2D3IA

Crystal structure of aluminum-bound ovotransferrin at 2.15 angstrom resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
682
structure length
670
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of aluminium-bound ovotransferrin at 2.15 Angstroms resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 222
structure length 670
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA03
3SERA 3B6WA 2PBWA 3DELB 4ZEIA 3RNNA 3KZGA 1MY2A 3VVFA 1Y3PA 2B65A 1DPEA 1D9VA 1URGA 1OIBA 3G3FA 1US5A 4GLIA 3G3KA 1SW2A 4HCWA 3TZAA 1YTVA 1DTGA 3S9NC 3OO7A 3OD7A 5DYHA 3PV0E 3O6HA 3MZ9A 4AB6A 4XKPA 2Y7WA 3KJ7A 3SEXA 4F3BA 1B3HA 2Q9TA 3UN6A 1QVSA 3KEIA 1FTLA 3TQLA 3KN3A 4DCXA 3SESA 2Z8FA 5CMBA 4LZ5A 4NWCA 4GRKA 3IB1A 4GIZA 4KPTA 4E0WA 3EHUA 4BDQA 1I6AA 4I62A 3TCFA 5AE4A 1DSNA 5BUUA 3K6XA 4F39A 5ISUA 3KG2A 3RN8A 4MF3A 3ILTB 2XXYA 3C32A 1M5FA 1KWHA 3UA8A 2OCUA 1B5HA 3C33A 3S9MC 4DE8A 1S7YA 3MQ9A 2QPQA 3PPQA 3OELA 4Q0CA 1B7HA 4EDPA 2PT2A 2R71A 2RC8A 3MW0A 3LR1A 3HO7A 1O7TA 1OQHA 4JDFA 4ZEBA 4NWDA 4OWDA 3RT8A 3MWBA 1PC3A 2PYYA 4BDMA 2VOZA 4FORA 1JEUA 5HPQA 3K6WA 3TELA 1OVTA 5AA2D 1O63A 1B46A 5CMCA 2ZYNA 1PEBA 2F78A 3IAZA 3S2VA 4U2RA 3VV5A 1B4HA 3FUZA 5FHMA 1I6BA 2P2AA 3IOWA 4H5GA 4YKJA 1Y20A 4DXUA 1RYOA 4PP0A 3IOUA 3R7XA 1B6HA 5H8QA 4F1UA 3CG3A 3E9XA 1B3LA 1LFGA 2PMSA 3OO9A 3DP4A 5IKBA 2F6PA 4KYDA 1LGBC 4NF8A 5IAIA 2IEEA 3QK6A 3E13X 2UVIA 5FHOA 1VFEA 3Q29A 3TTNA 4F19A 4ELRA 5HBCA 2RCAA 1EZOA 4O3BA 2F97A 3C35A 4UACA 2I6EA 2DWAA 4LONB 3EN3A 3KSJA 5TP9A 1SQYA 2H9BA 4DXCA 4RK9A 5I59A 1B05A 1P1OA 1QUJA 2B3BA 2F35A 5H8HB 4KR5A 1EZ9A 5CRYA 5DVIA 2HCAA 4GF8A 5A5XB 1P1QA 2F7BA 4I1DA 4I9DA 3TQWA 1WVJA 3PMVA 2GRVA 1LB9A 3L6GA 3I5OA 4NF6B 1LCTA 2AIXA 2O1MA 3H6WA 3ZKLA 5I2NA 4XKRA 4RA1A 1LFIA 3VE1B 2AYSA 3T9VA 1B3EA 1AL3A 3Q25A 4GXAA 5EHMA 4FECA 1I69A 1Z7ME 4KD5A 1EZPA 2ALUA 2ONSA 1MXVA 2QS2A 2F7CA 1USYH 4JWXA 1A8FA 1Y1ZA 3IB2A 5ELVA 4KI0E 