1WVJA

Exploring the glur2 ligand-binding core in complex with the bicyclic ampa analogue (s)-4-ahcp
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploring the GluR2 ligand-binding core in complex with the bicyclical AMPA analogue (S)-4-AHCP
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords ionotropic glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wvjA02
1GV8A 4YU0A 4G68C 3RPWA 1CE2A 5H8FA 4O3AA 3OO9A 4R72A 5KDTB 4YZZA 1R9QA 2HAVA 2ZMBA 3MWBA 4G8HA 3TMGA 3TEPA 4U21A 5CI5A 1ZIUA 4LZ5A 3EQ1A 3CSGA 3OMBA 2GRVA 5I57B 2FNCA 2H25A 3C33A 4LONB 2F7AA 5FHNA 4H67A 4JSOA 3TQLA 1B58A 3TFLA 2M8CA 4C1UA 1LCTA 1PB7A 1ZTYA 5DVIA 1US5A 2F78A 5AE4A 1B0LA 1XVXA 2F35A 3KN7A 2XXTA 3HO7A 3K1PA 2H9BA 3S9LC 1OLCA 4F18A 4N6PA 4IB2A 1IXIA 2AYSA 1VSOA 2DS9A 3Q26A 1DMBA 3HN0A 5F7VA 1B6HA 1O7TA 3G3GA 2XXXA 3C36A 2I3WA 1QUIA 4PFUA 1O63A 1OQHA 2F6GA 3KJ7A 3MZBA 3CVGA 1MQHA 1YTVA 3N94A 3H7MA 3KBRA 4F31B 4ZE9A 4QSCA 2HCAA 2Z8DA 2DVCA 3IX1A 4RPOA 3CFZA 2O7UA 3VLVA 3PU5A 4PFYA 4ISUA 3RTWB 3KEIA 3USDA 2RKMA 2O1MA 4OESA 1SD3A 5DEXA 2R71A 3K1MA 2UVGA 3MP6A 5AA3A 4IO2A 1MDP1 2FA7A 1ANFA 3PPQA 1Y1MA 5TP9A 3TAJA 4AB5A 1QULA 1MY3A 4NE4A 1VFDA 2ONKE 2X26A 1QKBA 5JK4A 5I2KB 1BKAA 3RGYA 4F2QA 4FEBA 2ZNSA 4R74A 1MXUA 2XXIA 5L9MA 4DLDA 3KN8A 3TKDA 3BFTA 1B2HA 2UVHA 4KYSA 2IA4A 4PE5B 1FTLA 1RKMA 4O3CA 2HEUA 5TU0A 5FTIA 3QUFA 3U92A 3VLWA 1A8EA 1IZ1A 4DE8A 2NOOA 3W15C 3MW0A 4HCWA 4LP2B 2F36A 1II5A 1SW5A 3TTKA 4QFLA 4OVJA 1DPEA 1MXXA 1DTGA 2I58A 1JEVA 1F9BA 4JBZA 2Q2CA 4HS7A 5ICQA 3DLNA 5LOMA 2P0SA 1B5IA 2A5TB 4IO6A 2Z8EA 5BUUA 2QL3A 2AL5A 4LZ8A 4YAHX 3OD7A 3QXMA 1POTA 5TPAB 1IQ7A 4NF6B 4WEDA 3TQWA 3UORA 1FQBA 1UQWA 3PGFA 4H1XA 4DXUA 