1N84A

Human serum transferrin, n-lobe
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title THE POSITION OF ARGININE 124 CONTROLS THE RATE OF IRON RELEASE FROM THE N-LOBE OF HUMAN SERUM TRANSFERRIN. A STRUCTURAL STUDY
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serotransferrin
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A02
1LFIA 2OK2A 1XS5A 4GRKA 3LBSA 3QYTA 1RYOA 4QSDA 2F8DA 1MY3A 4N07A 3TTRA 5I2KB 1SW2A 2AYSA 1MPDA 1UTHA 5FTIA 4UACA 1FTOA 3OO6A 1LSTA 3RGYA 2I4CA 4FJPA 4U1OA 4F1VA 2F34A 4ZEBA 1BKAA 1FTMA 4NF8A 4DCXA 2YJPA 5HBCA 3S9EA 1OQHA 5AA4A 3IO4A 5CM6A 1LGBC 3CFLA 1ZKBA 4KD5A 4OQOA 2ZXTA 3THIA 3KN8A 4F18A 2NOOA 5H8HA 3OSRA 4XIGQ 1ZTYA 1MDQA 3GXAA 5I59B 3TCGA 2HQ0A 1PB7A 5CMCA 5CBSA 4OERA 4JWOA 5FHOA 1A40A 1NNTA 4G68A 4OEVA 3MWBA 4PE5B 4R9FA 3RTFB 2P0SA 2NXOA 3KN3A 3LSXA 2QS1A 1VFEA 3K01A 4NF6A 1B1XA 2Y7PA 1N84A 1IEJA 3ODBA 3FUZA 1JVYA 4HCYA 1P1WA 1DTZA 2PT2A 3R7XA 1ZBMA 5AA1A 3C34A 3GBAA 3H3GA 1LAFE 1B58A 1FTJA 1LB8A 4JBZA 3SEXA 3A3CA 3F11A 4PFUA 3OO7A 1Y1MA 4H0WA 2B3BA 1IXHA 2QL3A 3FD3A 5JTYB 4RPNA 3OO8A 3DP4A 1DOTA 1QKBA 3DM0A 3S9NC 3PMWA 4JDFA 2DXYA 5I58B 3E4RA 3HHFA 1MDP1 2VD3A 4KQPA 2QJEA 1YPNA 3VVDA 3K0VA 3ZSFA 1NH7A 3HO7A 2P1SA 1ZLQA 5AE4A 4RK9A 4DIGA 3K00A 3W15C 5JK4A 4LATA 1NNKA 2XXRA 3TAJA 3SEYA 4M1VA 3MZ1A 4HTGA 1EZ9A 3KSXA 2UYEA 1S7YA 2GRVA 3G3IA 2ALUA 4OTEA 3TTKA 3JZJA 1B5HA 4NWCA 5H8NB 5KCJB 2DVZA 1B3HA 2Y7IA 4ZEKA 5TP9A 4FIMA 1II5A 3KOTA 1DMBA 3M3FA 1B3GA 1LBBA 3PU5A 4LONB 1POY1 2X26A 1MXXA 3QXMA 1QKAA 3S4UA 1WDNA 2XXHA 2Z8DA 1SBPA 1MY1A 4LVQA 2QSXA 2F35A 2A5TA 1URGA 4ELRA 2OCUA 2V3UA 2Q2AA 3TEPA 2ONRA 5EHSA 5B7DA 4HW8A 3FVOA 3MVWA 1DSNA 4Q5TA 3CRBA 3DP6A 