2AL4A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate and cx614.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A02
1UIVA 4NF4B 3M8UA 1H3DA 1B9JA 2AYSA 3S4UA 4LATA 3RT8A 1R6ZA 4H8IA 4FJPA 1SI0A 4R6KA 4GWOA 3LSXA 2B3BA 4U4SA 4F3BA 3ECRA 4QFNA 1SQYA 1YTVA 2F6GA 4X9TA 2A5SA 3I3VA 4EQBA 1B3FA 3IB0A 1NL5A 2O7UA 4JWYA 5DEXB 1MQJA 3OO6A 3CFXA 4OFOA 4FEBA 3AXFA 3N6UA 3T22A 5I2KA 1MQIA 1M5DA 1LFIA 2IA4A 4GIZA 2XXHA 2QS3A 4G8NA 3KN3A 1OQHA 1PB8A 4PFWA 1TT1A 1LBCA 1OQGA 5JTYA 4C0RA 2V3UA 4G77A 2F5XA 5BUUA 1Y9UA 1OMPA 5H8NA 3MVWA 4R9FA 3GZGA 3S9NC 4YICA 4WXJA 5I58B 4XKNA 1H76A 1TXFA 2E0SA 4EF1A 5AE4A 4BDOA 5CM6A 3QUFA 3R7XA 3ILTB 4YB6A 4F1YA 4F3PA 1POTA 3A3UA 2I4BA 4C1TA 3N94A 2RC7A 2Z22A 2RF1A 5DVJA 3MC2A 4WEPA 1NNPA 4R75A 3FJMA 3HSTA 2ZNUA 4DDDA 3KSXA 1UIUA 3HHGA 1Y1ZA 3C35A 5JK4A 1JVYA 4FEDA 5EHSA 5AA2A 1WVJA 4OETA 5A5XA 1HSEA 1IEJA 3PUYE 4RNSA 3KJTA 1DMBA 3CIJA 2Q8JA 2QJEA 1XOCA 3E3KA 4E0XA 3FXRA 3H3GA 4YMAA 2ZXTA 3QSLA 3S9EA 5IKBA 1XT8A 4EQ7A 1LB8A 2F8DA 3B6WA 1MY4A 1QVSA 5CMMA 4QFOA 1VR5A 1JW1A 1MY1A 2PVUA 4DLDA 3D4GA 2Z8FA 4NF6B 4HCYA 3HV1A 1QUIA 2I48A 5B70A 4QFKA 4RK2A 3O66A 1YAEA 3G3KA 3LR1A 1UTBB 1LGBC 1AL3A 5H8FB 3QXMA 4IO6A 5K2XA 3T96B 3IB1A 5ICTA 1B4ZA 2H25A 1MS7A 2XXWA 3VDFA 3OSQA 1SVXB 2HQ0A 5L9OA 1BTJA 1ZMGA 3MPKA 1XS5A 3H6VA 3K2DA 3IR1A 1LCFA 1A54A 2I58A 5L9MA 4IO2A 5ELVA 2FA7A 3FJGA 3U8QA 3TQWA 4KYEA 1PC3A 1Y3PA 2Y84A 4AB5A 2W7YA 3O28A 1N3WA 4I8CA 1QUKA 4YKKA 4F2OA 5TU0A 5LOMA 2GHAA 3C4MA 1P1UA 3OXNA 4G68C 5ITOA 1JEVA 1B32A 3ZSFA 5FTHA 1ZLQA 3S2VA 1N3XA 3QIMA 2OK2A 4ZEBA 3EHTA 5M2VA 4E0WA 2HEUA 2Q2CA 2UVIA 3GBBA 3PPRA 4N13A 4POXA 5H8SA 2V3QA 4H5GA 1JQFA 4EXKA 4ZEIA 4EDPA 1I6BA 1AOVA 3V83A 3TQLA 2NUVA 1MY3A 3PPPA 2PX1A 3O6IA 4POWA 3U72A 5I57A 4IGRA 1D9YA 4M4GA 1UQWA 4JBZA 1B1HA 4RXLA 4YZZA 4XXUA 2DE3A 1LBBA 3OO8A 2YJPA 4F18A 2REGA 1BP5A 3MP6A 4LZ7A 1RYXA 5HBCA 2UVJA 3TFLA 2I4CA 2ONSA 1ZKBA 5B7DA 3RNNA 3GBAA 3K02A 3VXCA 4U1ZA 2DWJA 3OEKA 4LONB 4YAHX 4ZS9A 1POY1 2F36A 3K6VA 3W9VA 3KBRA 4AQ4A 1DSNA 2LAOA 4FIMA 4U2RA 1OIBA 4GFRA 3TMGA 