3LSXA 3P7IA 3O29A 3VLWA 4AQ4A 2FNCA 1P99A 3H6TA 1H45A 4I8CA 1Y4TA 4F2QA 1UTHB 5I84A 4FJPA 4XTCQ 1MXYA 4R6KA 1QW0A 1ELJA 3H06B 5I2KA 2ONRA 1XVYA 4ND9A 1HSJA 1IUDA 1XC1A 1MY0A 1XVXA 1N0TA 2GH9A 3ONMA 3KFMA 1UQWA 3PPNA 4EUOA 3TTKA 1NNTA 5CMMA 1UTBA 3MZ1A 3TODA 1B3GA 5JK4A 3ZS6A 2DXYA 4TOZA 2O1LA 2UYFA 1ZKBA 1DMBA 4PFTA 3B6TA 1MQJA 5J1DA 3T9HB 4ZEDA 4XKNA 2XXWA 4YICA 5TPAA 3BFTA 3HN0A 5CM6A 1MXUA 3FV2A 5L9MA 1US4A 1GTKA 2I0BA 2H4IA 3MJNA 4ESWA 3SEWA 3QIMA 2UVJA 1GGGA 1IITA 3MBPA 3RLFE 4QF9A 1MQDA 3CG1A 3TTLA 4IO7A 2FYIA 2DYXA 1NKXA 5ITPA 4FEBA 3W9VA 2R6GE 1A40A 4BLAA 3LSFB 3OOAA 3T66A 3G3JA 5JTYA 2RC9A 4OTEA 2Q8JA 4GL8A 4G2ZA 1XT8A 1L5TA 2OZZA 2V93A 4IO6A 2PVUA 1DTZA 2NOOA 4OMBA 4QFPA 3ODBA 5I58B 3MPKA 2OJTA 5H8QB 1NH7A 2DE4A 3H03A 1B0HA 4OZ9A 3F11A 1P1NA 3FXRA 1QKBA 3K01A 1GV8A 1LSTA 3EF7A 4LP2B 4IY5A 3VLUA 3HPIA 1D9YA 1LCFA 1HSLA 2RCBA 1B0LA 1M5DA 1MS7A 2OLBA 3QSLA 5H8HA 3ECRA 1ZU0A 2I3WA 1FQFA 4G8NA 4QSDA 5TP9B 4KYSA 3SDFA 5I57B 3O9PA 1O64A 4G68C 3RQTA 2O7IA 3RPWA 4TQUQ 4TLMB 4IB2A 2VP1A 4P0GA 3OEKA 1N3WA 3FVNA 3EPEA 4OVJA 2D21A 1MY3A 2G93A 2XXUA 4OQOA 3T9UA 3K1NA 4G8MA 2DWJA 1A55A 1YCJA 1M5BA 4C0RA 3ZSFA 4Q30B 1II5A 1R9QA 3H6VA 2BJJX 5DEXB 1GR2A 3L6HA 1B9JA 2DP8A 2NVUB 4IO4A 4GQOA 3T22A 4KHZE 2XD2A 1B7UA 1TFDA 1RYXA 4R72A 4IO5A 4RK2A 3FXUA 1UTHA 1LAHE 3SEYA 2AL5A 2H98A 1FW0A 4YKKA 1POY1 4O3CA 3M8UA 5TU0A 3CFZA 4U23A 3R6UA 4U4SA 1SBPA 2GFEA 3BFUA 2O7UA 3G3HA 2ZNTA 4GL0A 2I3VA 3B7DA 3G3GA 3IX1A 4OEUA 2ZXTA 3M3LA 3VXBA 5I2KB 2X26A 4WKMA 1IIWA 4U1ZA 5K2YA 3S9EA 3O66A 1Q35A 4RJZA 5AA1A 3H4ZA 4MBPA 3RGYA 2O68A 3Q26A 4LATA 1UTBB 4NF5B 2Z22A 3OO6A 5H8FA 2XX9A 2XD3A 4IGTA 1NNKA 3QXMA 4M1VA 1ZLQA 3VVDA 2KLFA 1DOTA 2M8CA 5TPAB 2E1SA 1R6ZA 1XHYA 5ITOA 1ZJLA 2V3UA 5CBRA 1ATGA 3U92A 1JETA 3K2DA 2YLNA 1MPDA 2CMOA 2O6AA 3KJTA 4MLVA 5EYFA 1PDAA 2Y7RA 2XXQA 1A54A 4LQ5A 1JW5A 1ZTYA 3PPPA 3U93A 1AOVA 2I4CA 1B51A 1OMPA 2QS4A 1H44A 1LBBA 