1URGA

X-ray structures from the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQKGIMAQGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Maltose-binding protein
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
total genus 120
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1urgA01
3MVWA 4PFUA 4XKRA 1MY0A 2ESNA 3USDA 4RK9A 3T66A 5I58A 1SDXA 2RCAA 4U1OA 4PFTA 4DE8A 3KFMA 2DYXA 1B3GA 1T0KA 3VVEA 1TFAA 2Z22A 2X7QA 3MZ9A 4LVQA 3IK6B 4Z0IA 3GBAA 3KN3A 2ZNTA 1POTA 3MP6A 4I62A 4OFJA 5M2VA 2HXWA 3IX1A 4K3FA 1B5JA 4IY5A 3ZKLA 3SEVA 2ZMBA 4FEDA 2QS2A 4QHQA 5DVIA 1ZMGA 4KYSA 5FHMA 4G2ZA 1MXWA 1DOTA 3RQTA 3KOTA 1IXHA 1ZKBA 1IIWA 4X1DA 4U4SA 4U2RA 3KSXA 1FQEA 2ZXTA 2G29A 1SQYA 2I6EA 4H5FA 2VOZA 1VSOA 3RNNA 5K2YA 4FORA 1MPDA 3N6UA 5B70A 4EQBA 2Q2CA 3M3LA 2E1SA 4JWXA 2XXUA 3I6VA 3K1PA 1LBBA 3O28A 4ZEKA 2DS9A 4GVOA 3PD9A 4JXIA 1B58A 1LAFE 5EYFA 2O7IA 4O3CA 4ESXA 3C34A 3OD7A 3HO7A 1MM6A 1ZJLA 4E0XA 1DSNA 3T9VA 4G8HA 4ZEBA 1MG1A 3FXUA 5KZTA 2YLNA 3QSLA 1S7YA 3SEYA 3OMBA 3KJ7A 3OENA 4QRZA 1NMUA 3FUZA 1JVYA 4ELPA 4XKPA 3OOAA 4XTCQ 4FE8A 3C33A 4OFLA 1IXIA 4X48A 1URDA 2GHBA 5I57A 1PC3A 3A3CA 1JETA 1NNTA 2B65A 3SEUA 5TP9B 4QFLA 1EU8A 1P1WA 3IJXB 4R6YA 2QS3A 4LUBA 1QUKA 4YKPA 3G3IA 5AA4A 2XXVA 1VFDA 3R6UA 3HV1A 5JTYA 5AA2D 2GFEA 1Y4CA 3PUXE 4NF8B 1N7WA 4DXUA 1ANFA 3T93B 5DYHA 1QKBA 1UTHA 1H44A 5AA1A 4F2QA 4M1VA 1I69A 1URGA 3S9MC 5TPAA 2I4CA 1M5EA 1H76A 4WEPA 4IY6A 3UORA 1QJMA 3I5OA 2ZNSA 1Y9UA 3QK6A 2V84A 2F6GA 3BFUA 1MDQA 1ZTYA 1B3HA 2I58A 5CBRA 1B5HA 4L17A 1BIYA 3HPIA 3HSTA 4H65A 1OQGA 1LFHA 4G77A 3IB2A 4FEBA 4ONYA 3F11A 1DPEA 3E13X 4KHZE 4KPTA 5I56B 2VD2A 3CFLA 3O6HA 4NF4B 1D9VA 4HCYA 3FXQA 3CI8A 1AMFA 4ECFA 5CI5A 3G3HA 3K1MA 3JV9A 2FYIA 3FVOA 5EHSA 3K6XA 4YB6A 3M8UA 2THIA 1ATGA 1GTKA 1SVXB 4EUOA 3JZJA 3ILTB 1JNFA 5ITOA 3KBRA 2QJEA 4QFOA 4I1DA 2LAOA 3TKDA 2I3VA 2Z8EA 3K6UA 1B4ZA 2Y7WA 2ABHA 3D4CA 1BKAA 