1P1NA

Glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with kainate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA01
4ISUA 4X1DA 3MWBA 3G3HA 1MY2A 4G8MA 3HHGA 3M3LA 3T9VA 4QFOA 3W15C 3PMVA 2REGA 4QSEA 1B4ZA 3V8XB 3H06B 2F6PA 4ZEIA 3QK6A 3SETA 4XKRA 1D3KA 3RUMA 2H4IA 3F11A 4FAJA 3Q26A 2QSXA 1MPBA 3MZBA 3G3GA 1Y3PA 3C31A 4GRKA 2X26A 3UIFA 4FORA 3H6VA 3PPRA 1LAFE 3VE1B 1NNKA 3QSLA 4NF5A 3S2VA 3PPPA 5DEXA 3KJTA 1ZMGA 2O69A 1QW0A 2XX8A 5AA4B 2ZNUA 3FVGA 2P0SA 3O97A 3ONMA 2D3IA 2NWJA 1Y20A 2PT1A 3OOAA 3PUYE 3PU5A 4AB6A 3IOVA 3PMWA 3A3UA 2I3WA 2F34A 4M4GA 4F2QA 5K2XA 4LA9A 1MPCA 3D4GA 4XXUA 3T9XB 1A8EA 2A5TB 1PB9A 4NMYA 3DM0A 4H5FA 5CMCA 3FZVA 5CM6A 2AIXA 4OQOA 4LQ2A 4U1ZA 3KG2A 1B5JA 4PFTA 5FHNA 3Q29A 3FD3A 3G3FA 4I62A 1OMPA 3HPIA 1PC3A 4QHQA 2F7AA 1NH7A 1ANFA 1P1UA 3CFXA 3M8UA 1QKBA 2REJA 5DVJA 4JSDA 4IY6A 4IO6A 4ZZAA 2HEUA 1ZKBA 4X9TA 4F22A 2UYEA 3IOWA 3TFLA 2ZYKA 3ZKLA 4EQ7A 1B5IA 4R9FA 4U23A 4F18A 3FUZA 3H6TA 1H45A 1LCTA 3IOTA 1B1HA 4KPTA 4F1YA 2XHDA 4R74A 5IKBA 4F3PA 2QPQA 5AA2D 3QXMA 5FHMA 4U21A 2DE4A 1H43A 3H4ZA 3TZAA 4DZ1A 2UYFA 3C32A 4MFIA 2H99A 2BJJX 1J1NA 1B3LA 4WEPA 3IB2A 5I2KA 3T9UA 3CFZA 5HBCA 2QMXA 1SW5A 1XHYA 3V5AA 4EDPA 3S9LC 4KHZE 1JW4A 4U2RA 3O28A 4PFYA 2ONSA 1ELJA 2RC9A 1MH4A 3RNNA 2Z23A 4OFLA 3K6UA 1RYXA 3HO7A 2FNCA 3K6XA 3LUYA 1MPDA 3E9XA 4IGRA 3OSQA 2YLNA 3IJXB 4H67A 2VD3A 3U8QA 3OELA 2D5WA 1B05A 4GL0A 4KCCA 1TT1A 2XXTA 3BFTA 2OJTA 3RPWA 1EZPA 3DP8A 1Y4CA 4GVOA 4QFNA 3MP8A 3FASA 3MVWA 3EHUA 5KCJA 4N6PA 4K3FA 2HAUA 2H98A 3DP6A 4LONB 3S4UA 4GD5A 3TPAA 1OIBA 1HSEA 5H8FB 1LFHA 1EZ9A 1WODA 3T93B 5ELVA 3VXCA 4ESXA 2HXWA 1MDP1 1O64A 1OVBA 2G93A 3RTWB 1MY4A 4JBZA 3MVXA 2F7BA 3ILTB 4EQBA 3DLNA 1B1XA 2I58A 5H8SA 4BLAA 2O84X 1SD3A 4YKPA 4H0WA 4KI0E 4PFWA 4QFPA 1SQYA 1N3WA 1ZBMA 4KR5A 4NWDA 5I59A 4LATA 5JTYA 1HSJA 1M5CA 1LGBC 1UIVA 2VP1A 3M3KA 