1SI0A

Crystal structure of mannheimia haemolytica ferric iron-binding protein a in a closed conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADKGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for iron binding and release by a novel class of periplasmic iron-binding proteins found in gram-negative pathogens.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Mannheimia haemolytica
molecule keywords iron binding protein FbpA
total genus 126
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A02
2DSFA 4OYVA 1VSOA 1MDQA 3B6WA 2O68A 3Q28A 3E4RA 4H6DA 1B46A 2QJEA 2RC8A 2KLFA 3E13X 1B7ZA 4O3BA 4MF3A 4BDOA 1EZPA 5TU0A 3RNNA 2ZYOA 1NMUA 3SDFA 2DVZA 2XXPA 4NWCA 5I59A 2QMXA 5J1DA 3K6XA 2UXAA 4F2OA 1MY0A 4OETA 4XKQA 1MRPA 4EDPA 2BJJX 1PBPA 3JYRA 3MVWA 1N7XA 5AA1A 5CM6A 4I1DA 4H8IA 3ONMA 1Z7NE 1B7HA 2Z22A 4OXVA 2GRVA 3TUSA 1SYIA 3MAMA 1P1WA 2ZXTA 2XD2A 4Q8RA 1Y3QA 4WEDA 3KOTA 2H98A 2FNCA 2F7CA 1LSTA 2P1SA 4R2FA 2XD3A 4RJZA 1MG1A 1J1NA 2YPNA 3SEWA 1MXYA 5IAIA 2XXTA 3G3GA 1WVJA 3KG2A 1P1NA 3EHUA 3HV1A 4FORA 3H6TA 4I8CA 2DYXA 2V25A 2DXRA 3ZS6A 1DMBA 2YJPA 3VXBA 3K0VA 1OMPA 3B7DA 3GXAA 5KDTB 2H99A 3K4UA 1SW1A 5H8NB 4GIZA 3N6TA 3DELB 2G93A 2REGA 2QMWA 5F1QA 1YTVA 4ZZEA 4IO3A 4NF4A 1FQEA 3USDA 3TZAA 2UVGA 1IXHA 2PMSA 3FIRA 5I58A 3H6VA 4AQ4A 4G8MA 1JVYA 3OEMA 1LBBA 4LATA 1R1NA 1VFDA 2QS3A 4QF9A 2GFEA 1DPEA 3DP8A 2D21A 2QS4A 3K1NA 1TFAA 1Y3PA 4GVOA 4NWDA 4RPNA 3GBBA 1AL3A 1USYH 3MJNA 4XKPA 3MVZA 4X1BA 4YU0A 3SESA 3RLFE 4OWDA 3EPEA 1JNFA 4MFIA 2NXOA 1Z7ME 5DEXA 1MQIA 4YAHX 5KZTA 1QUJA 4U22A 3JV9A 4ZZAA 2QSXA 5DVJA 3FUZA 1MH4A 1B3HA 1LFGA 3OSQA 5M2VA 2Q8JA 3AXFA 2D3IA 4BDLA 1QJMA 1OLCA 2RKMA 4KYSA 3KBRA 1B3LA 5AA4A 3PUXE 1AOVA 4R9GA 4N13A 