1QVSA

Crystal structure of haemophilus influenzae h9a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQAKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 111
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA01
3E9XA 1WODA 3CVGA 1F9BA 1NMUA 3G3JA 1YAEA 1II5A 2XXUA 1WDNA 5H8FA 1JNFA 3KOSA 5CBRA 3PUYE 2Y7RA 1VE4A 4P0IA 2X7PA 2OWSA 1GR2A 2Z23A 1A7LA 3O29A 1A40A 4G68A 1YCJA 3KN3A 2H4IA 2DQVA 3FIRA 4TQUQ 1WVJA 2P0SA 1MY3A 4I62A 5CMBA 1QKAA 2O1MA 3S4UA 1TWYA 2O1LA 3B7DA 4OQOA 2LAOA 2WKYA 3TODA 1US4A 4BLAA 5KDTB 1P1NA 4PQJA 4M1VA 4QF9A 3E4RA 5I56A 1QUIA 3BFTA 3PPPA 3USDA 2UVHA 1FTKA 1DTZA 1FQAA 5DVFA 2DSFA 1TXFA 3RLFE 3EHTA 3T96B 4RK2A 1QW0A 5I2NB 5CMKA 4HS7A 4OESA 1M5FA 1XS5A 5EHMA 4KFQA 3RGYA 3M3KA 5FTIA 3N5LA 4RPOA 3RT6B 5I59A 4N07A 1A54A 1A55A 3DP8A 3PPOA 1MXYA 4JSOA 4YB7A 5ITPA 3SEWA 1R6ZA 3C32A 1BP5A 4KPTA 5DVJA 4Z7EA 3C35A 1EZOA 2PT1A 1M5EA 1P1UA 4HCWA 3UN6A 2AL4A 3A3CA 4GL0A 2O7IA 5KCJA 1O64A 3M3FA 4NWDA 4OVJA 3IR1A 2O84X 5BUUA 3B6WA 1H43A 1B4HA 4R9FA 1VSOA 3Q26A 5H8FB 4HW8A 3VE1B 1LGBC 3H03A 1ZBMA 2H25A 1B5HA 4GFRA 3TPAA 2AYSA 5H8QA 1A8EA 1RYOA 1OQGA 4YB5A 1FQDA 4KHZE 4IO4A 1NNTA 5HM4B 3S2VA 2DVCA 2ZYMA 4DCXA 3EPEA 2O7UA 2FYIA 2F34A 2PBWA 2XXQA 3OXNA 5J1DA 5M2VA 4QSCA 5I56B 4F29A 3GZGA 5IAIA 2X26A 2DXRA 1B05A 4JBZA 4KQPA 2Y7PA 1MM6A 3U1OA 2DE2A 3TDJA 3VLVA 4MBPA 2XXWA 3QSLA 2UVJA 3OEKA 5F1QA 1ZLQA 3TYHA 3IJXB 3L6HA 1B1XA 3B6TA 3B6QA 1GTKA 3TTKA 4OEVA 1EU8A 3IO6A 3FXRA 5I59B 1S9TA 3OSRA 4F1UA 4DDDA 2PMSA 3SEXA 4XTCQ 4L17A 3SEUA 1MPDA 3DLNA 3KSJA 3K1PA 1QUKA 3P7IA 5DYHA 3U72A 3LSLA 2NVUB 3UA8A 1N7WA 1UIUA 3Q25A 4ZEBA 2FA7A 1RKMA 3QUFA 1LAXA 3Q27A 3IOTA 1N0TA 4F1VA 1XVXA 3BKIB 1URSA 2P1SA 4GOTA 1PB7A 4OENA 5I57A 4BDLA 4P0GA 2PX1A 3K4UA 2Q8JA 4DLDA 2W7YA 3MAMA 1FQBA 3U8QA 4NF6B 1VR5A 4WEDA 2OBGA 3VV5A 5TP9A 3MQ9A 2HCAA 4U21A 1FQCA 4ECFA 4I8CA 3AXFA 3TQLA 2OZZA 2F6GA 4R2BA 2XX7A 4ZZAA 3O6GA 1MXUA 4RK9A 1MQIA 3TKDA 2DS9A 3SEVA 2Q88A 3G7WA 4DIGA 1DPPA 2RKMA 4WXJA 3MP6A 1D4NA 4P11A 4PFWA 4GXAA 2UYFA 4YU0A 3IX1A 4AQ4A 5CBSA 1MPCA 3OEMA 1IQ7A 1SW5A 4IB2A 4YZZA 3K00A 