1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
5I59A 5TPAA 4C1UA 5H8FB 1FQBA 1MY4A 4F1YA 2O7IA 1HSJA 3TCHA 3MUQA 3U92A 2I6EA 1MY2A 3R7XA 3C35A 3M3LA 4DDDA 1FTKA 2XD2A 4OYVA 1XHYA 3EHTA 1QVSA 3PUWE 4DXUA 3RT8A 3VVEA 4TOZA 2I3VA 1LAGE 1XC1A 3USDA 5I57A 1LGBC 2IA4A 2P2AA 4R2BA 3FUZA 4NF4B 2E0SA 5DVIA 2ONKE 4BDNA 4GQOA 4P0GA 4OEVA 3T9XB 4THIA 2V84A 2O68A 3K1PA 1PB7A 3ECRA 3HHGA 3PU5A 1B5JA 2DQVA 4QFLA 4NE4A 4MLQA 3FASA 3MQ9A 4GOTA 5DVJA 5DYHA 4ISUA 5H8NB 3PUYE 2HZKA 2OCUA 1QUIA 2UVJA 2RKMA 4L17A 3T22A 3CSBA 4OESA 3THIA 5IAIA 3H06B 3CRBA 2Z8DA 3OSQA 3S4UA 2FNCA 3FZVA 4IO6A 4XKPA 1DOTA 1PBQA 4FIMA 2HEUA 4R6HA 4QF9A 1P1UA 2F8DA 4RPNA 1LB8A 4NF8A 2B3BA 5F1QA 1LFGA 5AA4A 1S9TA 1MQHA 2F5XA 3FJMA 3IB2A 1A99A 4ZEBA 3U72A 4JSDA 4JDFA 4LVQA 3RQTA 2HZLA 3H03A 3UP9A 4FEBA 3W15C 3PD8A 5B70A 4MLVA 2F36A 5CRYA 2ZXTA 1IEJA 2UVIA 1B4HA 3T66A 1B7ZA 2P0SA 1NNPA 5CMMA 5BUUA 4RJZA 3HSTA 3MW0A 3BBRA 1VFEA 4BDOA 1MXUA 1P99A 2DYXA 2I0CA 4U2RA 2GFEA 4IO2A 1EZ9A 5KDTB 3FJ7A 5CMBA 1EU8A 4IGRA 1FTLA 1AMFA 4ND9A 1PC3A 1SBPA 2FA7A 1ATGA 1B1XA 4X9TA 3S9LC 3N26A 3R6UA 4PETA 1N7WA 1L5TA 3VE1B 1S7YA 3KSXA 4YKKA 3MC2A 4BDLA 1B3FA 1CE2A 2CZLA 1B5HA 2Z8EA 1IUDA 2DWJA 3SEWA 3G3GA 1DTGA 1D4NA 4BLAA 3M8UA 4XXUA 2DE2A 1YTVA 4DZ1A 1ZIUA 1Y1MA 5HBCA 4KYSA 4G4PA 5I58A 2F6PA 5L8DA 5M2VA 3V83A 1UTHA 4FATA 2KLFA 1OQHA 1NNTA 1MY3A 1MXZA 4R74A 4G8HA 4IO7A 2A5TB 3IAZA 2O7UA 3OO9A 4BDRA 3HN0A 2HQ0A 3O6IA 3TKDA 2V25A 3D4GA 4LQ2A 3VFJA 3R26A 4ESWA 3CG1A 3C33A 4XKNA 2ZYMA 3K1NA 3MVZA 4R9GA 3JYRA 1BP5A 1LFIA 1A8FA 2F97A 2V3UA 5DEXB 3HCQA 1R6ZA 4JWXA 1RYOA 1SD3A 1MDQA 3T9VA 2D5WA 4HW8A 1MXVA 1SW5A 3MP1A 1MM6A 3G3KA 1ZMGA 1B2HA 2QL3A 3MPKA 2HCAA 3DP4A 3QIMA 2ALUA 2R6GE 3O2AA 1MRPA 4DCYA 1B40A 3BFUA 3FV2A 4PP0A 1D9YA 1Y3NA 4G77A 1XT8A 4OENA 3IR1A 3MVYA 1TFAA 1FTMA 2DE3A 1LBCA 1N3WA 2ZYOA 4QFNA 2F7AA 