2D3IA

Crystal structure of aluminum-bound ovotransferrin at 2.15 angstrom resolution
Total Genus 222

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
682
structure length
670
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
100200300400500600600500400300200100
050100150200Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
publication title Structure of aluminium-bound ovotransferrin at 2.15 Angstroms resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
total genus 222
structure length 670
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA03
4F19A 1PB9A 4GXSB 3TCHA 3Q29A 3H6VA 1I69A 3UIFA 3S9EA 4RNSA 2UVGA 1VSOA 1B7HA 5CBRA 2V3TA 4NF6B 3RLFE 5K2YA 4GL0A 1PB8A 4OENA 3DM0A 3VFJA 3KEIA 2D21A 2Q89A 4IB2A 4KFQA 2ZMBA 1IITA 1TT1A 1JEUA 1H76A 4LZ7A 1II5A 3T9XB 3FJGA 4NTLA 4OFOA 3CRBA 1USYH 2XXRA 3MP1A 3CG3A 5CRYA 1IIWA 4YKJA 2LAOA 1DTGA 1MXYA 1FQBA 2QS1A 3VVDA 1N76A 4MH5A 3TTRA 3LBSA 1TFDA 2ANJA 3PV0E 1JW5A 1B9JA 3K0VA 3TCFA 2H9BA 4FEDA 4R2FA 1AL3A 4Q8RA 5B70A 2ONRA 1B46A 4XKNA 1Z7NE 4E0XA 4ELPA 5KZTA 5I59A 4TQUQ 4GD5A 5KDTA 1PDAA 3D4CA 2XX9A 3UORA 3Q25A 4XTCQ 4FATA 1PC3A 1Z7ME 2F7AA 2Z8EA 5HPQA 4X1BA 2I6EA 5L9OA 3OSRA 4QFKA 2F34A 3H6TA 3QAXA 4YB6A 5H8FA 2X7PA 1FTJA 3V89B 4R9GA 2F8DA 1NNKA 5I2NA 3K6UA 2DE2A 1IQ7A 1IUDA 4YMAA 4ZEDA 4F39A 1A40A 1YCJA 3FVGA 2Q9TA 1D3KA 1R9QA 4C1TA 3QYTA 1NH7A 2GRVA 1P1UA 3RPWA 2QMWA 1P1WA 1SVXB 1A8FA 1BP5A 3K00A 4G8NA 4ZE9A 3RUMA 5I2KB 2V3UA 4PQJA 3O9PA 1B3EA 5I57A 4YICA 3FIRA 3M8UA 5FTIA 4U4XA 5I56A 2UYFA 1MM6A 1TXFA 3HHFA 4OFLA 1PBQA 2NVUB 4C1UA 2WKYA 1AIVA 4YMBA 3T22A 3CFLA 1N3XA 3T93B 1N04A 4YKPA 3OSQA 1OVBA 1JETA 5H8QA 1LSTA 3HHGA 5DVJA 4HCYA 4BDNA 3FASA 1R1NA 2XXQA 2XX7A 5A5XB 1GVCA 3FVKA 1OLCA 1UTHB 1NFTA 3LUYA 4G68A 1WDNA 2ZYNA 2AIXA 2O1LA 2ESNA 3TKDA 3JYRA 1SW1A 1UTBB 1R6ZA 2XXXA 2Y7RA 2A5TA 4X48A 3K1MA 3TELA 4LZ5A 3SKPA 1O64A 1KWHA 3K6XA 3PUZE 3TFLA 3KOSA 2O7UA 3CI8A 3IB2A 4QSDA 4N13A 4ZEIA 3CG1A 