4QSEA 1HSLA 3TTRA 1B7ZA 5AA1A 1RYXA 4JDFA 4O3AA 3TZAA 1B9JA 3ODBA 2AL5A 2HXWA 1SW1A 4ESXA 3OD7A 3CIJA 3O6HA 2I6EA 2OCUA 3K02A 4F31B 4OMBA 3ZKKA 2F7CA 2Y7IA 4RYAA 4MLVA 4IO3A 4DZ1A 2Z8FA 4FAJA 4E0XA 3D4GA 3VVEA 3FVOA 3PUZE 3RN8A 1FQFA 3HHFA 1B51A 3KFMA 5L8DA 3V5AA 1JVYA 3FXUA 3PV0E 5H8NB 3PD9A 3H4ZA 3CR9A 4MH5A 1B4ZA 4F2QA 2QSXA 3FGSA 2OWTA 1URDA 4WKMA 4BDQA 4XKRA 3A3UA 2V3QA 2F6PA 3TFLA 3H7MA 3F11A 1PBPA 5KDTA 2Y7WA 4MFIA 3H6WA 3C34A 3CFXA 4ELOA 3FJGA 2XXPA 4RXLA 3A09A 3BBRA 2DWIA 1LSTA 2F7AA 4YKIA 2RCAA 1URGA 4OFOA 1IZ1A 3R6UA 4EF1A 4C1UA 3C36A 4R6YA 4YICA 1PDAA 3ECRA 4RA1A 4X48A 5JTYB 1Z7ME 2DOJA 1B3LA 1D9VA 2RC9A 3GBAA 5I2NA 3OSQA 1NNFA 3DP6A 3TAJA 3W15C 3K0VA 3MVZA 3CG1A 1B5JA 2ZNTA 3FUZA 3DELB 3PMVA 2F5XA 4U22A 2QS1A 1LFGA 4WEPA 1R9LA 1PC3A 3I3VA 5DVIA 3FV2A 4U1OA 4H1XA 4H5GA 5AA2A 4YAHX 3PUXE 4UA8A 4XIGQ 1LB8A 3GLBA 3QUJA 5ELVA 1Q35A 3UORA 2QS2A 1MY1A 1M5CA 2R6GE 1DMBA 1GGGA 2ZNUA 2HFBA 1FTLA 2IEEA 4FEBA 1MY4A 1NFTA 3TCHA 3VVDA 2P2AA 1DPEA 1SVXB 1MXXA 2A5SA 3OO9A 3LSWA 3C31A 2I3WA 4OYVA 1OVBA 1PBQA 2RCBA 1BLFA 4X1BA 2QJEA 4PFYA 4DCYA 1MDP1 3SEYA 4QFLA 3L6GA 1FQEA 1MH3A 5BWJA 4ZE9A 4BDMA 3HO7A 2D3IA 4EXLA 2NOOA 4GF8A 2H99A 3IOUA 4GVOA 5I2KA 2XHDA 4FECA 3S9NC 1BIYA 2QS3A 2I4CA 3FVGA 1AIVA 4C0RA 2D5WA 3PMXA 5FHOA 2I0CA 1P1WA 1AL3A 3PPRA 4NF8B 2YJPA 4IO5A 2ONRA 3FZVA 3CFZA 3MBPA 2ESNA 4F2OA 4EDPA 3H06B 5AA2B 5AA2D 1Y3QA 3OENA 1TFDA 1UIVA 2V84A 1TFAA 4NTLA 3IK6B 2UVIA 3OMBA 3C9HA 2DXYA 1Y4CA 3C4MA 1B7HA 4R75A 3QYTA 5K2XA 3QIMA 1QVSA 2Q2AA 4NF6A 4HCYA 1B32A 4DXCA 1UTHB 3HCQA 2B3FA 2ZMBA 3MVWA 1MDQA 5DEXB 1A8FA 2V93A 3HV1A 3T93B 4YMAA 3VLWA 1I6BA 2X7QA 5LOMA 1M5DA 3LBSA 2O51A 4PE5B 1LAHE 5ISUA 2PVUA 3ILTB 3VVFA 4GQOA 1MY2A 3HHGA 1MXWA 1ZU0A 5F7VA 5TPAA 5B7DA 1IXCA 2H5YA 1B3FA 4R72A 3TELA 3GXAA 1D3KA 1B52A 5I2KB 1B2HA 1B3HA 3VDFA 1Y3PA 3TCGA 2DWHA 3KN8A 1FTMA 1POY1 1O7TA 2E1SA 4NMYA 2HZKA 3T9UA 3I5OA 2D21A 4LQ2A 1CB6A 4O3CA 4XKNA 2HAVA 1B40A 1AMFA 1VFEA 5K2YA 4OEUA 2QMXA 3KG2A 2V25A 1DTGA 4N6PA 3LSXA 4ZE8A 3FJ7A 4KYEA 3O97A 3PU5A 4KYSA 4H6DA 2OK2A 2ZYKA 4LZ7A 1M5BA 2M8CA 