1N7XA

Human serum transferrin, n-lobe y45e mutant
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASELDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Serotransferrin
publication title THE POSITION OF ARGININE 124 CONTROLS THE RATE OF IRON RELEASE FROM THE N-LOBE OF HUMAN SERUM TRANSFERRIN. A STRUCTURAL STUDY
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7xA01
3LSWA 4M1VA 3OXNA 3Q26A 5I57B 1S7YA 2I3WA 4WXJA 4EDPA 4F1UA 4GXSB 4GVOA 4F1VA 1B7HA 5L9MA 3SEWA 2H98A 1S50A 4KFQA 1B3EA 5CI5A 1D4NA 3LSXA 3KG2A 4IY6A 2GHBA 3TPAA 3ECRA 3R7XA 2DVZA 4U22A 5H8QB 1ZBMA 3G3GA 3IB2A 4NF6B 4JWOA 4KD5A 2RC9A 3PMXA 3CI8A 3PPRA 2ONSA 3CR9A 3K1NA 2Q8JA 1PDAA 2VD2A 4ZZAA 1ELJA 3CSBA 4G77A 1ZJLA 4YICA 4N6PA 3GLBA 4EF1A 3KZGA 2DQVA 1B9JA 4C1UA 4H65A 3C4MA 3G3KA 4YKJA 4LA9A 1FTOA 4OESA 1JETA 5HM4B 1UQWA 2Y7PA 4FATA 1GV8A 4DXBA 1QULA 5I56A 4FJPA 4IY5A 3U1OA 1P99A 4HS7A 4JWXA 3BFTA 5DT6A 2D21A 3K00A 2RF1A 2ANJA 4G68A 1PC3A 1B6HA 3F11A 3AXFA 1IITA 3VVFA 3RUMA 2VHAA 4L17A 1Y3QA 2H9BA 3EHSA 3E9XA 1IXCA 3PV0E 5CBRA 1I6BA 3MP1A 4BDNA 4ESXA 4MFIA 3K4UA 4ZDMA 4ELQA 1NFTA 5DEXB 2RINA 1SD3A 2XXXA 3L6GA 1XT8A 5AE4A 1DMBA 2ZXTA 2Q88A 3QUFA 4YB6A 2ZMBA 2XX8A 3G3FA 1B2HA 5I56B 3R26A 2Y7KA 3LC8A 1UIUA 4YMAA 2V93A 2XXQA 3LUYA 2Z22A 3HCQA 3VFJA 3LSFB 1YCJA 4G2ZA 4HCWA 3U72A 1BLFA 5FHOA 3H06B 1H44A 4G68B 4PE5B 4MH5A 3W9VA 1Z7ME 3R6UA 4OQOA 3V83A 4DIGA 2OLBA 5I84A 2IA4A 2PT1A 4H6DA 1IUDA 4IO2A 3MVYA 1POY1 3UN6A 1YAEA 1NKXA 2Y7WA 3Q25A 4FEBA 1JQFA 1FQDA 4ZEFA 1GGGA 4IGTA 1MPCA 2I49A 3KSXA 2V3TA 3U94A 4HCYA 1B3FA 5FTHA 5JK4A 1MQDA 1MM6A 1USYH 4TQUQ 2REJA 3QUJA 4R9FA 2F35A 2UVGA 1P1QA 5KCJA 4YB5A 4N13A 1MS7A 4GWOA 3QIMA 4X9TA 1F9BA 1EZOA 1D3KA 3ODBA 3O6HA 3BBRA 4RPOA 5ISUA 3OENA 1JW4A 1SYIA 1LAHE 4GF8A 1MXWA 1PB9A 5LOMA 3B7DA 4QFPA 1NNPA 4RYAA 3KJTA 4OERA 3C35A 2GRVA 5BWJA 1AMFA 2REGA 4RA1A 4IO6A 3EF7A 3KN8A 1LAGE 3S4UA 1B52A 2CMOA 3T9HB 4XIGQ 