1B9JA 4GWOA 4NF6B 1OVTA 1N7XA 3T9UA 2ZNUA 4GIZA 1SI1A 4R6HA 5H8NB 3EQ1A 4OEUA 4H8JA 5CBSA 4RJZA 3W15C 3LBSA 1TXFA 1US4A 3PUWE 3QAXA 3G3JA 4Q30B 2V3QA 3FV2A 1HSEA 1B0HA 3T96B 5I2NB 1A8EA 3B7DA 3MVXA 3TEPA 1AL3A 3FJMA 3MPKA 3KZGA 4Z7EA 5FHOA 1UQWA 3WAFA 3IB1A 5DT6A 2F7CA 3CG1A 4DXBA 4G4PA 2DOJA 1MQDA 1I6BA 4POWA 3IO6A 3RPWA 4C0RA 4G68A 2R6GE 5I58B 3PPRA 3S9EA 4IB2A 4GLIA 4HW8A 4NTLA 4IO4A 4C1TA 5DVFA 3VDFA 2HFBA 4GFRA 3DP4A 5H8QA 2CMOA 4IGRA 4LQ5A 2QMXA 4JSDA 1PB8A 4UA8A 4RY1A 1B3EA 2E0SA 3FVKA 2DWIA 2AL5A 3TPAA 2Q89A 4F2OA 4F1YA 5FTHA 2QS4A 3RLFE 1MH3A 1A7LA 5AA2A 3PUZE 3N26A 5H8SA 2I4BA 5CC2A 3KN7A 3UN6A 3S2VA 4KFQA 4MLQA 2PBWA 5CMKA 4OETA 2DWJA 2XXPA 3CG3A 4ESWA 2O1LA 4KI0E 4H67A 5FTIA 3KSJA 5I59B 4N07A 4XIGQ 2ALUA 1F9BA 1AOVA 1B05A 5KDTB 3C9HA 1GV8A 3G3GA 1D4NA 3K01A 3K6VA 2F78A 5I2KA 3WAEA 1MXUA 2ONKE 3Q25A 2O69A 1CB6A 4MLVA 1Y4TA 3KN8A 4N6PA 4ND9A 4IO7A 1B52A 1IZ1A 1UTBB 4MH5A 3EN3A 5BWJA 2B3FA 3H06B 3SESA 2YPNA 3FJGA 1MQHA 5HBCA 3TTLA 3VVFA 4KYEA 3TFLA 1H43A 2IEEA 3O66A 2F7AA 1FW0A 4OEVA 3VFJA 1A54A 2H99A 3PPNA 3FXRA 3Q27A 3Q28A 1FTKA 3KG2A 4OWDA 4P0GA 1PBPA 3CFXA 4YMAA 3VLVA 4ZE8A 4X1BA 3I3VA 3O6GA 1SBPA 4U22A 4F31B 2I0BA 4KCDA 3THIA 1LCTA 3OO9A 1ZBMA 4BDMA 3V89B 3IO4A 3Q29A 1B0LA 4EDPA 5AA4B 3TTMA 2Q9TA 1XC1A 3H6UA 4JDFA 3OELA 3VLWA 1MY2A 1XOCA 3H6VA 4KYDA 4G8MA 1YAEA 4RPOA 4BDLA 3C31A 1B7HA 3K6WA 1Y1MA 1DPPA 1Y3PA 3OO8A 1SW1A 4NF5A 1M5FA 1TWYA 4LZ8A 4QFNA 1SYIA 5HPQA 5TPAB 1LB9A 3B6WA 2XHDA 2ZYKA 3H6WA 4U4XA 5H8FA 1NL5A 3TAJA 3HHFA 2Y7RA 1OQHA 3IOUA 3G3FA 4MBPA 1LFIA 1GR2A 4U21A 1JEUA 1B2HA 4BDRA 1SW2A 2UXAA 3K02A 1Y20A 4OFOA 4F3PA 3H3GA 2DVCA 1MPBA 2CZLA 5TU0A 4GL8A 5IAIA 4DLDA 4F39A 3LC8A 2VHAA 3H6TA 4OQOA 4YMBA 1TT1A 1EZPA 4F29A 3T22A 3SERA 4WEDA 3H4ZA 1Y1ZA 4XKNA 2R9JA 3DP6A 4DIGA 3R7XA 3MZBA 3CSGA 4KD5A 3TQWA 3QXMA 3FVNA 4GQOA 2PT1A 4KCCA 2XD3A 4LQ2A 1IQ7A 1VE4A 1P99A 3EF7A 1B40A 