2F36A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with glutamate at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A02
4NF4B 4YICA 1IXGA 2IEEA 1SW1A 2NUVA 1MY2A 4GL0A 2HAUA 2PVUA 1WDNA 3MP1A 1N3XA 3JZJA 1XC1A 4R6HA 4LP2B 4ZEBA 3GZGA 1UIVA 2V25A 4EF1A 1Z7NE 1LCTA 3T66A 3DP8A 3U93A 2DWIA 3IJOB 1N04A 4R72A 1DPPA 4XKNA 3IO4A 3IOVA 1NL5A 3OXNA 3S9MC 1FQDA 4R9FA 4GF8A 1PB7A 3TTNA 1JEVA 3KJTA 1B7ZA 1S7YA 3DM0A 3U1OA 2G29A 3H4ZA 5L8DA 2UVIA 2A5SA 1A8FA 3BFTA 1H45A 1BTJA 4MBPA 4X1BA 4DXCA 4ZEFA 4LZ8A 2DWJA 3RGYA 5H8HB 3FXQA 2DYXA 1I69A 3O9PA 1EZPA 3U94A 2H9BA 1MS7A 4Q5TA 5ISUA 3K00A 3Q26A 4EUOA 2Q2AA 2RF1A 4YMAA 5H8FA 3P7IA 5ICQA 5CBRA 1UQWA 2ONKE 3KOSA 4F19A 1ZTYA 3EHUA 1I6QA 1TFDA 3OOAA 3D4CA 1JVXA 3KSXA 5BWJA 2VOZA 4UA8A 3CSBA 3CIJA 1N3WA 3PV0E 2I4BA 4WEDA 3KEIA 5L9OA 4L17A 2XXWA 4GXAA 1Y3NA 5JK4A 3G3KA 1MRPA 3RLFE 3C36A 3CFXA 4LZ7A 3LC8A 4GXSB 2AL4A 2ONRA 3PUZE 4KD5A 1A99A 2F7AA 5ITOA 3FV1A 1UTHA 1R1NA 2O1MA 3MZ9A 3HCQA 2QS4A 4H1XA 3K0VA 5AA2D 5I56A 2DVZA 1TFAA 3OO8A 1B3GA 3K01A 2M8CA 1B3FA 4NF6A 5FTHA 1Z7ME 5L9MA 1SI0A 1TT1A 1GV8A 4F29A 4HW8A 2X26A 1I6BA 1NNPA 1TWYA 2FYIA 4R2BA 2KLFA 3LUYA 4X9TA 5H8QB 1AH5A 1CB6A 3O2AA 3VLUA 4ELQA 2A5TB 4G8NA 4KHZE 4GOTA 4LONB 1D9VA 2ZXTA 3CI8A 5K2XA 4MF3A 4THIA 2QSXA 1QKAA 1JEUA 2QL3A 3O29A 1N7XA 1POY1 4MLQA 3SETA 4JSDA 4RXLA 4NF8A 1QW0A 3PPNA 3AXFA 1JETA 3HV1A 5AA4B 1ZKBA 3KN8A 3N94A 4O3BA 4YKJA 2DVCA 3B6WA 4F31B 2DXRA 3WAFA 5AA2A 4F22A 2P1SA 2XXQA 1B6HA 2UVJA 2WKYA 4N6PA 1P1WA 5F7VA 1SD3A 5DVIA 2XXRA 1USYE 2NWJA 4OETA 4C0RA 2GRVA 2THIA 2HZLA 3USDA 1J1NA 3G3IA 3VDFA 3C33A 3KN7A 5TPAA 3K2DA 4TLMB 3FD3A 1MQGA 3LBSA 4MFIA 1ZLQA 1QKBA 5I2NB 5I58A 2RC9A 4H65A 2BJJX 2DS9A 2PT1A 4WEPA 2Z8FA 3MUQA 3VLWA 3H6WA 4KYDA 3KG2A 2O7UA 4JBZA 3EQ1A 1DPEA 1IXHA 3CFLA 3K1NA 3LSXA 3PU5A 2V3QA 1MXXA 1IXIA 4OEVA 2R6GE 3OEMA 3KBRA 2XXTA 3OO9A 3RY3A 1LAFE 4G68B 1PDAA 4F1YA 3ONMA 2XXXA 3Q27A 3G3FA 4XKPA 1B51A 2ZMBA 4PFWA 2HCAA 5AA3A 4PFYA 3MW0A 4Q8RA 1ZBMA 3OENA 3O28A 2DE2A 4DDDA 5DVFA 1ATGA 2F34A 1YPNA 4FATA 4I8CA 2I48A 1YCJA 