4OMBA 3OO7A 1SYHA 5L9OA 1B7UA 2H98A 3H4ZA 1UTBB 3FVGA 3P7IA 4OXVA 3WAEA 4NF5A 3RN8A 3I3VA 4GIZA 3M3FA 2H5YA 1FW0A 1M5EA 1I6AA 3OO6A 4LATA 3PPRA 4FAJA 2Q8JA 2PX1A 2H9BA 1US4A 3KN8A 1B52A 1LBBA 4GFRA 4OFLA 2UVHA 2F78A 2REJA 5K2YA 3TAJA 5FTIA 2O1MA 2RCBA 3CFZA 4OETA 5I56B 4NTLA 5EYFA 1Y4TA 1B3EA 4U1ZA 1MH3A 4KCCA 3K2DA 4G68A 3KJ7A 1Z7ME 3S9NC 2OWTA 2PT2A 4ZS9A 1SDXA 3O28A 4GXSB 3KOTA 1RYXA 4KHZE 3S9EA 3PMXA 2QS3A 3MPLA 1JEUA 4G8MA 5CM6A 4OERA 1XS5A 3VXBA 3H6VA 4E0XA 2GH9A 4F18A 4Z7EA 5B7DA 3JZJA 1MQGA 1IITA 5AA2A 3GBAA 1JETA 2NVUB 1SI1A 1IXHA 1MQDA 4F2OA 4NWCA 4F19A 1VR5A 2XXXA 1YPNA 3TELA 4DLDA 3TODA 2Z22A 4Q0CA 2NWJA 4MH5A 2UYFA 1VSOA 3SESA 4ECFA 3U94A 4DCXA 3S9MC 1DTZA 1B51A 3CSGA 2ZMBA 3RT6B 5JK4A 3K01A 4P11A 4JWOA 5ELVA 3ZKKA 4MBPA 1HSLA 2PT1A 3B6WA 4GXAA 2QS1A 3BKIB 3TTMA 4IY6A 4WXJA 1NNKA 5EHSA 4F31B 1ZBMA 2QPQA 4QRZA 3CG3A 3IK6B 1Z7NE 4OHNA 2G29A 1I69A 3K02A 4YKPA 3U93A 1MM7A 3PD9A 3Q26A 3E3KA 2NOOA 1M5BA 3TYHA 1SQYA 3Q25A 3O66A 1MG1A 3MZ1A 1KWHA 1B32A 2DWAA 3IOVA 1LSTA 5I2NB 4H6DA 2AL5A 3CFXA 4YB6A 1MQIA 1QULA 5ITOA 1N7XA 2YLNA 1POTA 1PEBA 3WAFA 1DPPA 1USYH 5FHOA 2O69A 4ZE8A 2DOJA 2ZNUA 3RPWA 4MF3A 4X1BA 1B0LA 2Y7WA 4O3AA 2F7CA 1II5A 4ZDMA 1Q35A 4FORA 4YU0A 5H8HA 4NF8B 5KCJB 4PQJA 1P1OA 4GL8A 5AA4B 4PFTA 3B7DA 4OQOA 1H44A 2D3IA 1IXGA 2F7BA 3ZS6A 1N84A 4IB2A 2DXRA 4AQ4A 3O97A 2QMXA 3UA8A 2Y7RA 1QW0A 1SW1A 4JBZA 3TTLA 2ABHA 2CMOA 2B65A 3U1OA 4YKJA 1P1NA 4GD5A 1A8EA 4TLMB 4QSDA 2FYIA 4LZ7A 1EZOA 4E0WA 1A55A 3K6VA 5CBSA 4Q5TA 1QJMA 4N6PA 4LZ8A 3C31A 4NF6A 1JW4A 4F3GA 2XXYA 1OQGA 1USYE 3UN6A 1MY0A 4F3PA 1P1QA 2ZYNA 4LQ5A 1N76A 2W7YA 4FECA 3V89B 1LFHA 2OJTA 3DM0A 4KYDA 4GLIA 1AH5A 3IORA 3N6UA 3FATA 4WEDA 1MDP1 2X7PA 2RC7A 2XXVA 3EHUA 5A5XA 4YB7A 4F3BA 2GHAA 4LUBA 4KQPA 5BWJA 3MBPA 4LONB 3K00A 2Z8FA 2NUVA 4RNSA 1B9JA 1UTHB 4PE5B 4PFYA 1FQDA 2R71A 3TPAA 