2RF1A 1XS5A 2ZYMA 2XX7A 1B4HA 3G7WA 3V8XB 1OIBA 4GOTA 3LR1A 2QSXA 2P2AA 5DEXB 4ZDMA 4EXKA 1PBQA 3PMXA 4F18A 3SDFA 2OZZA 2DP8A 2R71A 3LSWA 2Q88A 2AIXA 2GH9A 3KGCA 1WDNA 5H8HB 3IOVA 4RYAA 3QIMA 3RT6B 3TCHA 5B7DA 4WKMA 3LSXA 3W9WA 4ZZAA 2D5WA 4QSDA 1BP5A 1DMBA 1N04A 3TTKA 1HSLA 3GZGA 4F1VA 5A5XA 5FHNA 5K2XA 1MXZA 1JW4A 4R73A 2V3TA 4RNSA 1R6ZA 4F3GA 1DTZA 3VXBA 4Q8RA 2UVJA 3CRBA 3TODA 4IO6A 3KOSA 4TLLB 1QULA 1A40A 4H8IA 5AE4A 2Y7KA 1IXGA 4EQ9A 4G68B 4OXVA 3RT8A 4ELRA 1MPCA 4Q0CA 1FTOA 1XT8A 2IA4A 3T9XB 4BLAA 3DM0A 4AB6A 3TELA 3TQLA 3O97A 5H8QB 4TQUQ 1J1NA 4PQJA 1Z7NE 3OO6A 2F8DA 2A5TA 4IO2A 1O63A 2BJJX 5I84A 4OZ9A 5AA2B 4Q5TA 1LSTA 2ZYNA 1MQGA 4R2FA 2Y7PA 1B46A 3C35A 1YCJA 2O68A 3KJTA 1LGBC 1UIVA 4FECA 2RCBA 2YJPA 4AQ4A 3QYTA 3LSFB 2DXRA 3L6GA 1JW5A 4LP2B 2RKMA 4OENA 3SEXA 3PMVA 2I49A 4DZ1A 1N0TA 1LBCA 1QUIA 3K2DA 2I48A 4QSEA 4U1ZA 4ZEFA 4EF1A 1L5TA 4OYVA 1EZOA 5KCJA 4F1UA 3T9HB 3TZAA 4AB5A 4NMYA 1SW5A 2O6AA 2F35A 1POY1 5CMBA 1SYHA 4BDQA 1LAXA 2OLBA 3N6TA 3KEIA 3ECRA 4OHNA 3FASA 1MRPA 5BUUA 2DSFA 4FATA 3MUQA 4GXAA 1I6AA 2QPQA 5F7VA 2NXOA 3RTWB 3FIRA 2OJTA 2H25A 4H5GA 1NFTA 1II5A 3VXCA 2P1SA 1RKMA 3L6HA 4JBZA 1B51A 1P1UA 5I56A 1IXCA 1FQCA 1B5IA 1P1QA 4RXLA 3CVGA 2V25A 3OXNA 3ZSFA 1PDAA 2QS1A 4RPNA 3MC2A 4KR5A 4DDDA 2F34A 1ZU0A 3A09A 5L9SA 5L8DA 3K1NA 2I3WA 4GXSB 2OWSA 2W7YA 4ZEDA 5CM6A 2PX1A 4DCYA 2D21A 3PGFA 1YPNA 1Q35A 1MXYA 2NWJA 3MP8A 1TFDA 3MP1A 4F3SA 2D3IA 1P1OA 2DXYA 2H5YA 3UK4A 3FV1A 2V3UA 5DVJA 4R6KA 3OEMA 1ZLQA 3IL1B 1PEBA 2PYYA 3TYHA 4G68C 3UGWA 3U72A 5J1DA 2ZYOA 3C4MA 4HCWA 5H8FB 4NWDA 2H4IA 2P0SA 3FJ7A 2RC7A 5I2NA 1OVBA 1MXVA 3IR1A 2FA7A 4PFYA 2DE4A 3ONMA 1I6QA 4R75A 4DCXA 1D9YA 3BKIB 5AA3A 1IITA 4I9DA 4H6DA 3G3KA 4BDNA 3S4UA 1N76A 1Y3NA 2XXYA 4NEDA 1QW0A 3B6QA 3TCGA 3S9NC 1FQBA 5DTBA 2QL3A 2UVHA 1B7ZA 2HEUA 5HM4B 1VFEA 4U23A 2F97A 2F36A 1MQJA 2XXIA 5I57B 3GXAA 3FVGA 2X7PA 1FQFA 1SD3A 4KQPA 