2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
2WKYA 3TODA 5I59A 2G93A 1ZLQA 2BJJX 3O28A 2QS3A 1FQAA 2DS9A 2F5XA 4OETA 1B2HA 1B3LA 2VD2A 1LFHA 1LBCA 3OENA 2RKMA 4WEDA 3RN8A 4NF5B 3M3FA 4PFWA 4U4SA 3OO7A 2QS4A 4R6HA 4NF5A 4H5FA 2V3UA 2FA7A 1EZPA 3EHTA 3K1MA 4I1DA 3V83A 1A55A 2ESNA 1IXGA 2GH9A 4K3FA 2O1MA 3H06B 1ZJLA 3TDJA 3KN3A 1GGGA 1FTKA 5DVFA 4NE4A 1O7TA 1P1WA 4RA1A 5L9MA 2HCAA 1R9QA 4EUOA 3FV2A 2Q9TA 2ZNUA 3FJGA 3RUMA 1MY0A 4NMYA 4AB6A 1B4HA 4GL0A 3P7IA 4R2BA 2I0CA 1NH7A 4RPNA 1ELJA 5AA4B 2QMWA 5I2KB 1SD3A 3TQWA 5AA1A 5AA4A 2R71A 3T9UA 4E0XA 5I2KA 1UIVA 3LBSA 3OO6A 1S50A 3MAMA 3CI8A 1MH4A 4I8CA 4F2QA 4G2ZA 3TQLA 4N6PA 2XX8A 3RPWA 3MP6A 1I6QA 3KSJA 5HPQA 5L9OA 2E0SA 3C9HA 5CBRA 4XKPA 1Y3QA 3UGWA 4DZ1A 5AE4A 5JK4A 1IXHA 3Q27A 2O1LA 1H3DA 1VE4A 2ONSA 4U4XA 1ZKBA 4ELOA 2QS2A 2REJA 2DVZA 3VLUA 5AA2D 4F29A 3TYHA 4JDFA 2F34A 1POY1 1TFDA 4YU0A 3BFTA 3I5OA 4NF4B 5ISUA 4MLVA 4NWDA 2XXUA 2HAUA 2UVIA 4NF4A 1BKAA 2VD3A 3PMXA 1UIUA 4F22A 3TPAA 3FUZA 2ONKE 1H76A 5FHMA 1VSOA 1NFTA 1ZBMA 3FXRA 3PPPA 4POWA 2Q8JA 1MY1A 1B6HA 3CG3A 2DYXA 2Q2CA 1ATGA 1FQCA 2AL5A 3K6UA 2O6AA 1B05A 1GTKA 4ONYA 2HEUA 3PUYE 5BUUA 3PMWA 4FATA 4OERA 3MZBA 4ZEKA 3TTLA 4FEDA 3CVGA 4RK2A 1OQGA 3W15C 3B6WA 3PD8A 4YZZA 4RJZA 4LP2B 2V84A 3CFZA 3E13X 1RYOA 3U1OA 3O6HA 5K2YA 3AXFA 3C36A 4L17A 1XOCA 3RY3A 2XXVA 3L6GA 3MUQA 4IO6A 4R72A 4GIZA 1NNTA 4IO3A 4WXJA 5TPAB 3S9EA 2I4BA 2DP8A 3IR1A 4R9GA 5TPAA 3K4UA 4R6KA 1KWHA 3T9HB 1IEJA 1VFEA 4OFJA 1FQFA 2GRVA 4DCYA 3MWBA 2CZLA 3ODBA 5DT6A 4JWYA 3G3GA 1I6BA 3FVOA 2Y7PA 2ZYKA 3MPLA 1JW5A 3QYTA 4ZEFA 3LC8A 1Y9UA 3LUYA 1LAGE 1B5JA 1F9BA 3MP8A 1MY3A 4I9DA 2I3VA 3KJTA 3IL1B 5FHNA 1N04A 1NKXA 4FE8A 5EHMA 4YB7A 1B4ZA 3FD3A 4HS7A 3PD9A 3IOWA 3KEIA 4DCXA 4LVQA 4PQJA 3KG2A 3GBAA 5JEIA 4ZEBA 1N84A 1YAEA 4EXLA 2E1SA 5CMKA 3QK6A 3EHSA 2H25A 4TQUQ 4DIGA 2DWHA 2P1SA 1BTJA 1LBBA 4JSOA 4JWXA 3Q25A 4DXBA 2RCBA 3IO4A 2Y7WA 2F78A 1DSNA 5AA3A 2IEEA 3EPEA 1B1HA 1MY2A 3N6TA 5I57B 5I57A 1VFDA 2Q88A 4NF8B 5L8DA 2F7AA 1UQWA 1QKAA 3IAZA 3SDFA 3H7MA 5DTBA 