1NFTA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, iron loaded open form
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTVSSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Alternative structural state of transferrin. The crystallographic analysis of iron-loaded but domain-opened ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
molecule keywords PROTEIN (OVOTRANSFERRIN)
total genus 97
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nftA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nftA02
4JXIA 4YKJA 3LC8A 3LR1A 3T93B 5L8DA 1MQJA 3IOVA 3S4UA 3KN8A 4XKRA 3K6XA 1QW0A 5H8HB 2DQVA 2Y7WA 5ITOA 4MLQA 3MQ9A 5HM4B 4F1UA 4I9DA 4HS7A 3IL1B 3K0VA 2B3BA 3UN6A 1CE2A 3FXQA 2A5SA 5KZTA 4GWOA 5H8FB 2XX9A 4F19A 3IORA 3TTLA 4OESA 4RXLA 2FA7A 2Z8FA 2OWTA 3CG1A 2QS2A 2P2AA 1LAGE 4G68C 5H8HA 5ELVA 4EUOA 4ZEKA 1SVXB 5BWJA 2F97A 3FD3A 3CFZA 3C36A 4GFRA 4IO5A 5CMCA 4HTGA 4DCXA 2V3QA 4TLMB 3V5AA 4DXUA 2VD2A 2GHBA 3RY3A 3O97A 1SYHA 3O2AA 3CIJA 5L9MA 3ECRA 4EF1A 4HCYA 3O9PA 2X26A 3TTKA 2HAUA 1FW0A 3A09A 4ELOA 3S9MC 5H8FA 3GBAA 4PP0A 3SESA 4OXVA 4OYVA 2XXVA 3OO8A 4YICA 5AA4A 1MM6A 4OTEA 2HEUA 4F3SA 1OQGA 3M8UA 4DZ1A 1LFIA 1J1NA 5CMKA 4IY5A 1UIVA 4LZ8A 1MXXA 4NWDA 2IEEA 4MH5A 4YB6A 4YB7A 4UACA 2F78A 5CRYA 4LVQA 4JWXA 5AA3A 3VVEA 3FIRA 1Y3QA 4YU0A 2V3TA 4IY6A 4QFKA 3EPEA 1M5DA 4NF6B 3H6WA 1SI1A 2GFEA 4FIMA 3UA8A 4OFOA 1I6QA 1LBBA 2ALUA 1SBPA 3C32A 4EDPA 4HW8A 1D9VA 3WAEA 2O7UA 1B3GA 2X7PA 2I48A 5I2NB 1QKBA 3FXUA 2I0BA 3MBPA 4IO6A 4QFLA 2O1LA 3LSLA 2ZMBA 2O84X 3I6VA 1YTVA 2P1SA 4C1TA 4Q30B 4KCDA 1M5EA 4NWCA 5A5XB 1EU8A 1UQWA 4JSOA 3U93A 1NNFA 2GRVA 1B5JA 3RT6B 3TCFA 3Q26A 4LP2B 5CC2A 2ZNTA 3F11A 4NF6A 2HFBA 1XS5A 4NF8B 5CI5A 2RC7A 