3H6UA 1BTJA 1MM7A 4K3FA 1MXVA 1UTBB 3HPIA 3V83A 4YKJA 3V8XB 5JEIA 4KYDA 5H8NA 4POXA 2HEUA 3N94A 3QXMA 4RJZA 1Z7NE 1N76A 2GHAA 4Z0IA 4F22A 2XX9A 2XXRA 4OETA 3TEPA 3TMGA 3KJTA 3IL1B 5CMMA 1L5TA 4R73A 1MQHA 4NEDA 5JK4A 4DE8A 1ZTYA 3DP4A 4H0WA 1LFHA 3U92A 3CSGA 1FW0A 2DP8A 3RUMA 1B5IA 2VD3A 4R74A 2NXOA 2F97A 5IKBA 3PPQA 1GVCA 4KI0E 1OIBA 5TPAB 3E13X 2A5TB 2G93A 4G8MA 3C33A 4JXIA 1SBPA 2Z8EA 1H76A 5JTYA 2YLNA 3SETA 3S9MC 3LC8A 1B58A 1SI0A 2QS4A 2R71A 4DXBA 4OFJA 2XXXA 2RC8A 2V3UA 3PMWA 1R1NA 3MVXA 5H8HB 3RTFB 2Z8DA 1LAFE 5TU0A 1OQHA 1NNKA 3TTMA 2I58A 4X1DA 2XD3A 1VFDA 1AH5A 3LUYA 4G77A 1ZJLA 1NH8A 3RT8A 3E3KA 1JW1A 2DE3A 3N26A 4YKPA 5AA4B 4ZDMA 1ANFA 1B0HA 3FVNA 4G2ZA 4BDOA 2BJJX 3U94A 4PFTA 2DWAA 4F18A 5EYFA 2QRYA 1DSNA 4AB6A 5ICTA 3K2DA 4I1DA 3H6TA 2ZYOA 5A5XB 5FTHA 4LZ5A 3ZKLA 3N6UA 4IY5A 1ZMGA 4LUBA 2Y84A 1ATGA 1NKXA 1I6AA 3WAFA 3ZSFA 3I6VA 1B3EA 1SDXA 3VFJA 3ONMA 4R6KA 1UQWA 3GBBA 5HBCA 4LP2B 2Q2CA 4FJPA 2I48A 1MXZA 1SQYA 4QHQA 1B3GA 3KJ7A 1AOVA 1P1QA 3R26A 4RNSA 2REGA 3ILUB 4THIA 4F3BA 4POWA 4H65A 1XT8A 3MPKA 4N13A 4RPNA 4U4XA 1N04A 4ELPA 2VOZA 3IOVA 1EZPA 5I84A 2YPNA 2H98A 2ONKE 4E0WA 3SESA 2I3VA 2DYXA 4JWXA 3H3GA 1P1OA 1JW4A 3MZBA 3IO4A 3IJOB 3DM0A 4RY1A 4U23A 4TLLB 1SW2A 4NF8A 2PYYA 1NH7A 1H45A 3SKPA 2I49A 2QPQA 4LQ5A 1YTVA 4EQ9A 2XXVA 1BKAA 4PP0A 3PUVE 2XX8A 4ELQA 3TUSA 1ZIUA 4PFUA 2XXTA 4UACA 2F35A 4GWOA 4F39A 3O2AA 2OJTA 5I58B 4ONYA 4GD5A 2ONSA 3JV9A 3UP9A 4TLMB 4Q30B 1LAGE 4IY6A 3JZJA 3MC2A 2RC7A 3SERA 5L9OA 2HQ0A 3CSBA 4JWOA 4F3PA 4ISUA 1SYHA 1B0LA 4XKQA 5FHMA 4YB6A 2QL3A 1NL5A 4I9DA 3D4CA 5DT6A 3S9EA 1IXGA 1SD3A 5B70A 1UTHA 3IB2A 4LATA 1O63A 1N84A 5DEXA 3RNNA 2XXIA 2GH9A 2VHAA 1B1HA 5CM6A 4FEDA 2O69A 2O6AA 3IOWA 3G3IA 3FV1A 4NF5B 3IB1A 4NF4A 3IORA 4MF3A 3MJNA 3KEIA 2REJA 2F78A 4O3BA 3LR1A 4XXUA 1J1NA 1MG1A 4GXSB 3K1NA 3MP8A 1S50A 5CMCA 2ALUA 2Y7KA 4LA9A 5H8SA 3LSFB 3MW0A 3K1MA 2HAUA 2NWJA 1IXIA 4BDNA 1A99A 5L9MA 3THIA 3EQ1A 3W9VA 2IA4A 3KN7A 1LLSA 4LONB 1HSEA 3TTLA 3MWBA 3M8UA 3S9LC 1JQFA 2Q9TA 3K6UA 1MS7A 1Q1KA 4IO6A 5CRYA 2XXHA 4DXUA 3MUQA 4FATA 2ZNSA 2F36A 