2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
molecule tags Hydrolase
source organism Rhodococcus sp.
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
3A3UA 1QJMA 3I6VA 1GVCA 3OO7A 3DP8A 2OZZA 1XC1A 2V3TA 4N07A 3LSLA 1IZ1A 3T66A 3MWBA 2Q9TA 1ZMGA 1N3XA 1POY1 1SW4A 1Z7NE 5CI5A 1N7WA 4GD5A 1LCTA 1SW2A 3U72A 4LATA 5ICTA 3PMVA 1EH3A 2RC9A 3C36A 4JWXA 1MQHA 1LFIA 4NF6A 4NF6B 1B40A 4ZEFA 2O69A 1H44A 3F11A 3MBPA 2DYXA 4BDRA 3T9VA 4JWYA 4HCYA 3N6UA 3FUZA 5L8DA 2R6GE 3O6GA 1A55A 5CM6A 2H25A 1SI0A 3EHUA 1OQHA 4K3FA 3H06B 3CG1A 2Z8FA 1UTBB 3QSLA 3FJMA 1OLAA 4OFOA 1SI1A 3HV1A 2O6AA 3O6IA 1FTLA 1Y4TA 4OZ9A 2ZXTA 1PEBA 2XXUA 2ZYOA 3KFMA 3GLBA 4AB5A 4IY5A 5KZTA 4R9FA 1A99A 1H3DA 1FTOA 4HW8A 4BDLA 2QPQA 3P7IA 2I0CA 3PUWE 5AA4B 1LBBA 3MC2A 4AB6A 3VXBA 2OWTA 3S2VA 4XXUA 1MQIA 3FJ7A 4LZ5A 4ZZEA 4I8CA 3HO7A 4H8IA 3W9WA 2DVZA 3H6WA 5BWJA 1MQJA 3ZKKA 2AYSA 4E0XA 1O7TA 2NVUB 1IXCA 2DVCA 1NH8A 3JYRA 3PUVE 5I59A 3KJ7A 4G68C 4EDPA 4BDNA 3JV9A 4P11A 4IY6A 1MG1A 3HCQA 3HHGA 1Y9UA 4OYVA 4JWOA 1N84A 5H8FA 1OVBA 3MP1A 4QSDA 5H8FB 3C4MA 2GHBA 4XKQA 1LB9A 1SVXB 1B3GA 4BLAA 3LC8A 3PPOA 5FHOA 1AMFA 2I0BA 4OVJA 3RN8A 2ZNUA 3EQ1A 4G8NA 2P2AA 4WXJA 4ZE8A 3OEKA 4KYSA 4F18A 4F2OA 2D5WA 2Q88A 4NF5B 4XTCQ 1N0TA 5CRYA 2UVJA 2AL4A 3O66A 3DP4A 4X9TA 1PC3A 3T9HB 4GL8A 1NNPA 1RYOA 3UP9A 5H8QA 3C33A 3M3LA 5H8QB 3IORA 3TFLA 3FVGA 4POXA 3KSJA 3TODA 2IA4A 3ZSFA 1B7HA 3MJNA 4YKJA 2F78A 3RNNA 4FIMA 5I58B 4E0WA 5AA3A 4DE8A 2QMXA 2D21A 3CG3A 3MAMA 3K2DA 5IAIA 3CSGA 1R1NA 1ZIUA 3GZGA 2Y84A 4GVOA 3KGCA 4PE5B 3T93B 3O28A 1MH3A 4NE4A 1B5IA 1WODA 2QMWA 2P0SA 3IOVA 4DXUA 3H4ZA 3OXNA 4XKNA 3C9HA 4ZE9A 4KYEA 1O64A 1DPEA 2ZMBA 2H98A 3VLVA 4HTGA 1B0HA 4H8JA 2O1MA 2W7YA 4ZDMA 1B9JA 2XXIA 4IGRA 2DE4A 3PD8A 1QUIA 3DP6A 2UVIA 3TMGA 3ILUB 3E13X 1JVXA 4RYAA 1AIVA 4IO7A 5I2KA 2DWIA 5H8HA 5I2KB 5H8HB 4R72A 5LOMA 4KYDA 2O51A 1TXFA 5JTYA 3FVOA 2F7BA 5FHNA 5JTYB 2Y7WA 1Y3NA 4LP2B 3OO8A 1OQGA 2M8CA 1XVXA 3TTLA 3L6GA 3SETA 3C32A 4RXLA 1D9YA 4ECFA 3D4GA 3MVZA 3SESA 3TQLA 3UK4A 2QS2A 2Y7RA 5IKBA 3M8UA 3SEWA 1R6ZA 3W15C 