1B5IA 3IO6A 4PE5B 5I58A 1XOCA 3VXCA 4OFOA 1ANFA 1M5CA 4THIA 5JTYB 4R6HA 3FASA 3IR1A 4MH5A 1MY1A 4EF2A 2P1SA 4ESXA 3TUSA 4NE4A 3RT6B 2OWTA 1IZ1A 3C31A 2ONKE 2UVGA 2I58A 4EQ9A 1LLSA 3CSBA 3HHGA 2Y7KA 3RTWB 1MG1A 3OO8A 3A3CA 3MPLA 3TCGA 4LZ7A 1MH3A 3IORA 5I57A 2X7QA 3K6VA 4ECFA 4F1VA 1FQDA 1H43A 4AB5A 1B1XA 1EU8A 2PX1A 4G4PA 4POWA 3FXQA 3Q27A 1JW1A 3KGCA 3OENA 3C36A 4H65A 2RINA 3MUQA 3RTFB 4POXA 1LAFE 3MP6A 3THIA 3G7WA 4G77A 4K3FA 1FQCA 4OHNA 2XHDA 1TT1A 3DP6A 5L9OA 2HXWA 4E0XA 4MFIA 3A3UA 2QMWA 3VVEA 1AH5A 3UK4A 4QFOA 4ELQA 1AIVA 5DEXA 2P0SA 5CC2A 4FE8A 3H7MA 1BTJA 4IGRA 3D4GA 3TPAA 1URDA 1QUKA 2ABHA 4C1UA 3FJGA 4P11A 2NUVA 1LBCA 4U4XA 4RPOA 2OK2A 5AA2B 3T93B 3FGSA 2F6GA 1NH8A 3TFLA 3GBBA 4OERA 1B40A 1P1WA 3W9WA 2RC7A 1VSOA 3W15C 2VGQA 5JEIA 1A8EA 3PUYE 4F31B 2GHAA 3OSRA 1XS5A 4RY1A 2AL4A 2DVCA 4R2BA 3K1PA 1VE4A 2DS9A 2YJPA 1B3FA 3FD3A 1PB9A 4NF5A 2DQVA 3V5AA 4F29A 1PB7A 2HAUA 1MQGA 1MY4A 2I49A 3TAJA 1OLAA 3KSXA 2RF1A 1DPPA 2XXXA 3U8QA 4FEDA 3I6VA 1N7WA 3PU5A 3TDJA 2LAOA 4KCCA 1VFDA 4YMBA 4X1DA 5H8FB 2DOJA 3FATA 1Y1MA 2V3TA 2DE2A 2ZNSA 4YKPA 4YB7A 4QFLA 1WODA 2V84A 3DP8A 2Z8DA 5AA4B 3PD8A 1JEVA 4YAHX 4DZ1A 3G3IA 3C34A 5H8NA 1D3KA 1R9LA 2RKMA 1IXHA 4QRZA 3A09A 3PUWE 2DWIA 1QULA 2Q2AA 3K0VA 1A7LA 2R9JA 1MXZA 2G29A 3N6TA 3IB0A 4H8JA 5CI5A 5M2VA 3QAXA 2Y7PA 4NMYA 1JW4A 5I56B 4RPNA 2DSFA 2V3QA 5HM4B 4DLDA 1FQEA 4EF1A 2OBGA 3FZVA 4PFWA 5FTIA 3K4UA 1VR5A 3U94A 4JSOA 3UGWA 1B5JA 5B7DA 1YPNA 1B52A 4G68A 1NFTA 4F3PA 3MP1A 1SD3A 1T0KA 5ICTA 3PUVE 1UIVA 3M3KA 2ANJA 3I3VA 4F2OA 4F3SA 1R1NA 3V89B 5BWJA 2Q2CA 2VHAA 4ELOA 4H5FA 2I4BA 4X1BA 4LVQA 3CFXA 2OWSA 3OXNA 2O69A 1QUIA 3HHFA 1ZBMA 2F8DA 1MDP1 4F22A 3HV1A 1BIYA 2Q89A 3IL1B 3TEPA 1MQHA 4DXBA 3TTRA 1OLCA 1Y9UA 4RNSA 2A5SA 3CRBA 2W7YA 3GZGA 4OYVA 3VFJA 4Z0IA 2CZLA 1LB8A 3WAFA 1SDXA 1FCKA 3LSWA 3B6QA 1H76A 3GLBA 2F5XA 2REJA 1D4NA 3LSLA 1IXGA 3IOTA 2O84X 3E4RA 4UA8A 2HFBA 4YU0A 1SW5A 