2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
3C9HA 4U1OA 2Q9TA 5DEXB 4OVJA 1B7ZA 3EHSA 3V89B 2H4IA 3IB2A 4G68B 2D5WA 4F18A 2H5YA 4EQ7A 3M3FA 1KWHA 4R9FA 2Q88A 3KN8A 1P99A 1H76A 1XHYA 1GR2A 1RKMA 2YJPA 4H8IA 3IOWA 4KYDA 1ATGA 5CMMA 1P1OA 4ZZAA 5DVIA 3SEWA 5ELVA 4IGRA 1B52A 3HHGA 4ZEKA 3KFMA 1SD3A 1NKXA 5H8QB 4LZ8A 1MPCA 5IAIA 3KG2A 4BDOA 4G8NA 4DIGA 1IXIA 4IO2A 3GXAA 1Y20A 2VP1A 4NEDA 3K00A 1Y4CA 3DLNA 3RPWA 4BDRA 3MZ9A 2I4CA 3OO7A 3W9WA 3B6QA 4H8JA 1A40A 1I6AA 5TPAB 2HCAA 1UTBA 5AA4A 4XKNA 3D4GA 4P0IA 3MW0A 1NL5A 1UIVA 4FAJA 3OO6A 3HHFA 5LOMA 3T93B 2H9BA 1DPPA 2DQVA 2F5XA 1OVTA 2ZNUA 1PBQA 3VXCA 2F7BA 2O7UA 3FJ7A 1M5FA 3FV2A 1URGA 1YAEA 3TZAA 1SI0A 4X48A 5H8FB 5DYHA 4R6YA 1OLAA 5KCJB 5I2KB 1AMFA 4RK9A 1NNKA 1MPBA 4OFOA 3MQ9A 1MQJA 3FVNA 2R6GE 3OXNA 2OWSA 2D3IA 1Q35A 3FXQA 2ZYMA 3QK6A 2V3UA 4IO3A 3M3LA 3E9XA 4H67A 3GLBA 2IEEA 3W15C 3C31A 5FHOA 3ZKKA 2HFBA 3E4RA 5ITOA 4NF4A 1URDA 1R1NA 2Z8FA 1MPDA 2WKYA 1D9YA 3L6HA 2B65A 3MUQA 1R9LA 3O9PA 2W7YA 3HV1A 2AYSA 1TFAA 4OEVA 3C4MA 3TKDA 1NNFA 2A5TA 4QSCA 5I59B 4H65A 1FQEA 3IO6A 2Y7PA 4LA9A 1MQGA 3I3VA 4ESXA 4F3GA 4IY5A 2RKMA 3P7IA 5I58A 4GFRA 1B58A 5H8NB 3PMVA 4DXUA 1I6BA 2O68A 2VD2A 4JSDA 4G8HA 1JEUA 4I62A 3G3FA 3H6VA 1IIWA 2P1SA 1MXYA 1QUJA 4TLLB 1Y9UA 4BDLA 1A8EA 3TELA 1UTBB 2V25A 2XD3A 4Q0CA 3IORA 4GWOA 1XVYA 1IEJA 1Y3NA 4KCCA 1ZIUA 3Q26A 1B0LA 3JV9A 3MPLA 4MH5A 4U21A 4ONYA 5ITPA 3TTLA 2RCBA 3IK6B 4M1VA 1NMUA 3EN3A 3I5OA 1H45A 5AA1A 2DWIA 1LFIA 1Y1MA 3MPKA 3OMBA 3T96B 4U4SA 4ELRA 3ONMA 1B3LA 5DVFA 3PUWE 4HCYA 3N26A 4UA8A 4ZEIA 2ANJA 3K6UA 1OVBA 2NWJA 3H6TA 3B6TA 3IOTA 3PUVE 3TDJA 3SEXA 2OCUA 3TCGA 4F31B 2OBGA 1VE4A 1LB9A 2DXYA 2PYYA 3FZVA 5CBSA 4R75A 4EUOA 5I84A 4PFWA 1JW1A 3VE1B 3H03A 2NVUB 3VVFA 5CI5A 1MS7A 3K1MA 2QMWA 5EYFA 3IL1B 2Z8DA 2DVZA 2HXWA 1P1UA 4G68C 4HS7A 1B0HA 4EQ9A 2DE3A 1N7WA 1HSEA 3JYRA 4DXCA 1JQFA 3LUYA 4K3FA 2RC9A 4F2OA 1B51A 2Q89A 4PETA 4WEDA 2RF1A 4FIMA 4R74A 1FQDA 1LSTA 4WXJA 5DEXA 2QL3A 3HSTA 4H0WA 3UK4A 4BDQA 5K2YA 2LAOA 3O29A 4G68A 3S9EA 1OMPA 3QIMA 