5J1DA 1JW5A 1O7TA 2GFEA 2GH9A 4KFQA 4Z7EA 1Q35A 4IY5A 3FJMA 3CI8A 3IOWA 2I6EA 3MP8A 1MRPA 2GHBA 4YKKA 4BLAA 1US5A 2RCAA 3IX1A 1B2HA 1ANFA 4ECFA 3B6QA 2DWHA 5A5XA 1B7HA 4KYDA 3I6VA 3PMVA 4ZDMA 1H44A 4OHNA 2G93A 4FE8A 3KFMA 2ZNSA 5CC2A 2RC7A 3G3KA 4OMBA 3TQWA 3RQTA 2DYXA 1FTKA 4Q30B 4KYSA 4H5GA 3RNNA 5KDTA 1A8EA 4XXUA 4I62A 1PDAA 1Z7NE 5H8QB 4UA8A 2REJA 3KJ7A 2B3FA 3FVGA 3UGWA 3U1OA 3FIRA 5B70A 4NTLA 4EF1A 1AOVA 3M3LA 3K2DA 3W9WA 5I2KA 1A54A 4WEPA 5IAIA 1B9JA 4MFIA 2RF1A 4H1XA 3TPAA 5EHMA 1H3DA 2QMWA 3VVEA 4ONYA 5H8FB 1TT1A 1ZJLA 2R71A 3TFLA 2DS9A 2RINA 3UA8A 1MY4A 3B6TA 5F1QA 2ZNUA 2AL5A 1L5TA 3OSQA 4H6DA 4NWDA 3EHUA 5L9OA 4LQ2A 4MF3A 4X9TA 3UK4A 1AIVA 1P1OA 3ECRA 3VXCA 1SW5A 1Y9UA 1WVJA 4GXSB 3IR1A 4NF4B 1SYHA 3USDA 2I3WA 4EQ9A 1I6AA 4JWYA 2PX1A 1N04A 1QJMA 3O66A 4DXBA 3VFJA 1Y1ZA 4QFNA 4H67A 2I49A 1P1NA 4ESWA 4U4SA 2DVCA 4GLIA 4KCDA 4RJZA 3V5AA 5IKBA 1AH5A 5TPAA 5ICTA 3TCHA 1CB6A 3FJ7A 3IJXB 1FQFA 1H43A 3VLWA 2Y84A 4G8MA 5L9MA 5AA3A 4YB7A 1I6BA 3SEVA 3KBRA 2REGA 3N94A 2DOJA 2RCBA 3T9XB 1UTBB 3VV5A 4OZ9A 3SDFA 3OEMA 2F7CA 4ZZEA 3MW0A 4OEUA 2BJJX 4BDQA 2XD2A 5JTYA 4YAHX 1A7LA 5HPQA 3CFZA 4G68C 4R6KA 4BDNA 4N6PA 3V89B 3FATA 2GHAA 2XXWA 2DE3A 2XXVA 2VGQA 1MQHA 3TQLA 1VSOA 1SD3A 3Q28A 1IIWA 3U93A 1Y3PA 1B7UA 1B3LA 1M5CA 2O1LA 1FW0A 2W7YA 3PPOA 1FQAA 4O3BA 3ONMA 3O6GA 1EH3A 3TELA 3MZBA 2OJTA 4R75A 3CIJA 3DELB 2AL4A 4HS7A 3V83A 1USYH 1B3EA 5CI5A 1QUKA 4LP2B 1PBQA 5F7VA 4IO6A 3CSGA 4RK2A 5JEIA 1LAXA 1MXUA 4FEBA 3N26A 5H8NA 1MPBA 1AMFA 3R6UA 1JNFA 1VR5A 1Y3QA 1URSA 2XXTA 4GXAA 3LUYA 1F9BA 4LA9A 4EUOA 2B65A 2F5XA 3TZAA 2QS2A 3FZVA 4DLDA 1R9QA 4OFOA 1B52A 3ILUB 4YKPA 1NL5A 4DDDA 2F6PA 4GOTA 4I8CA 3IAZA 3R26A 4IB2A 