4KPTA 4ZZAA 3C4MA 4M4GA 4EQBA 1LBCA 3TCGA 4YZZA 4NWDA 2B65A 3FASA 2PYYA 3IO6A 1M5CA 2HXWA 1Y4TA 1EH3A 4OVJA 3V83A 1MPCA 1B1HA 4BDNA 1NNTA 2PBWA 2Z8DA 3PUXE 1FTMA 1LFIA 1S9TA 1D3KA 4YKPA 2QPQA 4FORA 4QSCA 4ND9A 5JTYA 2Q88A 4ZS9A 3LSLA 3T22A 3T9XB 3O66A 1XT8A 4OFOA 5FHOA 3UA8A 4JWXA 3OMBA 1LFGA 2GHBA 4GD5A 4HCYA 3I5OA 2RKMA 2XXPA 4QHQA 4KCCA 4E0XA 2REJA 1SW4A 2OZZA 3KN3A 4KYSA 3PD8A 3EPEA 3S9EA 3PMXA 2I4CA 4IY6A 4G77A 1LB8A 1BP5A 2F7BA 1MM7A 1SW2A 4OTEA 3TTKA 2Y7KA 4NWCA 3RTWB 1JNFA 4XKRA 3K02A 4HCWA 3VFJA 4GQOA 2I6EA 2B3FA 4FIMA 4ZEIA 3O97A 1URDA 5BUUA 2F5XA 3IB1A 4POXA 5DTBA 1POTA 5FHNA 1IXCA 4OERA 3U8QA 3H06B 3VXCA 1BLFA 3OO7A 2H4IA 2D5WA 1GR2A 4PE5B 2E0SA 3IOUA 1B7UA 5EHMA 1RKMA 4X48A 3O6HA 5TP9B 4G8MA 3KZGA 4N13A 1Y1MA 5CMBA 4G68C 4NMYA 2ONSA 2GH9A 2ZNTA 3HSTA 3SDFA 3UK4A 4NEDA 4JB7A 1M5BA 5FHMA 2VGQA 4KFQA 1OQHA 4EDPA 5HPQA 4O3AA 1XVYA 1EU8A 1UTBA 4IB2A 1IEJA 2O1LA 4RA1A 4FEBA 3FXUA 5TU0A 3PD9A 3K4UA 4GLIA 5CBSA 4IO6A 3SEYA 3PPRA 1XOCA 1FCKA 2AIXA 3S2VA 1DTGA 2VHAA 1Y4CA 1NFTA 2AYSA 1Q35A 1IZ1A 3H6UA 4ESXA 4P0IA 2F7CA 1P1UA 2O68A 4R73A 1B0HA 2XX9A 1B5HA 1B4ZA 5CMCA 4RNSA 4P0GA 3PUWE 5IAIA 3R26A 1OIBA 3VVEA 1LFHA 3F11A 1FW0A 5EHSA 2I58A 1M5DA 1MPBA 3ZSFA 1B0LA 1A54A 1B1XA 3SESA 3C35A 2H5YA 4KQPA 4BDLA 2XD3A 2RC8A 2VD3A 5I84A 2UVGA 5H8NA 1M5EA 3CG1A 4GWOA 3BFUA 4F18A 4X1DA 3PUYE 2F35A 1VE4A 2R71A 4I62A 2OBGA 4QF9A 3TZAA 3T9VA 3LSFB 1MXVA 1SYIA 2CMOA 2VP1A 3DELB 5A5XB 3HHFA 3IOWA 1MM6A 4RK2A 4YU0A 3MZBA 2AL5A 4FAJA 4NF5B 3SEWA 2UXAA 1B4HA 1XVXA 5KDTB 1GGGA 1LGBC 4YKIA 2I49A 4RK9A 4Z0IA 5CI5A 3TYHA 3KFMA 4YKKA 4DZ1A 3IK6B 4GFRA 1B40A 3MAMA 2D21A 4IGRA 3EF7A 1EZOA 1IIWA 2ABHA 5DEXB 3QK6A 3TUSA 1MY0A 4Q0CA 2DP8A 1MY3A 5CMMA 3GBAA 4MH5A 1YAEA 1A8EA 4AB6A 2OK2A 4LVQA 2X7PA 4OQOA 4R6YA 2Y84A 1AMFA 1AIVA 1NNFA 3MWBA 3I3VA 1FQAA 3PGFA 4JSOA 4OFLA 2O6AA 4OZ9A 4ELOA 1LAHE 2DQVA 3BKIB 3UN6A 4OFJA 4O3CA 4OXVA 4IY5A 3MPLA 4JWYA 3W9WA 5H8SA 4C1TA 3HPIA 4H67A 4DLDA 5JEIA 3FVGA 3TFLA 2B3BA 2OJTA 3LR1A 4ELPA 4K3FA 1R9LA 3PPOA 3SKPA 4RY1A 2Y7WA 1O7TA 3H6TA 1RYXA 3SEVA 