2F34A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with ubp310 at 1.74 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A02
1SBPA 2OZZA 1PDAA 1QJMA 1SW1A 3DLNA 2ZYNA 1M5FA 1B1HA 2HFBA 1FQEA 3OSRA 4EQ7A 3TTRA 1XC1A 1B5JA 2Y7PA 4DCYA 3BFUA 2QSXA 4G68B 2H9BA 1JW1A 3A3UA 1B7HA 5I56A 2HZKA 5H8HB 1Z7NE 2F6GA 4NEDA 4PP0A 1MXUA 3IOUA 2I4BA 1B52A 3M3FA 1MG1A 2GHBA 3RNNA 2ZNSA 3KEIA 2O7UA 3CFXA 4KHZE 2O68A 2O1LA 4QFNA 4JB7A 3KSJA 3N26A 1LBCA 2F35A 4NF4B 4F3GA 2AIXA 4QSEA 4E0WA 3MVWA 3UGWA 1B9JA 4OTEA 3PGFA 3ZKKA 3OMBA 1B3LA 3RUMA 2XXTA 5I84A 1MM7A 3H6UA 4ECFA 5I59B 3BBRA 1BP5A 1T0KA 1PB7A 3TODA 3IOWA 1QW0A 3G7WA 4R73A 2ZMBA 3V89B 3IB0A 4G4PA 2ZNUA 4I8CA 1IXCA 3TAJA 1LAHE 4R75A 1MM6A 4AB5A 5CBRA 5TU0A 3OOAA 1JEVA 2ZNTA 1B3GA 3TYHA 4IGTA 3MZBA 2I0BA 4C1TA 2W7YA 3TFLA 2THIA 3IO6A 4P11A 2NOOA 2LAOA 3MQ9A 2IEEA 2R9JA 4HCWA 3K01A 2XXQA 3IOVA 3U93A 2ZYKA 2DE3A 4ZS9A 2QS1A 3IOTA 3D4GA 2DSFA 3CI8A 4M4GA 4QSDA 3FATA 2VD2A 5AE4A 1OLAA 5DTBA 2XHDA 2Z23A 3LSXA 2YPNA 4DLDA 1YCJA 3JV9A 4GF8A 3K1NA 4X1BA 2KLFA 4Z0IA 3KBRA 1AOVA 3FXRA 3TQWA 3TKDA 4KI0E 2AL5A 1N0TA 1OVTA 3H3GA 4Q0CA 2A5TA 2OWSA 2WKYA 3IJXB 4QFOA 4GOTA 4TQUQ 2H25A 2VHAA 4GVOA 4F3BA 3N5LA 1GVCA 2VP1A 2XD3A 1ZTYA 3V5AA 3K02A 4NF8B 5EHSA 3EPEA 4AQ4A 3KJTA 5JK4A 3H7MA 4EQBA 4OQOA 3PPRA 1H45A 3S4UA 4OYVA 1LB8A 1CB6A 1DSNA 1US5A 1UTHB 1ZJLA 2I48A 1ZBMA 3EQ1A 1UIVA 5CM6A 1Y9UA 1NNPA 5I2KB 5B7DA 4PFUA 1A8EA 4LA9A 3EHSA 3SEXA 4XKNA 3MUQA 5HPQA 4LZ5A 4XTCQ 4LATA 3QYTA 1N7WA 3GBAA 3M3KA 1FQCA 4YAHX 3IK6B 1LSTA 4RYAA 3QSLA 2NVUB 4AB6A 4KCDA 2Y7WA 2CZLA 5I58B 1B2HA 5F7VA 1P99A 1D9VA 4HW8A 1BTJA 4O3CA 3FJ7A 2GRVA 3CFZA 1S50A 4DCXA 3C33A 2X7QA 3USDA 1IZ1A 4XIGQ 5DT6A 4H1XA 2FA7A 2O51A 2XX7A 1XHYA 2D3IA 2V25A 3GXAA 3H6TA 2I58A 3KJ7A 1HSJA 1P1OA 3RN8A 2RC7A 1R9QA 3S2VA 3T9VA 3T9HB 4DXCA 4YMAA 5I56B 1A99A 1F9BA 1MDQA 1ZKBA 1GR2A 3LBSA 4NF5A 3VFJA 2RKMA 1IXIA 5EHMA 1R6ZA 1RYOA 2Y84A 4F18A 4OZ9A 4IO5A 3SESA 3D4CA 3ILUB 1MH4A 2DWIA 3ZKLA 2PYYA 3FJMA 3FVKA 4X1DA 1LFHA 4OEUA 3G3IA 3B6QA 3Q25A 3OO7A 2UYFA 3VVEA 1HSLA 3LR1A 