4NF8A 4EQBA 3OSRA 1USYE 4XKNA 4H65A 1QJMA 3GXAA 3EHUA 3SKPA 5CMBA 2HAVA 3GLBA 5CC2A 5BWJA 2O51A 3T66A 4FECA 4ZE9A 2X26A 2X7QA 3D4CA 4OESA 1O64A 5ICQA 4NTLA 4PP0A 2GHBA 2O7IA 3K00A 1UTBB 4DXCA 1FTLA 2KLFA 1B46A 3G3HA 1UTBA 1BLFA 1MS7A 4ISUA 4N07A 2A5TA 4KYEA 4OMBA 4BDRA 4ZS9A 1IXCA 3GBBA 3TZAA 2XXXA 3O2AA 2I3WA 4OXVA 1Y4TA 4Q5TA 5ELVA 5ITPA 1QUIA 2H5YA 2VP1A 2HFBA 2Y7IA 2O7UA 5DVIA 1US4A 2R9JA 3KOSA 3VV5A 1SDXA 3JYRA 1SQYA 1A8EA 4QFNA 1MPBA 2QMXA 4F3GA 2DSFA 5CI5A 4YKIA 2F6GA 4Q30B 3R7XA 1HSEA 3HV1A 1BIYA 1AMFA 4AB5A 2Z23A 4OQOA 4OFOA 2R6GE 1Y4CA 3N26A 3PU5A 3SEYA 1LLSA 3H3GA 1XT8A 3VVDA 4YKPA 4F31B 4U23A 3JV9A 4OHNA 4BDMA 1DPEA 4KFQA 1NNFA 3H6UA 4X9TA 3IX1A 3G3FA 3SETA 2QS1A 4GF8A 1IQ7A 3PUVE 4H0WA 3ONMA 2AL4A 3KOTA 2PYYA 3C33A 3IB2A 5I59B 5KDTB 2ANJA 2RC9A 1B52A 1JW1A 5KDTA 1MY4A 2W7YA 3SEXA 3RT6B 4THIA 1TXFA 2XX9A 3IB0A 2HXWA 5IAIA 3H6WA 1J1NA 2NWJA 1DTGA 5DYHA 3O97A 3VLVA 2D5WA 3OO8A 1XVYA 3D4GA 5CRYA 4QRZA 3G3KA 4RY1A 4C0RA 3ZS6A 2GHAA 3G3IA 2I48A 1B7HA 2VGQA 3OEMA 1N0TA 4IY6A 1LCFA 4PFTA 4O3BA 3TTNA 1JNFA 4IB2A 3RTWB 4OEVA 3S2VA 1MM7A 1SW1A 1QW0A 3FASA 3LSWA 1SYIA 2UYFA 4OENA 3VLWA 1PB8A 3LSFB 5KZTA 2Y84A 3UORA 3CFXA 5F7VA 2O84X 4WKMA 3B6QA 3SEWA 4DDDA 4G4PA 3K6WA 4LUBA 3K6XA 2H99A 1MDQA 4H6DA 2O68A 3IORA 3WAFA 4R74A 5H8HB 1IZ1A 4G77A 5H8HA 5DVJA 5JTYB 4IGRA 2YLNA 3K01A 4PETA 5I58B 5JTYA 3QUFA 5K2XA 1P99A 3O29A 2ONRA 5I58A 2ZYOA 2I0BA 3VFJA 3K1NA 3K1PA 4YAHX 4JXIA 2HQ0A 5A5XB 5AA2B 4IGTA 2D3IA 2GFEA 4GVOA 5A5XA 5AA2A 4KCCA 3FVNA 4Z7EA 3E3KA 1QUJA 5TP9A 4F19A 2RINA 1FTJA 4G68C 2F6PA 1ANFA 4GWOA 3TCFA 4F2OA 1AIVA 4G8NA 5CMMA 2NOOA 3CRBA 4XXUA 3T22A 3TFLA 1OVBA 1IITA 1URGA 4BDLA 1P1QA 4HCYA 4RPOA 3BKIB 1LB8A 4R73A 1MQGA 4XTCQ 3E9XA 4G68B 3N94A 3VXCA 2F35A 2G29A 4G68A 4F1UA 4U22A 3UK4A 4XKQA 2XX7A 3SEVA 4IO5A 3S4UA 1N3WA 4KYDA 4M1VA 1B9JA 3B6TA 3I3VA 4MBPA 1MM6A 2Z8DA 4JBZA 2Z22A 1USYH 1UTHB 3TKDA 4U2RA 4MLQA 1XVXA 3MVWA 4F3PA 1B32A 1UTHA 1OQHA 3MVZA 4KQPA 1B3HA 3T93B 4LQ5A 1ZIUA 2V25A 2Y7RA 1MQJA 2PX1A 5CBSA 3RT8A 2YPNA 4QSCA 