1Y20A 4E0WA 1SDXA 2R9JA 2F97A 4NF4A 1OQGA 3WAEA 3B7DA 3K6WA 4ONYA 2I3WA 3G3HA 2HEUA 4LQ2A 4H5FA 3SERA 5I59B 1M5FA 3UORA 3W9VA 1FTKA 3PUVE 2CZLA 2Z8EA 1SW5A 3PMVA 4BDQA 1QUIA 4PQJA 1MY4A 3TQWA 2ZYMA 4ECFA 1OVBA 4H5GA 4EQ7A 4DXBA 3IOTA 2Y7PA 1ELJA 4FECA 2RC7A 1NNKA 1D9YA 1ZMGA 2RCAA 4F3PA 1UIUA 1PBQA 1JW4A 1MDP1 2DE3A 3TDJA 1DTZA 3T93B 5CRYA 4F39A 3SEUA 3V8XB 1BKAA 2E1SA 4FEDA 4U23A 3M3LA 2O69A 1PB8A 3A09A 3QXMA 4LQ5A 2P2AA 1PC3A 5CC2A 1R6ZA 4AQ4A 3VVDA 5B70A 4HTGA 4I1DA 5L9SA 1OLAA 3N6UA 2HAVA 1A55A 5H8HA 1SQYA 3MQ9A 3B6TA 3VVFA 3RN8A 2GHAA 4OESA 1N7WA 3DP6A 5AA1A 4XTCQ 1B52A 3FV2A 4U2RA 4F2OA 2ESNA 3IL1B 1ANFA 5KCJB 1ZJLA 3IX1A 3H6VA 3K1MA 1A40A 1QUKA 2V84A 1B2HA 5HBCA 5ITPA 5IKBA 4WKMA 3S4UA 3ZKKA 1N76A 1FTJA 2OWTA 4QSDA 2XX8A 5H8FB 4PFUA 2ZNSA 2OWSA 2NVUB 1B05A 1SVXB 4KI0E 3Q25A 1FTLA 2XD2A 5I2KB 3CVGA 1OLCA 4R75A 4DCYA 5B7DA 4QRZA 1AOVA 4LUBA 3DP4A 3HHGA 1MXWA 3Q29A 2QMWA 4QFOA 4OYVA 2G93A 1MY1A 3IB0A 1JW5A 1GTKA 2I3VA 3PPPA 1H3DA 3TELA 3MBPA 3TKDA 3S9LC 5F1QA 3H7MA 3K6VA 3BBRA 3FJ7A 3V5AA 1N84A 2PMSA 3V89B 3CSGA 3QSLA 1IUDA 2DWAA 5H8QA 3RTFB 1UTHB 4POWA 1FQCA 1Y1ZA 4XXUA 2A5TA 4QFKA 3TTLA 1US5A 4G8HA 1IQ7A 2V3UA 4NF6B 4RJZA 5LOMA 1P1QA 4U4XA 1A7LA 3IB2A 3MJNA 3RPWA 2F36A 3TQLA 2DXYA 4ESWA 2HZKA 4YAHX 1B3LA 3Q28A 1QJMA 3O6IA 5DVJA 2XXVA 3H3GA 4NE4A 5AA4A 3KSJA 1CE2A 4I9DA 1MQIA 1SI1A 3IJXB 2FA7A 3FVNA 3OSRA 2FNCA 4TOZA 3E3KA 4R2FA 5I59A 3HO7A 4YB5A 2Y7RA 4BDRA 1D4NA 4FE8A 3R7XA 4IO2A 4RYAA 3OO6A 1LLSA 3G3JA 3VV5A 1PBPA 4NF8B 1XHYA 1MQDA 1WVJA 2ZYNA 2IA4A 1Y3QA 2DE4A 4KR5A 2LAOA 4JDFA 1MH3A 1H76A 2GFEA 1FTOA 1MQHA 3S9NC 1Q1KA 3FATA 4H8IA 1MXYA 5AA2B 5I2NA 3G3GA 2PT2A 2F6GA 1LSTA 4F3BA 3JV9A 3EHSA 5K2YA 5M2VA 2Q8JA 3PMWA 4F1VA 4R6KA 1B3EA 2Q9TA 1MQJA 3E4RA 5KZTA 3KOTA 1B46A 3UGWA 4Q30B 2W7YA 3FVOA 1US4A 2V3TA 3C32A 3VE1B 2XXUA 1QVSA 3OSQA 5TPAB 2ALUA 4ZEDA 3QAXA 5FTIA 4G68A 4TLLB 1LAGE 5I58B 3RQTA 4IO7A 1LAXA 1OVTA 2X7QA 2ZNUA 5KCJA 4PFTA 4AB5A 1QUJA 2Z23A 4U22A 1PB9A 4QSEA 3UIFA 2Y7IA 2V93A 4DIGA 1JVYA 3JYRA 2XXHA 1Y3PA 1B9JA 4JXIA 1MH4A 5HM4B 