3CSGA 5JTYB 3VE1B 1JETA 2UVGA 1DPEA 5FHOA 4EXLA 3KJTA 3T66A 1NH7A 4IO7A 3RUMA 2I6EA 2OWSA 1US5A 5I2NA 1H44A 4FECA 2Y84A 5J1DA 3FATA 4C1UA 3KEIA 2QS1A 2O69A 1Y3PA 2OK2A 1OVBA 1VE4A 1UIUA 5CMBA 3QUFA 2AL4A 4P0GA 5A5XA 4DLDA 5CBSA 2DOJA 4LQ2A 5B7DA 4XXUA 2ZNSA 2ANJA 1IITA 3OO6A 1IEJA 3K01A 1FTMA 2VP1A 5K2YA 4NF8A 1N7WA 3JZJA 2DWIA 1URGA 3FJ7A 5JTYA 3TCHA 1VSOA 3PMWA 1N04A 2V84A 1QUKA 4G68B 3VLWA 4ELRA 1B52A 1SW1A 4OFJA 1B4HA 2DP8A 2F7CA 4MBPA 1YAEA 4EQBA 1Q1KA 3T9VA 3LSFB 4R2BA 2F6PA 1MH3A 4YB5A 4GXSB 4ZEFA 3SERA 3IB1A 2XXRA 4F31B 3TTMA 4WXJA 5TPAB 4DXCA 2QPQA 5DVIA 4WEPA 4DXBA 2LAOA 3UGWA 3ZS6A 3TUSA 4OQOA 3UIFA 1LB8A 1XVXA 4H0WA 3IJOB 3CFLA 1IZ1A 4H5GA 1MY3A 2PT1A 3ZSFA 2D5WA 1R1NA 3B6QA 3PPRA 1A8FA 5JEIA 1N76A 1LBCA 5F1QA 4G8NA 4U22A 3IOTA 4MLVA 4G68A 3G3KA 1GV8A 1SDXA 4FORA 4OHNA 2RC9A 3DP6A 3FXRA 3HHGA 4OMBA 5DYHA 4BDLA 2V93A 4BDQA 1LCTA 2VOZA 1D4NA 3KFMA 2ZXTA 3MZ1A 1FTLA 5TPAA 3QYTA 4IB2A 2E0SA 4U2RA 5AE4A 1QUJA 4GIZA 3MW0A 4ZEIA 2UVIA 4N13A 3JV9A 3PD9A 4ZE8A 1B3EA 3EN3A 3SEVA 3OD7A 5B70A 2ONSA 4RY1A 3RPWA 1GGGA 3MJNA 2ZNUA 1LSTA 4IO3A 1NH8A 2XX7A 4YKKA 4YZZA 3TYHA 1MY0A 1YCJA 2NWJA 1JW1A 2E1SA 4O3AA 1ZJLA 1JNFA 3H6VA 1B7UA 2HCAA 3HN0A 3KG2A 4QSCA 2AIXA 5L9OA 4ESXA 3ILUB 3M3FA 4F3PA 4AB6A 5M2VA 1MY1A 2DS9A 2G29A 4XTCQ 4QSEA 1B46A 3K1PA 3OOAA 3H6UA 2WKYA 5I56B 2UVJA 1P1WA 4LA9A 3VVDA 2HQ0A 1XT8A 3IO6A 2PX1A 1DTZA 3PGFA 3G7WA 1VFEA 3TEPA 3TZAA 4ZEDA 1TWYA 2UXAA 1Z7ME 1ZIUA 1AOVA 3C4MA 1NL5A 3KN7A 1EZPA 4KQPA 3MPLA 3MZBA 1MS7A 1B32A 3C9HA 5H8QB 3Q28A 3TODA 2DWJA 4R9FA 5DT6A 1A8EA 3G3HA 3R26A 4L17A 1FQAA 2PYYA 1H3DA 3MAMA 3UK4A 3S2VA 3CR9A 4QFOA 3MWBA 4MFIA 2UYFA 3VDFA 2ESNA 3HSTA 2D21A 5H8NA 2QMWA 5I56A 4E0XA 3PU5A 3TQWA 4Q8RA 4R72A 1ATGA 