4G4PA 3WAFA 1B7UA 1USYE 1SW5A 2HEUA 3A3UA 3PUVE 1SI1A 2VD3A 1TWYA 5ELVA 1IIWA 4EQ7A 5FTIA 5AA3A 5CBSA 2PYYA 4ZS9A 3IOVA 1B05A 2V3UA 5JEIA 4NEDA 2I3VA 3R6UA 1TFDA 4OENA 4Q30B 5A5XB 5ICTA 3TYHA 4ZEFA 3MP6A 2XX9A 3FJ7A 1OVTA 4YKPA 3O6IA 3CVGA 3RT6B 1IZ1A 1N3WA 4LP2B 4F29A 3LUYA 1R9LA 4ELRA 4ESXA 3ZSFA 2W7YA 3K6UA 4JB7A 5DYHA 4QSEA 3F11A 4K3FA 5TP9B 1HSEA 2X7PA 2H25A 4IO2A 3T93B 1M5BA 1AMFA 1JEVA 5B70A 2R71A 4IO4A 4Z7EA 4NTLA 3THIA 1M5FA 3H7MA 4KYDA 3SEVA 1A54A 3MVYA 1LAXA 5B7DA 5EYFA 4RK9A 1FTOA 3TCGA 2Y7WA 3VVEA 2ZYMA 2I6EA 3OOAA 1B51A 1EZOA 4KCDA 4DDDA 1O63A 3PPRA 2PT1A 4R9FA 4OVJA 5FHMA 2QRYA 2UVIA 4ZEDA 3DLNA 4F1VA 1B3GA 2PX1A 1MDP1 2E0SA 3MWBA 4DCYA 4ELQA 1SYHA 4KR5A 2QL3A 2GHAA 3K1PA 3PUZE 1YPNA 1SDXA 3HO7A 3MPLA 3H06B 3U1OA 1B58A 2HXWA 3TFLA 3K6VA 4N07A 2Y7RA 3H6UA 4YKKA 3OO9A 2QS2A 3BFTA 3W9VA 4LZ8A 4QFKA 1MXZA 4OHNA 2V3TA 5ITOA 2DOJA 4X1DA 3PGFA 2XX8A 4XKRA 4ESWA 3IL1B 3CI8A 3FZVA 4IO7A 1NNFA 5AA2A 2ZYKA 4GWOA 1TT1A 5HM4B 1B5IA 3SEUA 5K2XA 1HSJA 3O2AA 3VVDA 4BDQA 5I56A 3TELA 3OO8A 1UTHA 1FCKA 1RYOA 4RA1A 4OFJA 1MPCA 3MZ1A 2Z8EA 1URDA 4OEVA 2F34A 5CRYA 1IXIA 3TMGA 1XVXA 4GXAA 2H4IA 1QUIA 4G68B 4BDRA 1MXVA 5I2NB 3CSGA 3MVXA 4F3SA 2V93A 5I57A 4GF8A 3LSFB 2VD2A 2UYFA 4RY1A 1FQBA 2DQVA 1IQ7A 4OEUA 2AIXA 2DE2A 1FQAA 3E9XA 3RN8A 3FVKA 4L17A 3TODA 1LFHA 3LSLA 3KZGA 4NF8A 2RF1A 1N7WA 3IOUA 3IO6A 4Q5TA 4FAJA 5H8SA 1NKXA 1LCFA 3OO7A 2I49A 2HZKA 2A5TA 3IK6B 3QXMA 5H8QA 2DVCA 4IO5A 3PUWE 4EXLA 3U92A 1IITA 1MQDA 3TTLA 1DPPA 3V8XB 4EQBA 1B0HA 1MPBA 2CZLA 3CSBA 4F2QA 5CMKA 1H3DA 4HTGA 3JZJA 4THIA 1BLFA 3PUYE 4TLLB 4AB5A 4WEPA 5FTHA 2FYIA 5JTYA 1XS5A 3MP8A 4F3PA 4WKMA 4EF2A 2O7IA 1FQDA 4YB7A 1MXXA 3LSXA 3K02A 3I6VA 2NWJA 2THIA 3QK6A 4PFTA 4POWA 