2B65A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 117
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A02
3SEYA 4DE8A 1T0KA 3IOWA 2Z22A 4XKNA 5L8DA 1B1HA 1MXWA 3TCHA 5L9SA 1NMUA 3HSTA 3IJOB 3G3JA 4N07A 4YB7A 4H8JA 4IB2A 3BFUA 1IITA 2DOJA 1M5CA 1B9JA 1Y20A 2HFBA 4H1XA 2P1SA 4ZZEA 3B6QA 1SI0A 2HZLA 2D3IA 5I2NB 3AXFA 2QS1A 1QKAA 4OYVA 5CI5A 3G3FA 3C35A 5A5XA 4C0RA 5CMKA 2O7UA 4WEPA 3W9VA 2DVZA 3O6GA 5JTYA 3HPIA 3KN8A 4POXA 2NWJA 2AIXA 1IEJA 3O6HA 3TUSA 3DP4A 5H8NA 4QFOA 1A54A 1JETA 4ISUA 3DP8A 1EU8A 1NFTA 4PFYA 2Z8DA 4KQPA 1MY4A 2V3TA 3QYTA 3UIFA 3D4CA 3FGSA 1JEVA 3CR9A 4MFIA 1B2HA 4F39A 4AQ4A 4RY1A 4GOTA 4GXSB 4MLVA 3GZGA 4ESWA 4DZ1A 4F3SA 3QK6A 4Q5TA 1QKBA 3KN3A 3PMWA 1FCKA 2Z8FA 4RJZA 1BKAA 1JVYA 4R75A 1ZLQA 1TT1A 2BJJX 1JVXA 2AL4A 1FQCA 1M5DA 3CVGA 4F19A 4YMBA 1I69A 4H65A 3IB1A 2I48A 5BUUA 3N26A 1OVBA 4GXAA 4F3PA 1Y1ZA 3FJMA 2Q89A 1LBCA 4YKPA 3EHSA 2O68A 3EHTA 2H98A 4R9FA 3L6HA 4H8IA 2F5XA 4PP0A 1PBQA 2HZKA 2DP8A 2O1LA 3OO8A 4O3AA 4OEVA 3TQWA 4RNSA 1MRPA 2Y7RA 1GVCA 4Q0CA 2Q9TA 2FNCA 2H5YA 2XXYA 3K1PA 5CMMA 1RYOA 4F31B 3HN0A 3LUYA 3ILTB 5M2VA 1ANFA 1FTMA 4PETA 3VV5A 4TLLB 4F3BA 1H43A 3T9HB 1HSJA 1M5FA 2PX1A 4YZZA 2ZYNA 3OSRA 3UP9A 5BWJA 1SYHA 2LAOA 2UVHA 3KZGA 4ELQA 1AMFA 5I56A 3ZKKA 3FXQA 3IAZA 1ELJA 2XX7A 2OLBA 4LQ5A 3CSBA 1MPDA 5DYHA 2A5TA 1MH4A 3GBAA 3TYHA 1Z7ME 1H44A 2DE4A 3IOTA 2Y7PA 3LR1A 1UTBB 3GBBA 4G8NA 1IXCA 4E0WA 4NF6A 1B5JA 4OENA 3C32A 1SVXB 5AE4A 3HHGA 5EHSA 3H06B 1MQHA 3R6UA 2PT1A 3BBRA 3IOUA 4GF8A 3P7IA 2O69A 1XS5A 4XTCQ 2ONKE 1US5A 2XXXA 5AA4A 1POTA 3MC2A 1NKXA 3CG3A 5AA2A 1FQDA 2QRYA 3KSJA 3VLUA 4EQBA 3UN6A 1LB8A 3VLWA 4ZE8A 4RYAA 1FTKA 2DXRA 3VVFA 1HSLA 2F7AA 2VD2A 2DSFA 3FZVA 2V3UA 3FJGA 4FATA 4U21A 3K1NA 4JXIA 3W9WA 1R9QA 1VSOA 3S9NC 4FJPA 1LCFA 4LQ2A 3Q26A 3C9HA 3BFTA 4F22A 5H8NB 3VE1B 3PMVA 3F11A 4ESXA 3IR1A 1ZIUA 5CBRA 2OWSA 2R71A 5I58A 4GL0A 3KJ7A 3FVGA 2FA7A 1CE2A 2XXPA 4ZEFA 5FTIA 3S9MC 4G68C 2ZNUA 2R9JA 1ATGA 3MVXA 1SDXA 5KCJB 2HXWA 3O6IA 3E13X 1S7YA 3RLFE 2XD3A 4QFPA 4ZEKA 3KN7A 3OO9A 4QSDA 1DPPA 3B6TA 