3HCQA 4U4XA 1B2HA 4QSDA 3Q29A 3PU5A 5CBRA 3B6WA 5CC2A 3TAJA 1BP5A 4X1BA 3S9LC 4H6DA 4QHQA 3VVEA 5H8QA 3FASA 3O66A 2H99A 4FORA 2Q2AA 5I2NB 3TQLA 2F35A 3TPAA 4EF1A 1ELJA 1PB9A 4ELPA 2XD2A 1N84A 3CFXA 4LZ5A 1B5IA 2OK2A 1LB8A 3H4ZA 3D4CA 5HPQA 3PPRA 4JDFA 2XXTA 5JTYB 3N94A 1MQHA 1N7XA 2GFEA 2V3QA 2OWTA 4YKJA 1S50A 4ZE9A 4P0GA 1BIYA 1SQYA 3O6IA 3SKPA 1SW4A 3FJGA 4ELQA 1N3WA 1LBBA 3K6XA 1US4A 3G3IA 5H8FA 1TFDA 4F3SA 1VFDA 4NF6B 1LAHE 3SDFA 2V93A 4JWXA 3TTKA 5ICQA 5KCJA 5I2KA 1USYH 3CG3A 3SETA 3G7WA 3U72A 2HEUA 3T9HB 3PD8A 2VD3A 4R2BA 3CFZA 3A3UA 4ZEDA 3FATA 4R73A 4XIGQ 4ZDMA 4EDPA 3IJOB 3OOAA 3PPOA 4DXBA 4YB5A 1D4NA 1LCTA 3FJMA 1FTOA 1FCKA 4ZEBA 3UGWA 1Z7ME 3IOVA 3Q27A 1A8FA 2HZKA 2UXAA 4WKMA 4F1VA 3RT6B 4G77A 3SEVA 3K0VA 3TQWA 1B5JA 3PUXE 3U93A 2YLNA 5L9MA 3K6WA 3TCFA 3HPIA 1FW0A 4H5GA 1UIUA 2FA7A 5I59A 1ZU0A 2XXHA 1OQGA 3R26A 3SEUA 4Z7EA 1S9TA 3QUJA 2I0BA 2R71A 1IXHA 4O3CA 3DM0A 3RQTA 4RPOA 1URSA 1ZMGA 3UIFA 3LBSA 5I57B 4E0XA 4N6PA 3BFTA 2I48A 5H8NA 1JVXA 4KQPA 5EHSA 1FTKA 1QKBA 1DSNA 4GRKA 4U22A 4F39A 4OMBA 3KSJA 2F6GA 3N6UA 4GXSB 3KBRA 1GGGA 4N13A 3MVWA 2XXUA 4GIZA 4F3PA 2RC7A 3C32A 1MQDA 3T9XB 3O28A 4RNSA 3T66A 1PDAA 4KCDA 2XXRA 4OHNA 1SDXA 4LATA 3V8XB 1BTJA 4QFNA 5KDTB 1BKAA 3MZ1A 4ISUA 4RK2A 4AB5A 4AQ4A 3TTMA 5FTHA 1CB6A 3ILTB 5ICTA 2PT1A 1WDNA 3H7MA 1B1XA 2UVGA 2Z22A 2YPNA 1FTLA 4YKIA 1OQHA 4OEUA 3OEKA 2DP8A 1YPNA 2O6AA 3UN6A 2GH9A 1LFHA 2FNCA 1D9VA 2F8DA 4KYEA 3R7XA 3S2VA 4Q30B 4OFLA 3DP8A 3C34A 3OELA 5B7DA 1SYIA 1Y1ZA 4FE8A 5TU0A 4GL0A 1LBCA 4Q8RA 2PT2A 1FTMA 2UVIA 4MLQA 2VHAA 3U8QA 2V3TA 3U92A 2DOJA 2V84A 4MBPA 2GHAA 1FTJA 3PPQA 3OSQA 3R6UA 3CRBA 4IGTA 5JEIA 1AL3A 3WAEA 4DLDA 2ZYKA 4TLMB 3OENA 1M5DA 3IOUA 1USYE 2FYIA 4EQBA 1SW1A 3B7DA 4QFPA 2XXPA 1B9JA 4QFKA 1Y4TA 2QS1A 3H06B 3A3CA 1AIVA 1B7UA 4IB2A 2XX8A 3RUMA 2X26A 2QRYA 5H8HB 3MVZA 1QUKA 4RPNA 2DE4A 5FHNA 2Y7WA 5JK4A 2UVJA 2H98A 2Q8JA 2G93A 3E13X 4NE4A 4ECFA 1EZ9A 3CFLA 1NH8A 3MJNA 3ZKLA 4L17A 4R6HA 4IO5A 3AXFA 1MQIA 2XXQA 1P1WA 2IA4A 2E1SA 4JWYA 4EF2A 4NWCA 4YMBA 4GXAA 