1PEBA

Ligand-free high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATAENAAKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 119
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pebA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pebA01
2XXVA 3FVNA 5I59A 4OENA 4NF5A 4R2BA 4WEPA 4ELQA 2R71A 1MM6A 1B5IA 1NH8A 3EHSA 1I6BA 3OO6A 4IY6A 1H45A 1SVXB 4C1TA 5H8QA 1H43A 4XKNA 1LBCA 3PUYE 4U2RA 4IO2A 1DSNA 3MP1A 2DE4A 2XXRA 4JWYA 4AB5A 5FHMA 2DS9A 1A55A 4OTEA 1MXYA 2XXYA 1I6QA 4POXA 2GFEA 2O84X 3LSWA 3O2AA 1LFIA 3UK4A 4NF8B 1L5TA 1B6HA 2UXAA 3G3KA 1BP5A 5BUUA 3U94A 1A40A 3TKDA 4POWA 3CFLA 1SYHA 1TT1A 2ZNTA 1FQAA 4YMBA 2XXHA 4OEVA 4YKKA 3SEWA 4IO7A 3O9PA 3B6WA 4F1VA 2I6EA 3KN3A 4H67A 1SI1A 4U4XA 4YMAA 4R6HA 5I56A 5I59B 4KFQA 3PD8A 4NF5B 1LB8A 1OLAA 3FGSA 3OO7A 4G8MA 3UIFA 4RNSA 3ODBA 2Z8EA 4ISUA 5H8QB 1QUIA 5ITPA 1TFAA 1MG1A 1B58A 1AH5A 1MS7A 1ZLQA 1MDQA 2Y7KA 4XKPA 1LCTA 3CG1A 4OFLA 2XX9A 1SW1A 2XXIA 3C4MA 4NTLA 3BFUA 2A5SA 1QKAA 4KYEA 4PFYA 1WODA 1B7HA 4IGTA 2PT2A 3PMXA 2QS1A 1URSA 3MZBA 4DZ1A 2UVIA 3PPQA 4FJPA 4ZEFA 1NNFA 4G4PA 3RUMA 1MXXA 2QMXA 3DP8A 4K3FA 3KBRA 4Q5TA 4DCXA 3FIRA 3SERA 3KOTA 3HO7A 2XD2A 4FAJA 1BTJA 5DYHA 3C34A 3IORA 3OEMA 2XX8A 4XTCQ 4YKPA 4WEDA 5F1QA 1S7YA 2VOZA 4OFOA 2DXYA 4ZZAA 1PC3A 1EH3A 2OK2A 3Q26A 3OELA 1ATGA 3H4ZA 4OERA 1UTBA 1TXFA 1VFEA 2XXUA 4WKMA 1ZTYA 2XXPA 1PB8A 3IB1A 3V5AA 4GXAA 1O64A 4EQ9A 1Y1MA 3P7IA 3R26A 3IO4A 2DOJA 1QULA 2DWAA 3S2VA 2QS4A 2REJA 4F3GA 1D9YA 2ANJA 1NNTA 3S9EA 4G8NA 1Y3QA 3RLFE 3IOWA 4KQPA 5AA2A 4BLAA 3FATA 2QMWA 3HSTA 4ZEDA 4R6KA 1SYIA 2PBWA 3OEKA 4GL8A 4RK9A 1B0LA 1FQEA 4LATA 1O63A 3MWBA 1NH7A 4LP2B 3A3CA 4ONYA 2AL5A 2VP1A 5DEXA 1FQDA 3IOUA 3BBRA 3CRBA 1UTBB 2O69A 3CI8A 3CFXA 1XVXA 1B5JA 4KI0E 1H44A 4R2FA 2W7YA 3N6TA 3VLUA 3G3IA 5CI5A 1LAGE 3H6WA 3C36A 3K0VA 1UIUA 5I2KA 1MY4A 1PB9A 1Z7ME 3O29A 2DWIA 4PE5B 2PYYA 3UN6A 1LFHA 