4F29A 3IOWA 1I6AA 1KWHA 3KZGA 1P1OA 3O6IA 3OO7A 2RC8A 3WAFA 3E4RA 1LFHA 1A99A 1UTBB 3L6HA 4R73A 3VXBA 4U4SA 3U1OA 2DYXA 3TKDA 1MY2A 5H8QA 1LGBC 1B5HA 4NF5B 1MQIA 1MQHA 5I57B 4QFPA 4GL0A 3EHSA 1Y20A 3FASA 4KYDA 2Y7IA 1DTGA 3KOTA 1IUDA 4GL8A 1TT1A 1TXFA 3G3JA 1LAFE 2Y7RA 4RYAA 4YMBA 3A3CA 4KI0E 1HSEA 3PUVE 1GR2A 1MPDA 1B40A 4GXAA 2ONRA 3D4CA 1BIYA 2DXYA 4EXKA 3B6TA 4PFTA 1EH3A 2XXIA 1BTJA 3R6UA 5I2KB 2PT2A 4C0RA 4X1BA 4M1VA 4X9TA 3OSRA 2AL5A 1FTKA 5I59B 1LFGA 3RLFE 1XHYA 4DDDA 1T0KA 1MM7A 5BUUA 1A54A 3CVGA 3RGYA 2R71A 4N07A 4RPOA 2Q88A 4NF5A 2PBWA 4U4XA 1B0HA 2XXTA 2F7AA 2I58A 1XVYA 2IA4A 5I57A 2RINA 5AA2D 5ICTA 1AH5A 3PV0E 3OXNA 3HPIA 4ZS9A 3MP6A 1POTA 1DMBA 1OQHA 2RCBA 4K3FA 4FATA 4GF8A 3OO9A 3SEXA 3MPKA 2Z8DA 4GOTA 1L5TA 4I62A 3KBRA 5I2KA 4LONB 4OENA 1SYIA 5I59A 1BP5A 3TQLA 5FTHA 4POXA 1B7ZA 1ELJA 2F6GA 1R9LA 4LQ5A 2G93A 4H67A 3MVZA 3PD8A 5EHSA 1D3KA 4OEUA 2O7IA 3K6UA 2RCAA 3T96B 2B3FA 2ZYMA 3MVWA 5L9SA 3G3FA 3V83A 2BJJX 2Y7KA 3DP8A 2DE3A 2HZKA 4RA1A 3TAJA 3ZKKA 2O51A 3O66A 3Q29A 1RKMA 4MF3A 3BBRA 3PPPA 4KCCA 3FVNA 3CFXA 3FV1A 4R6KA 4ECFA 2XD2A 3TFLA 3S9EA 2HAVA 5I58B 2XXQA 3VXCA 4YMAA 5TU0A 3GXAA 1NNPA 4ESWA 3T9HB 3C34A 3SEUA 2XX8A 1M5BA 4KYSA 1NNKA 2DWAA 1JQFA 2H99A 4XIGQ 2ONKE 2F8DA 4IGRA 2XXWA 3B6WA 1LAXA 4NF4B 2XXXA 3RTWB 3U94A 1DOTA 3FV2A 3QK6A 3K2DA 1MQGA 1Y4CA 1S50A 4GD5A 3SEWA 4KYEA 4O3BA 2Z8EA 1FQDA 5ITPA 4PFYA 2VD3A 4KR5A 3PUXE 3Q27A 3LUYA 1EZOA 4QFNA 1FQBA 4FEDA 5I58A 3V89B 3GBBA 4P11A 2Q2CA 2KLFA 1SI0A 2I3VA 4IO4A 1DSNA 4N6PA 3A3UA 1B51A 4U23A 4FJPA 2X7QA 2D3IA 1URDA 4IGTA 2FNCA 2I0CA 1SW4A 4EF2A 1MDP1 1B5IA 3O29A 1N3XA 3C35A 3O6HA 1OLCA 2QS3A 4R2FA 1PDAA 3IB0A 3CG3A 2XD3A 4DIGA 1MG1A 4ZZEA 1AL3A 1MXZA 3HHFA 3PMVA 5KCJB 