2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
2XXYA 2I6EA 2NUVA 3D4CA 2DE4A 2G93A 1B5HA 1WVJA 2O1LA 1B1HA 3C36A 5EHMA 2PBWA 1AIVA 2CZLA 2AL4A 1OQGA 4IO5A 4LQ5A 4ZE9A 4KHZE 5A5XB 3E9XA 4NWCA 1N3WA 3ZSFA 4G68A 2HEUA 3SEVA 3TPAA 2FNCA 1B52A 2X7PA 1JVXA 4TOZA 4ELPA 2B3FA 4I1DA 4XKRA 2RINA 3SDFA 4RJZA 1MPCA 4QSDA 3MP8A 3EQ1A 1MH4A 1US5A 3S9LC 2ALUA 3QUJA 2REGA 1Q1KA 3A3CA 4PFWA 1IXIA 3H6VA 4Q5TA 5KDTA 2O84X 1B0LA 2I58A 3MZ9A 4XKPA 2H9BA 1B4HA 1TWYA 1N3XA 2ZNSA 3TYHA 1PEBA 2RCBA 3S2VA 5H8FB 1MQDA 3KOSA 1S50A 5FHOA 3G7WA 3G3IA 1ATGA 5DVJA 4FJPA 4G77A 4FATA 2V3TA 2HAVA 2PT1A 3LSLA 2I3VA 1JW4A 4OWDA 3K6WA 2DQVA 3C33A 4C1UA 3LSFB 2OLBA 3T22A 3DLNA 5ISUA 1XOCA 3CR9A 4DDDA 2YPNA 3O6GA 1BIYA 5TPAB 3HV1A 1QKAA 1MXZA 4R9FA 4FE8A 4X1DA 1LAFE 2QS2A 3PMXA 2I3WA 3N94A 2Z8FA 3KZGA 3RNNA 1MS7A 1SW5A 1XC1A 3Q29A 2I4CA 4LQ2A 3GBBA 3QSLA 3UN6A 1B7HA 1URSA 2HCAA 4YB6A 3MVYA 1QUKA 3O2AA 4LATA 4G68C 1B5JA 3IOUA 1SDXA 2VD3A 3O9PA 3K2DA 4IB2A 3GXAA 4E0WA 4OZ9A 4YKKA 3SEUA 5L9OA 5CM6A 2O68A 2F36A 4DCYA 1LFHA 1ELJA 4BLAA 2F5XA 4ZZAA 1A8FA 3FV1A 4DXUA 3SESA 1A54A 3TTMA 1MQJA 1YPNA 2O69A 5DVFA 4EXLA 4O3BA 3C32A 3LR1A 1LFGA 2I49A 3O29A 4AB5A 1IXHA 2O7IA 1B46A 1SBPA 3C9HA 3H4ZA 3K6VA 3M8UA 3PPRA 3TTRA 4RPOA 3UIFA 4ZECA 3IO4A 4M1VA 3PPOA 2RC8A 1WDNA 4OYVA 4KD5A 5FHMA 1DTGA 3CRBA 2HFBA 2AIXA 2H99A 4KI0E 4PP0A 4TQUQ 2PT2A 3V89B 2XXRA 4ZEKA 3OO7A 3FXUA 2W7YA 2Y7WA 1SVXB 2P1SA 3H6WA 3OMBA 1MY4A 1FQBA 3K1MA 2E1SA 3RPWA 1F9BA 3ILTB 3C35A 2ESNA 2QS3A 1YCJA 5I59B 2QJEA 4JWXA 1MXVA 4EQBA 1EZPA 3SEXA 4U22A 4H8IA 3I3VA 4R9GA 4G8NA 2R71A 3FZVA 3QAXA 4UA8A 1FW0A 1ZU0A 1IXCA 3THIA 4GL8A 4OHNA 1SI0A 4ZEDA 1Y4CA 3TFLA 3VE1B 4BDMA 4OFOA 3TTKA 1MXXA 4BDQA 5I58A 2Q2CA 1UTBA 5IKBA 1SD3A 5H8QA 3K02A 2PMSA 2I48A 2DS9A 4Z7EA 2QMXA 4TLMB 2I0BA 4JB7A 3U92A 5AA1A 2GRVA 3GBAA 4R2FA 1LAGE 2OWTA 4LP2B 2DVZA 1A40A 1NH7A 4IO4A 3RTWB 5FTHA 2XXHA 3K1NA 4NTLA 4WEDA 4I8CA 1MH3A 1LB8A 3CFZA 5H8FA 3N6UA 4R72A 1MQHA 4G68B 2X7QA 2QMWA 4POXA 1P1QA 4ZZEA 2VOZA 5TU0A 3FVNA 3ILUB 1PB8A 1LBCA 3FXQA 