2DWIA 3KN7A 3C34A 2UVGA 3S9MC 2VHAA 1EU8A 1YCJA 1Q1KA 2HZKA 1PBQA 3MQ9A 2IA4A 2F8DA 4ZZAA 3W9WA 5CMCA 4QFOA 2AYSA 1B3EA 4YKJA 3K02A 1QVSA 1OVTA 5HM4B 4IO2A 4POXA 3UN6A 3HN0A 1SBPA 5J1DA 2H9BA 1MXYA 4LA9A 3PV0E 2QSXA 4IO7A 3OMBA 2REGA 1N7WA 1SW5A 4GXAA 4U1OA 1AOVA 2DXRA 2Z8EA 4IY5A 3A3UA 3T9XB 3U93A 1VR5A 2DVCA 5FTHA 5H8SA 3H6VA 2QL3A 1RYXA 5M2VA 3K6VA 1B5HA 1MXUA 3FVKA 3MBPA 4OZ9A 1MPCA 1MXZA 3VDFA 1NMUA 4O3CA 3DM0A 3KBRA 3OXNA 4H67A 4H5GA 4ZZEA 1N76A 1IXIA 3OD7A 1YTVA 2ZMBA 3MW0A 1SYHA 4DXUA 2OWTA 3A3CA 2RC7A 3IB1A 2XXQA 3S9LC 3IK6B 4Q0CA 4JSDA 1XS5A 3B7DA 3MPKA 4IO4A 4X1BA 3SERA 2DE4A 4C1UA 2NXOA 2V93A 4UACA 4NF6B 3VXBA 4EQ9A 4NF6A 2I49A 1SI0A 3EF7A 2XXRA 2QJEA 4P11A 2RF1A 2OZZA 2NUVA 3ZSFA 4P0IA 4JB7A 2RCAA 3PUZE 3FXUA 2QRYA 3ILTB 1JVYA 3I6VA 3MC2A 4LATA 3USDA 1LAHE 3DP6A 2A5TB 4O3AA 1JQFA 5I2NB 4F1YA 3C32A 5I2NA 3FGSA 1HSJA 2VOZA 1PB7A 3TEPA 4UA8A 3T96B 1SW4A 2H4IA 5B7DA 2XD2A 3T9VA 3UIFA 1D9VA 4QFPA 3BFUA 4F3SA 2B3BA 4PFYA 4DE8A 3DP4A 4KPTA 1MXXA 4EF1A 1B58A 4EF2A 4H8IA 4R2FA 1JETA 3KSXA 3G7WA 1QKBA 3M8UA 3A09A 4RK9A 4NEDA 3EN3A 1LAFE 3TMGA 4OEUA 3MZ1A 3C31A 1QULA 1NH8A 1JEVA 3VE1B 2PT2A 2LAOA 1DTZA 1B7UA 2ALUA 1SI1A 3LR1A 4QSEA 3H03A 3N5LA 1O63A 3CFLA 3FATA 4BDNA 2XXYA 4X48A 4R9FA 3S9NC 2RC8A 1M5DA 4ZDMA 1S9TA 4WEPA 4OVJA 2THIA 1FQEA 1M5BA 1BP5A 3PPQA 4QF9A 2Z8FA 4I62A 2DXYA 1MDP1 3IOUA 4BLAA 4OWDA 3MZ9A 3TUSA 3SEUA 2XXPA 4ZEDA 2HZLA 3OSQA 1M5FA 1B5IA 3R26A 1HSLA 3OOAA 1PBPA 3CIJA 3FIRA 2V3QA 3RQTA 1T0KA 3Q29A 4ZE8A 2FYIA 3N6UA 4KI0E 1LCTA 4FORA 1DPPA 3FV1A 1Y1ZA 3CR9A 4MH5A 1SVXB 2OWSA 3CSGA 1MQHA 5IKBA 1CE2A 1A8FA 1DOTA 3PMVA 3RNNA 1FTOA 1PDAA 1EH3A 4JWOA 3HPIA 4GRKA 4G8HA 1FQDA 3PPNA 4YICA 4EDPA 1Y3PA 4GXSB 5DEXB 4F1VA 3L6HA 1YPNA 1SW2A 1N7XA 2DE2A 1IIWA 4AQ4A 5DEXA 4EQ7A 1Z7NE 4KYSA 4BDOA 5FHOA 2M8CA 4ND9A 1FTMA 4ELQA 1Q35A 3KN8A 1ZU0A 3TTMA 4DLDA 3LSLA 1LSTA 1II5A 1LAXA 4ELRA 2ZXTA 5I84A 3ECRA 4F18A 3WAEA 5L9SA 2XXHA 1D3KA 4KD5A 5EHSA 3H6TA 1US5A 2QPQA 1Y20A 4ECFA 1A40A 3DLNA 4PE5B 3VVEA 4HTGA 2DQVA 1I69A 4YB6A 4BDQA 