4EXKA 1EZPA 2QS4A 3TCFA 5HBCA 2DXYA 1MQJA 3WAEA 3IO6A 3M3LA 1MQHA 4OWDA 3TTLA 2H4IA 5KCJB 4P0GA 3KN3A 1SW5A 1SDXA 2RCBA 1B58A 3GBAA 4FECA 2XXUA 4GL0A 1B1XA 3FVGA 3IK6B 3CVGA 3PPPA 2H25A 3RPWA 1POTA 1SW4A 1H76A 5TP9A 4R6KA 3UK4A 1Y9UA 3O6IA 3O2AA 3IO4A 2XXRA 1N84A 2UYEA 2YJPA 3OSRA 1GTKA 2QSXA 5HPQA 3TDJA 1B0HA 4KYDA 3D4GA 4KPTA 3KJ7A 5I58A 4JXIA 5FTIA 1MXXA 3A3CA 4YB7A 4MF3A 1Y1ZA 2LAOA 5CMCA 1LFHA 1IXGA 1L5TA 3CFXA 2Q2CA 1O63A 3PUYE 1PB8A 1EZ9A 5CM6A 2O6AA 1BTJA 4DDDA 2Z23A 4ZZEA 2HCAA 2ZYOA 4F3BA 3OEKA 3V8XB 3FZVA 3K2DA 1II5A 4ZE8A 3HSTA 5EHSA 4EQ7A 4C1TA 5I2KA 4BLAA 2F6PA 2WKYA 4AB6A 1Y1MA 4F19A 5TP9B 4LZ7A 4FEDA 4PQJA 1URSA 1B5JA 5EHMA 5AA3A 1SW1A 1M5DA 2B3FA 4KYEA 5I58B 1DPEA 5M2VA 1AIVA 4QSEA 1B1HA 4WEDA 4NE4A 3VXCA 4LZ8A 2ZNTA 5DVIA 3O6GA 1MXYA 1IQ7A 2Y7IA 2H99A 2GH9A 3BKIB 4QFLA 2UVJA 3EHUA 1IXHA 1LBCA 3JZJA 1TFDA 3QXMA 2F7AA 3O28A 3RNNA 2PBWA 1SYHA 5I2KB 2PMSA 2I4BA 4GFRA 3OD7A 3V5AA 3TTKA 5L9SA 4F29A 3E13X 1EH3A 5H8QA 1Y4CA 3MUQA 1VFEA 5CC2A 4NF6A 5FHMA 3T93B 4RXLA 3H3GA 2VP1A 5AA4A 2VOZA 4XXUA 1Y3NA 3C9HA 3SESA 3FUZA 4E0WA 3IAZA 4R75A 3I3VA 2NWJA 2O51A 2UVHA 4GD5A 4ZEBA 3TUSA 3MC2A 3C33A 3THIA 4DCYA 3T9UA 4F3GA 3EHTA 1M5EA 3GBBA 4KI0E 1NL5A 3O9PA 3M8UA 4QSDA 2ZNUA 1Z7NE 3TCGA 4I1DA 3KOSA 1JVYA 2HAUA 5DVJA 4F18A 1OMPA 4RK9A 4OVJA 2OJTA 3KN7A 2V3UA 5AA4B 3CRBA 3OELA 3GXAA 1D9YA 2PVUA 2DE3A 4F3SA 3N5LA 4DLDA 4P0IA 1US4A 1NNKA 3DM0A 4U4XA 5DEXA 4AB5A 2O1MA 4IGRA 4R74A 3W9WA 1KWHA 2HAVA 2ZYKA 1ZKBA 4IB2A 3QYTA 1AH5A 2P2AA 1MQGA 1B46A 4NF5A 4I62A 3B6WA 1FQAA 4H8JA 3RQTA 4GQOA 5I59A 3TTMA 4G68C 3W15C 3VDFA 5CRYA 3CFZA 1GR2A 3TAJA 3FASA 1XOCA 3PD8A 2X26A 2XXPA 2PT2A 1B51A 1MDP1 5F7VA 3RLFE 5ELVA 2QMXA 3IJXB 1USYE 3KSJA 3USDA 4EUOA 2I0CA 3K01A 1ATGA 4UACA 4F3PA 2XXIA 4OHNA 3KGCA 1IZ1A 4RPNA 3HPIA 1OVBA 2XHDA 3SETA 1M5CA 2HZKA 2E0SA 2Z8FA 3MW0A 2NXOA 1XVXA 1H43A 2DS9A 3VVDA 3M3FA 4WKMA 1S9TA 1ZIUA 4NF5B 4BDMA 