1P1QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) l650t mutant in complex with ampa
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA01
3Q28A 2H5YA 3O6HA 2PMSA 4XIGQ 1M5BA 2X26A 5DTBA 3PU5A 4EDPA 1A54A 3SEYA 4XKRA 3FVGA 3IJXB 3MVZA 3UK4A 2DS9A 5EYFA 3OOAA 2O7IA 3R26A 3VV5A 1NNPA 1II5A 1R1NA 3K2DA 1N7WA 1N84A 4DXUA 1FQFA 3OELA 1N04A 3H6VA 4DZ1A 4IO5A 1SYHA 1TT1A 2QS1A 3PUVE 2ALUA 3SEUA 4AB5A 1UTHB 1PB7A 2UYEA 2XXXA 3D4GA 4ELQA 3KG2A 3UGWA 2ZMBA 3ZKKA 4ZZAA 3PUYE 3CG3A 1A8EA 4R75A 2XX9A 1LCFA 1ANFA 1MQGA 2OCUA 4KD5A 1H76A 1JVYA 2DWIA 4HTGA 4UACA 2CMOA 1SVXB 1FTJA 1NL5A 2X7PA 3MWBA 2E1SA 3MVWA 1Y1ZA 1B9JA 3QUJA 3PGFA 2ABHA 4XKPA 2Y7IA 1MQDA 3ZSFA 4RPOA 5ITOA 3VDFA 3TTMA 2RF1A 4QFNA 1B4ZA 3DLNA 1N3XA 1DPEA 1ZU0A 4NMYA 5CI5A 4OENA 3T66A 1P1WA 3CI8A 2RKMA 1B32A 3TTLA 4QRZA 4H67A 3TCHA 1D9YA 4OFOA 4GL0A 4U4XA 3KOSA 1RYOA 2VD2A 2DXRA 1H43A 4MLVA 5KCJA 3M3FA 1Z7NE 3TQWA 4DXBA 3PUZE 3U72A 1P1NA 3JV9A 4F19A 3DELB 4NF4B 3IX1A 3H7MA 4DDDA 1LFIA 1FQBA 3TCGA 4MBPA 2WKYA 4U1OA 3O9PA 3Q29A 5H8FA 1ELJA 3K6WA 5CM6A 3TUSA 1NNFA 4OQOA 3B6QA 4GL8A 3VXCA 3LBSA 1M5CA 3RTWB 4F3BA 3FUZA 1MRPA 2Q88A 4DE8A 4ELPA 4GF8A 4FE8A 1B0LA 3PMVA 3OO9A 1SYIA 5IKBA 3PPRA 4NE4A 1ZKBA 3QUFA 4PQJA 3USDA 4OXVA 1URDA 3AXFA 3HSTA 3U94A 1UIVA 2D21A 2P0SA 3MC2A 1RKMA 3RN8A 3ODBA 2F78A 5BUUA 5I59B 1FQEA 5AA4A 5I56A 3CSBA 1R9LA 3N94A 3KSXA 4EUOA 1WDNA 3RT6B 4R6HA 5I84A 3N6TA 1LSTA 4GRKA 4OWDA 4E0XA 3T9XB 1BP5A 1QJMA 1B7ZA 4BDOA 3SKPA 1FW0A 4GIZA 1POTA 4NF8A 4Z7EA 3SESA 3HPIA 3IO6A 4O3CA 4AB6A 4EXLA 2H99A 4N6PA 1BTJA 4PE5B 5A5XB 4KFQA 2QMXA 1PDAA 1TFAA 4C0RA 3MP6A 5DVJA 3H03A 1IZ1A 3C31A 4H6DA 5BWJA 1QUKA 2KLFA 3N6UA 4OTEA 4G68B 2R71A 4M4GA 5TP9A 3C36A 4PFTA 1IQ7A 4G8MA 5K2YA 2ZYNA 1LFGA 2DVCA 3DP4A 4LQ5A 1AIVA 2V3QA 3ONMA 4H5FA 5M2VA 1OQHA 2DE2A 4ND9A 2QS4A 1US5A 2F6GA 2ZYMA 4IGRA 5LOMA 3SEWA 1I6QA 3WAEA 