3DP4A 2ZYKA 3PUWE 1R9QA 3V8XB 1EZ9A 3TMGA 3PUYE 1M5CA 3KN3A 3ODBA 5F7VA 1LAHE 3H03A 3UORA 2THIA 3K4UA 5H8SA 4U21A 1B6HA 1QJMA 4ELQA 3K02A 3QAXA 2ZYNA 1D9YA 1ANFA 1USYE 2F35A 4GQOA 1I69A 3C33A 3VFJA 2Y7PA 4H8JA 4H6DA 1WODA 2UVHA 3PPOA 1SQYA 4DCYA 1POY1 1P1NA 2R9JA 1PB9A 4F2OA 4I8CA 1LB9A 3DM0A 5CMMA 4Z0IA 4NEDA 1FTOA 2F34A 4E0WA 5IKBA 5KCJA 3I3VA 1USYH 2XXHA 4PFUA 2O68A 3N6UA 4OZ9A 1NMUA 2NVUB 3W15C 3T22A 4RNSA 4H5FA 2Z23A 3G3GA 2O6AA 1OMPA 1B7HA 1P1QA 5HPQA 4EQ9A 1AMFA 3OEMA 1GTKA 3FJGA 1ZBMA 4JBZA 4EQ7A 3MC2A 1S9TA 2Q2AA 2XXUA 3U92A 3SKPA 4G77A 3B7DA 1JVYA 1JW4A 2NUVA 4XKNA 2F5XA 2VHAA 3SEYA 2GH9A 3CI8A 1IQ7A 2FYIA 4ONYA 3MVXA 3G3IA 1JVXA 3O28A 5DVJA 3SETA 1OIBA 2REJA 1N3WA 1JEUA 4BLAA 1H76A 3U72A 1B2HA 1TFDA 2XXPA 4WKMA 1MPCA 4FEBA 3H06B 4RJZA 1PB8A 3K1MA 2YPNA 3VV5A 1QULA 4JB7A 4TLLB 3IK6B 3KOSA 3U8QA 1WVJA 3T9UA 1MDQA 4QHQA 4F1VA 4G4PA 1IXCA 4BDMA 3ZKLA 1RYXA 4YKPA 3KSJA 3M3KA 1Q35A 4AB5A 2NOOA 2H4IA 2Q89A 2R6GE 4H8IA 5FTIA 1P1UA 2QS4A 1M5FA 4Q0CA 3BKIB 2QRYA 1OLAA 3T9XB 3OSQA 1PEBA 2H98A 1FQFA 1NFTA 1OVTA 1S7YA 1MXVA 2H25A 2I4BA 2PVUA 4HCWA 2Q9TA 4Q5TA 3RQTA 1O7TA 4LZ7A 3DLNA 3K00A 2V3UA 5AA4B 4R74A 4XKQA 5FHNA 5DEXB 3LSXA 2HXWA 4NTLA 1IXIA 1XOCA 2OCUA 1QKAA 3RTFB 2RF1A 3O6GA 3E13X 1NKXA 2DE4A 3FVGA 3RNNA 2DXRA 5LOMA 4TOZA 4X48A 2F7BA 2GHAA 4PETA 3QIMA 5K2XA 2P0SA 3N5LA 4H65A 1PC3A 3KGCA 4QF9A 2OZZA 4Z7EA 3L6GA 3TCGA 4RK9A 4PQJA 2OJTA 3TELA 1UTBA 4OEVA 4OETA 1HSJA 1PBQA 3E9XA 3TTRA 3W9WA 1Y1ZA 1URSA 4I1DA 3K6WA 5CM6A 3IOUA 3H3GA 5DEXA 2B65A 3KJ7A 5ISUA 3FUZA 3GLBA 3I5OA 1MXUA 3Q25A 4YKIA 3K6VA 4BDOA 2DWHA 4WEDA 1GVCA 2F36A 1MY4A 1Z7NE 4F39A 2CMOA 2W7YA 3H4ZA 3N94A 4KHZE 4O3CA 1FCKA 3FVKA 3CSBA 3BFUA 4JWYA 4F18A 4PE5B 1N7XA 2VGQA 5IAIA 