1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
1DPEA 3SEXA 2O6AA 4YB5A 1KWHA 1IXCA 4MLQA 3A09A 2A5TA 1VSOA 1Y3PA 3O29A 3D4CA 1MXUA 2UVJA 4F19A 4TOZA 3KN3A 3BKIB 4X9TA 3KN7A 1B2HA 3O6GA 1URDA 1UQWA 3WAFA 1D3KA 4XIGQ 3W9WA 3LSLA 1JVYA 3C34A 2ZNTA 5CMKA 1FQFA 5EYFA 3TCGA 2B3FA 3H4ZA 4YU0A 1SQYA 3RUMA 4ISUA 3L6GA 3TAJA 4ZDMA 1AH5A 4KYDA 1CE2A 1FW0A 5I56A 1FQAA 3JV9A 3MJNA 1UTBB 5BWJA 4E0WA 1MY4A 2V25A 3SEUA 4F2QA 1P1OA 2YLNA 4NF8B 1R1NA 2DVCA 4QF9A 1MQDA 4NF6B 2HAVA 1S7YA 3T9VA 1QW0A 5H8QB 1BP5A 2DQVA 3O2AA 3A3UA 2DWHA 3SESA 4MBPA 2O84X 2D21A 3KEIA 3C31A 1XOCA 2H25A 4IO6A 1TXFA 4ZE8A 1MRPA 4FATA 3MQ9A 2W7YA 1LFIA 1A55A 1XHYA 2PYYA 4POWA 2DE3A 4TQUQ 4DCYA 1OQHA 3PUXE 2R9JA 1SVXB 1FQBA 4YMAA 1NMUA 1NKXA 1LAFE 3GXAA 4G68B 4R2FA 5JTYA 1MM7A 4JBZA 3O97A 2Q88A 1B3HA 4X1BA 3C36A 2QS3A 3TDJA 3EHTA 5AA1A 2F7AA 2B3BA 4EQ9A 1RYXA 3VDFA 4NE4A 3N6UA 3UIFA 2E1SA 1LSTA 4N6PA 5H8HB 3IK6B 1N0TA 5ITPA 2DE2A 1MS7A 4NWDA 4R2BA 1NL5A 3TUSA 3HPIA 2GRVA 3M3KA 2DP8A 4GFRA 2F7BA 3MZ9A 4DDDA 1XVYA 1MXZA 1Y3NA 2H5YA 4ELRA 3TELA 3C33A 2Z22A 4AQ4A 5ICTA 2GHBA 4H5GA 3FGSA 4HS7A 3RLFE 1H76A 2XD3A 1ZIUA 3OO9A 1USYH 4OEUA 1SW1A 2O7UA 4OESA 2I3VA 3QIMA 3U72A 1JVXA 4BDOA 1P99A 1MPCA 3OEKA 2UYFA 4Q0CA 4I62A 3Q27A 1SBPA 3PPOA 4Q5TA 2RC9A 4GVOA 4IO4A 1PB9A 3CIJA 2HQ0A 5B7DA 3VLVA 3FVOA 1Y4CA 1MPBA 4PP0A 4F1VA 4R6KA 4PFYA 4EQ7A 4KD5A 2DYXA 3MP1A 4ND9A 4H65A 4NTLA 2GHAA 3FASA 2V3UA 5KDTA 2XX8A 3E9XA 1N3WA 5ITOA 3G3JA 1YTVA 4OZ9A 4IO3A 2Z23A 3CI8A 4H67A 3PUVE 3PUZE 3N94A 1NH8A 4BDNA 4GQOA 3PPNA 2PT2A 3FZVA 2ESNA 2OJTA 4NF4B 4OTEA 2VD2A 3H6UA 1RKMA 1BIYA 4AB5A 4IB2A 2FYIA 1FQDA 1UTHB 3MZ1A 1R9QA 2O1MA 1Y9UA 5I57A 1FTLA 5IAIA 3IX1A 3QUFA 4FEBA 3U92A 2O1LA 3IO6A 4EXLA 3OO7A 2ANJA 4DZ1A 1N3XA 4LA9A 2ONSA 2F78A 3S9MC 1B4HA 2R71A 4RPOA 3K6UA 3F11A 3HV1A 1A54A 1ZBMA 1VFDA 3W15C 2XXUA 2Q2AA 