2M8CA 3FATA 1A99A 3PMVA 4I8CA 2R71A 3K6WA 5I59B 1A40A 2Y84A 4XKRA 4OXVA 4HW8A 4R73A 1AOVA 3KBRA 2XXVA 3HN0A 3RT6B 4H0WA 3H4ZA 2XXTA 2Q89A 2D5WA 3O66A 4H1XA 2XXWA 3CG1A 2I4CA 3RTWB 2GHAA 3A09A 5ITOA 2I6EA 1P1OA 1UTHA 4ELPA 1Y4TA 2XX7A 4ND9A 2F6GA 4I9DA 3MPLA 3T9VA 2FYIA 2QL3A 4GOTA 3G3HA 1LGBC 4LP2B 5CMMA 3H6UA 5K2YA 4YMBA 2QRYA 4OFOA 2DWAA 3DLNA 3G3JA 2O69A 3PU5A 3UA8A 2Q9TA 1Q35A 1OQHA 2X7QA 4KHZE 4Z0IA 1XS5A 3S9EA 3PGFA 1MY0A 3VE1B 3Q27A 1B40A 1QVSA 4OENA 2DVCA 1SVXB 4F39A 3T96B 5TU0A 1MQIA 1B4HA 3ZKKA 2RC8A 4IO3A 2E1SA 3UORA 2F5XA 3FV1A 1UTHB 1SQYA 4U1OA 3FJMA 4IO5A 1M5BA 2O1LA 1OLCA 1N3XA 4R9GA 2H5YA 3TCHA 3TTNA 3K6VA 1HSEA 1MY1A 3IOWA 5H8HA 2NVUB 4ZE9A 3C31A 5FHNA 1MY4A 3DP6A 2AIXA 4NF4A 1XHYA 1SBPA 4NTLA 1DTZA 1N7WA 1QUKA 2DWJA 4JDFA 4G8NA 2PX1A 3MVXA 1FCKA 1QKAA 2YLNA 2ZNSA 2P1SA 4H5GA 3ZKLA 2I58A 5J1DA 2DYXA 2X7PA 3K1PA 4OEVA 5ICQA 3VXBA 3MZ9A 4Q30B 1LFIA 1MPDA 3S9MC 3DP4A 3SERA 4ONYA 4GIZA 4O3AA 1AL3A 2THIA 5DYHA 2QPQA 1MXUA 2F7BA 4X1BA 3OEMA 1Y20A 2HQ0A 5H8HB 1CB6A 3M3KA 3FVNA 4F2QA 1NNFA 4OETA 4NF4B 1IEJA 4K3FA 4PFUA 3TKDA 3TZAA 5AA2A 3U8QA 3FVOA 2VD3A 4U2RA 4G8HA 3O29A 1ZTYA 1B3HA 2PYYA 1QUJA 3KEIA 2I48A 3IJOB 3VLUA 1N04A 3IOUA 1A7LA 1M5FA 1B3LA 2UVIA 2DE4A 4F22A 3OMBA 4NMYA 3PD9A 4TOZA 4QSCA 2QJEA 1FQEA 5JTYA 1WVJA 3I6VA 4H8IA 1N3WA 1VFDA 2QS3A 2F97A 4AQ4A 5IAIA 3CSGA 5K2XA 4R6HA 4YU0A 5H8SA 1B7UA 5A5XA 3B6TA 3Q28A 3P7IA 1PEBA 4MLVA 3CIJA 1HSJA 4GXAA 1B05A 3ONMA 4PP0A 3MZ1A 4LONB 1MRPA 2ZYNA 2CZLA 5AA2B 4YZZA 4ELOA 4G4PA 1I69A 1MY2A 3SDFA 4OFLA 3RTFB 1LAXA 2HEUA 1TT1A 3A3UA 1OLAA 3D4CA 1SI1A 2XD3A 3SEUA 2NUVA 4IO4A 1B4ZA 5ICTA 1TFAA 3H6VA 1BKAA 3CFLA 5JTYB 3VLVA 4DCXA 5H8FA 3QK6A 4ZEDA 1NNTA 2OK2A 4TLMB 1A54A 1Q1KA 4EQBA 1MH4A 1BP5A 4OZ9A 5L8DA 2RKMA 1MY3A 5A5XB 3FIRA 3K02A 3B6QA 4H67A 1LB8A 3UGWA 3SEVA 1R9QA 2A5TA 4EXLA 1LSTA 5AA2D 2HFBA 2R9JA 1ANFA 4FE8A 4GL8A 1FW0A 1QUIA 1OIBA 2XX9A 4ECFA 1DPPA 1PBQA 