1XHYA

X-ray structure of the y702f mutant of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with kainate at 1.85 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xhyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xhyA02
3M3FA 4QFKA 1MY3A 1Y1MA 2RCBA 1XT8A 3O2AA 2Q89A 3KSJA 1NNPA 4PQJA 4JDFA 4IO7A 3V5AA 3T93B 3KJTA 3H6TA 1J1NA 4O3AA 2PBWA 3D4CA 1B9JA 4RK9A 3TQLA 3G3JA 3BFTA 1OIBA 1KWHA 2X26A 2ZNSA 3FXUA 5B70A 3HHGA 1N76A 4ZZAA 5M2VA 5TPAB 5CC2A 2F34A 1A7LA 5L9OA 1SW4A 1FQCA 1P1WA 5IAIA 4G4PA 3RNNA 4DLDA 2VD3A 2UXAA 1SW5A 1MG1A 3SEYA 1YCJA 3T22A 1B4HA 4NF6A 4R2FA 1B3FA 2QS2A 1USYE 2Q9TA 1LBCA 2A5TB 4R72A 1FTJA 2HEUA 5H8NA 1LCFA 4NWDA 3HSTA 2F7AA 4G2ZA 1XOCA 2LAOA 2QS3A 1IUDA 2GHAA 5ELVA 4H6DA 3PMXA 1URGA 2XXXA 3K6WA 1DPPA 3S9LC 1JETA 3S2VA 1TT1A 2Q2CA 1A54A 4EQ9A 4NF4A 4GXAA 1MQHA 1ZKBA 1JNFA 4L17A 1B46A 5TU0A 4QSCA 1Y3PA 1LSTA 3UK4A 2Y7WA 2XX8A 5K2YA 1POTA 3VVDA 2XXIA 5JTYA 4X48A 3HO7A 4I8CA 1URSA 4U1ZA 3IB1A 2R71A 2XXYA 3WAFA 2DXYA 1B2HA 1NL5A 3EHUA 3OO7A 1I6QA 4OTEA 3K2DA 1VR5A 1Y20A 4Q0CA 1OLCA 3JYRA 4KCDA 3T9VA 1S50A 1M5CA 4U21A 3FZVA 2M8CA 3DELB 2I0BA 2XXQA 2Y7KA 2H9BA 3CR9A 4OFLA 2DYXA 3OELA 3USDA 2VP1A 2WKYA 3N94A 2V25A 3PUYE 3VV5A 1XVXA 4H1XA 2PMSA 2REGA 1FCKA 1I6BA 4F3PA 3TODA 4KYDA 3CIJA 4JWOA 4WXJA 2XXUA 3U92A 3T9XB 2KLFA 3ZKKA 4U2RA 5L8DA 3U1OA 3TDJA 1MXWA 4NMYA 4KHZE 2FA7A 3ECRA 4NE4A 4FATA 4ELPA 5KCJB 1UIUA 3CFLA 3TTKA 1FW0A 1MPDA 2F6PA 1ANFA 2VD2A 4GF8A 1IXHA 3GBAA 4ESXA 3FJMA 3BFUA 4LQ2A 4OYVA 4XKNA 4YMBA 5I56B 4ZEFA 3RPWA 3TYHA 1D9YA 2XD2A 1MY1A 3C31A 4ZEKA 1B7HA 4X9TA 1ZBMA 4LZ5A 5DVIA 5AA3A 4ZZEA 5ICQA 5HBCA 4EXKA 3IAZA 3O97A 1UIVA 1A40A 1N3XA 5DEXA 1I6AA 1WVJA 2X7PA 1NNTA 4OEVA 4MFIA 1ELJA 5CBSA 3H06B 1Q35A 2V3UA 4H8IA 1UTBB 4JWYA 1IEJA 3PUWE 1N84A 4OVJA 1BLFA 3PUXE 3MAMA 3DM0A 3O66A 3IX1A 5JK4A 1XHYA 4R6HA 1QUIA 3M8UA 2XX7A 2Z8FA 5F1QA 5BUUA 1LAXA 2XXHA 4JBZA 1M5FA 3C36A 1A8FA 3CG1A 1NNKA 1LAGE 3LSXA 5CBRA 5I57B 2I49A 1TFDA 1DPEA 3CFZA 3N26A 3MC2A 4UACA 1NKXA 1PC3A 5TPAA 3MQ9A 3PMVA 3EHTA 3UORA 1MXYA 4QFLA 3QSLA 3T96B 4H8JA 1ZJLA 4ELRA 