5K2YA 1NNFA 1M5FA 3KN7A 5DYHA 3M8UA 2V93A 4YB6A 4GD5A 3TTMA 4F19A 2PBWA 3T9VA 1Q1KA 2X7QA 4BDOA 2FNCA 3H6TA 2I4BA 1O64A 1FQCA 4KI0E 3BKIB 3JYRA 2VD2A 1LFHA 2ESNA 2QRYA 3FXRA 3CSBA 4IGTA 3IOUA 4DZ1A 2OZZA 3TKDA 1TFDA 4F2OA 3C35A 4FAJA 4AB6A 1HSEA 4RXLA 1JW4A 4GFRA 4H8JA 2O6AA 4YU0A 5CBRA 3ZKLA 2OLBA 4QSEA 1OQGA 4MBPA 1PBPA 3JV9A 2Q9TA 3IB0A 3RY3A 2XXQA 4F3BA 2H5YA 2O69A 4K3FA 2PT1A 2F7AA 1MY2A 2V25A 3RT6B 3TTNA 2Y7KA 5DVIA 3U92A 3IORA 5L9SA 1PB9A 4IO4A 1MH4A 2ONSA 3SESA 3DLNA 3TCFA 1O63A 4ZE9A 4F3GA 1NFTA 1MM7A 1JETA 3T93B 1OLCA 3PPPA 4DXCA 3G3GA 3T9UA 3K4UA 3MC2A 2ONKE 5I56B 3A3UA 5ELVA 4OENA 2UVJA 5AA2D 5DT6A 3S2VA 2Q89A 1XHYA 2H99A 4GL0A 3O97A 1TWYA 5DTBA 4NF8B 4F2QA 2HEUA 3ZKKA 3D4GA 5H8FA 3K6UA 1LAHE 3BFUA 5BWJA 5AA4B 2F36A 3HPIA 4R6YA 4KCCA 3B7DA 3KOSA 2XXIA 3T66A 3TUSA 1YCJA 1NNPA 1I69A 1MM6A 1FQBA 4G8HA 4IO7A 3OD7A 5H8HB 4KR5A 3MQ9A 3B6WA 3RUMA 2Z22A 2NVUB 3H06B 3TMGA 1S50A 1S9TA 1DPEA 3RPWA 2ABHA 3IL1B 1P1QA 1B46A 4NF4A 1ATGA 4I1DA 2O7UA 4G68B 1QULA 2XX8A 3EHTA 4QSCA 3QK6A 4F1YA 3LSWA 2I3VA 1SVXB 3SERA 3C4MA 5ITPA 2HZLA 1URDA 1R6ZA 1B51A 2QMXA 2DWAA 1OIBA 3C31A 4LQ5A 4YB5A 2IEEA 4FATA 3KSJA 1JW1A 2R6GE 4G4PA 4LUBA 4ZE8A 1UTBA 4DCYA 4PFTA 3CG1A 4EQ7A 5KZTA 2OBGA 1EZOA 2DWJA 3H6WA 1PEBA 1B0LA 1J1NA 1IXCA 3UORA 2M8CA 4P0GA 4ZS9A 2DXRA 3MUQA 4IY6A 3Q25A 4YMBA 1OLAA 3L6HA 2DE2A 1N7XA 4R2BA 3T22A 3EF7A 1IUDA 1DTGA 1Y20A 1H76A 3IOVA 1B0HA 3VLUA 4IO3A 2HXWA 4XKNA 3M3KA 5ITOA 1D9YA 1TFAA 1VE4A 1NH8A 3H7MA 2UXAA 2F97A 2DWIA 4QFKA 4NE4A 4JXIA 2YLNA 1XVXA 2CZLA 3QSLA 2Z8EA 1N3XA 3PUYE 4O3AA 2YPNA 3I3VA 4POWA 3GLBA 3TTLA 4EF2A 4IO5A 5TP9B 4ZZAA 2O84X 3PUZE 1Y4CA 2I0BA 1P1UA 4OYVA 5L8DA 2A5SA 1SQYA 4R6HA 