1NNTA

Structural evidence for a ph-sensitive di-lysine trigger in the hen ovotransferrin n-lobe: implications for transferrin iron release
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural evidence for a pH-sensitive dilysine trigger in the hen ovotransferrin N-lobe: implications for transferrin iron release.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
source organism Gallus gallus
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 97
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-09-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA02
5K2YA 2CMOA 2QPQA 2RCBA 3RPWA 2DE3A 1B3FA 1A8FA 2XHDA 3TODA 1N76A 2V25A 4WEDA 1Y20A 4IY5A 5F1QA 2I58A 4AB5A 3FV1A 3B6TA 3K0VA 1B4HA 3KN3A 5HBCA 1QW0A 2OWSA 1P99A 2Y7IA 2VD3A 1FTMA 1VFDA 3MQ9A 4GQOA 4I8CA 4F19A 1FQAA 3MVXA 3OEKA 2XXTA 1B3GA 2UVIA 3VVEA 3EHSA 3ZKLA 3FD3A 2HFBA 3N26A 1H45A 3S9EA 3TTMA 1EZPA 4K3FA 1NFTA 1YCJA 1S9TA 1OQGA 4YMAA 2VHAA 2O69A 3D4GA 2YLNA 5H8HA 1BIYA 4C1UA 1XOCA 4I62A 1LSTA 3KFMA 4ZEKA 1MM7A 1ANFA 3F11A 3TFLA 3GXAA 5I59B 3IO6A 1XS5A 2ESNA 1WVJA 3TAJA 1BTJA 4R6YA 3IAZA 3H6WA 3B7DA 4O3CA 4KYEA 1OVBA 4OWDA 3CFXA 2OJTA 4XKPA 3MW0A 4NF5A 1UTHB 5I57A 2VGQA 4G2ZA 4G68B 5H8SA 3R6UA 2F7CA 2PMSA 5L8DA 3CRBA 3SEYA 4EXKA 1LFGA 1ZJLA 2OZZA 3MVYA 4BDMA 4H67A 4GLIA 2O7UA 4DXUA 3M3FA 2H98A 1UIVA 3VDFA 4OFJA 1MQDA 3O97A 5HPQA 3K1NA 1JW5A 3U8QA 2P1SA 3T9XB 4F2QA 3TUSA 2RKMA 1Z7NE 3OMBA 4NMYA 2ONRA 2AL4A 3HN0A 1NNFA 4P0GA 3T9UA 1AMFA 4FJPA 4U22A 3HCQA 4POWA 2PYYA 4IB2A 5AA2A 1A54A 1LGBC 2ZNTA 1O63A 4R2FA 4ZEIA 1YPNA 1MDQA 4OXVA 1XHYA 5M2VA 4MLQA 3FATA 3S9MC 5CMBA 4EQ7A 3D4CA 3I5OA 4PFYA 4F3PA 4QFKA 3V89B 2UVGA 1GTKA 4JWYA 3ILTB 4JSDA 2QS3A 3SESA 4ELOA 1FQDA 3Q26A 2VOZA 3LSWA 