4ZEBA 3T96B 2HAUA 4R6KA 1DTZA 4NWDA 3UA8A 4IO6A 1URSA 1FQFA 1B7UA 3UGWA 4FEBA 2IA4A 3TMGA 1UIVA 2ZXTA 4F3GA 2DWIA 1LCTA 4OFJA 4H67A 4GQOA 2ZNSA 3B7DA 3PD8A 3WAEA 1FTLA 3UORA 4DLDA 4TLMB 3O2AA 5DEXA 4WKMA 2F7CA 1GR2A 1I6AA 4LONB 4OERA 4G4PA 3ECRA 5JK4A 5DTBA 1A40A 4ZS9A 1AOVA 2YLNA 3PUZE 2Z23A 3IK6B 3OOAA 4NEDA 4QF9A 5I59B 1O7TA 4I9DA 1MPCA 2X7QA 3RGYA 4OTEA 1B40A 3TDJA 2ZNTA 1RKMA 3O9PA 1B6HA 4N6PA 2DS9A 1LAHE 1FTOA 2IEEA 3KOSA 3T93B 3FJ7A 4HCWA 2F6GA 2Q2AA 2A5TB 4YB6A 3R7XA 3PPOA 3VXCA 4ELRA 4U1OA 5ITPA 4H0WA 1GTKA 4OMBA 3FXUA 3O29A 2RF1A 4NF6B 5K2XA 4ZE9A 3FVOA 3TKDA 3FVKA 1B3HA 3MP6A 5I2KB 4X1DA 4DIGA 2HEUA 1WVJA 2W7YA 4KR5A 2ZMBA 1Y9UA 5AA1A 2XXIA 4KPTA 2X7PA 3C31A 3OO7A 3RNNA 1DOTA 2DXYA 3IO6A 3H3GA 1QVSA 4N13A 3MP1A 4FORA 3Q25A 3LSXA 3TTRA 2O7IA 1PBPA 2WKYA 2Q88A 4IO7A 2QSXA 3H03A 3V83A 1ZBMA 3G3KA 4NE4A 3G3GA 3L6GA 1NNPA 2NOOA 1Y3PA 3H6VA 4MH5A 4FAJA 3MZ9A 4LVQA 3MPLA 3RT6B 1N3XA 1IIWA 4X48A 3CFZA 1OQHA 3B6WA 2DE2A 5H8HB 4KCCA 4C1TA 3QSLA 1PB7A 3PPQA 3FIRA 3TCFA 1A99A 1B3EA 3FXRA 3IX1A 4UACA 2OBGA 3K2DA 5I58B 2F97A 3MVWA 4OVJA 4R6HA 4H5GA 3ILUB 4BDLA 3T22A 3OMBA 3EPEA 4DCXA 4G68A 3PMXA 1MQJA 4JSDA 3FD3A 5HBCA 1BP5A 1S9TA 1TFDA 1UQWA 2PT2A 2OWTA 1IXIA 2E1SA 4U23A 5LOMA 2I3WA 4EUOA 3LBSA 4ELOA 5ELVA 4OWDA 3FV1A 3K00A 1AH5A 3SDFA 4LA9A 4RK9A 2I49A 4FECA 4YKIA 2F7BA 3C4MA 3U72A 2I0BA 4GLIA 3PGFA 3U93A 2VD3A 4XKQA 1QUJA 1P1UA 2ONRA 3DP6A 4GVOA 5DEXB 1OLAA 3EN3A 2AL5A 4EF2A 3K01A 2D5WA 3DLNA 1SW1A 2UVJA 4OEUA 2YJPA 3SERA 2ZYOA 3IB0A 1B5IA 3MZBA 2RCAA 3E9XA 2HQ0A 1WODA 2ANJA 1MXVA 4NF5A 3PUWE 4BDMA 1PB8A 1M5BA 4I8CA 3O97A 4YMAA 3MUQA 4IGRA 1VR5A 3TELA 4K3FA 4KI0E 3MZ1A 4EXLA 1B52A 3EQ1A 3LSLA 2GHBA 4HTGA 1H45A 3MBPA 3FUZA 2REJA 3JV9A 4R9GA 2Q8JA 1MQGA 3IJXB 1LB9A 1PC3A 3H6UA 2PVUA 1NH7A 1D9VA 1Y4TA 4R2FA 3SEVA 4AB6A 5J1DA 1B5HA 1EZPA 3EF7A 3TZAA 1FQBA 1LFHA 2B3FA 4JWXA 3MAMA 3MPKA 1SBPA 1ZKBA 4NF4A 5FHOA 2XX8A 3CIJA 3I6VA 1H3DA 3TTMA 1ZJLA 3S9EA 2RC8A 1VFEA 2CMOA 3QAXA 1MM7A 5K2YA 3OXNA 4ZEIA 1FQEA 3OENA 4F1YA 1O64A 4O3BA 1B3FA 3PV0E 4MLQA 4KYSA 