4KCCA 3W9WA 2ABHA 2REJA 4EUOA 3ILUB 3KN3A 4U1OA 4TOZA 1S50A 4E0XA 1NL5A 4OZ9A 5I2KA 1XOCA 4NF6A 4H1XA 4O3AA 4HW8A 3BBRA 4ECFA 4M1VA 1QULA 3EHSA 4U1ZA 3HCQA 1NNTA 3KOSA 2Q2AA 1EH3A 1JW5A 5KCJB 3FD3A 4NF5A 1UQWA 4YB5A 4DZ1A 2VP1A 4F3GA 4I9DA 4OTEA 3FASA 4LVQA 1OVBA 1GVCA 1S7YA 2DWJA 1AIVA 2V84A 1UTBA 4GL0A 4KFQA 3VV5A 2LAOA 3R26A 2YLNA 3H3GA 1PDAA 4U4SA 4U21A 3U93A 4C1TA 3PPQA 2AL4A 4GLIA 1UIVA 1ANFA 3RUMA 4PFUA 5I59B 4EQ9A 2Z8FA 4FE8A 1GR2A 5H8FB 4QSCA 4QFLA 3LSWA 1DOTA 3ZKLA 1POY1 3TTNA 4DCXA 1PBQA 2Z8DA 1URSA 4G68C 1QKAA 4MH5A 1M5EA 1R6ZA 2VGQA 4KHZE 3QUFA 4RXLA 3SETA 1LCTA 4TLMB 3OELA 2F35A 4XTCQ 1OLAA 2WKYA 1H76A 2B3BA 3N5LA 5K2YA 1FTJA 5CC2A 1PEBA 3LR1A 1FTLA 4U4XA 3RGYA 3GLBA 1Q35A 3SERA 4DXBA 1CE2A 4YKJA 3MC2A 3O9PA 4LONB 1SVXB 4QHQA 4OERA 1I6BA 3M3LA 3TPAA 4RYAA 2F7AA 4NF4B 1MY1A 3P7IA 1A40A 4JWOA 3KN7A 1ZTYA 2I4BA 4H0WA 3T9HB 5I58B 3FV2A 1MQJA 3IJOB 1WODA 1B3EA 3UP9A 2DWAA 2O7UA 2M8CA 3KEIA 2DE4A 2ZNUA 4IGRA 3CG3A 1XHYA 4R74A 3SEXA 4G2ZA 2G29A 3TKDA 3PU5A 3U94A 3PPPA 5DT6A 2OWSA 1D4NA 4DE8A 3EN3A 3S9EA 3V89B 5DEXB 4LA9A 1NNPA 5FHNA 1SBPA 3HSTA 2O69A 1WDNA 5BWJA 2OZZA 2OWTA 3K6WA 2NOOA 1LGBC 1MPDA 3V5AA 5BUUA 1QW0A 3E3KA 2Y7KA 4GXSB 3T22A 3I3VA 5AA4B 2QS1A 4ZE9A 1JW1A 3T96B 3FV1A 1JETA 4GD5A 3OEKA 1DTGA 2O1MA 3PPNA 4F18A 2XXWA 1SQYA 3IX1A 3IOWA 4YMBA 4FECA 1D9VA 3FVGA 2CMOA 1R9QA 3L6HA 4F22A 5TPAA 3QUJA 2DP8A 3SKPA 1MH3A 4XIGQ 2HQ0A 4C1UA 3L6GA 1FTMA 5AA2D 5HBCA 4QFOA 1NH8A 3FXUA 1I6QA 4R72A 4DIGA 3MBPA 1F9BA 4MLQA 2QPQA 1H43A 4LZ7A 1JW4A 5L9OA 2F97A 3LC8A 5H8HA 2R6GE 4R73A 5CMCA 2F78A 2AL5A 3TAJA 3HHFA 1ATGA 2RINA 3HHGA 4ZEBA 4ELOA 3IJXB 3KFMA 4DLDA 3N6UA 3VE1B 2NVUB 4YKIA 4JSDA 1D3KA 3HPIA 3VDFA 4TQUQ 1QKBA 4YICA 2VHAA 3QAXA 