1ZU0A 4F1UA 1AIVA 3VXBA 3W9VA 1NNKA 4R9GA 1FCKA 4X9TA 4FEDA 3K6WA 4FE8A 4DCYA 4QFOA 5AA2B 1YPNA 4WXJA 2B65A 2LAOA 3FASA 4F18A 4I1DA 2ONKE 4R74A 1F9BA 4DIGA 4LONB 1SQYA 2Z22A 4U1OA 3H06B 3I6VA 1B3HA 4PP0A 3MVZA 5ICTA 1AL3A 4TLMB 1A99A 3TAJA 2HAVA 3EHTA 2Q9TA 3IK6B 3CG3A 5DVFA 3OO9A 3GZGA 2PMSA 2Y7IA 1FTJA 2NUVA 4TQUQ 2ESNA 4AQ4A 3E4RA 2V3QA 3QUJA 2VD3A 3OMBA 2ONSA 3TTLA 3N5LA 3KEIA 5I2KB 3C35A 2I4CA 3S9NC 3K1PA 5M2VA 5CRYA 2F35A 2OWSA 1B1XA 4FECA 3RPWA 2Z23A 1JNFA 2HQ0A 4P0GA 4H8JA 3MBPA 5B7DA 3LSXA 1OLCA 3MVXA 1Z7NE 1QJMA 3N26A 3EF7A 2WKYA 1LBBA 1B7ZA 4BDNA 5HM4B 1TFDA 3GBBA 3K6UA 1SW5A 3KJTA 3T9XB 1B51A 4DXUA 2ALUA 1GV8A 2F7BA 5B70A 1FTOA 3GXAA 2O1LA 3U1OA 3K1MA 1QVSA 4LZ8A 1H3DA 5H8NA 5I58A 1XT8A 2UVGA 1NFTA 3B7DA 4BDMA 4H5GA 3FVOA 5LOMA 1JEUA 4U22A 2X26A 5AA1A 4ECFA 4ESWA 4GVOA 2D3IA 3PD9A 1R1NA 3BFTA 1OQHA 3CFZA 3TTKA 4H65A 5BWJA 1CB6A 3OOAA 1I69A 5ITOA 1US4A 3PUVE 2YPNA 4H6DA 4E0WA 1N84A 1MY0A 4DLDA 1B5HA 1RYOA 2F6GA 3I5OA 1I6AA 5CBRA 2ZXTA 4G8HA 2PX1A 4ZDMA 2DWJA 4F31B 5CC2A 3E3KA 4R73A 2HZKA 2QRYA 2RC7A 3G7WA 1A8FA 3MW0A 2VHAA 4EUOA 1QKBA 4P11A 1B4HA 3TUSA 1B05A 1OQGA 5H8NB 2I49A 2OCUA 5I58B 1IXIA 2ZYKA 2GHAA 1BLFA 1WVJA 3UORA 5AA2D 3KN7A 4U23A 1FQFA 1ZIUA 2XXQA 2DWHA 3D4GA 1P1WA 4HTGA 4IB2A 1URDA 4NF6A 4YB6A 2H25A 3EHUA 4F1YA 3H6UA 1O7TA 3A3UA 3C32A 3PUXE 5CMMA 2GH9A 4PFUA 2I48A 4C1UA 1EZPA 4YICA 1PBPA 1YTVA 3LSFB 1US5A 3T9VA 4L17A 1MY1A 3VFJA 4MLVA 3R6UA 3MQ9A 3TTRA 3Q29A 3LSLA 1MQHA 4XKQA 5JTYA 5I57A 1Y20A 2OWTA 2QJEA 1USYE 3K1NA 4OMBA 3Q25A 3C33A 3MP6A 4G2ZA 2REGA 1MQJA 1IITA 4GF8A 4GQOA 2H9BA 1LSTA 3PUWE 4GIZA 1MQGA 2NWJA 4KCDA 1AOVA 4DXCA 2E0SA 4YU0A 1XS5A 5KDTA 1RKMA 1B46A 3PMVA 1AMFA 4YB5A 3HPIA 3CVGA 1ELJA 4NF6B 2XXWA 3IJOB 3F11A 3ZKLA 5IAIA 2CMOA 5J1DA 3OSQA 2V25A 5DTBA 1UIVA 3USDA 4JB7A 3OD7A 2ZYMA 3KG2A 1PBQA 2UYEA 2I3WA 3QK6A 4JDFA 3FJMA 4XKRA 4QHQA 4NF4A 3IB0A 2FA7A 