A 3KSJA 2HAUA 1IITA 4OEUA 2Y84A 5I56A 1R6ZA 1OMPA 1YPNA 4H1XA 4IY5A 2P2AA 1NL5A 1QUKA 4O3AA 4IB2A 3MP1A 4QFOA 1B7HA 4ELQA 5H8NA 2H98A 2QRYA 2RKMA 4X9TA 4XKRA 1SYHA 4BDLA 4GXSB 3MVZA 3PPOA 3TCGA 1BTJA 4F3BA 2DVCA 3VFJA 1QUJA 1A40A 4ISUA 4MBPA 5CMMA 1P1NA 1MY3A 5AA4A 2RC7A 4FEBA 2VP1A 3K2DA 3VLUA 1N0TA 1NNFA 1JEVA 2X7PA 5AA2B 4IO5A 1FQEA 1OLAA 3M8UA 3EQ1A 2VD3A 2D3IA 1Q35A 3CFZA 5EYFA 3C9HA 3KEIA 5DVFA 2DXYA 1DPEA 2V3UA 4ELPA 3DLNA 3TTLA 3ZKLA 5FTHA 1PDAA 4AQ4A 2CZLA 4ZE9A 1M5DA 4NWCA 1N76A 3M3KA 5J1DA 3G3GA 1B1XA 2XXQA 4NF4A 4YKIA 4NF5B 3PGFA 3CI8A 2XX7A 3HPIA 3C31A 3PD9A 2UYEA 2V84A 1USYE 3SERA 4BDNA 4ECFA 5K2YA 1AL3A 1AH5A 1H43A 4FIMA 3G7WA 4XXUA 4I62A 2ONKE 3PD8A 1USYH 4LONB 1VSOA 4QRZA 1XS5A 1MY4A 2HZKA 5TPAA 1LCTA 4IGRA 3FXQA 4KFQA 3RPWA 3N6UA 3G3FA 1Y4TA 4FE8A 3TODA 4EUOA 3HHFA 5HM4B 2I0BA 3ECRA 1LAGE 1P1OA 2VGQA 4G8HA 5CBSA 3FIRA 2HXWA 1OVBA 1MQIA 4NEDA 2ZYKA 3S9MC 2E1SA 3E13X 3OSRA 3DP4A 3LSLA 5IAIA 5I84A 3S4UA 1B5JA 3EN3A 4G68A 4DCYA 4YZZA 2XX8A 3TEPA 3Q29A 3L6GA 3KJTA 2ZYOA 4TLLB 2F7BA 1B3GA 4DXBA 1B52A 2O84X 2F5XA 5I56B 3PPQA 2XXIA 1MDP1 1MDQA 4JSDA 1P99A 2UVJA 1EU8A 1A8FA 4TLMB 4R6KA 1N84A 1B9JA 1DMBA 3G3IA 3TCFA 5H8NB 1OQHA 2A5TA 2DS9A 4OENA 1DSNA 1MXVA 2VD2A 4DE8A 3T93B 3CSGA 2XXUA 1B0HA 1ZU0A 5ELVA 1FW0A 4M1VA 1UTBA 3U94A 4BDOA 3FUZA 4R9FA 3I6VA 3MPKA 3OOAA 4R74A 4NTLA 3PUXE 3U93A 1FCKA 3RLFE 3TAJA 1I69A 1SVXB 3OO7A 3OO6A 1NNTA 5H8QA 2O69A 1DTGA 1ZIUA 4JWXA 3Q25A 1ZLQA 3FVOA 2B65A 3KN3A 3VDFA 4GL0A 3MBPA 4THIA 3OO8A 1SW5A 4OESA 4YB5A 2F36A 4DIGA 1MG1A 1NNKA 4ZEKA 1OIBA 2Z22A 1II5A 3H6TA 4NF4B 1B2HA 4N6PA 4GXAA 4OTEA 3HSTA 3CFLA 4QSDA 3FZVA 4FATA 2AIXA 3ZSFA 2ESNA 2FA7A 2V3TA 3PPPA 4OFOA 5IKBA 3S9LC 3O6GA 2ONRA 2IA4A 5TU0A 3GLBA 3CG1A 3JZJA 2DOJA 5CBRA 1FTJA 2ZNTA 1TFDA 1UIVA 