1OQHA

Crystal structure of the r124a mutant of the n-lobe human transferrin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGASAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural and functional consequences of binding site mutations in transferrin: crystal structures of the Asp63Glu and Arg124Ala mutants of the N-lobe of human transferrin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oqhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oqhA02
1NFTA 4H1XA 4LZ8A 1D9YA 1VFDA 4GQOA 4DXUA 5H8SA 3K02A 3KN3A 1GV8A 1OLCA 1N84A 2GRVA 4FAJA 3RGYA 4MLQA 5TPAA 1LFIA 5I58B 3R26A 1Y3PA 4AQ4A 4IY5A 4DIGA 4NMYA 5FHOA 2IEEA 1B5HA 1BTJA 3FV2A 1O7TA 1B52A 4GIZA 2HQ0A 4TQUQ 3KN7A 5CMMA 3G7WA 5J1DA 4I9DA 1JW4A 2F7AA 4F2QA 5H8QB 3SETA 4IO6A 1KWHA 4M4GA 3W15C 3GLBA 5H8HA 3V8XB 1VSOA 3N94A 4YKJA 4KYDA 3OXNA 5F7VA 3C32A 1LAHE 4NWDA 1XHYA 4OXVA 3TODA 2O1LA 2XX9A 2HAVA 3VV5A 5HM4B 4YAHX 4EF1A 3KOSA 4YKKA 2O69A 1MXYA 4OWDA 3RLFE 2F78A 2UVHA 3Q28A 1JW5A 5CM6A 2RC9A 5DEXB 3ZKLA 2H98A 3FGSA 1Z7ME 3MZ9A 3OSQA 3T9UA 1VR5A 2I48A 3UP9A 1LLSA 5JEIA 1J1NA 3V83A 3G3IA 3MZ1A 1ZMGA 4TLLB 3OMBA 4F3PA 4U21A 1TFDA 5TPAB 3TEPA 2B3BA 2DE4A 1PBQA 3MUQA 3U93A 4PFYA 4XKRA 5TU0A 2B3FA 2ESNA 2B65A 4KYSA 2PBWA 2Z8EA 1H43A 1AOVA 1XOCA 3AXFA 2OBGA 3B7DA 3QUFA 4HTGA 3LUYA 4LA9A 4TLMB 1DTGA 3D4CA 3DM0A 4M1VA 1Z7NE 1M5CA 3KG2A 1MS7A 1MPBA 2XXQA 3JV9A 1SW1A 2HZKA 2GHAA 3CIJA 2AYSA 3OO8A 3PUWE 1QUIA 1PB7A 2UYEA 3MPKA 5DVFA 3G3KA 4TOZA 4FEDA 4WKMA 3CFXA 2XXYA 1AIVA 4QSDA 3A09A 3Q25A 3K6XA 1YTVA 4ZZAA 5DT6A 1B7HA 2X7QA 3IO4A 4JSOA 3CFZA 1B0HA 3S9MC 1L5TA 1P1WA 2DVCA 4EQBA 4UA8A 4ZDMA 1Y3NA 4OEUA 3FZVA 5AE4A 4OQOA 4GL0A 4ZEDA 4QRZA 1MM7A 4JDFA 5CBSA 3O29A 2NOOA 