3R26A 4KR5A 2A5TB 1NL5A 2ZYNA 3O9PA 1AL3A 4GD5A 4PETA 4ND9A 3S2VA 2G93A 2HXWA 4DE8A 3V8XB 4PFWA 3SERA 5CBRA 4GWOA 3ZS6A 2ONKE 1XC1A 2V3UA 3R7XA 1B5IA 5DEXB 4NWDA 4BDLA 4X1BA 1KWHA 5CI5A 3VE1B 3FASA 2PVUA 2QJEA 4RA1A 4F31B 5FHOA 2F7BA 4GL8A 2HAVA 4Q30B 2R71A 3E13X 3GLBA 5TPAA 2ABHA 4NEDA 3BBRA 2XXWA 4KYSA 1JQFA 1QKAA 3FVGA 3T66A 5CMKA 1MY0A 1FTKA 4FECA 1DTZA 3VXCA 1I6QA 4X48A 3HHFA 1B3EA 3FXQA 4GXSB 1B58A 5CC2A 1Y4CA 1PB9A 3C33A 3RTWB 4P11A 3JZJA 5I59A 3EHUA 4N07A 1IXIA 1MPBA 1Y1MA 3M3LA 2GFEA 3OXNA 1ZBMA 3S9LC 3K02A 3W9WA 4XTCQ 4E0XA 1JNFA 2ZNUA 3OO6A 3KOTA 1UTHA 4OFOA 4G68A 1A55A 4YB6A 4KCDA 4H0WA 3RTFB 1IQ7A 4F1UA 2P2AA 1B7HA 4TLMB 4F1YA 3C34A 4GXAA 2LAOA 1B1XA 3PPQA 2Q2AA 2O6AA 2F97A 1D4NA 2BJJX 1SQYA 3SKPA 1PBQA 3S4UA 2DS9A 1LAXA 2DWJA 2ZYKA 3M8UA 5AA3A 4DZ1A 3E4RA 1LLSA 5DVFA 4R9GA 4YU0A 3TPAA 4OTEA 1MY1A 4JWOA 4OFLA 3I6VA 2HEUA 2DE4A 1SI0A 2REGA 1ZKBA 3SEWA 4NWCA 3ODBA 4IGRA 5KCJB 3K4UA 1TT1A 3VXBA 3B6WA 3PPPA 4H8JA 2WKYA 1VR5A 4FORA 4EF2A 1PDAA 1FTJA 3UIFA 1ZTYA 3RY3A 3RLFE 1USYE 1FQCA 1DSNA 5AE4A 2HAUA 3PGFA 1N3WA 2PT2A 4I9DA 1DPPA 2UXAA 2O68A 1WODA 4GVOA 1PBPA 1URSA 1N7XA 1SW2A 2XXXA 3QSLA 4PFTA 1OMPA 3FGSA 4POXA 4LA9A 5CMMA 5EYFA 3N6UA 2NUVA 1US4A 4OETA 3DLNA 2IA4A 4BDRA 4NF4B 2V3QA 3VLWA 2DOJA 3H06B 3BFTA 2QS2A 4OENA 2I3VA 1FQBA 5DEXA 4OYVA 4MH5A 2DXYA 3C9HA 2B3BA 2P0SA 3IORA 5I2KB 2XXUA 4ZEFA 1B9JA 3IJOB 2QRYA 3MP1A 4OQOA 1ZMGA 5FTHA 4F29A 3G3KA 4IO6A 1LFHA 2AL5A 1CB6A 4R72A 3BFUA 3O66A 4F18A 4TQUQ 1OLAA 3V83A 4F3GA 1POY1 1P1OA 4LZ7A 5CM6A 2W7YA 3PPRA 5ICTA 3JYRA 4FEDA 4ZECA 1H44A 1MQHA 4OMBA 3FXRA 4ISUA 3OO8A 4N13A 5IKBA 4UACA 3VVDA 4IY6A 2V84A 2ZYMA 1OIBA 3VLVA 5J1DA 5KZTA 1QUKA 4YKJA 5LOMA 1SW5A 3OSRA 1MXUA 3VFJA 1MY2A 4KCCA 3EHTA 