3HHGA 3N6TA 4U4SA 1URDA 1JVXA 2DP8A 4NWDA 3TQWA 2NOOA 4C0RA 1N7XA 3FD3A 4QF9A 5DVFA 1MXVA 4LQ5A 4QHQA 1FTKA 1DTGA 4XKPA 4UA8A 2OCUA 3RY3A 3RN8A 3EQ1A 4YKKA 4OTEA 1Y3PA 4HTGA 2QS1A 1IIWA 3RGYA 2A5SA 3MQ9A 4BDRA 5H8FB 3I5OA 4QFOA 3CG3A 5L9OA 3FJGA 2V84A 3OOAA 4LQ2A 3IORA 1MG1A 1LCFA 3S2VA 3S9NC 2B65A 4OMBA 5CBSA 2A5TB 3Q29A 5CMKA 3U92A 2HZLA 3H6TA 2ESNA 4LVQA 3MJNA 5DTBA 1SW2A 3KOTA 3O97A 2GFEA 4LZ5A 1PB7A 4Q0CA 3S9LC 4ZEIA 3ZS6A 1OQGA 1VSOA 4GRKA 4FAJA 3IB1A 4NEDA 4DZ1A 4OYVA 4KQPA 1FQBA 1H45A 2ALUA 3RT8A 3OO7A 2F8DA 1NH7A 4XKQA 1DSNA 1WDNA 2UXAA 4YAHX 2D3IA 2DOJA 1YPNA 1US5A 2Q2AA 2O84X 4RNSA 4YKIA 1FTJA 4RY1A 3HO7A 4F1YA 4F31B 1MM7A 3VV5A 2I3VA 3SKPA 3LSLA 3FXRA 2Z8DA 3MVWA 2UYFA 3MWBA 5EYFA 3QAXA 3K1MA 3C32A 3FVKA 1LB9A 1SI0A 2HXWA 3PUWE 3V89B 3L6HA 1JEUA 3H6WA 1P1UA 4O3BA 1LLSA 2Z8EA 1B7ZA 4BDQA 4ZS9A 1N76A 3IX1A 3QSLA 2G93A 3H03A 1JW1A 3KFMA 3GZGA 4ELRA 3FXQA 1RKMA 3UIFA 1IXIA 2XXYA 1VR5A 2F78A 1H3DA 4PFTA 1R1NA 4DXCA 3JYRA 3SEYA 1FTLA 1A55A 2DWHA 4Q8RA 4G8MA 5KDTA 1XVYA 4JWYA 3JV9A 2V25A 3N94A 1MDQA 3MPKA 3OO6A 1R6ZA 4PETA 3EPEA 4MLQA 3MP8A 3SEXA 1RYXA 4QRZA 1NMUA 4F2OA 2OZZA 1B0LA 3PUVE 4DXUA 3N26A 3E3KA 2AL5A 2ABHA 3HHFA 5B70A 1JW5A 2ONKE 3PPNA 2QS2A 4PFWA 1P1WA 2B3BA 5F1QA 3K0VA 1I6AA 3K6XA 3VVEA 2XXHA 4BDOA 2F36A 4O3CA 1B3GA 1VE4A 2YPNA 1T0KA 1LCTA 1OVTA 3TEPA 4PFYA 1FQFA 2F7CA 5KDTB 5BUUA 3OO8A 1MH3A 3MBPA 4JBZA 2V3QA 1WODA 3C36A 1EU8A 1MXZA 1ZMGA 1NH8A 3VLWA 2W7YA 1FQCA 3ILTB 1CE2A 4TLLB 1DOTA 1B32A 5AA1A 3MP6A 1B5HA 1URGA 1I6QA 1A8FA 3C34A 4M4GA 2RCAA 2Y7RA 3OO9A 4ZEKA 3FV2A 5KZTA 4EF2A 4THIA 4RJZA 1UTBA 3ZSFA 4EQ9A 3N6UA 1GVCA 4NWCA 4POWA 2OWTA 3MAMA 1HSLA 1QW0A 3LR1A 3FJ7A 2AYSA 1QJMA 1J1NA 2IEEA 4ZECA 3HV1A 4WEPA 2P0SA 3T9XB 3TYHA 4YKPA 4NF8A 4N07A 3PUZE 3T66A 5JEIA 2R6GE 4X1DA 3OSQA 5TPAA 3UP9A 1JNFA 3E4RA 3TMGA 2XD2A 2VGQA 4GLIA 4Q5TA 4R6YA 1P1NA 2O68A 4FORA 1N0TA 1UIVA 3BFUA 4ESWA 4KYSA 3DP8A 