2OLBA 3CVGA 4Q30B 3GBBA 4DLDA 4HW8A 4ND9A 4OTEA 3O2AA 3MP1A 2V3TA 3CR9A 1I69A 4EDPA 4DCYA 1B3LA 5LOMA 4BDRA 2O68A 1Y4TA 4ZEKA 3FJMA 4RPOA 4QFNA 4HCYA 5BWJA 2DWHA 2THIA 3KOTA 5AA2D 3TUSA 3W9VA 3IOWA 3K4UA 3BKIB 3E13X 4BDOA 3FXRA 5FTHA 1R6ZA 3TTKA 3V5AA 4MBPA 5I56A 4EF2A 1N7WA 3G3GA 3KSJA 5ISUA 4ZZEA 4PFTA 3N5LA 3SKPA 1Y1ZA 3CG3A 4R2BA 2P1SA 2DWAA 2Y7IA 1QW0A 3IK6B 1A8FA 4N07A 4R72A 1MXVA 2FNCA 2F8DA 3E3KA 4FJPA 1BLFA 3TTRA 2RC7A 2Z22A 4P11A 5KDTA 2RINA 4GOTA 1POY1 1R9LA 2OJTA 3HSTA 5CBRA 2O1MA 4IY6A 4KPTA 3IJXB 1D9VA 4NF8A 5B7DA 4PFUA 3EN3A 1UTBA 3K1MA 3QXMA 2QS4A 1MY4A 2A5TA 3PPNA 3OSRA 3BFTA 2RKMA 1BIYA 1B3EA 3U8QA 1M5DA 4R6KA 3M3FA 4XKQA 4NF5A 2ONRA 4YMAA 3PPPA 3MWBA 4ZECA 3H7MA 4F1YA 3T96B 1UTHB 1B9JA 2PVUA 1JETA 3HHFA 1QULA 3C36A 4U2RA 3QYTA 4UACA 3I3VA 5JTYB 3GBAA 1FQFA 1OVTA 4JWOA 1QJMA 4R9FA 4ZEBA 4GL8A 3H4ZA 1MY3A 4H5GA 4E0WA 3VVEA 4L17A 5I58A 3A3UA 4ONYA 4KYEA 4NF4B 4BDNA 2H99A 1LAXA 1S50A 4C0RA 1LFGA 5ITOA 3OO9A 4P0GA 3DP6A 2YPNA 4F29A 3DP8A 5ICTA 3FXQA 1IXHA 1LBBA 3PV0E 3N26A 1SD3A 2QMWA 1QKBA 3TQWA 4LQ2A 3IB2A 1P1QA 2RC8A 5KDTB 5H8QA 3T22A 4RYAA 4O3AA 3CRBA 4NF8B 3ZSFA 1GR2A 3EHUA 1PEBA 1MPDA 2ZYNA 2A5TB 3TAJA 2RCBA 1VFEA 3K1PA 3KN8A 1VE4A 1FQDA 1B4ZA 2HAUA 3MQ9A 1A54A 3S9LC 4YB5A 4OHNA 4HCWA 3IJOB 3RQTA 2DQVA 3SERA 1F9BA 1P1OA 2H25A 5FHNA 4E0XA 1OVBA 2UYFA 3ZS6A 3G3FA 3H3GA 1N04A 4PETA 4GLIA 5DEXA 3PGFA 2F5XA 5H8FB 2RF1A 1PC3A 4DXBA 3IB0A 3RNNA 3MVXA 2HFBA 4AB5A 4G68C 3I6VA 3HO7A 2QSXA 1LB8A 4YMBA 1NNKA 4F22A 1YPNA 4F3SA 1B2HA 3M3KA 4WEPA 2PYYA 5I57A 4C1UA 2V84A 1ZU0A 3KGCA 3A3CA 4IGTA 3LSXA 5DTBA 1B5JA 1MY2A 4YKPA 3MVWA 2OWSA 2VD2A 5A5XB 4G2ZA 2PT2A 1RKMA 4ELQA 2GFEA 4DXCA 3B6WA 2Q2CA 2R6GE 4QF9A 1MQJA 2I0BA 3PMWA 