1N84A

Human serum transferrin, n-lobe
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title THE POSITION OF ARGININE 124 CONTROLS THE RATE OF IRON RELEASE FROM THE N-LOBE OF HUMAN SERUM TRANSFERRIN. A STRUCTURAL STUDY
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serotransferrin
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A02
5DEXB 4F3GA 1SW4A 2QRYA 3T9VA 4BDOA 1KWHA 3HV1A 3IAZA 1LB8A 3BFTA 2HAVA 3LBSA 5AA2D 2XX7A 3FJ7A 2F36A 1M5DA 2OJTA 3SEYA 3KSXA 2DSFA 2HQ0A 3H6UA 3TYHA 3SERA 3TQLA 4BDRA 1II5A 2XXPA 4O3CA 1D4NA 4OZ9A 4XKNA 3T9HB 4JBZA 1JETA 3USDA 5AA2B 5KCJB 4DIGA 1Z7ME 2AYSA 1DPEA 1WVJA 1ZJLA 2P2AA 1JW1A 5CMCA 2GFEA 4QSEA 3PUXE 4U22A 1SD3A 1DSNA 1LAXA 1SDXA 4F3SA 4JSDA 3QK6A 3DELB 4R9GA 4FATA 4M4GA 3B7DA 2PMSA 1JVXA 3VLVA 2X26A 4IO4A 1FQCA 4KQPA 1ZBMA 1SVXB 3RY3A 4HS7A 5JEIA 3O9PA 1MY0A 2F34A 4RYAA 4U2RA 1P99A 4ZECA 2VD3A 3LSXA 1MPBA 4F22A 4H5FA 2I6EA 4NTLA 2I3WA 3ZSFA 1N3XA 4GOTA 4DLDA 1H76A 4DXCA 2Y7WA 5I58B 1Y3QA 1AL3A 3CFXA 4POWA 1LAFE 3O66A 1H44A 5H8QA 1JVYA 2Z8DA 1MPDA 5ITPA 1FTLA 5LOMA 3VVEA 4LZ5A 5L8DA 4MH5A 1B5JA 3KJ7A 3U93A 3K02A 3TAJA 1YTVA 3TPAA 3UP9A 3TELA 5BUUA 4G8NA 3PPPA 3MBPA 4JDFA 1ZIUA 5HPQA 3PUZE 4DE8A 4YB6A 3H06B 1SQYA 3PPNA 1EH3A 1XVYA 2Z23A 3G3GA 3IB2A 2NWJA 3THIA 2Y7IA 1LFIA 5AE4A 2ONSA 3G3JA 3K00A 4GFRA 4QHQA 1H43A 3Q25A 1FCKA 3AXFA 1SBPA 4NF8A 2F5XA 3MPLA 4IGRA 1QUKA 1IQ7A 4U4XA 4KYEA 2HZLA 3M3KA 4M1VA 1BLFA 4NWDA 2GH9A 2GRVA 3GLBA 2AL5A 1A8EA 4XKPA 3KBRA 3K1PA 4E0XA 2DE3A 3K0VA 1QULA 1ZU0A 1IIWA 3PV0E 5JTYB 1LSTA 3IB0A 1R9LA 1SW2A 5H8QB 3OEKA 3QAXA 3FVNA 1SI0A 2LAOA 1MXUA 3ZKLA 3KFMA 4OFLA 2XXHA 4I62A 1L5TA 4AB5A 2F6PA 5ICQA 2RCBA 2O69A 3SDFA 3V89B 3LSFB 3PU5A 1NMUA 3BFUA 4OQOA 3N26A 4YMAA 1Y1MA 4LVQA 3PUVE 4PFTA 5KDTB 4N07A 4EUOA 4FIMA 3FZVA 4XIGQ 1USYH 2YPNA 1O63A 3H6VA 3O2AA 1A40A 4YICA 1RYXA 1R9QA 4EQBA 2NOOA 1DTGA 3GXAA 2Y84A 2PYYA 1URSA 1QUJA 4F39A 