4JXIA 1QVSA 4EF2A 4ESWA 3PMWA 3PUZE 3K0VA 2OCUA 1WDNA 3MVWA 3FXUA 2CMOA 1LB8A 2XXQA 1B1XA 4OFJA 2ZYOA 1B7HA 2ANJA 2Y7RA 4U23A 4OZ9A 1FQCA 3TELA 4R9FA 1H3DA 4HTGA 3K6UA 5I2NA 4NF5A 3N6TA 1LFGA 4H6DA 2XX8A 4YKIA 1LCFA 3PMVA 3Q25A 3T93B 3IORA 4ND9A 3GXAA 1D3KA 4OWDA 4MF3A 3MJNA 4QFPA 1YPNA 2F7CA 3H6WA 3PUXE 4N13A 4F3PA 4HW8A 4QFOA 1GGGA 1PB8A 1OIBA 3CG1A 3OEKA 3RT6B 4ONYA 4M1VA 1UTHB 2F5XA 1AMFA 4I62A 2PYYA 1B40A 4U4XA 5CRYA 3EHTA 4LZ7A 1M5FA 2X7PA 1P99A 2UYFA 3B6TA 5ITOA 4X9TA 4N07A 3VV5A 2QJEA 1IUDA 3TCGA 1B5JA 3OO7A 3T9HB 5ISUA 3O9PA 1T0KA 1B5HA 5AA2D 3FASA 5JEIA 4GIZA 1FTOA 4PP0A 2I0CA 3KSJA 5IKBA 4OQOA 2HFBA 3OO6A 3MZ9A 3DP6A 1FW0A 3IOUA 3ZS6A 4KFQA 1TFDA 3D4GA 3K02A 3E9XA 5A5XB 1Y4CA 2FYIA 1QKAA 2F97A 4MBPA 4MLVA 4X48A 3IOTA 5I58A 2QPQA 4BDRA 1A55A 1Y3QA 4YICA 1LAHE 1JETA 2WKYA 3C31A 4NWCA 3R26A 1NNTA 1LFIA 1LBBA 1B3FA 3V5AA 4Q8RA 1IITA 5ICTA 1VE4A 4GD5A 4NF8B 3I6VA 1O64A 2H4IA 2IEEA 3FGSA 3S9MC 2LAOA 5KCJB 1N7XA 4RA1A 1MQGA 1ATGA 1JW5A 4ZDMA 1NNPA 4IY5A 4ELOA 4C1TA 3U94A 2ESNA 3KZGA 3FZVA 4NWDA 5I59B 2XXWA 2ZYNA 1PEBA 1BTJA 1B3EA 1I69A 4G8MA 2O6AA 3TTRA 2RC9A 2DWIA 3EHUA 3G3HA 3O6IA 4F1UA 1N3WA 1D9YA 3B7DA 4F1YA 4LA9A 3BKIB 5DT6A 3UIFA 4U22A 1OVTA 1L5TA 1USYH 3W9WA 2QSXA 3D4CA 3K6WA 1H44A 1DTZA 5EYFA 3IB1A 5H8NA 2QMXA 1P1OA 3IO4A 3M8UA 2OZZA 1Q35A 4XKQA 1N0TA 3F11A 4ZEIA 4O3BA 1SVXB 5KDTA 1US4A 4OFOA 3LSFB 1FQAA 3UK4A 1SW2A 4NF4B 1URGA 3A3CA 4RPNA 3ZKKA 4OFLA 2OWTA 5FTHA 1MPBA 4KCCA 5B7DA 3IK6B 4YKPA 1PBPA 2O84X 1SI1A 1B32A 3U93A 3QIMA 3OEMA 5I57A 5DVJA 4H0WA 1JNFA 3CIJA 1LAFE 2NUVA 2Y7KA 3CFLA 1B51A 3VDFA 4X1DA 4PETA 1DPPA 4M4GA 5L9SA 3E4RA 3IJOB 4F3GA 1IXCA 3FXQA 1KWHA 4BDOA 2YJPA 2QRYA 1BLFA 1JVXA 3VVFA 