2BJJX 4H5FA 3PUXE 3G7WA 1UTBB 4U23A 4X48A 1A8EA 4IO7A 3TODA 4XTCQ 4FIMA 3ILUB 1QKBA 3IR1A 4RK2A 1LBBA 1O7TA 1XC1A 4OFJA 2OBGA 1PBPA 2OWSA 5H8NA 5IKBA 3H7MA 1ZLQA 3EN3A 3IB0A 4XKNA 3K6UA 1ZU0A 4R2FA 4NF8B 1JEVA 3U93A 3G3IA 4QFNA 3T22A 4DE8A 1BIYA 5TPAB 3PPQA 3LBSA 1O64A 2DSFA 2DE2A 5I2NA 4P11A 4JSOA 4ISUA 2O7UA 1B5IA 2FNCA 1TXFA 4JSDA 5I57A 2I0BA 3MVZA 5B7DA 3IOTA 4QFKA 2ONRA 1LAFE 2G29A 3TQLA 1YTVA 2KLFA 2DWIA 2QMWA 3TTRA 4U1ZA 4OEUA 1R9LA 2FA7A 2AL4A 3IL1B 4E0XA 1LFGA 2ZYMA 4R72A 4MBPA 3TELA 1TWYA 4LATA 4POXA 1D9VA 5H8NB 4R2BA 4Z7EA 3PMWA 5ITPA 2DXRA 4KR5A 4KCDA 2F34A 2RC7A 3FXUA 3PPOA 4U21A 3WAFA 1RYOA 4LUBA 3DELB 5CMBA 3TFLA 2O7IA 4BDLA 5I2NB 1MPBA 3FGSA 4JB7A 1FTMA 4KCCA 3IOVA 3MZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LSWA 4M1VA 3OXNA 3Q26A 1FPEA 5I57B 1S7YA 2I3WA 4WXJA 4EDPA 4F1UA 2WBBA 4GXSB 4GVOA 4F1VA 1B7HA 5L9MA 3SEWA 2H98A 1S50A 4KFQA 4MNIA 1B3EA 5CI5A 1D4NA 3LSXA 3KG2A 4IY6A 2GHBA 3TPAA 3ECRA 3R7XA 2DVZA 4U22A 5H8QB 1ZBMA 3G3GA 3IB2A 4NF6B 4JWOA 4KD5A 4OVSA 2RC9A 3PMXA 3CI8A 1NUZA 3PPRA 2ONSA 3CR9A 3K1NA 2Q8JA 4O8MA 3KBZA 1PDAA 2VD2A 4ZZAA 3GYYA 1ELJA 3CSBA 2Y5KA 4G77A 1ZJLA 4YICA 4N6PA 3GLBA 4EF1A 3KZGA 2DQVA 1B9JA 4C1UA 4GWUA 5J16A 4MHFA 4H65A 3C4MA 4UABA 3G3KA 4YKJA 4LA9A 1FTOA 4OESA 1JETA 5HM4B 1UQWA 2Y7PA 4FATA 1GV8A 4DXBA 1QULA 5I56A 4FJPA 4IY5A 1LBXA 3U1OA 1P99A 4HS7A 4JWXA 3BFTA 5DT6A 2D21A 3K00A 2RF1A 2ANJA 4G68A 1PC3A 1B6HA 5EQ9A 3ISPA 1FBGA 1FRPA 3F11A 2CEXA 3AXFA 1IITA 3VVFA 3RUMA 2VHAA 4L17A 1Y3QA 2H9BA 3EHSA 3E9XA 1IXCA 3PV0E 5CBRA 1I6BA 3MP1A 4BDNA 4ESXA 4MFIA 3K4UA 2DDKA 4ZDMA 4ELQA 1NFTA 5DEXB 3MSTA 2RINA 1SD3A 2XXXA 3L6GA 1XT8A 5AE4A 4NX1A 1DMBA 2ZXTA 2Q88A 3QUFA 4YB6A 2ZMBA 4PDHA 2XX8A 3G3FA 1B2HA 5I56B 3R26A 2Y7KA 3LC8A 1UIUA 4YMAA 2V93A 2XXQA 3LUYA 2Z22A 3HCQA 3VFJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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