3FVGA 5CMMA 4KFQA 4WKMA 2Q88A 1BTJA 1B0LA 3OO6A 3TCGA 3H03A 1B7ZA 4MLQA 2V3TA 5L9OA 3CVGA 1DMBA 3KEIA 4GLIA 4RY1A 3MP8A 2HZKA 3MVZA 1I69A 1IUDA 1Y3NA 1TXFA 2I58A 3RN8A 3H4ZA 3S9LC 2H99A 3N6TA 1NNFA 1B4HA 3PMVA 4OWDA 4YAHX 3HHFA 1ZTYA 3V5AA 1N04A 1VSOA 3PD8A 1RKMA 1NNTA 2F7BA 2F8DA 1ANFA 3MVXA 4N6PA 5I2NB 1JQFA 2DWAA 2QS1A 1ZMGA 3O97A 3BKIB 4BDQA 1R1NA 1D3KA 1Y9UA 4LA9A 2IA4A 5K2YA 4HW8A 4RPOA 4EDPA 1SW5A 3M3LA 4F1UA 2RKMA 3TEPA 4YKJA 3GBAA 1DPPA 1Y4TA 3G3KA 4E0WA 3G3IA 5FTHA 2O51A 4ESWA 2H5YA 4OHNA 4PFWA 3HHGA 1B3HA 3I6VA 1ZKBA 4GF8A 1DOTA 1PBQA 2R9JA 4LZ7A 3ECRA 1MH3A 3JV9A 2XXTA 3QYTA 5HBCA 3Q29A 3T93B 3S9NC 2XX8A 1LGBC 1NNPA 4AB6A 5DEXA 1B0HA 4O3AA 3KOSA 3TTNA 2CMOA 1JW4A 3KOTA 3FVKA 5CM6A 4LONB 2E0SA 4GIZA 2X7PA 1Y3PA 1O64A 1JNFA 4F18A 3KSJA 1XOCA 3IOWA 5EYFA 1Q1KA 3U94A 2HXWA 4ZEKA 3TODA 1I6AA 3B6TA 4THIA 3K6XA 2O68A 3G3FA 4FECA 3PPQA 1B51A 4IO6A 5AA2A 5KCJA 1B4ZA 2V3UA 5ELVA 1M5CA 3VXBA 2HFBA 2DP8A 1NH8A 1URGA 1A55A 3PPOA 3RUMA 2F78A 3UK4A 2ZNSA 1IXHA 1BIYA 4NF5B 1NL5A 5B7DA 3T66A 3FVOA 2OWSA 4DXBA 3IOTA 1AIVA 2YJPA 1D9YA 1SYIA 4PQJA 3ODBA 3B6QA 4BDLA 4MLVA 5K2XA 3CFZA 4FEBA 4DCYA 2XXQA 3VVDA 4U21A 1MPCA 4F29A 4F31B 1HSLA 1B52A 3OMBA 1FQBA 5ITOA 3ZKKA 4GL8A 3R6UA 5I58A 3H3GA 3MVYA 3QUFA 2UVHA 5ISUA 3VLUA 3OSRA 3K6UA 3QIMA 4DDDA 3FASA 4POXA 3CRBA 5FHOA 4EF1A 2IEEA 2B3FA 3KZGA 2DWIA 2UVGA 3O6GA 3MZ9A 3IORA 3RT6B 2HCAA 1Y20A 2ZYNA 1MQJA 3GBBA 1B7UA 2AIXA 4WEPA 3K1MA 3V8XB 4ZDMA 5AA1A 1MY3A 3U1OA 1R6ZA 4QRZA 3HCQA 4U23A 5EHSA 4ND9A 3A3UA 5I56B 2O1MA 4P0GA 4C1UA 4QSCA 1POY1 4ZS9A 3MQ9A 1B3GA 5L9MA 1LBCA 3DP6A 1OVBA 1F9BA 2DXYA 4LQ2A 4U1OA 4YU0A 4R2FA 3E9XA 5JTYA 1XT8A 3O29A 2RINA 3UIFA 4G8MA 1UTBA 1IITA 3GZGA 3QSLA 3MJNA 2H25A 4ELOA 4IGTA 1MXZA 2X7QA 2I4CA 1FTMA 3MZ1A 3PD9A 2DXRA 4I1DA 4KCCA 2QJEA 4JXIA 2DVZA 1QKBA 4IO7A 1XS5A 1IXIA 3SKPA 2Q8JA 1H3DA 3MP6A 3TTRA 3G3HA 3UORA 4G4PA 4ELPA 5KDTA 2QS3A 4OENA 