4H8IA 4C1TA 4YMBA 4U2RA 1UTBA 1QJMA 2NUVA 4JSDA 3T9XB 1N3WA 3RPWA 1P99A 2Q89A 3CFLA 4IO2A 1USYH 4Q8RA 3TTNA 3PPNA 1JEUA 4M4GA 1XHYA 2B65A 3SDFA 4KD5A 5CI5A 4U4SA 5KZTA 3VLUA 2F8DA 4LZ8A 4JB7A 5L9SA 5FHNA 4TOZA 3KOTA 4G4PA 4GRKA 3KBRA 3FVKA 4XKPA 2V3TA 4X9TA 4EXKA 3FATA 4G68B 3HSTA 1B7UA 2XD2A 2RINA 2FNCA 2UXAA 3VXBA 4ZECA 2O68A 1PEBA 4NF4B 3UK4A 2A5TA 3G3HA 3KGCA 2G29A 4H8JA 3T9VA 2ZXTA 4ZEDA 4ZEFA 3EN3A 1OMPA 1B46A 3WAEA 3T22A 2XXYA 4ZEKA 2UYEA 4FORA 3O66A 5AE4A 1H3DA 3G3FA 5H8HA 2GHBA 4R6HA 2CZLA 2B3BA 2DE4A 3Q29A 4ELRA 1I6QA 1GV8A 1LBBA 2DWJA 5AA4A 1N3XA 1LCTA 3QAXA 4FE8A 3K6XA 1LBCA 4QRZA 1JW5A 4ND9A 3K01A 1NNPA 3KZGA 3O28A 3RTWB 4OHNA 4GLIA 3Q28A 4F3SA 1I69A 1Y1ZA 3ZS6A 5DTBA 1LB9A 4OERA 3CI8A 3EHSA 2R9JA 4QFKA 4F1YA 5A5XA 1Y1MA 1Y20A 1H44A 1FTOA 3O9PA 2H9BA 2GRVA 4ESWA 5KCJB 3T66A 1OLAA 1D9YA 1FTJA 3PD8A 1OVTA 4FIMA 4QFPA 3OO8A 1MY0A 4OWDA 2ANJA 1B6HA 1Y3NA 3M3LA 5H8QB 3UIFA 3FXQA 1ZKBA 3JYRA 3QK6A 4R9GA 4OXVA 2E0SA 3N6TA 1SI1A 1EZ9A 1QUJA 3MPLA 1US5A 4QFOA 3O6IA 3TQWA 3FD3A 1LFIA 4EF2A 1JVXA 1POTA 2KLFA 1EH3A 1Y4TA 1T0KA 1SW4A 1JETA 2Z22A 1SYIA 4HTGA 1IIWA 1R9QA 1N7XA 4G68C 2THIA 2UVGA 3U93A 1DOTA 4OTEA 1JEVA 5I58A 3TCFA 1XVYA 3W9WA 3CRBA 1PB9A 3OELA 3EF7A 2HZLA 2VGQA 1CE2A 2I0BA 2CMOA 3RQTA 4F3GA 5AA3A 4EUOA 3OO6A 3PGFA 4JWYA 1MQDA 1YPNA 4QSDA 4GL8A 4MLQA 4H67A 4NE4A 3G3KA 3UGWA 1IUDA 2GFEA 4QFNA 1IITA 4G8NA 3RY3A 4Q0CA 2I4BA 3IAZA 1FCKA 3VXCA 2OLBA 1XC1A 3V89B 4KCDA 3HN0A 3MVYA 1LCFA 4OFLA 3EHUA 5I57B 1MH4A 4NF5A 1HSJA 3K6WA 1Y9UA 5HPQA 1USYE 1QKBA 3OO7A 4NWCA 5TP9B 3T9HB 4KR5A 1MQGA 5CC2A 4LVQA 2PT2A 1MRPA 5ICQA 1MPBA 4KCCA 3G3GA 4PETA 2ZYNA 3R7XA 3IB0A 2VD2A 3MP1A 2RF1A 4IO7A 1PB8A 4IGTA 1XOCA 3BFUA 4U1ZA 3K6VA 3MZ1A 4EQBA 4R2FA 4H5FA 4F19A 1IEJA 2QMWA 1KWHA 4ZEIA 3OOAA 3FASA 4IGRA 3CG3A 4YKKA 4ZS9A 4G8HA 1TT1A 3FJMA 2VP1A 4GIZA 3KSXA 1S7YA 4AB5A 1QULA 4OZ9A 3MZ9A 2AIXA 1MQJA 1IXHA 4EQ7A 4Q5TA 1ELJA 2DVZA 5ITOA 2F7BA 3PUWE 1OLCA 3H6VA 4ZZEA 4BDRA 5EHSA 2ABHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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