2Q8JA 1MY3A 1RYXA 3M3FA 1LCFA 4HTGA 3FGSA 3V83A 2HAVA 4QFPA 2UYFA 1B3LA 3ILUB 1A99A 2AYSA 3C32A 1USYH 1ZIUA 2O1MA 2NUVA 1R9LA 1NNKA 4BDOA 4F19A 4ZEIA 4DXCA 4O3BA 4FIMA 2DQVA 3D4GA 3RY3A 3AXFA 3FATA 1OLAA 5JTYB 2FNCA 4H1XA 2ONSA 2OBGA 2O84X 4H0WA 1B7UA 4WXJA 1QVSA 2QMWA 1PB7A 4THIA 3VVDA 4JWYA 4R74A 1UTHB 2O51A 2OCUA 3EHSA 5I59A 2DWAA 1S50A 1B1HA 1M5DA 1UIUA 4JWOA 3EHTA 1WODA 5KDTA 5A5XB 2REGA 4QFKA 1A55A 4YU0A 4PP0A 2OWTA 1H45A 1AIVA 4OVJA 1FCKA 3FZVA 4NWCA 4YKJA 1MS7A 3O29A 4LATA 1JQFA 2F6PA 3A3UA 4MF3A 5LOMA 2WKYA 4GD5A 1UTBA 1EZ9A 2RC8A 4EF2A 2XXXA 3TUSA 3GLBA 1JEVA 3O6IA 4JB7A 4GF8A 3Q26A 1ELJA 2H9BA 3RUMA 1LFGA 2PVUA 2DE3A 1Z7ME 2Y84A 3C36A 5ICTA 3CIJA 2A5TB 1MH4A 1B32A 3UIFA 3MBPA 4ZS9A 3QUFA 2XXRA 3OSRA 3OEKA 3ODBA 5ISUA 1MM7A 3DP8A 2B3BA 1FQDA 4O3AA 4YICA 4GL0A 4ZE9A 1R1NA 2PMSA 1GGGA 4FJPA 1QUJA 4GRKA 1MY4A 2XX8A 3PMWA 1KWHA 4R72A 1N84A 4PETA 4ZECA 2ONRA 4POXA 1H3DA 3K0VA 1CE2A 1FTLA 1O7TA 1GVCA 1S9TA 3RTFB 2M8CA 5ELVA 3MWBA 2XD2A 1VR5A 2H98A 1MXXA 3MAMA 4XKQA 4R9GA 1IEJA 2Y7IA 4YZZA 1D3KA 1FTMA 5KCJB 2UVIA 4R9FA 1QKAA 1JVXA 3CR9A 5JEIA 3VV5A 3U8QA 4X9TA 1YTVA 3N94A 1US5A 1LAGE 1B6HA 3SETA 3MQ9A 3K00A 1N3WA 3E3KA 3TTRA 1NNFA 5CMMA 2X26A 4RK2A 3CFZA 3VLUA 4UACA 1XVXA 4F3BA 1A8FA 1URSA 2HQ0A 4YB7A 4LZ5A 1R9QA 2RC9A 5EHMA 1NH7A 2XXQA 3MVZA 4YB5A 2HAUA 3U94A 2VGQA 3LUYA 4NE4A 2GRVA 2NOOA 4QSCA 4PFWA 3RN8A 2Q2AA 1M5CA 3SKPA 4EQ7A 4P0IA 1LLSA 2HZKA 2XXTA 3MVYA 2KLFA 5ITPA 5TP9A 1OMPA 1EH3A 4IO3A 4EXLA 3N5LA 3GBBA 2NVUB 4I8CA 2Z8DA 3TDJA 2PT2A 4P11A 3ZS6A 1BLFA 3UP9A 4OTEA 1Q1KA 4OERA 3O2AA 3MPLA 3OO7A 3U93A 5DEXA 1O64A 1SI0A 3IOWA 5CMCA 3DLNA 4NF8A 5H8HA 3FD3A 1NH8A 3R26A 3MW0A 2DE2A 4ELQA 3U92A 3IOTA 5I2KB 4MFIA 1HSJA 3BBRA 4OMBA 1FQAA 1IUDA 3LSLA 4ELOA 2OK2A 3B6TA 1B3FA 1NKXA 2Z8FA 2G93A 2GHAA 3V5AA 2VP1A 3IJOB 3IAZA 2ANJA 1JW1A 3PPOA 1LB8A 3O9PA 2F7BA 3S9LC 1PB9A 1B1XA 1MQIA 3K4UA 3H03A 3JYRA 