4ND9A 4ZE8A 4EF2A 3B6QA 2ZYOA 4O3CA 5JTYB 5I57B 4F3PA 4QFKA 1XVYA 2V3TA 1KWHA 3HN0A 4QFLA 1DMBA 3VV5A 3VLVA 2RINA 1N04A 4ESXA 4OEUA 5KDTB 3M3FA 1IIWA 1VFDA 4IO3A 3IB2A 2THIA 4QSDA 4YAHX 1IZ1A 1MXZA 4R75A 1Y3PA 4GXSB 1PDAA 2AYSA 3FVGA 3HCQA 2XXTA 1B32A 1CE2A 2VD2A 4EQ7A 5A5XA 3VVEA 3RTFB 2Q2AA 3FJGA 4U21A 1LAFE 2F6PA 2QSXA 4THIA 4Q0CA 5EYFA 3TEPA 3VLWA 3S9MC 3E13X 3QIMA 5EHSA 1IQ7A 1QUKA 4KCCA 3TODA 4NF4B 1FTKA 4ELOA 1P1OA 2P0SA 2Y7PA 1HSJA 4ZS9A 1VR5A 3K6XA 3TZAA 1EU8A 5AA4A 3PPNA 1B2HA 4JXIA 1SDXA 3G3GA 1MM7A 1DTZA 1VE4A 4GFRA 3LR1A 1JVYA 3AXFA 4OQOA 2Z8FA 1UTHA 3KFMA 3U72A 3IOTA 2P2AA 1B3EA 1DOTA 2P1SA 1II5A 3V83A 3MPLA 3G3FA 4JWOA 4F3BA 1IXHA 5A5XB 4OFJA 4EF1A 1QUJA 4G68A 1S50A 3TQWA 1GVCA 3ZS6A 1MXWA 3L6GA 5K2XA 1B3FA 3FV2A 3GLBA 5HBCA 3TELA 4KYDA 2RKMA 1JW1A 3M3LA 3O66A 4I9DA 2HCAA 4MH5A 5JEIA 2DP8A 3RGYA 5H8HA 2O6AA 4GWOA 2Q2CA 4HW8A 4LA9A 5AA4B 2A5TA 5HPQA 2B3FA 4KYSA 2O1MA 2NOOA 4BDRA 4ZEIA 2I3VA 1EZ9A 3R7XA 1MXVA 3CIJA 3UGWA 1UTHB 1FTMA 2R9JA 3SEVA 1IEJA 3QSLA 4N6PA 4H8IA 4JSOA 4TLLB 4OVJA 3DELB 4IO5A 2V84A 2X7QA 3UP9A 1N3WA 3C9HA 3T93B 3RTWB 2QPQA 1B52A 3OSRA 4H5FA 3TQLA 2M8CA 3THIA 4ELPA 4XIGQ 4G68B 1OVTA 1NL5A 4KR5A 3S4UA 3TTNA 3JYRA 3K2DA 4GOTA 1NKXA 1DTGA 3U92A 4NEDA 5H8SA 4X1BA 2OZZA 3QXMA 5TP9A 3WAEA 1NNPA 2O51A 2QS3A 1UQWA 5H8HB 4F22A 3EQ1A 2A5TB 4LZ5A 2OLBA 3SKPA 3GBAA 4QSCA 2DVCA 4OZ9A 3ZKKA 2F36A 3G3HA 4H1XA 3LUYA 3B6TA 1XC1A 3WAFA 1JW5A 2Q8JA 1URGA 1B40A 4QFNA 4BDLA 4OETA 4HCWA 3QAXA 1MY3A 1N3XA 4I8CA 3TCFA 4NMYA 3PPRA 4OWDA 2E1SA 5F7VA 3O6GA 1GR2A 5AE4A 1IXGA 1OVBA 5TPAA 2V3UA 4RK2A 3N6UA 5CMCA 4HS7A 3W9WA 3HHGA 5TP9B 4PFTA 5FHOA 3MVWA 4RPNA 2QL3A 4G77A 2PVUA 5CM6A 1MPCA 4EQBA 2Z8DA 3RT6B 3OENA 4R6YA 5DVIA 3TCGA 3OXNA 4LZ7A 4GD5A 4IO4A 4N07A 3VVFA 3MVYA 4X1DA 4N13A 3ILUB 2H99A 3HV1A 3Q28A 3KSJA 3U93A 1A7LA 3FVKA 3QUFA 3IAZA 1HSLA 4F2OA 4BDOA 1BKAA 4MLQA 4GL0A 1MQIA 4OESA 