2XXUA 3S9EA 2PX1A 3FVKA 4GFRA 4JWYA 4GOTA 3K4UA 4R6HA 2G93A 1B7ZA 1SYIA 3ZSFA 5AA2B 2F6PA 1I6AA 2DWHA 4I9DA 1EZOA 3PUVE 4LQ5A 1PDAA 2ONSA 3TCHA 2Q89A 2DWAA 1QUKA 1OMPA 4BDMA 1MQDA 1D9VA 5J1DA 3IB0A 3LSXA 3CR9A 3V89B 2V93A 4X1BA 1MPCA 3SESA 1H76A 5B70A 3RNNA 2I3VA 3ONMA 2X7QA 1B1HA 2DQVA 2RINA 1MH3A 3O6GA 1AL3A 4MH5A 1IIWA 4YMBA 1Y20A 3QK6A 4DDDA 1B9JA 1Y3PA 5I2KA 1MY2A 3KFMA 4R75A 4QRZA 1MXZA 3EHSA 3DP4A 2Z23A 4Q5TA 1N04A 2HQ0A 3H03A 1NNKA 4NTLA 1AIVA 2I4CA 3BBRA 5FHOA 4KR5A 5H8QB 3MZ1A 4WXJA 1D4NA 3EPEA 4GQOA 4DZ1A 3OSRA 5F1QA 3PD8A 3SETA 4JWXA 3U8QA 3K6VA 1ZMGA 3V8XB 1MH4A 3RT8A 2F8DA 3N6UA 5KZTA 3PUWE 4FAJA 3T9VA 1Y1ZA 2B3FA 4EF1A 5AA1A 4JSDA 4H8JA 2XXVA 3T9XB 3U1OA 1EZPA 2A5TA 3FXRA 3H06B 4GRKA 4IO7A 2XD3A 5I56B 1S50A 3W9VA 5L8DA 4KPTA 1NKXA 1Z7ME 4MFIA 3M3LA 1XOCA 1TT1A 3U72A 3FATA 4TQUQ 5TPAA 4LUBA 3TDJA 4XXUA 4NF6A 1DOTA 2PT2A 2ZNTA 2REGA 2DYXA 1VR5A 1A99A 3L6HA 3M3FA 3CSBA 4Z0IA 5CC2A 4KQPA 2GHBA 3GZGA 4DCYA 1RYXA 4EQ7A 1QJMA 1MXVA 2ZYMA 4ZEFA 4P0GA 2QS3A 1MQJA 4BDNA 2I4BA 1NH7A 3PPNA 3SEWA 4DXBA 1RYOA 1A54A 4IGRA 1R9LA 1WODA 1DSNA 5AA4B 2PVUA 4RYAA 3O97A 4BDQA 4AQ4A 4IGTA 1UIUA 1P1WA 5CMBA 1Y4TA 5IAIA 2ZNUA 4FORA 4LATA 1B3LA 4NMYA 1XT8A 4EXLA 1BP5A 3K6XA 4EQBA 5EHMA 4WEPA 3MP1A 2DE4A 2V3UA 1HSJA 4NEDA 3C32A 3FIRA 1LB9A 2QMWA 3VVEA 1B46A 1UTBB 3Q28A 3ZKLA 4ESXA 1UTHA 5I84A 3FVGA 1MG1A 2XXPA 2DWJA 3LSLA 2V25A 2VD2A 2E0SA 4THIA 5ITPA 2O7IA 4ELQA 2P1SA 3S9NC 1FQEA 3H6VA 4FE8A 1MS7A 4GWOA 4EQ9A 2RC8A 3VXCA 4R2FA 1JW1A 2BJJX 3VVDA 3H6TA 1A8FA 2F7BA 4ZE8A 3RY3A 1QW0A 3FVNA 3MAMA 3WAEA 3H3GA 5A5XA 3KSXA 3MP8A 3VFJA 1LLSA 2DE2A 2VGQA 1MRPA 1MM7A 1SYHA 4EUOA 4BLAA 4R6KA 4ZS9A 2DP8A 2H99A 3TTLA 3T96B 4EDPA 