1ELJA 1MQGA 2ZNTA 1EU8A 4H8JA 3WAEA 1LAGE 4BDMA 3CG1A 3ILTB 3Q27A 4R75A 2PT2A 1MM7A 3RPWA 4JBZA 3D4CA 4X48A 2P0SA 4IY5A 1I69A 1LAHE 1B4ZA 2B3FA 3VLVA 4KD5A 4KYEA 4YZZA 4E0WA 1B1XA 1PB9A 3T9XB 3MPKA 4YMAA 3V83A 4NE4A 3R7XA 3LBSA 2O84X 1BKAA 2OJTA 4I62A 2H9BA 1S9TA 4H65A 1LB8A 2DXYA 2IEEA 4G8NA 3QSLA 3K2DA 4R6YA 4DXCA 1P99A 1ZBMA 3CFXA 5L9SA 3MQ9A 4F3BA 1GGGA 4JWXA 2I0CA 3U8QA 5AA2B 1P1UA 1US4A 3IOTA 4LUBA 1OIBA 3O66A 4OESA 2O51A 5CMMA 5I56B 3MZBA 2E1SA 1UTHB 4F39A 3CIJA 2X26A 3C35A 1BP5A 3G3HA 1ZJLA 1XT8A 1Y4TA 1XVYA 1H45A 3I5OA 1ZIUA 3D4GA 3UGWA 2UVHA 2OLBA 2X7QA 3G3FA 4G77A 3QIMA 5I57B 2HFBA 3CFZA 5HPQA 1N3XA 1IEJA 3S9NC 4R2BA 4KPTA 3CR9A 3H6WA 2A5SA 2F7BA 4GOTA 5KDTA 2HAVA 4IGTA 5H8NA 5DVFA 3KN8A 3TCFA 2PBWA 1VFEA 3B6QA 1SI0A 4ZDMA 4NF8B 4JWYA 4IB2A 3K00A 4Q0CA 2RC7A 2XHDA 4FEDA 4GFRA 3PD8A 1MXUA 5H8FA 4YB6A 4RK2A 2A5TB 3O6GA 2O6AA 4FATA 2Q89A 1DTZA 2XXHA 5H8QB 4GL8A 4BLAA 2Q9TA 3RTFB 2VOZA 1II5A 1MQHA 3S9MC 3OXNA 4N6PA 3C4MA 2Y84A 4GRKA 2B65A 5CI5A 2F8DA 3C33A 4RNSA 3IR1A 1O7TA 1EZ9A 1VE4A 3TQWA 3FXRA 3RT8A 4FJPA 4BDNA 1FQCA 2RCBA 2HZLA 3UIFA 1D9YA 1YCJA 2F6PA 4G8HA 3M3FA 5JTYB 1OQHA 3KJ7A 1B52A 2UVJA 1PB8A 1QUKA 1B4HA 4OFOA 1P1OA 4OFLA 5L8DA 3TTKA 2XXIA 4AB6A 1N84A 2IA4A 4MBPA 4RPOA 3IB0A 3S2VA 1O64A 3PPOA 4WXJA 2F36A 5CMBA 4HCYA 3OD7A 2UYEA 5F7VA 3G3JA 2OBGA 3ZKKA 4M4GA 5I2KB 2FA7A 1LFIA 4NF6B 4F1UA 2GHBA 4LZ5A 3T66A 3MZ9A 4FIMA 1JQFA 1N0TA 3TDJA 4ELPA 2Q88A 2ONKE 3KSJA 4F19A 3EF7A 3N94A 4NF5B 3PMXA 1IXCA 1B1HA 3CFLA 2O1LA 1Y3NA 1KWHA 4X9TA 4F31B 3QYTA 1Q1KA 5A5XA 3A3CA 1UTBB 1LB9A 5EHMA 3TTRA 1GV8A 1ZLQA 1BTJA 2DE3A 3VFJA 4PQJA 5IKBA 2DWIA 1A99A 5ICQA 1B0LA 1MS7A 3G3IA 3FVNA 4ZEKA 1B9JA 5TP9A 4ONYA 4H5FA 2I3WA 1OQGA 1IXGA 3TQLA 