5F1QA 3CR9A 1UTHB 1ZJLA 3F11A 1MM7A 4EXLA 5ISUA 4GD5A 1N7XA 4P0GA 4OFLA 2XXTA 2H5YA 1MPBA 4OEVA 2F7CA 4O3AA 1JW4A 1YCJA 1I6QA 3Q26A 1SBPA 4GRKA 3SESA 2GH9A 4LQ5A 1SD3A 3OSRA 2F34A 3TCFA 2D5WA 2UVHA 3FXQA 1B7HA 3Q25A 3ILUB 1MM6A 3H6UA 2ESNA 3FASA 2OJTA 3KG2A 3RTWB 5I56A 1QUJA 2B65A 1XHYA 3H6TA 4JWXA 5H8HA 1EU8A 5H8QA 4TOZA 4IO5A 1A8EA 3MP8A 1O64A 4OVJA 1NFTA 5I2KB 5FHMA 4ZE8A 1WDNA 3FGSA 1D4NA 3SEVA 1FTOA 3E9XA 3LUYA 2NVUB 1SI1A 4WKMA 2I49A 4KPTA 3C32A 5DYHA 3DLNA 3O6GA 1LB9A 4RPNA 2F7AA 4G68A 5JTYB 3GXAA 1MXVA 3VV5A 2DS9A 2O84X 2ONKE 5KCJA 5H8NB 5DT6A 1SW1A 5HPQA 2GRVA 4GL0A 3VE1B 1O7TA 2IEEA 3UA8A 2BJJX 3K1MA 5DTBA 4ZE9A 2Q2AA 3TODA 1B3EA 3V5AA 5K2YA 4GL8A 3PPOA 3U94A 1GTKA 3MVYA 2F6PA 4N6PA 5AA4A 3JZJA 3I6VA 1MXWA 4OZ9A 3VLWA 5AA2B 2XD3A 4FORA 5A5XB 2I0BA 2XXUA 4NF5A 4RK9A 3FV2A 2ALUA 1B7UA 4NF8A 3TUSA 3E4RA 4WEDA 2PYYA 3C36A 3O97A 4OENA 2V25A 3WAEA 1A7LA 1XVXA 2F7BA 3CVGA 1A40A 3FVGA 1P99A 4IO3A 2I3VA 3SEUA 4MH5A 4JDFA 4KYSA 3MVXA 1B1XA 1BIYA 1SW4A 2V3TA 4F29A 5CBSA 2ZNSA 1DTZA 4F19A 2DE4A 3KJ7A 2V84A 3TTKA 2XXPA 1NH8A 3KZGA 1S9TA 3IAZA 3G3GA 3Q29A 3H4ZA 1LAFE 3EHUA 4GOTA 3B6TA 4EUOA 1VSOA 3BKIB 4QSCA 4KR5A 1JW5A 2D21A 2DOJA 5AA2D 1LSTA 1SW2A 4U1OA 3TZAA 4F31B 2Q88A 3TTRA 3BBRA 1LAHE 3T66A 3DELB 3FZVA 4LZ5A 1P1QA 1US4A 4RJZA 3VVEA 1B0LA 3I5OA 3T9UA 2NXOA 3IOWA 2X7PA 2KLFA 2ONRA 3PPQA 4H5FA 2A5TA 4Z0IA 4OERA 2DE2A 2O68A 5L9SA 4ELPA 1LAXA 4ZZEA 1EZ9A 2WKYA 4QSDA 1H44A 1N76A 1N84A 2XD2A 2O6AA 2YPNA 3G7WA 2DWHA 3IL1B 3L6HA 4O3BA 2B3FA 4QSEA 1QW0A 2Y7PA 3ZKLA 3FIRA 4KQPA 4XIGQ 5FTIA 2HZKA 2GFEA 2ZYMA 1I6AA 1BLFA 5TPAA 3L6GA 1RYOA 5I57B 4X48A 3PPNA 1LFGA 2QS2A 3TDJA 1FQEA 1MPDA 3UGWA 3UP9A 3CFZA 3OD7A 1SYHA 1US5A 1MQDA 4XKQA 1M5CA 1J1NA 1B52A 2Y7WA 4P11A 3KEIA 3N26A 1N04A 1PEBA 3R6UA 5I59A 2DQVA 3TELA 3RPWA 2RCBA 4G2ZA 2GHBA 3T9HB 4ESWA 4ONYA 3JV9A 1MRPA 4LP2B 3FATA 3RGYA 3BFUA 4QF9A 2XXVA 1O63A 4N07A 1GR2A 3SEXA 2I6EA 5ICQA 3OEMA 4KYDA 4R2FA 4F39A 2QL3A 2ZYKA 1NNKA 3H7MA 3K4UA 3KOTA 1B5JA 1XC1A 2HXWA 3MBPA 3QAXA 1GV8A 3IOVA 4ZEFA 3GLBA 4JWOA 3CFLA 