1XS5A 3FVKA 3RY3A 1OMPA 2QS2A 1LCFA 1SYHA 2HAUA 2XXTA 3MBPA 3KSXA 3V83A 2F6PA 3E4RA 4U4SA 5I58A 4HCWA 4QSCA 5CBRA 4OERA 5H8FB 5TP9B 1WVJA 4XKRA 1GV8A 3CR9A 4WEDA 4EDPA 4XXUA 1R9LA 4KI0E 2XHDA 5TPAA 2OK2A 3ILTB 5CRYA 4ELOA 5L9OA 3K01A 3DM0A 4F3BA 2DWIA 3FIRA 4QFLA 3PPPA 3JYRA 3G7WA 1A8EA 2ALUA 3RTWB 4YZZA 3GBBA 1US4A 3BBRA 4RK9A 2NOOA 3GBAA 3MW0A 2ONKE 1R6ZA 3FVNA 5H8SA 2H9BA 1GVCA 4F22A 3V8XB 3THIA 2M8CA 3KN8A 1PEBA 5EHMA 2QL3A 4G8HA 3C35A 2QS4A 4IO7A 2Y7IA 4GWOA 4ZZEA 1OIBA 1M5CA 4YKKA 2I49A 1Q35A 5DT6A 5ISUA 5M2VA 4YB6A 3PMWA 1NNPA 3DP8A 1B46A 3H6TA 1JW5A 4XTCQ 2KLFA 3A3CA 5CI5A 3O6IA 1SDXA 1DTGA 1N84A 1L5TA 4G4PA 4R72A 4Z7EA 4OQOA 2I4BA 2UVGA 3LBSA 2Q8JA 1M5FA 1XC1A 1PBPA 1ATGA 2RINA 5KCJA 1I69A 2QS1A 4N13A 1PBQA 4F18A 4RA1A 1A7LA 2PT1A 2F8DA 1AL3A 5AA2A 3ZKLA 5FHOA 4H1XA 3EF7A 3S9LC 4QHQA 1NNFA 3RN8A 1H44A 1ZLQA 1US5A 1B32A 1SYIA 3MAMA 2AIXA 4H0WA 5B70A 5FTHA 5HBCA 2DWJA 1HSLA 4ESWA 4QFOA 3G3HA 1J1NA 3PMVA 2I58A 1FQEA 4POXA 1SW2A 3LR1A 3FATA 1B05A 5I59A 4ZEKA 1O7TA 1MQIA 4FE8A 4EUOA 3VFJA 3VVFA 2VD3A 3PMXA 4JSDA 1MDP1 5K2XA 3T93B 1LCTA 4DE8A 2OLBA 3KGCA 1EZ9A 3CSBA 1EZPA 1OLAA 2F6GA 1B9JA 3QYTA 4XKPA 4GIZA 1B3EA 5KZTA 2A5TB 4GL0A 4JDFA 2DXRA 4K3FA 1ZU0A 4FORA 4X1DA 4GF8A 2ZYKA 2B65A 4FECA 4DXUA 3EN3A 3ECRA 1UTBA 3BFUA 4IY6A 1I6QA 2ZXTA 3MP8A 4NF5A 2V3QA 1B52A 4P0IA 2AL4A 3U94A 2DE4A 2F97A 1XVXA 4OHNA 5A5XA 4KQPA 3K6VA 1B58A 4BDLA 4WEPA 4IGRA 3EHSA 3OO8A 1URGA 4YKPA 2CMOA 3T9XB 4KR5A 3OSQA 2CZLA 2P1SA 3C9HA 2I0BA 4G8NA 2XXVA 3PD8A 4LUBA 3HO7A 4HTGA 1BLFA 2VP1A 2ZNSA 4OEVA 3O6HA 4EF1A 3M8UA 4U23A 2DWAA 4OENA 3TCFA 4MF3A 1YPNA 3MPLA 4H6DA 1B3GA 2XXHA 3Q25A 4OWDA 3HSTA 3G3FA 3HCQA 3UN6A 3JZJA 1JQFA 2Y7KA 2IA4A 4PETA 4H8IA 2I6EA 3UA8A 4U21A 4LQ5A 1Z7ME 3KJTA 2O69A 3TKDA 3IAZA 3LSXA 4HCYA 3TODA 4P11A 4IO2A 5CBSA 3FXQA 5FHMA 3PV0E 3TPAA 4MH5A 4U1ZA 5AA3A 