4JDFA 2PT2A 3KN8A 1MQGA 2PT1A 2Y7RA 2HFBA 1YTVA 1A54A 5TP9B 1HSEA 4ZEBA 4JXIA 3BKIB 3ONMA 4NE4A 4PFWA 4F19A 1FQCA 2X7QA 2I58A 4RYAA 2Q2CA 3MZ9A 1SI0A 1EZOA 3IOWA 1PB8A 1IEJA 5LOMA 3DM0A 4R6HA 5L9MA 3PMVA 1LLSA 5JTYA 3TDJA 4DXUA 1N04A 1FTLA 2V93A 4U4SA 3OD7A 3VLVA 4NF6A 1MH3A 1URDA 2OK2A 3CRBA 3UA8A 3O28A 4WEDA 1DTZA 4IO7A 2UVGA 2YLNA 1LCFA 4MH5A 2ONSA 3IAZA 4DDDA 1JW1A 1I6QA 4LA9A 4C0RA 4Q8RA 4RPOA 1MXYA 4PFYA 1LFHA 2P0SA 2DE3A 1FQDA 1I6BA 2ZNUA 4OEVA 2G93A 3D4GA 5I59A 3KBRA 2HEUA 4IY6A 4LQ2A 4MLVA 2Q88A 4QF9A 1HSJA 4IGTA 4P11A 3JV9A 1UTBB 2HZLA 1R1NA 4YKJA 1D4NA 3DELB 2H5YA 4DLDA 4I9DA 4JBZA 4RNSA 3TTNA 4N07A 5ICQA 2FNCA 1AOVA 2I4BA 1QVSA 1TT1A 3IJXB 3LR1A 3LSWA 4FECA 3F11A 1IXGA 1B5IA 2VOZA 2F7AA 2OZZA 4PE5B 3IX1A 3B7DA 1MY2A 3K6XA 1H44A 2RCAA 1BLFA 4ZEFA 3Q28A 5H8FA 1PEBA 4GFRA 2P1SA 1TXFA 3O6HA 4QHQA 3RT6B 3S2VA 2RINA 3V89B 4I1DA 1SW1A 4KCDA 5DTBA 3IOUA 3RT8A 3PMWA 4ONYA 3C4MA 2IEEA 2QJEA 2OJTA 2QS2A 1QW0A 4YAHX 4U1ZA 4QFNA 4KYEA 3R7XA 1QJMA 2O7IA 4U23A 3JYRA 2Q9TA 3ODBA 1L5TA 4ZDMA 2W7YA 1AMFA 5DYHA 2QS4A 5I58B 1LAFE 1MQDA 3LSXA 1POTA 1YAEA 1WVJA 3VXBA 3THIA 2REGA 4ELRA 2XD2A 3HN0A 5JTYB 1NNPA 1SD3A 4F1UA 1MPDA 4JSOA 5L8DA 2Q2AA 3SEXA 1H76A 3C34A 4R73A 1B7ZA 3TZAA 3LUYA 2GHBA 4GOTA 4X1DA 4OYVA 4LUBA 3FD3A 5H8HB 1B4ZA 2PVUA 1XC1A 2Y7IA 3LSFB 3SKPA 4H6DA 1SYIA 2NVUB 1FQBA 1NMUA 3VV5A 4ZECA 3H6UA 4QSEA 2O7UA 2DQVA 4XKQA 1LB9A 1MM6A 1PC3A 4G4PA 3IOTA 5I59B 1SI1A 4XIGQ 1GVCA 1Q1KA 2I3WA 4AB5A 1XVXA 3PPNA 3O66A 4YB6A 4RA1A 2ALUA 2XXXA 1OQGA 3MJNA 2O1MA 4GLIA 1MPCA 5M2VA 4IO2A 3PUWE 4G2ZA 1POY1 2UYFA 1A7LA 4UA8A 4LATA 4QSCA 1LB8A 2DWHA 4F29A 4MF3A 5CI5A 4YU0A 1LFIA 3LC8A 1MH4A 4ZS9A 3SEUA 2A5SA 1O63A 4IO6A 1MS7A 3TTMA 3UGWA 1OVTA 4L17A 4DXCA 3IB2A 5DVIA 4FORA 3CFXA 1B3EA 3TPAA 1JVYA 