2Q2AA 2F8DA 2QL3A 2VP1A 4ZEBA 2GFEA 4EDPA 4KYEA 2H4IA 1SW4A 1NMUA 3ECRA 5K2YA 3PD8A 1N04A 1OMPA 3B7DA 1NNPA 2QRYA 1URGA 2IEEA 3TQLA 4KYSA 5JTYA 3O6IA 3VLVA 3IX1A 1XVYA 3ZS6A 4GXAA 3FATA 4HCWA 1USYH 4I62A 4F39A 4DIGA 2YJPA 4AB6A 3MVZA 4NWDA 3SEYA 2V84A 5K2XA 5JEIA 4LZ5A 2F34A 4F2QA 3HSTA 3FGSA 3V8XB 4IGRA 5FTIA 3PU5A 3FJMA 5CC2A 4HCYA 4OENA 1VE4A 2XX9A 1DTZA 3DP8A 1AOVA 3DP4A 4AQ4A 4PFUA 1O64A 4YB5A 1TXFA 3VVDA 3KJTA 4NEDA 2Y7IA 3R26A 3IR1A 2D3IA 4ZEFA 2FA7A 4YAHX 5L9SA 1IEJA 3LBSA 4RXLA 2ONKE 2G29A 1ZMGA 3TAJA 3V5AA 1JW5A 3WAEA 1MDP1 2ZYKA 3U8QA 4RK9A 1I6BA 4F1YA 2Z8EA 4LZ7A 3P7IA 1OVBA 1SYHA 3TCHA 2ONSA 3O6HA 4U4XA 1UQWA 2QS4A 3U94A 3VXCA 2XXVA 1XS5A 3UP9A 4H1XA 1IUDA 1EH3A 4GQOA 1CE2A 3TZAA 2NOOA 5EYFA 3IOTA 3QK6A 1AMFA 1N7XA 3TCGA 4ECFA 4I9DA 3Q26A 4OETA 4YKJA 3G3HA 3MC2A 4LVQA 2E0SA 5CMKA 4YKPA 3E4RA 3K4UA 3HO7A 4IO2A 2F97A 2ZYOA 3KN3A 1MY0A 1PB9A 1TT1A 3OXNA 4XKNA 4P11A 4GXSB 4R2BA 5CI5A 5DTBA 3O28A 3OELA 5IAIA 1HSJA 1MPBA 3TTLA 1ANFA 5B7DA 2XXIA 2VGQA 4OERA 4MF3A 3MPLA 4YICA 4F3BA 3CIJA 3CFLA 3PUYE 3EHSA 1B5IA 5KZTA 1OQHA 2DE2A 1LAXA 1NNFA 1QUIA 3F11A 4U2RA 5I58B 1MY2A 1UTBB 1MPDA 5H8QB 4BDLA 3PV0E 2R9JA 2DWIA 1B51A 3SERA 5EHSA 1DSNA 3MAMA 2O1MA 1QULA 2AL5A 3IJXB 3BBRA 1BP5A 2Y7KA 4PETA 4F19A 4R73A 1ZIUA 1SW2A 1SQYA 3CSGA 4YU0A 3PGFA 5CMCA 2VHAA 1QW0A 5ICTA 1HSEA 4PFTA 3IB0A 4UACA 1MDQA 1Y1MA 3G3GA 3JV9A 1N76A 2H5YA 3U72A 3FJ7A 1RKMA 2ZNUA 4FECA 3FVKA 4G8MA 1B40A 3TUSA 2UXAA 1LSTA 2O51A 3GZGA 1R1NA 3IL1B 3G3KA 4U1OA 1MQGA 4Q0CA 5JTYB 3S9NC 4EF1A 4RNSA 5I2KB 4ESXA 4XKQA 4GL0A 3KJ7A 1MXWA 4POWA 1OVTA 3QUFA 4QSEA 1DPEA 3JZJA 3KSXA 5CBRA 5AE4A 4JSOA 1MRPA 4LZ8A 2OWSA 3CG1A 4X48A 1SYIA 3IK6B 4XTCQ 4MLVA 3RT8A 1US4A 3PPPA 1FTLA 4PFYA 3RN8A 1QJMA 4KCCA 3T93B 5L8DA 3VVFA 1P1NA 3B6TA 3K0VA 5AA3A 4RA1A 1TFDA 4OVJA 1MG1A 1VSOA 4H5GA 3FVOA 2DE3A 1QUJA 3MJNA 4F3PA 4ZDMA 3H06B 3MWBA 4KR5A 1MXYA 4LUBA 5J1DA 5JK4A 2V3UA 4ESWA 2A5SA 3LUYA 1A8EA 3MVXA 4NF6A 3KN8A 4GF8A 4L17A 3T96B 5H8NB 1NNTA 3VXBA 4Q30B 3BFUA 2DYXA 4Z0IA 4GRKA 1XT8A 2XX8A 