4MF3A 1US4A 4Q30B 2D3IA 3FJGA 2RC9A 3OEKA 3G7WA 3MVWA 4FEDA 4RK2A 3T66A 2ZNTA 2UVGA 2A5TA 2OJTA 1SYIA 2UVJA 3HHFA 4GVOA 1B40A 4XKRA 4YAHX 2D5WA 4BDMA 4PETA 5L9SA 1AOVA 2ZYMA 3L6GA 3TEPA 2ANJA 4Q8RA 4RPOA 1MY0A 1B58A 3QAXA 2OCUA 1YAEA 4FJPA 4GOTA 4U4XA 2ONRA 2DWHA 5AA4B 3ZKLA 2Q8JA 1NH8A 5ICTA 2Y7RA 1N0TA 4JSDA 3KJ7A 1D9VA 1PEBA 1NMUA 1TWYA 1US5A 3FV1A 3OO6A 2Y7IA 3LBSA 5HPQA 3B6QA 4WEPA 3MJNA 3W9VA 3MVXA 2O7IA 3ZSFA 1R6ZA 1QKAA 5TP9B 1URDA 4R2BA 1Q1KA 5H8FB 4RYAA 4OXVA 3F11A 1Y3QA 3TCFA 4F39A 3MVYA 3HPIA 4RPNA 1P1OA 3PPQA 1ZIUA 2DP8A 2DWIA 3OXNA 4Z0IA 1PB7A 2B65A 1DSNA 4C1UA 4PFTA 4QFNA 3LSFB 3VXCA 5CI5A 5H8QB 4DCXA 1PBPA 1LAHE 3UA8A 1BTJA 3DLNA 2AIXA 3R26A 4JWXA 3RLFE 4NF5A 4IGRA 1M5BA 2ZYNA 4KI0E 4P11A 3CFXA 3K1NA 2H99A 3THIA 1DMBA 2RINA 4ZE8A 3MZ9A 3T9UA 4N13A 2NOOA 1T0KA 3VFJA 3KN8A 3RT8A 5KCJA 2HCAA 5I58B 1YPNA 2VHAA 1IXGA 3SDFA 3I3VA 1AIVA 2O84X 3U94A 2AYSA 1JW1A 5DVFA 4TOZA 1WODA 5I56A 2OLBA 2PX1A 3IOTA 4R6KA 3MP8A 5EHMA 2QRYA 4R9FA 3FXQA 3IR1A 2F97A 4BDLA 5A5XB 3PUZE 3IL1B 3K1MA 1AL3A 1HSJA 1B3HA 4PFWA 4OETA 4GD5A 2AL5A 2DOJA 4XXUA 3IOWA 1B7ZA 1Z7ME 3MP1A 3QUJA 3FUZA 3H6UA 2ONSA 3T9HB 1O63A 3S9EA 1QULA 1USYH 1FQDA 3KFMA 3FIRA 4ONYA 2HAVA 3BKIB 3N6UA 1PB8A 3Q25A 3RGYA 2F8DA 1SQYA 3R7XA 1VFEA 5BWJA 3M3KA 3H3GA 3TCHA 3IOUA 1B52A 4KPTA 2GRVA 1QW0A 4Q5TA 1IIWA 2D21A 2R6GE 3G3GA 4X1DA 5EYFA 3FV2A 1FQBA 3H7MA 4IO2A 1N3WA 4LA9A 4F3BA 5I57A 1B3GA 2HXWA 4BDOA 1TXFA 2F5XA 1QVSA 4H5FA 2I0CA 4G68B 3MZ1A 4I9DA 3KN7A 2O1LA 4H0WA 4BLAA 3U8QA 2HFBA 4YZZA 5I2NB 3KN3A 3K6XA 3B6WA 4ZDMA 4NEDA 4KFQA 2P2AA 3QXMA 4O3BA 4ZEDA 3V83A 2DE2A 4HCWA 1N04A 1MXZA 3M3LA 3Q27A 5DTBA 3PD8A 3OEMA 1YTVA 3C4MA 4EUOA 3OMBA 4K3FA 1LFGA 2ESNA 4F1VA 3FJ7A 4LATA 3P7IA 2F78A 3HN0A 4RY1A 2RF1A 1POY1 2PT1A 3PUVE 2I3WA 1IXCA 3RY3A 3VXBA 4N6PA 1MPBA 4NTLA 2ZYKA 2F6GA 1AMFA 4ESWA 3K02A 3LR1A 5KDTA 4NWCA 5AA1A 3FATA 3K1PA 3SETA 1GR2A 1QUKA 1LFHA 4BDNA 5AA4A 3JV9A 2H5YA 1H44A 4KYSA 1NFTA 3A09A 4OERA 3ILUB 2RKMA 3IK6B 4QSEA 4ELQA 1LCTA 5CRYA 1Y1ZA 3OO9A 3V8XB 4O3CA 4OFOA 4FIMA 1MY4A 1P1NA 3TTLA 1QUJA 1GGGA 1L5TA 2ZMBA 