1QKAA 3FIRA 3LUYA 4F3PA 4Z7EA 1VE4A 4PETA 1DTZA 2BJJX 4R6YA 4DCXA 4R6KA 4KPTA 1XHYA 3KN3A 1B46A 1MXXA 2NUVA 4EQ9A 2GHBA 2XD3A 5AA3A 4GWOA 3SESA 3MVWA 5CI5A 3KJTA 4ESXA 4HTGA 2B3BA 3DM0A 4H8JA 3LR1A 3TUSA 2ABHA 4YKIA 4OFOA 2THIA 2GHAA 2O7UA 1B2HA 3ONMA 3VVFA 1UTBB 2AL4A 2W7YA 3A09A 4IO2A 5DVIA 1US4A 4QF9A 2FA7A 3IB1A 3T96B 4ZEDA 1UTHA 3UGWA 2F7AA 1PC3A 1B58A 4GD5A 4G68C 3A3CA 3IX1A 5I2NA 4IB2A 4XTCQ 2ZNUA 4IO5A 3TTMA 2OK2A 1N0TA 3VDFA 3E4RA 4RJZA 5BWJA 1P1UA 4LP2B 1QUIA 3C32A 4KD5A 4YMBA 5FHNA 3MC2A 3TMGA 4RXLA 4RPNA 4ZEBA 1PEBA 3DP8A 1N76A 2Y7RA 3Q26A 5FHMA 5CC2A 1PB8A 4XKQA 3N5LA 3U8QA 1GR2A 4QFPA 3ZS6A 3EHUA 2PVUA 4BDNA 4EQ7A 3MWBA 4L17A 2OZZA 4HCYA 4ECFA 3EF7A 4C0RA 4MBPA 3WAEA 1XC1A 4RK2A 3V83A 2ONKE 4H5GA 2ZNTA 4I8CA 1YPNA 1MRPA 4XXUA 4GVOA 5I2KA 3M8UA 2V25A 4LATA 5A5XA 1LBBA 2E1SA 4G68B 1FQEA 1UTHB 3K4UA 3OD7A 3K2DA 4NF4A 3LC8A 3EHTA 4GQOA 4R73A 5DVJA 1EZ9A 5B70A 3FXUA 2XXVA 4LQ5A 1PB7A 1LCFA 3TDJA 1HSEA 3H6TA 3OSQA 3HN0A 4NMYA 1GTKA 1OVTA 3N94A 5F7VA 1QJMA 2PX1A 3Q27A 1O7TA 1B5IA 1MS7A 3DLNA 5H8NA 2RF1A 2XD2A 4GXAA 4F1YA 1LFGA 3LSWA 1LLSA 4WEDA 1GGGA 4KYDA 2G29A 5JK4A 4Z0IA 1B3LA 3IOUA 1A7LA 4G2ZA 2H4IA 1UIUA 5IKBA 4NF6A 4NF5A 3VE1B 2WKYA 4EXLA 2XXIA 5TU0A 3C33A 5DVFA 2OWTA 4X1DA 3N6UA 5IAIA 5CBRA 4QFLA 5I2KB 2VGQA 2DYXA 5DTBA 1OQGA 5A5XB 2P1SA 1PDAA 4QFOA 3TQWA 3R7XA 2QSXA 2OCUA 1POTA 2ZYOA 3KG2A 5TPAA 3LSLA 3MP1A 1AMFA 1MDQA 3DP4A 4NF4B 5KZTA 3OXNA 1MM7A 3RTFB 3RLFE 1Z7NE 3I5OA 2XX9A 3CFLA 3FV2A 5H8FA 2XXXA 3UA8A 5I59B 1MXVA 3PUWE 1UQWA 4OYVA 1SYHA 1TFAA 1J1NA 1MY2A 2Y7PA 4K3FA 1MY4A 3PMWA 3TFLA 1B05A 4Q8RA 4IY6A 3I3VA 2REGA 1BKAA 1RYOA 2Q89A 4H1XA 5H8NB 4IO3A 1MM6A 2UVIA 2DOJA 4OMBA 4JWOA 5CMKA 3QUJA 2D5WA 2RC9A 1EZPA 3PUYE 2V3QA 3RPWA 5H8SA 2QS4A 3H7MA 1EZOA 1IXCA 1B1XA 4OESA 1P1OA 4G8HA 3K6WA 4NF6B 4QFNA 4YB7A 1FQFA 1CE2A 1SI1A 5I56A 4OERA 2H98A 5AA4B 2I49A 3TCHA 4ISUA 2QPQA 1B3FA 3SEWA 5HM4B 3HSTA 