1VFDA

Human lactoferrin, n-terminal lobe mutant with arg 121 replaced by glu (r121e)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRETAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutation of arginine 121 in lactoferrin destabilizes iron binding by disruption of anion binding: crystal structures of R121S and R121E mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 81
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA02
3QXMA 2NOOA 4FEDA 3B6WA 3TPAA 2XX9A 4F3PA 2ZYNA 4YZZA 3FATA 3H06B 3MVZA 4NF8B 4NF5B 5AA4B 3TELA 1URGA 3CG1A 1Y3NA 1WODA 5I58A 3FJGA 4H5FA 1IQ7A 1B2HA 4LZ7A 1MY0A 1SDXA 4PFYA 4ISUA 4NF8A 5AA2D 5H8NA 4PFWA 5H8HB 3RTFB 1MPDA 3T9VA 5KCJA 4M1VA 4R6HA 4QSDA 1TFAA 4EXKA 1OLCA 4ZEBA 4IO2A 2I3VA 5TU0A 5I2NB 4OEVA 2F8DA 4X9TA 4TQUQ 4GXAA 2PBWA 4OERA 5H8HA 4R9FA 3K01A 4XKRA 3K2DA 4KI0E 4TLLB 1JQFA 2XXYA 1DTZA 2F6PA 4NTLA 1B40A 1MM7A 4KPTA 1II5A 3PUYE 4ONYA 3O29A 4AB6A 1PDAA 1MY2A 3K4UA 4QFNA 2UYEA 1MQHA 3ZKLA 4DCYA 2F36A 3W9VA 1A8EA 1LFGA 1FTOA 3GBAA 3KBRA 2GFEA 4I62A 3TDJA 4F3SA 3SESA 4G4PA 2ONSA 2B3FA 3IL1B 3TCGA 3K6WA 1FTKA 3RQTA 4UACA 1GGGA 1PB7A 3G3GA 3PD8A 5FTHA 4XTCQ 1ZKBA 2QPQA 1R9LA 1Y1MA 2HQ0A 4GXSB 5B70A 3HHGA 4XKQA 1FQBA 5IKBA 3FV2A 4KYSA 2VGQA 3IX1A 3TEPA 1VE4A 3K0VA 1Y4CA 2O84X 4ZE9A 3D4GA 1A55A 1EU8A 4POXA 3OOAA 2D3IA 2F6GA 3HO7A 5KDTA 1LAGE 2QL3A 4RK2A 4XKNA 4RPOA 1I6BA 3KOSA 3B7DA 4PFTA 3A09A 4LA9A 3B6QA 2ZXTA 4U2RA 4DIGA 5H8FB 1AOVA 2A5TA 3W9WA 4YMAA 1OVBA 3C34A 4H0WA 3QK6A 5H8QA 4LZ8A 1LSTA 4N07A 1BP5A 2DP8A 4JWYA 3DP8A 4ELPA 5I59A 1UTHB 3HHFA 3V89B 5CMKA 1FQCA 3CSBA 3MWBA 3TTMA 1B32A 4MF3A 3VV5A 3KZGA 3O66A 4TOZA 4X1BA 4IB2A 2OCUA 3Q27A 3VLWA 4QSCA 4PE5B 5DVIA 3KJ7A 1UTHA 