1EH3A 1FQBA 4I62A 1N3WA 5EHSA 4EXLA 3PMVA 3U94A 3GXAA 2PMSA 3O97A 1PDAA 3VVFA 2CMOA 3S9NC 1MM6A 1MRPA 1EZ9A 2Y84A 3LC8A 1YCJA 1R9QA 2I3VA 3L6HA 1D3KA 1ATGA 1LCTA 1N3XA 4Q5TA 3CSBA 4G68B 4GF8A 4YICA 3TTLA 3VLWA 1PBPA 4RPNA 3VLUA 4BLAA 1WVJA 1IITA 1RYXA 1B3GA 2ALUA 3OO7A 3RTFB 4H0WA 1O63A 2Y7PA 3T9VA 5HBCA 1IXGA 4XIGQ 2W7YA 3QK6A 4R74A 5I57B 1MQDA 4ELRA 5L9MA 1SYHA 4PE5B 1B6HA 1B7UA 3K6UA 2FYIA 5BUUA 2XXIA 3T66A 2XXVA 3MZBA 4U4SA 4DZ1A 4GRKA 1MG1A 2I49A 4OFOA 1ZTYA 2V93A 4LQ5A 3TYHA 2UXAA 3CG1A 4KQPA 5CRYA 4LP2B 4K3FA 1B1HA 2VD3A 5FTIA 3K0VA 4EUOA 1MDP1 1OMPA 4R75A 4RY1A 5TP9A 4F1VA 2PT1A 2XHDA 3FASA 3OD7A 3THIA 1MY1A 3EHTA 2KLFA 3KEIA 1IZ1A 1WDNA 2DXYA 4FEBA 5CMBA 1ZJLA 2VGQA 3CSGA 1XC1A 5EHMA 2XX8A 3SEUA 1MY0A 4OFLA 4QFOA 4F2OA 4JWYA 2G29A 3TMGA 3C31A 2Y7WA 5KZTA 3S4UA 3SEYA 3LR1A 4YZZA 3FJ7A 3OENA 4ESWA 4O3BA 2V3QA 3TTNA 3FIRA 3P7IA 3O6GA 3SESA 3Q27A 2DE2A 2ZNSA 4YKIA 4FE8A 4OETA 5AA4B 1DOTA 5H8NB 4F3BA 4KHZE 2HEUA 1P99A 3E9XA 5I59B 4OEVA 1TT1A 2O51A 4G4PA 1UIVA 3HCQA 1DSNA 1NKXA 2QS1A 2M8CA 2QL3A 1LGBC 1B7ZA 2I0CA 2Q9TA 3K6VA 4FECA 4Q0CA 4NE4A 2XXTA 4G8NA 2H5YA 1SVXB 3SEXA 3WAFA 3UGWA 2ZMBA 4EQ7A 5TP9B 2Z23A 3TFLA 4OYVA 1YAEA 2QJEA 2HZLA 4PFWA 1Y1MA 1UTHA 2BJJX 5ICQA 5JTYA 2FA7A 2ONSA 2I58A 4QHQA 3GZGA 2F6PA 2OWTA 4NF6B 4NF4A 4DDDA 1JEUA 4F3GA 5L9SA 4G8HA 2PX1A 2ONKE 1DTZA 3H03A 3MW0A 2XXPA 3QIMA 3C4MA 4O3CA 3K2DA 5L9OA 5I2KA 3CFLA 5ITPA 4H5FA 3KZGA 2V3UA 1Y9UA 3U92A 1US5A 5HPQA 4ECFA 3KSXA 1JQFA 1UQWA 5F1QA 3VXCA 1Y20A 5K2XA 3PUVE 3TCGA 1I6QA 1JEVA 1R1NA 4I8CA 1OIBA 1SDXA 3PU5A 4MF3A 2REJA 1M5EA 1MXZA 1URSA 4H67A 1FTLA 4G77A 5M2VA 2VHAA 3TTMA 1LFHA 2QRYA 1MXUA 2X7PA 2LAOA 4U1ZA 1A99A 2YJPA 3U72A 4OVJA 1OLAA 2F36A 5H8FA 