5I2KA 4F2QA 2YJPA 3IORA 4ND9A 4LQ5A 3O6IA 1B3HA 4OFJA 4RK9A 3CG3A 2XXYA 2Z8EA 2QSXA 4ZE8A 1LGBC 1SW2A 4XKPA 2ANJA 2I4CA 2B3FA 1VR5A 4YB7A 1LAXA 3GXAA 3C32A 3VXCA 3HO7A 4PFTA 4EQ9A 4K3FA 1R9QA 2DXRA 4G77A 3KFMA 1ELJA 5ITPA 5CMBA 5AA4B 1F9BA 3EHSA 2QS3A 4EXKA 1QUIA 4NMYA 4OWDA 1B7UA 2DE2A 1M5FA 5A5XA 2F7CA 1ZMGA 3OXNA 4YMBA 1ANFA 4AB6A 1LFGA 2NOOA 1H3DA 2X26A 5AA3A 1MQHA 1O64A 2XXHA 3KG2A 1VFDA 1RYOA 1QKAA 4RXLA 3FJ7A 2YPNA 1URGA 1B3LA 3MPLA 5I57A 2UXAA 1A55A 3H7MA 4C1TA 3QXMA 1BP5A 2RC8A 4E0WA 4JWYA 2NXOA 3RNNA 3N6TA 1Y4CA 4LZ8A 1B3FA 2DWAA 5AA1A 5F7VA 2Y7WA 1M5CA 1N3WA 1DOTA 5F1QA 3H03A 5FHNA 3OEMA 2RF1A 2Z23A 2I48A 1Y3NA 4F2OA 3RGYA 2I6EA 5CRYA 5JEIA 3W15C 3ILUB 4OQOA 2F97A 3TKDA 4POWA 3OO9A 2O51A 4OERA 2Q8JA 2WKYA 3K6VA 5TPAB 1JW5A 5JK4A 3TTKA 4GL8A 3ZS6A 4OFLA 2KLFA 3O9PA 3N5LA 3FVKA 3QIMA 4F3SA 3UN6A 3TMGA 1MM7A 1GR2A 3OSQA 3W9WA 3K00A 4FAJA 3K1PA 3T9VA 2HCAA 1ZTYA 1PBQA 1DPPA 1VFEA 5AA2A 3C33A 2H9BA 2Y7KA 4GF8A 3H6WA 4G68B 1XVYA 3FASA 2LAOA 3G3KA 3GZGA 4ESXA 4FJPA 4I8CA 4HTGA 2H4IA 3PUVE 3TYHA 4GVOA 4X48A 3SDFA 1MXXA 3S9EA 1A99A 3ILTB 3AXFA 1H45A 3FGSA 3EPEA 4OETA 1J1NA 3I3VA 3QYTA 1N7XA 1B5HA 3RY3A 3U92A 1HSLA 3GBAA 3G3HA 4H65A 1JETA 4KCCA 3EHUA 5K2XA 4NF5A 3QK6A 4H5FA 2HQ0A 3EHTA 4TOZA 3K01A 3L6HA 3B6QA 4R6YA 2ZXTA 3USDA 4ELOA 1YCJA 3B6TA 3MP6A 2A5TB 3K1MA 3TCHA 4G8NA 1NH7A 1BIYA 5CMCA 2OCUA 4X1BA 1TWYA 3IL1B 3IB0A 1Y3QA 3FVGA 4ZZAA 3E3KA 1IIWA 2PX1A 4EXLA 2XXTA 5DVJA 1FQAA 2XXWA 4XKNA 3RQTA 5ITOA 2DVZA 3S9NC 3KSXA 1M5BA 3V8XB 3PUYE 4F39A 1N3XA 1O7TA 4OMBA 3K0VA 4R2FA 5H8QB 1CB6A 2R6GE 2DE4A 2XXRA 3RUMA 4WKMA 1IXCA 2D21A 3A3CA 4G68C 1R9LA 4QFPA 4JWOA 2QS1A 4GWOA 5EHSA 1Y20A 3KZGA 4YKPA 4M4GA 3SETA 1I6AA 3PPRA 3MZBA 3V5AA 4YKKA 1MY0A 3LBSA 1GTKA 4GRKA 4R72A 1ZKBA 3QAXA 3IO4A 2PYYA 