1OVTA

Refined crystallographic structure of hen ovotransferrin at 2.4 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
682
structure length
682
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of diferric hen ovotransferrin at 2.4 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 203
structure length 682
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA03
1A99A 4U21A 3MZBA 3UA8A 1SW2A 3OO9A 1NKXA 2I0CA 3QXMA 2Z8EA 2F36A 4ONYA 4U1OA 4PE5B 4G77A 4XTCQ 3CFZA 5FHOA 4F18A 1LBCA 3RLFE 1LAGE 3LSFB 3FIRA 3IJOB 4R9FA 1JW4A 2G93A 2CMOA 1B4HA 4KYDA 1N84A 3KSXA 2R71A 5FTHA 1HSEA 4MH5A 5ITOA 4DLDA 3ZS6A 2DP8A 2XXTA 1RYXA 4ISUA 2PVUA 1N3WA 1SYIA 1P99A 3SESA 3G3GA 4EQBA 3KN7A 3H03A 4POWA 1R6ZA 2UYFA 3PPOA 3PUXE 4HS7A 5ICTA 3MQ9A 1AOVA 3FXRA 5I84A 1URGA 1M5FA 4R6KA 4LZ7A 4YKKA 2THIA 3K6VA 1JQFA 1Z7ME 1NNKA 1B51A 4LZ8A 3G3JA 5JEIA 4RK9A 2P2AA 3P7IA 2AYSA 2I58A 1TT1A 2UVGA 2Y7WA 3SDFA 3MP6A 4ND9A 3R26A 4ELPA 2DVCA 1FQDA 4P0GA 1ZU0A 1JNFA 3SEUA 1MY2A 1MXUA 1MQIA 3T9XB 1H3DA 1ZBMA 3HV1A 4YMAA 2ONSA 2F34A 2FA7A 2NWJA 3QUJA 2YJPA 2V3TA 4XKQA 1A8EA 3JV9A 1IITA 3UORA 2VHAA 1OLAA 5DVJA 3KN3A 2E0SA 4NF8A 1F9BA 3E13X 3K00A 3FVNA 2D5WA 3UN6A 4BDNA 3SERA 3Q28A 1MM6A 2F7BA 3CI8A 2RCAA 1BLFA 3GBBA 1ZTYA 4HCWA 5KDTB 1I6BA 3C4MA 2NOOA 2Z22A 4I1DA 1JVYA 3TCFA 1MQHA 4Q30B 3DP6A 2XXPA 1TXFA 4EUOA 4U4SA 3FVGA 3M8UA 1AH5A 3PMVA 4AB6A 5KDTA 1MXWA 4ZS9A 1MXXA 4R75A 2V25A 4Z7EA 1XVYA 1LSTA 1MH3A 5I56B 3U93A 3A3CA 3RUMA 2OJTA 5FTIA 4LVQA 1Y9UA 4ZEKA 4RYAA 1EZ9A 4F3PA 3DM0A 3H3GA 1B3EA 1MY1A 3PUVE 3S2VA 2UVIA 4ZEDA 3O29A 3RTWB 2PT1A 5I56A 2Z8FA 3IK6B 1TFAA 3LUYA 3IX1A 1NNPA 4XIGQ 2REGA 4FIMA 1B3FA 3PUWE 3IOTA 1H45A 1URDA 4QFPA 3FXUA 3HN0A 1BIYA 5KCJB 2G29A 2RC9A 3LR1A 4MFIA 3KN8A 5AA2D 4NMYA 3H6WA 4DCXA 4OERA 1USYH 1S50A 1KWHA 2NUVA 4O3CA 4WEPA 4DE8A 4RXLA 1DPPA 4YU0A 1Y4CA 1EZOA 3AXFA 2V84A 5B7DA 5KCJA 2XHDA 2QS2A 2GHAA 3N6TA 4IO3A 