3LBSA 4WEPA 5AA2A 2XX8A 3TCHA 1MRPA 2XXIA 1FTKA 3C4MA 4R2FA 3K00A 5LOMA 4O3AA 3IJOB 4EQBA 2YPNA 4LA9A 4R6YA 2UYEA 1ZMGA 4C1TA 4U22A 1PBPA 2XX7A 1H3DA 3SEUA 3PGFA 4YMAA 4QSCA 4QFNA 1MH4A 3N26A 1BP5A 4YZZA 1N04A 1I6QA 3HSTA 1BKAA 2QS1A 2VD3A 3KOSA 4PFUA 4PETA 1AMFA 2HZKA 1ZIUA 1OQGA 3CIJA 1IEJA 1SVXB 2DXRA 3WAEA 1Q1KA 4Z7EA 4GXSB 3VDFA 1FTJA 3S4UA 2THIA 3UP9A 4IY6A 1B4ZA 1JNFA 1LFHA 1FTMA 1SI0A 4HCYA 4JB7A 4YB5A 3PPOA 1QJMA 1TXFA 2F36A 4YB6A 3O6GA 3TTMA 4FIMA 3U1OA 1Y3NA 1URSA 1OVBA 3OSQA 4ZDMA 5AA4A 4KYEA 4R75A 2XXVA 1FQAA 4FATA 3H6UA 1NMUA 3O6IA 4XXUA 1N7XA 3MP8A 3MVZA 4ZE8A 2F7AA 5FHNA 3FJMA 5H8NB 3N6UA 2X7PA 4ZZEA 1FQBA 3S9LC 1A99A 3FVKA 5I56A 2ZYKA 3UIFA 2ZNUA 3CR9A 4BDRA 3SKPA 4NEDA 1F9BA 4OFLA 1BLFA 1PB8A 4QHQA 3FJ7A 4JBZA 3PD9A 3QUFA 3USDA 4ZZAA 3OEMA 2HEUA 5KDTB 5F7VA 4R73A 4H1XA 3V8XB 1J1NA 1B2HA 5H8SA 4X9TA 4F1YA 3C9HA 3IOVA 1CE2A 4KQPA 3FIRA 3MVWA 3M3FA 4M4GA 4JWOA 1HSEA 3FV1A 3TMGA 4WEDA 3N5LA 4ELPA 4GWOA 4OEVA 4LUBA 4G68B 4H6DA 4ZS9A 2QMXA 1SW1A 4PQJA 1YAEA 2XXTA 4NTLA 2H5YA 3O2AA 4ISUA 4HS7A 3QYTA 2WKYA 4RYAA 5L9SA 1MXXA 3JZJA 4LQ2A 2Z23A 1EH3A 5ICQA 2F34A 1JVXA 1UIUA 4XIGQ 3IO4A 2GHBA 4OENA 2O51A 1MDQA 4Q5TA 4BDLA 5KZTA 2HAVA 3FVGA 4NF4A 5EHSA 3MZBA 4F3GA 4GVOA 2QS3A 3K02A 3FVOA 3DLNA 1CB6A 2Y7IA 4TLLB 2Q88A 1MM6A 2Z8EA 4BDOA 3K1MA 2A5TA 3T9XB 5KCJA 5AA3A 1PBQA 1TWYA 3MVYA 4QFKA 2I0CA 1IQ7A 4HTGA 3O28A 3CSGA 3KBRA 4YKIA 4F18A 4IO3A 1B32A 2QSXA 2ZMBA 4GD5A 4U21A 1B1HA 4OETA 1IXCA 1B7ZA 3KOTA 1SW4A 3BBRA 2DWHA 1SYIA 2REGA 4N13A 3CFLA 3JV9A 4ZEKA 1POTA 5DVJA 1JQFA 1FTOA 1WDNA 3RY3A 3ILUB 3KN7A 2ESNA 1N76A 4N07A 3K6UA 4H8IA 1NNFA 2UVHA 3VLVA 4MLQA 1MM7A 4P0IA 4RXLA 2DE3A 2FA7A 2HZLA 3U72A 4EXLA 4JSDA 2XXHA 4GFRA 2H99A 3SETA 3RUMA 4OESA 4H0WA 3O97A 4QSEA 2XXPA 1S50A 2V25A 4KFQA 3SEVA 3LUYA 2XXRA 4PFYA 1N3XA 3IJXB 4JWYA 2NXOA 4ONYA 1S9TA 3ZKKA 4JXIA 4ZEFA 4GOTA 1LAGE 1Y4CA 3PPRA 2QJEA 4G8HA 4N6PA 5CBSA 3EQ1A 