2R9JA 5EHSA 4PETA 4POXA 3DM0A 2ONSA 4UA8A 4PFYA 3DP4A 3S4UA 3IORA 1A55A 3PV0E 1L5TA 4PE5B 1NH7A 1PB7A 3O28A 3S9LC 3FVOA 4KI0E 2GH9A 2H5YA 3C32A 3IB1A 3G3KA 2Q2CA 2RC9A 2AYSA 2Y7IA 1ZKBA 5ISUA 3H4ZA 4XXUA 1XC1A 1SD3A 2Y7PA 1B6HA 3M8UA 1AH5A 4HCWA 3PMVA 3MW0A 3G7WA 2ZNSA 1LBCA 1T0KA 2XXRA 3BKIB 3UORA 5L9MA 3GZGA 1M5CA 3TEPA 4LQ5A 1GTKA 4DXUA 4ISUA 4JXIA 3ECRA 5JK4A 1NFTA 1MM6A 1TXFA 1FW0A 1LLSA 4FEBA 3MUQA 2I0BA 3EQ1A 1HSLA 4JDFA 4Z0IA 3RQTA 4QRZA 2ZMBA 4QFPA 2F5XA 2XXVA 1MY4A 1URGA 2I58A 3ODBA 4QSDA 4OQOA 3OSRA 3UN6A 5LOMA 4O3CA 3IO4A 4ZECA 2OCUA 4C0RA 3GBAA 1NNKA 2P2AA 3MP1A 1QVSA 1ZU0A 3IB2A 2XX7A 4P11A 1YAEA 3FXQA 1POTA 3KJTA 1DSNA 1MY2A 2XXYA 1BIYA 3CRBA 3Q25A 1RYXA 1B40A 3C9HA 1Y4CA 3IAZA 1LAFE 2XXUA 3Q29A 4G68A 1H44A 5I2NA 1MXWA 4PFWA 4U23A 4EXKA 3A09A 2ESNA 1P1QA 4ZE8A 3UA8A 4LQ2A 2D5WA 2DS9A 4UACA 2XXQA 3C31A 2XXXA 4OMBA 3W15C 3FJGA 4GQOA 1B5JA 2ALUA 5ITPA 2I4CA 3FATA 3RY3A 3OO6A 1B5HA 3VLUA 3H03A 2F6GA 3PMWA 1UIUA 1ZMGA 4P0GA 1VR5A 1M5DA 3FJMA 3RTWB 1PC3A 3OMBA 3FGSA 1B32A 1Y9UA 1SW2A 4F1YA 4MLVA 1JVXA 3SEYA 1JEUA 5FHOA 3K01A 1FTKA 4P0IA 1Y20A 4KQPA 4NMYA 4ZEIA 3UK4A 2ONRA 2OK2A 5TPAB 3OENA 3TCHA 4H5GA 2I48A 1US5A 1A8EA 2RCAA 2PVUA 5CBRA 4PP0A 3VXCA 1CB6A 3C34A 3U72A 1FQFA 5DTBA 1SW4A 2HCAA 2V3QA 4ND9A 2DWHA 4H67A 3KGCA 5I84A 5H8HB 3K1MA 1B2HA 4HS7A 4EF1A 1Y1MA 3O97A 2NUVA 3BFUA 4R6HA 1A8FA 3TTMA 5AE4A 1B3FA 3VLWA 3T9VA 5DVIA 4U2RA 1I6AA 4IY6A 3N26A 1MY3A 2ZYNA 3M3KA 4R6KA 3DP6A 3B6TA 1A7LA 4XKNA 1N04A 5KCJA 3O6HA 3EHTA 3VVFA 3T9UA 3C36A 3O29A 2ANJA 1IUDA 4QFNA 3Q26A 1N76A 2HAUA 1RKMA 3PD9A 3KSXA 2Z23A 4JSOA 3HN0A 4IO6A 1Y1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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