4IO3A 3DELB 1B0LA 1MM7A 1TFAA 4GQOA 2Q2CA 1UTHB 4JDFA 3KN8A 3LSXA 4F3SA 2Y7IA 3GBAA 3JZJA 1XS5A 3C35A 3FATA 4PETA 1MY0A 5H8QB 2Y7WA 1UTBA 4R2FA 3GBBA 1B3FA 2H25A 4XKPA 5H8NB 4ECFA 4G8HA 5I57A 2XXQA 3MAMA 4DCXA 3OSRA 5HM4B 3M3FA 4WXJA 4OZ9A 3C33A 4BDNA 2PT2A 3FV1A 4BDOA 2I48A 3SDFA 1JQFA 1MXUA 1YPNA 1EU8A 2H9BA 4NF8B 4RYAA 4BDMA 1LSTA 2OCUA 3H3GA 1IEJA 3EQ1A 2DWHA 1QUJA 3S9EA 4HTGA 1IIWA 3OO8A 2QS4A 5DT6A 1PEBA 1MY3A 1BKAA 4KQPA 2Q9TA 2Q88A 3L6GA 2OK2A 1SYHA 5CI5A 1R6ZA 1M5DA 2Y7PA 2ALUA 3K1PA 3CI8A 1VR5A 5FHOA 4GXSB 2DXRA 1MXYA 3FVOA 1B58A 3C34A 1DTZA 3G3JA 1Z7ME 3V83A 4OMBA 1JVXA 3D4CA 3E4RA 4TLLB 1XVXA 4E0XA 1A55A 4TLMB 1URSA 1A99A 3HSTA 1P1QA 3TYHA 1I6BA 4AB5A 5AE4A 1R9QA 4U1OA 1HSLA 3K2DA 1US4A 3UK4A 4G2ZA 1R1NA 1Y1ZA 4R6HA 1JETA 4POXA 3IB0A 1JW1A 1O63A 3MQ9A 5TP9A 5BUUA 1D9YA 1NL5A 2O1MA 2ESNA 4HW8A 4EXLA 1F9BA 1JEUA 5AA1A 3K4UA 4LZ7A 2WKYA 2V3QA 3C4MA 4F29A 5B70A 2XXRA 4H6DA 1LB8A 1ZJLA 3V89B 3I6VA 5H8HB 2O7UA 2F5XA 3E3KA 3CG3A 2E0SA 2IEEA 1NNPA 4G8NA 1MH3A 1IXCA 1ZLQA 4I8CA 5A5XB 1YCJA 4YKIA 1GV8A 2LAOA 4EXKA 3AXFA 3HN0A 2X7PA 3OXNA 2Y84A 1IXGA 1BP5A 3MVZA 3W9WA 1NNTA 2GH9A 1AL3A 2I0CA 3QUFA 4O3AA 1IUDA 4ZEBA 1P1OA 1B0HA 3HCQA 4JB7A 1SVXB 1DTGA 1DPEA 3B6QA 2R6GE 1B7HA 2B3BA 1DPPA 3KSJA 5CBRA 4IB2A 3KN3A 3CVGA 5EHSA 4JSOA 3TTMA 3S9NC 2RCAA 1DOTA 4LVQA 4G68B 4POWA 2XXUA 3TTLA 4U22A 4I1DA 5AA2B 4KFQA 2DXYA 3U93A 1MXWA 4Q30B 4UACA 3MW0A 2DWIA 3ODBA 2V3UA 2F78A 5CRYA 5I2NB 1T0KA 2I4CA 4IO7A 2O68A 3CRBA 1N0TA 3TTKA 1B4HA 1RYOA 5H8FA 4QFLA 3FVKA 4JWYA 3EHTA 3IO4A 3OEMA 2ZMBA 2THIA 4LZ8A 1QJMA 3EF7A 3RN8A 4WEDA 4YICA 3CFLA 1GTKA 1WVJA 4NF4B 3BFUA 4X48A 1M5BA 3SEUA 3IR1A 3JYRA 3PV0E 4RA1A 3LSFB 1GVCA 2QRYA 3T22A 4H8JA 1H76A 1ZIUA 2OLBA 4MBPA 4ZE8A 4P0GA 5L8DA 5I56B 3CIJA 4G77A 1MS7A 3LBSA 4ZEKA 4MF3A 4H1XA 4LQ5A 4GIZA 2Z8FA 1IQ7A 3W9VA 5TPAB 1AMFA 1I6QA 2HFBA 2QMWA 