1H76A 3OMBA 4OETA 1MS7A 4R75A 3DLNA 3JZJA 3PU5A 1FQFA 1RKMA 3MVYA 5JK4A 3RGYA 1Y1MA 1CE2A 3K1PA 3VE1B 1D3KA 4F2QA 4OQOA 5I56A 4JBZA 4QSCA 5I56B 3K6VA 4DDDA 4PETA 1US5A 2NXOA 1GTKA 1M5BA 3K4UA 2O1LA 4YB5A 2V3QA 4BDOA 5AA2D 4F1UA 3U93A 4LZ7A 1GGGA 5TP9B 2ANJA 2ONRA 3OENA 5CMKA 4Q5TA 3K6UA 3DELB 3ONMA 1N04A 3T22A 2YPNA 3PMXA 3HPIA 4RK2A 2V84A 4M1VA 5ITOA 1P99A 2XHDA 1CB6A 4KCDA 1EZ9A 3RTFB 2KLFA 1POTA 1ZKBA 3TEPA 4WKMA 1O63A 2I49A 3VVDA 3H6TA 3K6XA 3T9XB 1QUJA 3TZAA 3U8QA 2AL5A 3TELA 4X1DA 3RY3A 4EF1A 4OENA 4I62A 2UYEA 2HZLA 3N6TA 1NNFA 4IO6A 2NUVA 4ONYA 4ISUA 3RQTA 3AXFA 4MLVA 4XKPA 1XT8A 4QFOA 3V8XB 4YU0A 5TU0A 4H5GA 5L9MA 3GBBA 3TTRA 1J1NA 3PPQA 4U1OA 2THIA 3WAEA 3SEXA 3S4UA 4FEDA 3E9XA 2XX9A 3OOAA 1ZTYA 3MZ9A 4QFPA 3S9EA 2I58A 1XOCA 3G3IA 4TLLB 3THIA 1VFDA 3VXCA 1LAGE 4P0GA 3CR9A 3VVFA 3SERA 1FTJA 3LBSA 3KN7A 3PMWA 4GRKA 4F3GA 1MPBA 1GR2A 1MXVA 5I84A 1PBQA 4FECA 4DLDA 4ELOA 4KD5A 5FTHA 1H43A 5H8SA 1YTVA 1I6BA 3TCFA 2ZNSA 3RT6B 3OSRA 4U22A 3HN0A 4NMYA 2QS3A 4G8HA 3QUJA 3SDFA 4U23A 1P1NA 4G4PA 2OK2A 3ZKLA 1SW1A 3MP6A 1OLCA 2VHAA 4N6PA 1NMUA 5J1DA 3HHFA 2F6PA 4NF4A 4NF4B 4GQOA 3UN6A 4PFUA 3IJXB 2F7AA 3S9NC 3SEYA 1OVTA 3PD9A 3Q26A 4MH5A 1XS5A 4R9GA 2GFEA 3MPLA 1GV8A 3B7DA 4FE8A 1DOTA 2IEEA 4POWA 2GH9A 5F1QA 2UXAA 1JNFA 4EXKA 2OBGA 2F6GA 3FATA 3V5AA 5DTBA 2DP8A 3ECRA 5CMMA 3CVGA 4UA8A 3H6UA 3USDA 5I2NA 1B0LA 1KWHA 5I2NB 1A7LA 4G8MA 2E1SA 4ZECA 1NNTA 2I4BA 1B7UA 4U4SA 4OEVA 1MPCA 4H1XA 4JB7A 3MVWA 1YCJA 4PQJA 3UORA 5HM4B 4U21A 1F9BA 4OEUA 5L9SA 2FNCA 2PX1A 4KHZE 1JEVA 4U4XA 3FGSA 1I6AA 3LSFB 1B52A 2O84X 5I59B 3SKPA 2XXRA 1R9LA 3QXMA 2VD2A 4FAJA 2YJPA 5CC2A 5BUUA 5A5XA 1LSTA 3SEUA 2DWJA 2QJEA 4DIGA 3BFTA 1N3WA 1IUDA 1JW5A 3W9VA 2Z23A 2NOOA 3IOUA 2RF1A 1FQCA 3O2AA 1ATGA 1Q1KA 1MY1A 4IGTA 4ND9A 1US4A 1MDQA 2HCAA 4YKIA 4R6YA 3BFUA 4OFLA 1LB8A 1NH7A 1MRPA 3CFLA 3O6HA 1B7ZA 3PPPA 4EQBA 3KEIA 1LAHE 5DEXA 4PFTA 1HSLA 4FORA 1TT1A 3D4CA 2A5SA 5HPQA 3O97A 5ICQA 3IO4A 2GRVA 1I6QA 4F22A 4MBPA 3TTKA 4TOZA 5DVIA 1MDP1 5KDTA 3LSXA 2RINA 5KDTB 1N7XA 2ZYKA 1YPNA 2OJTA 2XXYA 2UYFA 