5K2XA 1A54A 3MZBA 4YB6A 2F36A 5I2NA 1H3DA 5BUUA 3FD3A 3C33A 4NF5B 3WAFA 2VOZA 4TQUQ 1M5BA 3G3GA 2DWHA 2XXVA 1MXUA 3FXRA 4NTLA 1DOTA 2P2AA 3S9NC 1JVYA 3QYTA 2F78A 4POXA 3H6UA 1MY2A 5FHMA 5JTYA 2M8CA 2I3VA 4Z0IA 1TXFA 3KZGA 3CG1A 4MLVA 4O3AA 2PMSA 4GLIA 1QUIA 1B3EA 3KJTA 1R6ZA 2ABHA 1SW5A 4NF6A 4PP0A 1RYXA 3PUZE 4IO4A 4XKRA 1B05A 4RJZA 2QS3A 1II5A 3U1OA 4KHZE 1EH3A 5CMBA 3TODA 2UYFA 3LSXA 4GVOA 1XOCA 4YZZA 3IR1A 1PB7A 5CM6A 4GOTA 2REJA 5KZTA 3KN7A 1XT8A 3QSLA 3PD9A 2I6EA 3HN0A 2F34A 4NF8B 5J1DA 3OO9A 1JW5A 1Y3QA 4QSEA 4IO6A 2OLBA 4PE5B 2DVCA 4OENA 4ZE8A 4YB7A 1IUDA 1LAGE 1LFGA 3OSRA 3GBBA 4BDNA 3V83A 2A5SA 3L6GA 2Z23A 3MVXA 2I49A 3K02A 4XTCQ 5L9OA 3G3KA 1Q1KA 1A55A 2PVUA 1I69A 4OTEA 3ILUB 3KOSA 3TMGA 3VDFA 2QMXA 2ZYNA 2ESNA 1MXXA 1YCJA 1JETA 5I57A 5M2VA 1Z7NE 1MDQA 3MVYA 4YMAA 1P1QA 1HSLA 1D3KA 4IO7A 4YU0A 4KFQA 3SEYA 2XHDA 5FTIA 3TTNA 3VLWA 4AB6A 3QUFA 4PQJA 5AE4A 1B4ZA 1VR5A 3T9VA 2HQ0A 3IAZA 5CMKA 4KI0E 2ALUA 3CVGA 4R9GA 3Q28A 3F11A 4LVQA 3RGYA 1MY3A 3SERA 1NNPA 4F3BA 5IKBA 1B3FA 5KDTA 3EQ1A 2PBWA 4FJPA 4N07A 1MY4A 2QJEA 1XVXA 1IQ7A 5B70A 2Z8EA 4FEBA 2B3FA 1B32A 4X9TA 1MY1A 3TCHA 2ONSA 1B3GA 3THIA 2XX9A 3LSFB 1EZOA 1N04A 2AIXA 4U2RA 3PV0E 1N76A 3CSGA 1ZKBA 4F29A 3EF7A 1B5HA 2Y84A 1N3XA 2F97A 1MXWA 2I0CA 3K1NA 3DELB 2RCAA 4LUBA 4Q5TA 2O1MA 4HW8A 5F1QA 4MF3A 3OEMA 4JB7A 3FVOA 4F1UA 4F2QA 2P0SA 3RNNA 3Q25A 2PX1A 4TOZA 1QKAA 1B1HA 1LCFA 3VXBA 1FQAA 1IXCA 1PBPA 3K2DA 1SW2A 4HTGA 4YKPA 3BFUA 4BDMA 4H1XA 2ZYOA 4LQ2A 2F7CA 1SI1A 1T0KA 1UTHB 2THIA 3USDA 1POTA 2Q2CA 4OESA 3FGSA 5AA2A 3U94A 4OZ9A 4RA1A 4FEDA 4QFOA 1Y3PA 4WEPA 1B3HA 1B6HA 5TP9B 1WVJA 5I56A 3LSWA 2HAVA 1ZLQA 3GBAA 4KR5A 1OIBA 2DSFA 5H8HA 2BJJX 3BKIB 4M4GA 2QSXA 4C1UA 3MP8A 3MAMA 3CIJA 3PUYE 2DYXA 4U1ZA 3PGFA 1ZJLA 4GD5A 3TEPA 1YTVA 3FVKA 1B4HA 3FVGA 3PMXA 4UACA 4LZ7A 3TFLA 1AOVA 3DP4A 3KN3A 3RT8A 4PFTA 3RLFE 3A09A 1MM7A 3S4UA 4XXUA 1B40A 3O2AA 3CSBA 3K4UA 3W9VA 1FQFA 1TWYA 2AL5A 1UQWA 3MWBA 1POY1 2UVHA 4NF5A 5BWJA 3N6TA 4ZS9A 4I1DA 1IXGA 1IZ1A 5A5XA 1GTKA 2Y7RA 1B46A 3IX1A 