2ALUA 1LAGE 2I0CA 5TPAB 3MZBA 4UACA 2B65A 3S9MC 1LCTA 1GV8A 4RA1A 4ZZAA 3U72A 2UXAA 2I48A 5H8FB 3IL1B 3OO7A 4OETA 2ZXTA 4QFKA 1LB9A 2DE4A 1VFEA 4KYSA 3CG1A 4TLMB 3UN6A 1TFDA 2REJA 1EU8A 5TP9B 1WODA 3TTLA 4XKRA 3MW0A 3RGYA 3CSBA 1MQDA 1OLAA 4Q0CA 4GXSB 1NNKA 5DT6A 3FXRA 1MQHA 2XHDA 3FUZA 1B5HA 2XXRA 4MFIA 4ONYA 1B40A 3CG3A 4OFJA 4IY5A 2VP1A 2Y7KA 3E3KA 2VOZA 2XXWA 2Z22A 1LFHA 3O6HA 2H9BA 3FJMA 3C36A 1P1WA 4ZE9A 1AH5A 1XVXA 3IO6A 4X1BA 3W9VA 3HO7A 3RQTA 4YKKA 1OQHA 3C34A 4YKPA 3IJOB 2O84X 1M5FA 3EPEA 3RTWB 3IK6B 3M3FA 2M8CA 4U1ZA 2ZMBA 1P1QA 2O6AA 1LAHE 4WXJA 4EF2A 2DWJA 3SEXA 3OELA 2I3VA 2DVCA 5I84A 2ONRA 4LUBA 1OMPA 4PE5B 3TCFA 3S2VA 4H6DA 2HEUA 1PB9A 1USYE 1OLCA 2Q2CA 1WDNA 5J1DA 4H65A 3ILTB 3OO9A 3OENA 1YCJA 3FD3A 3K01A 1YAEA 2PT1A 1NKXA 2PBWA 1FW0A 1I6QA 1VR5A 4U4SA 5FTIA 4GRKA 3C31A 3WAFA 4QSDA 3T22A 5M2VA 3D4CA 2HAUA 2V93A 3Q28A 3F11A 1US5A 4R9FA 1UIVA 2YLNA 1Y4CA 4OEUA 4ZEFA 3SEVA 1QVSA 3QXMA 3R26A 4FORA 2D21A 4NEDA 4ELQA 1VFDA 2UYFA 3FATA 4P11A 4OTEA 1QW0A 3KGCA 2Q2AA 2I0BA 1Q35A 3W9WA 3C4MA 3EQ1A 4F1VA 1P1NA 4G77A 4ZZEA 1MQGA 1JW5A 3P7IA 4R72A 3RT8A 1MQIA 2ESNA 4PFYA 4NE4A 4Q5TA 4YB5A 4ZE8A 3OO8A 4DXUA 2G93A 4KHZE 4G68A 3KN8A 2RCAA 4MF3A 4TOZA 3T9XB 1S50A 2FNCA 3IR1A 3VFJA 4ELRA 3U92A 3T9UA 2XXYA 1SW1A 4YZZA 4OEVA 1FTJA 2DE2A 2D3IA 1D9VA 4FEDA 3C35A 4KR5A 2R6GE 1TT1A 3L6GA 3D4GA 1ZLQA 1Y1ZA 5ICTA 3ILUB 3E13X 1ATGA 1H45A 3FGSA 1GVCA 1M5EA 2OBGA 4P0IA 2NXOA 4X48A 2KLFA 3PGFA 4NWCA 4BDMA 3PPRA 4RK9A 1B7HA 3VXCA 1N84A 1FQDA 2V84A 2CZLA 4NF8B 5CMBA 4R2BA 2I4BA 2QMWA 3K1NA 5F1QA 1N3WA 3MUQA 3VV5A 3S9EA 1B6HA 2P0SA 4GL0A 1A99A 2ZYMA 3S4UA 4R75A 4H0WA 4RNSA 1FQAA 4EXKA 2Z8FA 4F19A 2A5TA 1MY1A 2QL3A 2F6GA 3MAMA 2O7IA 1MDP1 4LZ8A 3SEUA 2FYIA 4TQUQ 4JWYA 3VLWA 3CSGA 2A5SA 4O3BA 4X9TA 4N13A 5I59A 3EHSA 2DWHA 4UA8A 4C1TA 2DS9A 2F97A 4HCWA 3JZJA 1A54A 1NH7A 3CR9A 2F7CA 1HSJA 2UYEA 2QS2A 5H8HA 3TTKA 3OEMA 3IO4A 