4F3SA 1ZBMA 3M3KA 3MZBA 1UTHA 1Y4TA 2NWJA 3K6XA 2ZNTA 1LGBC 3U93A 3IB1A 3TEPA 4Q8RA 1MM6A 3RY3A 3O66A 1Z7ME 1M5EA 4GD5A 1B3GA 3RLFE 2HXWA 3IOVA 1BTJA 5TP9A 1ZTYA 2VD2A 3CVGA 1FQFA 2I0CA 4P0IA 5DVIA 3EF7A 1D9VA 2DXRA 1TFAA 4H6DA 3SKPA 1Y9UA 2ZMBA 1D4NA 4X9TA 1UIVA 3OO8A 4O3CA 3K00A 1H76A 4WXJA 1S7YA 4RK2A 1GTKA 3QYTA 3H3GA 3RGYA 4GWOA 1R9QA 3EHTA 5KCJA 2KLFA 3K6UA 3KEIA 1I69A 3ZKKA 1M5DA 3H6TA 2PVUA 3W9WA 5CBSA 1BLFA 3B6WA 4XIGQ 3MP1A 1JNFA 2XX7A 1DPPA 1P99A 4OEVA 3TKDA 4WKMA 3FXRA 2REJA 1B3LA 1XHYA 3UA8A 2WKYA 1NNKA 3BFTA 2UYFA 4FEBA 3ZKLA 5CMBA 1D3KA 1FTKA 4OQOA 2A5TA 3IAZA 5I2KA 3IB2A 1P1WA 4BDRA 1IIWA 2UVHA 1JVYA 4QRZA 4EQ7A 3VFJA 4ND9A 4H5FA 2HAUA 3MZ1A 3CFXA 2RC7A 2XXWA 3OD7A 2X26A 3AXFA 1N0TA 5BUUA 1O7TA 1LB9A 3ONMA 5ELVA 4KCDA 3VLWA 3HCQA 2IA4A 3RT6B 3FASA 4KYDA 2D5WA 4DXBA 1YTVA 4ELRA 1M5BA 2UYEA 4OEUA 1T0KA 1MM7A 4MLQA 4U4SA 2XXPA 2ZYNA 4KQPA 2NVUB 1MQIA 4R75A 5AA2B 3A3UA 4GFRA 4DXCA 3PMVA 4DLDA 1D9YA 4OXVA 3D4GA 2F7CA 3B6QA 1LLSA 4IO3A 3V83A 4QF9A 4OFJA 2BJJX 4HS7A 4R6YA 3WAFA 3TTNA 2OZZA 4DZ1A 1IQ7A 1B1XA 4K3FA 1A7LA 3HHGA 3C31A 4GLIA 1UIUA 4YMAA 4QSCA 3MPKA 1GV8A 3DELB 1B6HA 3N5LA 4G8HA 1OIBA 4RY1A 4PE5B 3G3FA 4YB7A 3L6GA 2PX1A 1B58A 4U1ZA 3KBRA 3O97A 5H8NA 1DOTA 1N84A 4F18A 1GR2A 4NF8A 4JWYA 2XHDA 4C1TA 1B7ZA 3OO6A 3S4UA 4QFLA 2F7AA 1Y3NA 1H3DA 2CMOA 1EU8A 2XD3A 3G3JA 3USDA 3IJOB 4OTEA 4YKIA 5H8HA 1B3HA 4PQJA 5I57A 4NF5A 5AA4A 4NF6B 1J1NA 2Y84A 4C0RA 3IORA 2RCAA 3OSQA 3H6UA 3A09A 5I2NA 2V25A 3TCFA 3KOTA 5F7VA 2RF1A 1USYE 1UTHB 2FYIA 4WEPA 2R6GE 4KPTA 3MBPA 1S9TA 4IO6A 3VLUA 1GGGA 1JQFA 2GHAA 2I4BA 3LC8A 2Z23A 3VVEA 4H65A 3CI8A 2F7BA 3LSWA 3PUVE 3TQWA 3PPQA 1B3EA 3IOWA 5B70A 5TP9B 2Z22A 1PBPA 4YMBA 1POTA 3PPNA 4JXIA 4FORA 1I6QA 3OO9A 4F31B 4FIMA 3CG3A 1OLAA 3CSBA 3S9MC 1POY1 3KGCA 2ABHA 2DXYA 1Y1ZA 1RYOA 4N07A 2UVIA 3KFMA 1WODA 5KCJB 3PMWA 1VFDA 1IXGA 2QS1A 2Q89A 4LONB 3TMGA 5AA2D 2V3QA 4QFKA 1MY1A 1LCFA 4H0WA 3U1OA 4QHQA 5HPQA 4M4GA 2Y7RA 4NE4A 1B0HA 1AH5A 1IZ1A 2PYYA 3PD9A 1EZOA 4R6KA 2DP8A 3H03A 3SEWA 1FTOA 2A5TB 