2DVCA 3TDJA 1S7YA 5H8SA 1NMUA 3OO8A 1B3GA 3O6GA 4I1DA 3IX1A 3FUZA 1O7TA 2X26A 1DSNA 1ZJLA 3FVNA 1BIYA 3MP8A 2O51A 2H99A 4POWA 4U21A 3MVZA 5TP9A 1YTVA 4OERA 3OENA 1US4A 3T9HB 5CM6A 3D4GA 4AB5A 1LAXA 3KN8A 3FJMA 3B6QA 4ND9A 1I6QA 1MY4A 3C31A 2F36A 2NUVA 3HO7A 2Y7KA 2QRYA 3S9MC 1IXCA 2R9JA 2DSFA 3KJ7A 4JSOA 2F6PA 1LLSA 4Q0CA 4LZ8A 3RN8A 4OZ9A 4F22A 4ELRA 4OEUA 3T9VA 3PPQA 4I8CA 2PX1A 3QUFA 4OYVA 1LAFE 2R71A 2OWSA 3VLVA 3S2VA 3KFMA 4KCDA 2DE4A 4OVJA 4IGRA 3TZAA 5CI5A 2DVZA 4XXUA 1N84A 4ZDMA 4LVQA 1QW0A 2CZLA 3W9VA 2O84X 4OFJA 1OLAA 4R9FA 5I59B 2RCBA 3KSXA 4AQ4A 3RT8A 3MUQA 2Q2AA 3C35A 3FXRA 5KDTB 4JWOA 1PB7A 2I0BA 4R6HA 4EF1A 3RTWB 3VXBA 4X1DA 4QHQA 2YJPA 1RYOA 4ZZEA 4PFUA 3K01A 1XVYA 2RKMA 1A7LA 5H8FB 4OESA 5TPAA 3O28A 1LCFA 2DWAA 2UYEA 1HSLA 1I6AA 5I2NB 3A09A 3RGYA 5CC2A 2XXYA 1SW5A 5FHMA 2Y7PA 2H4IA 2D5WA 4H8JA 2VGQA 3H06B 4OTEA 3G3GA 5DTBA 2UXAA 4LA9A 1OQGA 5DEXA 1ANFA 2AL5A 4ISUA 4P0GA 4RPOA 4XIGQ 2ZXTA 2DXYA 1YAEA 3IOTA 1SQYA 1MY3A 1F9BA 1B58A 2ZNTA 1Y3PA 4DE8A 3C36A 1BKAA 5I57B 4KYDA 1MY0A 4EF2A 3TTKA 5CBSA 2PYYA 1M5DA 5I56B 4GFRA 3FV1A 4XKRA 2REJA 2F7BA 3PPRA 2NWJA 1MY1A 2VHAA 1MY2A 1NH8A 4YKKA 1BTJA 1B1HA 3TTMA 1FQEA 4OMBA 2H98A 4G2ZA 1Y3QA 2XXTA 2QJEA 1URGA 4NWDA 1L5TA 1N3WA 3IO6A 4GLIA 5TU0A 4NWCA 5L8DA 1B0LA 3EF7A 3E13X 4MLVA 4TOZA 3HSTA 5K2XA 1CE2A 4G68B 3OD7A 4JSDA 1ZBMA 4H65A 3CFZA 2ONSA 2O69A 2Q88A 2VD2A 3MC2A 1HSEA 3WAEA 5L9MA 3V8XB 2PT2A 2PBWA 4KPTA 4EQ7A 4G8MA 1DOTA 4DIGA 4R2BA 3PUYE 4OQOA 4XKQA 3TQWA 3SEYA 1A54A 2Y7IA 4YB5A 1POTA 2O68A 2VP1A 3BFTA 5BUUA 1LFIA 3FV2A 2XXPA 5TP9B 1PEBA 1VE4A 2I58A 3H4ZA 3U1OA 2OJTA 3GZGA 4H0WA 3PMXA 3E9XA 4NF8B 3MVXA 4R6KA 3FXUA 2DOJA 5F7VA 1FQFA 3VVFA 1GGGA 4ZEBA 1B5HA 2QL3A 1ATGA 3PU5A 4DDDA 2XXIA 1LB9A 4JBZA 4H67A 3GBAA 3CR9A 1MDQA 4F3PA 3IR1A 3KN3A 3OO6A 2GHBA 4BDOA 2OWTA 3KGCA 2B3FA 3PPPA 2FNCA 3U72A 4QFPA 1LBCA 4OEVA 1IZ1A 2QMXA 3UGWA 5FTHA 2HQ0A 5CMKA 4MFIA 3IJXB 4NF4A 3VE1B 2I3WA 4QF9A 3MP6A 