2UYEA 4XIGQ 2R6GE 3K1MA 4OHNA 1UIUA 3H7MA 4R2BA 1OQGA 3FASA 5KDTA 4H6DA 1EH3A 1Q35A 4JWYA 1P1OA 1NH8A 1MH3A 2H9BA 5CMBA 4DXBA 4YU0A 3O66A 5I57A 4R74A 1QJMA 4ELPA 2GRVA 1MY2A 1DSNA 2UVIA 1S50A 3E4RA 4RA1A 5A5XB 4ZZAA 4P0IA 1MM6A 2QL3A 1B05A 4EDPA 1II5A 3MW0A 3ODBA 2P2AA 5JTYB 2UVGA 3PPNA 3LSWA 2G29A 2DE3A 4PFWA 2V93A 3HCQA 3FVNA 4BDQA 4G68B 3C34A 1Y3NA 3PUYE 3T66A 4XXUA 5I2NA 5FHNA 3U94A 3VXBA 1MS7A 4FEDA 1N76A 4BLAA 5ICQA 5DVIA 4IO3A 1KWHA 4IY5A 1LLSA 4NF8A 3TAJA 1B1XA 3M3LA 1B7ZA 2VP1A 3TTKA 1A8EA 4NMYA 1URDA 4R6YA 3QUFA 4IO4A 1OIBA 1MY0A 2OZZA 1H76A 1IZ1A 3M3FA 1SW2A 4LZ8A 4H5FA 4P0GA 3THIA 1RYXA 3T9UA 2RKMA 4GD5A 1ZTYA 3A09A 3MQ9A 3K02A 1P1NA 1BTJA 1SW5A 4OZ9A 2A5SA 2XHDA 3C33A 4OQOA 1MXYA 3GLBA 3IORA 3RY3A 3KBRA 3CG1A 4NF5B 1URGA 3A3CA 4IO5A 3LC8A 2X26A 1PB9A 3SEUA 1R9LA 3FATA 2CZLA 4EQ9A 3G3IA 1YCJA 5F7VA 3WAFA 4JWOA 4KFQA 1IQ7A 2H99A 3K6VA 4JB7A 1D9YA 1CB6A 2HAVA 1B51A 5AA3A 3KG2A 1DTGA 4BDRA 3VLVA 5HPQA 3VDFA 4KCDA 1MQDA 5I56B 1Z7NE 4NTLA 4LZ5A 1LSTA 3G7WA 4YKKA 1DPEA 2OK2A 1MXXA 1IXHA 1P1WA 4KYEA 4OXVA 3S9LC 5HM4B 2XXVA 1UTHA 4I62A 4JBZA 4ONYA 4DXUA 5EYFA 4NF4B 3U92A 3RTWB 2Y7WA 3ZSFA 3PUXE 3JZJA 3SETA 1US4A 1N3WA 1YTVA 3T9XB 3R26A 3D4GA 2RC9A 1XVXA 4AB5A 1FW0A 2H25A 5DVJA 3MVZA 3KOTA 4KD5A 1UTBA 3ZKLA 3A3UA 2Y7IA 2ZYKA 4EF1A 1FQAA 3GXAA 4POWA 5AA4B 2B3BA 1YPNA 1B0LA 5KDTB 4ZECA 4OESA 4U22A 1JEUA 5AA2B 4YKJA 4KHZE 4QFNA 1A55A 5H8QA 1IUDA 2DWAA 3FV2A 5I57B 4F29A 3PPPA 1B4ZA 2ESNA 3K0VA 1VFDA 2I6EA 4L17A 4Z0IA 3CSGA 2RINA 4MF3A 4F18A 3K6UA 3KGCA 1XHYA 4GL8A 2XXWA 2ZYMA 1B7HA 1LBBA 1R6ZA 1I6QA 1N0TA 4U4SA 3PUVE 1LAGE 3SEWA 4EQ7A 2NUVA 1A8FA 5H8FA 4DXCA 1AIVA 1LFIA 2QS2A 2XXTA 2REGA 1MG1A 2F8DA 3IOVA 3BKIB 2QJEA 5TPAA 4LUBA 4NF8B 3EHUA 4Q30B 1B58A 3SKPA 4JSOA 2O51A 1B0HA 4F2QA 3VFJA 4Z7EA 2RC7A 1B46A 2O1MA 3OSQA 2G93A 3S4UA 2XX9A 3MJNA 4OFLA 1LGBC 5I84A 5KCJA 2V25A 1OLCA 2V84A 2XXRA 3N6UA 1LAFE 3M3KA 1NNFA 5F1QA 1BIYA 3SESA 4RPOA 4G8HA 3LSFB 3DELB 2VHAA 1B3GA 3CRBA 1POY1 4QSCA 4O3CA 2Y84A 4U4XA 1USYH 4QSEA 5ISUA 1XVYA 1YAEA 2M8CA 2NVUB 