1SDXA 4RPOA 4NF6A 4F3GA 1PBPA 2HQ0A 2NVUB 1MY1A 3SESA 4OTEA 3RTFB 2HAVA 4FECA 4IO5A 4RK2A 4ZS9A 3CR9A 2XXXA 4DXCA 2DP8A 4GWOA 4Z0IA 3K01A 1Y1MA 1MXZA 5TU0A 3IB1A 4ND9A 3U72A 3H03A 3MBPA 4ZECA 4KYSA 1MQDA 3O29A 1WDNA 3FJMA 3MP1A 3IO6A 1XT8A 5CMBA 2QL3A 4ELPA 2ZNTA 2XXIA 1R9LA 1VFDA 2FYIA 4FEDA 4EQ9A 4NF5B 4DIGA 5DEXB 3VVFA 4GXAA 3KEIA 1M5FA 1XVYA 1B3EA 1FTOA 4PP0A 2ZYOA 4F3BA 2ANJA 1LFGA 4OESA 1FQAA 5L9MA 5KDTA 3RLFE 3TKDA 1QUIA 4U4SA 4G68C 2R9JA 4GFRA 4E0WA 4O3CA 4HS7A 2DVCA 1GGGA 3PPOA 1AH5A 3KGCA 1UQWA 4YU0A 1A54A 1NKXA 2HZLA 4R75A 3N6TA 4OERA 4YZZA 2UVJA 1D9VA 1Y3NA 2DYXA 3TDJA 1BTJA 3OEKA 2QS1A 4KYDA 4R6KA 1MM6A 4JXIA 2F36A 1LBCA 1TXFA 3K1MA 4ZE9A 4ZEDA 4RY1A 3KSXA 3LC8A 4C1UA 3G7WA 5I58A 4RJZA 2PX1A 2GHAA 3USDA 4NTLA 3UORA 3VVDA 2F35A 2RC8A 4LP2B 3IORA 1O7TA 3FGSA 4F19A 4R73A 4TOZA 4YAHX 4QF9A 4QFKA 5H8HA 3FV2A 3T9HB 2UVHA 5CC2A 1FTMA 1LLSA 3VFJA 3FVNA 2IA4A 5A5XA 2P1SA 4BDRA 3L6HA 1N3XA 2B65A 1RKMA 3R26A 4XIGQ 4F1UA 4FEBA 2RCBA 3PUWE 3OO7A 4IY5A 4YB5A 4FE8A 2ZYNA 4THIA 1P1NA 5JK4A 3TEPA 4OEUA 1LBBA 3MZ9A 3UP9A 1SW2A 3FJ7A 4N07A 2VD2A 1FTLA 2RC7A 2XXPA 2DS9A 3PUVE 1N7XA 3MP6A 4QSCA 4MH5A 4OHNA 4MLQA 3RQTA 4OENA 1JW5A 3UA8A 3QYTA 5AA3A 3K6WA 3G3IA 4G68A 2RINA 5AA4A 5AA2A 3O6IA 1FQEA 1FTJA 3SEVA 3TODA 3PMXA 1SW1A 4OYVA 3I5OA 2X7QA 4YMBA 2DVZA 3IL1B 2D21A 2O1LA 3OENA 3ZS6A 2G29A 3SEXA 2KLFA 2XXWA 4GF8A 2A5TA 2UXAA 1SBPA 2I49A 1Y4TA 2Q8JA 5CBSA 3MPLA 3TTNA 4PQJA 3A09A 3OO6A 1SI1A 3TCFA 3ECRA 5ITPA 5I59B 5JTYB 5DTBA 3VLUA 3VLVA 2QS3A 3EHSA 4X1BA 1FQCA 3MUQA 4OVJA 4ELRA 2DOJA 3QIMA 4R72A 4UA8A 2XXVA 4P0IA 1URGA 1FW0A 3KBRA 2RKMA 1KWHA 1QKAA 3MVYA 3PD8A 4KD5A 3SKPA 2PBWA 2B3FA 1UTBB 3IAZA 5F7VA 3EPEA 1LB9A 4NWCA 2VOZA 3GLBA 5BWJA 2NOOA 1H44A 3ILUB 4YKKA 5I57B 1YAEA 1CB6A 3N6UA 4LUBA 4HCYA 4AQ4A 1QVSA 1Q35A 4R2BA 3H7MA 2DWAA 4RNSA 3K02A 5DVFA 3MPKA 4ELQA 1MQGA 4C1TA 