4ZEIA 4OXVA 1B6HA 1WVJA 1FCKA 2XXQA 3CFZA 4WKMA 1MDQA 5JTYB 2V3QA 1ZTYA 1N76A 4G8MA 3KJTA 4XIGQ 2DS9A 2I6EA 4DE8A 3DM0A 1Y3QA 4YKJA 3G3JA 1R6ZA 3BFUA 5DTBA 1FQDA 2Q2CA 4G2ZA 2O1LA 3TFLA 3DLNA 4GIZA 1O7TA 4U21A 2Z23A 4YB5A 4XKPA 1Q1KA 3MPLA 5HM4B 3O6HA 3S4UA 1JW1A 4ZZEA 4N6PA 1IIWA 1NKXA 4F1VA 2Q88A 4JWOA 3TODA 1LAXA 4BDQA 3HN0A 5TP9A 3OXNA 4LQ2A 3EPEA 1B05A 3HCQA 2FYIA 3FJMA 3PPQA 2DWHA 4GLIA 2B3BA 1HSLA 2Y7RA 1B4ZA 3VE1B 1QJMA 4ESWA 1UQWA 3PPOA 3C4MA 3D4CA 2IEEA 4PP0A 3GLBA 3H03A 4GQOA 2Y7PA 3KGCA 1QW0A 4LUBA 2R6GE 3C36A 1R1NA 3KEIA 1S7YA 3O28A 1XT8A 1BIYA 1MQIA 4UA8A 3UP9A 3OO7A 2Y7IA 4YKIA 1I6QA 3RT6B 1NH7A 4R74A 1IXGA 3TCFA 1D9VA 3RNNA 1EZPA 5FHOA 1GVCA 2BJJX 4ZECA 1NFTA 4KCCA 4IO3A 3ECRA 1OQGA 3M8UA 1ZLQA 1QVSA 2E0SA 4THIA 3MZ9A 4Z7EA 1UTBA 4I1DA 2VOZA 3PUXE 4IGRA 4H6DA 3O97A 1P1OA 2W7YA 3Q29A 3RTWB 3K1NA 5EHMA 3RUMA 1H43A 1MY1A 1OQHA 3LBSA 2YJPA 3TUSA 4OTEA 3BBRA 5AE4A 1B0LA 4RXLA 1N04A 1VR5A 3G3FA 3I5OA 4M4GA 4EUOA 1EZOA 5CC2A 2RCBA 3WAEA 1SYHA 4WEPA 5I56A 1NNPA 1FW0A 2DWJA 5I57A 5ISUA 2I0BA 4LQ5A 2F97A 5ITOA 2REJA 3TAJA 4OWDA 5FHMA 3H6WA 5A5XA 1Y3PA 1DMBA 1MXUA 2DQVA 4OVJA 3IAZA 1QUKA 4F1YA 1MXZA 3UA8A 5K2XA 4FIMA 4G68C 2HXWA 3W15C 3CI8A 3SETA 1P1UA 3KFMA 3TTNA 1MH4A 5DEXB 2DE3A 3RGYA 1B3EA 3S9NC 3G3KA 2V3UA 1JEVA 1JETA 3G3HA 3PMXA 2KLFA 3VDFA 3MP8A 2QS4A 5DEXA 2HZKA 4JXIA 2QS3A 4Q0CA 3U72A 2RF1A 3IOWA 5AA2B 4ND9A 2H25A 2X7QA 1VSOA 5CBSA 4FAJA 4R2BA 4GWOA 1ZJLA 1EH3A 2F7CA 1MXWA 2F7BA 3VLVA 3WAFA 4MH5A 1YAEA 4QFOA 5L9OA 1B52A 3I6VA 1O63A 5F7VA 1M5CA 3LSWA 4F19A 3O9PA 2VHAA 3EHTA 1SW5A 4NMYA 1XOCA 2NWJA 1B58A 1Z7NE 5DVJA 3T22A 3PUVE 4Z0IA 3FVOA 3LSFB 2HAVA 2XXPA 3CFXA 3OEMA 1OVTA 1MXXA 3K6XA 3H7MA 2PT2A 4NF5A 5AA4A 