2Q2CA 3K1MA 3N5LA 3S9NC 5TU0A 1TFAA 3ODBA 1ZKBA 3I6VA 2Y7RA 3TTKA 4C1UA 1QVSA 4RXLA 3FD3A 2E0SA 4M4GA 4PFUA 4JSOA 4U22A 1RYOA 3TTRA 1VFEA 5I2NA 1P1QA 2DS9A 1FTKA 5AA4A 2ZYOA 4YICA 1DPPA 3WAEA 2ZYNA 1GTKA 4F1YA 1Z7NE 3IOWA 2UXAA 3MZBA 4F39A 3VXCA 4U4XA 3MVZA 2O51A 3H03A 3IJXB 3TFLA 4ESXA 5HM4B 5DVJA 3K0VA 2G93A 3OELA 3UP9A 4C0RA 1B0LA 3MUQA 3B6TA 3FXUA 4ZE9A 3B6WA 2F34A 4UA8A 1H45A 1B6HA 4BDMA 2RKMA 1A99A 4UACA 2I3WA 4OETA 3IB1A 3LSWA 5HPQA 3I5OA 4LZ5A 2Q9TA 4OFLA 2G29A 4PFTA 4YKJA 4ZS9A 3SKPA 1NNKA 3MVWA 4NWCA 1FQCA 1CB6A 3OXNA 5AA2D 1FCKA 4OFOA 2LAOA 5DVIA 3MWBA 5H8NA 4NF4A 1LBBA 4EQBA 3QAXA 2Z8EA 4XKQA 1H43A 5BUUA 1UTHA 5KDTB 1USYE 1MXWA 3VV5A 3ZKKA 3IOTA 3CRBA 2RC7A 3CG1A 3DLNA 1IIWA 3V5AA 1VR5A 4PFWA 2QPQA 2PBWA 1PDAA 3FVGA 1Y20A 1B51A 3N6TA 3SERA 2X7QA 3V89B 4HW8A 3TCHA 1POTA 4LVQA 3H3GA 4JWXA 4IY5A 3TZAA 2HEUA 5J1DA 3K2DA 4DIGA 4F3PA 5I57B 1OVBA 4R9FA 1B3LA 1B3FA 3CFLA 5LOMA 2PX1A 1MXVA 3VLWA 2HZKA 2NWJA 1GGGA 1B40A 2HCAA 4ONYA 1OQGA 4MFIA 4JWYA 3FJMA 1Q1KA 4F31B 2AL5A 2UYEA 4JB7A 3IOUA 5F1QA 3B7DA 3K02A 4IO5A 2Z8FA 1IQ7A 1LFHA 4RJZA 3H6WA 3UORA 3T22A 4Q8RA 4E0XA 4RK2A 4YAHX 3HN0A 2NUVA 2OCUA 2X26A 3GLBA 4NMYA 2VGQA 4OMBA 4KYSA 4XKNA 4ELPA 5TPAB 1MM6A 4QFKA 2QJEA 1O64A 3S4UA 5JK4A 3PD9A 2RCAA 4BLAA 3N26A 4H5FA 3Q28A 4TLMB 3PPRA 4R9GA 2IEEA 5DVFA 4LZ7A 2ONRA 3G3KA 3DP4A 4LONB 1B5IA 4G2ZA 3B6QA 1QUJA 1JW4A 4FIMA 2WKYA 3SDFA 1QJMA 2NVUB 1LAXA 1LBCA 3SETA 2RF1A 3FV2A 4QSDA 1B0HA 1YAEA 1B7ZA 1NNTA 1OLCA 3CFZA 5CMCA 2P2AA 4Q30B 5ELVA 2OBGA 1N7WA 1JETA 2Q89A 3DP6A 3TMGA 5I84A 5L8DA 3RQTA 1URSA 3RTFB 2X7PA 1SI0A 1IZ1A 2V84A 4TLLB 3E3KA 3O9PA 1H3DA 5I2KA 1LGBC 3T66A 1M5DA 1NFTA 3OD7A 2HFBA 4KYEA 3OMBA 3AXFA 3OSRA 3K1NA 3OO6A 2I4CA 1FTOA 3IL1B 5K2YA 4L17A 2XX7A 4O3CA 2XXYA 2AYSA 5DEXB 4ZEBA 1MY2A 4H8JA 5FTIA 3VE1B 2F36A 1MXXA 2OWSA 3LC8A 5AA2B 1F9BA 