1H3DA 1JEVA 1S50A 1N04A 3G3KA 5ITOA 1N76A 4F1VA 1QULA 3RGYA 4JWXA 5ICTA 2PVUA 1EH3A 2ONKE 4DE8A 4EF1A 2I0BA 5KZTA 2OWSA 1LAXA 2GFEA 1FTKA 1P1WA 1PDAA 3FXRA 4F2OA 3MZ1A 4BDLA 3OMBA 1EZOA 1B40A 2UVIA 2QJEA 4YKJA 2Y7KA 3R6UA 2Y7RA 3CG1A 3RY3A 1LFIA 3TUSA 4GLIA 5DYHA 5ICQA 4R9GA 4DCYA 3H6UA 2H5YA 1LAGE 1MXVA 1FCKA 1NH8A 5L9SA 3O6GA 1VE4A 3B6WA 2ZXTA 5L9OA 1POTA 3K0VA 1US5A 2Z8DA 5M2VA 3O2AA 2VHAA 2I4BA 5DVIA 3A3CA 1B6HA 5LOMA 4C0RA 3O9PA 1B7UA 1P99A 2F7CA 4XKNA 4RPNA 5TP9B 1B3HA 1MQHA 3TQWA 4KCDA 1FQFA 1AOVA 2I3VA 5EHMA 1B5HA 3KJ7A 4OFOA 2VGQA 4KYEA 3K00A 4FJPA 3C9HA 4GOTA 2HCAA 4BDQA 3KFMA 4WKMA 3VVEA 4TQUQ 1FQBA 1UTHA 2UVGA 1II5A 2DSFA 3U94A 1NFTA 4DLDA 1ZU0A 3PUXE 5H8QA 5F1QA 1SI0A 2O51A 2ONRA 4ZDMA 2RF1A 2F6GA 5H8NA 4ONYA 4XKQA 3LSLA 4Q8RA 3TAJA 3TMGA 1B3GA 2W7YA 4NF8A 2YJPA 4U4XA 3IOUA 1FQDA 3DP4A 2V3TA 3THIA 4OFJA 3K6VA 4NE4A 4LZ5A 3UGWA 1I69A 2O7IA 2DE3A 4ESWA 5HPQA 2M8CA 3EN3A 2AL4A 3TELA 3B7DA 1Z7NE 2CZLA 3FXQA 4NEDA 3LR1A 4H8IA 1B51A 3N5LA 1IXHA 3O66A 2XX9A 5B7DA 3TTRA 3TQLA 3PGFA 3B6TA 1USYH 2V25A 1TWYA 1S7YA 3HHFA 3BBRA 4M1VA 2XXYA 3S9MC 3O6HA 1CE2A 2E1SA 1OQGA 1MG1A 2YPNA 1QUKA 4IO4A 4H5GA 1A40A 1N84A 3MC2A 4IGTA 5J1DA 4H65A 1USYE 3GZGA 1MQJA 2A5SA 3SEWA 3VLWA 1PB8A 1UIUA 2P2AA 1IZ1A 1S9TA 4QRZA 2GRVA 2OWTA 3MJNA 2Q89A 3SERA 3CSBA 2AYSA 2V93A 1OLAA 4Q0CA 1B2HA 1B7ZA 2CMOA 2XD2A 2Z8EA 3PPNA 3Q27A 3I3VA 2PYYA 3FXUA 1I6AA 4DXBA 4NF6B 5IAIA 4OETA 3IX1A 3KZGA 4RK9A 1A8FA 3KOSA 5I2KB 2DQVA 3U92A 1B52A 4ELOA 1POY1 1XC1A 3FJGA 4F31B 2F97A 4JWOA 3IK6B 5FTHA 1OQHA 4P11A 1TFDA 3T66A 4Z7EA 3T96B 4FIMA 4I9DA 1NNFA 4R6YA 3P7IA 4RXLA 1Y9UA 2R71A 4HCWA 3IJOB 1SW4A 1PB7A 4G4PA 4MLVA 3VV5A 4DXUA 2Z22A 5ISUA 3JV9A 2I6EA 3ZKKA 1ATGA 4QSDA 3LSWA 4EUOA 1JNFA 1L5TA 1IITA 1OLCA 3H6WA 4O3BA 4OEVA 3RT8A 1MXXA 3K1NA 1D4NA 1ZTYA 4F39A 4YB7A 3N94A 1OVTA 3E13X 3VXBA 5KCJB 1AIVA 4OWDA 3BKIB 