1VR5A 1M5EA 2QS4A 3CSBA 4P11A 4IGTA 4JB7A 5FHNA 5CMMA 4YKJA 3EHSA 3RT6B 2OBGA 1A40A 3MVWA 4G2ZA 4GVOA 3TMGA 4BDQA 3S9MC 3K1MA 1FW0A 2XXRA 3OEKA 2Q89A 3T9VA 5H8FB 1QULA 2XXVA 1MPBA 3PV0E 4DXCA 1LBBA 2QRYA 4F2QA 4QFLA 4LP2B 5L9OA 3EPEA 1DOTA 3OSQA 2PYYA 3VV5A 5H8FA 3W9VA 2P0SA 3C32A 5H8SA 4KPTA 1PDAA 3QSLA 4I8CA 1O64A 1IUDA 2QS1A 2FYIA 1PC3A 4KHZE 1NNFA 3A09A 2YLNA 4OWDA 3W9WA 1UTHB 3FXQA 3M3FA 1DTGA 1B1XA 3LSXA 3OSRA 4ZZAA 1SVXB 1B7UA 3KSJA 5DTBA 2F5XA 2Q2AA 4KCCA 5I58B 1S9TA 1UTHA 1D9YA 1P1NA 4NWCA 3K6WA 4C0RA 2QJEA 4C1TA 3FGSA 3T9UA 4OEUA 5H8NB 3MZ9A 4H8IA 2ZYOA 3UIFA 1I69A 3DP4A 1B9JA 3UP9A 1LB8A 2BJJX 2HAVA 3ZKKA 1IQ7A 5AA4B 1YPNA 4QSCA 1JW5A 1MH4A 4ZE8A 4GL8A 2D3IA 2I3VA 3Q26A 2ZYKA 4GWOA 5H8QB 4ZEIA 1BKAA 5H8HB 3FVKA 1A7LA 3U92A 2V93A 5AA4A 3SEXA 1NMUA 4MLVA 2ZNTA 3I6VA 3BBRA 5H8QA 3T93B 2XXYA 2VD2A 2Z8DA 5H8HA 4KD5A 3VFJA 2ZYNA 4R6YA 2AL5A 3O66A 3L6HA 4G8HA 3M3KA 2RC8A 4LONB 2O84X 2Q88A 3E9XA 2RF1A 3EF7A 4YB6A 1XT8A 2Y84A 4MF3A 1CB6A 1ZMGA 4OHNA 3MVZA 1N04A 3SEYA 1N76A 1PBQA 5TU0A 4L17A 4ELRA 2F97A 3TTKA 4IO4A 3MC2A 2ALUA 1P1WA 2X26A 5IAIA 3ODBA 1SW1A 1XS5A 4U4XA 2Y7IA 4M1VA 4PFYA 1NL5A 4OFJA 2RC7A 1UQWA 2H5YA 1ZLQA 4F1UA 1QUIA 4FE8A 4FORA 1P1OA 4G68C 2XX9A 1A55A 1XOCA 3ILUB 2GHBA 1XC1A 1ZKBA 3TKDA 1XHYA 1IXCA 3O2AA 1I6AA 3EHTA 4NTLA 3GZGA 4O3AA 3CIJA 1Y3PA 1SQYA 1LAHE 4DCYA 2HEUA 2I48A 5ITPA 1GVCA 5CMBA 1DTZA 4IY6A 4FEBA 4FATA 1SI0A 1LGBC 2V3UA 3KEIA 4GLIA 1Y20A 5HPQA 3A3UA 1FQAA 3C35A 4IO5A 2ZYMA 1H76A 3FZVA 1WDNA 4OXVA 4LQ2A 4TOZA 2CZLA 3S4UA 3M3LA 4XKPA 3KJTA 3HHFA 3LC8A 5K2YA 4HTGA 2O7UA 4G4PA 4U22A 2DE4A 4OMBA 4JDFA 3FV2A 5B70A 3L6GA 4BDOA 3IJXB 4NF5B 1USYE 1P1QA 2HZKA 1N0TA 1TWYA 2ONKE 3G7WA 4EF1A 3MBPA 5I57B 4IGRA 2VOZA 3TCHA 3U72A 4NE4A 4I9DA 1OQGA 3TTLA 1EU8A 4NF5A 2UYEA 3OO8A 4NF8B 3GBAA 3FD3A 5I57A 4QRZA 3OEMA 3TDJA 3MJNA 3GXAA 1UIVA 4MBPA 3O6HA 2HXWA 4BDRA 4NEDA 1AMFA 1WVJA 3FASA 1MY3A 2VP1A 1B3HA 