1BP5A 4NEDA 2XX7A 4EXKA 3MVZA 3C33A 3MZ9A 5I59A 1ZU0A 5FHNA 4OETA 3EPEA 4LZ8A 4BDMA 5FTHA 5AA2B 4JSOA 1QUJA 3AXFA 1EZPA 4JB7A 1FTLA 1MQGA 4GIZA 1BIYA 4C1TA 4PP0A 1KWHA 2D3IA 1N0TA 3HN0A 4I9DA 4AB5A 3FV1A 2X7PA 2ZYMA 2O68A 3O29A 4U2RA 2PMSA 3G3HA 4ZECA 3PUWE 2I48A 1A99A 3SETA 2Z8FA 1MQJA 4FORA 3H03A 3PMXA 1JEVA 2FYIA 4L17A 4QFOA 4TLLB 1B1HA 3ZS6A 1LAGE 3U8QA 3H6VA 4X1BA 4GL8A 3WAFA 1N3WA 1B05A 5I57B 2ZYOA 5A5XB 1GGGA 1MQDA 2H98A 1B40A 3DP8A 3BBRA 4EQBA 5DVJA 1H45A 5I58A 5M2VA 3CR9A 4FEDA 3G7WA 3P7IA 4HCWA 1M5BA 3C32A 3G3JA 2UVHA 3VDFA 5CMBA 3QUFA 1USYE 4U21A 5CMMA 3IOTA 3IB1A 3C36A 3IK6B 2O1MA 5H8SA 1MG1A 1GR2A 3FVKA 1D9VA 3VXBA 4H65A 3KGCA 4F22A 3FASA 3MAMA 1ZMGA 2HZKA 5I56A 1SI0A 3IB2A 4X48A 3RLFE 1AL3A 2F78A 5K2XA 5KCJA 2Q8JA 4RYAA 5FHMA 2H25A 2NWJA 2XXPA 5I84A 5CMKA 5BUUA 2VP1A 4H8IA 4F31B 2AIXA 4R9GA 2VOZA 3EHSA 3VVFA 4G2ZA 1XT8A 2RC9A 5HM4B 3K1PA 3O6IA 5I2NB 4QFPA 1NMUA 5DEXB 4YKIA 2F7BA 3PV0E 3KG2A 2G29A 4OESA 1JQFA 1TXFA 4U23A 3MPLA 3GBBA 1D4NA 1D3KA 3K6VA 3FVNA 3PGFA 4NF5B 1B5IA 2THIA 1HSLA 3S9MC 4F1UA 4E0XA 3TDJA 1Y3NA 1A8FA 1JEUA 2UVIA 4TOZA 4MH5A 2Q88A 2H4IA 5TPAB 4ESXA 4U4XA 1FQEA 4N13A 2E1SA 4KHZE 3OXNA 4PFWA 2XXXA 3W9VA 4PFYA 2HCAA 1SYIA 4RY1A 3FXQA 1MQIA 1QVSA 1DPPA 2Y7WA 3N6TA 3N5LA 1SW4A 1PB8A 1B3FA 2V3QA 4POXA 3RN8A 1YAEA 3VLVA 4OXVA 4ELPA 5EYFA 4ISUA 1N76A 3K02A 3FGSA 3MPKA 4KYEA 1MPCA 4QFLA 2IA4A 4R74A 3PUXE 4JSDA 5DVFA 4TQUQ 4OVJA 5H8QA 2E0SA 4Z0IA 1MXVA 1UIVA 1OVTA 4LZ7A 1PC3A 4F39A 1CE2A 1Y4TA 3C9HA 1UTHB 1MY0A 4YMAA 2DSFA 1RYXA 4GF8A 3UP9A 5ISUA 3HSTA 2O7IA 3UN6A 3MBPA 2Y7RA 2HFBA 4IGRA 3LC8A 4JWXA 1T0KA 2HAVA 1R1NA 2V84A 1IQ7A 1XVYA 4M4GA 3E3KA 4THIA 1LCFA 3MP1A 4PETA 1LB9A 1LBCA 