4PFWA 1AMFA 2IEEA 3M3KA 3L6GA 3FGSA 3OMBA 1B3FA 3SEXA 3I6VA 1UIUA 2G93A 4BLAA 4F18A 3SEWA 1SDXA 1J1NA 3LSWA 4RXLA 3ONMA 1N7XA 5JK4A 4P11A 3VLWA 3S4UA 5TPAB 3BFUA 3Q27A 3C32A 3MQ9A 3LSLA 1D9YA 4BDQA 3FD3A 4F1UA 3P7IA 4OXVA 4Z7EA 5HBCA 4DCXA 1MM7A 1MQDA 4KR5A 4F3GA 1A8EA 3G3KA 2RC7A 4FIMA 1XHYA 4HTGA 4IO3A 3PPOA 4EDPA 2IA4A 1P99A 3JV9A 2ALUA 4GQOA 1MPBA 5DEXB 4TLMB 5CMBA 4YZZA 1AOVA 3MZBA 4JWXA 4O3AA 1B32A 3R6UA 3EHSA 1P1QA 2Y7WA 3OEMA 4YU0A 3KSJA 4ZEFA 2GFEA 4QFOA 2NXOA 3IOVA 3I3VA 3SERA 4HS7A 3DP8A 1POY1 4MBPA 2E1SA 1XOCA 4N6PA 1NKXA 1B52A 4KD5A 3RT6B 1MG1A 2F78A 3GLBA 2XXUA 1NL5A 2F97A 3KZGA 4ESXA 4RY1A 2I0CA 3I5OA 2DWJA 4E0WA 2OK2A 5AA2B 1S50A 1QJMA 3HPIA 1O63A 1MPCA 2I49A 1FQAA 1ELJA 3KBRA 1RYXA 3G3FA 2FYIA 2HAVA 1VFDA 5BWJA 1MQJA 3B6TA 2I3VA 4GOTA 2RC9A 3K2DA 1OMPA 4IO5A 3A3CA 4NF8A 1M5FA 4ONYA 4GVOA 3CVGA 3VV5A 2UVJA 4LATA 5J1DA 1XC1A 2RCAA 3JZJA 1OQHA 4THIA 4U4SA 2QS2A 4EXKA 2DS9A 3O2AA 4ZEKA 3QSLA 3GBBA 3PMWA 2QS3A 1H3DA 3SDFA 3MZ9A 1Y3NA 3DELB 4I62A 1A55A 1URDA 2KLFA 3KOTA 1SYHA 4GXAA 4YKIA 2RINA 4PETA 3PD9A 3AXFA 4LONB 4FEBA 4HW8A 4WEDA 2XHDA 2E0SA 3FJ7A 4BDLA 2P1SA 1Y4CA 3G3IA 2ONKE 5CMMA 4F31B 1MQGA 1MXVA 3IOUA 1Q1KA 4ECFA 2HXWA 1H44A 3N5LA 2Y84A 2H25A 2Z23A 1JEVA 1MS7A 5IAIA 2ABHA 2OZZA 4NE4A 1LFGA 4F3SA 5ICTA 3GXAA 3MPLA 3MJNA 5AA4A 4U1ZA 4ZECA 1NNTA 3SETA 3TYHA 4LUBA 4F2OA 1LFHA 1Y1ZA 1XVXA 1MXXA 2F7CA 4G77A 5FHOA 3THIA 2V84A 3PPNA 1LCTA 4GF8A 4R72A 2HCAA 3SEVA 1B7ZA 1IEJA 4NF4B 2G29A 1WODA 2DWIA 3Q26A 3LR1A 3OELA 3TQLA 2I48A 4WXJA 3PMVA 3KN7A 3C9HA 3K6WA 4RK9A 4QFLA 4G68C 4NMYA 4F1VA 1M5EA 5KCJB 4POXA 3IK6B 3OOAA 4FE8A 3E4RA 1D9VA 4JXIA 1JNFA 2ZYKA 1EZOA 1LGBC 5B7DA 2QPQA 1H45A 4ZS9A 3ODBA 2DYXA 3MZ1A 1Y20A 3G7WA 4R74A 3MW0A 3N6TA 4DXBA 3IL1B 3USDA 3EN3A 3N26A 2F35A 2OLBA 3U94A 1QVSA 1I6BA 1QKAA 4P0IA 1B5IA 4WKMA 3QXMA 3S9LC 2YPNA 4PFYA 1JW4A 3V83A 3KG2A 4U23A 1WVJA 3G3JA 4DXCA 4NF5A 4QSEA 5JTYB 4ELQA 4Q5TA 5FHNA 1ZIUA 5ITOA 5AA2A 2XXHA 