3T93B 2D5WA 1ANFA 5H8SA 5CRYA 3H4ZA 4ZE8A 4BDRA 2LAOA 3HV1A 3TTLA 2UYFA 1B5HA 1DSNA 1O64A 3FVGA 1EZ9A 1ZIUA 2CMOA 2XX8A 1JW4A 2ONKE 3TQWA 1AH5A 2DWIA 4R6KA 2Q89A 3T9HB 3RLFE 4KCDA 2GH9A 1P1WA 3SEWA 1DOTA 3DP6A 1I69A 4O3BA 4F29A 3QUJA 3GZGA 2RKMA 3PU5A 1YTVA 1URSA 3MVXA 1LCTA 1MG1A 5I2NA 1MS7A 1B4HA 5AA3A 1B7ZA 4F2OA 4RK9A 4NEDA 1LB8A 3V5AA 2DWAA 4BLAA 2V84A 1TXFA 1Z7ME 3THIA 3S9LC 3QIMA 4F2QA 2OLBA 1NL5A 3M3LA 3IB1A 1B0HA 1SBPA 4OMBA 1OMPA 1LB9A 4KQPA 1Y20A 2ABHA 4FEBA 3RT8A 4KFQA 1CB6A 2O51A 4GFRA 3A3UA 2X7PA 1JEUA 3SEYA 3SKPA 5DYHA 1MM6A 4ZDMA 4DZ1A 3FD3A 2XXRA 5K2YA 4RY1A 4OFLA 1FQAA 2O69A 4GD5A 2X26A 4JDFA 4KYDA 3R26A 2O7IA 3OO8A 3OSRA 1USYH 2RC7A 1MQDA 4F22A 4P11A 3C33A 2DSFA 2F35A 4F31B 3PV0E 4IGTA 1UIUA 1VFDA 4KHZE 1MPBA 1TT1A 2UXAA 4H5GA 4XXUA 2QJEA 5H8FA 2F7AA 4RA1A 2ZNUA 4F3BA 2XXWA 1GTKA 3N6TA 3IB2A 4OHNA 2UVHA 4RYAA 4R72A 1IITA 3MAMA 2Q2AA 3FV1A 4K3FA 3CSGA 3TYHA 3FUZA 1N0TA 4IY5A 3VLUA 2THIA 4HW8A 4U23A 3IR1A 1MXVA 1H76A 4X48A 3DP4A 1IEJA 3RN8A 2DVZA 1MQGA 3K6UA 1LAFE 3N5LA 4KD5A 3T9XB 3PPRA 4EQBA 2P1SA 3OEKA 2A5SA 5JTYA 1RYOA 2RINA 3TKDA 1H3DA 2AYSA 4JB7A 5JK4A 4ZZAA 2NUVA 5TPAB 3SERA 3CRBA 2P2AA 4PFUA 4ESXA 3OENA 4BDLA 1OLAA 4YU0A 4LZ5A 2Y84A 1USYE 3HSTA 5CMMA 5F1QA 4H67A 3GBBA 2UVIA 3IB0A 3PMVA 3TQLA 3SEXA 4WXJA 1AL3A 1FTMA 2XD3A 5TPAA 3SEUA 4EXLA 3OO9A 1XVXA 3QYTA 4HS7A 1LBCA 4FJPA 3K00A 3S9EA 3V83A 2H4IA 4G8NA 1BKAA 4L17A 3UIFA 3EF7A 1SI0A 3C32A 2RCAA 2VD3A 1B1XA 4H65A 5HBCA 4IO7A 3U93A 1L5TA 3M3KA 2RC9A 5DT6A 2V93A 3SEVA 4NF4B 4E0WA 1SW1A 2PX1A 3KN3A 4QFKA 1URDA 1N3WA 1HSJA 2HCAA 4C0RA 1B7UA 5J1DA 1UIVA 2AL4A 3S2VA 4I9DA 1AIVA 4ECFA 3N26A 4ELOA 1LLSA 4EQ9A 3I3VA 1QUIA 3MQ9A 2G93A 4NF4A 1DPEA 5IAIA 3FIRA 