2NUVA 5CMKA 3K6WA 4QSEA 2NVUB 1HSJA 4KCDA 3UIFA 4I1DA 4R9GA 1IXCA 4MFIA 1SW4A 3B6QA 4F18A 4QSCA 3PUXE 1IXIA 1AMFA 2NWJA 3C35A 4LVQA 2E1SA 4XXUA 4EXKA 1N0TA 3W9WA 1NNTA 1M5BA 4JBZA 4BDQA 3C34A 3MBPA 4N13A 1PB8A 2DXRA 1MQHA 2Z8FA 4RK9A 3TDJA 3N6TA 3IO6A 2XD3A 1FTMA 1B0LA 2F34A 5I2KB 5A5XA 2DE3A 2E0SA 2OK2A 3CI8A 2ZYMA 5DVIA 1S7YA 5AA3A 1URDA 1H3DA 3F11A 1AH5A 4OZ9A 1T0KA 4YU0A 5AA1A 4JB7A 3RT6B 1SI0A 3DELB 3O66A 4ZS9A 1MH4A 3KJTA 2DWJA 3PD8A 3IB1A 3IOUA 3ILTB 4ZE9A 1Y4CA 1LCFA 3KFMA 1OQGA 3FV1A 2ZYOA 1P1NA 3FJGA 5EYFA 2XD2A 3SDFA 2R71A 3FUZA 3OEKA 4R2FA 1USYH 1A40A 3MJNA 4G68A 2QMXA 1JW1A 3ODBA 1Q1KA 2QS3A 5IAIA 3EHSA 5AA2B 2P2AA 2IA4A 3K1NA 1URGA 2F7CA 1NL5A 3MP8A 1B4HA 4OESA 3C33A 1SBPA 3N6UA 5L8DA 3UN6A 5JK4A 1XVYA 1JVXA 3RPWA 1I6BA 1MQIA 1POTA 3TCHA 3DLNA 2AIXA 1SI1A 3FVKA 3BFUA 1ZIUA 2H4IA 2XX7A 3ILUB 4GD5A 4WEDA 4H6DA 4Q8RA 3KJ7A 3H06B 2Q88A 3LSWA 1TFAA 4IGRA 1H76A 3RTWB 3LBSA 3L6GA 4WXJA 1LSTA 1MH3A 4QFPA 3BBRA 1A55A 2UVGA 1HSLA 3PMXA 4ZEIA 3M3LA 1B5IA 5K2YA 4NEDA 2OCUA 1O64A 3VDFA 4U4XA 4Z7EA 4OFJA 2REGA 2F6GA 3RN8A 4H8JA 1B1XA 5CC2A 2F35A 4QFLA 3UORA 4KR5A 2Z8DA 1NNFA 1GTKA 3IL1B 4PP0A 1SW5A 4KD5A 3EPEA 5IKBA 5ELVA 2O6AA 1CB6A 3G3HA 2ZNUA 3EQ1A 3LSLA 3H6WA 2DWIA 4IO3A 1A7LA 1ZBMA 3FXUA 1IUDA 1AL3A 3G3JA 1I6AA 1DPPA 1MXXA 3TKDA 5KCJB 1D4NA 2ZXTA 1P1UA 4FORA 3TPAA 3RT8A 4BDLA 2O7IA 4QFKA 1CE2A 5AA4A 5H8NA 1RYOA 5I59A 4POXA 1DMBA 2ZNTA 3S9EA 4MH5A 1B05A 1FW0A 2D3IA 1GVCA 4F31B 2DSFA 1S9TA 2OZZA 4U22A 3EF7A 4XTCQ 1EZOA 1Y3QA 1QUJA 2XXWA 2HCAA 4PQJA 4EQ9A 2Q89A 4N6PA 3D4GA 1LBCA 4RK2A 3H6UA 4FIMA 2X26A 4R6HA 5DVJA 3K01A 3PUZE 3VFJA 2F7BA 2R9JA 2AL5A 5H8HB 2VP1A 3UA8A 3JZJA 5CI5A 3TQLA 1EU8A 1MQGA 3QAXA 1H44A 2UVIA 2D5WA 4JXIA 