3BFUA 3T93B 3ZS6A 3O28A 4QFLA 4TLMB 1JW4A 5HM4B 1D9VA 1J1NA 3U92A 2RC8A 4U2RA 4KCCA 3EHUA 4HS7A 4G4PA 5H8HB 1GGGA 5JTYB 2UYFA 1B3GA 4LZ8A 3EPEA 2R9JA 4UA8A 2GRVA 1MM6A 2F97A 4G68C 2HAVA 4KYDA 1NKXA 3CFZA 1H45A 3I3VA 2XXTA 5CMMA 2V3TA 3MAMA 2Z22A 3G3FA 3MW0A 1UTBA 3FZVA 3MPKA 3O66A 3N26A 2Q9TA 3IB0A 3IOVA 1PEBA 1SI0A 4R9FA 3K0VA 3TTRA 3TMGA 5CC2A 1L5TA 3FJMA 5H8NB 3FD3A 1MXWA 2F7CA 4XTCQ 4KQPA 2I49A 1VFDA 1QKAA 1CE2A 4KI0E 1GR2A 4ESWA 1JEVA 4TLLB 2ZNUA 3A3CA 4JDFA 1N7XA 2QS3A 1B1HA 1YPNA 4AQ4A 3Q27A 3M8UA 4R2BA 2XD3A 4NF5B 4I9DA 5L9SA 1FQAA 4OEUA 4JWXA 1M5DA 3E9XA 2H25A 3O97A 3VVDA 4NF6B 3FV2A 4P11A 2AL4A 2XXIA 4BDQA 2UVHA 1XC1A 2V3UA 4ZEBA 2P2AA 1JVXA 2OK2A 3FIRA 4WKMA 2O69A 4X1BA 5DVFA 4YU0A 5ICQA 3VXBA 4YZZA 1SW4A 2QPQA 2Z8DA 5FHNA 1GVCA 4QFPA 3RNNA 1SW2A 4PP0A 3UN6A 3B7DA 2FYIA 1HSJA 3CFLA 4R72A 3D4CA 3BFTA 1EZ9A 3SEXA 2I48A 3VE1B 1JQFA 1YCJA 3FXRA 1EZOA 4C1UA 4Z0IA 4Q30B 1B1XA 3PPPA 2I4BA 1Y1MA 3HV1A 4G77A 3EQ1A 3F11A 4GFRA 4F29A 2I6EA 4P0IA 4RJZA 4ISUA 1TWYA 1EH3A 4QFOA 4GD5A 4H1XA 4ZDMA 1IXGA 4G2ZA 3GLBA 1MXYA 5ICTA 3H3GA 1Y9UA 3LR1A 1JW1A 2BJJX 4F39A 4XXUA 2ESNA 2RINA 1QUJA 5CMBA 1VR5A 5I58B 5I2KA 2R6GE 3K02A 1DMBA 5TPAB 4MFIA 1UIUA 4LATA 3R6UA 3VLWA 4FATA 1LFHA 3CR9A 3PD8A 2CZLA 4BDLA 5IAIA 2PT1A 3IAZA 2I3WA 3THIA 2Y7RA 3V89B 1LBCA 3FGSA 3FVOA 5DT6A 2Y84A 1ZIUA 1JNFA 4XKNA 5HPQA 2A5TA 4FJPA 3IORA 4OFLA 2VP1A 5FHOA 5I57A 2HXWA 5AA2D 4P0GA 3T22A 1XOCA 4F1VA 1VE4A 4GXAA 1Y3QA 2DOJA 3S9MC 1O64A 3RLFE 4ZE8A 3RQTA 3TQLA 4F2OA 3K1PA 4OEVA 1B3EA 4H5GA 3TODA 2ZXTA 3QSLA 2QL3A 4RK9A 5CBRA 2IA4A 3R7XA 2XXYA 4BDMA 2NOOA 3IR1A 2I0CA 3UP9A 4DXCA 1B6HA 4IB2A 1FTOA 3S9NC 3KN8A 2XXRA 3OMBA 2XXPA 4GXSB 1OMPA 4O3AA 1FCKA 2DYXA 1P1UA 1Y3PA 1FTMA 1XVXA 1B7HA 3IB2A 2DVZA 4LUBA 1XVYA 1DSNA 2YLNA 4KYSA 5J1DA 1SD3A 4G8NA 3FJGA 1MPDA 3V8XB 2QMWA 2RC9A 4BLAA 1MXUA 4N07A 3KJ7A 3B6TA 