4F3SA 3FJGA 3P7IA 1DOTA 2XXIA 2XXPA 3CSGA 1IITA 4JXIA 1LB8A 1WDNA 1MY1A 3UK4A 4R75A 5CM6A 2FNCA 5DTBA 4O3AA 1I6AA 1NH7A 5FHNA 3H6VA 3ZS6A 5I59B 1HSJA 1POY1 2A5SA 3PPQA 3Q26A 3IO4A 1ANFA 3PU5A 5AE4A 4YMBA 1MQHA 5CMMA 4IGTA 4GXAA 4G77A 4YB7A 4NF8A 2F5XA 3K6XA 4LZ8A 1YCJA 4NF6A 2O68A 3K4UA 3HHFA 2QRYA 4FEDA 2H98A 4GRKA 3LUYA 5EHSA 1T0KA 5H8QA 3K1PA 4RYAA 4YKIA 3U93A 1IXGA 4NF5B 1A8FA 5I56B 5F7VA 2ZNUA 2UVIA 1MH4A 4ZZAA 2GFEA 1ZMGA 2D5WA 4ZEFA 3SEYA 2XXXA 3EPEA 3CVGA 5L9SA 5A5XB 1LAGE 2DXYA 4WXJA 4AB6A 2ZMBA 3S9EA 3TTMA 3FXRA 1XT8A 3IR1A 1P1NA 3M3FA 4G68C 3EQ1A 3IB2A 1DTZA 4G68A 4FAJA 4MLVA 1PB8A 4O3BA 4BDRA 1N76A 3KZGA 1QKAA 4ZECA 3R26A 3KJ7A 3M3LA 5H8HA 1B5HA 3OOAA 5DYHA 2REGA 4PE5B 1MY0A 3BFTA 4OYVA 1IEJA 1PC3A 3VLUA 3D4GA 3O28A 1IXHA 4GOTA 4WKMA 5JTYB 1MPDA 3CFXA 4EXKA 3OENA 1N7XA 4OVJA 3T9UA 1TWYA 1IXIA 4G8MA 2ABHA 3ILUB 1PB7A 2I0CA 1II5A 1QUIA 1BTJA 3W9VA 2V3TA 4GXSB 4R73A 1UIVA 1M5EA 1S50A 2HXWA 4THIA 4DXBA 2H99A 3K00A 3G3GA 1P1WA 1DMBA 1MQGA 1JW1A 3MC2A 1FTMA 1M5BA 1MDQA 2F7CA 4NEDA 5I2NB 1Y3QA 2ZYMA 4EF2A 1LAHE 4LQ2A 5AA4B 4BDQA 4KHZE 3QUJA 1Y4TA 2REJA 2Z8DA 3FUZA 2RCBA 3QSLA 4LATA 4KPTA 2XD2A 4LP2B 3K6WA 3Q29A 3RT8A 4ELQA 2V93A 3TTLA 1GR2A 5ICQA 3VXBA 1D9YA 1Y1MA 3G3IA 2Y7WA 3ONMA 4OXVA 2NXOA 4C1TA 4KCDA 3VVDA 2OWTA 1UIUA 2THIA 4I1DA 1B1HA 1SI1A 2UVHA 4N07A 3U1OA 1EU8A 3LSFB 4Z0IA 4X48A 1LB9A 2VHAA 4U2RA 4OFJA 3E13X 1EH3A 2RC8A 3RNNA 1TFDA 4PQJA 4R74A 2GH9A 5H8NB 3MVYA 1MXYA 3OEMA 2XXWA 3IB0A 3FJ7A 1VE4A 1ZTYA 1QULA 3EHUA 3U8QA 3ZSFA 3TEPA 1JEUA 1HSEA 1MQJA 2YPNA 3O66A 2QSXA 1B4ZA 1N04A 3SEWA 4I9DA 3RPWA 4KFQA 2BJJX 4ZEDA 1B7HA 2XXRA 3SEVA 3C32A 3QXMA 1P1UA 5IKBA 3KFMA 3TQLA 1EZOA 5H8FA 5TP9A 2I48A 3HHGA 3DELB 1B1XA 4F1UA 1SW5A 4U1OA 3IJOB 3QK6A 2D3IA 3MP6A 3KOTA 4RNSA 3R7XA 1Y1ZA 1MH3A 3CG3A 2XX9A 3PUWE 3UGWA 3L6HA 1AIVA 4QRZA 4KCCA 4RPNA 1B5JA 