3PUXE 5DVFA 3LC8A 3PMWA 2E0SA 2Y84A 2VD2A 1JVYA 1MQIA 1TFAA 4EQ7A 5F1QA 3EHSA 3QUJA 3UORA 1RKMA 1P1UA 1Z7NE 1MPBA 3HCQA 4DDDA 1MXWA 2DVZA 2NWJA 1SI1A 4Q8RA 5KDTA 3CVGA 4BDNA 1QKAA 2D3IA 1NL5A 2B3FA 1N84A 4OXVA 5FTHA 3Q28A 4EXKA 2HQ0A 2QRYA 3TKDA 3KN8A 4DCYA 1MPCA 4LZ8A 2IA4A 4XKQA 3AXFA 1M5EA 2ZYMA 4NF8B 1Y3QA 3N94A 4R9GA 3E3KA 2I48A 1IXIA 3CI8A 4R9FA 3GBAA 1LAXA 5CMKA 3EHTA 3GXAA 3D4CA 3R26A 4OFJA 5L8DA 5A5XA 2ZYOA 4FAJA 4ZE9A 3MVXA 4L17A 3BKIB 4R74A 3TYHA 3MC2A 3JYRA 4WXJA 5I59B 4HW8A 5K2XA 4NF6A 4X48A 3PUZE 2H25A 3IK6B 4IO2A 5B70A 2UXAA 3T96B 3PMXA 5DT6A 4NF4B 1GVCA 1NNPA 1SYHA 2D5WA 4U1OA 4DIGA 3H3GA 3MAMA 5I2NB 4KCDA 4ZECA 2A5TB 1B58A 3OMBA 1USYE 2PT1A 5KCJB 2QL3A 3DM0A 4H67A 3V83A 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBZA 3SERA 3B6WA 2PBWA 4H45A 3DELB 4ZEIA 3RNNA 3KZGA 1MY2A 3VVFA 1Y3PA 2B65A 4GX4A 2OX3A 1DPEA 1D9VA 5ET8A 1URGA 1OIBA 3G3FA 1US5A 5I3SA 4GLIA 3G3KA 1SW2A 2WEFA 4HCWA 3TZAA 1YTVA 1DTGA 3S9NC 3OO7A 3OD7A 5DYHA 3PV0E 3O6HA 3MZ9A 3T1BA 4AB6A 4XKPA 2Y7WA 3KJ7A 4PC9A 3SEXA 4F3BA 1B3HA 2Q9TA 3UN6A 1QVSA 3KEIA 1FTLA 3TQLA 3KN3A 4DCXA 3SESA 2Z8FA 5CMBA 4PAIA 5J16A 4LZ5A 4NWCA 4GRKA 1FPLA 3IB1A 4GIZA 4KPTA 4E0WA 3EHUA 4BDQA 1I6AA 4I62A 3TCFA 5AE4A 1DSNA 5BUUA 3K6XA 4F39A 5ISUA 3KG2A 3RN8A 4MF3A 4PFBA 3ILTB 2XXYA 3C32A 1M5FA 4P8BA 1KWHA 3UA8A 2OCUA 1B5HA 3C33A 3S9MC 4DE8A 1S7YA 3MQ9A 2QPQA 3PPQA 2VT5A 3LUZA 3OELA 4Q0CA 1B7HA 4EDPA 2PT2A 2R71A 2RC8A 3MW0A 3LR1A 3HO7A 1O7TA 1OQHA 4JDFA 4ZEBA 4NWDA 4OWDA 3RT8A 3MWBA 1PC3A 2PYYA 4GWSA 4BDMA 2VOZA 4FORA 1JEUA 2F3BA 5HPQA 1NUZA 3K6WA 3TELA 1OVTA 5AA2D 1FPGA 1O63A 1B46A 5CMCA 2ZYNA 1PEBA 2F78A 3IAZA 3S2VA 4U2RA 3VV5A 2B4LA 5EQ7A 1B4HA 3FUZA 1NUYA 1I6BA 5FHMA 2P2AA 3IOWA 4H5GA 4YKJA 1Y20A 4DXUA 1RYOA 4O8MA 2FVZA 4PP0A 3IOUA 4OA4A 3R7XA 1B6HA 5H8QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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