3HPIA 4FJPA 4R6HA 1T0KA 4F2OA 1ELJA 1B32A 3B6WA 3G7WA 3CI8A 4OVJA 3O6IA 1IZ1A 3SETA 4KI0E 2ZYKA 3MPKA 5EHMA 1B1HA 2O1LA 4BLAA 1B9JA 1IXGA 2Q9TA 1JEUA 3TKDA 2R71A 4PP0A 1TWYA 5DYHA 4FE8A 2A5TB 3BBRA 4AQ4A 5AA4A 3TZAA 3IJXB 5I57A 3EN3A 3RNNA 2VHAA 3IOVA 4JB7A 2RC8A 3PMXA 2F35A 3KN7A 1OIBA 2DQVA 2PT2A 4F3BA 4JWXA 2UVJA 2ANJA 4I9DA 1FTKA 1S7YA 2RC7A 2XXUA 1NFTA 1N7WA 1MG1A 5TP9A 5H8HB 5CBSA 5CRYA 1FTOA 1BP5A 4Q30B 1S9TA 4DZ1A 1IEJA 1JEVA 3K6VA 4ZEIA 4TLLB 3FV1A 3FXQA 1MXYA 4H67A 1M5BA 4JSOA 2OLBA 3CIJA 3W15C 1MH4A 3L6HA 3FJGA 3JYRA 2NVUB 4KCDA 4OXVA 1AOVA 1B3EA 1I6BA 3C9HA 1PBPA 2VD2A 1N7XA 3OOAA 4FAJA 1A8FA 5I57B 4R74A 1URDA 4F2QA 4PFUA 3O28A 1MXWA 2QMXA 3H6WA 1CB6A 4H8IA 2Z8EA 5L9SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DEXB 4PGPA 4F3GA 1SW4A 4PFBA 2QRYA 1INPA 4P3LA 3T9VA 4BDOA 1KWHA 3HV1A 3IAZA 2WX9A 1LB8A 4N8GA 3BFTA 2HAVA 3LBSA 3KC0A 5AA2D 2XX7A 3FJ7A 2F36A 1M5DA 2OJTA 1RDYA 3SEYA 3KSXA 2DSFA 2HQ0A 2VPOA 3H6UA 3TYHA 3SERA 3TQLA 4BDRA 1II5A 2XXPA 1LBYA 4O3CA 1D4NA 4OZ9A 4XKNA 3T9HB 4JBZA 4X04A 1LEVA 3E78A 1JETA 3USDA 5AA2B 5KCJB 4DIGA 4PAIA 1Z7ME 4PGNA 2AYSA 1DPEA 1WVJA 1ZJLA 2P2AA 4OVSA 1JW1A 5CMCA 2GFEA 4QSEA 3PUXE 3FXBA 2QFLA 5ET8A 4U22A 1SD3A 1DSNA 1LAXA 1SDXA 4GWXA 4F3SA 4JSDA 3QK6A 3DELB 4R9GA 4FATA 2MKZA 4M4GA 3B7DA 2PMSA 1JVXA 1G0IA 3VLVA 2X26A 4IO4A 2XA5A 1FQCA 4XFEA 4KQPA 1ZBMA 1SVXB 3RY3A 4HS7A 5JEIA 3O9PA 1MY0A 2F34A 4RYAA 4U2RA 1P99A 4ZECA 2VD3A 3LSXA 1MPBA 2CZKA 4F22A 4H5FA 2I6EA 4NTLA 2I3WA 3ZSFA 1N3XA 4GOTA 4DLDA 1H76A 4DXCA 2Y7WA 5I58B 1Y3QA 1AL3A 5EYGA 3A29A 3CFXA 4POWA 1LAFE 3O66A 1H44A 5H8QA 1JVYA 2Z8DA 1MPDA 2CEYA 5ITPA 1FTLA 5LOMA 3VVEA 2GQ1A 4LZ5A 5L8DA 4MH5A 1B5JA 3KJ7A 3U93A 3K02A 3TAJA 4MJOA 4GWZA 1YTVA 3TPAA 3UP9A 2BJIA 3TELA 5BUUA 3GYYA 4G8NA 3PPPA 3MBPA 4JDFA 1ZIUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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