4EQ9A 3HHFA 2R6GE 2V84A 4JSDA 3THIA 4NE4A 4OVJA 1QULA 4QHQA 2D5WA 3C36A 4ZZEA 1IXGA 4YB6A 5ITPA 3PPPA 1I6QA 3SETA 3IB1A 3IB2A 3SEYA 3G3HA 3SDFA 4YICA 4RY1A 2VGQA 1LCTA 1NMUA 3RGYA 3U94A 5L9SA 2PMSA 1XOCA 1UIUA 2UVGA 2XX9A 3FIRA 3BKIB 2O1MA 3LSWA 4MFIA 2Y7IA 3K1MA 2Q9TA 1IUDA 3A09A 5I2NA 4H8JA 1MPCA 4GXSB 2VD3A 1MXXA 4MLVA 3FVGA 4F31B 4NF6A 5KDTA 1TXFA 2XXVA 4U2RA 2DE4A 1FQDA 4F2OA 3TPAA 4ESXA 4P0GA 1MXWA 3CSBA 1DMBA 2AL4A 1D3KA 4ZEFA 4DZ1A 4RPOA 3H06B 1BKAA 3PPNA 3FXQA 2ZXTA 2H99A 1JW5A 2ONKE 4NTLA 1Y3QA 2B65A 3TQLA 2X26A 4DDDA 1URGA 3K2DA 2OK2A 1TT1A 2HAUA 4OEVA 3R7XA 1LAXA 4GWOA 2Q89A 4GLIA 3TCGA 4JSOA 2NWJA 4ZEKA 3E3KA 3W15C 2E0SA 2PBWA 3PU5A 1H44A 4F22A 1B0LA 3CSGA 1MY3A 3DP8A 1N04A 2PT2A 5TPAA 3GLBA 2QJEA 3MC2A 4F2QA 2HCAA 3H03A 2HZLA 5M2VA 3OXNA 2IA4A 5HM4B 3PUXE 5AA3A 1NL5A 5CRYA 4YZZA 4OWDA 2BJJX 3HHGA 1I69A 4U4XA 3WAEA 2F5XA 1JVYA 3H6VA 5TP9A 4RPNA 1JETA 2I49A 4G8MA 3KOTA 5AA4A 3VLUA 1B7ZA 1MY0A 3E13X 3SEUA 2PT1A 4QFPA 4OETA 2OLBA 1VFEA 5JEIA 3L6GA 5B70A 1B3FA 1FCKA 3F11A 3IAZA 3GBBA 1FQFA 4Q30B 1MXYA 3UA8A 2V3UA 4I62A 4NF5B 1Z7ME 5FHMA 2P1SA 4H8IA 5CC2A 2DXYA 4GRKA 2QMXA 3OELA 4GD5A 1A8FA 4K3FA 4KYEA 3KN7A 2QRYA 4HTGA 3Q26A 4Z7EA 4RK2A 3TTMA 3ZSFA 4FATA 4N07A 1OQGA 1P1WA 1B32A 1R1NA 3OSQA 3C34A 3HCQA 3VVDA 4ZZAA 4THIA 5DVJA 1A54A 1NKXA 4OMBA 5JTYA 1UTBA 2RC8A 3KOSA 4OFLA 1HSEA 4YKJA 1Y20A 4DXUA 5K2XA 1LCFA 4TLMB 1B5HA 1OQHA 1XT8A 4KPTA 2O7IA 4ZE8A 3O6HA 4POXA 2GFEA 1Y3NA 4FE8A 1LGBC 4JDFA 1SD3A 1O64A 3IX1A 3U92A 1US4A 5ELVA 4R6YA 3T9UA 1FW0A 2DQVA 3K6WA 5I2NB 3FGSA 3TEPA 1VFDA 4ELPA 2F34A 3TDJA 3Q29A 1MDP1 2Z8DA 4NF6B 4H5FA 5J1DA 5KDTB 4WEPA 2V3QA 3FZVA 4Q5TA 2QPQA 1URSA 3OEMA 1XVXA 4ELQA 2DYXA 2REGA 1ZMGA 2RF1A 1PB9A 3LSFB 3VLVA 4FAJA 1MQDA 1MQGA 2HQ0A 4I9DA 4RA1A 3G3GA 1B58A 4F1YA 2FNCA 4KYDA 1FTLA 1RKMA 4G8HA 3M3LA 1H3DA 1P1UA 4LVQA 1S7YA 4G68C 3CG3A 3IORA 1NNFA 1JVXA 2H98A 1QUJA 3JYRA 1Q35A 1LFGA 1VE4A 4OERA 1M5EA 1FQBA 2DXRA 3KZGA 1WDNA 3UK4A 1TFAA 1ZU0A 5KZTA 3MP6A 3C35A 1SI1A 3G3KA 4Q8RA 1EZ9A 1AMFA 2AYSA 4GL0A 2DVZA 1FTJA 4RJZA 