1B2HA 4RPOA 1GR2A 3RQTA 4RPNA 5FHMA 2ZYOA 1MQJA 3G3JA 4THIA 1EH3A 1TWYA 3I3VA 1OLCA 4XKQA 3PPNA 1GVCA 4OZ9A 3IOUA 2F5XA 4ZE8A 2H4IA 4DCXA 4GL0A 2Q8JA 3QIMA 3U72A 3KG2A 4BDNA 5TPAB 4Q5TA 4F3SA 3OELA 4YMBA 2V93A 1Y9UA 1QUJA 3L6HA 1R9LA 4ESWA 5KCJA 1Y3NA 3FUZA 1MDP1 2B3FA 1LCFA 3IB2A 2DSFA 3K6VA 3RNNA 4QHQA 3LBSA 3TEPA 1B4ZA 4YB5A 3FJ7A 2I0BA 3MVWA 3H03A 1Z7ME 2DVCA 1TFDA 3TQWA 1MPDA 4RYAA 1FW0A 5H8NA 3TELA 4H1XA 5CRYA 2E1SA 1MQGA 1R6ZA 3H6TA 4NF4A 2ALUA 1B6HA 3ECRA 3G3IA 2RF1A 1MQIA 3OO7A 3TCHA 3IL1B 2V3TA 2HZKA 4ZEBA 1UTBA 1UQWA 2DWIA 2I49A 3O28A 4KPTA 5I2KA 2DE2A 3MAMA 1TXFA 5BUUA 2O1MA 2Y7PA 2GRVA 3IJXB 1P1QA 3FV2A 3PMXA 2THIA 1QUIA 1PB7A 2FNCA 3MUQA 2DVZA 3RGYA 2Z8DA 1URGA 4F2OA 4U2RA 4YICA 3PUZE 3UGWA 3IB1A 1S7YA 3IO4A 4YAHX 3QUJA 2FYIA 1B05A 1XVYA 1B32A 1Y4TA 2Z22A 1MRPA 2XXIA 4MFIA 5DVJA 4HCYA 1NNKA 1RKMA 1CE2A 4FEBA 3MZBA 4LZ8A 2XXPA 3Q28A 4JB7A 1MH3A 4PP0A 3T9HB 4NF6B 4M4GA 1Y1ZA 1FCKA 1O7TA 4DXBA 4RK9A 5FTIA 3LSXA 4R75A 2F78A 1N0TA 2Q88A 1FQFA 4IO3A 1IIWA 3CFZA 1GV8A 2F7AA 2QSXA 5L9SA 2I3WA 1US5A 3KJ7A 4EDPA 3EF7A 1H43A 1XT8A 3O6HA 3S9NC 4RK2A 1LAFE 1ZIUA 2YPNA 4QF9A 2Q89A 3M3KA 4R73A 3H7MA 5I56B 2PT1A 1QULA 1QVSA 4ZE9A 4ZDMA 4RNSA 3LC8A 2Z8EA 1AH5A 1SW4A 2AYSA 1NKXA 1USYH 2RC7A 3UA8A 3V5AA 5KDTA 3UP9A 4GRKA 1M5CA 1SVXB 5JTYA 3ONMA 3CFLA 3QXMA 2X26A 3IX1A 3LR1A 4O3AA 5ELVA 4PQJA 1R1NA 3KN8A 1IXHA 5L9OA 2F36A 2Y84A 3QYTA 4HCWA 5JEIA 1NNPA 1AIVA 3U93A 4JXIA 5IAIA 3HO7A 3C31A 1B52A 4OHNA 2B65A 3U92A 1YTVA 3L6GA 5DVIA 1D9VA 3MP8A 3HPIA 1FTOA 4IO7A 1VE4A 1POTA 4OESA 1OQHA 3MBPA 4GOTA 3W15C 2OBGA 3SEVA 2OWTA 3KEIA 1S50A 3H6UA 1P1NA 1GGGA 1QKBA 4FE8A 3RT8A 3E3KA 4KQPA 4C0RA 1BLFA 4IGTA 1DOTA 4MBPA 4QSCA 2REJA 3CVGA 1H76A 4LATA 1VSOA 2KLFA 5CBSA 