4EDPA 3UIFA 3KZGA 4EXLA 1VFDA 4X1DA 3OO9A 4XKPA 4XTCQ 2ZMBA 1LFGA 3KEIA 4GVOA 4OWDA 4FECA 1POTA 3MVXA 3HCQA 3LR1A 1MH3A 3HHGA 1YTVA 1US4A 1NKXA 3O2AA 3U72A 1OVBA 4OFLA 4YICA 4R72A 2ZNTA 1XOCA 4G8NA 1B32A 4OFJA 2XXUA 3MJNA 4P0IA 4ND9A 4P11A 5AA2A 1MXZA 3OOAA 3SEUA 3KJTA 1B5JA 3TYHA 3O6HA 2HAUA 4BDRA 1BLFA 1SI1A 4NF6B 1QUIA 2XHDA 2FA7A 3L6GA 3CVGA 5LOMA 2UYFA 3N6UA 4RA1A 3CG3A 4YKJA 4F3PA 1ZIUA 3Q29A 4IO2A 4C1UA 3QIMA 4R2FA 2QS4A 3K1NA 2OWSA 3T9HB 2R9JA 2UVGA 3T96B 1I6QA 3K6XA 1B7ZA 3PUVE 1Z7ME 1XC1A 4F3SA 1UIUA 1IITA 4BDLA 1HSJA 2QPQA 1M5DA 2D5WA 3QUJA 4C0RA 5I57A 1QW0A 4Q0CA 4WKMA 3PD9A 1GTKA 3TODA 3OELA 1B4ZA 1RKMA 4WEDA 3OEKA 4GWOA 3H4ZA 3OMBA 3MP6A 3IJOB 1LCTA 3QAXA 3ILTB 3EQ1A 3PPQA 3PPRA 4XKQA 3RT8A 3S9LC 4QRZA 3O28A 3EN3A 5TU0A 4MLQA 4ZEIA 2XD3A 3D4CA 1MXWA 3PD8A 3CFXA 3LSFB 1ELJA 3E9XA 4PQJA 4G77A 1MS7A 3FXUA 4RPOA 2PYYA 4GQOA 4DXUA 1IXGA 2RC8A 1GVCA 3RTWB 1N7WA 1R9LA 2KLFA 2ANJA 2OWTA 2LAOA 1WODA 4WXJA 2ZYNA 2WKYA 3K6WA 2NUVA 1MXYA 4KPTA 2XXYA 2I0CA 4YZZA 2RKMA 3MVYA 2Q2CA 3BFTA 4TLMB 3HV1A 2D21A 5I2NA 4QHQA 5DEXA 3SEWA 2A5TB 4ELOA 5ICQA 3PPNA 3Q27A 2QS3A 1SDXA 4F29A 2I58A 2Z23A 4Q8RA 4DE8A 1B6HA 4O3CA 4NF5A 4R73A 4ELQA 4MLVA 4ZEFA 3A09A 4QF9A 4NMYA 3WAEA 1LLSA 3H6UA 1EU8A 1FCKA 3O9PA 2DQVA 3FV2A 3GZGA 3FJGA 3LSLA 4H5FA 4ZEDA 3E13X 1A55A 1IXIA 2VHAA 3V8XB 1GV8A 1UQWA 1P99A 5CRYA 1OMPA 2V3TA 2O51A 4E0WA 4U1ZA 3Q26A 2CMOA 4AQ4A 4XKRA 2PVUA 1JVXA 1B4HA 4LZ5A 1IZ1A 4U22A 3K1MA 3I5OA 1FQDA 2XX9A 3VE1B 1BTJA 1M5EA 2DP8A 3U94A 3SKPA 3G3FA 1SW1A 4RNSA 2F6GA 5KDTB 3OENA 2ZYKA 3IO6A 2H9BA 2P2AA 2DE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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