1A40A 1RYOA 4ZZAA 1F9BA 3OEKA 5DTBA 1Y3NA 1IXGA 3H6TA 3S9LC 4RPNA 3R7XA 3LBSA 1JEVA 4P0IA 1HSLA 1N0TA 1B3LA 1UTHB 4PFWA 4ISUA 5AA1A 4ZE9A 3IAZA 1US4A 1FQCA 2AYSA 2XXYA 3ONMA 4F1YA 3VVFA 1QUIA 3FGSA 3USDA 1MXWA 5TP9B 1N84A 1ZMGA 4R75A 2XHDA 2CZLA 2ZYOA 2ABHA 4YAHX 1P99A 1IXHA 4F3BA 4G8MA 3TDJA 4XKPA 1B3HA 1MPBA 1AIVA 4F22A 3N6TA 1R6ZA 4G8HA 3PPNA 3P7IA 3OELA 1B05A 1IIWA 4G2ZA 3K1NA 1B9JA 4ZDMA 3TTNA 4OERA 5I84A 1ZLQA 3VLUA 1B58A 1I6BA 4FE8A 1ZU0A 3BFTA 1B1HA 3MP8A 4GRKA 2M8CA 1CB6A 2QSXA 3HCQA 1UTHA 4ELPA 2A5TB 4TQUQ 1DPPA 3OENA 3KSXA 2QMXA 2Z22A 1II5A 3W9VA 3N26A 2I49A 5TP9A 4LATA 1O64A 1SD3A 2OLBA 3TPAA 3QUJA 3THIA 4OWDA 3PPQA 1PB7A 1SW2A 3QSLA 3PUZE 1H43A 1Y9UA 4QSDA 4QRZA 4BDNA 1B3FA 4JSDA 1YPNA 3FZVA 4IO2A 2I3WA 1TFAA 4R6YA 3RT8A 2YJPA 4AQ4A 3MVYA 2I4CA 3D4GA 5JK4A 1MRPA 1LLSA 1ZKBA 4X1DA 1BKAA 4JDFA 4NF4A 1BLFA 3MP1A 2OBGA 5AA2B 2DE2A 3UP9A 2A5TA 5HBCA 3EQ1A 1ZTYA 1XC1A 4ND9A 3C31A 1VFDA 3IJXB 4DE8A 2YLNA 5ICQA 1A7LA 3GZGA 5FHMA 2PMSA 4OFLA 3ILTB 4R6HA 4NMYA 3AXFA 1Y1MA 2H9BA 3MUQA 1Y4TA 2DVZA 3IO4A 1JW5A 1VR5A 3EF7A 5CBRA 3S9NC 2UYEA 1QVSA 4LZ5A 1B0LA 1NNTA 2H5YA 4U1ZA 3MZ9A 4F2QA 2Q8JA 4ZECA 1SW5A 1LCFA 1A55A 1FTJA 5KDTB 3EHUA 4BDRA 4U1OA 4NE4A 4OVJA 3E3KA 5AA2A 3OMBA 5EHMA 4R9GA 1FQEA 1MXYA 1O63A 1MH4A 3FVOA 3CRBA 3RN8A 4GLIA 2DSFA 4FAJA 4M4GA 2DVCA 4KD5A 1MQDA 4KPTA 4JWOA 3DELB 3FJMA 2NXOA 3HO7A 4KFQA 1WDNA 2RKMA 4THIA 3EHTA 2HZLA 5EYFA 3PMXA 1PBPA 4H1XA 4RK2A 3QXMA 5DVFA 1B4ZA 3LSWA 2QJEA 3VLVA 5KDTA 4GVOA 4POWA 3IB2A 2QL3A 4LUBA 3IX1A 5H8NB 2V25A 1B1XA 3JYRA 4F3GA 3IR1A 3SDFA 3M3LA 4ZEBA 3H7MA 2O1MA 3HV1A 4UA8A 1H45A 2REGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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