3DP8A 1IZ1A 3KJTA 4N6PA 1HSLA 5FHNA 3ZKKA 4DXCA 1M5FA 1MPCA 4OEVA 2RCAA 5B70A 2F8DA 2XXRA 4Q8RA 3CR9A 3TTLA 3K01A 4JSOA 1MXXA 2Y7RA 4C1TA 4NTLA 3PUWE 3TDJA 1NMUA 4YKKA 3CG1A 3MP6A 1D3KA 4TOZA 2NXOA 1SBPA 1JW4A 2QS4A 4LVQA 2XX9A 3A3CA 4Z7EA 4IO2A 4HTGA 4NF6A 2UYFA 3HHGA 5TP9A 2XXVA 5H8NB 4KHZE 1MH4A 2Z23A 4EUOA 4LP2B 4O3BA 1UIUA 3Q29A 1M5EA 4E0WA 3T22A 3FJGA 3IOWA 4BDQA 2R9JA 4EXLA 1XVXA 3PMVA 4F22A 3N94A 3FIRA 3UORA 2OLBA 1UTBB 4R6HA 3MWBA 3OOAA 2X7QA 1IITA 3CSBA 4XKNA 3TZAA 2O84X 5I2NB 1MM6A 4WKMA 5I56A 3KBRA 3OO9A 1R9QA 4H8IA 4AB6A 2XXYA 3PUYE 2QMWA 2QL3A 2Q2CA 1RYOA 3OENA 3PU5A 1ZLQA 2Z8FA 1MG1A 4HS7A 3TTRA 3K6XA 1ZU0A 3G3GA 1BP5A 1Y3PA 2AIXA 3UN6A 2R6GE 4OERA 1BKAA 4H65A 5A5XA 5B7DA 1QJMA 2DP8A 2FA7A 4YZZA 1L5TA 4DLDA 4G8HA 4MF3A 1I6AA 4P0IA 1I69A 5H8FB 1JVXA 1LCTA 3G7WA 2O51A 1FTLA 4R74A 3K1PA 3E9XA 1HSEA 3C4MA 4BLAA 4U4XA 3TYHA 3OD7A 5AA2D 2DYXA 3TQLA 4FIMA 4QFLA 1LB8A 4M1VA 2GH9A 1A40A 3H3GA 2NOOA 3MPLA 5EHSA 3PD8A 4NF8A 3GZGA 3TCFA 5H8QA 3EQ1A 1P1UA 4YKPA 3O2AA 5EHMA 1PC3A 5AA4A 1IEJA 1DPEA 1N7WA 4QRZA 5ITOA 1DMBA 4DCYA 3K6WA 1SYHA 2HZLA 1NH7A 1MXWA 3ILUB 4AQ4A 4X9TA 4JWXA 5KDTB 1T0KA 3KGCA 5JTYB 5DYHA 4XKRA 4ESXA 4G77A 1D9YA 3MJNA 3MPKA 1FQEA 3DP4A 4F1VA 3IB0A 3AXFA 5I58B 3OSQA 2XXQA 2QMXA 1A99A 3DELB 5TU0A 3B6QA 4G68C 3KN7A 1JW1A 4XXUA 3EN3A 4ELQA 1ATGA 4QFPA 1B0LA 5HM4B 3U1OA 3MZ1A 3TKDA 4Q0CA 4YB7A 3FVOA 5I84A 4LUBA 4YKIA 1B3HA 1EU8A 3TTNA 4ZZEA 2VP1A 1B3LA 3SEXA 2F35A 2D5WA 4F3BA 1Y3QA 3IR1A 5K2XA 2I4BA 5JK4A 1II5A 3SETA 5I2NA 3H4ZA 3O6GA 2ZXTA 3N6TA 1LFIA 3Q27A 4U4SA 3DM0A 3OEMA 2OCUA 2M8CA 2DXRA 4RXLA 2I4CA 2Y7KA 4KYDA 3Q25A 3TTKA 1DTGA 3PMWA 3C32A 1SI1A 2VD2A 1PB8A 5F7VA 1B5JA 3GBAA 4U21A 4G4PA 2D21A 3K1MA 3BKIB 3O6IA 4GFRA 1B40A 