5EYFA 2H99A 3ILUB 3I6VA 2OLBA 1NH8A 2D3IA 1LBBA 5I2KA 3CR9A 1HSLA 3KJ7A 1RYOA 3ZS6A 4F3GA 3UP9A 4EF2A 2YPNA 2XXYA 4XKQA 4RPOA 3MPKA 1MPDA 3VLVA 5CM6A 4G4PA 4PP0A 2Q2CA 5ELVA 3MVXA 3TAJA 2P0SA 3FJMA 2O7IA 2NXOA 3RNNA 2O84X 1HSEA 3FUZA 3RT6B 1GVCA 4KYEA 1L5TA 1B5IA 2OCUA 4LATA 1AL3A 3MZ1A 4XIGQ 3MC2A 2I0CA 5JTYB 4OWDA 3TEPA 4U21A 4HS7A 3W15C 3TCFA 3FXRA 1O63A 1URGA 4EXKA 5DYHA 3KGCA 1NMUA 3TODA 2Q89A 4F3SA 3OD7A 1HSJA 3RT8A 1SYHA 4MLVA 3B6QA 4U1ZA 1QULA 2ANJA 2O51A 3QIMA 3K6UA 4NTLA 1VFDA 2NOOA 4N07A 3N26A 3IR1A 4M1VA 2RCBA 5TP9A 3VXBA 2QMXA 3C31A 2DSFA 3PPQA 3QUJA 3QUFA 2Z22A 3FJGA 4YB6A 1URSA 3G7WA 3TTRA 4ZZEA 2XHDA 3N6TA 2RINA 2QRYA 4QFNA 3ODBA 4FJPA 2F6PA 3MP6A 1SBPA 4ZEKA 3ZKLA 5I57B 4QFLA 2H25A 3U72A 3L6HA 4R74A 3TMGA 4IO3A 4EXLA 3LSWA 3OEKA 2I0BA 1O64A 4UACA 4JWOA 1T0KA 5CMKA 4ZE9A 1DSNA 4ISUA 3T9HB 4DXUA 4ZDMA 4ZE8A 2HQ0A 2QJEA 1UTBB 2ZYOA 1B3HA 1ZU0A 2F8DA 2UVHA 3C9HA 1PEBA 2F78A 3CG3A 2XXIA 4BLAA 1B58A 5ICTA 3TCHA 4DE8A 1NKXA 2PX1A 2QS3A 3O6GA 2H98A 3K1PA 1B5JA 3QYTA 4Z7EA 4LA9A 1ZIUA 2REGA 4P11A 4LZ5A 1MXZA 1MXUA 4IGTA 4PETA 4U1OA 3HN0A 4R9GA 4GIZA 4OENA 1LB9A 3CRBA 4F1UA 3H03A 4G2ZA 5A5XA 3FVKA 4YMBA 4BDOA 4GVOA 3EN3A 4ZECA 3K6XA 2ZYKA 1P99A 4NF5A 4OHNA 5KDTA 3SEXA 5H8NB 4IO5A 2DOJA 5DT6A 3N5LA 1USYH 1Y9UA 4C1UA 1VFEA 4IO4A 5DEXA 4H8JA 3TPAA 1N0TA 1XS5A 3A3UA 3D4GA 1MDQA 1FQBA 3THIA 3GXAA 3L6GA 3MVZA 1H44A 1OMPA 1R9QA 1DOTA 1I6AA 4OEUA 1JW1A 3TTMA 2YLNA 3M3FA 4GL8A 1VSOA 4U4SA 4TQUQ 3E13X 4DCXA 3A3CA 1FQFA 4WXJA 3ECRA 4RPNA 3FGSA 3MVWA 4H6DA 1FQEA 3CFZA 4GRKA 1MG1A 2YJPA 2QS2A 3U92A 2QS1A 3IAZA 1KWHA 3T9UA 1VR5A 5I56B 4YB7A 3EHTA 3GBBA 4QFPA 1DMBA 3OELA 1II5A 3FZVA 1H43A 1TXFA 1NH7A 1B7HA 3GLBA 4KCDA 4ELRA 3MP8A 2XX7A 1JQFA 3E9XA 3RUMA 2UYFA 1EZ9A 1S50A 3R6UA 1B32A 3M3KA 3IORA 3M8UA 3C34A 3FIRA 1IITA 3T96B 4OMBA 1P1NA 1YTVA 2DWHA 1F9BA 5J1DA 1LCFA 3ILTB 5AE4A 3MVYA 4H0WA 4F2QA 1P1OA 1WODA 2UYEA 4EQ9A 1BIYA 2VD2A 3DLNA 2HFBA 5I57A 4BDMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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