3HO7A 3TTLA 1VE4A 2F34A 3MVYA 3RQTA 3Q28A 1M5EA 3V5AA 2RCBA 1R1NA 4GIZA 4IO2A 1TXFA 3K4UA 2XD2A 5I59A 3VVEA 2GH9A 3PPRA 3TODA 1TWYA 2QPQA 4OFOA 2V3QA 3N6TA 1IXGA 1B3LA 3E3KA 4ZEDA 1B32A 3RTFB 4YICA 3ONMA 3QUJA 4GWOA 1OMPA 3H4ZA 4G8MA 1P1QA 1UTHB 3PU5A 1NNTA 2GFEA 3CI8A 2DWJA 3USDA 2PBWA 3N5LA 2ONSA 1QUKA 5L9OA 4F2OA 1B4HA 2QMWA 3S2VA 3U8QA 3TFLA 1HSEA 3MWBA 4RK2A 4R72A 1XT8A 3K6WA 1PEBA 1QULA 4HW8A 4MBPA 1MXUA 2I0CA 1ZU0A 4RPNA 5KZTA 1Y1MA 1NL5A 1P99A 2OCUA 3DM0A 1SQYA 1D4NA 2O84X 5CM6A 3TCGA 1Y3QA 1Y4CA 4ECFA 5I2KA 3IB2A 4LATA 4U2RA 3Q29A 5H8QB 1QW0A 5B70A 3KSXA 3N94A 5TP9A 4Q8RA 1Q1KA 5EHMA 4TQUQ 1LAXA 1EZOA 4JDFA 4YAHX 2B65A 2QS4A 3HV1A 4OETA 4G77A 3UK4A 3TEPA 4DDDA 2ABHA 3KEIA 2XXUA 1TFAA 1SYIA 1I6BA 4BDOA 1LFGA 2DVCA 4WXJA 3KJTA 1O63A 4PFTA 4NWCA 4P11A 3H6WA 5AA2D 1PDAA 3OEKA 3OEMA 3I3VA 4UA8A 5H8FB 3G3HA 1SI1A 4YB5A 5TU0A 3OO6A 1XC1A 2Y7KA 2YPNA 4F1UA 4ND9A 3RT8A 2ALUA 5FHMA 5H8HA 3RPWA 1ZMGA 5TPAB 4LP2B 5IAIA 2DQVA 1D3KA 2H4IA 1JW4A 1N84A 2OJTA 4QRZA 5IKBA 2DYXA 4C1UA 1USYE 3QIMA 4GRKA 2UXAA 3IO4A 1F9BA 2PMSA 1BLFA 3O28A 4TOZA 3VVDA 4IGTA 4X9TA 2Q2CA 5DT6A 5CBSA 3K6XA 1MXZA 1WDNA 5B7DA 1MDP1 5FTHA 1JNFA 1MQIA 4DCYA 2UYFA 1GV8A 2QMXA 2NXOA 4XKPA 1GGGA 4PE5B 4IY6A 4FE8A 4QHQA 3QXMA 5H8SA 2VOZA 1JQFA 4QFLA 4E0XA 2PYYA 2THIA 5ITOA 3KFMA 4WEDA 4G2ZA 4QFKA 4HS7A 5DVFA 2Z8EA 1JW5A 4HCYA 3V8XB 2I4BA 5CC2A 2FYIA 3H6TA 3MP8A 1MPBA 2I3VA 3W15C 2DWHA 4M1VA 1AL3A 2F6PA 3V89B 2HCAA 3HHFA 2QS3A 1N7WA 4U1ZA 3TPAA 3ZS6A 4ZDMA 1A7LA 3CFLA 1N7XA 1J1NA 4X1BA 1XOCA 3RUMA 1NNKA 2F35A 3OD7A 2F78A 1MY3A 3IL1B 2AYSA 4F1VA 1N04A 4KYDA 2D21A 2XXHA 4RXLA 5L9MA 2P0SA 2F36A 3U1OA 3SEXA 1SW4A 1EZ9A 1L5TA 4EXKA 3CFXA 1SD3A 4R73A 1MY1A 3PD9A 1MDQA 3JYRA 2VGQA 2E0SA 4PQJA 4XKRA 5CMCA 3I5OA 2I58A 4THIA 1OVTA 4I1DA 5CRYA 1QUIA 5JEIA 4M4GA 4BDNA 4GFRA 3M8UA 3TQLA 3TTNA 2GHAA 3Q27A 5TP9B 4LZ7A 1JW1A 5ICTA 2I4CA 2O6AA 3OELA 3T9VA 2XXQA 4PFUA 1DMBA 2KLFA 1FTJA 3RN8A 4FIMA 3C36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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