1MM7A 4YMBA 1B51A 2DE4A 5FTIA 4YKKA 4MF3A 4POWA 3T9HB 4LA9A 4Q0CA 1FQCA 3MQ9A 4IO3A 1B3LA 2GHAA 3L6HA 1URGA 5DEXA 4GOTA 5DYHA 1Q35A 2I3VA 2F6PA 1PBPA 1P1QA 3IK6B 5H8QA 1GTKA 3EHTA 1IEJA 2I0BA 3FASA 3IL1B 2G93A 2B3BA 3MP1A 4LONB 3G3GA 3MP8A 5KZTA 4O3BA 1LGBC 2F7AA 1SBPA 1QKBA 1OIBA 3EF7A 3QIMA 2XD2A 4IO6A 3P7IA 2HQ0A 1MY2A 1EU8A 4DCYA 2REJA 3B6WA 2REGA 1IXCA 2FNCA 4GWOA 3K4UA 3LSWA 1IIWA 5KDTA 3MJNA 2ZNTA 1ATGA 4G8HA 2XXWA 4JWOA 4PETA 3H06B 4QSDA 1S7YA 1P1OA 3QXMA 3VLUA 5ISUA 2LAOA 4E0WA 2V25A 3FV1A 3GZGA 3PPNA 3G3IA 3C32A 3ILUB 4LZ5A 3PMWA 3MPLA 2NVUB 2I58A 3GBAA 2VOZA 3OENA 1N3WA 3FVKA 4F1UA 1HSLA 1Y4TA 3C34A 3UORA 2HAUA 4YKJA 5B7DA 3QYTA 2NUVA 3O2AA 1JEUA 1XHYA 4FAJA 3SERA 2FA7A 3IO4A 2F8DA 3TPAA 2E0SA 2ZNSA 2AIXA 4YB6A 3MBPA 4K3FA 4DLDA 3IOWA 4F18A 3TTNA 2F7BA 1B52A 3DP8A 5FHMA 4QSEA 2V93A 4TOZA 5I2NA 3VLVA 4ESXA 3G3KA 1N76A 3QK6A 3KEIA 3KOTA 1Q1KA 2UVGA 3OEMA 2O84X 2W7YA 4BDNA 4ZE9A 3W9VA 4NWDA 4ZEFA 3G3HA 5AA2A 2GHBA 4EQ9A 4YKPA 1P99A 4KPTA 3W15C 4RY1A 5KCJB 4U4SA 3MVXA 1IXIA 1B7UA 2NXOA 1SDXA 4FEDA 5AA3A 3DP6A 4BDRA 1MY0A 4X9TA 3A3UA 4H65A 1H3DA 4F22A 1DTZA 1NH8A 4N13A 1PBQA 1POY1 4EXKA 5H8FB 4HCWA 4FEBA 5JK4A 4NEDA 1JW5A 4QSCA 1MDQA 3UIFA 1B4HA 2O1LA 4M1VA 2XHDA 4NTLA 2HZKA 3OSRA 3E3KA 5DVIA 5F1QA 1MXXA 1I6BA 4EF2A 1ZBMA 4H8IA 1UTHA 3H6UA 4YMAA 3I6VA 4PFYA 3OO6A 1UQWA 3M3KA 5AA4B 5I56B 1FTKA 1Z7ME 1LCTA 1I69A 2HFBA 2ZYOA 4LVQA 2Y7WA 1ZJLA 2AL5A 1LB8A 4THIA 4IGTA 4RK2A 2OLBA 2PT2A 2ZYKA 4NF8B 2YJPA 3LSLA 1BKAA 4OESA 4U23A 2YPNA 1MY3A 4F1YA 2O1MA 4FECA 2GH9A 1AL3A 2AYSA 2B65A 1I6AA 4U22A 1MY4A 2Y7KA 1LAHE 3TFLA 4PFWA 1OVTA 4GVOA 3VFJA 4MLQA 4KR5A 3TYHA 1LLSA 4RXLA 2O6AA 5TP9B 5JEIA 4YICA 3RUMA 1OLAA 4FIMA 4DCXA 3KBRA 5H8SA 1NMUA 3EHSA 1TFDA 2Q2CA 4FORA 1AH5A 3KZGA 1D4NA 3RGYA 4EQBA 2HEUA 4ZEKA 3PPOA 1PB9A 3TKDA 3K6VA 1SQYA 4R6KA 4R74A 4NF4A 3CSGA 4WEDA 3V83A 3L6GA 