2E1SA 2VOZA 2M8CA 4R2BA 1IIWA 2FYIA 1T0KA 1SW5A 3IB2A 3OMBA 4L17A 4OMBA 1L5TA 1Z7ME 3MAMA 3TKDA 1NMUA 3TCHA 3U92A 4RYAA 4H0WA 3FD3A 3LSLA 4TQUQ 4LUBA 4XKPA 5I56B 5ITPA 4BDLA 1A99A 5H8HB 5H8QB 3A3CA 2P0SA 1FQFA 2X7QA 5I2NA 3CSGA 3N6TA 5BWJA 4DXUA 4HCWA 1NH7A 4OTEA 2X26A 3G3JA 1Y4TA 3K1NA 2XXYA 2OWTA 4OEUA 4F1UA 5TP9A 2VD3A 2PT1A 5CMBA 2P2AA 3H03A 3PD8A 1Y20A 4Q5TA 4G68B 2Y7IA 3UIFA 3MZ9A 2DP8A 2XHDA 3HPIA 5KCJB 4U22A 4PE5B 4MBPA 2R71A 2VD2A 3OENA 4OHNA 4YB7A 2RKMA 5IAIA 3PMWA 1QKBA 3HHFA 1AMFA 4IB2A 3SEWA 5EYFA 1WODA 3C33A 5AA4B 1Q35A 3U93A 1D3KA 1N7WA 1B5IA 3TPAA 4MFIA 4Q0CA 3C31A 1S7YA 1DTGA 4NF5B 3UORA 3IO4A 4NF8B 3JYRA 4P0IA 4QRZA 2PBWA 3KSJA 2VGQA 1USYH 5J1DA 4GXSB 1IUDA 4BDRA 1MXYA 2REJA 1N0TA 1II5A 2Q9TA 1PBPA 3SEYA 4BDMA 2H4IA 1IZ1A 1MY0A 1EZOA 1MG1A 4C1UA 1M5BA 2O69A 4I62A 1HSJA 5L8DA 3FXUA 2G29A 2OCUA 2F78A 1OLAA 4GF8A 4YMBA 4HW8A 3MZBA 3TEPA 2R9JA 3P7IA 2O7IA 3V89B 3K0VA 3DP4A 4OFJA 3WAFA 1FCKA 2UVGA 3PUXE 2F35A 3R26A 4ND9A 1FW0A 3EN3A 4ZEDA 4BDNA 4KI0E 4MLQA 4PP0A 1UTHA 4LVQA 3B6QA 3A09A 3EF7A 2RC8A 4GLIA 4K3FA 5I84A 1PBQA 3DP6A 1URGA 3OOAA 2PT2A 1LLSA 4F3SA 4ELRA 1P1WA 3VVDA 4IO7A 3PGFA 3VFJA 2Y7RA 3DP8A 2NWJA 1B40A 1LCTA 3EPEA 3IK6B 1B6HA 1QJMA 3BFTA 3B7DA 3KGCA 1OVTA 1SDXA 3O9PA 2A5TB 3KN7A 4LQ2A 2ZYOA 1R1NA 1ZBMA 3FV1A 1MDP1 1DPPA 3IOUA 2AL4A 1FQBA 1FTLA 4QHQA 3QUJA 2FNCA 3MPLA 1CB6A 3MZ1A 4PETA 1MXXA 4U4XA 1ELJA 3MWBA 1B4HA 3S9MC 4DCXA 5JEIA 1B7ZA 1P1NA 2I0CA 4QFLA 2OWSA 1F9BA 5CMCA 1R9QA 4R73A 3DM0A 4FECA 5TPAB 4JSDA 4ECFA 3LSWA 2XXIA 4YB5A 3CG3A 1IXGA 4AB6A 2CZLA 1BKAA 1VE4A 1AH5A 3O2AA 1B3GA 1FQDA 3ODBA 1MQGA 3IORA 3Q27A 3OO7A 5I59B 1JVXA 4ZDMA 1IXHA 5KDTA 3THIA 4EQ9A 3SETA 2QMWA 4I9DA 4LA9A 2PMSA 1B3LA 4PFTA 1RKMA 1MY2A 2XX8A 4ELOA 3HN0A 1EZPA 2Z23A 4F3GA 1FQAA 4RPOA 3TTMA 5FHOA 3USDA 3HCQA 2DXYA 3CSBA 3LC8A 4R72A 4IGTA 1P1OA 4ZEKA 2HFBA 3TTLA 1CE2A 2Z8EA 1PDAA 3RQTA 3S9LC 3MJNA 1ATGA 1OLCA 3PMVA 1AIVA 4OWDA 3FVKA 3FUZA 5DVIA 2DVCA 1Q1KA 1B0HA 5EHMA 4NE4A 2RCAA 1B2HA 4NF4A 2QPQA 3O6HA 1TFAA 4ZECA 3VVFA 1XVYA 2V93A 1QKAA 1IITA 