3VXBA 4JSOA 2HEUA 1B3HA 3TMGA 2HFBA 4QHQA 3VVFA 3PUWE 4ZEFA 1MY4A 1N7XA 3IOVA 2P0SA 4FECA 3PPNA 5HPQA 4OFJA 4LP2B 1B9JA 4KYEA 1XVYA 2H98A 1P1NA 5EYFA 1D3KA 4GL8A 1F9BA 4DXBA 4GVOA 4U22A 1S9TA 1NH8A 3A3CA 3VVDA 3PUZE 2HAUA 1B46A 2CZLA 1M5DA 4I8CA 3DELB 3E9XA 4QSEA 3IK6B 5ICQA 2ESNA 3N94A 3HPIA 3OMBA 3PGFA 2WKYA 1Y4TA 2I58A 5FHNA 3L6HA 1B3FA 1D9YA 1QUJA 1YPNA 4JBZA 3KSXA 2QRYA 3P7IA 2OWTA 3FXQA 2OBGA 1US4A 2Z8FA 1MRPA 1ATGA 2D21A 3JV9A 3Q28A 3IOTA 3VVEA 3PPPA 1JW5A 4G8HA 4HCYA 2OZZA 3E4RA 1N84A 1D4NA 5BWJA 2PMSA 3N6UA 3IO4A 2DXYA 5AA2A 2QSXA 4H8JA 1LFIA 3UORA 1IZ1A 1QULA 5CI5A 2ANJA 3TTRA 3G7WA 1LCFA 1JNFA 2H9BA 3C35A 4MLVA 2I48A 5B7DA 3OD7A 3SDFA 1A99A 3QSLA 4F39A 5EHSA 2I4BA 3IJOB 3U1OA 2XXIA 4U4XA 2AIXA 3K1MA 3RPWA 5I58B 3GXAA 5ICTA 1LBBA 1FTJA 3BFTA 1PEBA 3F11A 5FTIA 3ILUB 4C1UA 3MVYA 3KG2A 5H8NB 5I2KB 5KCJB 2H5YA 3EHUA 4MLQA 4N13A 5L9SA 1S50A 4G68B 4EF2A 4Q8RA 4Q5TA 4OZ9A 2PVUA 1ZMGA 1AMFA 4LONB 3Q25A 3Q26A 1SW4A 5I2KA 1LAHE 4EQ7A 1POY1 4G68A 3UN6A 2QS2A 4YKKA 1RKMA 2ZYKA 5CMBA 3EHSA 3T9UA 2DOJA 3IOUA 3O2AA 3H6VA 3G3IA 3ZSFA 5DVFA 3C9HA 1B7HA 3MJNA 4PETA 2RC8A 2Q8JA 3TZAA 3IORA 1A8FA 1A7LA 1FTLA 2AL5A 4OQOA 1YCJA 1LFHA 1M5EA 2VP1A 4O3AA 1NMUA 1FQFA 4FE8A 3MVWA 4TLMB 5JEIA 3VFJA 4MFIA 1NNFA 4QFPA 4ZS9A 2REGA 2H99A 1N3XA 4F3GA 5CBRA 3MZBA 2GHBA 2ZNTA 4NF6B 4R75A 5KDTB 3K6VA 2Z8EA 3FZVA 2XD2A 1H44A 5ITPA 4EDPA 2XXXA 4GOTA 3CFLA 3T66A 4NWCA 5BUUA 2A5TB 1TFDA 1SD3A 2QS1A 3R6UA 4FATA 2YLNA 4NF6A 4DDDA 1B5IA 5AA1A 5H8QB 1MH3A 3MBPA 4IO6A 2I49A 3OSQA 3MZ1A 1PBPA 1GR2A 1POTA 3E3KA 5I59B 4RPNA 4QRZA 3K02A 2O7UA 3B6TA 2UVGA 2QMXA 2I4CA 4OETA 4F18A 4YMBA 4LATA 1FQEA 4R2FA 2M8CA 4Q30B 5KZTA 2VD2A 1Y9UA 5CM6A 1IXHA 1IUDA 5L9MA 