1SW5A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in the ligand free form
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
total genus 97
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw5A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw5A02
1NL5A 4UA8A 3QK6A 3VFJA 3WAFA 4WKMA 3CIJA 4P0GA 3SEUA 1BKAA 4POXA 4YKPA 5CBSA 1EZ9A 3VVFA 1FQBA 1MY2A 2R6GE 3TZAA 2DWJA 4ONYA 3PUZE 4OFJA 1FQFA 3T9VA 5M2VA 3O6GA 3B6TA 1SI1A 4QFPA 2DWAA 3QXMA 1FQDA 1PEBA 4PETA 4N13A 4KQPA 4GF8A 2DE4A 4F2OA 5IAIA 1F9BA 1Y3PA 4FEDA 3TODA 3S9LC 1MY1A 4JXIA 4G77A 3TQWA 3TTMA 2V25A 5FHOA 4EQ9A 3DELB 1KWHA 4YMBA 3S9MC 2O7UA 5CMCA 4PE5B 3RGYA 4EUOA 1A99A 1EH3A 4ZEFA 4X1DA 5EHSA 4R75A 1ZU0A 3IR1A 4MBPA 3A3UA 2XXXA 4P11A 4NF6A 2I3WA 2ZNSA 3JYRA 1VSOA 3B6WA 3C9HA 5CRYA 2ZNUA 1IXGA 1USYH 4QSCA 3EPEA 5I56A 3N26A 4ELRA 4PFUA 1MXXA 5DTBA 1EU8A 4GXAA 5AA3A 3PGFA 4ZEKA 1O7TA 4PP0A 3ZKLA 1I6QA 3C31A 3MPLA 1URSA 3CFXA 3SEVA 1ZLQA 1VE4A 1XS5A 3VLVA 3T9HB 4UACA 3MZ1A 3OELA 4R9GA 1O63A 2ZYOA 3PMVA 4R9FA 5F1QA 1MPCA 2Z8FA 3IK6B 1GR2A 3M3KA 4ZEIA 3K6UA 2QRYA 2V3UA 4G8NA 2I4BA 3I6VA 4XKRA 4C1UA 1AH5A 2ZXTA 5ITOA 1TWYA 2THIA 1AOVA 5AA2D 5CI5A 4NF5B 1RYOA 5KZTA 3U94A 4U23A 1QUIA 1OLCA 2PT1A 2VP1A 2OWTA 2Z8EA 4OETA 2XD3A 2DWIA 1OQGA 2GH9A 2WKYA 1QJMA 3CSGA 4OHNA 3EHSA 4U2RA 4NF8A 5CBRA 4G68A 3IB2A 1LSTA 3LR1A 1EZPA 4ZEDA 3HN0A 1LCFA 1D4NA 5JTYA 3LBSA 4MLVA 3MP6A 4GIZA 3A09A 4OEVA 2I6EA 3FUZA 1MH3A 1POTA 3T9XB 4IGTA 3MP1A 1D9YA 3MC2A 4JSDA 3RTWB 1N04A 3UORA 5F7VA 3FXQA 3O9PA 1JETA 2HQ0A 3UK4A 2F8DA 4OZ9A 2B3FA 4BLAA 3K0VA 4AB5A 5B7DA 1OIBA 1BP5A 3EHTA 4MLQA 1IXHA 2G29A 3C33A 4DIGA 5K2XA 1Q1KA 1B7HA 2FYIA 1VFDA 1IQ7A 3IB0A 1LFHA 1QKAA 3VLWA 3F11A 5TPAB 1LCTA 3SDFA 1LAGE 3FVGA 4EQ7A 3OENA 2Q88A 2D5WA 5I2NA 1M5BA 3G3IA 5A5XB 4THIA 1P1UA 1DTGA 1US4A 3RT6B 3RT8A 4DLDA 2RC9A 1LFIA 5KDTB 3H6UA 3KJ7A 1WODA 2QS4A 1FTOA 4FE8A 3CRBA 3SEYA 3PPQA 3MUQA 3USDA 3K00A 4M1VA 1MY4A 3TTLA 4QFOA 1YAEA 2Q9TA 3EHUA 4NWCA 3U1OA 1NKXA 4IO2A 3QUFA 1LAHE 4R6HA 1DPPA 4F2QA 2P0SA 4YZZA 1S9TA 1MG1A 5AE4A 1MQHA 4G68C 1Y3QA 1B52A 4EF1A 2UXAA 2XX7A 