3ONMA 5DYHA 4OFOA 2F8DA 2V93A 1H43A 1N3XA 1SVXB 1POTA 2D21A 5TPAB 3N6TA 4JWYA 3EHTA 3PD8A 4GL8A 2OBGA 4G68A 3DP4A 3TTLA 3CG1A 1ZIUA 1JNFA 4BDOA 3HO7A 2REJA 1ZLQA 5ICQA 2I3VA 3MJNA 3OO6A 2XXIA 1YTVA 2NXOA 1A40A 1LLSA 1OMPA 1NFTA 2UVIA 5TP9B 1IITA 1D4NA 1PC3A 3LSLA 5AA4B 4F1VA 4ZE9A 2QL3A 5EYFA 3KSXA 1DPEA 1D9YA 4JBZA 3K1PA 5I57A 2B3BA 4JWXA 4I1DA 2DOJA 4IGRA 4M1VA 2ANJA 1TFDA 2E1SA 4GQOA 2DWJA 4H5GA 5A5XA 3Q27A 3LUYA 4PETA 3FVNA 4R6KA 1QUIA 2XXXA 4N6PA 4XKQA 1BLFA 1OIBA 4F3SA 1GV8A 3VXBA 4RNSA 2UVJA 3K00A 3BFTA 1LAFE 2V3TA 4HCYA 3TTKA 4ISUA 4PQJA 2HXWA 3QIMA 3T96B 3PUWE 3RTWB 3Q28A 4XKRA 1B3HA 2DE2A 4R9GA 3KG2A 1N7XA 5JTYB 1LAGE 1UTBB 4QSCA 1EZOA 3OENA 4IY5A 4GXAA 4XXUA 2Q88A 1MY2A 3TUSA 3A3CA 5K2YA 4YU0A 3RQTA 4U21A 3G3FA 4FIMA 3CVGA 1GGGA 3N6UA 1N76A 3ODBA 1EZPA 5IAIA 4TLLB 2M8CA 3W9WA 2I0CA 1A55A 3RPWA 3FXUA 3RTFB 3I5OA 3VV5A 4NWDA 1NNKA 4ZEIA 2B3FA 4KR5A 3WAFA 3SEVA 4MBPA 4R2FA 3C31A 3E9XA 1S9TA 5AA2D 4E0XA 1QUKA 2Q2CA 1JEUA 1MQHA 1B51A 1Y4TA 2A5TB 3C4MA 4ESWA 3MZ1A 1B1XA 2I6EA 4BDRA 4YB5A 3RY3A 3RT6B 3MVXA 4NWCA 5FHNA 2FYIA 1UTHA 1USYH 4POWA 2ESNA 3ECRA 1LFIA 4U1ZA 4WKMA 4JWOA 3KN3A 1Y1ZA 1FTKA 4IO4A 3FD3A 3EN3A 3EHUA 1TWYA 3ZS6A 5L8DA 4G2ZA 5AA2A 2XX8A 4U1OA 5L9OA 1M5BA 3DP6A 3PUVE 4R6HA 1M5CA 4LQ5A 2OJTA 1URDA 1NNTA 4TOZA 3O6IA 1O7TA 5FTHA 5ICTA 2QMWA 3KFMA 3TTNA 2YJPA 3R6UA 4ELOA 1J1NA 1QVSA 3FVOA 2F36A 3R26A 3VDFA 4ONYA 2XXYA 3GZGA 3G3JA 3HV1A 3OO8A 1B6HA 3KN8A 4LZ7A 5F1QA 4U4SA 3QUFA 3S9NC 1B3EA 3I3VA 5H8NA 2Z8EA 4H67A 3UP9A 5H8FA 1WVJA 1MPBA 2HAVA 3MPKA 4MH5A 5H8SA 2OCUA 4FORA 2Z8FA 4G8NA 3V8XB 2XXWA 2CMOA 4PFTA 4UA8A 3EF7A 1XS5A 1R9LA 1SW5A 5I57B 4GIZA 5IKBA 4EF1A 4O3BA 1DPPA 1P1NA 3RT8A 3QXMA 5A5XB 2ZYOA 4X48A 3VXCA 1GTKA 2XXRA 4ELRA 2F6PA 3PMVA 2Q2AA 3VE1B 2ALUA 1SQYA 3CIJA 2DWAA 3SKPA 1PEBA 4U22A 5DEXA 3O9PA 4F29A 1LBBA 3ILTB 1B40A 3VVFA 3O6GA 4F3PA 1FTMA 4IB2A 4QF9A 3AXFA 1B4HA 4EXKA 4YKPA 1A7LA 4RK9A 2RCBA 2P2AA 3DELB 1II5A 4WXJA 2NUVA 4ZECA 3T22A 4GFRA 4FECA 5H8QA 3TCFA 4OXVA 4QFLA 3IO4A 1MXVA 2OWTA 3N94A 4YKIA 4EF2A 3HSTA 2XXUA 3CR9A 