3TCGA 3TTKA 5AA2D 1FTJA 4H5FA 2XXUA 3C4MA 2Z23A 1AOVA 1BLFA 3EPEA 3K0VA 4ESXA 2ZNSA 2GHBA 2QMWA 2Y7PA 3EQ1A 1N04A 2I58A 3SKPA 2AL4A 1R1NA 1D9VA 4F22A 2I49A 2VP1A 3BFTA 2VD2A 3MVWA 5TP9A 2Q2CA 5KDTA 1B58A 4IO4A 4C1TA 3KGCA 2DE4A 1H45A 1FTOA 4G8NA 3UIFA 2V3QA 5H8QA 2O84X 4HCYA 4GF8A 5JEIA 1H43A 3PV0E 3L6HA 1N0TA 5I2KB 5JTYA 3LUYA 2VD3A 5CI5A 4I1DA 4PFWA 3FVKA 5K2XA 1PB8A 4C0RA 1POY1 1BIYA 5J1DA 2XHDA 5DTBA 2XX9A 4OTEA 3CI8A 1WVJA 4QFPA 4RA1A 1JVXA 3TMGA 1DSNA 1ZTYA 3FIRA 3SEXA 4YB5A 1XVYA 3QUJA 3JV9A 2E1SA 2OZZA 4XKRA 3UGWA 3UORA 4K3FA 3VLUA 1B3LA 2DS9A 2AIXA 1PBPA 3V5AA 2X26A 5H8SA 3PUZE 3PUXE 2I48A 1Y3PA 1R9QA 4EUOA 4KR5A 2A5TA 4EXKA 1MH4A 1B46A 4QFOA 1QUKA 3QSLA 3IOWA 5HPQA 4XIGQ 3FJGA 2H25A 3H7MA 1OMPA 2F35A 3F11A 4F1UA 3OEKA 4O3BA 3AXFA 3RGYA 4GRKA 3OMBA 3K6WA 5DEXA 2YJPA 2UVGA 1Y1ZA 3DP8A 5DVFA 4U4XA 2THIA 4G68B 2R9JA 4ELQA 3MZ9A 1SI0A 1D3KA 5LOMA 2A5SA 4N13A 3OOAA 2XXIA 3EF7A 3VDFA 4M4GA 3Q28A 1O63A 1OLCA 3VLVA 1JW1A 3RY3A 1FCKA 3FXRA 4NEDA 4G68C 5CBRA 4OZ9A 4ZZAA 2XD3A 1TWYA 3QYTA 3VXCA 1O64A 3C9HA 4FJPA 5CMCA 1A54A 5AA2B 1CB6A 2O51A 4JXIA 4EXLA 4H65A 3VVDA 2G93A 4H0WA 4HS7A 4RXLA 5ITPA 1IZ1A 2XXQA 4UACA 1LAHE 1EH3A 2HAVA 3VV5A 4OFOA 1NFTA 5F7VA 3IJOB 4EF2A 1LCTA 3KEIA 3TTNA 2Q9TA 4I8CA 2XX8A 1B4ZA 3TQLA 1FQEA 3KJTA 1JW5A 4JWYA 5I56A 5I59B 5TPAB 4KI0E 1NNFA 4DXCA 5EHMA 3A3CA 1URSA 3IOTA 2ANJA 3FXQA 4OWDA 3G7WA 3IX1A 5L9MA 2XXHA 1LCFA 4M1VA 4WKMA 2V3TA 2AYSA 3RLFE 4ONYA 3K1MA 3O6GA 2B3FA 3MP8A 3HO7A 2M8CA 3LSFB 3H3GA 3IJXB 4EQBA 4JSOA 4H1XA 1MXYA 1OVBA 3B6QA 4FEDA 4Q30B 5I57B 3RNNA 4AB5A 1B0HA 3E4RA 1FQCA 3KSJA 1ZJLA 4F39A 3SEUA 4DE8A 5AA1A 3H6UA 1T0KA 3OXNA 1M5FA 3QXMA 3T9UA 3PMVA 3W9VA 3GXAA 4WEPA 1LB9A 2OWSA 4RK9A 2I0BA 2P1SA 3T93B 4X1DA 3VVFA 4GL0A 3KOSA 5H8HB 1JNFA 3G3IA 2LAOA 4QHQA 2ONRA 4EF1A 3KBRA 3OENA 1AIVA 1H76A 1B3GA 2PMSA 4O3CA 1DPEA 