3PV0E 3S2VA 3T9UA 1F9BA 3H4ZA 1H44A 3IOTA 5ELVA 1GV8A 2NWJA 4ZEDA 1B3FA 4ZS9A 1ZTYA 3VVFA 2PVUA 5ITPA 5K2XA 1A55A 2F34A 4JSOA 3C35A 1B46A 3BBRA 5F7VA 1PB8A 3CVGA 3H6WA 4JXIA 1UTBB 4IO2A 1A8FA 4R73A 1N0TA 1NNTA 1RYXA 3FVNA 4X48A 2OWTA 2DWAA 3PUWE 2QSXA 3ILTB 4F3PA 2XXVA 2O68A 1NFTA 5I59A 4LP2B 1KWHA 4F31B 3K00A 1WODA 2F5XA 4LQ2A 3K6UA 4R9GA 3O29A 3HO7A 3WAFA 4H0WA 3V5AA 1B5JA 1IUDA 4JWYA 2V84A 1B0HA 1MQIA 1MS7A 3I5OA 1MDP1 2H98A 1NNKA 5TU0A 2PBWA 5A5XA 3OXNA 3JYRA 1SI1A 3U8QA 4U21A 4Q5TA 4F3GA 1MG1A 4X1DA 2XX8A 4RNSA 1XT8A 2O7UA 2Q2AA 3VVEA 4G68A 1MQHA 3Q25A 4I62A 4KHZE 1WVJA 2QJEA 1IXHA 1MPCA 5AA1A 1B40A 1ZMGA 2GFEA 3CRBA 2B3FA 3G3JA 2O51A 3FJ7A 3KFMA 4OVJA 4MH5A 1VFEA 4GLIA 2RCBA 2UVIA 1OQGA 2DE3A 1S9TA 2XXUA 4JBZA 1XS5A 2G29A 3GBBA 4OERA 2XXHA 1QULA 3G7WA 5H8HA 2PYYA 3ZKLA 3E4RA 5JTYA 1A7LA 1URSA 3A09A 3O6GA 1SW1A 3C9HA 3O6IA 2F36A 3LSFB 4HW8A 1TXFA 1A99A 2ONKE 5B70A 1QUIA 5CRYA 4JSDA 4F3SA 1CB6A 4U1ZA 1QW0A 3K1MA 4ZZEA 3W9WA 3SDFA 1MXZA 3CG1A 2F35A 5I2KB 4JB7A 3T96B 1DOTA 5H8NA 4KYEA 1LAXA 1R6ZA 3U93A 1LB9A 4XKQA 4IO7A 2RCAA 3OEKA 1B3HA 1ZLQA 2QRYA 3TCFA 4ELRA 1Y4CA 3SETA 4TQUQ 5AE4A 3EN3A 3HHFA 2A5TB 2VGQA 1B05A 4ONYA 3SEVA 5I57B 2Q89A 1FTLA 4YKIA 5L9MA 3TDJA 4OFJA 2Q8JA 2ANJA 1MXVA 4NF5A 1Y20A 3OO8A 1NH7A 3FATA 1YAEA 3E13X 2OBGA 3IB1A 2X7QA 2H4IA 3S4UA 3HHGA 4DIGA 2QS2A 5EHSA 4OETA 4I8CA 1B5HA 4NF6A 2DWJA 3K6XA 2Z23A 3RPWA 1JETA 3DM0A 1R9QA 3ECRA 4R2FA 4ELOA 4WXJA 3N5LA 3MZ9A 3MZBA 5CBSA 1USYE 4OHNA 4Q8RA 2DQVA 1DPPA 3T9VA 4IY5A 4F2QA 1AMFA 4YB7A 2OJTA 1EZPA 3GXAA 5HBCA 3LC8A 3FXUA 3IOUA 1O7TA 1YTVA 2Z8FA 3U1OA 1LBBA 3PMXA 1BLFA 4OZ9A 1OLCA 2OZZA 4IO4A 3Q26A 2ONRA 1B2HA 2DWHA 2DP8A 1MQJA 2VD3A 2A5SA 1D3KA 4RYAA 4HCYA 5DEXB 4RPNA 3TTKA 3LUYA 2DXYA 2VHAA 1LAFE 5H8QB 3H6TA 4EQ7A 3TEPA 2D5WA 2I4CA 2HCAA 1M5EA 5I58A 4QHQA 3JZJA 1USYH 1M5FA 1MY1A 5TPAA 5L9OA 2DSFA 4NWCA 