4G77A 3V83A 2DS9A 2DWHA 5ITOA 1POY1 4U23A 3U1OA 3OEKA 4P0IA 3K4UA 2F78A 1MQJA 4ND9A 3O29A 3VLWA 1JW4A 2RINA 4IY6A 2UVHA 1PBQA 3C32A 1MXZA 4HS7A 2O84X 4LQ2A 3UORA 4OESA 1YAEA 3P7IA 3DM0A 5CBSA 1B7UA 5CMMA 4KQPA 5BUUA 3UN6A 2F97A 4PFYA 1QKAA 1BIYA 3H6WA 4IO3A 4R72A 1B0HA 4H6DA 3MBPA 3OD7A 1M5DA 3IR1A 1EU8A 1VSOA 1LB9A 5CMCA 4OHNA 5LOMA 1AL3A 4YKKA 4R2BA 2XXPA 1IEJA 3E4RA 2YLNA 2F7CA 3I6VA 2DP8A 4XKPA 4OENA 2QS3A 4F39A 5KCJA 4LP2B 4KFQA 1MPDA 3SERA 2Q8JA 2Y7KA 2G93A 1FTOA 3T93B 1IIWA 4H65A 4X9TA 2F7BA 1YPNA 3T9XB 3FASA 3U72A 1Q1KA 1B05A 4IO6A 3FUZA 5AA2B 2GHAA 1Y4CA 1PBPA 3IJOB 3S9EA 2ONRA 3W9VA 2PX1A 3B6WA 3TELA 1ELJA 2DVCA 4FJPA 5H8HA 3MVZA 4QFKA 3TZAA 3RLFE 3C9HA 5AA1A 4F1UA 2A5SA 1AH5A 3PPOA 3B6TA 4ZEDA 2GH9A 1H76A 2HEUA 4EXLA 3B7DA 1USYE 2UXAA 3PV0E 2QS2A 1MH3A 3PUZE 3M8UA 1SYHA 4PFWA 3MVYA 3O28A 4UACA 4PE5B 2H4IA 4NF4A 2Z22A 4R74A 4DIGA 2F7AA 1MY4A 5H8NB 4ZDMA 5ISUA 5BWJA 4YMBA 1OLCA 4BDMA 2ONSA 3QK6A 3JZJA 4KYSA 3FV1A 3O97A 4DXBA 5H8FB 1MY1A 5I59A 2RC9A 4L17A 4BDLA 1SW2A 5CI5A 3K6XA 3QAXA 4MLQA 3PPQA 3U8QA 4NMYA 1N3WA 1PB8A 5FHOA 3PD9A 2ZYMA 1MRPA 4FEDA 1N84A 3QUJA 3MP1A 4JXIA 1Y3PA 1KWHA 3OO9A 3MZ9A 1DOTA 4C0RA 3O2AA 1SYIA 1NH7A 1I6BA 2P0SA 3LC8A 4LONB 4DE8A 3S9LC 4LUBA 1OVBA 4H0WA 5DEXB 1WODA 3MW0A 1SI0A 3CFLA 4QRZA 5CMKA 3K0VA 2RCAA 3MP8A 1NH8A 4EDPA 4LZ8A 1IQ7A 3FV2A 1ATGA 1P1QA 4EUOA 1AIVA 4F19A 3IL1B 3MWBA 1JQFA 5H8QB 5FTIA 1QKBA 4R9FA 4WEDA 2QS4A 3MAMA 4KCCA 2VOZA 1O63A 4FEBA 2XD2A 4O3AA 3HN0A 4RXLA 2ABHA 3T66A 2X7PA 4KD5A 4IO2A 3TCHA 1I6AA 1FQAA 3PMXA 2O69A 2G29A 1B5IA 3CRBA 2UYEA 3K6UA 3L6HA 2PVUA 3PUYE 1UQWA 4NF8A 1EH3A 4N13A 3S9MC 1SDXA 2R71A 3FJGA 1ANFA 3K6VA 3O66A 1DTZA 2I4CA 1DTGA 1MS7A 1XVYA 1IXHA 1Y1MA 1RYXA 5I2KA 1VR5A 2XXHA 4IO7A 1L5TA 4BDQA 1B46A 3HPIA 4MF3A 5DVFA 1SW4A 3PMWA 3SEWA 4BLAA 2H5YA 3KGCA 3UIFA 2Y7RA 5KCJB 5HBCA 4C1UA 5CMBA 4YB7A 2O6AA 4BDNA 5I58A 4OFJA 4ZEBA 3H4ZA 1B4ZA 1MQIA 3MPLA 2I3WA 1CE2A 3TMGA 5L9MA 5DVIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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