2I0CA 3RN8A 3RUMA 5H8FA 3A09A 4JBZA 3G3FA 4R9FA 3N5LA 1MXYA 3W9VA 4U1OA 2A5SA 3C36A 4NE4A 4IO5A 3KSXA 4IO4A 2PBWA 3KZGA 4QSEA 4G8MA 5TP9B 2E0SA 1H3DA 3GBBA 4UA8A 1IUDA 1LBBA 3FXUA 3QK6A 2I48A 4KFQA 4G8NA 3IOVA 2ANJA 4BDOA 1VFEA 3K6UA 4ZZAA 4WEPA 2GHBA 4RY1A 2RC9A 4FATA 2X7PA 4U23A 1ELJA 4H5FA 1I6BA 2O1LA 3FZVA 3THIA 3LUYA 1JEVA 3VV5A 3QUFA 2PX1A 4R6KA 1A7LA 1MS7A 3P7IA 4ECFA 1RYXA 4ELRA 1A8EA 2XD2A 5A5XB 3LSLA 3CSGA 1JETA 1N84A 3O29A 1B5HA 5I58A 4EF1A 3CIJA 4XIGQ 4EQ9A 3MVZA 1EZ9A 2I6EA 4PE5B 2IEEA 3USDA 1LBCA 1F9BA 2YJPA 1JVYA 1SYIA 4L17A 1AOVA 1SW1A 2RINA 1O64A 1EZOA 2F6PA 2UVJA 3VLUA 3WAEA 2ONSA 3TMGA 4EQBA 2H9BA 1B1HA 2ZNSA 3A3UA 4LQ5A 1LAGE 4NF8B 2DWHA 5H8QB 3RT6B 1WDNA 2XX8A 4LONB 3HSTA 1B51A 3HV1A 4LZ5A 2CZLA 4PFUA 2NVUB 3FVNA 5AA4B 4HW8A 3C35A 3PD9A 3PV0E 3T9VA 2QS1A 3K00A 3CI8A 4LQ2A 2UYEA 3FJMA 3PPOA 3QAXA 1MXZA 1MXVA 2F34A 3T96B 5AA1A 4RJZA 3MC2A 2OK2A 2XD3A 3VVFA 4JDFA 1M5DA 3JV9A 1B0HA 1HSJA 3KSJA 4ELPA 4KD5A 1MY3A 1SD3A 4I1DA 3DP6A 3CG3A 5DT6A 2NWJA 5H8HB 2Q9TA 4OEUA 1B7ZA 2RC8A 4H6DA 3ZSFA 3TCGA 2O7IA 4ONYA 5L9MA 3SDFA 4TLLB 1IXGA 3UK4A 5ISUA 2D3IA 2H25A 2G29A 2A5TA 1PEBA 2H5YA 5BWJA 4QFOA 4WXJA 2UVHA 4NF5B 4QFNA 5I57B 3K2DA 4OVJA 4GF8A 1OVTA 4KI0E 4R2BA 3IOTA 4QSDA 3KOSA 2HQ0A 2ZMBA 4GIZA 3SEUA 3FVKA 4ZS9A 2DWAA 2XXHA 1TFAA 3LSFB 4Z0IA 1YAEA 4F39A 5ICQA 4DDDA 3EPEA 3U94A 4U1ZA 2GHAA 1SDXA 1P1WA 4FAJA 1LB9A 1URDA 3MZ9A 3H6VA 3G3HA 1NNTA 5ITPA 1JEUA 1LAHE 3IK6B 2DQVA 1M5BA 1Q1KA 2XX7A 4H5GA 5AA2B 1B46A 1IXCA 1N3XA 1MY4A 2H99A 4MLVA 3WAFA 3T93B 1N04A 2HCAA 5CMCA 1J1NA 4DIGA 1B7UA 1Q35A 4ZEDA 2F6GA 4X1DA 3PUVE 1NH8A 2Y7WA 5DTBA 3PUXE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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