3ZSFA 2VHAA 3C34A 4QSEA 4F29A 3IL1B 1MPCA 3MZBA 5H8FA 2OBGA 2Y7IA 3D4CA 1A40A 1XOCA 2RC8A 1ZKBA 2DWIA 3LBSA 3TQWA 3N94A 1FQFA 3O6HA 3MVXA 1R9LA 2H4IA 2XXRA 1GV8A 4R6YA 1NH8A 3IOUA 3Q27A 4RPOA 3W9WA 3G3JA 1URGA 5FTHA 1Q1KA 2UYEA 3UK4A 5ICTA 3K4UA 3VLWA 1TT1A 4G2ZA 1WODA 1M5CA 2Q2AA 4IO3A 4R73A 2RINA 2QS2A 1GR2A 4F3SA 4NF6B 4ZEKA 3OELA 5I2NA 1UIUA 1J1NA 4R75A 1BKAA 4NF4A 4XKQA 3TEPA 1B6HA 4R2FA 1GGGA 4KD5A 3TTRA 1JEVA 3HHFA 2PBWA 2DXYA 5L9SA 3TDJA 3O29A 3OSRA 3A09A 3LSXA 4F2QA 4NMYA 4OVJA 4NWDA 3L6GA 2DP8A 5KCJA 2DSFA 4P0IA 1EZPA 5A5XB 4ZEIA 1N3XA 1UIVA 3QUFA 5H8NA 3ONMA 1FQAA 2Y7KA 1ANFA 1B5IA 2I4BA 4YMBA 5IKBA 2Y84A 4XTCQ 1Y20A 3V8XB 2ZYKA 4POWA 4ELOA 4U23A 3ZKLA 5CC2A 1I6QA 3FD3A 3ILTB 3OEMA 2Q89A 4Z0IA 3B6TA 1A7LA 2RC9A 4YAHX 1B7HA 4ZE9A 1HSEA 3SEYA 5I58B 5TP9B 1M5DA 2BJJX 1NKXA 4QSCA 4HCWA 5H8QB 4KFQA 3CFLA 3TZAA 3MAMA 1JQFA 1MXXA 5ICQA 5JTYB 3HPIA 3OD7A 3FXUA 3PPQA 1IIWA 4RY1A 1Y3QA 3KZGA 1Y4CA 1QUJA 2I4CA 4Q8RA 3LC8A 4ZEDA 3KN7A 5AA3A 3EHSA 1SW4A 1ZLQA 5FHMA 4AB6A 3MJNA 5ISUA 1MPDA 1B3HA 4TQUQ 1US5A 2ONSA 2YPNA 4BDQA 4U21A 4UA8A 4RYAA 3GBBA 3T96B 1TXFA 2UXAA 1ELJA 2HAUA 3I6VA 2XXWA 3LSWA 4FE8A 3FVOA 4BDMA 4ZZEA 3A3UA 3KG2A 2X7QA 3PPNA 1SW2A 3E13X 3HV1A 3MP6A 4EQ7A 4HTGA 4KYEA 4EDPA 4KPTA 4H8JA 2ZNTA 1GVCA 4F1VA 1YAEA 3KN3A 5FHNA 3FGSA 4R72A 1DMBA 1MPBA 1NMUA 5I84A 3ODBA 4TLLB 3GLBA 2XXTA 3K6XA 3N6TA 4ZECA 2OK2A 3TFLA 4YMAA 1UQWA 4NF5B 1GTKA 3C36A 5I2KA 2HXWA 2QJEA 3G3FA 1BTJA 2DVCA 4ELRA 4JB7A 3CR9A 1B1HA 4I62A 1PB9A 4YKIA 3FVNA 2DWHA 4PFUA 3M3KA 3RUMA 1SYIA 3DELB 1VE4A 2QSXA 5TU0A 3EN3A 2OLBA 1RKMA 1F9BA 1Y9UA 1VFDA 4QFKA 1IQ7A 1MY1A 4ELPA 2REGA 2D21A 4H5GA 2WKYA 3K6UA 2HFBA 1OIBA 3RTFB 4IY5A 3GZGA 2PYYA 4H8IA 2DVZA 3H6WA 2O6AA 1OVTA 1OLAA 3SETA 2Q88A 4ZEFA 3RTWB 1H3DA 4LZ5A 3O9PA 4RK2A 3QK6A 3T9HB 2XX7A 3E9XA 4R9FA 3FV1A 1S50A 5DT6A 1I6BA 