3PUXE 3HO7A 2UYEA 3O6HA 3FXRA 2ONKE 4GXSB 1OLAA 4WEPA 2V93A 1QUKA 1UTHA 1URDA 4F31B 5L9OA 3KJTA 1M5EA 4ELOA 2A5TB 3ZS6A 1MRPA 5I57A 1XVYA 4OEUA 2P1SA 1HSJA 4Z7EA 1LB8A 2QSXA 4BDOA 2Y7PA 4NF8B 4FATA 4H0WA 4M4GA 4PFTA 5BUUA 2Y7IA 5ISUA 2F97A 2NXOA 2OJTA 5JTYB 1N0TA 3MZBA 5H8FA 3EF7A 1BLFA 1GVCA 4L17A 3RNNA 3RY3A 3O6IA 1MQGA 4ND9A 1B51A 4KCDA 3RLFE 1FQAA 3PPRA 3G3HA 5CMBA 4QFKA 1LGBC 3KEIA 1NNPA 1LFGA 3FVNA 3UIFA 1B5IA 4LATA 3B7DA 3FJGA 3KOTA 4YICA 4GRKA 3EN3A 3RQTA 4FORA 1Y20A 3TFLA 1FTKA 3OMBA 4LQ5A 3O29A 3HCQA 4YAHX 2Y84A 4IY6A 3JZJA 3OOAA 1QUJA 4O3BA 1B7ZA 3SEXA 2OK2A 3U93A 5I2NB 2XD2A 3U8QA 3AXFA 5ICQA 4FECA 1H43A 3MVXA 4KD5A 3N5LA 2D21A 3S9EA 4OERA 1ZIUA 1ZKBA 4POWA 2O6AA 4NMYA 4H5GA 3OEMA 1XVXA 4OESA 5CMKA 4RPOA 5LOMA 1AL3A 3OO6A 1L5TA 1LBCA 1NH7A 3IO6A 3OO9A 2PMSA 5H8NA 1FTJA 2PBWA 2FNCA 4LQ2A 3H6VA 4H6DA 3K01A 3CVGA 4ESXA 3VLUA 5EHMA 3K4UA 5BWJA 1Y1ZA 2O1MA 5DVFA 3H7MA 2OCUA 3JV9A 4KYDA 2PT2A 4KYEA 1B0LA 3IOUA 4GL0A 1II5A 3KN7A 4IO6A 4IY5A 1MXZA 2AL4A 1US5A 4F29A 3TUSA 2OBGA 3S9NC 3K6WA 5KCJB 1UTHB 1UTBA 1SD3A 2UVHA 1LB9A 4DXCA 4HS7A 1DOTA 4ZZEA 1JW5A 2YJPA 1FW0A 2DOJA 1FTMA 3HV1A 2BJJX 1LAXA 3MBPA 1LLSA 4R73A 5I57B 1PBQA 3MWBA 2PVUA 3D4GA 3S4UA 2DYXA 3MAMA 3MVYA 2VGQA 4I62A 3PMXA 3TAJA 4NF4B 2XX9A 4TQUQ 4EXLA 3K1PA 5H8HA 1MXUA 4QSEA 1AMFA 4F1VA 1ZTYA 4EQBA 2O68A 1JW1A 1Y1MA 4ESWA 1TFDA 1A54A 3U72A 1ATGA 3H6WA 3FJMA 4U1ZA 1B1HA 4JWYA 2ZMBA 3R7XA 4HTGA 1YPNA 4ISUA 3OSQA 2DE3A 3SETA 2ANJA 3KG2A 1H76A 3N6TA 3KN8A 1NFTA 2DXRA 3QAXA 2NWJA 3ZKKA 4OWDA 2XXQA 3E9XA 5I59A 1P1OA 3V8XB 4RNSA 4QFNA 2DXYA 4RPNA 3GLBA 5TP9A 2GRVA 4BDQA 4DXUA 5JK4A 1ZJLA 2RINA 3PD9A 3LSFB 4U4SA 2R9JA 1JVXA 3H03A 5I58A 1IXCA 4XXUA 1XC1A 2I3VA 4MFIA 2OLBA 3K02A 3E13X 1JEUA 2I0BA 1MQIA 2VD3A 4PFYA 2HAUA 3T93B 4F22A 4WEDA 2F7AA 4U22A 3GBBA 5J1DA 2P2AA 1EZOA 1M5DA 3MVZA 4RK2A 1BTJA 2AIXA 1I69A 3VVEA 5IKBA 3BFUA 1JQFA 3Q26A 2F36A 3MPKA 1R1NA 1R6ZA 3HHFA 4RA1A 4NE4A 2XXHA 3TTNA 2H99A 3H4ZA 1VFEA 4QRZA 2UVIA 4MF3A 5H8NB 1CB6A 1PB7A 3LSWA 4G8HA 3W9VA 2RKMA 3IB1A 1N76A 5JEIA 3EQ1A 4KCCA 2V3QA 4GWOA 2QS3A 3LSLA 