4DCXA 2QS2A 4OFJA 3IJXB 3BBRA 3VV5A 2X7QA 1PEBA 3KEIA 4JBZA 2NUVA 3VLVA 2REGA 3C36A 1LGBC 2OJTA 2F7AA 5DTBA 3EHUA 1NH7A 1B7HA 4ND9A 4P11A 4E0WA 1FQBA 3EHTA 3K01A 3FIRA 4DE8A 1QW0A 2ZNTA 1OLCA 4JWOA 4FECA 2QPQA 1EZPA 1DMBA 4KD5A 3RTFB 4ZECA 2DWJA 1MG1A 3GZGA 5H8SA 3TTRA 3RN8A 3MP6A 2O69A 4U23A 1FQCA 4OWDA 1J1NA 3OD7A 2ZNSA 4ZEFA 3MBPA 1QJMA 1O7TA 5AA2B 4XKPA 4NF8A 5HBCA 5L8DA 3O6HA 3JZJA 4H5FA 4EXLA 3V5AA 1RYOA 5I56B 4ZZEA 2CZLA 3PMWA 3VFJA 3G3HA 5F7VA 4F22A 4R2FA 3I6VA 1XS5A 3FV1A 4YKKA 3KGCA 4RY1A 3RTWB 1H43A 1MXZA 4GQOA 2I58A 2ONRA 3E3KA 3UP9A 2VGQA 4LQ5A 4C0RA 5AA4B 1TT1A 2O84X 1PC3A 4POWA 4QFLA 3K1PA 3LR1A 2ZMBA 3DP6A 4FATA 4R6KA 2GRVA 2Y7KA 1JW4A 4YICA 1O64A 3C35A 4G8MA 4X1DA 4JXIA 5A5XB 3VVDA 4O3BA 1N0TA 1M5EA 4R72A 4I8CA 4DZ1A 1DTGA 2GHBA 1QULA 2DWAA 3S9MC 1M5CA 1R9QA 2DE2A 4IY6A 1IITA 1HSJA 5HM4B 4OXVA 1S7YA 1SVXB 3IB0A 1BLFA 3O6GA 4KPTA 1JNFA 2ONKE 4NMYA 1MY0A 5AA2D 1VFEA 5DT6A 5CRYA 2KLFA 1PB8A 3ZSFA 1QVSA 2Y7IA 2O51A 1GVCA 4NF4B 4GF8A 2NXOA 2D21A 1AH5A 3M3KA 4F1YA 3MC2A 1SBPA 1I6QA 2E0SA 4GL8A 2A5TB 4JSOA 4RYAA 3LC8A 3G3JA 2DS9A 5ISUA 2O7IA 4C1TA 2DXRA 1L5TA 3H3GA 5I58B 3LSLA 1CE2A 1LAFE 4F19A 2I3WA 4BLAA 3O97A 4I9DA 2H25A 3ODBA 4ELOA 3KSXA 1DTZA 1A7LA 2HAUA 4EXKA 1MXVA 3MP1A 3M8UA 1UTHA 5EHMA 3K6VA 4THIA 2NOOA 2XXYA 3ECRA 3H6WA 2I4BA 4OERA 3CR9A 2RINA 5TP9A 1VSOA 2O1LA 1LLSA 3HO7A 3FUZA 2RC8A 4MFIA 1MH3A 4QRZA 5L9SA 5DVJA 4NWDA 1MDP1 2AL4A 3SESA 2CMOA 3T9UA 4G4PA 4QF9A 1JEVA 2R9JA 3CI8A 3PPPA 1LAXA 2G29A 3TYHA 3RY3A 1XC1A 4XKQA 1US5A 3ZS6A 4LONB 1A99A 2X7PA 1GV8A 1F9BA 1WODA 1MH4A 2XXWA 3TUSA 5TPAA 1NNTA 3FXUA 4LP2B 1MRPA 4OYVA 3EPEA 3IB1A 2ZXTA 4KYSA 1MM6A 4DCYA 3OO8A 4RXLA 2F6PA 3N5LA 1ZBMA 3UORA 1H44A 1SYHA 4PFUA 4OQOA 4HCWA 2XX7A 4DDDA 4PFYA 3IO4A 2XXIA 2B3BA 3KOTA 1ZTYA 3QXMA 5CMCA 2HZLA 3QAXA 3VLUA 4OETA 1EU8A 1NFTA 3UA8A 1ANFA 1P1NA 2XXXA 3T22A 2OZZA 5AA3A 3KJ7A 4G2ZA 1O63A 2QS4A 4YAHX 4ESWA 2UYEA 1DPEA 3PPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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