2F97A 3RY3A 3IORA 1N7XA 3C9HA 3IOTA 4JSDA 2DOJA 2I4CA 1FTJA 3QSLA 3HPIA 4NF6A 1B46A 3FVGA 1SW2A 4DE8A 1FQAA 4LZ5A 4GWOA 4P0IA 3RUMA 3QUJA 2QS2A 2XXXA 2A5SA 1GGGA 4KCCA 2DYXA 3MAMA 1N76A 3I5OA 3OEMA 1Q35A 1EZPA 5I2NA 4X48A 3VVDA 2G93A 3HHGA 2XXUA 5I84A 3O28A 1M5FA 1ZLQA 3ECRA 1IEJA 3IX1A 4X1BA 2Y7KA 2DVZA 3MP6A 2YLNA 4MLVA 2UVJA 3USDA 1FQEA 2V25A 1TXFA 1ZKBA 4G8MA 3DP4A 2ZYKA 3UK4A 3H6VA 1MDQA 4BDMA 1FTKA 2GH9A 2NXOA 1ELJA 4R73A 4YB7A 3ONMA 1TWYA 4F1UA 4H65A 3HV1A 1H45A 1HSEA 2VOZA 2ABHA 4LONB 1LAGE 3JYRA 4KFQA 1PB9A 3KBRA 4RJZA 4POWA 3TELA 4HS7A 3VLVA 2H9BA 3SEWA 3OOAA 1NNPA 2GHBA 4Z0IA 1IIWA 2XXRA 3PPQA 1SQYA 4U23A 3S2VA 2O84X 2ANJA 3PPOA 5B70A 4RNSA 1II5A 3PUYE 1BP5A 4IO5A 1QKAA 4ISUA 2I3WA 2I4BA 4U1OA 2O7UA 4DCXA 5I2NB 1LB9A 4F39A 1QUKA 1ANFA 3T9HB 1B40A 3MVZA 2WKYA 1USYE 3FVOA 4FATA 3O6IA 1FCKA 4GVOA 3PD9A 3VE1B 1B3HA 1OQHA 3PPRA 3Q26A 4XKNA 1BKAA 1XS5A 1MPCA 4OENA 3IR1A 2DP8A 4YB6A 3U1OA 4KI0E 3R6UA 2I6EA 4IO7A 4XKPA 4IO4A 4RA1A 1B3FA 4JWXA 4R6YA 3E4RA 3ZKKA 1DPEA 1B51A 3M8UA 1FQCA 2QPQA 4GXAA 2RCAA 4ZE8A 2Q2AA 3OO6A 3O6HA 2CZLA 3TCFA 3MVYA 1LAFE 1WODA 1XT8A 5AA2A 3IAZA 3B6TA 1A8EA 2Y7RA 1SYIA 4OMBA 1QVSA 4OERA 2P0SA 1MXWA 4C1TA 4ELPA 1FTOA 1UIUA 3VXBA 4LATA 4NWCA 5I56B 4IO2A 4GFRA 4ESXA 1JVYA 3FD3A 3TZAA 3H6TA 3MC2A 3SEVA 4THIA 3MPLA 2AL4A 4LZ7A 4GXSB 5FHMA 5DYHA 3HN0A 3OELA 4AB6A 4IB2A 3Q29A 3WAEA 4ZEFA 3IOVA 4NTLA 5CMCA 1US4A 4LUBA 3FATA 1NMUA 3R7XA 3T9XB 3FVNA 1UTBB 1NH8A 3T93B 2XXHA 4F19A 1B32A 2Q8JA 3O9PA 3V89B 1B58A 2DS9A 3LSFB 1IQ7A 2D21A 4RXLA 4X1DA 4X9TA 4ELOA 3K00A 4NF5B 1JNFA 1NH7A 4H8IA 2HXWA 1XVXA 5KCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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