1N3XA 1XHYA 3IORA 4YKKA 2I0CA 1P1NA 2HZLA 3HHGA 2A5SA 3PU5A 5F1QA 2F5XA 4YAHX 4N13A 4NF4A 3DELB 5L9MA 2RINA 4C1UA 4PE5B 3PPQA 1MY1A 2HCAA 4OESA 3OSQA 3EPEA 1MDP1 3H7MA 3PUYE 2DWHA 3EHUA 4TLMB 3BFTA 3CSBA 1OLCA 2VD3A 4R2BA 5L9OA 4FAJA 3MJNA 4LONB 4TOZA 4G8NA 4YKIA 1FTJA 1RYOA 5IKBA 1M5BA 4XXUA 4E0WA 1DTGA 1BTJA 1LAHE 2XX9A 3TCFA 3P7IA 4QF9A 4NF6A 2O7UA 2V93A 4JSOA 3IB0A 2UVGA 3W9VA 4ISUA 3M3KA 4RA1A 3E4RA 4LA9A 5H8NA 2AL4A 1XVYA 4ZZEA 4IGTA 5ICQA 3UA8A 3SEWA 4NF5B 1NNPA 3PD8A 1USYE 1SW4A 1AH5A 3PV0E 2XXWA 3HCQA 3TTNA 3TMGA 4F22A 1WVJA 3RGYA 2XXHA 3MZ1A 5JK4A 2QRYA 2UYEA 3HN0A 3VE1B 2DVZA 1Y3QA 3E9XA 3QUJA 5CRYA 3ZKKA 2REJA 3PUVE 4M4GA 3PPPA 4LZ7A 4HS7A 4IO5A 3U1OA 2Z23A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MVWA 4PFUA 4XKRA 1FPEA 1MY0A 2ESNA 3USDA 4RK9A 3T66A 5I58A 1SDXA 2RCAA 4U1OA 4PFTA 5ESYA 3KFMA 4DE8A 2DYXA 1B3GA 1T0KA 1FPDA 3VVEA 1IMDA 1TFAA 3FXBA 2Z22A 3PTYA 2X7QA 3MZ9A 4LVQA 3IK6B 4Z0IA 3GBAA 3KN3A 2ZNTA 1POTA 2B4LA 3MP6A 4I62A 4OFJA 5M2VA 2HXWA 1G0IA 3IX1A 4K3FA 1B5JA 4IY5A 3ZKLA 3SEVA 2ZMBA 4FEDA 2QS2A 4QHQA 1BK4A 5DVIA 1ZMGA 4GWSA 4KYSA 1NUXA 5FHMA 4G2ZA 1MXWA 1CNQA 1DOTA 3RQTA 3KOTA 1IXHA 1ZKBA 1IIWA 4X1DA 4U4SA 4U2RA 3KSXA 1FQEA 4MJOA 2ZXTA 2FIXA 2G29A 1SQYA 2I6EA 4H5FA 2OWZA 2VOZA 1VSOA 3IFCA 3RNNA 5K2YA 4FORA 1MPDA 3N6UA 5B70A 4EQBA 2Q2CA 3M3LA 2E1SA 4JWXA 2B4MA 2XXUA 3I6VA 2WBDA 3K1PA 1LBBA 3O28A 4ZEKA 2DS9A 4GVOA 4P1EA 2VPNA 2GQ1A 3PD9A 4JXIA 1B58A 2XWIA 1LAFE 4PFBA 5EYFA 2O7IA 2R8TA 4O3CA 2XWVA 4ESXA 1LBVA 3C34A 3OD7A 3HO7A 1MM6A 1ZJLA 4E0XA 1DSNA 3RPLB 3T9VA 4G8HA 4ZEBA 1MG1A 3FXUA 5KZTA 2YLNA 3QSLA 1S7YA 3SEYA 3OMBA 3MYUA 3KJ7A 3OENA 4QRZA 2FIEA 1NMUA 2WX9A 3FUZA 1JVYA 4ELPA 4XKPA 4GWWA 3OOAA 4XTCQ 4FE8A 3C33A 4OFLA 1IXIA 4X48A 1IMCA 1URDA 2GHBA 5I57A 1PC3A 3A3CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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