3CI8A 3T66A 1LBCA 1MY1A 3KG2A 4R6YA 4YB7A 4JB7A 1MXWA 3THIA 2RF1A 4NF8A 4R73A 2Y7IA 2Q88A 1FTMA 1FTKA 4KYEA 5KCJA 2DOJA 4GXAA 1HSEA 5H8HA 1VFEA 2I0BA 4F3SA 1NMUA 1QUJA 4ZZAA 1ZU0A 1Z7NE 5K2YA 4H8IA 3SERA 5I59A 3TCFA 5H8HB 3RUMA 2G29A 3DM0A 1NFTA 3OSQA 4OEUA 1JVYA 3GBBA 3H4ZA 2O68A 4L17A 3TODA 1AOVA 2THIA 1R1NA 1WVJA 2HZLA 2Q9TA 4ELPA 4U1ZA 2DE3A 4G4PA 4ZZEA 3C9HA 4BDLA 1TWYA 2XXHA 4PFWA 4DXCA 2E1SA 3SEYA 3Q29A 2V84A 4YB5A 4C0RA 4G68A 2ALUA 3IJXB 4AB6A 1I6QA 4R9GA 4OEVA 3AXFA 3O6HA 3RQTA 3O66A 3HSTA 4IO5A 4G68B 3LBSA 3TPAA 5CMKA 2I49A 3B6QA 1LFHA 4PFTA 4P11A 2O1LA 1TXFA 2VD3A 1ELJA 3ILUB 5L9OA 4G8NA 4NF4A 2NWJA 2OBGA 2CZLA 1EU8A 3R7XA 2NXOA 3LR1A 4UACA 2UVIA 3OENA 3WAFA 3FV2A 3K00A 5FHMA 2H5YA 2RCAA 2Y7WA 1IXHA 3S2VA 5JTYB 1USYE 4OXVA 1OVBA 3HPIA 4H65A 4RK2A 4XTCQ 1B0HA 4KYDA 3PPRA 2P2AA 2YPNA 3HV1A 1A40A 2R9JA 3UN6A 2UXAA 1EH3A 3L6GA 4ELRA 2KLFA 3OO8A 1URDA 3RLFE 5H8FB 3IL1B 3T9UA 2REJA 1PC3A 5CM6A 2VP1A 4XIGQ 1PB9A 4YB6A 5EHSA 5K2XA 2A5SA 1YAEA 3E13X 1IEJA 3C34A 4RY1A 1GVCA 1A7LA 2XHDA 1R6ZA 5DVFA 4H5GA 3LSWA 5AA2A 1H45A 1MQIA 3K01A 1B3HA 1B52A 3QUJA 5HM4B 3A09A 4H5FA 3O29A 3N26A 3OXNA 4F39A 4F29A 3QYTA 3I3VA 1MDQA 4RK9A 5M2VA 4PQJA 3QSLA 4GLIA 3KN3A 4FEDA 3C4MA 2VHAA 4IO3A 3PPOA 3GLBA 1MXYA 4FECA 4RJZA 3G3IA 4TLLB 1N7WA 4ZEKA 1FQDA 4YMAA 1XVYA 3IOWA 2VOZA 1N3XA 4Z7EA 1AH5A 3H6UA 1S9TA 1SDXA 1M5DA 4TOZA 4JDFA 5CMMA 1I6BA 1OLAA 3G7WA 3G3JA 1NL5A 1ZKBA 2H98A 3CFXA 2NVUB 2D21A 2OJTA 3BFUA 3VLUA 3IR1A 2RCBA 3RN8A 4GL8A 3TUSA 3CRBA 1BIYA 1FCKA 4QFNA 2DXRA 3B6WA 4KCDA 2OWSA 1M5BA 1SW4A 2B65A 2XXYA 3G3FA 5CBRA 1LAXA 5H8QA 1FTJA 3FUZA 4KHZE 3I5OA 4FATA 2O51A 3T22A 2UYEA 5DEXB 2Z8FA 3DP8A 3TTMA 3EF7A 3SDFA 5TP9B 5DYHA 