1ZKBA 2RF1A 3H3GA 3ZSFA 4UACA 3MZ9A 4O3AA 3FUZA 2ABHA 1FW0A 1LAHE 1B4ZA 3K00A 3PUZE 4RJZA 5TPAB 3W15C 2YLNA 4FORA 4ZEBA 5JK4A 3SETA 3LBSA 4XXUA 3TDJA 1FQBA 1ZJLA 1Y3NA 4IY5A 4QFPA 3KN8A 4LQ2A 1ANFA 3FZVA 4M4GA 4JSDA 1P1NA 2NXOA 2D21A 1Y4TA 4DE8A 1D4NA 1Q1KA 5KCJA 1N7WA 5L9SA 1MY2A 1JVXA 5L9MA 3MUQA 3D4CA 2B3BA 2DQVA 1P1QA 1DPPA 3CSBA 4PFWA 3TMGA 1LAXA 3EN3A 3KZGA 3MJNA 4F19A 1IUDA 1BIYA 2O7IA 3TTMA 5I2NA 4Z0IA 3RN8A 4UA8A 1H76A 1LFGA 4NWCA 2V93A 1VSOA 5I84A 5ELVA 5FTHA 1JW4A 3V89B 5FTIA 1POTA 3IL1B 3FV1A 3I3VA 3IJXB 3IOVA 4PETA 4F2QA 4P0IA 3CSGA 2Y84A 3SEXA 5TU0A 3RY3A 5KCJB 2DXRA 4ELRA 3PPPA 4IGRA 1A8EA 2Q89A 2ZMBA 4ZEKA 2DE2A 4LVQA 1N7XA 3ECRA 1M5DA 3RQTA 2AL4A 2FNCA 5K2YA 2NVUB 4M1VA 3RT8A 1WDNA 3PU5A 1NMUA 3H03A 1GGGA 2RC8A 3SEUA 1USYH 4JWXA 3H6VA 2DE3A 1QW0A 3M8UA 4GLIA 2UVHA 1P1UA 3MZ1A 2OBGA 5FHNA 3FXQA 5I2NB 1MPDA 4GRKA 4RXLA 5I56B 4YZZA 5CMBA 1B3LA 2IEEA 1Q35A 2F78A 5KZTA 2H98A 2RCAA 2VGQA 3M3KA 3H7MA 3G3JA 3K01A 3O28A 1B7UA 1T0KA 1N76A 3VE1B 3T9HB 3EPEA 4NWDA 3TCHA 3MP8A 1POY1 1HSEA 4MFIA 2I0CA 1B9JA 4EXLA 3DLNA 1B3GA 3DP6A 2ZYNA 1D9VA 4ZZEA 4DXBA 5EHMA 5CMKA 5IKBA 3V8XB 2DSFA 2F97A 2FYIA 1R9QA 1RYXA 3SDFA 1TWYA 3KGCA 2H5YA 1MQDA 3VVDA 1PB7A 2GHBA 1R6ZA 1P99A 1GTKA 4KPTA 1JETA 4R9FA 1SD3A 2F7AA 3PV0E 3DM0A 1OMPA 2XHDA 4H0WA 1YAEA 1FTLA 3K4UA 4LQ5A 4RPOA 1MPBA 5ISUA 4O3BA 3MPKA 3RNNA 2RC9A 1S9TA 3UA8A 1FQCA 1LGBC 1A54A 2Y7RA 1R9LA 5DVJA 2R6GE 2G93A 3L6HA 4ZE9A 3Q27A 1N0TA 4F39A 4RYAA 4RY1A 3LC8A 3JV9A 1JQFA 3VDFA 3KSXA 5L9OA 2H4IA 1ZMGA 3K6VA 4Q30B 3T9UA 2HAUA 2DVZA 3S9LC 2RCBA 1JEVA 2ZNSA 3OO8A 2I0BA 3A09A 3O6IA 3FXUA 2CZLA 1M5EA 2G29A 3FJ7A 4FEBA 1ZBMA 2F8DA 4X48A 3VXCA 1LLSA 3HHFA 3PGFA 1YCJA 1OIBA 3FXRA 3FD3A 3MC2A 4Q8RA 1DPEA 1M5FA 3KOSA 2OJTA 4U1ZA 3T22A 1B0HA 2YJPA 4YKJA 1MDP1 3SEYA 1LCFA 4FATA 5DEXB 4YB7A 3ILTB 3IX1A 4KHZE 4F29A 4EXKA 4QF9A 4DDDA 1LB9A 2BJJX 4G68C 3TPAA 