1LFIA 3C4MA 2NXOA 1H44A 3L6HA 2QSXA 1SW1A 1JEVA 5AA2A 3FD3A 4N6PA 1H45A 3N6TA 2DVCA 3I6VA 1GVCA 1BKAA 3GLBA 4NF4A 2F78A 2YLNA 4JSDA 1PBQA 2XXXA 1L5TA 2Q8JA 1MXUA 1HSLA 1JW1A 5L9MA 3TDJA 3EN3A 4EQ9A 1ZJLA 4ONYA 5M2VA 2DOJA 4RYAA 4JWOA 1VR5A 2OK2A 4IY5A 1R9LA 4FEDA 4DE8A 1B2HA 2M8CA 3PUWE 3T9HB 2GHBA 2V93A 3FJGA 1LCTA 1B7UA 4IO7A 2H25A 2ZYMA 3UORA 1XVXA 5DT6A 4HTGA 2RC9A 2H98A 1ZLQA 3HN0A 3OSRA 2XXQA 3HHFA 4MH5A 3IO6A 1FQEA 4ZS9A 2F6GA 1DMBA 4U21A 2DWHA 2B65A 1NH8A 3DM0A 4IY6A 2THIA 4R6HA 2DSFA 2Q9TA 4THIA 3E3KA 4NF8B 3RUMA 3RQTA 2F35A 5HBCA 4QFNA 4EF2A 3PUXE 3EHUA 4QFOA 2ANJA 4H67A 5I56B 5H8HB 4GIZA 5CRYA 2XXUA 5ITOA 3SETA 5A5XA 5DEXB 5CMMA 3C34A 5I57B 4NF5B 1OLCA 5HM4B 4NMYA 2OBGA 5AA4B 1JEUA 1P1OA 1NL5A 4ELOA 3FIRA 1Z7NE 4GOTA 4P0GA 4TLLB 4EXKA 5BWJA 4OFLA 4ZEIA 3UGWA 4IGTA 2XD2A 1N7WA 1R6ZA 5H8SA 4F29A 3W15C 3OEMA 5I2NB 4F22A 3OEKA 3RTFB 3MVWA 3W9VA 3TELA 2UVGA 1YAEA 5ITPA 4H8JA 3MUQA 1FQAA 4O3AA 3Q28A 3ODBA 5FHNA 1AL3A 1M5CA 4EUOA 1B3FA 1Y3QA 4BDOA 4E0XA 1M5FA 1KWHA 3T9UA 3VDFA 1Q35A 4KFQA 1I6AA 3BKIB 3OENA 1PB7A 4F1UA 2O7UA 1QVSA 3QIMA 4F3GA 5LOMA 3Q25A 4OESA 3K01A 4GVOA 3T9VA 1PC3A 5DYHA 3FV2A 3M3LA 3T9XB 1LBBA 4F2OA 2D21A 5TPAA 3HPIA 5KDTB 4G2ZA 3KSJA 2DWAA 3N26A 2ONRA 3Q27A 2Z8DA 3PUZE 3MP6A 1CB6A 2AYSA 1B05A 4DCXA 1ZKBA 4HW8A 2QPQA 1IITA 4MFIA 5F1QA 4QFPA 3OOAA 4MBPA 1FTJA 4FAJA 3T66A 2OJTA 1FQDA 4ELQA 1II5A 1EZ9A 3MW0A 2HZLA 4JBZA 1NKXA 4NF4B 1JETA 4XXUA 5ICQA 3VV5A 3R6UA 3KN7A 3H7MA 2XXTA 3QXMA 1A99A 4YZZA 4R74A 3M3FA 1VFEA 2F6PA 3UK4A 1NFTA 2UVJA 2HZKA 3I5OA 1B32A 2P0SA 4X1BA 3S9EA 4RPNA 1FCKA 4OMBA 4BDNA 1URDA 3E13X 3TODA 3R7XA 4N13A 1FQCA 2P2AA 1Y20A 2GH9A 1B9JA 3FVGA 4U23A 5I59A 1PDAA 2O6AA 1A55A 1MY3A 1H43A 4ZE8A 2ZXTA 5I56A 1B4ZA 2Y7PA 5DEXA 3FUZA 3EPEA 3MQ9A 2DWJA 1RYXA 5I84A 1LAHE 1FTMA 2LAOA 4G4PA 3JYRA 2Q88A 4LA9A 4ISUA 1P1UA 2B3BA 3K1PA 1SI1A 4JDFA 2RKMA 3LSXA 1Y3PA 1O63A 3DP6A 2OCUA 4F1VA 2HQ0A 3KG2A 1QKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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