1FQBA 1MG1A 3VVFA 1B1XA 3TCGA 1M5CA 3DELB 2NVUB 2DOJA 4GFRA 2I58A 1QUKA 1JW4A 3U94A 3V89B 5TP9B 3TTRA 2XXTA 5EYFA 4LONB 2OBGA 4RNSA 2UVJA 1LFGA 1EZ9A 3OELA 1ZTYA 3QUJA 4OYVA 5TU0A 3IJXB 4TLMB 1TFAA 1GVCA 2F7CA 4ELPA 4M4GA 3BBRA 5B70A 1URSA 3TTKA 3GZGA 1EZOA 2XXWA 1N3XA 3M3LA 2Q2AA 4FJPA 5LOMA 4QSDA 3K0VA 5H8QB 4QFKA 3ZKKA 3MJNA 5H8QA 3IOTA 4YMBA 5KCJB 1WDNA 2DWJA 3ZKLA 4ZECA 4KCDA 4TLLB 5KCJA 1MRPA 1Y1MA 3IOVA 4GLIA 4FIMA 4ZEIA 3FZVA 4QHQA 2P2AA 4MF3A 1MQIA 4EXKA 4XIGQ 1A54A 2A5SA 3CG1A 5ICTA 1ZMGA 1CB6A 1S7YA 2YJPA 1XC1A 1D9YA 4YMAA 1WVJA 1MQDA 2I4CA 4Q8RA 1JEUA 4GOTA 1MPDA 2ZNSA 3H4ZA 5I56B 3RLFE 3E4RA 4F3BA 5I56A 3MVXA 1FCKA 4F39A 2ZYMA 4NWCA 4QFLA 2F7BA 1A7LA 3HSTA 3FVGA 3SESA 3M3KA 5FTIA 3CSBA 1NNKA 2I6EA 4TOZA 1I6AA 2FNCA 2OK2A 2XHDA 1NL5A 3HO7A 5H8FB 3W9VA 2OLBA 1B3FA 4LQ2A 5H8FA 2PVUA 3DP8A 4G8MA 3FJ7A 4FAJA 1R6ZA 3FJMA 3FXQA 4RXLA 2ABHA 1JVXA 4KHZE 2DE3A 2B3FA 4R75A 3U92A 2F97A 2OJTA 3IJOB 3OEKA 3Q26A 3PUXE 3U8QA 1B0LA 1D4NA 1B7ZA 3Q28A 4PFUA 1LB9A 1OIBA 3O6IA 1IUDA 3THIA 4YB5A 3PGFA 3C4MA 4H8JA 1H43A 3KZGA 1LFIA 1OLAA 4LZ5A 3KGCA 4ESXA 1WODA 3U72A 3PUWE 1LGBC 1Z7ME 3QXMA 4P0GA 3PPOA 3G3JA 2PBWA 2Y7KA 1RKMA 1TT1A 2B65A 1POTA 2Q89A 4U21A 1PEBA 1R9LA 1R1NA 2CMOA 4HCWA 5H8NB 2ZNTA 3TAJA 5F1QA 4KR5A 5H8NA 3HCQA 1AL3A 2F36A 1A99A 5HBCA 1AH5A 4H1XA 1Y3NA 4GQOA 1B0HA 3F11A 1B3GA 1XHYA 4FEBA 1TWYA 1OMPA 1PB9A 3KJ7A 3MVYA 4GD5A 3TELA 1GV8A 3OO9A 4RYAA 2V3TA 3KFMA 3V5AA 1DMBA 2UYEA 4GL8A 3LSXA 2X7PA 3QIMA 1P1UA 4C1TA 4YKKA 5CM6A 3K2DA 1PC3A 2P0SA 4LZ8A 2H98A 1GR2A 2XD3A 3O66A 2UVHA 3HHGA 1B51A 3C35A 1NNPA 1H45A 3JZJA 2UXAA 2XXIA 1MXVA 2AIXA 4U1ZA 4N13A 4R6YA 1MXWA 3R6UA 3EQ1A 1P1OA 4E0WA 2PMSA 1M5EA 1OLCA 4MFIA 3V8XB 4XKRA 3ILUB 4LZ7A 3RGYA 3O6GA 1MH3A 3O9PA 4Z0IA 5ITOA 3HHFA 3QAXA 1H44A 2OCUA 2PT1A 2ZYNA 1L5TA 2O69A 3TCHA 3RTFB 1P1NA 3QSLA 4OTEA 2DWAA 4OFLA 3UP9A 4ESWA 3IO6A 3PPRA 3UA8A 3MP1A 4X1DA 4HW8A 2D21A 1FW0A 1B40A 1URDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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