4RY1A 2DWAA 2XXWA 1II5A 3H03A 4JSOA 5ITPA 4EQ9A 3C31A 3B6QA 1I69A 2REGA 4OESA 1OMPA 4GWOA 3FVNA 3S9MC 4G2ZA 2CZLA 3KOSA 1TFDA 3QK6A 1B05A 4QSEA 3CIJA 4NF8A 3TDJA 2H99A 5K2XA 2I4CA 4GOTA 3LR1A 3MP8A 1FQBA 4YKPA 5B70A 1BLFA 1OIBA 1DMBA 4U2RA 2D3IA 3G3KA 2FYIA 1MM7A 2QL3A 1P1WA 3FIRA 2VOZA 4IO5A 2QS1A 1QW0A 4EF2A 1B1HA 4KPTA 3C34A 1SYIA 3TKDA 3KBRA 3OD7A 2A5TA 4HCWA 2A5TB 4KQPA 1LAXA 4R74A 1MXZA 4RPOA 4JDFA 2Y7KA 1FW0A 1SYHA 1MXYA 2HEUA 1ZLQA 5I57A 1LAFE 5I57B 1N76A 1LBCA 4JSDA 4Q30B 3V83A 2HQ0A 3QYTA 2ABHA 4R2FA 3E4RA 2DSFA 1SQYA 3VLUA 2AIXA 3L6HA 1B51A 2XXPA 3M3KA 5DYHA 3U1OA 4Q0CA 1QKBA 4IB2A 4ZEDA 1P1OA 4G68A 4G68B 1B3FA 1SD3A 2ONSA 3O9PA 3OSQA 2DQVA 4M4GA 3TYHA 1LLSA 1PB9A 1Y1ZA 1ZJLA 3FV1A 4EUOA 3I3VA 2QRYA 1Z7ME 2DXYA 3VDFA 3CSBA 1XHYA 4IO2A 2I6EA 2F7CA 4DXCA 4IO3A 4QFLA 2DE3A 3FXQA 4YZZA 5DT6A 3GXAA 2Y7IA 1MPDA 4F1YA 1MQGA 2V25A 3N5LA 2ZYMA 2RCBA 1NL5A 4ZZAA 2X7QA 2F8DA 1Q35A 1D9VA 2PBWA 1JETA 4Q8RA 4LVQA 4OHNA 4ZS9A 2DS9A 3FD3A 4FEBA 3Q29A 5ISUA 1AH5A 3CFZA 3KSXA 4R6KA 1USYE 1QUKA 3QUFA 4H65A 3IR1A 4GXAA 4YKKA 4IO4A 3VV5A 1M5EA 1P1UA 2B3BA 1B46A 5DVJA 1URGA 4PFYA 4F3SA 2OCUA 2ALUA 2RKMA 1ANFA 2B3FA 3G7WA 2REJA 4H6DA 1IITA 4ELRA 4ESXA 3G3HA 3UGWA 4R6HA 4MLQA 4ESWA 4UACA 5AA2A 5AA2B 1RYXA 1MY0A 2HZKA 1M5FA 3KZGA 3IK6B 3SEVA 1EU8A 2P1SA 2QS4A 2UVHA 3IB0A 1SDXA 1URDA 4Z7EA 5CMCA 4LQ2A 5EYFA 2CMOA 2XD3A 3V89B 1M5CA 1Y3PA 1JEUA 2F97A 3EN3A 3IAZA 4YB7A 3UA8A 3FASA 4THIA 4ELPA 3PPNA 1USYH 4YB6A 4XKRA 1FTMA 2HXWA 2RCAA 1VE4A 1LFHA 1D4NA 4DZ1A 3Q27A 2X7PA 4GFRA 2F36A 3ILTB 1B58A 1NNKA 3MVXA 2Q89A 4LUBA 2O68A 1YAEA 1TFAA 3FJGA 3FXRA 5H8NA 3DM0A 5H8NB 2I3WA 3LSWA 4R2BA 3A09A 1XVYA 5M2VA 1MM6A 4TQUQ 5L9OA 1MXXA 5DVFA 1PDAA 2XXHA 4O3BA 2XXXA 2O7UA 2PVUA 4F3BA 1B32A 3CRBA 2ZNTA 2H9BA 4DCYA 3TPAA 4WEDA 1P1QA 1NKXA 1FQEA 4KI0E 1UQWA 2XX8A 2ESNA 4H67A 3K1NA 4LONB 1UTBA 2PT1A 5EHMA 2UVGA 3CFXA 2PT2A 1UTHA 4F19A 1MY4A 1UTHB 1UIVA 1IXGA 2HFBA 2XD2A 2RC8A 2Y7PA 1B1XA 1ZBMA 1VFEA 3OO9A 5KCJA 5EHSA 5KCJB 1VR5A 3KN3A 2FA7A 4YMAA 2ONKE 4FJPA 4ELQA 4P0IA 1S50A 3RPWA 4OMBA 