1EZOA 2F5XA 1IXCA 4I62A 4OYVA 1MH4A 3ONMA 3QYTA 3CR9A 4OHNA 4F3SA 1M5CA 4HCYA 2DYXA 4IO6A 4QRZA 2HFBA 4YKIA 4E0XA 2X7PA 1SW2A 4ZECA 4MF3A 4JBZA 1SBPA 2HXWA 5AA3A 5CBSA 3N94A 2QS2A 3H6TA 3T96B 3JZJA 3E9XA 3TYHA 4OXVA 5ICQA 4AB6A 2XXXA 5H8FA 1SI0A 2ONRA 3TFLA 4PQJA 2HZLA 3O97A 2F34A 1D3KA 4QSEA 3SESA 1MXUA 2IA4A 4BDQA 1Y9UA 1M5BA 1XHYA 2UYFA 2GRVA 2O68A 1SW4A 2XX7A 2HEUA 1XOCA 2Q88A 3DP4A 4FIMA 2ZNUA 2KLFA 3C31A 4C0RA 2AIXA 1PEBA 2O7UA 3BKIB 3K02A 3O6HA 2XD3A 2PT1A 4EDPA 1J1NA 3IR1A 4NE4A 3PMWA 5DT6A 1Y1ZA 2I58A 4NF8A 3T66A 4U4SA 2I4BA 2F7CA 3U8QA 5H8FB 1Y4CA 3KJ7A 1MRPA 2UVJA 3MAMA 4Z7EA 3IO6A 4MBPA 2Y7WA 4TOZA 4R72A 5L8DA 4LUBA 4KD5A 3PPOA 2D5WA 1B1HA 1MH3A 4RA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXVA 3FVNA 5I59A 4OENA 1NV3A 4NF5A 4R2BA 4WEPA 4ELQA 2R71A 1MM6A 4GWWA 1B5IA 1NH8A 3EHSA 1I6BA 2OWZA 3OO6A 4IY6A 1H45A 1SVXB 4C1TA 5H8QA 1H43A 4XKNA 1FPKA 1LBCA 3PUYE 4U2RA 4IO2A 1DSNA 1SPIA 3MP1A 2DE4A 2XXRA 4JWYA 3ROJA 4MMPA 4AB5A 5FHMA 1NV0A 2DS9A 1A55A 4OTEA 1MXYA 2XXYA 1I6QA 4POXA 2GFEA 2O84X 3LSWA 3O2AA 1LFIA 3KBZA 3UK4A 4NF8B 1L5TA 1B6HA 2UXAA 1QGXA 2XA5A 3G3KA 1BP5A 4MEVA 4OVPA 5BUUA 3U94A 1A40A 1LBYA 4POWA 3TKDA 4NAPA 3CFLA 1SYHA 2JJKA 1TT1A 2ZNTA 1FQAA 4YMBA 2XXHA 4OEVA 4YKKA 3SEWA 4IO7A 3O9PA 3B6WA 4F1VA 2I6EA 3KN3A 4NQ8A 4H67A 1SI1A 4U4XA 4YMAA 4R6HA 5I56A 5I59B 4KFQA 3PD8A 4NF5B 1LB8A 1OLAA 3FGSA 3OO7A 4G8MA 3UIFA 4RNSA 3ODBA 5ET5A 2Z8EA 4ISUA 5H8QB 1QUIA 5ITPA 1TFAA 1MG1A 4HE0A 4P1EA 1B58A 1AH5A 1MS7A 1ZLQA 1MDQA 2Y7KA 4XKPA 1LCTA 3CG1A 2P3NA 4OFLA 2XX9A 1SW1A 2XXIA 3C4MA 4NTLA 3BFUA 5I3SA 2A5SA 2XWOA 1QKAA 4KYEA 4PFYA 1WODA 1B7HA 4IGTA 2PT2A 3PMXA 2QS1A 1URSA 3MZBA 4DZ1A 2UVIA 3PPQA 4FJPA 4ZEFA 1NNFA 4G4PA 3RUMA 4GX6A 1MXXA 2QMXA 3DP8A 4K3FA 3KBRA 4Q5TA 4DCXA 3FIRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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