1SD3A 3CG3A 3TTRA 2YLNA 1H43A 1IXIA 4OMBA 3ONMA 4H65A 1A55A 4QHQA 1FTOA 4OWDA 2HZKA 3KGCA 4JXIA 5TP9A 1ATGA 5HM4B 3OO8A 4QF9A 3O6IA 5H8FA 4JSOA 3QUFA 4QFOA 1MPCA 1LLSA 1DOTA 1MQDA 1BKAA 3G3IA 4P0GA 2XXVA 4EQ7A 2H4IA 5F7VA 2PYYA 4PFYA 1QJMA 1P1UA 2PVUA 1CE2A 2BJJX 1B4ZA 2OWTA 3VLVA 1BP5A 1MXVA 1RYXA 1Y4CA 4YMAA 1LAFE 1I69A 1VSOA 1WDNA 4E0WA 4F2OA 5H8QA 2REJA 4NF6B 1Y4TA 4R9GA 3TPAA 3O28A 4DCYA 3I5OA 4LQ5A 4AB5A 2CMOA 4F1YA 4OFJA 1SVXB 2DE4A 2HAUA 1P99A 4I62A 3K6UA 1D3KA 4LVQA 4GQOA 1II5A 2HZLA 1JEVA 4GIZA 3CSGA 3C35A 1FQAA 3RQTA 3A3UA 2F7CA 2XXPA 3TTMA 1B51A 3CSBA 4GLIA 1MRPA 4IO5A 1FQFA 1MQGA 2OK2A 5JTYB 2E0SA 4MBPA 2QSXA 3SKPA 3TKDA 3MPLA 4WKMA 4R6YA 3MWBA 3A3CA 5FTIA 2UYFA 1MXXA 3MW0A 5KZTA 4M1VA 1OLAA 1Y3NA 4QFPA 3PV0E 2XD3A 1H45A 1GVCA 1MDQA 5K2XA 3RN8A 4KYEA 3D4GA 1B0LA 3G3FA 2F7BA 2F35A 4ELOA 5JEIA 4G8HA 2NVUB 2XXRA 1B3EA 1JQFA 4BDQA 1PBQA 2Q88A 1B5JA 3H03A 4LZ8A 3AXFA 4DIGA 3KSXA 2PT2A 3MZBA 4EDPA 3Q28A 1OMPA 1LB8A 4PFUA 3B6TA 2XHDA 1MM6A 3IJOB 2O68A 4RJZA 4RNSA 2DQVA 4G68A 1AH5A 1PB9A 1R9QA 3DP6A 5I2NA 4QRZA 5CMBA 5FHOA 2Z22A 3OD7A 4GL8A 4FEBA 3K00A 2THIA 4DZ1A 3IJXB 3Q29A 4FORA 3IB0A 4OENA 1SYHA 3OSRA 2HQ0A 2IA4A 1A99A 3TCGA 1M5DA 2OBGA 3Q26A 3U72A 5AA2B 4EQBA 5J1DA 1B5IA 1H76A 2QMWA 3C34A 4FE8A 4XTCQ 3E3KA 2RCAA 1TFAA 2DE3A 3ZS6A 3C9HA 1P1QA 5CMCA 2DS9A 2V3QA 1O64A 5H8HB 3FVNA 3CI8A 1MDP1 1ZTYA 2FYIA 4DE8A 3SEXA 3S9NC 4F18A 3CRBA 1UTHB 3TFLA 3JZJA 5DVJA 3GZGA 3RUMA 2QL3A 4U1OA 4EF2A 4U23A 3VVEA 2ABHA 3E9XA 4OESA 3PPNA 3RTWB 4ECFA 3UP9A 4ZECA 2Q2AA 2DWJA 3O6GA 1DTGA 2NWJA 3HCQA 2O6AA 3B7DA 5FHMA 4WEDA 3OENA 1Y9UA 3IOVA 4HW8A 2Y7PA 3SEWA 4DXCA 3H6WA 4C1TA 3MBPA 1MQJA 2ZXTA 4U4SA 4YKKA 2ALUA 2UYEA 3MVZA 3BBRA 1MXUA 5CMKA 1FTLA 1GTKA 2XXWA 3MP6A 4F31B 4R75A 3TQWA 4F2QA 3TAJA 1B05A 2I48A 4F3GA 1SBPA 1UTBA 1FTMA 3LSWA 2DWAA 1H3DA 1FQEA 3DP4A 3SESA 1S7YA 4YB7A 1VFDA 2OWSA 2UVHA 4LP2B 2NUVA 4FECA 5CM6A 3N5LA 3IORA 4HCYA 2OZZA 3EHSA 1EU8A 1DTZA 1SI0A 3EQ1A 3S9MC 4M4GA 4YICA 3PGFA 4QSDA 3MPKA 4NF8B 4OEUA 2DVZA 1JVXA 5I2KB 4IB2A 5B7DA 2A5SA 1B3LA 4PE5B 5IKBA 4I1DA 2I3VA 3KOSA 