5CMKA 1B4HA 3G3JA 5FTIA 1UTHA 3V83A 3FVNA 4RPNA 4F31B 1M5EA 1QKBA 3TQWA 1B0LA 3T9XB 4Q30B 1ATGA 3KOSA 1KWHA 3RTWB 4UACA 4RY1A 5B7DA 3MVWA 4KI0E 3W9VA 1WODA 5BWJA 1Y3PA 2FYIA 2F78A 1Y9UA 2RC9A 1B58A 1JNFA 1LBCA 4R9GA 1ZBMA 1FTOA 2V25A 2VHAA 1IXHA 4OZ9A 3SEYA 3CIJA 4G8MA 2R71A 2HAVA 2DWJA 4NF6B 3FV2A 1EH3A 1IZ1A 2OLBA 2DYXA 4HW8A 5FHMA 1MXWA 1SBPA 1IUDA 3VVEA 5KDTA 1T0KA 3TUSA 1EZPA 1QULA 2XXPA 3D4CA 1D9YA 2D5WA 5I2NA 3MP8A 4PFUA 1GGGA 2H25A 4KYSA 4U4XA 2DP8A 4R2BA 1US4A 3FXUA 4H8JA 1TFAA 3WAFA 3I5OA 5CM6A 2PBWA 2THIA 4POXA 1A8EA 3FJMA 3Q26A 1FQFA 1UQWA 3U72A 2REJA 3TTRA 1NKXA 4EQBA 3MAMA 1LAHE 5DEXA 3C35A 3MUQA 4H5GA 3U1OA 3SESA 1XT8A 4P0GA 1RYXA 5DT6A 4P0IA 5TP9A 1Z7NE 4BDRA 1B51A 1IXIA 3CSBA 1D3KA 4Q0CA 3HV1A 3QUJA 2AL4A 4PQJA 5BUUA 4GD5A 5KCJA 4KR5A 4PETA 3VVFA 5L9OA 3IR1A 3O2AA 4ZEDA 1LBBA 3BBRA 1URSA 4KHZE 2I49A 5H8FB 1B6HA 3Q27A 2GFEA 4PP0A 3M3LA 1FTKA 3TELA 5ICTA 5ISUA 3SEVA 3MQ9A 2NUVA 2XD3A 3DP8A 4EF2A 1MXUA 2QMWA 4FEDA 5FHOA 4Q5TA 3T66A 4YMAA 1JW4A 1UTHB 4O3BA 4U2RA 4KQPA 2O68A 4F1VA 3P7IA 1MRPA 5HBCA 1VE4A 2F6PA 4NF8A 3DP6A 3T22A 2Q89A 3UORA 3MVXA 1Y1ZA 5HPQA 3WAEA 2XXVA 3VLWA 4MLQA 4U22A 4Z7EA 4QFLA 2I3VA 3KN7A 2F8DA 3EF7A 4DCXA 3FATA 3GBBA 2ZYNA 1NFTA 3KGCA 4HCYA 2DWIA 3M3FA 1MY1A 4XTCQ 5AE4A 2OBGA 3CVGA 3OEKA 4F3GA 1CE2A 4GQOA 4LVQA 4QFKA 1PB7A 4DZ1A 1JVXA 3E9XA 4LZ7A 3H6VA 4RJZA 1SQYA 2H99A 3PMXA 3BFTA 3K6WA 2ABHA 3TQLA 5KDTB 3N94A 3RN8A 4F1YA 4U1OA 1MPBA 3H3GA 4F3PA 2ZYMA 1LSTA 5I2NB 4KD5A 4R75A 3U8QA 3IK6B 5B70A 3CR9A 3T9HB 3UP9A 1XOCA 2QL3A 4N13A 4Z0IA 1OLCA 4ZEIA 4KYDA 3B6WA 3PUZE 1RKMA 4IO4A 1WDNA 2GRVA 4LP2B 3KOTA 4H67A 1EZ9A 1ZJLA 5DEXB 4BDQA 2CMOA 1B46A 2F34A 3QSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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