2I48A 2XXRA 3MQ9A 3PMXA 1PBQA 4YKKA 3FJ7A 3PV0E 2RC7A 3C35A 4XKRA 3S4UA 4WKMA 1XHYA 4F19A 1SI0A 3MPKA 5I56A 4OENA 3MUQA 3JZJA 4ZECA 3DELB 1B3GA 4G2ZA 4EXKA 4IY6A 3SEUA 3PD9A 4I8CA 2I6EA 2GFEA 1GR2A 5ELVA 1H43A 2XX7A 5HPQA 3ILTB 1OQGA 2HZKA 2Y84A 3HHFA 4U4SA 1P1UA 4UA8A 2GH9A 4FJPA 3FJGA 3TZAA 3IO6A 4I1DA 3TYHA 2QS4A 2YLNA 1SW1A 1XS5A 5AA4A 2O69A 3TTNA 5BWJA 4ZEBA 3ECRA 4OYVA 2PBWA 3HHGA 1UIVA 4FIMA 1EZ9A 2ABHA 1MY0A 3A3UA 2OK2A 1B4HA 1B4ZA 3IAZA 1Y3NA 1B05A 1MPDA 4LVQA 1LSTA 4F22A 4OTEA 1UTBA 4U1OA 2W7YA 1NH8A 3UP9A 1JEUA 4OERA 4POWA 1IXGA 4IO4A 5I2NB 3JV9A 4NF5B 4KD5A 4TLMB 4OMBA 1HSLA 3PPPA 3HCQA 1N84A 3SEVA 3UA8A 2ONRA 4K3FA 4Q30B 1ZLQA 4MLQA 3M3KA 3MPLA 1JQFA 3O28A 2QS2A 1P1NA 3OOAA 4DCXA 1URSA 2HAUA 2PMSA 4ECFA 4G77A 4QSEA 3K2DA 2B3BA 3R6UA 3FV1A 5H8SA 2R6GE 3CG3A 3P7IA 5CBSA 4OETA 3SEXA 1CB6A 1JW4A 3LC8A 1POY1 3RTFB 1Q1KA 4YKJA 4LQ2A 3UGWA 3G3KA 2DVZA 3JYRA 3KGCA 4P0IA 2UVJA 4DIGA 4E0XA 2DXYA 2Y7PA 4HCYA 5CMCA 1LGBC 1P1QA 4RNSA 2DSFA 1FQFA 4JWOA 4QF9A 2ZYKA 4F1VA 3FD3A 3GBAA 3N5LA 1ZBMA 3VE1B 3SKPA 1N76A 2V3TA 3LUYA 4GL0A 2V3QA 3MBPA 3MC2A 4POXA 1GTKA 4GXSB 3IB2A 1J1NA 2Q8JA 4OHNA 4XKPA 5I58B 1SBPA 1NNFA 1SQYA 2Q2AA 4R2BA 3V83A 3OELA 4KI0E 3FJMA 3ODBA 2D3IA 4QSDA 2OLBA 4F3BA 2Z22A 3MVZA 2F34A 4QHQA 1Y9UA 2GHAA 3KOSA 3VXBA 3E3KA 5HBCA 1ZJLA 3KOTA 1M5CA 1M5EA 3MVYA 1TFAA 3FVOA 4QFKA 2D5WA 4RXLA 2XD2A 4Q0CA 3K1NA 4XKNA 1S7YA 5DTBA 3PUYE 2ZXTA 4GF8A 4F2OA 1YCJA 1MY4A 3KJTA 3Q27A 4GVOA 2AIXA 2AL4A 4ZEDA 2HXWA 3IOVA 3O2AA 4E0WA 3EN3A 3QAXA 2QS1A 1LAGE 1XC1A 2XX9A 1MM6A 3MVXA 5JTYA 1B7UA 4U2RA 2PT1A 5H8NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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