5CI5A 3VLUA 3PUVE 3QYTA 3SKPA 3OELA 3UK4A 5HM4B 2XX7A 4F22A 3IOTA 5CRYA 1Y3NA 5KZTA 1H43A 5CMKA 1OVBA 4U23A 1S50A 4ELQA 4U21A 2QRYA 4H1XA 4IO4A 4KD5A 4FE8A 3SERA 2DVZA 3MQ9A 3K1PA 1FTJA 5DEXA 4ISUA 3CRBA 1QULA 2HZLA 2VP1A 3PV0E 1ZIUA 2ABHA 4H6DA 2Z8DA 1B5HA 5I2NB 2VHAA 1JNFA 4MLVA 3IO6A 2O51A 4TLLB 3PUZE 3W9WA 4PFUA 4NEDA 4Q30B 4H8JA 2G93A 1IXIA 3SDFA 4PFYA 3RLFE 5DVFA 4I1DA 4GQOA 5TP9B 2DYXA 2HAUA 2HCAA 3CG1A 2NOOA 4EF2A 4JSOA 1KWHA 3C34A 3MUQA 4R6YA 4OYVA 5CC2A 4RY1A 3FVOA 3Q28A 4R6HA 2DXRA 3G3FA 4YU0A 4G8MA 3PD9A 2Y7KA 3T9XB 5I58A 1JETA 1TWYA 1M5FA 3K6XA 1MH3A 2OBGA 2RINA 2OZZA 4HS7A 4G8HA 4UA8A 1Y3QA 1USYE 3G3IA 5AA1A 1DOTA 1A8FA 4ZZAA 4FAJA 3KFMA 3EQ1A 1URSA 1LFHA 3ZS6A 2QS4A 5AA3A 2OLBA 2CMOA 4DXCA 4KFQA 4PQJA 4DZ1A 4NMYA 2DWIA 3FVNA 2DWAA 3PUWE 2UYEA 1VFEA 1Y1MA 2Q89A 5FHNA 2QS1A 4DE8A 4Z7EA 1FQCA 1B58A 1B46A 1Y4CA 3CI8A 4NF6A 1NNTA 3KOSA 3MW0A 4M1VA 1DPEA 3IX1A 2H99A 1MXUA 4OESA 4FATA 2AIXA 2P1SA 2ZYNA 1UTBA 3C9HA 1PB9A 3W15C 3N5LA 3M3LA 5H8FA 3VLVA 4G4PA 4X1BA 3LSFB 1A55A 3U1OA 2DSFA 4JXIA 4R74A 4KCDA 3E13X 1H45A 2THIA 2F97A 3D4CA 2XXRA 1NKXA 3H06B 3TYHA 4OQOA 1EH3A 4MF3A 2R6GE 4KCCA 1R9LA 4BLAA 2UYFA 1MDQA 3MVZA 1Z7NE 1ANFA 4UACA 4QFPA 4GXAA 4YKJA 1FTMA 3T9VA 1MQHA 2ZNTA 3KN8A 2XX9A 4NTLA 3RTFB 3TCGA 3T93B 3FJ7A 4THIA 1YPNA 3LBSA 1SYIA 2H98A 4LZ8A 4XKRA 3VXBA 3K6UA 4IY5A 4Q8RA 1VFDA 2XXQA 4HTGA 3TAJA 1MH4A 2QSXA 4OXVA 1MXZA 3M3FA 1JEUA 3RY3A 2AL5A 2H9BA 1ZTYA 4DXBA 4YKIA 1TFDA 2YLNA 4NWCA 3G3HA 2O1LA 2ZMBA 3O29A 3RUMA 1GVCA 3IJOB 1B3HA 2D3IA 4X1DA 1NNFA 4O3CA 1HSLA 1LAGE 4ESXA 4DCYA 1GGGA 1IQ7A 4XTCQ 4JB7A 5F7VA 4DIGA 4BDQA 4H67A 1FTKA 2O1MA 4GVOA 3MP1A 3UN6A 4F1VA 4TLMB 5CBRA 3IJXB 2XXXA 4YKPA 3K01A 4RA1A 1I69A 1B05A 2ANJA 3TTNA 1URDA 2RC9A 3OO9A 3V8XB 3HO7A 5KDTB 3QK6A 1MPCA 3PMXA 3PU5A 3RT6B 3ZKKA 4R9GA 4F2QA 3K6WA 3H6WA 4IY6A 2UXAA 1PB7A 1B51A 3ONMA 3RN8A 1IXCA 3K00A 4H65A 2I3WA 2QMXA 1M5EA 4NWDA 4KHZE 3M3KA 1D9VA 2HAVA 3EHSA 1ZU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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