1SD3A 1FTLA 4Z0IA 4PE5B 1MH3A 3W9WA 2H5YA 1FTOA 1T0KA 1QUKA 3LC8A 3HV1A 1B40A 1Y1MA 2R6GE 2W7YA 5H8HA 4G8HA 3OO7A 2VOZA 4MLQA 3IO4A 4QRZA 3WAFA 3HCQA 2V25A 4OWDA 3TEPA 3G3HA 3MWBA 2B65A 2RF1A 1NNFA 2QS4A 4KHZE 1MXUA 2AYSA 1B0HA 4JB7A 1DMBA 2D3IA 3RQTA 1LAHE 5DT6A 3H7MA 4ZE8A 4FAJA 4X9TA 2Q8JA 3T66A 4AB6A 3PGFA 1TFAA 1A99A 1S9TA 1B1XA 4C0RA 1QULA 2DP8A 2Z8FA 4R73A 3ZKLA 5ICQA 1PBPA 3F11A 2QSXA 1N0TA 1LB8A 4IY6A 1FCKA 1JVXA 4M1VA 4EUOA 1B3LA 4H5GA 4BDMA 3M3FA 4RPNA 4IO7A 4FORA 1P1NA 3B7DA 3Q28A 4GRKA 3EQ1A 1US5A 3RNNA 3TODA 1UIVA 4O3CA 3ILUB 4ELOA 3TCGA 1RKMA 3DLNA 4H1XA 4U22A 4I9DA 4TLLB 5AA4B 3CSBA 1VFEA 1JVYA 1QKBA 4KYEA 4RYAA 3T9UA 1SYIA 3IJOB 3SESA 3ZKKA 1FQCA 4IO4A 3L6HA 4ESWA 2XX8A 5KCJA 1ZTYA 3O66A 2O1MA 5ISUA 1H43A 2X7QA 2CMOA 3H3GA 4Q30B 1SBPA 1SW4A 1XT8A 2V3QA 2OBGA 4JWYA 3C4MA 3DP6A 4RJZA 4UACA 3PD8A 4R6YA 3IORA 4XKPA 5H8NA 3H6WA 2I4CA 4HCWA 2DXRA 3OXNA 2O6AA 3U92A 5I58B 1B6HA 4EQBA 1FTMA 1DTZA 2OCUA 4M4GA 3S9NC 4FECA 1Q35A 5JTYA 1EH3A 3VDFA 5LOMA 3H03A 4U1OA 1YPNA 4RK2A 3TTLA 4ZZAA 2BJJX 4DXUA 1SI0A 3C34A 1MXWA 1BLFA 3MVWA 2ZYOA 2XD2A 4KQPA 3K4UA 1B05A 2FA7A 5IKBA 5F1QA 1QUJA 4QSCA 3VLUA 2Q2CA 5DVFA 1B3HA 5I84A 1VR5A 3ZS6A 4NF5B 1QUIA 4OHNA 2PMSA 4G4PA 3A3UA 3UK4A 3RY3A 1EZ9A 1Y4TA 3TUSA 1GTKA 4FJPA 1DPEA 4NF6A 3PUXE 3DP4A 5AA3A 4UA8A 3OEKA 4LQ2A 4K3FA 3H6UA 3MBPA 4LQ5A 5HM4B 3U93A 3FXQA 2B3BA 1FQDA 4IO2A 3ZSFA 3MAMA 3O97A 3VVEA 3R26A 2ZNUA 5H8HB 3N6UA 4QFNA 1AH5A 2P0SA 3QK6A 3K6VA 1LAGE 1SW2A 3K1PA 1HSJA 4LP2B 4YAHX 2V93A 3PUVE 3R7XA 2PT1A 3E3KA 4L17A 1URSA 2HZLA 1TWYA 1UQWA 2YLNA 1GV8A 1EU8A 3BKIB 1R9LA 3PUWE 3TTNA 2M8CA 3BBRA 3K1NA 3QIMA 2DQVA 3CIJA 4GIZA 4GWOA 1ZMGA 3IAZA 3LSXA 4IY5A 5JEIA 1OIBA 5ELVA 2PVUA 2GHAA 1CB6A 5EHMA 5AA1A 1ZU0A 3UP9A 1DPPA 1M5BA 4KI0E 2F5XA 3TAJA 3LSFB 5ITPA 1MDP1 4DZ1A 3QUJA 3V5AA 1NNPA 3FATA 2HEUA 4KYSA 5DYHA 4RA1A 5EHSA 4YB7A 3B6WA 3N94A 1LBBA 2XD3A 4NEDA 1MPDA 3CFXA 2P2AA 2THIA 3U8QA 3IOWA 1FW0A 3M3LA 1ZLQA 