1MS7A 5AE4A 4FAJA 2QS1A 3QK6A 5ISUA 4UA8A 5I59B 2P0SA 3H6VA 3KEIA 2V3TA 2ONKE 5EHSA 1B6HA 1MH3A 1LB9A 4DXBA 4LUBA 4IO4A 3SERA 3VE1B 3C32A 1IZ1A 4AB6A 4DXUA 2P1SA 4LONB 2G93A 2QPQA 4F3SA 1OQGA 1B32A 3U93A 1SDXA 3ODBA 3VLUA 4XKPA 4PP0A 2DSFA 3IO4A 4HTGA 2O51A 1HSLA 2QJEA 3QYTA 2O7UA 2H25A 4OHNA 4G8MA 4EF1A 3TUSA 3E4RA 1IQ7A 3QIMA 2DVCA 2DXRA 3PPOA 1LBBA 4NF5B 4XKQA 1B7UA 4LZ7A 4IY6A 1MQIA 3OOAA 2V84A 4C0RA 2GH9A 5FTHA 4KD5A 1O7TA 2VGQA 4YB5A 3G3HA 4F19A 4POXA 3TMGA 1EZ9A 4Z7EA 2I4BA 3TTNA 3PPRA 2YPNA 3KZGA 4IO6A 3IB2A 3FASA 4G8NA 3K4UA 4ZE9A 2UVIA 4H5GA 2IEEA 3VLWA 3SEUA 5FHNA 1B1XA 3KG2A 5AA2A 4ZEBA 4THIA 1B0HA 5AA2D 3UGWA 2R9JA 2CZLA 3GLBA 5ITOA 3LC8A 3UN6A 1EH3A 1B1HA 1MM7A 2Z23A 4YB6A 2B3FA 3K0VA 3EN3A 4ZS9A 2GFEA 2AL4A 3GXAA 2GHBA 5H8NB 4GWOA 5H8HA 2V93A 3S4UA 1LGBC 4RXLA 2I6EA 3EF7A 4IY5A 3ILTB 1F9BA 2G29A 4JB7A 4R74A 3FVGA 3KOTA 3K01A 4KQPA 1UTHA 1UQWA 2RC7A 1JVYA 4KCCA 4BDRA 3PPPA 1OQHA 5I58A 1IITA 4NF4B 1SI1A 4OZ9A 2ZYOA 2XX9A 1R1NA 4YU0A 3G3KA 3CVGA 1LFIA 2Z8DA 1ZU0A 4R73A 1JEUA 2ZNUA 4KR5A 3V89B 3R6UA 3O9PA 4G77A 3K6VA 3O29A 1Z7NE 4GL0A 3VDFA 5A5XA 4GXSB 2FNCA 1A8EA 1FTKA 3FXRA 1PDAA 1D4NA 1RYOA 3FVKA 4OQOA 1EZPA 3N6TA 4ISUA 3KBRA 3SEVA 3FVOA 1JW4A 2I58A 1VE4A 1BIYA 4GFRA 4F1UA 1B5HA 2Z8EA 4YKIA 3O6HA 3TELA 3OSQA 4IGTA 3E13X 4DDDA 4AQ4A 1S9TA 1SW1A 1EZOA 4XIGQ 4TQUQ 1HSEA 3TZAA 4ZEIA 3PD9A 4E0XA 3IO6A 1RKMA 2YJPA 5KDTB 4MH5A 3W9WA 3HV1A 1MH4A 2RC8A 4NF8A 2H98A 3W15C 1ZLQA 4N07A 5I2KA 1N7XA 1XVYA 2O69A 3FGSA 1JW5A 2B3BA 1XC1A 1OVTA 3GBBA 1NNFA 5DT6A 3UIFA 5I59A 4RA1A 4U22A 4G68C 3EPEA 3LUYA 4YKJA 4TLMB 4MLVA 4POWA 3I6VA 2NXOA 1MY2A 2E1SA 5ITPA 5DYHA 1GV8A 4HS7A 4P0IA 1XS5A 1QKBA 1CB6A 3PU5A 4EXLA 5H8SA 2VOZA 3DP8A 2I4CA 5LOMA 2O1MA 3C33A 3RT6B 4X1BA 1R9LA 2F36A 4F29A 1M5EA 1OVBA 4TLLB 5DEXB 3H4ZA 3FD3A 4ND9A 5I84A 1SW2A 4IO3A 3LSLA 4MLQA 3WAEA 1NH7A 3MUQA 2XXTA 4H67A 4GRKA 4YKPA 3L6HA 2W7YA 1N7WA 1ZMGA 2Y84A 3PMWA 3VVFA 3RTFB 2QMXA 2X7QA 4F22A 5CMMA 2QS4A 5L9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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