1B5IA 4ECFA 2HZLA 3RT8A 2M8CA 1OVBA 4R6YA 3TZAA 3FXQA 3BKIB 3C4MA 5L8DA 5KDTB 3RTFB 3S9EA 3OSQA 1A40A 4PFUA 3S9LC 4ZECA 4WEPA 2IEEA 1SW5A 3CIJA 4LZ7A 1HSEA 3RY3A 3KJTA 2XXQA 5CMCA 4C1TA 3KSJA 2XX7A 4POXA 1O63A 1DTGA 3C33A 3M3LA 3MVYA 3OD7A 4EF1A 3KN7A 1BIYA 4I1DA 2H9BA 5FTHA 4QF9A 5CMKA 2OWSA 3TAJA 1S50A 3LSXA 1Y3NA 2UVJA 1US4A 2PX1A 3MUQA 1MH4A 4ZEIA 5EHMA 1MPBA 3PUXE 3HN0A 1AOVA 3CFXA 3OO7A 3K1NA 4OYVA 4IY6A 1QVSA 3KGCA 4L17A 1T0KA 2UXAA 1FQDA 3PPQA 3MZ1A 4YAHX 1PC3A 2THIA 3UA8A 1LAGE 2Y7PA 2RC7A 4YB5A 3HCQA 4QFKA 3QAXA 3PD9A 5I2NB 2P1SA 3K01A 3TELA 2Z8EA 2ONSA 4H8JA 4KCDA 1IITA 2D3IA 4OMBA 1VSOA 4GQOA 4RA1A 3KN3A 1B58A 3IJOB 1MH3A 5AA2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q28A 2H5YA 2WEFA 3O6HA 2PMSA 4XIGQ 1M5BA 4OVSA 2X26A 5DTBA 3PU5A 4EDPA 1A54A 2FIEA 3SEYA 4XKRA 3FVGA 3IJXB 3MVZA 1NUZA 3UK4A 2DS9A 3E79A 5EYFA 3OOAA 2O7IA 3R26A 3VV5A 1YXIA 1NNPA 4PFRA 1II5A 1R1NA 1NUXA 4DI3D 4GWZA 3K2DA 1N7WA 4N6KA 1N84A 4DXUA 1FQFA 3OELA 1N04A 3H6VA 4DZ1A 4IO5A 1SYHA 1TT1A 2QS1A 3PUVE 2CZIA 2ALUA 3SEUA 4P1LA 4AB5A 1EYIA 1UTHB 1PB7A 2UYEA 2XXXA 3D4GA 4ELQA 3KG2A 5EQ7A 3UGWA 2ZMBA 3ZKKA 4ZZAA 4NHBA 3PUYE 3CG3A 1A8EA 4R75A 2XX9A 1LCFA 1ANFA 4I40A 4P3LA 4NG7A 1LBWA 1MQGA 2OCUA 4KD5A 2WX9A 1H76A 1JVYA 2DWIA 4HTGA 4UACA 2CMOA 1SVXB 1SPIA 1FTJA 1NL5A 2X7PA 4MAGA 3MWBA 2E1SA 4MHFA 3MVWA 1AWBA 1Y1ZA 1B9JA 3QUJA 3PGFA 2ABHA 4XKPA 2Y7IA 1MQDA 3ZSFA 3RYDA 5FBPA 4RPOA 4OVRA 5ITOA 3TTMA 3VDFA 2RF1A 4QFNA 1B4ZA 3DLNA 1N3XA 1DPEA 1ZU0A 4NMYA 5CI5A 4OENA 3T66A 1P1WA 2CZHA 1YZ0A 4NX1A 3CI8A 2RKMA 1B32A 3TTLA 4QRZA 4H67A 3TCHA 4GWXA 5DW8A 5EYGA 1D9YA 4OFOA 2QVUA 4GL0A 4U4XA 3KOSA 1RYOA 4X04A 2VD2A 2DXRA 1H43A 4MLVA 5KCJA 2F3BA 2HHMA 3M3FA 1Z7NE 3TQWA 4DXBA 3PUZE 3U72A 1P1NA 3JV9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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