1MY4A 3C31A 2DYXA 2F6PA 3KOSA 3LSWA 3RPWA 1PBPA 4F39A 3PPRA 2B65A 3O9PA 4LZ5A 2ABHA 2H98A 3S9NC 3RT8A 4R72A 1Y1ZA 3K4UA 4G68B 3QK6A 5DVIA 3D4GA 5ELVA 1BTJA 2XXXA 4YKPA 2O69A 2ZNSA 2ZNUA 3BFTA 3K2DA 3Q27A 1GV8A 1PEBA 1B5HA 3KFMA 4ZEBA 1NNTA 2HFBA 3HPIA 4F29A 3H4ZA 4X48A 3IB0A 2ZMBA 4G68A 1OIBA 2DQVA 1IZ1A 1AIVA 1B2HA 3MVXA 4YB5A 4OZ9A 3FV1A 4F2OA 3FVOA 2H9BA 4YICA 3G3HA 4E0WA 4OETA 2V3QA 1D9VA 1MQGA 4Q5TA 3V8XB 5EHSA 3ZKLA 4RPNA 1HSJA 1OVTA 2RKMA 4QFKA 1QJMA 3S9LC 4OQOA 3EQ1A 1JVXA 4GOTA 2FNCA 3OENA 3HCQA 2OWTA 4THIA 3MVYA 3R7XA 1MDQA 3TTRA 2LAOA 3VDFA 1A8FA 5BUUA 3PD9A 2DXRA 3H7MA 2DWHA 4PFUA 1ZJLA 2IEEA 3SETA 5HBCA 1MDP1 3IB1A 1OMPA 1JETA 4OENA 3OO7A 4BDMA 2VGQA 5FHMA 3HHGA 2Q9TA 4HCYA 3BKIB 4FJPA 4WEDA 2DSFA 1XVXA 4RJZA 3T9HB 5DT6A 3O97A 1B1HA 1O63A 4BLAA 5I59B 3VXBA 3PMWA 4PFWA 4YKIA 1VSOA 2R9JA 3D4CA 5L9SA 4DZ1A 1M5DA 4OFOA 2GFEA 4O3BA 5CM6A 4X9TA 3SEWA 4OESA 1FCKA 3CG3A 5I59A 4N07A 2PMSA 4OTEA 3TEPA 3I3VA 5CC2A 1JW1A 1MS7A 5CBSA 3DLNA 1B58A 3CSGA 4GFRA 1SW5A 1GGGA 2AIXA 1I6QA 4N6PA 3RN8A 4KCDA 2QS3A 3E4RA 3B6TA 1NH8A 4IO6A 1R9LA 5TPAB 3CG1A 3MUQA 2I49A 4EDPA 5ICQA 3IAZA 3U1OA 2DE2A 1J1NA 2X7QA 1JEVA 1JEUA 3I5OA 5TPAA 4YAHX 4E0XA 1MQDA 3F11A 1DMBA 2O7IA 1LLSA 1B7HA 3ONMA 2I4BA 4WKMA 3PPQA 3OXNA 4X1BA 3VLVA 4MLQA 2AL4A 4IO2A 4N13A 5DVFA 5A5XB 4RPOA 1Y4TA 3H6VA 4KI0E 4DXUA 2UVJA 2F78A 4FAJA 2OWSA 3TYHA 5A5XA 1FTMA 4YZZA 3TAJA 3TQWA 3U94A 2P1SA 4G8NA 3K1NA 4HW8A 2O6AA 4RNSA 3LBSA 3IOWA 1Q35A 2Y7RA 1FQCA 3GLBA 2DWIA 1FTOA 2UVHA 5EYFA 4DXBA 4OYVA 4DIGA 2GH9A 3E3KA 4FECA 3PPPA 1ANFA 3Q25A 3VVEA 1IXHA 3G3KA 3THIA 4POXA 3IL1B 4GRKA 4F3SA 4KYEA 2Y7PA 1YAEA 4ZZEA 2M8CA 1O7TA 3H6UA 2ZXTA 1IIWA 3BFUA 3CRBA 2Y7KA 3B6QA 3MWBA 2XD2A 5KZTA 4IO7A 1S7YA 1M5CA 2XXHA 4ZDMA 3HO7A 1NFTA 4GD5A 4I62A 4QHQA 2IA4A 1HSLA 4ZEFA 2OCUA 2XXIA 3KG2A 4JSOA 1SYHA 3R6UA 1SD3A 4H65A 3T66A 1FQFA 2O51A 1UIUA 3U8QA 3VLWA 1RYOA 2ONRA 1QUKA 4QFOA 