5AA4A 4F3PA 5AE4A 4GIZA 5TPAA 4F1VA 3T9UA 5TPAB 3K1MA 3ODBA 3MZBA 2B65A 1DTGA 2HAUA 4WEPA 4NWCA 1HSJA 2VP1A 4C0RA 4C1TA 1M5DA 5A5XB 3MQ9A 1DTZA 1NFTA 3K02A 1B3LA 3TTNA 1SW5A 1PB8A 5K2YA 2ZYNA 1BKAA 3R6UA 2R71A 2XX7A 2Z8EA 1BP5A 4EXLA 4X1BA 4U1ZA 3MPKA 4QF9A 3KJTA 1B2HA 4PFWA 1SBPA 1ELJA 4RPNA 3RTWB 3O29A 2XXQA 4G77A 1URSA 4NF5A 5DEXB 1PB7A 1A8EA 4DCXA 3H7MA 1FCKA 4H0WA 4RK9A 1LGBC 2H5YA 3B6WA 1JW4A 4HS7A 3HSTA 1L5TA 3G3FA 2G29A 4FATA 4ZEBA 3U94A 2R9JA 1JW1A 2DWHA 4TLMB 3FZVA 5ELVA 4LZ8A 3MZ1A 2I3VA 2Q2AA 1B3HA 1PBPA 5AA1A 5I58A 3IOWA 3IJOB 4O3CA 3K00A 3PUXE 4GLIA 3BKIB 3QAXA 2VD3A 4XIGQ 3IX1A 3KG2A 2O7IA 2VGQA 1QVSA 3IO6A 2LAOA 3LUYA 3BBRA 4OFJA 3OELA 3IOTA 3TAJA 1MY3A 4DXBA 3TQWA 1IQ7A 1EZPA 4PP0A 3CI8A 1ZU0A 2DOJA 4F31B 4C1UA 3QIMA 4NF8B 2WKYA 3GBAA 3K0VA 4OERA 3TUSA 3TTMA 3FVKA 1Y3QA 3RT8A 2F34A 3N26A 1HSEA 3U92A 1B4ZA 3VFJA 3VVEA 5CBRA 1AL3A 1IIWA 1JQFA 3K01A 1A40A 1B5HA 4YAHX 1MXWA 1Y4CA 2HAVA 3TCHA 2G93A 4RNSA 4KR5A 4RJZA 1DPPA 1Y20A 1A8FA 1MH4A 2PMSA 3IL1B 3I5OA 4YMBA 1A54A 2GHAA 4GF8A 1B5JA 2F35A 1IXHA 3C35A 5F7VA 3UIFA 3ZS6A 4LA9A 3OO6A 3K6WA 3VLWA 1EZOA 1LFGA 1UIUA 2XXTA 4R73A 3PPRA 1MQDA 1FQAA 4GXSB 3R26A 2V3UA 3A3CA 4BDMA 1T0KA 4QFKA 3EHTA 3H3GA 3PUZE 3PGFA 3TCGA 3EF7A 1MY2A 4AQ4A 4I1DA 4N13A 1WDNA 1IEJA 4NEDA 4L17A 3KOTA 4MFIA 1FQDA 3R7XA 1LCFA 2F5XA 4JXIA 1AOVA 3N94A 4OXVA 3Q25A 3WAFA 4BDQA 4EQ7A 3PUYE 2RC7A 4QHQA 2OLBA 4KCCA 2V93A 3MUQA 2DXRA 4O3AA 4Z0IA 3IB2A 3G3GA 2H4IA 1JVYA 2XXVA 1IXIA 3FXUA 3E3KA 1QULA 2X26A 5TP9A 4NTLA 5B7DA 2QSXA 2E0SA 2NWJA 2Q2CA 3MW0A 2OWSA 5CBSA 3EHSA 4I9DA 3H6VA 4GL0A 1QKAA 4QFNA 1FTKA 3EPEA 5FHMA 2Q8JA 1WVJA 1DSNA 3RUMA 4MF3A 4RA1A 2Z8DA 3IB1A 4ZEIA 4ZEKA 5JEIA 1BIYA 1MXUA 1TWYA 1B6HA 1H45A 4LQ5A 1BTJA 4OTEA 4X48A 1S7YA 4YICA 4H5FA 4QRZA 1S9TA 5HBCA 3Q28A 3RLFE 3KN8A 3T96B 1B3EA 2BJJX 3S9LC 4F29A 1B4HA 2DE2A 2PYYA 4KFQA 3G3JA 2YLNA 4OWDA 3OEMA 3M3FA 1VSOA 1R9QA 3FV2A 2Z22A 5FTIA 3PV0E 4F39A 2I48A 3B6TA 4NWDA 5CMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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