2ZNSA 5KDTB 3PUZE 2DE2A 2HZKA 2V84A 1MDQA 3HV1A 1SYIA 2XD3A 2F8DA 5K2YA 1BLFA 2NXOA 2O6AA 4YMAA 1DSNA 4Q5TA 4GL8A 1B46A 3N26A 5I2NA 4DDDA 3FIRA 2DWJA 3Q28A 3TCHA 1VSOA 3RT6B 4ZZEA 1DMBA 4FATA 2GHBA 2AL5A 2QS2A 3VDFA 3PD9A 3KN7A 3WAEA 5EYFA 4XTCQ 4N13A 1VFEA 3PPQA 5JEIA 3OO9A 1JVYA 4L17A 1XOCA 4PE5B 3SEYA 1B32A 2ZYMA 1GR2A 1LCFA 2FA7A 1Q1KA 1YTVA 4YB6A 4OXVA 4NF4A 4IO2A 1PBQA 3ZSFA 3KOTA 3QUJA 4ZEFA 1A7LA 1N7WA 5CMKA 3TCGA 3CSGA 2OBGA 1LAHE 2ABHA 5I58B 1Y3QA 5FTIA 3WAFA 2XXHA 1IXIA 4EF2A 2Q2AA 5I56A 1M5EA 3OD7A 5I84A 1NMUA 1URDA 3QAXA 2NUVA 5TPAA 3C36A 3R7XA 1BIYA 2PMSA 2OZZA 2XX7A 3GXAA 1MQIA 4PFUA 3Q25A 5CMMA 1B9JA 1MRPA 3UN6A 3U1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4PDHA 3LV0A 4GX6A 2XA5A 1B1HA 4KPTA 4F1YA 2XHDA 4R74A 5IKBA 4F3PA 2QPQA 1EYJA 5AA2D 3QXMA 5FHMA 4U21A 2DE4A 1H43A 3H4ZA 3TZAA 4DZ1A 2UYFA 3C32A 4MFIA 2H99A 2BJJX 1J1NA 4MNIA 1B3LA 4WEPA 3IB2A 5I2KA 3T9UA 3CFZA 5HBCA 2QMXA 1SW5A 1XHYA 4PAIA 3V5AA 4EDPA 3S9LC 4KHZE 1JW4A 4U2RA 3O28A 4PFYA 2ONSA 1ELJA 2RC9A 1SPIA 3B50A 1MH4A 3RNNA 2Z23A 4OFLA 3E79A 3RPLB 3K6UA 1RYXA 3HO7A 2FNCA 3K6XA 3LUYA 1MPDA 3E9XA 1AWBA 4IGRA 3OSQA 2YLNA 3IJXB 4H67A 2VD3A 4UABA 3U8QA 3QMFA 3OELA 2D5WA 1B05A 4GL0A 4KCCA 1TT1A 2XXTA 3BFTA 2OJTA 3RPWA 1EZPA 3DP8A 1Y4CA 4GVOA 4QFNA 3MP8A 5ET8A 3FASA 3MVWA 3EHUA 5KCJA 4N6PA 4K3FA 2HAUA 2H98A 3BIGA 3DP6A 4LONB 3S4UA 4GD5A 3TPAA 1OIBA 1HSEA 5H8FB 1FJ6A 1LBVA 1LFHA 1EZ9A 4GBVA 1WODA 3T93B 5ELVA 3VXCA 4ESXA 2HXWA 1MDP1 1O64A 1OVBA 2G93A 3RTWB 1MY4A 4JBZA 3MVXA 2F7BA 3ILTB 4EQBA 2B4LA 3DLNA 1B1XA 2I58A 5H8SA 4P1LA 1IMBA 4BLAA 2O84X 1SD3A 4YKPA 4H0WA 4KI0E 4PFWA 4QFPA 1SQYA 4N81A 1N3WA 1ZBMA 4KR5A 4NWDA 5I59A 4LATA 5JTYA 4PTKA 1HSJA 2ZZVA 1M5CA 1LGBC 1UIVA 2VP1A 3M3KA 4OVSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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