3MP1A 3ZSFA 3W15C 3T22A 3O28A 3IO4A 1LCTA 4ELOA 2VD3A 1Z7NE 2E1SA 1POY1 5CMKA 3OELA 1POTA 3USDA 3VVDA 4XXUA 5AA3A 1QVSA 4R6HA 1URSA 3N5LA 5F1QA 3UK4A 2I6EA 4RK2A 4KYSA 4KR5A 1QKAA 2A5TB 1LCFA 2OZZA 4IY5A 1WODA 2A5SA 4PFTA 3RNNA 3VLUA 2PX1A 4TLMB 3VE1B 2RINA 3B7DA 5DEXB 2A5TA 3OD7A 2UXAA 5CRYA 3C34A 5ISUA 1MY0A 3KBRA 3CFXA 2O1MA 1MPDA 2XXUA 5EHMA 5DEXA 4GL0A 1ZIUA 2Q2CA 5F7VA 4Q0CA 2O68A 3PGFA 4GQOA 4F1YA 1QW0A 3VVFA 3G3IA 3TTNA 1B40A 4PP0A 4H5FA 3OOAA 4KQPA 1FQBA 4ESXA 4EQ9A 5I2NB 3H06B 4ZE9A 1SDXA 1Y3NA 1US5A 4AQ4A 4NWDA 2F7AA 1MQJA 4JBZA 2I4CA 5I2NA 4ECFA 2DVZA 3TPAA 3PD8A 1ATGA 3FJ7A 3WAFA 1MPCA 3G3FA 2D21A 4FEDA 2O1LA 4EF2A 1PB7A 3TZAA 5BWJA 4OFLA 2F7CA 2DOJA 4JWOA 2W7YA 4YB7A 4X1DA 5JTYB 1P1UA 1MG1A 4K3FA 4Z0IA 4F3GA 3DP8A 1DPEA 2B3BA 4H0WA 3MAMA 3K6UA 4C1UA 4R73A 4EXKA 2H4IA 1Y1MA 1MXVA 4RY1A 5JTYA 3TCGA 1MXYA 2DS9A 3SEVA 1FTLA 2XX7A 4QF9A 1N7XA 3N94A 4PQJA 5LOMA 4F22A 1B32A 2HAUA 5AA1A 1B3LA 4U23A 4H5GA 3HSTA 3ECRA 3C36A 1R1NA 1B5JA 3QIMA 3TFLA 2XX8A 1EZPA 3C9HA 2QPQA 1TFDA 1T0KA 3KZGA 3TQLA 3QUFA 4PETA 4ZECA 2X7PA 4NF4B 2F8DA 4ESWA 1AL3A 1MXZA 3KGCA 2RCBA 3MPLA 3PMXA 3ILTB 2B3FA 1B52A 1BP5A 3B6WA 4F1VA 1Y3QA 1OVBA 4NF4A 3CR9A 2ESNA 3O6GA 5JK4A 4QSDA 4H67A 1IXIA 2F35A 3RY3A 3JYRA 4JXIA 3LSLA 1B46A 4IB2A 4TQUQ 1GR2A 4ELQA 1B05A 1L5TA 1VFEA 5J1DA 1MRPA 3FATA 5DYHA 2QSXA 2NVUB 3EHUA 3PUZE 2XXQA 2Q8JA 3K6XA 3TELA 3IOVA 2Z23A 4JWYA 4AB5A 5TP9B 2REJA 1B3GA 3MW0A 5AE4A 4UA8A 1PB9A 1PB8A 1QKBA 3DELB 3VXCA 4F3BA 1FTKA 5HM4B 3UGWA 1DSNA 4G8MA 2F6GA 1B0HA 1B5IA 5TP9A 2ANJA 3RGYA 4LA9A 2DWJA 3CFLA 3K0VA 1B7ZA 4GF8A 3TODA 1SBPA 4EXLA 1R9QA 4M4GA 3FUZA 1A54A 4UACA 5IKBA 5L8DA 2HCAA 3H6TA 4JSDA 3CVGA 1SI1A 1LAXA 1GTKA 3OO6A 2PT2A 2DXYA 3MP8A 3KOTA 3QYTA 4R9GA 4JWXA 2WKYA 2GRVA 1RKMA 3PUYE 3FJMA 1SW4A 4H6DA 2KLFA 1H44A 2HZLA 2QL3A 1CE2A 1US4A 5L9MA 1LFHA 1LB9A 3JZJA 4YMBA 3MZ1A 1FQEA 1VE4A 2YPNA 1LAFE 1N7WA 3K01A 2R6GE 