4N07A 3CSGA 4F2QA 1JQFA 4H8IA 2DE3A 1MQIA 4EXLA 5I2KA 3MVYA 2UVIA 1SI1A 5I58A 2Z22A 1ZKBA 1M5CA 2ZNSA 3OO9A 1IXGA 1FTKA 4BDRA 3C33A 1IXIA 3RTFB 3EHTA 2ZYMA 4OETA 4F29A 2I4BA 1MRPA 3TPAA 2GH9A 4PFTA 4H5FA 5M2VA 1Y9UA 2XXWA 2REGA 4O3BA 2HZKA 3EHUA 2XXVA 4F1YA 3O6IA 3SEUA 5H8NB 3VXCA 4H6DA 5A5XA 2DWHA 1B51A 5L9SA 1UTHA 3K02A 4F3BA 1MXZA 3ECRA 4DLDA 3IB1A 5DVIA 2NOOA 1B4HA 1XS5A 3ILTB 3UN6A 3HN0A 1UTBA 5CMCA 1B2HA 2AL4A 3EPEA 2HFBA 3O6HA 1B4ZA 4PP0A 1P1OA 5AA2D 1MQHA 2F6GA 4DCYA 3FZVA 4MF3A 1IXHA 1GR2A 3UA8A 3TMGA 5H8QB 3KJTA 4U2RA 4IO6A 4R75A 1USYE 2Z8DA 1D4NA 3IB0A 2A5SA 4WEPA 1B7UA 4GL8A 3T96B 1EZPA 5AE4A 2UVHA 4IGTA 4JDFA 2VD3A 2O7IA 4EQ9A 1B5JA 1MH4A 2RC8A 3W15C 2HAUA 3FVOA 1N7WA 3MPKA 1OVTA 3O29A 4KCCA 2A5TB 5EYFA 1JW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F19A 1PB9A 4GXSB 3TCHA 3Q29A 3H6VA 1I69A 3UIFA 3S9EA 4RNSA 2UVGA 4P3LA 3MYUA 1VSOA 1B7HA 1EYJA 5CBRA 2V3TA 4NF6B 3RLFE 5K2YA 4GL0A 1PB8A 4OENA 3DM0A 3VFJA 3KEIA 2D21A 2Q89A 4IB2A 4MMPA 4KFQA 2ZMBA 1IITA 4MNCA 1TT1A 1JEUA 1H76A 4LZ7A 3RPLB 1II5A 3T9XB 3FJGA 4NTLA 1YXIA 4OFOA 3CRBA 1USYH 2XXRA 3MP1A 3CG3A 5CRYA 2ZZVA 1IIWA 4YKJA 2LAOA 1DTGA 1MXYA 1FQBA 2QS1A 3VVDA 1N76A 4MH5A 3TTRA 3LBSA 1TFDA 2P3NA 2ANJA 3PV0E 1JW5A 4JVDA 1B9JA 3K0VA 3TCFA 2DDKA 2H9BA 4FEDA 4R2FA 1AL3A 4Q8RA 5B70A 2ONRA 1B46A 4XKNA 1NI9A 1Z7NE 4E0XA 4ELPA 5KZTA 5I59A 4TQUQ 4GD5A 1Q9DA 5KDTA 1PDAA 3D4CA 5EQAA 1LBVA 2XX9A 3UORA 3Q25A 4XTCQ 4FATA 1PC3A 1Z7ME 3EKIA 2F7AA 1XI6A 2Z8EA 5HPQA 2FVZA 4X1BA 2I6EA 4HE1A 5L9OA 3OSRA 4QFKA 4N6KA 2F34A 3H6TA 1FBCA 3QAXA 4YB6A 5H8FA 2X7PA 1FTJA 4PGNA 3V89B 2CEXA 4R9GA 2F8DA 1NNKA 5I2NA 3K6UA 2DE2A 1NV2A 5IM2A 1IQ7A 4GWUA 1IUDA 4YMAA 1DK4A 4MNIA 5A5LA 4ZEDA 4F39A 1A40A 1YCJA 3FVGA 1NUYA 2JJKA 2Q9TA 1D3KA 1R9QA 1VDWA 4C1TA 3QYTA 1NH7A 2GRVA 1P1UA 3RPWA 2QMWA 1P1WA 1SVXB 4GX4A 1BK4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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