5HM4B 4DZ1A 2DVZA 5B70A 5DYHA 5AA2A 4H5FA 1IZ1A 1GGGA 2DS9A 2ONSA 1A40A 3O28A 4O3CA 3HPIA 3UN6A 3IL1B 1N7XA 1UTBB 4LZ5A 4GFRA 5DVJA 3TELA 5ELVA 1XOCA 5AA4A 4JDFA 4NF6B 4JB7A 2GFEA 3SEWA 3TCHA 2H25A 2YPNA 3G3JA 4ZZAA 4AQ4A 1Y4CA 3HSTA 3MQ9A 4ZEBA 4K3FA 4GLIA 4ZE8A 2XX8A 4OENA 2UVJA 4ZE9A 5I56B 4YB5A 2DQVA 1D9VA 1LBBA 3PPOA 3LSXA 2ZYKA 1Q35A 1P1QA 1R9QA 4I9DA 5H8HB 3RTFB 1SYIA 3RN8A 1PB8A 1SW1A 4ZDMA 1P99A 3H3GA 1B3FA 3OEKA 1URGA 1NMUA 3T66A 4XTCQ 3KGCA 4DDDA 3N94A 4N6PA 1N3XA 3C32A 4BDNA 1A8FA 1I6AA 3W9WA 2GHBA 4ELQA 5ITPA 1FTLA 3PMWA 3VXBA 5I2KA 1PBPA 4QF9A 5TP9B 1XHYA 1Y4TA 2DWHA 5DVIA 2I49A 4XIGQ 1M5FA 5H8QA 3ZSFA 1B2HA 3UA8A 1FQEA 1QW0A 4G68B 2XXWA 3CFZA 1B05A 1MY3A 5FHNA 1S7YA 2H9BA 1IIWA 4DE8A 2HAVA 1VR5A 1XT8A 2H98A 4MH5A 2O51A 2F6GA 3N6UA 3A3CA 3H6TA 4E0WA 4C0RA 5DEXA 1MH4A 1RKMA 2REGA 1WDNA 1ELJA 4QHQA 3V83A 2I48A 3T22A 4U4XA 1MXWA 4YKKA 4YKIA 2GHAA 4FJPA 1LAFE 1HSLA 1H3DA 1B3EA 4XKNA 1SW4A 1I6BA 4NWDA 4ECFA 3O97A 4ZS9A 2I0CA 1M5CA 4XKPA 4JWXA 4YB6A 4G4PA 4NF5A 3KSXA 1JW4A 1NH8A 3LC8A 4FIMA 1PC3A 2F35A 3FGSA 1MY0A 1MS7A 3R26A 1A55A 3L6GA 2H4IA 2VOZA 3FATA 3PD8A 1MXVA 3BKIB 3K2DA 3TCGA 3C34A 3B6QA 1H45A 3TTRA 2HEUA 2ABHA 1OQHA 3FIRA 3CR9A 4F1YA 2ALUA 1D3KA 1NNKA 2I4CA 1MM7A 4X1BA 4DCXA 4IGRA 1GV8A 3DP8A 1NNTA 1B4HA 5AA1A 3G7WA 2VHAA 1YTVA 1ZMGA 1WVJA 4RY1A 4DXBA 2R71A 1B3HA 4TLLB 2PYYA 4BDMA 1NNFA 4QFLA 4F18A 2DE2A 3TTKA 3PV0E 2RF1A 3MZ9A 2Q89A 2E1SA 3DM0A 3TQLA 3V5AA 4H1XA 5I84A 4H67A 4YB7A 4LZ7A 3THIA 3ONMA 4IB2A 4X48A 3IJXB 3KSJA 1CE2A 1TXFA 3PUWE 3HHGA 1N7WA 3TCFA 4Q8RA 4Z0IA 1FQCA 3ILUB 1B40A 2CZLA 2ZYNA 3SKPA 3ECRA 4RJZA 3OXNA 1OVTA 3IJOB 1B0HA 4JBZA 4R6KA 5L9SA 1USYE 1MDP1 3QIMA 1HSEA 4RK9A 3P7IA 2YLNA 3UGWA 5TPAA 2O7IA 3RPWA 4QSDA 1B5HA 3O2AA 5I2KB 2RC8A 5CMMA 4G8MA 2IEEA 3TMGA 1YCJA 2ZYMA 3QUJA 4FEBA 3O66A 1B46A 5CC2A 1B3LA 3H06B 3L6HA 5A5XA 2DVCA 5H8QB 2G93A 1MQJA 3MP8A 2DP8A 4F19A 4EXKA 3MW0A 1Z7NE 2X7PA 5KDTA 1POY1 1DSNA 3ILTB 4P0IA 3U92A 1QVSA 1AIVA 2E0SA 4O3AA 2IA4A 3DLNA 3VV5A 3TDJA 3G3FA 4NEDA 5H8FB 3Q28A 1IITA 2FA7A 2HFBA 1QKBA 3FZVA 3IOTA 4TOZA 2Z22A 1GTKA 