4U22A 4LA9A 3OO8A 2QRYA 3IB1A 3ILUB 2O1LA 4LP2B 3G3HA 3U8QA 3I5OA 1QKAA 1XVXA 2XXPA 1NL5A 2IEEA 3IB0A 3PGFA 1UTBA 4KCDA 2F6GA 4IGTA 2ESNA 3SERA 1MXWA 1IXCA 4U1OA 4DIGA 3TCFA 1IXIA 4EQ9A 1P1WA 3PPPA 3C32A 4OFJA 3S2VA 4R6KA 1URDA 1O7TA 3DLNA 3MWBA 4IO5A 1TFDA 1LAXA 1QKBA 1WDNA 5KZTA 1AL3A 5HM4B 2V93A 4GWOA 1YCJA 3Q29A 1JVYA 4YICA 3DP6A 3IO6A 4YZZA 3KFMA 4POXA 4H67A 3H6TA 4U4SA 2NXOA 4OEUA 2GRVA 2PVUA 1NH7A 3IO4A 2QS4A 5AE4A 1LAFE 2F34A 3CVGA 3QAXA 1SVXB 2VOZA 4X48A 4N07A 1B05A 2RF1A 1MS7A 3PUVE 5CMKA 3TUSA 3SDFA 3SEVA 3PMWA 1MQJA 1LLSA 3CIJA 4DXBA 3LSLA 4GVOA 2I3WA 2H99A 4I9DA 3PPOA 2VGQA 3N5LA 2RCAA 1ZU0A 4MFIA 1PDAA 3LR1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I59A 5TPAA 4C1UA 5H8FB 1FQBA 1MY4A 4F1YA 2O7IA 1HSJA 3TCHA 4NF0A 5ET7A 3MUQA 3U92A 4O7MA 2I6EA 1MY2A 3R7XA 3C35A 3M3LA 4DDDA 2CEYA 1FTKA 2XD2A 4OYVA 1XHYA 3EHTA 1QVSA 3PUWE 4DXUA 3KC0A 3RT8A 3BIGA 3VVEA 4TOZA 2I3VA 3D1RA 1LAGE 1XC1A 3USDA 2JJKA 5I57A 1LGBC 2IA4A 2P2AA 4R2BA 3RPLA 3FUZA 4NF4B 2E0SA 5IZ3B 5DVIA 2ONKE 3ISPA 4BDNA 4GQOA 4P0GA 4OEVA 3T9XB 4O7IA 4THIA 2V84A 2O68A 3K1PA 1PB7A 3ECRA 3HHGA 3PU5A 4GWXA 1B5JA 2DQVA 1FPLA 4QFLA 4NE4A 4MLQA 3FASA 3MQ9A 4GOTA 5DVJA 5DYHA 4ISUA 4P8BA 5H8NB 3PUYE 2HZKA 2OCUA 4P9KA 1QUIA 2UVJA 2RKMA 4L17A 3T22A 3CSBA 4OESA 3THIA 5IAIA 3H06B 1VDWA 2Z8DA 3CRBA 4HE1A 3OSQA 3S4UA 2FNCA 3FZVA 4IO6A 4HE0A 4XKPA 1DOTA 1PBQA 4FIMA 2HEUA 4R6HA 4QF9A 1P1UA 2F8DA 4RPNA 1LB8A 4NF8A 2B3BA 2P3NA 5F1QA 1LFGA 5AA4A 1S9TA 1MQHA 2F5XA 3FJMA 3IB2A 1A99A 4ZEBA 1LBWA 4PFIA 3U72A 4JSDA 4JDFA 4LVQA 3RQTA 2HZLA 3H03A 3UP9A 4FEBA 3W15C 3PD8A 5B70A 4MLVA 2F36A 5CRYA 2ZXTA 4N6KA 1IEJA 4P1LA 4PAFA 4GBVA 2UVIA 1B4HA 1LEVA 3T66A 1B7ZA 3KC1A 1IMDA 2P0SA 1NNPA 5CMMA 5BUUA 3FXBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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