4ECFA 1B7UA 1LFGA 5I58B 4DLDA 2DVZA 2QMXA 4QFNA 2PVUA 2FA7A 1OVTA 3IORA 4M1VA 1JEVA 1SD3A 2P0SA 2XXQA 4I8CA 3RGYA 3MVXA 4QFPA 2HZLA 1IUDA 4DCXA 2YJPA 4JWOA 3PGFA 1ZJLA 2DOJA 2PMSA 3KBRA 3VVEA 4F2OA 5JEIA 2QMWA 4RY1A 3TQWA 1I6BA 5CC2A 1D9VA 3GZGA 3MPKA 2F35A 1BKAA 4P0GA 3R6UA 3S2VA 1AOVA 5CMBA 2R6GE 4FJPA 1FTJA 4GLIA 4ZEIA 4F29A 4QSEA 2OZZA 4GL8A 2O7IA 4R6YA 1QKBA 1AMFA 3USDA 3H06B 3RT6B 3IOVA 3KG2A 1ELJA 2Y7PA 3TTNA 3H7MA 3KSJA 3I3VA 4DXCA 3TYHA 1A40A 3FV1A 2Y84A 3T96B 4R6HA 1WODA 3PUYE 2H4IA 1S9TA 1MY3A 1DSNA 1MG1A 1D4NA 3T9HB 1TT1A 1JNFA 3C4MA 2VOZA 1QUKA 1O63A 5DEXA 4F3GA 5L9MA 2DSFA 5KCJB 4GD5A 1LLSA 5I2KB 3KOSA 1SW4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DPEA 3SEXA 2O6AA 4YB5A 1KWHA 5EYGA 1IXCA 4P56A 4MLQA 2CEXA 3A09A 2A5TA 1VSOA 1Y3PA 3O29A 1FBDA 3D4CA 1MXUA 1FJ6A 2UVJA 4F19A 4TOZA 3KN3A 3BKIB 4X9TA 1FPEA 3HFUA 2KR0A 3KN7A 1NUXA 1B2HA 3O6GA 1URDA 1FPGA 1UQWA 3WAFA 1D3KA 1RDZA 4XIGQ 3W9WA 1IMBA 3LSLA 1JVYA 3C34A 2ZNTA 5CMKA 2VPOA 1FQFA 5EYFA 3TCGA 2XWVA 2B3FA 1EYKA 3H4ZA 4YU0A 1SQYA 3RUMA 4P47A 1EYIA 4ISUA 3L6GA 3TAJA 4ZDMA 2PCRA 1G0HA 1AH5A 4KYDA 1CE2A 1FW0A 1INPA 5I56A 1FQAA 3JV9A 3MJNA 4X8RA 1UTBB 5BWJA 4E0WA 1MY4A 2V25A 3SEUA 4F2QA 1DBZA 1P1OA 2OX3A 2YLNA 4NF8B 1R1NA 2DVCA 2XWKA 4QF9A 1MQDA 4NF6B 2HAVA 1S7YA 5EQ7A 4OVPA 3T9VA 1QW0A 4H45A 5H8QB 1BP5A 2DQVA 3O2AA 3A3UA 2DWHA 3SESA 4MBPA 2O84X 1DCUA 2D21A 1CNQA 2GQ1A 3KEIA 3C31A 1FBGA 1XOCA 2H25A 4MHFA 4IO6A 2FBPA 1TXFA 4ZE8A 1MRPA 4FATA 5LDZA 3MQ9A 3KC0A 2W7YA 4MIJA 1LFIA 1A55A 1XHYA 4QXDA 2PYYA 4POWA 2DE3A 4TQUQ 4DCYA 1OQHA 3PUXE 2R9JA 1SVXB 1FQBA 4YMAA 5IGAA 1NMUA 1NKXA 1LAFE 3GXAA 4G68B 4R2FA 5JTYA 1MM7A 1FBCA 4JBZA 3O97A 2Q88A 1B3HA 1KZ8A 4X1BA 3C36A 2QS3A 1FJ9A 3TDJA 3EHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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