4U2RA 3OMBA 1B0LA 3FJGA 4F19A 3K02A 3QAXA 3PU5A 3T96B 2DWAA 1UTBB 1YCJA 2QMXA 5I58A 4RA1A 3IOUA 4QFNA 1NH7A 4OEVA 2QMWA 2OK2A 3Q29A 3S9EA 5AA2B 2H25A 5K2XA 3TUSA 4BDLA 4R2FA 1N3XA 3V83A 1D3KA 1UTBA 3N26A 3PPNA 4OVJA 3SKPA 1IXGA 1EH3A 4H1XA 2PBWA 3IR1A 4R74A 5H8NA 1II5A 1IEJA 3EN3A 4TLLB 2XD3A 1Q1KA 1LFGA 5AA2A 2DE3A 4QSEA 1ELJA 2HQ0A 4WXJA 2I3WA 2OLBA 3RTFB 3N6UA 4DDDA 4XKNA 1OLCA 1H43A 3IORA 4GXSB 2I0BA 2XXWA 3IO6A 4U1ZA 1D4NA 5CI5A 4F31B 3IB2A 3KJ7A 3V89B 5CMCA 3WAEA 3C33A 4EQ7A 4P0IA 4GXAA 2NXOA 4NF6B 3RQTA 1MM7A 1LFIA 4GIZA 1FTJA 3O6IA 4LATA 1YTVA 1M5BA 4R2BA 4Q8RA 5I2KB 2H99A 4LQ5A 1B6HA 4XKRA 4NF6A 3K1PA 1OQHA 3TTMA 4H8JA 3MPKA 5M2VA 1B4ZA 4KFQA 4LUBA 5CBRA 1VFDA 5I2KA 1QUJA 3V5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N81A 1A99A 1IMBA 4U21A 3MZBA 3UA8A 1SW2A 4P1EA 3OO9A 1NKXA 2I0CA 3QXMA 2Z8EA 2F36A 2HPGA 4ONYA 4U1OA 4PE5B 4G77A 4XTCQ 3CFZA 5FHOA 4F18A 1LBCA 3RLFE 1LAGE 3LSFB 3FIRA 3IJOB 4R9FA 1JW4A 2G93A 2CMOA 4GWSA 1B4HA 4KYDA 1N84A 3KSXA 2R71A 5FTHA 1HSEA 4MH5A 5ITOA 4DLDA 3ZS6A 2DP8A 2XXTA 5IGAA 1RYXA 4ISUA 2PVUA 1N3WA 4PAKA 1SYIA 1DBZA 1P99A 3SESA 3G3GA 4EQBA 4GX6A 3KN7A 3H03A 4POWA 1FBGA 2DDKA 1R6ZA 4GWYA 2UYFA 3PPOA 3PUXE 4HS7A 5ICTA 3MQ9A 1AOVA 3FXRA 5I84A 1K9ZA 1URGA 1M5FA 4R6KA 4LZ7A 4GBWA 4YKKA 4N6DA 2THIA 4PC9A 3K6VA 3U65A 2WBBA 1JQFA 1Z7ME 1NNKA 1B51A 4LZ8A 4NQ8A 3G3JA 5JEIA 4GWWA 1FJ9A 2P3NA 2Q74A 4RK9A 2P2AA 3P7IA 2AYSA 2I58A 1TT1A 2UVGA 2Y7WA 3SDFA 3MP6A 2ZZWA 4ND9A 3R26A 4ELPA 2DVCA 1FQDA 4P0GA 1ZU0A 1JNFA 4MJOA 3SEUA 1MY2A 1MXUA 1MQIA 3T9XB 1H3DA 1ZBMA 3HV1A 4YMAA 2ONSA 1NUWA 5A5LA 2F34A 2FA7A 2NWJA 3QUJA 2R8TA 2YJPA 2V3TA 4XKQA 1A8EA 3JV9A 1IITA 3UORA 2VHAA 1OLAA 5DVJA 3KN3A 2E0SA 4NF8A 1F9BA 3E13X 3K00A 3FVNA 2D5WA 3UN6A 4BDNA 3SERA 3Q28A 1MM6A 2F7BA 3CI8A 2RCAA 1BLFA 3GBBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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