4ZEKA 3LR1A 3KN7A 1HSEA 1I6AA 1J1NA 1A54A 3LUYA 2DYXA 5I84A 3AXFA 3KN8A 4HTGA 1ZU0A 1A40A 1SQYA 1MXYA 5LOMA 2XHDA 2R71A 2DXRA 1T0KA 4GL0A 1NNTA 3T96B 2XXTA 2UVJA 3JZJA 2XXVA 2GRVA 1DTGA 4NE4A 1KWHA 1IXIA 4QFLA 4P0GA 3TTKA 3KSJA 4GF8A 1JVXA 3H6TA 5TP9B 4HCWA 3RY3A 1B5JA 4U4SA 3MUQA 3QUFA 3PD9A 4GRKA 2R9JA 4H8IA 1BTJA 2DE4A 1M5BA 4ELRA 4FORA 4ZEDA 3UGWA 1LGBC 5L8DA 2DE2A 1SW2A 4DXUA 4X1DA 1QKAA 1NNKA 3JYRA 3KOTA 2NXOA 1TWYA 1XHYA 3FVNA 3CR9A 3FXUA 4ELQA 3FASA 2Y7KA 2V25A 3ZKKA 3EQ1A 1MPCA 1PC3A 3V8XB 1IXCA 2O1MA 4OFOA 4RJZA 3U8QA 1MQJA 3U94A 4IY6A 5CMCA 4YB6A 2V3TA 3LC8A 4R73A 4DCXA 1UTBB 4KR5A 3CIJA 4R9GA 2E1SA 1B3GA 1XC1A 2O68A 3UK4A 2ZYOA 1PB9A 2Z22A 2ONRA 2XX7A 2Y7WA 4RNSA 4NWDA 3LSXA 3C31A 3H6UA 2O6AA 2I0CA 2OWSA 3H3GA 1RYXA 4IO4A 2NVUB 4JSDA 2IA4A 2DVCA 4OEUA 1PB8A 4C1TA 5I56B 4LVQA 5I57B 4BDNA 4EF1A 3ODBA 5M2VA 4YAHX 4OESA 3TCHA 3OO6A 2Z8DA 4YKPA 1H45A 1XS5A 4BDMA 1B51A 5A5XB 3OELA 1GV8A 2ALUA 3CG3A 3IO6A 2PYYA 4U1OA 4AQ4A 2OK2A 1QKBA 1ZBMA 3E13X 4G77A 4POWA 2G29A 1Q35A 3USDA 3M3FA 3MP6A 4JWXA 3ILTB 3S9MC 1B1HA 2B65A 2F5XA 2XXUA 1JVYA 4IO5A 1MY3A 2F34A 3QAXA 1M5FA 3EN3A 3MPKA 3PMWA 4P0IA 4OYVA 2YPNA 4QF9A 3LSLA 4E0XA 2ZYMA 3L6GA 1Y1ZA 3O6IA 3MW0A 2QMWA 3FGSA 4BDOA 1OIBA 4YICA 4OENA 1SI1A 2FA7A 1VFEA 3MP1A 4F1UA 4O3CA 3O6GA 2Q9TA 4U1ZA 1B3LA 1US5A 3MC2A 2PT1A 3R7XA 2ZNSA 1P99A 3FXRA 3CVGA 3BKIB 3U92A 4DLDA 1MDP1 1DPPA 1CE2A 2XXHA 3FJ7A 1R9QA 1ELJA 2I3WA 4MBPA 2GHAA 1BLFA 4AB5A 3ZS6A 2HZLA 2FNCA 1SVXB 5ELVA 1PBQA 3VXCA 4WEDA 2OJTA 2F78A 4R6YA 3FVKA 1WDNA 3IJXB 1N7WA 2ZMBA 4H1XA 4PQJA 4YB7A 4DXCA 3K1PA 3ONMA 1SYIA 1P1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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