3PPPA 5DEXB 3IAZA 2Z8DA 2O69A 3CG1A 5DT6A 3CSBA 3IO4A 5H8SA 3K1MA 3LUYA 1UIUA 2XXUA 2QL3A 1ZBMA 4BDRA 4I8CA 4OQOA 3I3VA 3PPNA 1DMBA 2QMXA 3TYHA 1O64A 4ZECA 2Y7KA 2V84A 3RUMA 1JEVA 3K1NA 4GOTA 3IORA 2A5SA 1N84A 4GD5A 2Q2CA 4YMAA 3E3KA 2AYSA 4RXLA 1A8EA 4LZ8A 3OO7A 2B3BA 1P1WA 2A5TA 2HXWA 4R74A 4TLMB 3W15C 1IXIA 2XXTA 1SW2A 2Q2AA 1SI0A 4JWOA 3K6XA 1MM6A 4HCWA 1UIVA 3PUVE 3D4CA 4R72A 4IO5A 5FTHA 4F3GA 4GL8A 2OZZA 3BFTA 1BIYA 5FHMA 3QYTA 1MPDA 1N3WA 3C36A 2XXIA 4H8IA 4XKQA 4GQOA 4HW8A 4F3BA 2OWSA 1OVBA 2KLFA 3M8UA 3E4RA 4PFWA 5ICTA 4LONB 4OFLA 2W7YA 4JSOA 1SBPA 3M3LA 1SDXA 2AL5A 3DP4A 1SW5A 2Y7WA 4N07A 1S50A 3FV2A 2F7BA 3T96B 4LP2B 2XHDA 3SESA 4C1TA 3TKDA 4OYVA 3S2VA 4WXJA 3DP6A 4BDLA 1OMPA 3IOVA 3M3FA 3IOWA 4F3SA 1RYXA 2NOOA 3C35A 3C4MA 5L9MA 4E0XA 4EDPA 2NVUB 3TEPA 3SERA 2NUVA 2ESNA 2QJEA 5CM6A 1SVXB 4IO3A 5EYFA 3Q25A 4PQJA 3TPAA 3I5OA 1B4ZA 4IO4A 4KHZE 1JVYA 1PDAA 2ONRA 2H5YA 4R2BA 3MVWA 2F7CA 4OXVA 1SYHA 4GVOA 3FV1A 1T0KA 3KBRA 1A7LA 1B58A 1B3GA 3WAEA 3KOSA 5HPQA 2RC7A 4LVQA 4R6YA 4OVJA 4KYSA 4OMBA 4YU0A 3Q27A 1TT1A 4OFOA 4YKJA 2RCAA 2XXRA 5TU0A 2F34A 4IO7A 2QS2A 2VD2A 4G2ZA 1B5JA 4Q5TA 1MQDA 2QMWA 1FCKA 3QSLA 3OSRA 3IX1A 1J1NA 4KI0E 5FTIA 4FAJA 3GZGA 3VE1B 2UVGA 3GBAA 1JNFA 4H65A 3PUYE 3CI8A 1SQYA 5I59B 4Q30B 3FXUA 5KCJA 2QS1A 3KFMA 2O84X 4X9TA 4U1OA 4I1DA 3R6UA 1DTZA 2HCAA 4KPTA 2X26A 3FJ7A 2Z23A 5I58B 1R9LA 4H8JA 2F78A 2REJA 4R2FA 1B6HA 3G3GA 2F6PA 2RCBA 3OO8A 1MXYA 2V3TA 3V89B 2HZLA 3GXAA 1QULA 3CFLA 4NF4A 2XXPA 5K2YA 1UQWA 3K6VA 1Y9UA 3FASA 2CMOA 1MPBA 1P1NA 1Y3NA 3ODBA 1IUDA 3OD7A 2X7QA 2QPQA 4F39A 3KN3A 4KFQA 2ZNTA 2HZKA 4F1UA 4NTLA 3UP9A 4Q0CA 2UYFA 2PX1A 3PU5A 3VVDA 1ANFA 1B32A 2DSFA 3G3KA 1H44A 3FVOA 4RYAA 4ELPA 3FVKA 2F5XA 3Q29A 3MJNA 1MDQA 2XXYA 2LAOA 2I58A 1B1XA 2B65A 2Q8JA 1DPEA 1PB9A 4HCYA 5L8DA 5AA2B 4U21A 2M8CA 5HBCA 3KZGA 1B9JA 1IEJA 4EF2A 3FD3A 3BBRA 4LUBA 4OTEA 1B7UA 1TFAA 1Z7ME 2Y7RA 3VXCA 4LA9A 4DCYA 4F3PA 4KR5A 3T9UA 5AA4B 2O1LA 2XXVA 3VDFA 4AB6A 3CG3A 2D3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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